SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS11485 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS11485 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P04983 Ribose import ATP-binding protein RbsA; EC 7.5.2.7 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
39% identity, 94% coverage: 13:501/522 of query aligns to 4:491/501 of P04983

query
sites
P04983
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
S
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
D
K
 
K
R
 
A
Y
 
F
-
 
P
A
 
G
A
 
V
P
 
K
V
 
A
L
 
L
D
 
S
G
 
G
I
 
A
D
 
A
L
 
L
D
 
N
L
 
V
R
 
Y
P
 
P
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
L
 
M
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
M
S
 
M
K
 
K
I
 
V
I
 
L
C
 
T
G
 
G
L
 
I
V
 
Y
D
 
T
A
 
R
S
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
T
M
 
L
M
 
L
L
 
W
D
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
E
Y
 
T
A
 
T
P
 
F
A
 
T
S
 
G
R
 
P
T
 
K
Q
 
S
A
 
S
E
 
Q
G
 
E
L
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
G
M
 
I
V
 
I
M
 
H
Q
 
Q
E
 
E
L
 
L
N
 
N
L
 
L
I
 
I
P
 
P
T
 
Q
L
 
L
S
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
F
L
 
L
-
 
G
E
 
R
K
 
E
L
 
F
P
 
V
R
 
N
R
 
R
F
 
F
G
 
G
W
 
K
I
 
I
D
 
D
R
 
W
K
 
K
K
 
T
L
 
M
A
 
Y
E
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
D
A
 
K
Q
 
L
M
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
L
G
 
N
L
 
L
G
 
-
E
 
R
L
 
F
D
 
K
P
 
S
W
 
D
T
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
I
G
 
G
H
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
N
 
V
L
 
L
I
 
S
G
 
F
S
 
E
C
 
S
R
 
K
C
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
D
M
 
A
L
 
L
T
 
T
N
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
T
E
 
E
L
 
S
L
 
L
F
 
F
S
 
R
R
 
V
I
 
I
E
 
R
R
 
E
L
 
L
R
 
K
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
V
 
R
A
 
G
I
 
I
I
 
V
Y
 
Y
I
 
I
S
 
S
H
 
H
R
 
R
L
 
M
E
 
K
E
 
E
L
 
I
K
 
F
R
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
D
I
 
V
V
 
T
V
 
V
L
 
F
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
L
 
F
V
 
I
C
 
A
N
 
E
D
 
R
D
 
E
I
 
V
G
 
A
R
 
S
Y
 
L
S
 
T
T
 
E
E
 
D
Q
 
S
L
 
L
V
 
I
Q
 
E
L
 
M
M
 
M
A
 
V
G
 
G
E
 
R
L
 
K
T
 
L
K
 
E
V
 
D
D
 
Q
L
 
Y
D
 
P
A
 
H
E
 
L
H
 
D
R
 
K
R
 
A
I
 
P
G
 
G
A
 
D
P
 
I
V
 
R
L
 
L
R
 
K
I
 
V
R
 
D
G
 
N
L
 
L
G
 
C
R
 
-
A
 
G
P
 
P
V
 
G
V
 
V
H
 
N
P
 
D
A
 
V
S
 
S
L
 
F
A
 
T
L
 
L
H
 
R
A
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
S
G
 
G
L
 
L
I
 
M
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
M
R
 
K
L
 
V
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
L
R
 
P
A
 
R
E
 
T
Q
 
S
G
 
G
E
 
Y
I
 
V
F
 
T
I
 
L
G
 
-
D
 
D
S
 
G
Q
 
H
E
 
E
P
 
V
A
 
V
R
 
-
I
 
T
R
 
R
S
 
S
P
 
P
K
 
Q
D
 
D
A
 
G
V
 
L
K
 
A
A
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
V
M
 
Y
V
 
I
T
 
S
E
 
E
D
 
D
R
 
R
K
 
K
G
 
R
Q
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
G
Q
 
M
A
 
S
I
 
V
S
 
K
V
 
E
N
 
N
T
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
T
N
 
A
L
 
L
G
 
R
S
 
Y
V
 
F
S
 
S
R
 
R
-
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
S
L
 
L
D
 
K
H
 
H
A
 
A
A
 
D
E
 
E
S
 
Q
S
 
Q
V
 
A
A
 
V
Q
 
S
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
K
 
R
K
 
L
L
 
F
R
 
N
I
 
V
R
 
K
S
 
T
G
 
P
S
 
S
V
 
M
A
 
E
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
G
 
G
E
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
W
 
G
L
 
L
Y
 
M
R
 
T
D
 
R
C
 
P
P
 
K
I
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
R
 
R
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
S
 
K
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
R
 
Q
L
 
L
F
 
I
A
 
N
E
 
Q
L
 
F
A
 
K
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
K
 
L
G
 
S
L
 
I
L
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
S
 
S
D
 
E
L
 
M
R
 
P
E
 
E
L
 
V
M
 
L
Q
 
G
I
 
M
C
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
I
V
 
V
M
 
M
S
 
H
A
 
E
G
 
G
R
 
H
I
 
L
A
 
S
D
 
G
T
 
E
F
 
F
S
 
T
R
 
R
D
 
E
D
 
Q
W
 
A
S
 
T
Q
 
Q
E
 
E
R
 
V
I
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 43% coverage: 4:227/522 of query aligns to 8:226/378 of P69874

query
sites
P69874
N
 
N
D
 
K
S
 
Q
L
 
P
S
 
S
Q
 
S
G
 
L
S
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
V
T
 
Q
L
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
R
K
 
K
R
x
C
Y
x
F
-
 
D
A
 
G
A
 
K
P
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
P
G
 
Q
I
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
T
L
 
I
R
 
N
P
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
x
F
L
 
L
A
 
T
L
 
L
T
 
L
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
S
x
L
K
 
R
I
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
E
D
 
T
A
 
V
S
 
D
A
 
S
G
 
G
G
 
R
M
 
I
M
 
M
L
|
L
D
 
D
G
 
N
Q
 
E
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
D
A
 
I
S
 
T
R
 
H
T
 
V
Q
 
P
A
 
A
E
 
E
G
 
N
L
 
R
G
 
Y
I
 
V
R
 
N
M
 
T
V
 
V
M
 
F
Q
 
Q
E
 
S
L
 
Y
N
 
A
L
 
L
I
 
F
P
 
P
T
 
H
L
 
M
S
 
T
I
 
V
A
 
F
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
A
F
 
F
G
 
G
W
 
L
-
 
R
I
 
M
D
 
Q
R
 
K
K
 
T
K
 
P
L
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
T
R
 
P
A
 
R
Q
 
V
M
 
M
E
 
E
V
 
A
V
 
L
G
 
R
L
 
M
G
x
V
E
 
Q
L
 
L
D
 
E
P
 
T
W
 
F
T
 
A
-
 
Q
-
 
R
P
 
K
V
 
P
G
 
H
D
 
Q
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
V
I
 
V
G
 
N
S
 
K
C
 
P
R
 
R
C
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
Y
R
 
K
E
 
L
V
 
R
E
 
K
L
 
Q
L
 
M
F
 
Q
S
 
N
R
 
E
I
 
L
E
 
K
R
 
A
L
 
L
-
 
Q
R
 
R
A
 
K
E
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
T
I
 
F
I
 
V
Y
 
F
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
E
E
 
E
L
 
A
K
 
L
R
 
T
I
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 42% coverage: 11:230/522 of query aligns to 2:224/648 of P75831

query
sites
P75831
S
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
E
L
 
L
S
 
K
G
 
D
I
 
I
G
 
R
K
 
R
R
 
S
Y
 
Y
A
 
P
A
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
Q
-
 
V
P
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
Y
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
L
C
 
G
G
 
C
L
 
L
V
 
D
D
 
K
A
 
A
S
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
T
M
 
Y
M
 
R
L
 
V
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
D
Y
 
V
A
 
A
P
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
A
A
 
L
S
 
A
R
 
Q
T
 
L
Q
 
R
A
 
R
E
 
E
G
 
H
L
 
F
G
 
G
I
 
-
R
 
-
M
 
F
V
 
I
M
 
F
Q
 
Q
E
 
R
L
 
Y
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
S
T
 
H
L
 
L
S
 
T
I
 
A
A
 
E
E
 
Q
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
L
 
V
P
 
P
R
 
A
R
 
V
F
 
Y
G
 
A
W
 
G
I
 
L
D
 
E
R
 
R
K
 
K
K
 
Q
L
 
R
A
 
L
E
 
L
A
 
R
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
Q
 
L
M
 
L
E
 
Q
V
 
R
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
E
E
 
D
L
 
R
D
 
T
P
 
E
W
 
Y
T
 
Y
P
 
P
V
 
-
G
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
G
 
N
S
 
G
C
 
G
R
 
Q
C
 
V
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
S
R
 
H
E
 
S
V
 
G
E
 
E
L
 
E
L
 
V
F
 
M
S
 
A
R
 
I
I
 
L
E
 
H
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
D
E
 
R
G
 
G
V
 
H
A
 
T
I
 
V
I
 
I
Y
 
I
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
-
E
 
P
E
 
Q
L
 
V
K
 
A
R
 
A
I
 
Q
A
 
A
D
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
V
 
V
C
 
R
N
 
N

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
31% identity, 39% coverage: 27:230/522 of query aligns to 22:223/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
S
L
 
L
D
 
S
L
 
I
R
 
E
P
 
R
G
 
G
Q
 
D
V
 
F
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
I
C
 
G
G
 
C
L
 
L
V
 
D
D
 
T
A
 
A
S
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
S
M
 
S
M
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
E
Y
 
T
A
 
I
P
 
E
A
 
L
S
 
T
R
 
N
T
 
D
Q
 
Q
A
 
L
E
 
S
G
 
D
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
G
 
K
I
 
F
R
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
F
Q
|
Q
E
 
R
L
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
S
T
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
A
R
 
I
F
 
Y
G
 
A
W
 
G
I
 
M
D
 
P
R
 
Q
K
 
S
K
 
Q
L
 
R
A
 
L
E
 
E
A
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
Q
 
L
M
 
L
E
 
E
V
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
x
K
W
 
W
-
 
Q
T
 
N
P
 
K
V
 
P
G
 
N
D
x
Q
L
 
L
G
x
S
L
 
G
G
|
G
H
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
G
 
N
S
 
G
C
 
G
R
 
E
C
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
S
R
 
H
E
 
S
V
 
G
E
 
E
L
 
N
L
 
V
F
 
M
S
 
E
R
 
I
I
 
L
E
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
A
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
H
A
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
-
E
 
K
E
 
H
L
 
I
K
 
A
R
 
A
I
 
S
A
 
A
D
 
N
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
V
 
I
C
 
S
N
 
D

Sites not aligning to the query:

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
31% identity, 39% coverage: 27:230/522 of query aligns to 22:223/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
S
L
 
L
D
 
S
L
 
I
R
 
E
P
 
R
G
 
G
Q
 
D
V
 
F
L
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
M
K
 
N
I
 
I
I
 
I
C
 
G
G
 
C
L
 
L
V
 
D
D
 
T
A
 
A
S
 
T
A
 
G
G
 
G
G
 
S
M
 
S
M
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
E
Y
 
T
A
 
I
P
 
E
A
 
L
S
 
T
R
 
N
T
 
D
Q
 
Q
A
 
L
E
 
S
G
 
D
L
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
Q
G
 
K
I
 
F
R
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
F
Q
|
Q
E
 
R
L
 
Y
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
S
T
 
S
L
 
L
S
 
T
I
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
A
R
 
I
F
 
Y
G
 
A
W
 
G
I
 
M
D
 
P
R
 
Q
K
 
S
K
 
Q
L
 
R
A
 
L
E
 
E
A
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
Q
 
L
M
 
L
E
 
E
V
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
x
K
W
 
W
-
 
Q
T
 
N
P
 
K
V
 
P
G
 
N
D
x
Q
L
 
L
G
x
S
L
 
G
G
|
G
H
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
M
G
 
N
S
 
G
C
 
G
R
 
E
C
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
S
R
 
H
E
 
S
V
 
G
E
 
E
L
 
N
L
 
V
F
 
M
S
 
E
R
 
I
I
 
L
E
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
H
A
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
H
A
 
T
I
 
I
I
 
I
Y
 
M
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
-
E
 
K
E
 
H
L
 
I
K
 
A
R
 
A
I
 
S
A
 
A
D
 
N
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
E
L
 
I
R
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
E
L
 
I
V
 
I
C
 
S
N
 
D

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
30% identity, 42% coverage: 12:228/522 of query aligns to 1:215/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
P
 
P
L
 
I
L
 
I
T
 
R
L
 
I
S
 
R
G
 
N
I
 
L
G
 
H
K
 
K
R
 
W
Y
x
F
A
 
G
A
 
P
-
 
L
P
 
H
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
H
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
E
V
 
K
L
 
L
A
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
I
K
 
R
I
 
T
I
 
I
C
 
N
G
 
R
L
 
L
V
 
E
D
 
D
A
 
F
S
 
Q
A
 
E
G
 
G
G
 
E
M
 
V
M
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
P
 
S
Y
 
V
A
 
K
P
 
D
A
 
D
S
 
R
R
 
A
T
 
L
Q
 
R
A
 
E
E
 
I
G
 
R
L
 
R
G
 
E
I
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
T
 
H
L
 
M
S
 
T
I
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
-
L
 
-
P
 
P
R
 
M
R
 
R
F
 
V
G
 
R
W
 
R
I
 
W
D
 
P
R
 
R
K
 
E
K
 
K
L
 
A
A
 
E
E
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
E
Q
 
L
M
 
L
E
 
E
V
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
L
E
 
D
L
 
Q
D
 
A
P
 
R
W
 
K
T
 
Y
P
 
P
V
 
-
G
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
M
S
 
E
C
 
P
R
 
K
C
 
I
L
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
R
 
E
E
 
M
V
 
V
E
 
G
L
 
E
L
 
V
F
 
L
S
 
D
R
 
V
I
 
M
E
 
R
R
 
D
L
 
L
R
 
A
A
 
Q
E
 
G
G
 
G
V
 
M
A
 
T
I
 
M
I
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
E
L
 
M
E
 
G
E
 
F
L
 
A
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
F
L
 
M
R
 
D
D
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
I
V
 
V

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
30% identity, 42% coverage: 13:229/522 of query aligns to 2:222/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
L
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
A
 
T
P
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
S
L
 
V
R
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
C
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
D
 
T
A
 
P
S
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
D
M
 
V
M
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
L
A
 
S
P
 
S
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
A
Q
 
E
A
 
L
E
 
R
G
 
N
L
 
Q
G
 
K
I
 
L
R
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
I
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
E
 
P
K
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
I
D
 
G
R
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
S
A
 
R
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
V
 
M
-
 
L
-
 
K
-
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
E
 
H
L
 
R
D
 
A
P
 
N
W
 
H
T
 
R
P
 
P
V
 
-
G
 
S
D
 
E
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
N
S
 
N
C
 
P
R
 
R
C
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
E
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
S
 
Q
R
 
L
I
 
L
E
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
I
 
F
I
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
K
 
K
R
 
R
I
 
M
A
 
S
D
 
-
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
V
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
T
C
 
A

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
30% identity, 42% coverage: 13:229/522 of query aligns to 2:222/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
L
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
R
 
R
Y
|
Y
A
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
A
 
T
P
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
S
L
 
V
R
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
C
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
D
 
T
A
 
P
S
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
D
M
 
V
M
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
L
A
 
S
P
 
S
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
A
Q
 
E
A
 
L
E
 
R
G
 
N
L
 
Q
G
 
K
I
 
L
R
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
|
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
I
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
E
 
P
K
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
I
D
 
G
R
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
S
A
 
R
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
V
 
M
-
 
L
-
 
K
-
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
E
 
H
L
 
R
D
 
A
P
 
N
W
x
H
T
 
R
P
 
P
V
 
-
G
 
S
D
x
E
L
 
L
G
x
S
L
x
G
G
|
G
H
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
N
S
 
N
C
 
P
R
 
R
C
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
x
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
E
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
S
 
Q
R
 
L
I
 
L
E
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
I
 
F
I
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
K
 
K
R
 
R
I
 
M
A
 
S
D
 
-
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
V
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
T
C
 
A

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 42% coverage: 13:229/522 of query aligns to 5:225/233 of P75957

query
sites
P75957
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
L
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
A
 
T
P
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
S
L
 
V
R
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
|
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
C
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
D
 
T
A
 
P
S
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
D
M
 
V
M
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
M
A
 
S
P
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
A
Q
 
E
A
 
L
E
 
R
G
 
N
L
 
Q
G
 
K
I
 
L
R
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
 
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
I
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
E
 
P
K
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
I
D
 
G
R
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
S
A
 
R
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
V
 
M
-
 
L
-
 
K
-
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
E
 
H
L
 
R
D
 
A
P
 
N
W
 
H
T
 
R
P
 
P
V
 
-
G
 
S
D
 
E
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
N
S
 
N
C
 
P
R
 
R
C
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
E
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
S
 
Q
R
 
L
I
 
L
E
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
I
 
F
I
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
K
 
K
R
 
R
I
 
M
A
 
S
D
 
-
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
V
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
T
C
 
A

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs (see paper)
29% identity, 42% coverage: 13:229/522 of query aligns to 4:224/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
L
 
L
L
 
L
T
 
Q
L
 
C
S
 
D
G
 
N
I
 
L
G
 
C
K
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
Q
A
 
T
P
 
D
V
|
V
L
 
L
D
 
H
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
F
D
 
S
L
 
V
R
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
L
 
M
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
H
I
 
L
I
 
L
C
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
D
D
 
T
A
 
P
S
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
D
M
 
V
M
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
Y
 
M
A
 
S
P
 
K
-
 
L
-
 
S
-
 
S
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
A
Q
 
E
A
 
L
E
 
R
G
 
N
L
 
Q
G
 
K
I
 
L
R
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
Y
Q
|
Q
E
 
F
L
 
H
N
 
H
L
 
L
I
 
L
P
 
P
T
 
D
L
 
F
S
 
T
I
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
L
 
V
F
 
A
L
 
M
E
 
P
K
 
L
L
 
L
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
I
D
 
G
R
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
P
A
 
A
E
 
E
A
 
I
A
 
N
R
 
S
A
 
R
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
V
 
M
-
 
L
-
 
K
-
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
D
E
 
H
L
x
R
D
 
A
P
 
N
W
x
H
T
 
R
P
 
P
V
 
-
G
 
S
D
x
E
L
 
L
G
x
S
L
 
G
G
|
G
H
x
E
Q
 
R
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
N
S
 
N
C
 
P
R
 
R
C
 
L
L
 
V
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
G
M
 
N
L
 
L
T
 
D
N
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
A
E
 
D
L
 
S
L
 
I
F
 
F
S
 
Q
R
 
L
I
 
L
E
 
G
R
 
E
L
 
L
-
 
N
R
 
R
A
 
L
E
 
Q
G
 
G
V
 
T
A
 
A
I
 
F
I
 
L
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
D
L
 
L
E
 
Q
E
 
L
L
 
A
K
 
K
R
 
R
I
 
M
A
 
S
D
 
-
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
V
 
E
L
 
M
R
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
T
C
 
A

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
27% identity, 41% coverage: 13:228/522 of query aligns to 1:215/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
L
 
I
T
 
F
L
 
V
S
 
N
G
 
D
I
 
V
G
 
Y
K
 
K
R
 
N
Y
x
F
A
 
G
A
 
S
-
 
L
P
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
L
D
 
K
L
 
V
R
 
N
P
 
K
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
V
A
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
L
K
 
R
I
 
C
I
 
I
C
 
N
G
 
L
L
 
L
V
 
E
D
 
E
A
 
P
S
 
T
A
 
K
G
 
G
G
 
E
M
 
V
M
 
F
L
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
P
 
K
Y
 
I
A
 
N
P
 
N
A
 
G
S
 
K
-
 
V
R
 
N
T
 
I
Q
 
N
A
 
K
E
 
V
G
 
R
L
 
Q
G
 
K
I
 
V
R
 
G
M
 
M
V
 
V
M
 
F
Q
 
Q
E
 
H
L
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
F
P
 
P
T
 
H
L
 
L
S
 
T
I
 
A
A
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
-
L
 
-
P
 
P
R
 
V
R
 
K
F
 
V
G
 
K
W
 
K
I
 
M
D
 
N
R
 
K
K
 
K
K
 
E
L
 
A
A
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
D
Q
 
L
M
 
L
E
 
A
V
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
E
 
D
L
 
K
D
 
K
P
 
D
W
 
Q
T
 
Y
P
 
P
V
 
I
G
 
-
D
 
K
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
M
S
 
Q
C
 
P
R
 
E
C
 
V
L
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
R
 
E
E
 
M
V
 
V
E
 
K
L
 
E
L
 
V
F
 
L
S
 
N
R
 
V
I
 
M
E
 
K
R
 
Q
L
 
L
R
 
A
A
 
N
E
 
E
G
 
G
V
 
M
A
 
T
I
 
M
I
 
V
Y
 
V
I
 
V
S
 
T
H
|
H
R
 
E
L
 
M
E
 
G
E
 
F
L
 
A
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
I
V
 
F
L
 
M
R
 
D
D
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
I
V
 
V

6fn1A Zosuquidar and uic2 fab complex of human-mouse chimeric abcb1 (abcb1hm) (see paper)
35% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 953:1157/1182 of 6fn1A

query
sites
6fn1A
R
 
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
S
M
 
V
M
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
E
Y
 
I
A
 
K
P
 
Q
A
 
L
S
 
N
-
 
V
-
 
Q
-
 
W
-
 
L
R
 
R
T
 
A
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
-
M
 
-
V
 
V
M
 
S
Q
 
Q
E
 
E
L
 
P
N
 
I
L
 
L
I
 
F
P
 
D
T
 
T
L
 
-
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
V
G
 
S
W
 
Y
I
 
E
D
 
E
R
 
I
K
 
V
K
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
N
A
 
I
Q
 
H
M
 
Q
E
 
F
V
 
I
V
 
D
G
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
K
W
 
Y
-
 
N
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
H
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
C
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
T
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7zkaA Abcb1 v978c mutant (mabcb1) in the outward facing state bound to aac
32% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 949:1153/1177 of 7zkaA

query
sites
7zkaA
R
|
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
S
M
 
V
M
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
Q
 
E
A
 
I
E
 
K
G
 
Q
L
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
Q
M
 
W
V
 
L
M
 
R
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
I
I
 
V
-
 
S
-
x
Q
-
 
E
P
 
P
T
 
I
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
V
G
 
S
W
 
Y
I
 
E
D
 
E
R
 
I
K
 
V
K
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
N
A
 
I
Q
 
H
M
 
Q
E
x
F
V
 
I
V
 
D
G
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
K
W
 
Y
-
 
N
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
x
Q
-
x
L
-
x
S
-
 
G
G
|
G
H
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
H
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
V
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7zk6A Abcb1 l335c mutant (mabcb1) in the outward facing state bound to 2 molecules of aac
32% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 949:1153/1177 of 7zk6A

query
sites
7zk6A
R
|
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
S
M
 
V
M
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
Q
 
E
A
 
I
E
 
K
G
 
Q
L
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
Q
M
 
W
V
 
L
M
 
R
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
I
I
 
V
-
 
S
-
x
Q
-
 
E
P
 
P
T
 
I
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
V
G
 
S
W
 
Y
I
 
E
D
 
E
R
 
I
K
 
V
K
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
N
A
 
I
Q
 
H
M
 
Q
E
 
F
V
 
I
V
 
D
G
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
K
W
 
Y
-
 
N
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
x
Q
-
 
L
-
x
S
-
x
G
G
|
G
H
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
H
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
V
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7zk5A Abcb1 l335c mutant (mabcb1) in the outward facing state bound to aac
32% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 949:1153/1177 of 7zk5A

query
sites
7zk5A
R
|
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
S
M
 
V
M
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
Q
 
E
A
 
I
E
 
K
G
 
Q
L
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
Q
M
 
W
V
 
L
M
 
R
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
I
I
 
V
-
 
S
-
x
Q
-
 
E
P
 
P
T
 
I
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
V
G
 
S
W
 
Y
I
 
E
D
 
E
R
 
I
K
 
V
K
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
N
A
 
I
Q
 
H
M
 
Q
E
 
F
V
 
I
V
 
D
G
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
K
W
 
Y
-
 
N
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
x
Q
-
x
L
-
x
S
-
 
G
G
|
G
H
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
H
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
V
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7zk4A The abcb1 l335c mutant (mabcb1) in the outward facing state
32% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 950:1154/1176 of 7zk4A

query
sites
7zk4A
R
|
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
S
M
 
V
M
 
F
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
Q
 
E
A
 
I
E
 
K
G
 
Q
L
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
Q
M
 
W
V
 
L
M
 
R
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
I
I
 
V
-
 
S
-
x
Q
-
 
E
P
 
P
T
 
I
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
V
G
 
S
W
 
Y
I
 
E
D
 
E
R
 
I
K
 
V
K
 
R
L
 
A
A
 
A
E
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
N
A
 
I
Q
 
H
M
 
Q
E
 
F
V
 
I
V
 
D
G
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
K
W
 
Y
-
 
N
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
x
Q
-
x
L
-
x
S
-
x
G
G
|
G
H
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
H
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
V
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
K
L
 
V

Sites not aligning to the query:

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
28% identity, 41% coverage: 13:228/522 of query aligns to 1:207/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
L
 
M
L
 
I
T
 
E
L
 
I
S
 
E
G
 
S
I
 
L
G
 
S
K
 
R
R
 
K
Y
 
W
A
 
K
A
 
N
P
 
F
V
 
S
L
 
L
D
 
D
G
 
N
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
K
L
 
V
R
 
E
P
 
S
G
 
G
Q
 
E
V
 
Y
L
 
F
A
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
L
L
 
F
S
 
L
K
 
E
I
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
G
L
 
F
V
 
H
D
 
V
A
 
P
S
 
D
A
 
S
G
 
G
G
 
R
M
 
I
M
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
P
 
D
Y
 
V
A
 
T
P
 
D
A
 
L
S
 
S
R
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
P
E
 
E
G
 
K
L
 
H
G
 
D
I
 
I
R
 
A
M
 
F
V
 
V
M
 
Y
Q
 
Q
E
 
N
L
 
Y
N
 
S
L
 
L
I
 
F
P
 
P
T
 
H
L
 
M
S
 
N
I
 
V
A
 
K
E
 
K
N
 
N
L
 
L
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
L
 
F
P
 
G
R
 
M
R
 
R
F
 
M
G
 
K
W
 
K
I
 
I
-
 
K
D
 
D
R
 
P
K
 
K
K
 
R
L
 
V
A
 
L
E
 
D
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
-
Q
 
D
M
 
L
E
 
K
V
 
I
V
 
E
G
 
H
L
 
L
G
 
L
E
 
D
L
 
R
D
 
N
P
 
P
W
 
L
T
 
T
P
 
L
V
 
S
G
 
G
D
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
G
H
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
S
 
N
C
 
P
R
 
K
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
P
R
 
R
E
 
T
V
 
Q
E
 
E
L
 
N
L
 
A
F
 
R
S
 
E
R
 
M
I
 
L
E
 
S
R
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
K
E
 
K
G
 
N
-
 
K
V
 
L
A
 
T
I
 
V
I
 
L
Y
 
H
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
D
L
 
Q
E
 
T
E
 
E
L
 
A
K
 
R
R
 
I
I
 
M
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
V
R
 
M
D
 
D
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7niwA Nanodisc reconstituted human abcb4 in complex with 4b1-fab (posaconazole-bound, inward-open conformation) (see paper)
32% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 935:1139/1140 of 7niwA

query
sites
7niwA
R
 
R
Y
 
A
A
 
N
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
 
S
G
 
G
A
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
T
M
 
V
M
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
Q
 
E
A
 
A
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
Q
M
 
W
V
 
L
M
 
R
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
I
I
 
V
-
 
S
-
 
Q
-
 
E
P
 
P
T
 
I
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
C
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
V
D
 
S
R
 
Q
K
 
D
K
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
M
 
-
E
 
N
V
 
I
V
 
H
G
 
P
L
 
F
G
 
I
E
 
E
L
 
T
D
 
L
P
 
P
W
 
H
-
 
K
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
 
S
-
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
Q
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
C
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
F
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
28% identity, 43% coverage: 13:234/522 of query aligns to 1:226/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
L
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
N
I
 
I
G
 
T
K
 
K
R
 
V
Y
 
F
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
A
 
T
A
 
I
P
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
D
 
H
L
 
V
R
 
P
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
Y
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
E
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
S
 
I
K
 
R
I
 
C
I
 
V
C
 
N
G
 
L
L
 
L
V
 
E
D
 
R
A
 
P
S
 
T
A
 
E
G
 
G
G
 
S
M
 
V
M
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
E
Y
 
L
A
 
T
P
 
T
A
 
L
S
 
S
R
 
E
T
 
S
Q
 
E
A
 
L
E
 
T
G
 
K
L
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
R
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
F
Q
 
Q
E
 
H
L
 
F
N
 
N
L
 
L
I
 
L
P
 
S
T
 
S
L
 
R
S
 
T
I
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
L
R
 
E
F
 
L
G
 
D
W
 
N
I
 
T
D
 
P
R
 
K
K
 
D
K
 
E
L
 
V
A
 
K
E
 
R
A
 
R
A
 
V
R
 
T
A
 
E
Q
 
L
M
 
L
E
 
S
V
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
D
L
 
K
D
 
H
P
 
D
W
 
S
T
 
Y
P
 
P
V
 
-
G
 
S
D
 
N
L
 
L
G
 
S
L
 
G
G
 
G
H
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
S
S
 
N
C
 
P
R
 
K
C
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
A
T
 
T
N
 
T
R
 
R
E
 
S
V
 
I
E
 
L
L
 
E
L
 
L
F
 
L
S
 
K
R
 
D
I
 
I
E
 
N
R
 
-
L
 
-
R
 
R
A
 
R
E
 
L
G
 
G
V
 
L
A
 
T
I
 
I
I
 
L
Y
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
E
L
 
M
E
 
D
E
 
V
L
 
V
K
 
K
R
 
R
I
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
I
 
V
V
 
A
V
 
V
L
 
I
R
 
S
D
 
N
G
 
G
K
 
E
L
 
L
V
 
I
C
 
E
N
 
Q
D
 
D
D
 
T
I
 
V
G
 
S

Sites not aligning to the query:

6s7pA Nucleotide bound abcb4 (see paper)
32% identity, 39% coverage: 22:227/522 of query aligns to 923:1127/1128 of 6s7pA

query
sites
6s7pA
R
|
R
Y
 
A
A
 
N
A
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
E
L
 
V
R
 
K
P
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
S
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
S
 
V
K
 
Q
I
 
L
I
 
L
C
 
E
G
 
R
L
 
F
V
 
Y
D
 
D
A
 
P
S
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
T
M
 
V
M
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
-
Q
 
E
A
 
A
E
 
K
G
 
K
L
 
L
G
 
N
I
 
V
R
 
Q
M
 
W
V
 
L
M
 
R
Q
 
A
E
 
Q
L
 
L
N
 
G
L
 
I
I
 
V
-
 
S
-
x
Q
-
 
E
P
 
P
T
 
I
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
C
S
 
S
I
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
L
 
I
F
 
A
L
 
Y
E
 
G
K
 
D
L
 
N
P
 
S
R
 
R
R
 
V
F
 
-
G
 
-
W
 
-
I
 
V
D
 
S
R
 
Q
K
 
D
K
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
Q
 
A
M
 
-
E
 
N
V
 
I
V
 
H
G
 
P
L
x
F
G
 
I
E
 
E
L
 
T
D
 
L
P
 
P
W
 
H
-
 
K
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
P
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
K
G
 
G
L
 
T
-
 
Q
-
 
L
-
x
S
-
x
G
G
 
G
H
x
Q
Q
 
K
Q
 
Q
M
 
R
V
 
I
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
R
S
 
Q
C
 
P
R
 
Q
C
 
I
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
M
 
A
L
 
L
T
 
D
N
 
T
R
 
E
E
 
S
V
 
E
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
Q
S
 
E
R
 
A
I
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
A
R
 
R
A
 
-
E
 
E
G
 
G
V
 
R
A
 
T
I
 
C
I
 
I
Y
 
V
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
E
 
S
E
 
T
L
 
I
K
 
Q
R
 
N
I
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
F
R
 
Q
D
 
N
G
 
G
K
 
R
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>HSERO_RS11485 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS11485
MQPNDSLSQGSPLLTLSGIGKRYAAPVLDGIDLDLRPGQVLALTGENGAGKSTLSKIICG
LVDASAGGMMLDGQPYAPASRTQAEGLGIRMVMQELNLIPTLSIAENLFLEKLPRRFGWI
DRKKLAEAARAQMEVVGLGELDPWTPVGDLGLGHQQMVEIARNLIGSCRCLILDEPTAML
TNREVELLFSRIERLRAEGVAIIYISHRLEELKRIADRIVVLRDGKLVCNDDIGRYSTEQ
LVQLMAGELTKVDLDAEHRRIGAPVLRIRGLGRAPVVHPASLALHAGEVLGIAGLIGSGR
TELLRLIFGADRAEQGEIFIGDSQEPARIRSPKDAVKAGIAMVTEDRKGQGLLLPQAISV
NTSLANLGSVSRGGMLDHAAESSVAQDYVKKLRIRSGSVAQAAGELSGGNQQKVVIARWL
YRDCPIMLFDEPTRGIDIGAKSDIYRLFAELAAQGKGLLVVSSDLRELMQICDRIAVMSA
GRIADTFSRDDWSQERILAAAFSGYVGRQEAAAAAHVAGNTA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory