SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS17235 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS17235 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:257/261 of query aligns to 5:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
Q
 
K
K
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
A
T
 
A
A
 
R
A
 
V
F
 
F
V
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
H
 
V
I
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
F
S
 
N
E
 
E
D
 
-
F
 
-
L
 
A
A
 
A
S
 
G
A
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
V
F
 
E
G
 
A
H
 
N
A
 
P
P
 
G
V
 
V
S
 
V
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
T
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
S
 
D
E
 
R
R
 
E
E
 
S
V
 
V
D
 
H
A
 
R
M
 
L
F
 
V
A
 
E
D
 
N
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
W
 
F
S
 
-
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
G
 
-
P
 
R
T
x
D
S
 
S
P
 
M
V
 
L
E
 
S
E
x
K
V
 
M
A
 
T
L
 
V
S
 
D
D
 
Q
W
 
F
D
 
Q
Q
 
Q
T
 
V
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
P
L
 
Y
L
 
M
K
 
A
K
 
E
N
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
L
 
Y
G
 
G
F
x
N
A
x
V
L
 
G
R
x
Q
T
 
T
P
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
S
 
K
H
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
I
x
F
V
x
T
E
 
E
G
x
T
A
 
A
R
x
M
Q
 
V
E
 
A
R
 
E
I
 
V
V
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
P
E
 
E
E
 
K
M
 
V
R
 
I
Q
 
E
R
x
K
L
 
M
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
V
 
V
S
 
P
L
 
M
R
 
G
K
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
V
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
H
A
 
E
G
 
S
A
 
D
S
 
Y
I
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
H
S
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
C
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
I

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 97% coverage: 3:255/261 of query aligns to 1:243/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
M
N
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
Q
 
K
K
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
I
 
I
T
 
A
A
 
I
A
 
N
F
 
L
V
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
I
H
 
F
I
 
F
C
x
N
D
x
Y
V
x
N
S
x
G
E
x
S
D
 
P
F
 
E
L
 
A
A
 
A
S
 
E
A
 
E
R
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
L
-
 
V
-
 
A
G
 
E
H
 
H
A
 
G
-
 
V
P
 
E
V
 
V
S
 
E
Y
 
A
S
 
M
R
 
K
T
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
S
 
I
E
 
A
R
 
E
E
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
F
F
 
F
A
 
K
D
 
Q
L
 
A
A
 
I
Q
 
E
R
 
R
W
 
F
S
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
A
 
T
G
 
-
P
 
R
T
 
D
S
 
N
P
 
L
V
 
L
E
 
M
E
 
R
V
 
M
A
 
K
L
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
D
Q
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
R
 
A
A
 
V
V
 
S
P
 
R
L
 
T
L
 
M
K
 
M
K
 
K
N
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
L
 
I
G
 
G
F
 
N
A
 
A
L
 
G
R
x
Q
T
 
A
P
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
W
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
S
 
R
H
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
I
 
F
V
x
I
E
 
T
G
x
T
A
 
D
R
 
M
Q
 
T
E
 
D
R
 
K
I
 
L
V
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
D
E
 
E
E
 
K
M
 
T
R
 
K
Q
 
E
R
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
V
 
I
S
 
P
L
 
L
R
 
G
K
 
A
M
 
Y
V
 
G
T
 
T
A
 
T
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
Q
 
A
V
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
G
 
S
A
 
K
S
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
C
 
D
G
 
G

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:255/261 of query aligns to 3:243/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
K
 
E
D
 
G
Q
 
K
K
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
T
I
 
I
T
 
A
A
 
L
A
 
T
F
 
Y
V
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
V
H
 
V
I
 
V
C
 
S
D
|
D
V
x
I
S
 
S
E
 
D
D
 
E
F
 
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
L
A
 
I
R
 
E
A
 
G
R
 
K
F
 
G
G
 
G
H
 
K
A
 
A
P
 
V
V
 
-
S
 
-
Y
 
F
S
 
Q
R
 
H
T
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
S
 
H
E
 
P
R
 
E
E
 
D
V
 
H
D
 
D
A
 
E
M
 
L
F
 
I
A
 
A
D
 
-
L
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
W
 
A
S
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
S
G
|
G
P
 
E
T
 
F
S
 
T
P
 
P
V
 
T
E
 
A
E
 
E
V
 
T
A
 
T
L
 
D
S
 
A
D
 
Q
W
 
W
D
 
Q
Q
x
R
T
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
G
T
 
V
R
 
R
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
P
 
R
L
 
A
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
G
F
 
I
A
 
E
L
 
G
R
x
I
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
S
 
K
H
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
L
 
G
P
|
P
G
x
A
I
 
F
V
x
I
E
 
N
G
x
T
A
 
T
R
 
L
Q
 
V
E
 
Q
R
 
N
I
 
V
V
 
P
A
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
E
M
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
S
 
Q
R
 
M
V
 
H
S
 
A
L
|
L
R
|
R
K
x
R
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
L
V
 
V
I
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
S
S
|
S
P
 
D
A
 
K
G
 
A
A
 
S
S
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
S
S
 
Y
L
 
Y
S
 
A
V
 
V
C
 
D
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:255/261 of query aligns to 3:243/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
K
 
E
D
 
G
Q
 
K
K
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
T
I
 
I
T
 
A
A
 
L
A
 
T
F
 
Y
V
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
V
H
 
V
I
 
V
C
 
S
D
|
D
V
x
I
S
 
S
E
 
D
D
 
E
F
x
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
L
A
 
I
R
 
E
A
 
G
R
 
K
F
 
G
G
 
G
H
 
K
A
 
A
P
 
V
V
 
-
S
 
-
Y
 
F
S
 
Q
R
 
H
T
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
S
 
H
E
 
P
R
 
E
E
 
D
V
 
H
D
 
D
A
 
E
M
 
L
F
 
I
A
 
A
D
 
-
L
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
W
 
A
S
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
x
S
G
|
G
P
x
E
T
 
F
S
x
T
P
 
P
V
 
T
E
 
A
E
|
E
V
 
T
A
x
T
L
 
D
S
 
A
D
x
Q
W
 
W
D
 
Q
Q
x
R
T
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
G
T
 
V
R
 
R
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
P
 
R
L
 
A
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
G
F
 
I
A
 
E
L
 
G
R
x
I
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
x
S
S
 
K
H
x
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
L
 
G
P
|
P
G
 
A
I
 
F
V
x
I
E
 
N
G
x
T
A
 
T
R
 
L
Q
 
V
E
 
Q
R
 
N
I
 
V
V
 
P
A
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
E
M
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
S
 
Q
R
 
M
V
 
H
S
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
L
V
 
V
I
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
D
A
 
K
G
 
A
A
 
S
S
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
x
S
S
x
Y
L
 
Y
S
 
A
V
 
V
C
 
D
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
33% identity, 96% coverage: 5:255/261 of query aligns to 3:243/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
K
 
E
D
 
G
Q
 
K
K
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
G
G
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
T
I
 
I
T
 
A
A
 
L
A
 
T
F
 
Y
V
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
V
H
 
V
I
 
V
C
 
S
D
 
D
V
 
I
S
 
S
E
 
D
D
 
E
F
 
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
L
A
 
I
R
 
E
A
 
G
R
 
K
F
 
G
G
 
G
H
 
K
A
 
A
P
 
V
V
 
-
S
 
-
Y
 
F
S
 
Q
R
 
H
T
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
A
S
 
H
E
 
P
R
 
E
E
 
D
V
 
H
D
 
D
A
 
E
M
 
L
F
 
I
A
 
A
D
 
-
L
 
A
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
W
 
A
S
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
S
G
 
G
P
 
E
T
 
F
S
 
T
P
 
P
V
 
T
E
 
A
E
 
E
V
 
T
A
 
T
L
 
D
S
 
A
D
 
Q
W
 
W
D
 
Q
Q
 
R
T
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
G
T
 
V
R
 
R
R
 
A
A
 
Q
V
 
I
P
 
R
L
 
A
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
G
F
 
I
A
 
E
L
 
G
R
x
I
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
I
 
W
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
S
S
 
K
H
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
L
 
G
P
|
P
G
x
A
I
 
F
V
 
I
E
 
N
G
 
T
A
 
T
R
 
L
Q
 
V
E
 
Q
R
 
N
I
 
V
V
 
P
A
 
L
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
E
M
 
T
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
S
 
Q
R
 
M
V
 
H
S
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
T
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
N
Q
 
L
V
 
V
I
 
A
F
 
W
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
D
A
 
K
G
 
A
A
 
S
S
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
S
S
 
Y
L
 
Y
S
 
A
V
 
V
C
 
D
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
33% identity, 93% coverage: 7:248/261 of query aligns to 4:236/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
D
 
D
Q
 
N
K
 
K
V
 
V
-
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
V
T
 
A
A
 
H
A
 
S
F
 
Y
V
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
H
 
I
I
 
V
C
 
S
D
|
D
V
x
I
S
 
N
E
 
E
D
 
D
F
 
H
L
 
G
A
 
N
S
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
G
G
 
G
H
 
E
A
 
A
P
 
-
V
 
-
S
 
S
Y
 
F
S
 
V
R
 
K
T
x
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
S
 
N
E
 
P
R
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
V
A
 
K
D
 
R
L
 
T
A
 
V
Q
 
E
R
 
I
W
 
Y
S
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
G
G
 
G
P
 
E
T
 
Q
S
 
A
P
 
L
V
 
A
E
 
G
E
 
D
V
 
Y
A
 
G
L
 
L
S
 
D
D
 
S
W
 
W
D
 
R
Q
 
K
T
 
V
L
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
Y
C
 
G
T
 
C
R
 
K
R
 
Y
A
 
E
V
 
L
P
 
E
L
 
Q
L
 
M
K
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
S
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
H
G
 
G
R
 
I
L
 
V
G
 
A
F
 
A
A
 
P
L
 
L
R
 
S
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
S
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
N
W
 
I
A
 
G
I
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
P
 
Q
S
 
K
H
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
G
P
|
P
G
x
A
I
x
Y
V
x
I
E
 
E
G
 
T
A
 
P
R
x
L
Q
 
L
E
 
E
R
 
S
I
 
L
V
 
T
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
K
E
 
E
M
 
M
R
 
K
Q
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
I
S
 
S
R
 
K
V
 
H
S
 
P
L
 
M
R
 
G
K
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
L
V
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
E
A
 
K
G
 
S
A
 
S
S
 
F
I
 
M
S
 
T
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 98% coverage: 1:255/261 of query aligns to 1:250/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
D
 
I
L
 
M
N
 
N
L
 
L
K
 
T
D
 
D
Q
 
K
K
 
T
V
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
I
 
A
T
 
V
A
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
E
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
H
 
N
V
 
V
H
 
V
I
 
V
C
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
D
E
 
E
D
 
A
F
 
Q
L
 
G
A
 
E
S
 
A
A
 
M
R
 
V
A
 
R
R
 
K
F
 
E
G
 
N
H
 
N
A
 
D
P
 
R
V
 
L
S
 
H
Y
 
F
S
 
V
R
 
Q
T
|
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
S
 
D
E
 
E
R
 
A
E
 
A
V
 
C
D
 
Q
A
 
H
M
 
A
F
 
V
A
 
E
D
 
S
L
 
A
A
 
V
Q
 
H
R
 
T
W
 
F
S
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
G
 
-
P
 
I
T
 
V
S
 
A
P
 
P
V
 
I
E
 
H
E
 
E
V
 
M
A
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
D
W
 
W
D
 
N
Q
 
K
T
 
V
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
M
F
 
F
L
 
L
C
 
M
T
 
S
R
 
K
R
 
H
A
 
A
V
 
L
P
 
K
L
 
H
L
 
M
K
 
L
K
 
A
N
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
C
S
|
S
V
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
L
L
 
V
G
 
A
F
 
W
A
 
P
L
 
D
R
 
I
T
 
P
P
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
D
L
 
Y
G
 
A
P
 
K
S
 
H
H
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
|
I
V
x
I
E
 
D
G
 
T
A
 
P
R
 
L
Q
 
N
E
 
E
R
 
K
I
 
S
V
 
F
A
 
L
A
 
E
K
 
N
A
 
N
A
 
E
A
 
G
Y
 
T
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
L
E
 
E
E
 
E
M
 
I
R
 
K
Q
 
K
R
 
E
L
 
K
L
 
A
S
 
K
R
 
V
V
 
N
S
 
P
L
 
L
R
 
L
K
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
Q
 
V
V
 
M
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
L
G
 
S
A
 
S
S
 
Y
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
S
S
 
A
L
 
I
S
 
T
V
 
A
C
 
D
G
 
G

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
36% identity, 98% coverage: 3:259/261 of query aligns to 3:257/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
F
N
 
D
L
 
L
K
 
S
D
 
G
Q
 
R
K
 
K
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
G
G
 
G
A
 
S
Q
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
D
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
V
 
V
H
 
A
I
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
-
E
 
-
D
 
D
F
 
V
L
 
M
A
 
A
S
 
A
A
 
Q
R
 
A
A
 
V
R
 
V
F
 
A
G
 
G
H
 
L
A
 
E
P
 
N
V
 
G
S
 
G
Y
 
F
S
 
A
-
 
V
R
 
E
T
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
T
S
 
K
E
 
R
R
 
A
E
 
S
V
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
A
F
 
M
A
 
Q
D
 
K
L
 
A
A
 
I
Q
 
D
R
 
A
W
 
L
S
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
F
D
 
D
V
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
A
 
S
G
 
-
P
 
T
T
 
M
S
 
R
P
 
P
V
 
A
E
 
V
E
 
D
V
 
I
A
 
T
L
 
D
S
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
D
Q
 
F
T
 
N
L
 
F
A
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
A
T
 
R
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
T
 
N
R
 
Q
R
 
I
A
 
A
V
 
C
-
 
R
P
 
H
L
 
F
L
 
L
K
 
A
K
 
S
N
 
N
G
 
T
G
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
V
G
 
G
F
 
A
A
 
P
L
 
L
R
x
L
T
 
A
P
 
H
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
F
G
 
A
V
 
V
I
 
F
G
 
G
L
 
W
T
 
T
E
 
Q
T
 
A
W
 
L
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
M
G
 
A
P
 
P
S
 
K
H
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
|
G
I
 
F
V
|
V
E
 
K
G
x
T
A
 
A
R
x
M
Q
 
Q
E
 
E
R
 
R
I
 
E
V
 
I
A
 
I
A
 
W
K
x
E
A
 
A
A
 
E
A
 
L
Y
 
R
G
 
G
I
 
M
G
 
T
H
 
P
E
 
E
E
 
A
M
 
V
R
 
R
Q
 
A
R
 
E
L
 
Y
L
 
V
S
 
S
R
 
L
V
 
T
S
 
P
L
 
L
R
 
G
K
 
R
M
 
I
V
 
E
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
D
Q
 
V
V
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
G
 
A
A
 
R
S
 
F
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
G
L
 
I
S
 
N
V
 
V
C
 
T
G
 
G
N
 
G
V
 
V
E
 
R
V
 
M

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:255/261 of query aligns to 2:250/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
K
 
K
D
 
G
Q
 
K
K
 
T
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
I
 
I
T
 
A
A
 
Q
A
 
V
F
 
L
V
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
I
H
 
V
I
 
L
C
 
N
D
 
G
V
x
F
S
 
G
E
 
D
D
 
P
F
 
A
L
 
P
A
 
A
S
 
L
A
 
A
R
 
E
-
 
I
A
 
A
R
 
R
F
 
H
G
 
G
H
 
V
A
 
K
P
 
A
V
 
V
S
 
H
Y
 
H
S
 
P
R
 
-
T
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
S
S
 
D
E
 
V
R
 
A
E
 
Q
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
D
 
-
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
W
 
E
S
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
V
S
 
A
P
 
P
V
 
V
E
 
E
E
 
Q
V
 
F
A
 
P
L
 
L
S
 
E
D
 
S
W
 
W
D
 
D
Q
 
K
T
 
I
L
 
I
A
 
A
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
P
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
G
T
 
T
R
 
R
R
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
L
 
G
L
 
M
K
 
R
K
 
A
N
 
R
G
 
N
G
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
H
G
 
G
R
 
L
L
 
V
G
 
G
F
 
S
A
 
T
L
 
G
R
 
K
T
 
A
P
 
A
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
V
W
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
T
S
 
S
H
 
N
I
 
V
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
x
W
V
|
V
E
 
L
G
x
T
A
 
P
R
x
L
Q
x
V
E
 
Q
R
 
K
I
 
Q
V
 
I
A
 
D
A
 
D
K
x
R
A
 
A
A
 
A
A
 
N
Y
 
G
G
 
G
I
 
D
G
 
P
H
 
L
E
 
Q
E
 
A
M
 
Q
R
 
H
Q
 
D
R
 
L
L
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
K
V
 
Q
S
 
P
L
 
S
R
 
L
K
 
A
M
 
F
V
 
V
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
H
I
 
L
A
 
G
N
 
E
Q
 
L
V
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
Q
I
 
V
S
 
R
G
 
G
Q
 
A
S
 
A
L
 
W
S
 
N
V
 
V
C
 
D
G
 
G

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:257/261 of query aligns to 6:236/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
Q
 
K
K
 
G
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
A
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
A
E
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
L
V
 
V
H
 
A
I
 
L
C
 
C
D
|
D
V
x
L
S
x
R
E
 
P
D
 
E
F
 
G
L
 
K
A
 
E
S
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
I
F
 
G
G
 
G
H
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
A
Y
 
F
S
 
F
R
 
Q
T
x
V
D
|
D
V
x
L
S
 
E
S
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
-
D
 
R
A
 
V
M
 
R
F
 
F
A
 
V
D
 
E
L
 
E
A
 
A
Q
 
A
R
 
Y
W
 
A
S
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
A
 
A
G
 
A
P
 
P
T
 
G
S
 
S
P
 
A
V
 
L
E
 
T
E
 
-
V
 
V
A
 
R
L
 
L
S
 
P
D
 
E
W
 
W
D
 
R
Q
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
A
P
 
P
F
 
M
L
 
H
C
 
L
T
 
S
R
 
A
R
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
R
L
 
E
L
 
M
K
 
R
K
 
K
N
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
Q
G
 
G
R
 
L
L
 
F
G
 
A
F
 
E
A
 
Q
L
 
E
R
x
N
T
 
A
P
 
A
Y
|
Y
S
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
R
T
 
S
W
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
D
L
 
L
G
 
A
P
 
P
S
 
L
H
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
A
V
x
I
E
 
A
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
x
T
E
 
E
R
x
A
I
x
V
V
 
L
A
 
E
A
 
A
K
 
I
A
 
A
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
-
E
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
R
Q
 
R
R
 
D
L
 
W
L
 
E
S
 
D
R
 
L
V
 
H
S
 
A
L
 
L
R
 
R
K
 
R
M
 
L
V
 
G
T
 
K
A
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
A
V
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
E
A
 
K
G
 
A
A
 
S
S
 
F
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
S
 
I
L
 
L
S
 
P
V
 
V
C
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
M

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 97% coverage: 3:255/261 of query aligns to 1:241/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
x
M
N
 
G
L
 
I
K
 
Q
D
 
N
Q
 
R
K
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
G
G
 
S
A
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
L
 
K
A
 
Q
I
 
T
T
 
A
A
 
L
A
 
R
F
 
F
V
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
V
H
 
V
I
 
I
C
 
N
D
|
D
V
 
I
S
 
D
E
 
A
D
 
E
F
 
K
L
 
V
A
 
R
S
 
A
A
 
T
R
 
V
A
 
D
R
 
E
F
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
-
P
 
R
V
 
V
S
 
L
Y
 
G
S
 
A
R
 
V
T
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
R
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
F
 
V
A
 
K
D
 
Q
L
 
T
A
 
I
Q
 
D
R
 
A
W
 
F
S
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
-
 
E
-
 
R
A
 
A
G
 
G
P
 
A
T
 
L
S
 
R
P
 
K
V
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
Q
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
V
 
H
P
 
G
L
 
H
L
 
M
K
 
V
K
 
E
N
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
G
A
 
A
L
 
G
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
S
 
A
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
 
I
E
 
H
G
 
T
A
 
P
R
 
M
Q
 
W
E
 
D
R
 
E
I
 
L
V
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
P
E
 
E
E
 
K
M
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
V
 
Q
S
 
P
L
 
T
R
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
Q
 
T
V
 
L
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
D
G
 
S
A
 
G
S
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
C
 
C
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 96% coverage: 5:255/261 of query aligns to 2:240/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
K
 
Q
D
 
N
Q
 
R
K
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
L
 
K
A
 
Q
I
 
T
T
 
A
A
 
L
A
 
R
F
 
F
V
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
V
H
 
V
I
 
I
C
 
N
D
|
D
V
x
I
S
 
D
E
 
A
D
 
E
F
 
K
L
 
V
A
 
R
S
 
A
A
 
T
R
 
V
A
 
D
R
 
E
F
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
H
 
H
A
 
-
P
 
R
V
 
V
S
 
L
Y
 
G
S
 
A
R
 
V
T
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
S
 
N
E
 
K
R
 
A
E
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
G
M
 
M
F
 
V
A
 
K
D
 
Q
L
 
T
A
 
I
Q
 
D
R
 
A
W
 
F
S
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
-
 
E
-
 
R
A
 
A
G
 
G
P
 
A
T
 
L
S
 
R
P
 
K
V
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
Q
 
V
T
 
T
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
P
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
V
 
H
P
 
G
L
 
H
L
 
M
K
 
V
K
 
E
N
 
N
G
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
V
 
R
A
 
A
G
 
-
R
 
W
L
 
L
G
 
G
F
 
G
A
 
A
L
 
G
R
 
Q
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
R
S
 
A
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
G
I
 
L
V
x
I
E
 
H
G
 
T
A
 
P
R
 
M
Q
 
W
E
 
D
R
 
E
I
 
L
V
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
P
E
 
E
E
 
K
M
 
D
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
V
 
Q
S
 
P
L
 
T
R
 
G
K
 
K
M
 
L
V
 
G
T
 
E
A
 
P
E
 
D
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
Q
 
T
V
 
L
I
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
D
G
 
S
A
 
G
S
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
C
 
C
G
 
G

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
35% identity, 97% coverage: 6:257/261 of query aligns to 2:256/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
K
 
Q
D
 
D
Q
 
S
K
 
E
V
 
V
-
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
T
 
A
A
 
R
A
 
R
F
 
L
V
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
H
 
R
V
 
V
H
 
F
I
 
V
C
 
C
D
 
A
V
x
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
F
 
G
L
 
L
A
 
R
S
 
T
A
 
T
R
 
L
A
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
R
H
 
E
A
 
A
P
 
G
V
 
V
S
 
E
Y
 
A
S
 
D
-
 
G
R
 
R
T
 
T
-
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
R
S
 
S
E
 
V
R
 
P
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
W
 
Y
S
 
-
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
G
T
 
G
S
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
E
E
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
D
 
L
Q
 
D
T
 
V
L
 
V
A
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
V
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
A
 
V
V
 
L
P
 
K
L
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
R
G
 
G
G
 
T
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
V
A
 
V
L
 
H
R
 
A
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
A
W
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
S
 
T
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
|
V
E
 
E
G
x
T
A
 
P
R
 
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
S
I
 
V
V
 
R
A
 
E
A
 
H
K
x
Y
A
 
S
A
 
D
A
 
I
Y
 
W
G
 
E
I
 
V
G
 
S
H
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
A
R
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
L
 
T
S
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
P
L
 
I
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
E
 
S
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
M
V
 
V
I
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
C
 
C
G
 
G
N
 
G
V
 
L

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
35% identity, 97% coverage: 6:257/261 of query aligns to 4:258/261 of P16544

query
sites
P16544
K
 
Q
D
 
D
Q
 
S
K
 
E
V
 
V
-
 
A
I
 
L
V
|
V
T
|
T
A
x
G
G
x
A
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
|
L
A
x
E
I
|
I
T
x
A
A
x
R
A
x
R
F
x
L
V
x
G
E
x
K
A
x
E
G
|
G
A
x
L
H
x
R
V
|
V
H
x
F
I
x
V
C
|
C
D
x
A
V
x
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
F
 
G
L
 
L
A
 
R
S
 
T
A
 
T
R
 
L
A
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
R
H
 
E
A
 
A
P
 
G
V
 
V
S
 
E
Y
 
A
S
 
D
-
 
G
R
 
R
T
 
T
-
 
C
D
|
D
V
 
V
S
 
R
S
 
S
E
 
V
R
 
P
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
W
 
Y
S
 
-
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
G
T
 
G
S
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
E
E
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
D
 
L
Q
 
D
T
 
V
L
 
V
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
V
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
A
 
V
V
 
L
P
 
K
L
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
R
G
 
G
G
 
T
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
V
A
 
V
L
 
H
R
 
A
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
A
W
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
S
 
T
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
F
V
 
V
E
 
E
G
 
T
A
 
P
R
 
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
S
I
 
V
V
 
R
A
 
E
A
 
H
K
 
Y
A
 
S
A
 
D
A
 
I
Y
 
W
G
 
E
I
 
V
G
 
S
H
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
A
R
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
L
 
T
S
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
P
L
 
I
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
E
 
S
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
M
V
 
V
I
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
C
 
C
G
 
G
N
 
G
V
 
L

2rh4B Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
35% identity, 97% coverage: 6:257/261 of query aligns to 11:265/268 of 2rh4B

query
sites
2rh4B
K
 
Q
D
 
D
Q
 
S
K
 
E
V
 
V
-
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
T
 
A
A
 
R
A
 
R
F
 
L
V
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
H
 
R
V
 
V
H
 
F
I
 
V
C
 
C
D
x
A
V
x
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
F
 
G
L
 
L
A
 
R
S
 
T
A
 
T
R
 
L
A
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
R
H
 
E
A
 
A
P
 
G
V
 
V
S
 
E
Y
 
A
S
 
D
-
 
G
R
 
R
T
 
T
-
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
R
S
 
S
E
 
V
R
 
P
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
W
 
Y
S
 
-
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
G
T
 
G
S
 
A
P
 
-
V
 
T
E
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
D
S
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
L
Q
 
D
T
 
V
L
 
V
A
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
V
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
A
 
V
V
 
L
P
 
K
L
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
R
G
 
G
G
 
T
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
V
A
 
V
L
 
H
R
 
A
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
A
W
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
S
 
T
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
|
G
I
 
F
V
|
V
E
 
E
G
x
T
A
 
P
R
x
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
S
I
 
V
V
 
R
A
 
E
A
 
H
K
x
Y
A
 
S
A
 
D
A
 
I
Y
 
W
G
 
E
I
 
V
G
 
S
H
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
A
R
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
L
 
T
S
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
P
L
 
I
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
E
 
S
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
M
V
 
V
I
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
C
 
C
G
 
G
N
 
G
V
 
L

1xr3A Actinorhodin polyketide ketoreductase with NADP and the inhibitor isoniazid bound (see paper)
35% identity, 95% coverage: 11:257/261 of query aligns to 5:253/256 of 1xr3A

query
sites
1xr3A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
T
 
A
A
 
R
A
 
R
F
 
L
V
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
H
 
R
V
 
V
H
 
F
I
 
V
C
 
C
D
x
A
V
x
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
F
 
G
L
 
L
A
 
R
S
 
T
A
 
T
R
 
L
A
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
R
H
 
E
A
 
A
P
 
G
V
 
V
S
 
E
Y
 
A
S
 
D
-
 
G
R
 
R
T
 
T
-
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
R
S
 
S
E
 
V
R
 
P
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
W
 
Y
S
 
-
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
G
T
 
G
S
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
E
E
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
D
 
L
Q
 
D
T
 
V
L
 
V
A
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
V
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
A
 
V
V
 
L
P
 
K
L
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
R
G
 
G
G
 
T
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
V
x
T
A
x
G
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
x
V
A
 
V
L
 
H
R
 
A
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
A
W
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
S
 
T
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
|
G
I
 
F
V
|
V
E
 
E
G
x
T
A
x
P
R
 
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
S
I
 
V
V
 
R
A
 
E
A
 
H
K
x
Y
A
 
S
A
 
D
A
 
I
Y
 
W
G
 
E
I
 
V
G
 
S
H
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
A
R
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
L
 
T
S
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
P
L
 
I
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
E
 
S
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
M
V
 
V
I
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
C
 
C
G
 
G
N
 
G
V
 
L

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
35% identity, 95% coverage: 11:257/261 of query aligns to 6:254/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
I
T
 
A
A
 
R
A
 
R
F
 
L
V
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
H
 
R
V
 
V
H
 
F
I
 
V
C
 
C
D
x
A
V
x
R
S
x
G
E
 
E
D
 
E
F
 
G
L
 
L
A
 
R
S
 
T
A
 
T
R
 
L
A
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
R
H
 
E
A
 
A
P
 
G
V
 
V
S
 
E
Y
 
A
S
 
D
-
 
G
R
 
R
T
 
T
-
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
R
S
 
S
E
 
V
R
 
P
E
 
E
V
 
I
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
W
 
Y
S
 
-
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
G
T
 
G
S
 
A
P
 
T
V
 
A
E
 
E
E
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
A
D
 
D
-
 
E
-
 
L
W
 
W
D
 
L
Q
 
D
T
 
V
L
 
V
A
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
V
T
 
T
R
 
K
R
 
Q
A
 
V
V
 
L
P
 
K
L
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
M
K
 
L
K
 
E
N
 
R
G
 
G
G
 
T
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
V
x
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
L
x
Q
G
 
G
F
x
V
A
 
V
L
 
H
R
 
A
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
A
W
 
L
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
S
 
T
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
x
F
V
|
V
E
 
E
G
x
T
A
 
P
R
x
M
Q
 
A
E
 
A
R
 
S
I
 
V
V
 
R
A
 
E
A
 
H
K
x
Y
A
 
S
A
 
D
A
 
I
Y
 
W
G
 
E
I
 
V
G
 
S
H
 
T
E
 
E
E
 
E
M
 
A
R
 
F
Q
 
D
R
 
R
L
 
I
L
 
T
S
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
P
L
 
I
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
V
T
 
Q
A
 
P
E
 
S
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
Q
 
M
V
 
V
I
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
I
S
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
A
A
 
A
S
 
A
I
 
V
S
 
T
G
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
C
 
C
G
 
G
N
 
G
V
x
L

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:260/261 of query aligns to 4:254/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
N
 
S
L
 
L
K
 
K
D
 
N
Q
 
K
K
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
K
A
 
K
F
 
F
V
 
A
E
 
L
A
 
N
G
 
D
A
 
S
H
 
I
V
 
V
H
 
V
I
 
A
C
 
V
D
x
E
V
x
L
S
 
L
E
 
E
D
 
D
F
x
R
L
 
L
A
 
N
S
 
Q
-
 
I
-
 
V
A
 
Q
R
 
E
A
 
L
R
 
R
F
 
G
G
 
M
H
 
G
A
 
K
P
 
E
V
 
V
S
 
L
Y
 
G
S
 
V
R
 
K
T
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
S
 
K
E
 
K
R
 
K
E
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
E
M
 
F
F
 
V
A
 
R
D
 
R
L
 
T
A
 
F
Q
 
E
R
 
T
W
 
Y
S
 
S
G
 
-
R
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
M
G
 
D
P
 
G
T
 
V
S
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
S
L
 
D
S
 
E
D
 
L
W
 
W
D
 
E
Q
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
Y
G
 
S
P
 
A
F
 
F
L
 
Y
C
 
S
T
 
S
R
 
R
R
 
A
A
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
I
L
 
M
K
 
L
K
 
K
N
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
-
 
I
R
 
R
L
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
A
L
 
-
R
 
G
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
V
S
 
A
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
R
T
 
S
W
 
I
A
 
A
I
 
A
E
 
H
L
 
Y
G
 
G
P
 
D
S
 
Q
H
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
|
P
G
 
G
I
 
T
V
|
V
E
 
K
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
x
T
A
x
N
Y
x
I
G
 
G
I
 
L
G
 
G
H
 
S
-
 
S
-
 
K
-
 
P
E
x
S
E
 
E
M
 
L
R
 
G
Q
 
M
R
 
R
L
 
T
L
 
L
S
 
T
R
 
K
V
 
L
-
 
M
S
 
S
L
 
L
-
 
S
R
 
S
K
 
R
M
 
L
V
 
A
T
 
E
A
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
Q
 
V
V
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
E
G
 
A
A
 
S
S
 
F
I
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
D
S
 
A
L
 
V
S
 
V
V
 
V
C
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
T
V
 
V
L
 
L

3sjuA Hedamycin polyketide ketoreductase bound to NADPH (see paper)
36% identity, 96% coverage: 8:257/261 of query aligns to 1:252/255 of 3sjuA

query
sites
3sjuA
Q
 
Q
K
 
T
V
 
A
I
 
F
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
V
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
V
T
 
A
A
 
R
A
 
T
F
 
L
V
 
A
E
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
I
H
 
A
V
 
V
H
 
Y
I
 
G
C
 
C
-
x
A
-
x
R
D
|
D
V
 
A
S
 
K
E
 
N
D
 
V
F
 
S
L
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
D
R
 
G
A
 
L
R
 
R
F
 
A
G
 
A
H
 
G
A
 
H
P
 
D
V
 
V
S
 
D
Y
 
G
S
 
S
R
 
S
T
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
S
 
S
E
 
T
R
 
D
E
 
E
V
 
V
D
 
H
A
 
A
M
 
A
F
 
V
A
 
A
D
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
E
R
 
R
W
 
F
S
 
-
G
 
G
R
 
P
L
 
I
D
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
|
G
I
 
R
A
 
N
G
 
G
P
 
G
T
 
G
S
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
E
E
 
T
V
 
A
A
 
D
L
 
L
S
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
L
W
 
W
D
 
A
Q
 
D
T
 
V
L
 
L
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
V
T
 
T
R
 
R
R
 
E
A
 
V
V
 
L
P
 
R
L
 
A
-
 
G
-
 
G
L
 
M
K
 
R
K
 
E
N
 
A
G
 
G
G
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
V
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
F
 
V
A
 
M
L
 
Y
R
 
A
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
S
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
Y
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
S
W
 
V
A
 
G
I
 
F
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
K
S
 
T
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
|
G
I
x
Y
V
|
V
E
 
E
G
x
T
A
 
P
R
x
M
Q
 
A
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
R
A
 
E
A
 
G
K
x
Y
A
 
A
A
 
R
A
 
H
Y
 
W
G
 
G
I
 
V
G
 
T
H
 
E
E
 
Q
E
 
E
M
 
V
R
 
H
Q
 
E
R
 
R
L
 
F
L
 
N
S
 
A
R
 
K
V
 
I
S
 
P
L
 
L
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
S
T
 
T
A
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
G
Q
 
L
V
 
V
I
 
G
F
 
Y
L
 
L
C
 
V
S
 
T
P
 
D
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
S
 
T
G
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
L
S
 
N
V
 
V
C
 
C
G
 
G
N
 
G
V
 
L

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
37% identity, 98% coverage: 3:257/261 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
N
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
L
A
 
E
F
 
L
V
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
H
 
A
I
 
V
C
 
N
D
 
Y
V
x
A
S
|
S
E
x
S
-
 
A
-
 
G
-
 
A
D
 
A
F
 
D
L
 
E
A
 
V
S
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
I
R
 
A
F
 
A
G
 
A
H
 
G
A
 
G
P
 
E
V
 
A
S
 
F
Y
 
A
S
 
V
R
 
K
T
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
S
 
Q
E
 
E
R
 
S
E
 
E
V
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
L
F
 
F
A
 
A
D
 
A
L
 
V
A
 
I
Q
 
E
R
 
R
W
 
W
S
 
-
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
T
S
 
L
P
 
L
V
 
L
E
 
R
E
 
-
V
 
M
A
 
K
L
 
R
S
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
Q
Q
 
S
T
 
V
L
 
L
A
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
S
R
 
R
R
 
A
A
 
A
V
 
A
P
 
K
L
 
I
L
 
M
K
 
L
K
 
K
N
 
Q
G
 
R
G
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
E
L
 
M
G
 
G
F
 
N
A
 
P
L
 
G
R
x
Q
T
 
A
P
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
S
 
R
H
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
A
P
|
P
G
|
G
I
 
F
V
x
I
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
H
 
A
E
x
T
E
 
D
M
|
M
R
 
T
Q
 
S
R
 
-
L
 
L
L
 
L
S
 
E
R
 
V
V
 
I
S
 
P
L
 
L
R
 
G
K
 
R
M
 
Y
V
 
G
T
 
E
A
 
A
E
 
A
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
G
Q
 
V
V
 
V
I
 
R
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
A
-
 
D
P
 
P
A
 
A
G
 
A
A
 
A
S
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
I
C
 
D
G
 
G
N
 
G
V
 
L

Query Sequence

>HSERO_RS17235 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS17235
MDLNLKDQKVIVTAGAQGIGLAITAAFVEAGAHVHICDVSEDFLASARARFGHAPVSYSR
TDVSSEREVDAMFADLAQRWSGRLDVLINNAGIAGPTSPVEEVALSDWDQTLAVNLTGPF
LCTRRAVPLLKKNGGGAIVNISSVAGRLGFALRTPYSASKYGVIGLTETWAIELGPSHIR
VNAVLPGIVEGARQERIVAAKAAAYGIGHEEMRQRLLSRVSLRKMVTAEDIANQVIFLCS
PAGASISGQSLSVCGNVEVLG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory