SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS18295 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS18295 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2xsrA Crystal structure of wild type acinetobacter radioresistens catechol 1,2 dioxygenase (see paper)
55% identity, 100% coverage: 2:303/303 of query aligns to 5:309/309 of 2xsrA

query
sites
2xsrA
D
 
N
K
 
R
K
 
Q
A
 
Q
I
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
L
 
V
Q
 
K
K
 
Q
I
 
M
E
 
-
S
 
N
T
 
V
E
 
D
L
 
T
A
 
A
E
 
K
G
 
G
-
 
P
-
 
V
N
 
D
Q
 
E
R
 
R
V
 
I
K
 
Q
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
N
 
V
R
 
R
L
 
L
V
 
L
R
 
G
D
 
D
M
 
L
F
 
F
Y
 
Q
T
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
P
 
P
E
 
S
E
 
E
F
 
V
W
 
W
A
 
K
A
 
G
V
 
L
D
 
E
Y
|
Y
L
|
L
T
 
T
S
x
D
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
S
 
A
G
 
N
E
 
E
F
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
L
A
|
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
E
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
M
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
A
R
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Q
 
S
K
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
D
 
G
P
 
S
Q
 
E
P
 
S
G
 
D
-
 
K
-
 
V
D
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
I
Q
 
E
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
T
H
 
E
G
 
G
K
 
N
P
 
I
L
 
I
A
 
E
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
D
P
 
K
D
 
S
Q
 
Q
S
 
S
P
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
R
S
 
T
I
 
I
R
 
L
T
 
T
D
 
D
E
 
V
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
R
 
V
F
 
A
R
 
L
S
 
T
R
 
T
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
E
G
 
G
A
x
T
T
 
T
D
 
Q
R
x
A
L
 
L
L
 
L
T
 
N
K
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
S
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
E
Y
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
A
E
 
T
L
 
A
K
 
T
H
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
D
P
 
E
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
A
K
 
R
H
 
R
E
 
E
V
 
L
D
 
D
A
 
K
P
 
P
F
 
F
Y
 
K
A
 
H
I
 
I
E
 
T
F
 
F
N
 
N
F
 
V
N
 
E
L
 
L
L
 
V
P
 
K
E
 
E
Q
 
A
A
 
E
D
 
A
L
 
A
P
 
P
K
 
S
A
 
S
D
 
E
I
 
V
N
 
E
R
 
R
P
 
R
R
 
R
L
 
A
A
 
S
A
 
A

1dmhA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound 4-methylcatechol (see paper)
52% identity, 97% coverage: 10:302/303 of query aligns to 13:308/309 of 1dmhA

query
sites
1dmhA
L
 
L
Q
 
R
K
 
V
I
 
A
E
 
S
S
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
Q
A
 
E
E
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
N
 
H
R
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
S
D
 
D
M
 
L
F
 
Y
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
A
S
 
N
G
 
Q
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
|
L
I
 
L
A
 
S
A
x
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Q
 
S
K
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
D
 
G
P
 
S
Q
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
A
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
T
L
 
K
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
-
 
T
-
 
G
D
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
P
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
C
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
E
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
V
E
 
D
L
 
A
K
 
V
H
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
A
I
 
I
R
 
K
K
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
G
P
 
P
F
 
F
Y
 
A
A
 
E
I
 
M
E
 
V
F
 
F
N
 
D
F
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
T
P
 
R
E
 
L
Q
 
V
A
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
V
I
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
A

1dltA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter sp. Adp1 with bound catechol (see paper)
52% identity, 97% coverage: 10:302/303 of query aligns to 13:308/309 of 1dltA

query
sites
1dltA
L
 
L
Q
 
R
K
 
V
I
 
A
E
 
S
S
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
Q
A
 
E
E
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
N
 
H
R
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
S
D
 
D
M
 
L
F
 
Y
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
A
S
 
N
G
 
Q
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Q
 
S
K
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
D
 
G
P
 
S
Q
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
A
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
T
L
 
K
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
-
 
T
-
 
G
D
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
P
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
C
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
E
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
V
E
 
D
L
 
A
K
 
V
H
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
A
I
 
I
R
 
K
K
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
G
P
 
P
F
 
F
Y
 
A
A
 
E
I
 
M
E
 
V
F
 
F
N
 
D
F
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
T
P
 
R
E
 
L
Q
 
V
A
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
V
I
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
A

1dlmA Structure of catechol 1,2-dioxygenase from acinetobacter calcoaceticus native data (see paper)
52% identity, 97% coverage: 10:302/303 of query aligns to 13:308/309 of 1dlmA

query
sites
1dlmA
L
 
L
Q
 
R
K
 
V
I
 
A
E
 
S
S
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
Q
A
 
E
E
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
N
 
H
R
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
S
D
 
D
M
 
L
F
 
Y
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
A
S
 
N
G
 
Q
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Q
 
S
K
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
D
 
G
P
 
S
Q
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
A
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
T
L
 
K
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
-
 
T
-
 
G
D
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
P
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
C
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
E
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
V
E
 
D
L
 
A
K
 
V
H
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
A
I
 
I
R
 
K
K
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
G
P
 
P
F
 
F
Y
 
A
A
 
E
I
 
M
E
 
V
F
 
F
N
 
D
F
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
T
P
 
R
E
 
L
Q
 
V
A
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
V
I
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
A

P07773 Catechol 1,2-dioxygenase; 1,2-CTD; EC 1.13.11.1 from Acinetobacter baylyi (strain ATCC 33305 / BD413 / ADP1) (see paper)
52% identity, 97% coverage: 10:302/303 of query aligns to 15:310/311 of P07773

query
sites
P07773
L
 
L
Q
 
R
K
 
V
I
 
A
E
 
S
S
 
G
T
 
L
E
 
E
L
 
Q
A
 
E
E
 
G
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
R
 
R
V
 
V
K
 
K
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
N
 
H
R
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
S
D
 
D
M
 
L
F
 
Y
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
P
 
S
E
 
D
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
Q
A
 
L
G
 
G
K
 
A
S
 
N
G
 
Q
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
F
E
 
D
H
 
H
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
M
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Q
 
S
K
 
V
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
R
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
D
 
G
P
 
S
Q
 
D
P
 
P
-
 
N
G
 
G
D
 
H
T
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
A
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
P
N
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
I
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
T
L
 
K
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
-
 
T
-
 
G
D
 
E
Q
 
Q
S
 
Q
P
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
M
R
 
R
C
 
R
S
 
S
I
 
I
R
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
R
 
R
S
 
T
R
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
A
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
E
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
N
K
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
 
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
|
I
H
|
H
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
T
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
V
E
 
D
L
 
A
K
 
V
H
 
E
V
 
H
T
 
T
D
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
A
I
 
I
R
 
K
K
 
A
H
 
N
E
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
G
P
 
P
F
 
F
Y
 
A
A
 
E
I
 
M
E
 
V
F
 
F
N
 
D
F
 
L
N
 
K
L
 
L
L
 
T
P
 
R
E
 
L
Q
 
V
A
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
V
I
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
A

2azqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from pseudomonas arvilla c-1 (see paper)
53% identity, 97% coverage: 6:300/303 of query aligns to 9:304/309 of 2azqA

query
sites
2azqA
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
V
 
F
L
 
F
Q
 
N
K
 
Q
I
 
V
E
 
A
S
 
G
T
 
L
E
 
D
L
 
H
A
 
A
E
 
E
G
 
G
N
 
K
Q
 
P
R
 
R
V
 
F
K
 
K
T
 
Q
V
 
I
V
 
I
N
 
L
R
 
R
L
 
V
V
 
L
R
 
Q
D
 
D
M
 
T
F
 
A
Y
 
R
T
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
E
V
 
I
Q
 
T
P
 
E
E
 
D
E
 
E
F
 
F
W
 
W
A
 
H
A
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
R
A
 
L
G
 
G
K
 
G
S
 
R
G
 
N
E
 
E
F
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
I
E
 
E
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
L
M
 
Q
D
 
D
E
 
A
A
 
K
E
 
D
A
 
A
R
 
E
R
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
L
Q
 
A
K
 
Q
G
 
G
F
 
E
A
 
V
R
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
D
 
G
P
 
T
Q
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
V
T
 
V
L
 
M
F
 
F
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
D
 
D
E
 
A
H
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
T
V
 
V
E
 
D
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
T
L
 
Q
G
 
G
R
 
T
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Y
F
 
F
D
 
D
P
 
S
D
 
T
Q
 
Q
S
 
S
P
 
E
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
R
S
 
R
I
 
I
R
 
I
T
 
T
D
 
D
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
F
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
S
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
D
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
Q
R
 
E
L
 
C
L
 
L
T
 
D
K
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
Q
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
I
T
 
S
V
 
A
P
 
F
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
H
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
N
 
N
I
 
F
A
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
K
Y
 
Y
L
 
L
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
I
P
 
G
E
 
E
L
 
L
K
 
R
H
 
F
V
 
V
T
 
E
D
 
D
P
 
A
A
 
A
E
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
D
H
 
R
E
 
G
V
 
V
D
 
Q
A
 
G
P
 
E
F
 
R
Y
 
F
A
 
A
-
 
E
I
 
L
E
 
S
F
 
F
N
 
D
F
 
F
N
 
R
L
 
L
L
 
Q
P
 
G
E
 
A
Q
 
Q
A
 
S
D
 
P
L
 
D
P
 
A
K
 
E
A
 
A
D
 
R
I
 
S
N
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
R

5umhB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase protein from burkholderia multivorans
50% identity, 100% coverage: 2:303/303 of query aligns to 6:308/310 of 5umhB

query
sites
5umhB
D
 
D
K
 
T
K
 
K
A
 
E
I
 
V
D
 
Q
A
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
K
 
A
I
 
A
E
 
A
S
 
N
T
 
L
E
 
N
L
 
G
A
 
D
E
 
A
G
 
G
N
 
N
Q
 
A
R
 
R
V
 
F
K
 
R
T
 
Q
V
 
I
V
 
V
N
 
H
R
 
R
L
 
L
V
 
L
R
 
S
D
 
D
M
 
L
F
 
F
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
D
V
 
I
Q
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
K
A
 
L
G
 
G
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
I
G
 
G
F
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
R
R
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
L
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
V
Q
 
R
K
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
D
 
D
-
 
L
K
 
D
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
P
 
D
G
 
A
D
 
G
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
R
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
F
 
T
D
 
G
E
 
T
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
S
L
 
K
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
T
P
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
A
I
 
V
R
 
R
T
 
T
D
 
D
E
 
A
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
T
R
 
L
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
N
K
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
T
 
S
V
 
G
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
H
L
 
V
K
 
V
H
 
D
V
 
K
T
 
T
D
 
G
P
 
G
A
 
A
E
 
A
I
 
L
R
 
-
K
 
G
H
 
M
E
 
K
V
 
S
D
 
D
A
 
A
P
 
-
F
 
Y
Y
 
K
A
 
E
I
 
I
E
 
E
F
 
F
N
 
D
F
 
I
N
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
E
 
L
Q
 
L
A
 
D
D
 
G
L
 
R
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
V
I
 
V
N
 
H
R
 
R
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
S
A
 
A

5td3A Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia vietnamiensis
50% identity, 99% coverage: 2:300/303 of query aligns to 5:304/307 of 5td3A

query
sites
5td3A
D
 
E
K
 
T
K
 
R
A
 
E
I
 
V
D
 
Q
A
 
D
V
 
L
L
 
L
Q
 
K
K
 
A
I
 
A
E
 
S
S
 
S
T
 
A
E
 
N
L
 
A
A
 
S
E
 
T
G
 
G
N
 
D
Q
 
A
R
 
R
V
 
T
K
 
Q
T
 
Q
V
 
I
V
 
V
N
 
L
R
 
R
L
 
L
V
 
L
R
 
G
D
 
D
M
 
L
F
 
F
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
D
V
 
I
Q
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
K
A
 
L
G
 
G
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
R
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
V
Q
 
R
K
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
D
 
D
K
 
L
D
 
D
P
 
A
Q
 
D
P
 
A
G
 
G
-
 
A
D
 
G
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
F
 
K
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
S
L
 
H
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
D
 
T
-
 
G
-
 
A
Q
 
Q
S
 
R
P
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
A
I
 
V
R
 
R
T
 
T
D
 
G
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
R
 
T
Y
 
Y
R
 
A
F
 
F
R
 
R
S
 
T
R
 
L
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
T
 
T
V
 
S
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
P
L
 
V
K
 
T
H
 
T
V
 
K
T
 
T
D
 
G
P
 
G
A
 
A
E
 
A
I
 
L
R
 
-
K
 
G
H
 
L
E
 
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
-
F
 
Y
Y
 
Q
A
 
D
I
 
I
E
 
T
F
 
F
N
 
D
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
E
 
R
Q
 
V
A
 
G
D
 
G
L
 
A
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
I
I
 
V
N
 
E
R
 
R
P
 
P
R
 
R

5vxtB Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from burkholderia ambifaria
52% identity, 92% coverage: 24:303/303 of query aligns to 31:311/312 of 5vxtB

query
sites
5vxtB
R
 
R
V
 
T
K
 
Q
T
 
Q
V
 
I
V
 
V
N
 
H
R
 
R
L
 
L
V
 
L
R
 
G
D
 
D
M
 
L
F
 
F
Y
 
K
T
 
A
I
 
I
E
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
D
V
 
I
Q
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
F
 
V
W
 
W
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
N
Y
 
Y
L
 
L
T
 
N
S
 
K
A
 
L
G
 
G
K
 
Q
S
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
L
E
 
E
H
 
K
F
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
R
 
R
M
 
M
D
 
D
E
 
A
A
 
E
E
 
D
A
 
E
R
 
A
R
 
I
G
 
G
V
 
L
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
|
L
Y
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
V
Q
 
R
K
 
D
G
 
G
F
 
V
A
 
A
R
 
K
M
 
I
D
 
D
K
 
L
D
 
D
P
 
A
Q
 
D
P
 
E
G
 
G
-
 
A
D
 
G
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
I
Q
 
H
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
F
 
T
D
 
G
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
V
 
C
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
N
H
 
S
L
 
H
G
 
G
R
 
F
Y
|
Y
S
 
S
F
 
H
F
 
F
D
 
D
P
 
P
-
 
T
-
 
G
D
 
K
Q
 
Q
S
 
S
P
 
D
F
 
F
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
A
I
 
V
R
 
K
T
 
T
D
 
G
E
 
A
Q
 
D
G
 
G
R
 
K
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
R
 
R
S
 
T
R
 
L
V
 
M
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Y
|
Y
S
 
G
V
 
C
P
 
P
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
T
 
D
K
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
S
 
N
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
V
H
|
H
F
 
F
F
 
F
V
 
V
T
 
T
V
 
S
P
 
D
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
F
N
 
N
I
 
I
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
W
 
W
D
 
D
D
 
D
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
T
 
T
R
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
P
E
 
P
L
 
V
K
 
T
H
 
A
V
 
K
T
 
A
D
 
G
P
 
G
A
 
A
E
 
A
I
 
L
R
 
G
K
 
L
H
 
-
E
 
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
-
F
 
Y
Y
 
Q
A
 
D
I
 
I
E
 
E
F
 
F
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
T
P
 
P
E
 
R
Q
 
V
A
 
E
D
 
G
L
 
K
P
 
D
K
 
N
A
 
Q
D
 
I
I
 
V
N
 
E
R
 
R
P
 
L
R
 
R
L
 
A
A
 
S
A
 
A

2boyA Crystal structure of 3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp (see paper)
33% identity, 86% coverage: 24:284/303 of query aligns to 4:250/253 of 2boyA

query
sites
2boyA
R
 
R
V
 
T
K
 
G
T
 
N
V
 
I
V
 
V
N
 
G
R
 
K
L
 
M
V
 
I
R
 
A
D
 
A
M
 
I
F
 
N
Y
 
A
T
 
V
I
 
I
E
 
K
E
 
D
L
 
E
D
 
K
V
 
V
Q
 
S
P
 
Y
E
 
S
E
 
E
F
 
Y
W
 
K
A
 
A
A
 
S
V
 
T
D
 
G
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
S
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
K
G
 
N
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
|
L
I
 
F
A
 
L
A
 
-
G
 
D
L
 
V
G
 
F
F
 
F
E
 
E
H
 
H
F
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
S
R
 
V
M
 
A
D
 
-
E
 
-
A
 
A
E
 
E
A
 
S
R
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
S
Q
 
Q
G
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
S
T
 
S
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
F
V
 
I
S
 
P
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
K
 
S
-
 
I
G
 
P
F
 
Y
A
 
T
R
 
M
M
 
P
D
 
M
K
 
R
D
 
D
P
 
D
Q
 
E
P
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
T
L
 
L
F
 
I
M
 
F
Q
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
F
 
V
D
 
D
E
 
Q
H
 
E
G
 
G
K
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
N
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
L
E
 
D
V
 
M
W
 
W
H
 
Q
A
 
A
N
 
D
H
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
E
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
T
Q
 
L
S
 
P
P
 
D
F
 
Y
N
 
L
L
 
F
R
 
R
C
 
G
S
 
K
I
 
I
R
 
R
T
 
T
D
 
D
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
R
 
T
F
 
L
R
 
R
S
 
T
R
 
I
V
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
E
V
 
I
P
 
P
P
 
K
G
 
N
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
A
K
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
W
H
 
H
G
 
A
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
W
F
 
I
V
 
I
T
 
A
V
 
K
P
 
E
G
 
G
Y
 
Y
R
 
E
K
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
E
G
 
N
D
 
G
P
 
Q
Y
 
W
L
 
T
W
 
G
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
N
A
 
A
T
 
V
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
L
H
 
L
V
 
S
T
 
L
D
 
D
P
 
K
A
 
I
E
 
E
I
 
A
R
 
Q
K
 
S
H
 
-
E
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
G
P
 
P
F
 
H
Y
 
F
A
 
E
I
 
T
E
 
S
F
 
Y
N
 
K
F
 
F
N
 
T
L
 
L

3n9tA Cryatal structure of hydroxyquinol 1,2-dioxygenase from pseudomonas putida dll-e4
32% identity, 89% coverage: 4:273/303 of query aligns to 2:265/286 of 3n9tA

query
sites
3n9tA
K
 
K
A
 
A
I
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
D
Q
 
Q
K
 
A
I
 
V
E
 
D
S
 
S
T
 
F
E
 
E
L
 
T
A
 
S
E
 
P
G
 
-
N
 
N
Q
 
P
R
 
R
V
 
F
K
 
K
T
 
Q
V
 
I
V
 
M
N
 
Q
R
 
S
L
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
H
M
 
L
F
 
H
Y
 
D
T
 
F
I
 
V
E
 
S
E
 
E
L
 
V
D
 
E
V
 
L
Q
 
T
P
 
E
E
 
Q
E
 
E
F
 
W
W
 
F
A
 
E
A
 
G
V
 
I
D
 
R
Y
 
F
L
 
L
T
 
T
S
 
A
A
 
T
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
G
 
C
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
Q
E
 
E
F
 
F
G
 
I
L
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
D
G
 
T
L
 
L
G
 
G
F
 
V
E
 
S
H
 
M
F
 
L
L
 
V
D
 
D
L
 
-
R
 
-
M
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
A
E
 
I
A
 
N
R
 
H
R
 
R
G
 
Q
V
 
S
Q
 
T
G
 
N
G
 
A
T
 
T
P
 
E
R
 
T
T
 
T
I
 
V
E
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
F
Y
 
F
V
 
I
S
 
E
G
 
G
A
 
M
P
 
P
E
 
D
Q
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
K
 
E
G
 
N
F
 
M
A
 
A
R
 
L
M
 
T
D
 
D
K
 
G
D
 
V
P
 
P
Q
 
A
P
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
L
M
 
V
Q
 
Y
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
V
H
 
Q
G
 
G
K
 
R
P
 
P
L
 
V
A
 
V
N
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
L
E
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
Q
A
 
T
N
 
A
H
 
D
L
 
N
G
 
G
R
 
M
Y
|
Y
S
 
S
F
 
G
F
 
Q
D
 
D
P
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
P
P
 
F
F
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
R
I
 
Y
R
 
R
T
 
S
D
 
D
E
 
N
Q
 
D
G
 
G
R
 
C
Y
 
F
R
 
A
F
 
I
R
 
Q
S
 
T
R
 
T
V
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
C
Y
|
Y
S
 
P
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
V
D
 
G
R
 
E
L
 
M
L
 
L
T
 
D
K
 
A
L
 
A
G
 
N
R
 
R
H
 
H
G
 
A
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
F
F
 
M
V
 
I
T
 
Q
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
L
 
L
T
 
V
T
 
T
Q
 
H
I
 
L
N
 
F
I
 
N
A
 
S
G
 
D
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
A
A
 
V
F
 
F
A
 
G
T
 
V
R
 
K
E
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
-
P
 
-
E
 
Q
L
 
V
K
 
K
H
 
Y
V
 
E
T
 
D
D
 
R
P
 
P
A
 
A
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
-
H
 
H
E
 
D
V
 
E
D
 
D
A
 
A

3o6rA Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with pyrogallol (see paper)
34% identity, 83% coverage: 32:284/303 of query aligns to 15:253/256 of 3o6rA

query
sites
3o6rA
L
 
L
V
 
I
R
 
R
D
 
D
M
 
F
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
I
E
 
V
E
 
R
L
 
H
D
 
E
V
 
I
Q
 
T
P
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
E
A
 
T
A
 
I
V
 
M
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
T
 
I
S
 
S
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
W
F
 
L
E
 
D
H
 
A
F
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
T
R
 
T
M
 
V
D
 
D
E
 
S
A
 
V
E
 
S
A
 
Y
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
F
Y
 
F
V
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
L
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
A
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
A
D
 
D
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
F
 
R
D
 
D
E
 
T
H
 
S
G
 
G
K
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
T
N
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
S
P
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
-
P
 
-
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
R
I
 
V
R
 
V
T
 
P
D
 
A
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
R
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
R
 
I
V
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
P
Y
|
Y
S
 
E
V
 
I
P
 
P
P
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
M
T
 
N
K
 
S
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
V
 
I
T
 
T
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
K
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
F
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
V
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
L
E
 
P
I
 
V
R
 
N
K
 
K
H
 
I
E
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
G
P
 
E
F
 
T
Y
 
W
A
 
Q
-
 
L
I
 
V
E
 
D
F
 
F
N
 
N
F
 
F
N
 
I
L
 
L

3o6jA Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with hydroxyquinol (see paper)
34% identity, 83% coverage: 32:284/303 of query aligns to 15:253/256 of 3o6jA

query
sites
3o6jA
L
 
L
V
 
I
R
 
R
D
 
D
M
 
F
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
I
E
 
V
E
 
R
L
 
H
D
 
E
V
 
I
Q
 
T
P
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
E
A
 
T
A
 
I
V
 
M
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
T
 
I
S
 
S
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
W
F
 
L
E
 
D
H
 
A
F
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
T
R
 
T
M
 
V
D
 
D
E
 
S
A
 
V
E
 
S
A
 
Y
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
 
F
Y
 
F
V
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
L
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
A
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
A
D
 
D
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
F
 
R
D
 
D
E
 
T
H
 
S
G
 
G
K
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
T
N
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
S
P
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
-
P
 
-
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
R
I
 
V
R
 
V
T
 
P
D
 
A
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
R
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
R
 
I
V
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
P
Y
|
Y
S
 
E
V
 
I
P
 
P
P
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
M
T
 
N
K
 
S
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
V
 
I
T
 
T
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
K
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
F
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
V
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
L
E
 
P
I
 
V
R
 
N
K
 
K
H
 
I
E
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
G
P
 
E
F
 
T
Y
 
W
A
 
Q
-
 
L
I
 
V
E
 
D
F
 
F
N
 
N
F
 
F
N
 
I
L
 
L

3o32A Crystal structure of 4-chlorocatechol dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3,5-dichlorocatechol (see paper)
34% identity, 83% coverage: 32:284/303 of query aligns to 15:253/256 of 3o32A

query
sites
3o32A
L
 
L
V
 
I
R
 
R
D
 
D
M
 
F
F
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
I
E
 
V
E
 
R
L
 
H
D
 
E
V
 
I
Q
 
T
P
 
T
E
 
P
E
 
E
F
 
Y
W
 
E
A
 
T
A
 
I
V
 
M
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
T
 
I
S
 
S
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
W
F
 
L
E
x
D
H
x
A
F
 
F
L
 
F
D
 
E
L
 
T
R
 
T
M
 
V
D
 
D
E
 
S
A
 
V
E
 
S
A
 
Y
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
G
 
N
G
 
W
T
 
T
P
 
S
R
 
S
T
 
A
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
|
P
L
x
F
Y
 
F
V
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
L
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
A
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
A
D
 
D
P
 
-
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
R
L
 
M
F
 
R
M
 
F
Q
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
F
 
R
D
 
D
E
 
T
H
 
S
G
 
G
K
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
T
N
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
E
 
D
V
 
V
W
 
W
H
 
H
A
 
S
N
 
T
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
N
Y
|
Y
S
 
S
F
 
F
F
 
F
D
 
S
P
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
P
D
 
D
Q
 
Q
S
 
-
P
 
-
F
 
Y
N
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
R
I
 
V
R
 
V
T
 
P
D
 
A
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
R
 
S
Y
 
I
R
 
E
F
 
F
R
 
H
S
 
S
R
 
I
V
 
R
P
 
P
V
 
V
G
 
P
Y
|
Y
S
 
E
V
 
I
P
 
P
P
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
L
L
 
M
T
 
N
K
 
S
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
S
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
I
H
|
H
F
 
I
F
 
R
V
 
I
T
 
T
V
 
A
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
K
 
P
L
 
L
T
 
I
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
S
A
x
C
F
 
S
A
 
A
T
 
V
R
 
K
E
 
S
G
 
E
L
 
L
V
 
V
P
 
-
E
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
L
E
 
P
I
 
V
R
 
N
K
 
K
H
 
I
E
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
G
P
 
E
F
 
T
Y
 
W
A
 
Q
-
 
L
I
 
V
E
 
D
F
 
F
N
 
N
F
 
F
N
 
I
L
 
L

3hgiA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from the gram-positive rhodococcus opacus 1cp (see paper)
35% identity, 76% coverage: 56:286/303 of query aligns to 43:257/258 of 3hgiA

query
sites
3hgiA
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
L
E
 
D
H
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
-
V
 
-
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
P
Q
 
S
K
 
K
G
 
C
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
E
D
 
E
P
 
D
Q
 
E
P
 
K
G
 
I
D
 
T
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
|
H
A
|
A
N
 
D
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
H
Q
 
L
S
 
P
P
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
R
 
I
V
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
E
K
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
G
P
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
I
T
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
H
 
T
E
 
G
V
 
D
D
 
D
A
 
G
P
 
K
F
 
N
Y
 
Y
A
 
-
I
 
V
E
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
D
P
 
P

3i51A Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4,5-dichlorocatechol (see paper)
35% identity, 76% coverage: 56:286/303 of query aligns to 41:255/256 of 3i51A

query
sites
3i51A
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
L
E
x
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
-
V
 
-
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
P
Q
 
S
K
 
K
G
 
C
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
E
D
 
E
P
 
D
Q
 
E
P
 
K
G
 
I
D
 
T
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
H
Q
 
L
S
 
P
P
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
R
 
I
V
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
E
K
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
G
P
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
I
T
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
H
 
T
E
 
G
V
 
D
D
 
D
A
 
G
P
 
K
F
 
N
Y
 
Y
A
 
-
I
 
V
E
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
D
P
 
P

3i4yA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3,5-dichlorocatechol (see paper)
35% identity, 76% coverage: 56:286/303 of query aligns to 41:255/256 of 3i4yA

query
sites
3i4yA
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
|
L
I
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
L
E
 
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
-
V
 
-
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
P
Q
 
S
K
 
K
G
 
C
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
E
D
 
E
P
 
D
Q
 
E
P
 
K
G
 
I
D
 
T
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
H
Q
 
L
S
 
P
P
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
R
 
I
V
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
E
K
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
G
P
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
I
T
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
H
 
T
E
 
G
V
 
D
D
 
D
A
 
G
P
 
K
F
 
N
Y
 
Y
A
 
-
I
 
V
E
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
D
P
 
P

3i4vA Crystal structure determination of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3-chlorocatechol (see paper)
35% identity, 76% coverage: 56:286/303 of query aligns to 41:255/256 of 3i4vA

query
sites
3i4vA
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
L
E
 
D
H
 
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
-
V
 
-
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
P
Q
 
S
K
 
K
G
 
C
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
E
D
 
E
P
 
D
Q
 
E
P
 
K
G
 
I
D
 
T
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
H
Q
 
L
S
 
P
P
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
R
 
I
V
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
E
K
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
G
P
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
I
T
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
H
 
T
E
 
G
V
 
D
D
 
D
A
 
G
P
 
K
F
 
N
Y
 
Y
A
 
-
I
 
V
E
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
D
P
 
P

3hjsA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 4-methylcatechol (see paper)
35% identity, 76% coverage: 56:286/303 of query aligns to 41:255/256 of 3hjsA

query
sites
3hjsA
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
L
E
x
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
-
V
 
-
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
P
Q
 
S
K
 
K
G
 
C
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
E
D
 
E
P
 
D
Q
 
E
P
 
K
G
 
I
D
 
T
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
H
Q
 
L
S
 
P
P
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
R
 
I
V
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
E
K
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
G
P
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
I
T
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
H
 
T
E
 
G
V
 
D
D
 
D
A
 
G
P
 
K
F
 
N
Y
 
Y
A
 
-
I
 
V
E
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
D
P
 
P

3hjqA Crystal structure of catechol 1,2-dioxygenase from rhodococcus opacus 1cp in complex with 3-methylcatechol (see paper)
35% identity, 76% coverage: 56:286/303 of query aligns to 41:255/256 of 3hjqA

query
sites
3hjqA
Y
 
W
L
 
L
T
 
I
S
 
D
A
 
V
G
 
G
K
 
E
S
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
W
G
 
P
L
 
L
I
 
F
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
L
E
 
D
H
x
V
F
 
F
L
 
I
D
 
E
L
 
H
R
 
S
M
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
-
V
 
-
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
T
 
T
P
 
M
R
 
G
T
 
S
I
|
I
E
 
E
G
 
G
P
|
P
L
x
Y
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
G
 
N
A
 
S
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
P
Q
 
S
K
 
K
G
 
C
F
 
T
A
 
L
R
 
P
M
 
M
D
 
R
K
 
E
D
 
E
P
 
D
Q
 
E
P
 
K
G
 
I
D
 
T
T
 
P
L
 
L
F
 
V
M
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
F
 
T
D
 
D
E
 
L
H
 
D
G
 
G
K
 
N
P
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
A
L
 
K
V
 
V
E
 
E
V
 
L
W
 
W
H
 
H
A
 
A
N
 
D
H
 
N
L
 
D
G
 
G
R
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
F
 
Q
F
 
F
D
 
A
P
 
P
D
 
H
Q
 
L
S
 
P
P
 
E
F
 
W
N
 
N
L
 
L
R
 
R
C
 
G
S
 
T
I
 
I
R
 
I
T
 
A
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
R
 
E
F
 
I
R
 
T
S
 
T
R
 
I
V
 
Q
P
 
P
V
 
A
G
 
P
Y
|
Y
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
P
 
T
G
 
D
G
 
G
A
 
P
T
 
T
D
 
G
R
 
Q
L
 
F
L
 
I
T
 
E
K
 
A
L
 
Q
G
 
N
R
 
G
H
 
H
G
 
P
S
 
W
R
|
R
P
 
P
A
 
A
H
|
H
I
 
L
H
|
H
F
 
L
F
 
I
V
 
V
T
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
K
R
 
E
K
 
S
L
 
V
T
 
T
T
 
T
Q
 
Q
I
 
L
N
 
Y
I
 
F
A
 
K
G
 
G
D
 
G
P
 
E
Y
 
W
L
 
I
W
 
D
D
 
S
D
 
D
F
 
V
A
 
A
F
 
S
A
 
A
T
 
T
R
 
K
E
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
-
H
 
-
V
 
I
T
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
H
 
T
E
 
G
V
 
D
D
 
D
A
 
G
P
 
K
F
 
N
Y
 
Y
A
 
-
I
 
V
E
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
F
N
 
V
L
 
L
L
 
D
P
 
P

Query Sequence

>HSERO_RS18295 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS18295
VDKKAIDAVLQKIESTELAEGNQRVKTVVNRLVRDMFYTIEELDVQPEEFWAAVDYLTSA
GKSGEFGLIAAGLGFEHFLDLRMDEAEARRGVQGGTPRTIEGPLYVSGAPEQKGFARMDK
DPQPGDTLFMQGQVFDEHGKPLANALVEVWHANHLGRYSFFDPDQSPFNLRCSIRTDEQG
RYRFRSRVPVGYSVPPGGATDRLLTKLGRHGSRPAHIHFFVTVPGYRKLTTQINIAGDPY
LWDDFAFATREGLVPELKHVTDPAEIRKHEVDAPFYAIEFNFNLLPEQADLPKADINRPR
LAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory