SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS14940 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS14940 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9SIB9 Aconitate hydratase 3, mitochondrial; Aconitase 3; mACO1; Citrate hydro-lyase 3; EC 4.2.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
54% identity, 98% coverage: 13:900/903 of query aligns to 108:987/990 of Q9SIB9

query
sites
Q9SIB9
K
 
K
I
 
P
S
 
G
G
 
G
S
 
G
K
 
E
K
 
F
G
 
G
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
K
 
D
S
 
P
L
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
R
I
 
V
S
 
D
R
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
Y
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
S
V
 
A
L
 
I
R
 
R
N
 
N
C
 
C
D
 
D
G
 
N
Q
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
E
 
K
E
 
E
H
 
D
V
 
V
K
 
E
Q
 
K
L
 
I
A
 
I
N
 
D
W
 
W
G
 
E
A
 
K
K
 
T
A
 
S
A
 
P
R
 
K
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
I
 
I
P
 
P
F
 
F
V
 
K
V
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
C
M
 
M
R
 
R
N
 
D
V
 
A
A
 
M
S
 
N
K
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
S
N
 
D
P
 
S
K
 
N
N
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
H
 
V
F
 
A
R
 
R
E
 
S
K
 
E
K
 
N
A
 
A
L
 
V
D
 
Q
L
 
A
N
 
N
M
 
M
K
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
F
S
 
Q
R
 
R
N
 
N
N
 
K
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
A
F
 
F
M
 
L
K
 
K
W
 
W
G
 
G
M
 
S
Q
 
T
A
 
A
F
 
F
D
 
Q
T
 
N
F
 
M
G
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
G
R
 
R
G
 
V
V
 
V
H
 
F
N
 
N
K
 
T
T
 
K
G
 
G
V
 
L
Y
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
S
L
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
M
 
M
I
 
I
N
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
A
G
 
G
W
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
T
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
M
Y
 
S
F
 
M
L
 
V
T
 
L
P
 
P
D
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
F
N
 
K
L
 
L
T
 
A
G
 
G
A
 
K
L
 
M
R
 
R
E
 
N
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
T
 
H
K
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
E
 
N
G
 
G
T
 
M
E
 
S
S
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
N
M
 
M
A
 
S
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
M
 
M
G
 
G
F
 
F
F
 
F
P
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
H
A
 
V
T
 
T
I
 
L
E
 
Q
Y
 
Y
F
 
L
K
 
K
G
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
S
K
 
D
A
 
E
E
 
T
I
 
V
D
 
A
A
 
M
F
 
I
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
F
 
L
K
 
R
A
 
A
Q
 
N
E
 
N
L
 
M
-
 
F
-
 
V
-
 
D
Y
 
Y
G
 
N
V
 
E
P
 
P
K
 
Q
A
 
Q
G
 
D
Q
 
R
I
 
V
D
 
-
Y
 
Y
T
 
S
Q
 
S
E
 
Y
V
 
L
S
 
E
L
 
L
D
 
N
L
 
L
G
 
D
T
 
D
V
 
V
A
 
E
P
 
P
S
 
C
L
 
I
A
 
S
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
Q
 
H
D
 
D
R
 
R
I
 
V
E
 
T
I
 
L
G
 
K
N
 
E
V
 
M
K
 
K
S
 
A
T
 
D
F
 
W
S
 
H
D
 
S
L
 
C
F
 
L
T
 
D
K
 
S
P
 
K
T
 
V
A
 
G
E
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
A
-
 
I
-
 
P
K
 
K
K
 
E
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
L
 
K
G
 
V
A
 
V
S
 
N
Y
 
F
K
 
S
-
 
F
N
 
D
A
 
G
D
 
Q
G
 
P
V
 
A
D
 
E
L
 
L
H
 
K
N
 
H
G
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
S
C
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
C
E
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
A
 
K
P
 
P
H
 
W
I
 
I
K
 
K
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
E
 
L
A
 
K
A
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
Q
P
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
N
K
 
E
L
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
N
V
 
I
T
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
T
C
 
C
I
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
S
G
 
G
D
 
E
L
 
I
T
 
N
P
 
E
A
 
S
M
 
V
N
 
G
E
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
T
K
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
G
R
 
R
I
 
V
H
 
H
P
 
P
N
 
L
I
 
T
R
 
R
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
T
V
 
V
T
 
N
R
 
I
D
 
D
L
 
F
M
 
E
T
 
T
E
 
E
P
 
P
V
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
K
 
K
G
 
N
G
 
G
K
 
K
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
R
D
 
D
I
 
I
W
 
W
P
 
P
T
 
T
S
 
T
Q
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
A
K
 
E
L
 
V
L
 
V
K
 
Q
F
 
S
A
 
S
M
 
V
N
 
L
A
 
P
K
 
D
T
 
M
F
 
F
K
 
R
E
 
A
N
 
T
Y
 
Y
A
 
E
D
 
S
V
 
I
-
 
T
K
 
K
G
 
G
A
 
N
P
 
P
G
 
-
K
 
-
L
 
M
W
 
W
E
 
N
A
 
K
I
 
L
K
 
S
G
 
-
V
 
V
A
 
P
K
 
E
G
 
N
E
 
T
V
 
L
Y
 
Y
N
 
S
W
 
W
-
 
D
P
 
P
S
 
N
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
H
E
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
E
 
K
N
 
D
F
 
M
S
 
T
E
 
M
E
 
D
P
 
P
K
 
-
A
 
P
A
 
G
A
 
P
A
 
H
G
 
N
I
 
V
T
 
K
G
 
D
A
 
A
R
 
Y
A
 
C
L
 
L
G
 
L
V
 
N
F
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
S
I
 
I
T
 
T
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
K
 
Q
E
 
K
S
 
D
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
A
K
 
K
W
 
F
L
 
L
Q
 
M
A
 
E
N
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
D
K
 
R
A
 
K
D
 
D
F
 
F
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
G
N
 
N
H
 
D
E
 
E
I
 
I
M
 
M
M
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
I
R
 
R
I
 
I
K
 
V
N
 
N
L
 
K
M
 
L
I
 
M
P
 
N
A
 
G
K
 
E
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
V
G
 
G
G
 
P
I
 
K
T
 
T
I
 
V
H
 
H
Q
 
I
P
 
P
S
 
S
G
 
G
E
 
E
E
 
K
M
 
L
S
 
S
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
M
K
 
R
Y
 
Y
V
 
K
A
 
S
E
 
S
G
 
G
T
 
E
P
 
D
T
 
T
M
 
I
V
 
I
F
 
L
G
 
A
G
 
G
E
 
A
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
R
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
P
Q
 
M
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
K
S
 
S
F
 
F
E
 
E
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
I
L
 
I
P
 
P
L
 
L
Q
 
C
F
 
F
L
 
K
G
 
S
N
 
G
D
 
E
S
 
D
V
 
A
Q
 
D
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
H
E
 
E
-
 
R
-
 
Y
T
 
T
F
 
I
D
 
H
L
 
L
K
 
P
G
 
T
L
 
D
E
 
I
G
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
P
 
P
Q
 
G
Q
 
Q
E
 
D
A
 
V
T
 
T
L
 
V
V
 
T
I
 
T
H
 
-
R
 
-
K
 
D
N
 
N
G
 
G
E
 
-
T
 
-
K
 
K
E
 
S
V
 
F
K
 
T
L
 
C
L
 
T
L
 
V
R
 
R
I
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
E
I
 
V
E
 
E
V
 
L
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
K
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
L
 
I
R
 
R
Q
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P09339 Aconitate hydratase A; ACN; Aconitase; Aconitate/2-methylaconitate hydratase; Iron-responsive protein-like; IRP-like; RNA-binding protein; EC 4.2.1.3; EC 4.2.1.- from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
53% identity, 99% coverage: 2:899/903 of query aligns to 9:904/909 of P09339

query
sites
P09339
S
 
A
R
 
K
N
 
D
T
 
V
L
 
F
N
 
Q
T
 
A
L
 
R
K
 
K
E
 
T
F
 
F
K
 
T
I
 
T
S
 
N
G
 
G
S
 
-
K
 
K
K
 
T
G
 
Y
K
 
H
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
P
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
K
 
D
S
 
S
L
 
G
G
 
I
V
 
G
N
 
K
I
 
V
S
 
S
R
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
Y
S
 
S
I
 
I
R
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
S
V
 
V
L
 
L
R
 
R
N
 
Q
C
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
F
K
 
V
V
 
I
T
 
K
E
 
K
E
 
E
H
 
H
V
 
V
K
 
E
Q
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
K
W
 
W
G
 
G
A
 
T
K
 
A
A
 
E
A
 
L
R
 
K
V
 
D
D
 
I
E
 
D
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
K
V
 
P
A
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
L
R
 
R
N
 
K
V
 
A
A
 
M
S
 
A
K
 
A
L
 
V
G
 
G
K
 
G
N
 
D
P
 
P
K
 
D
N
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
P
L
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
H
 
K
F
 
A
R
 
G
E
 
T
K
 
E
K
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
A
L
 
V
N
 
N
M
 
M
K
 
D
L
 
L
E
 
E
F
 
F
S
 
E
R
 
R
N
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
K
F
 
F
M
 
L
K
 
S
W
 
W
G
 
A
M
 
K
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
N
T
 
N
F
 
Y
G
 
Q
V
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
A
F
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
S
G
 
V
V
 
V
H
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
E
N
 
D
K
 
G
T
 
E
G
 
L
V
 
V
Y
 
T
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
M
 
M
I
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
S
Y
 
Y
F
 
F
L
 
P
T
 
V
P
 
P
D
 
E
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
K
L
 
L
T
 
V
G
 
G
A
 
K
L
 
L
R
 
P
E
 
N
G
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
L
V
 
A
L
 
L
T
 
K
I
 
V
T
 
T
E
 
Q
L
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
T
 
K
K
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
F
 
F
F
 
F
G
 
G
E
 
P
G
 
G
T
 
I
E
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
P
L
 
L
T
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
N
M
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
M
 
C
G
 
G
F
 
F
F
 
F
P
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
E
T
 
A
I
 
L
E
 
N
Y
 
Y
F
 
L
K
 
R
G
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
D
K
 
P
A
 
E
E
 
H
I
 
I
D
 
D
A
 
V
F
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
F
 
C
K
 
R
A
 
S
Q
 
N
E
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
Y
V
 
T
P
 
P
K
 
D
A
 
A
G
 
E
Q
 
D
I
 
P
D
 
Q
Y
 
F
T
 
T
Q
 
D
E
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
S
T
 
Q
V
 
I
A
 
E
P
 
A
S
 
N
L
 
L
A
 
S
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
R
 
L
I
 
I
E
 
P
I
 
L
G
 
S
N
 
A
V
 
M
K
 
Q
S
 
E
T
 
T
F
 
F
S
 
K
D
 
K
L
 
Q
F
 
L
T
 
V
K
 
S
P
 
P
T
 
A
A
 
G
E
 
N
N
 
Q
G
 
G
F
 
F
N
 
G
K
 
L
K
 
N
A
 
A
E
 
E
D
 
E
L
 
E
G
 
N
A
 
K
S
 
E
Y
 
I
K
 
K
-
 
F
-
 
K
-
 
L
-
 
L
N
 
N
A
 
G
D
 
E
G
 
E
V
 
T
D
 
V
L
 
M
H
 
K
N
 
T
G
 
G
D
 
A
V
 
I
L
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
S
C
|
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
P
P
 
N
H
 
Y
I
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
V
A
 
N
A
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
L
 
M
E
 
K
K
 
E
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
N
V
 
L
T
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
T
C
 
C
I
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
S
G
 
G
D
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
A
 
E
M
 
I
N
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
V
V
 
A
K
 
K
N
 
N
D
 
D
V
 
L
V
 
L
A
 
I
A
 
T
A
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
H
P
 
P
N
 
L
I
 
V
R
 
K
A
 
G
N
 
N
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
T
V
 
V
T
 
N
R
 
I
D
 
N
L
 
L
M
 
K
T
 
T
E
 
D
P
 
P
V
 
I
G
 
G
K
 
V
G
 
G
K
 
K
G
 
D
G
 
G
K
 
Q
D
 
N
I
 
V
Y
 
Y
L
 
F
G
 
N
D
 
D
I
 
I
W
 
W
P
 
P
T
 
S
S
 
M
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
N
K
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
F
 
Q
A
 
T
M
 
V
N
 
T
A
 
P
K
 
E
T
 
L
F
 
F
K
 
R
E
 
K
N
 
E
Y
 
Y
A
 
E
D
 
T
V
 
V
K
 
F
G
 
D
A
 
D
P
 
-
G
 
N
K
 
K
L
 
R
W
 
W
E
 
N
A
 
E
I
 
I
K
 
E
G
 
T
V
 
T
A
 
D
K
 
E
G
 
A
E
 
-
V
 
L
Y
 
Y
N
 
K
W
 
W
P
 
D
S
 
N
-
 
D
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
Q
E
 
N
P
 
P
P
 
P
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
E
F
 
M
S
 
S
E
 
V
E
 
E
P
 
P
K
 
-
A
 
G
A
 
K
A
 
V
A
 
E
G
 
P
I
 
L
T
 
K
G
 
G
A
 
L
R
 
R
A
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
K
F
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
S
I
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
K
 
G
E
 
K
S
 
D
S
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
W
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
A
 
E
N
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
S
K
 
P
A
 
R
D
 
D
F
 
F
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
G
N
 
N
H
 
H
E
 
E
I
 
V
M
 
M
M
 
M
R
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
I
R
|
R
I
 
I
K
 
K
N
 
N
L
 
Q
M
 
I
I
 
A
P
 
P
A
 
G
K
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
-
V
 
T
E
 
E
G
 
G
G
 
G
I
 
F
T
 
T
I
 
T
H
 
Y
Q
 
W
P
 
P
S
 
T
G
 
G
E
 
E
E
 
V
M
 
T
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
C
M
 
M
K
 
K
Y
 
Y
V
 
K
A
 
E
E
 
D
G
 
K
T
 
T
P
 
G
T
 
L
M
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
A
G
 
G
E
 
K
E
 
D
Y
 
Y
G
 
G
T
 
M
G
 
G
S
 
S
S
 
S
R
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
R
A
 
T
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
E
S
 
S
F
 
F
E
 
E
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
F
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
K
G
 
Q
N
 
G
D
 
E
S
 
N
V
 
A
Q
 
D
S
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
K
E
 
E
T
 
V
F
 
I
D
 
E
L
 
V
K
 
D
G
 
-
L
 
V
E
 
D
G
 
E
E
 
T
I
 
V
K
 
R
P
 
P
Q
 
R
Q
 
D
E
 
L
A
 
V
T
 
T
L
 
V
V
 
R
I
 
A
H
 
I
R
 
N
K
 
E
N
 
D
G
 
G
E
 
N
T
 
V
K
 
T
E
 
T
V
 
F
K
 
E
L
 
A
L
 
V
L
 
V
R
 
R
I
 
F
D
 
D
T
 
S
P
 
E
I
 
V
E
 
E
V
 
I
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
K
 
R
H
 
H
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
Q
F
 
M
V
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

A0QX20 Aconitate hydratase A; ACN; Aconitase; (2R,3S)-2-methylisocitrate dehydratase; (2S,3R)-3-hydroxybutane-1,2,3-tricarboxylate dehydratase; Iron-responsive protein-like; IRP-like; Probable 2-methyl-cis-aconitate hydratase; RNA-binding protein; EC 4.2.1.3; EC 4.2.1.99 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
49% identity, 100% coverage: 3:903/903 of query aligns to 8:941/943 of A0QX20

query
sites
A0QX20
R
 
K
N
 
S
T
 
S
L
 
L
N
 
N
T
 
S
L
 
F
-
 
G
-
 
A
K
 
R
E
 
D
F
 
T
K
 
L
I
 
T
S
 
V
G
 
G
S
 
D
K
 
Q
K
 
S
G
 
Y
K
 
E
F
 
I
Y
 
Y
S
 
R
L
 
L
P
 
N
A
 
A
L
 
V
Q
 
P
K
 
G
S
 
T
L
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
I
 
-
S
 
E
R
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
Y
S
 
S
I
 
L
R
 
K
I
 
V
V
 
L
L
 
A
E
 
E
S
 
N
V
 
L
L
 
L
R
 
R
N
 
T
C
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
K
 
N
V
 
I
T
 
T
E
 
K
E
 
D
H
 
H
V
 
I
K
 
E
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
W
 
W
G
 
D
A
 
P
K
 
N
A
 
A
A
 
E
R
 
P
V
 
S
D
 
I
E
 
E
I
 
I
P
 
Q
F
 
F
V
 
T
V
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
M
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
C
L
 
I
A
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
T
M
 
M
R
 
R
N
 
E
V
 
A
A
 
V
S
 
A
K
 
A
L
 
L
G
 
G
K
 
G
N
 
D
P
 
P
K
 
N
N
 
K
I
 
V
E
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
A
P
 
P
V
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
D
 
D
H
 
V
F
 
F
R
 
G
E
 
N
K
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
F
D
 
E
L
 
R
N
 
N
M
 
V
K
 
E
L
 
L
E
 
E
F
 
Y
S
 
E
R
 
R
N
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
F
 
F
M
 
L
K
 
R
W
 
W
G
 
G
M
 
Q
Q
 
G
A
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
D
F
 
F
G
 
K
V
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
I
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
T
V
 
V
H
 
M
N
 
V
K
 
R
T
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
C
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
M
 
M
I
 
V
N
 
N
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
A
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
Y
 
S
F
 
M
L
 
L
T
 
I
P
 
P
D
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
F
N
 
K
L
 
L
T
 
S
G
 
G
A
 
E
L
 
I
R
 
K
E
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
D
L
 
M
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
T
 
H
K
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
E
 
K
G
 
G
T
 
V
E
 
A
S
 
E
L
 
V
S
 
P
L
 
L
T
 
A
D
 
N
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
L
A
 
G
N
 
N
M
 
M
A
 
S
P
 
P
E
 
E
Y
 
F
G
 
G
A
 
S
T
 
T
M
 
A
G
 
A
F
 
I
F
 
F
P
 
P
V
 
I
D
 
D
D
 
E
A
 
E
T
 
T
I
 
I
E
 
N
Y
 
Y
F
 
L
K
 
R
G
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
K
 
D
A
 
E
E
 
Q
I
 
L
D
 
A
A
 
L
F
 
V
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
K
 
K
A
 
A
Q
 
Q
E
 
G
L
 
M
Y
 
W
G
 
H
V
 
D
P
 
P
K
 
E
A
 
R
G
 
E
Q
 
P
I
 
V
D
 
-
Y
 
F
T
 
S
Q
 
E
E
 
Y
V
 
L
S
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
I
A
 
S
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
I
 
I
E
 
E
I
 
L
G
 
T
N
 
D
V
 
A
K
 
K
S
 
N
T
 
A
F
 
F
-
 
R
S
x
K
D
 
D
L
 
I
F
 
H
T
 
N
-
 
Y
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
N
K
 
H
P
 
P
T
 
T
A
 
P
E
 
E
N
 
T
G
 
K
F
 
L
N
 
D
K
 
E
K
 
A
A
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
S
-
 
F
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
R
-
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
T
Y
 
G
K
 
R
N
 
P
A
 
T
D
 
N
G
 
P
V
 
V
D
 
L
L
 
V
H
 
H
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
D
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
D
N
 
H
G
 
G
D
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
C
 
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
L
K
 
T
V
 
T
A
 
K
P
 
P
H
 
W
I
 
V
K
 
K
T
 
T
S
 
N
L
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
Q
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
D
Y
 
Y
L
 
Y
E
 
N
A
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
W
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
G
 
Y
V
 
L
T
 
G
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
T
C
 
C
I
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
T
G
 
G
D
 
P
L
 
L
T
 
P
P
 
E
A
 
E
M
 
I
N
 
S
E
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
N
K
 
D
N
 
N
D
 
D
V
 
L
V
 
A
A
 
V
A
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
 
R
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
G
R
 
R
I
 
I
H
 
S
P
 
P
N
 
D
I
 
V
R
 
K
A
 
M
N
 
N
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
A
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
T
V
 
M
T
 
D
R
 
F
D
 
D
L
 
F
M
 
E
T
 
S
E
 
D
P
 
P
V
 
L
G
 
G
K
 
Q
G
 
D
K
 
S
G
 
E
G
 
G
K
 
N
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
R
D
 
D
I
 
I
W
 
W
P
 
P
T
 
S
S
 
A
Q
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
E
K
 
E
L
 
T
L
 
I
K
 
A
F
 
S
A
 
S
M
 
I
N
 
N
A
 
R
K
 
E
T
 
M
F
 
F
K
 
T
E
 
E
N
 
S
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
V
 
V
-
 
F
K
 
K
G
 
G
A
 
-
P
 
-
G
 
D
K
 
D
L
 
R
W
 
W
E
 
R
A
 
S
I
 
L
K
 
P
G
 
-
V
 
T
A
 
P
K
 
E
G
 
G
E
 
D
V
 
T
Y
 
F
N
 
E
W
 
W
-
 
D
P
 
P
S
 
A
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
I
 
V
A
 
R
E
 
K
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
E
 
D
N
 
G
F
 
M
S
 
P
E
 
A
E
 
E
P
 
P
K
 
E
A
 
-
A
 
P
A
 
V
A
 
S
G
 
D
I
 
I
T
 
K
G
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
A
V
 
L
F
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
S
I
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
P
S
 
G
S
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
A
K
 
Q
W
 
Y
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
E
K
 
R
A
 
K
D
 
D
F
 
Y
N
 
N
S
 
S
Y
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
G
N
 
N
H
 
H
E
 
E
I
 
V
M
 
M
M
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
I
R
 
R
I
 
L
K
 
R
N
 
N
L
 
Q
M
 
L
I
 
L
P
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
D
R
 
D
V
 
V
E
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
-
 
R
-
 
D
I
 
F
H
 
T
Q
 
Q
P
 
P
S
 
G
G
 
G
E
 
P
E
 
Q
M
 
A
S
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
A
 
S
M
 
E
K
 
N
Y
 
Y
V
 
K
A
 
K
E
 
A
G
 
G
T
 
I
P
 
P
T
 
L
M
 
V
V
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
K
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
G
 
G
S
 
S
S
 
S
R
 
R
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
T
R
 
E
S
 
S
F
 
F
E
 
E
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
L
 
P
G
 
A
N
 
G
D
 
E
S
 
S
V
 
A
Q
 
A
S
 
S
L
 
L
G
 
K
I
 
L
T
 
D
G
 
G
D
 
T
E
 
E
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
K
 
E
G
 
G
L
 
I
E
 
E
-
 
E
-
 
L
G
 
N
E
 
S
I
 
G
K
 
K
P
 
T
Q
 
P
Q
 
K
E
 
T
A
 
V
T
 
H
L
 
V
V
 
T
I
 
A
H
 
T
R
 
K
K
 
E
N
 
D
G
 
G
E
 
S
T
 
K
K
 
V
E
 
E
V
 
F
K
 
D
L
 
A
L
 
V
L
 
V
R
 
R
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
I
 
G
E
 
E
V
 
A
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y
K
 
R
H
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
Q
F
 
Y
V
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
N
L
 
M
L
 
L
A
 
K
A
 
S

2b3xA Structure of an orthorhombic crystal form of human cytosolic aconitase (irp1) (see paper)
50% identity, 97% coverage: 21:900/903 of query aligns to 19:886/888 of 2b3xA

query
sites
2b3xA
K
 
K
F
 
F
Y
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
N
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
K
 
D
S
 
S
L
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
R
I
 
Y
S
 
G
R
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
F
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
V
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
V
 
A
L
 
I
R
 
R
N
 
N
C
 
C
D
 
D
G
 
E
Q
 
F
K
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
K
E
 
Q
H
 
D
V
 
I
K
 
E
Q
 
N
L
 
I
A
 
L
N
 
H
W
 
W
G
 
N
A
 
V
K
 
T
A
 
Q
A
 
H
R
 
K
V
 
N
D
 
I
E
 
E
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
K
V
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
N
 
D
V
 
A
A
 
V
S
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
G
N
 
D
P
 
P
K
 
E
N
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
C
P
 
P
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
D
|
D
H
|
H
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
H
 
F
F
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
A
K
 
D
A
 
S
L
 
L
D
 
Q
L
 
K
N
 
N
M
 
Q
K
 
D
L
 
L
E
 
E
F
 
F
S
 
E
R
 
R
N
 
N
N
 
R
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
F
 
F
M
 
L
K
 
K
W
 
W
G
 
G
M
 
S
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
D
 
H
T
 
N
F
 
M
G
 
R
V
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
S
G
 
G
I
|
I
V
 
I
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
V
V
 
V
H
 
F
N
 
D
K
 
Q
T
 
D
G
 
G
V
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
|
D
S
 
S
H
|
H
T
 
T
T
 
T
M
 
M
I
 
I
N
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
Y
 
S
F
 
M
L
 
V
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
Y
N
 
R
L
 
L
T
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
P
R
 
H
E
 
P
G
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
K
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
F
 
F
F
 
F
G
 
G
E
 
P
G
 
G
T
 
V
E
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
I
T
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
N
M
 
M
A
 
C
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
M
 
A
G
 
A
F
 
F
F
 
F
P
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
V
T
 
S
I
 
I
E
 
T
Y
 
Y
F
 
L
K
 
V
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
D
K
 
E
A
 
E
E
 
K
I
 
L
D
 
K
A
 
Y
F
 
I
E
 
K
A
 
K
Y
 
Y
F
 
L
K
 
Q
A
 
A
Q
 
V
E
 
G
L
 
M
Y
 
F
G
 
R
-
 
D
-
 
F
V
 
N
P
 
D
K
 
P
A
 
S
G
 
Q
Q
 
D
I
 
P
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
V
P
 
P
S
 
C
L
 
C
A
 
S
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
I
 
V
G
 
S
N
 
D
V
 
M
K
 
K
S
 
K
T
 
D
F
 
F
S
 
E
D
 
S
L
 
C
F
 
L
T
 
G
K
 
A
P
 
K
T
 
Q
A
 
G
E
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
Q
K
 
V
K
 
A
A
 
P
E
 
E
D
 
H
L
 
H
G
 
N
A
 
D
S
 
H
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
I
Y
 
Y
K
 
D
N
 
N
A
 
T
D
 
E
G
 
-
V
 
F
D
 
T
L
 
L
H
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
S
C
|
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
N
V
 
V
A
 
M
P
 
P
H
 
Y
I
 
I
K
 
K
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
M
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
D
V
 
V
T
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
|
C
T
 
M
T
 
T
C
|
C
I
|
I
G
 
G
N
 
N
A
 
S
G
 
G
D
 
P
L
 
L
T
 
P
P
 
E
A
 
P
M
 
V
N
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
T
K
 
Q
N
 
G
D
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
|
N
R
|
R
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
G
R
 
R
I
 
V
H
 
H
P
 
P
N
 
N
I
 
T
R
 
R
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
T
V
 
I
T
 
R
R
 
I
D
 
D
L
 
F
M
 
E
T
 
K
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
K
 
V
G
 
N
K
 
A
G
 
K
G
 
G
K
 
Q
D
 
Q
I
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
K
D
 
D
I
 
I
W
 
W
P
 
P
T
 
T
S
 
R
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
K
 
A
L
 
V
L
 
E
K
 
R
F
 
Q
A
 
Y
M
 
V
N
 
I
A
 
P
K
 
G
T
 
M
F
 
F
K
 
K
E
 
E
N
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
D
 
K
V
 
I
K
 
E
G
 
T
A
 
V
P
 
-
G
 
N
K
 
E
L
 
S
W
 
W
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
-
G
 
A
V
 
T
A
 
P
K
 
S
G
 
D
E
 
K
V
 
L
Y
 
F
N
 
F
W
 
W
P
 
N
S
 
S
-
 
K
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
E
 
S
P
 
P
P
 
P
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
N
F
 
L
S
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
L
E
 
Q
E
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
S
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
T
 
V
G
 
D
A
 
A
R
 
Y
A
 
V
L
 
L
G
 
L
V
 
N
F
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
S
I
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
K
 
A
E
 
R
S
 
N
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
A
K
 
R
W
 
Y
L
 
L
Q
 
T
A
 
N
N
 
R
G
 
G
V
 
L
L
 
T
K
 
P
A
 
R
D
 
E
F
 
F
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
G
N
 
N
H
 
D
E
 
A
I
 
V
M
 
M
M
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
I
R
 
R
I
 
L
K
 
L
N
 
N
L
 
R
M
 
F
I
 
L
P
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
N
V
 
K
E
 
Q
G
 
A
G
 
P
I
 
Q
T
 
T
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
E
 
E
E
 
I
M
 
L
S
 
D
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
E
K
 
R
Y
 
Y
V
 
Q
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
T
 
L
P
 
P
T
 
L
M
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
A
G
 
G
E
 
K
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
|
S
S
 
S
R
|
R
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
P
Q
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
S
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
F
 
Y
L
 
L
G
 
P
N
 
G
D
 
E
S
 
N
V
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
T
 
R
F
 
Y
D
 
T
L
 
I
K
 
I
G
 
I
L
 
P
E
 
E
G
 
N
E
 
-
I
 
L
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
M
E
 
K
A
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
V
H
 
Q
R
 
V
K
 
K
N
 
L
G
 
D
E
 
T
T
 
G
K
 
K
E
 
T
V
 
F
K
 
Q
L
 
A
L
 
V
L
 
M
R
 
R
I
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
D
I
 
V
E
 
E
V
 
L
D
 
T
Y
 
Y
Y
 
F
K
 
L
H
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
N
F
 
Y
V
 
M
L
 
I
R
 
R
Q
 
K
L
 
M

P21399 Cytoplasmic aconitate hydratase; Aconitase; Citrate hydro-lyase; Ferritin repressor protein; Iron regulatory protein 1; IRP1; Iron-responsive element-binding protein 1; IRE-BP 1; EC 4.2.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
50% identity, 97% coverage: 21:900/903 of query aligns to 20:887/889 of P21399

query
sites
P21399
K
 
K
F
 
F
Y
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
N
A
 
K
L
 
L
Q
 
E
K
 
D
S
 
S
L
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
R
I
 
Y
S
 
G
R
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
F
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
V
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
V
 
A
L
 
I
R
 
R
N
 
N
C
 
C
D
 
D
G
 
E
Q
 
F
K
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
K
E
 
Q
H
 
D
V
 
I
K
 
E
Q
 
N
L
 
I
A
 
L
N
 
H
W
 
W
G
 
N
A
 
V
K
 
T
A
 
Q
A
 
H
R
 
K
V
 
N
D
 
I
E
 
E
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
K
V
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
A
L
 
V
A
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
N
 
D
V
 
A
A
 
V
S
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
G
N
 
D
P
 
P
K
 
E
N
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
P
L
 
V
V
 
C
P
 
P
V
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
D
 
D
H
 
H
S
 
S
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
H
 
F
F
 
N
R
 
R
E
 
R
K
 
A
K
 
D
A
 
S
L
 
L
D
 
Q
L
 
K
N
 
N
M
 
Q
K
 
D
L
 
L
E
 
E
F
 
F
S
 
E
R
 
R
N
 
N
N
 
R
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
F
 
F
M
 
L
K
 
K
W
 
W
G
 
G
M
 
S
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
D
 
H
T
 
N
F
 
M
G
 
R
V
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
I
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
V
V
 
V
H
 
F
N
 
D
K
 
Q
T
 
D
G
 
G
V
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
M
 
M
I
 
I
N
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
Y
 
S
F
 
M
L
 
V
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
Y
N
 
R
L
 
L
T
 
M
G
 
G
A
 
K
L
 
P
R
 
H
E
 
P
G
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
S
T
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
K
L
 
H
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
K
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
E
F
 
F
F
 
F
G
 
G
E
 
P
G
 
G
T
 
V
E
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
I
T
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
N
M
 
M
A
x
C
P
 
P
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
M
 
A
G
 
A
F
 
F
F
 
F
P
 
P
V
 
V
D
 
D
D
 
E
A
 
V
T
 
S
I
 
I
E
x
T
Y
 
Y
F
 
L
K
 
V
G
 
Q
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
D
K
 
E
A
 
E
E
 
K
I
 
L
D
 
K
A
 
Y
F
 
I
E
 
K
A
 
K
Y
 
Y
F
 
L
K
 
Q
A
 
A
Q
 
V
E
 
G
L
 
M
Y
 
F
G
 
R
-
 
D
-
 
F
V
 
N
P
 
D
K
 
P
A
 
S
G
 
Q
Q
 
D
I
 
P
D
 
D
Y
 
F
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
V
 
V
S
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
V
P
 
P
S
 
C
L
 
C
A
 
S
G
 
G
P
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
R
 
K
I
 
V
E
 
A
I
 
V
G
 
S
N
 
D
V
 
M
K
 
K
S
 
K
T
 
D
F
 
F
S
 
E
D
 
S
L
 
C
F
 
L
T
 
G
K
 
A
P
 
K
T
 
Q
A
 
G
E
 
F
N
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
Q
K
 
V
K
 
A
A
 
P
E
 
E
D
 
H
L
 
H
G
 
N
A
 
D
S
 
H
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
I
Y
 
Y
K
 
D
N
 
N
A
 
T
D
 
E
G
 
-
V
 
F
D
 
T
L
 
L
H
 
A
N
 
H
G
 
G
D
 
S
V
 
V
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
S
C
|
C
T
 
T
N
 
N
T
 
T
S
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
S
V
 
V
L
 
M
L
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
K
 
N
V
 
V
A
 
M
P
 
P
H
 
Y
I
 
I
K
 
K
T
 
T
S
 
S
L
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
E
 
Q
A
 
E
A
 
S
G
 
G
L
 
V
L
 
M
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
E
 
S
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
D
V
 
V
T
 
V
A
 
G
Y
 
Y
G
 
G
C
|
C
T
 
M
T
 
T
C
|
C
I
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
S
G
 
G
D
 
P
L
 
L
T
 
P
P
 
E
A
 
P
M
 
V
N
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
I
V
 
T
K
 
Q
N
 
G
D
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
R
|
R
N
 
N
F
 
F
E
 
E
A
 
G
R
|
R
I
 
V
H
 
H
P
 
P
N
 
N
I
 
T
R
 
R
A
 
A
N
 
N
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
T
V
 
I
T
 
R
R
 
I
D
 
D
L
 
F
M
 
E
T
 
K
E
 
E
P
 
P
V
 
L
G
 
G
K
 
V
G
 
N
K
 
A
G
 
K
G
 
G
K
 
Q
D
 
Q
I
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
K
D
 
D
I
 
I
W
 
W
P
 
P
T
 
T
S
 
R
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
E
 
Q
K
 
A
L
 
V
L
 
E
K
 
R
F
 
Q
A
 
Y
M
 
V
N
 
I
A
 
P
K
 
G
T
 
M
F
 
F
K
 
K
E
 
E
N
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
D
 
K
V
 
I
K
 
E
G
 
T
A
 
V
P
 
-
G
 
N
K
 
E
L
 
S
W
 
W
E
 
N
A
 
A
I
 
L
K
 
-
G
 
A
V
 
T
A
 
P
K
 
S
G
 
D
E
 
K
V
 
L
Y
 
F
N
 
F
W
 
W
P
 
N
S
 
S
-
 
K
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
E
 
S
P
 
P
P
 
P
F
 
F
F
 
F
E
 
E
N
 
N
F
 
L
S
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
L
E
 
Q
E
 
P
P
 
P
K
 
K
A
 
S
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
I
T
 
V
G
 
D
A
 
A
R
 
Y
A
 
V
L
 
L
G
 
L
V
 
N
F
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
S
I
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
D
H
 
H
I
 
I
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
N
I
 
I
K
 
A
E
 
R
S
 
N
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
A
K
 
R
W
 
Y
L
 
L
Q
 
T
A
 
N
N
x
R
G
 
G
V
 
L
L
 
T
K
 
P
A
 
R
D
 
E
F
 
F
N
 
N
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
R
 
R
R
 
R
G
 
G
N
 
N
H
 
D
E
 
A
I
 
V
M
 
M
M
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
V
 
I
R
 
R
I
 
L
K
 
L
N
 
N
L
 
R
M
 
F
I
 
L
P
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
R
 
N
V
 
K
E
 
Q
G
 
A
G
 
P
I
 
Q
T
 
T
I
 
I
H
 
H
Q
 
L
P
 
P
S
 
S
G
 
G
E
 
E
E
 
I
M
 
L
S
 
D
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
M
 
E
K
 
R
Y
 
Y
V
 
Q
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
T
 
L
P
 
P
T
 
L
M
 
I
V
 
V
F
 
L
G
 
A
G
 
G
E
 
K
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
|
S
S
 
S
R
|
R
D
 
D
W
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
T
 
P
Q
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
K
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
S
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
I
 
I
H
 
H
R
 
R
S
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
L
 
I
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
F
 
Y
L
 
L
G
 
P
N
 
G
D
 
E
S
 
N
V
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
T
 
R
F
 
Y
D
 
T
L
 
I
K
 
I
G
 
I
L
 
P
E
 
E
G
 
N
E
 
-
I
 
L
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
M
E
 
K
A
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
I
 
V
H
 
Q
R
 
V
K
 
K
N
 
L
G
 
D
E
 
T
T
 
G
K
 
K
E
 
T
V
 
F
K
 
Q
L
 
A
L
 
V
L
 
M
R
 
R
I
 
F
D
 
D
T
 
T
P
 
D
I
 
V
E
 
E
V
 
L
D
 
T
Y
 
Y
Y
 
F
K
 
L
H
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
I
L
 
L
P
 
N
F
 
Y
V
 
M
L
 
I
R
 
R
Q
 
K
L
 
M

3snpA Crystal structure analysis of iron regulatory protein 1 in complex with ferritin h ire RNA (see paper)
49% identity, 97% coverage: 21:900/903 of query aligns to 19:848/850 of 3snpA

query
sites
3snpA
K
 
K
F
 
F
Y
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
N
A
 
K
L
 
L
Q
 
D
K
 
Y
S
 
S
L
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
R
I
 
Y
S
 
G
R
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
F
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
V
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
V
 
A
L
 
V
R
 
R
N
 
N
C
 
C
D
 
D
G
 
K
Q
 
F
K
 
L
V
 
V
T
 
K
E
 
K
E
 
E
H
 
D
V
 
I
K
 
E
Q
 
N
L
 
I
A
 
L
N
 
N
W
 
W
G
 
N
A
 
V
K
 
T
A
 
Q
A
 
H
R
 
M
V
 
N
D
 
I
E
 
E
I
 
V
P
 
P
F
 
F
V
 
K
V
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
T
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
S
L
 
V
A
 
V
D
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
N
 
D
V
 
A
A
 
V
S
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
K
 
G
N
 
D
P
 
P
K
 
E
N
 
K
I
 
I
E
 
N
P
 
P
L
 
I
V
 
C
P
 
P
V
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
I
D
|
D
H
|
H
S
|
S
V
 
-
Q
 
-
I
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
R
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
E
R
 
R
N
 
N
N
 
R
E
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
F
 
F
M
 
L
K
 
K
W
 
W
G
 
G
M
 
S
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
R
T
 
N
F
 
M
G
 
R
V
 
I
V
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
F
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
I
H
 
H
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
V
V
 
V
H
 
F
N
 
D
K
 
Q
T
 
D
G
 
G
V
 
Y
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
T
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
|
D
S
 
S
H
|
H
T
 
T
T
 
T
M
 
M
I
 
I
N
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
W
 
W
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
A
G
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
Y
 
S
F
 
M
L
 
V
T
 
L
P
 
P
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
G
V
 
Y
N
 
R
L
 
L
T
 
M
G
 
G
A