SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS19050 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS19050 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
45% identity, 98% coverage: 5:264/266 of query aligns to 4:261/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
P
G
 
G
W
 
W
G
|
G
N
 
N
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
H
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
D
I
 
L
E
 
A
A
 
S
A
 
M
L
 
D
Q
 
A
T
 
T
Q
 
L
D
 
E
I
 
L
I
 
V
R
 
R
S
 
A
E
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
S
C
 
V
E
 
T
V
 
P
L
 
C
A
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
D
N
 
S
T
 
A
E
 
S
V
 
V
K
 
E
A
 
R
I
 
L
A
 
V
E
 
A
A
 
D
A
 
S
M
 
V
D
 
A
H
 
R
F
 
C
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
P
D
 
S
V
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
A
T
 
L
S
 
D
E
 
E
E
 
A
S
 
Q
W
 
W
N
 
A
R
 
M
L
 
Q
V
 
L
A
 
E
V
 
L
N
 
N
Q
 
L
T
 
T
S
 
T
L
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
M
H
 
C
K
 
K
H
 
Y
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
V
M
 
M
E
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
L
 
T
A
 
S
A
 
G
L
 
I
R
 
R
W
 
W
I
 
T
G
 
G
F
 
A
P
 
A
Y
 
Q
L
 
V
G
 
G
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
M
L
 
I
A
 
Q
F
 
M
T
 
G
K
 
R
N
 
V
V
 
V
A
 
A
M
 
V
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
A
M
 
K
G
 
N
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
S
V
 
V
L
 
V
P
 
P
G
 
G
M
 
L
M
 
L
D
 
H
T
 
T
P
|
P
M
|
M
I
 
V
R
 
D
E
 
T
P
 
-
L
 
-
K
 
K
A
 
I
S
 
A
Y
 
H
G
 
N
G
 
G
D
 
D
I
 
V
E
 
E
Q
 
L
M
 
L
R
 
L
A
 
R
K
 
K
R
 
R
N
 
Q
A
 
A
Q
 
R
C
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
P
F
 
F
M
 
M
G
 
G
D
 
D
A
 
G
W
 
R
D
 
D
V
 
T
A
 
A
H
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
T
D
 
E
M
 
I
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
S
L
 
A
R
 
R
C
 
C

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
37% identity, 97% coverage: 5:262/266 of query aligns to 5:253/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
M
 
L
Q
 
K
G
 
N
K
 
K
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
K
L
 
K
Y
 
F
A
 
A
R
 
L
E
 
N
G
 
D
G
 
S
R
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
D
x
E
R
x
L
S
 
L
I
 
E
E
 
D
A
x
R
A
 
L
L
 
N
Q
 
Q
T
 
I
Q
 
V
D
 
Q
I
 
E
I
 
L
R
 
R
S
 
G
E
 
M
G
 
G
G
 
K
V
 
E
C
 
V
E
 
L
V
 
G
L
 
V
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
R
 
K
N
 
K
T
 
K
E
 
D
V
 
V
K
 
E
A
 
E
I
 
F
A
 
V
E
 
R
A
 
R
A
 
T
M
 
F
D
 
E
H
 
T
F
 
Y
G
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
C
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
I
|
I
A
 
M
D
 
D
V
 
G
G
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
A
E
 
E
T
 
V
S
 
S
E
 
D
E
 
E
S
 
L
W
 
W
N
 
E
R
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
T
 
Y
S
 
S
L
 
A
F
 
F
L
 
Y
T
 
S
H
 
S
K
 
R
H
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
I
 
I
M
 
M
E
 
L
K
 
K
Q
 
Q
R
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
I
R
 
R
W
 
G
I
 
-
G
 
G
F
 
F
P
 
A
Y
 
G
L
 
A
G
 
P
Y
|
Y
T
 
T
A
 
V
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
I
 
L
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
A
Q
 
H
Y
 
Y
A
 
G
P
 
D
M
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
N
 
V
C
 
A
V
 
V
L
 
L
P
|
P
G
 
G
M
 
T
M
x
V
D
 
K
T
|
T
P
x
N
M
x
I
I
 
G
R
 
L
E
 
G
P
 
S
L
 
S
K
 
K
A
 
P
S
|
S
Y
 
E
G
 
L
G
 
G
D
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
M
 
M
R
 
R
A
 
T
K
 
L
R
 
T
N
 
K
A
 
L
Q
 
M
C
 
S
P
 
L
M
 
S
G
 
S
F
 
R
M
 
L
G
 
A
D
 
E
A
 
P
W
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
H
 
N
A
 
V
S
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
L
 
D
D
 
A
M
 
V
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 97% coverage: 5:262/266 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
S
x
R
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
N
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
N
V
 
I
L
 
F
-
 
F
A
x
N
V
x
Y
D
x
N
R
x
G
S
|
S
I
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
E
Q
 
E
T
 
T
Q
 
A
D
 
K
I
 
L
I
 
V
R
 
A
S
 
E
E
 
H
G
 
G
G
 
V
V
 
E
C
 
V
E
 
E
V
 
A
L
 
M
A
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
R
 
I
N
 
A
T
 
E
E
 
D
V
 
V
K
 
D
A
 
A
I
 
F
A
 
F
E
 
K
A
 
Q
A
 
A
M
 
I
D
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
|
I
A
 
T
D
 
R
V
 
D
G
 
N
G
 
L
P
 
L
V
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
D
S
 
E
W
 
W
N
 
D
R
 
D
L
 
V
V
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
Q
 
L
T
 
K
S
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
H
 
T
K
 
K
H
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
I
 
T
M
 
M
E
 
M
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
K
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
-
W
 
-
I
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
A
-
 
G
Y
x
Q
L
 
A
G
 
N
Y
|
Y
T
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
T
V
 
T
A
 
A
M
 
R
Q
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
M
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
M
 
F
M
x
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
I
 
T
R
 
-
E
 
D
P
 
K
L
 
L
K
 
D
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
E
Q
 
K
M
 
T
R
 
K
A
 
E
K
 
A
R
 
M
N
 
L
A
 
A
Q
 
Q
C
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
F
 
A
M
 
Y
G
 
G
D
 
T
A
 
T
W
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
H
 
N
A
 
A
S
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
A
A
 
S
R
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
Q
D
 
T
M
 
L
I
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
V
L
 
M

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
32% identity, 98% coverage: 1:261/266 of query aligns to 1:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
M
 
M
D
 
Y
K
 
K
L
 
D
M
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
S
S
x
T
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
 
G
K
 
K
A
 
S
A
 
M
A
 
A
V
 
I
L
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
E
G
 
K
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
N
D
 
Y
R
|
R
S
 
S
I
 
K
E
 
E
-
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
N
Q
 
S
T
 
V
Q
 
L
D
 
E
I
 
E
I
 
I
R
 
K
S
 
K
E
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
E
C
 
A
E
 
I
V
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
V
N
 
E
T
 
S
E
 
D
V
 
V
K
 
I
A
 
N
I
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
I
D
 
K
H
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
 
L
A
 
A
D
 
N
V
 
P
G
 
V
G
 
S
P
 
S
V
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
Q
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
H
 
S
K
 
R
H
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
-
 
Y
I
 
F
M
 
V
E
 
E
K
 
N
Q
 
D
R
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
L
 
V
-
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
I
R
 
P
W
 
W
I
 
P
G
 
L
F
 
F
P
 
V
Y
 
H
L
 
-
G
 
-
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
M
L
 
K
A
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
N
 
T
V
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
N
V
 
I
L
 
G
P
|
P
G
|
G
M
 
A
M
x
I
D
 
N
T
|
T
P
 
P
M
 
I
I
 
N
R
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
F
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
A
D
 
D
I
 
P
E
 
E
Q
 
Q
M
 
-
R
 
R
A
 
A
K
 
D
R
 
V
N
 
E
A
 
S
Q
 
M
C
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
M
 
I
G
 
G
D
 
E
A
 
P
W
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
H
 
A
A
 
V
S
 
A
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
H
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
T
M
 
L
I
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
32% identity, 98% coverage: 1:261/266 of query aligns to 1:251/261 of P40288

query
sites
P40288
M
 
M
D
 
Y
K
 
K
L
 
D
M
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
V
I
x
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
G
x
S
S
x
T
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
|
G
K
|
K
A
x
S
A
x
M
A
|
A
V
x
I
L
x
R
Y
x
F
A
|
A
R
x
T
E
|
E
G
x
K
G
x
A
R
x
K
V
|
V
L
x
V
A
 
V
V
 
N
D
 
Y
R
 
R
S
 
S
I
 
K
E
 
E
-
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
N
Q
 
S
T
 
V
Q
 
L
D
 
E
I
 
E
I
 
I
R
 
K
S
 
K
E
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
E
C
 
A
E
 
I
V
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
V
N
 
E
T
 
S
E
 
D
V
 
V
K
 
I
A
 
N
I
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
S
A
 
A
M
 
I
D
 
K
H
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
H
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
 
G
I
 
L
A
x
E
D
 
N
V
 
P
G
 
V
G
 
S
P
 
S
V
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
x
D
W
 
W
N
 
N
R
 
K
L
x
V
V
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
Q
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
H
 
S
K
 
R
H
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
-
 
Y
I
 
F
M
 
V
E
|
E
K
 
N
Q
 
D
R
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
 
S
L
 
V
-
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
I
R
 
P
W
 
W
I
 
P
G
 
L
F
 
F
P
 
V
Y
 
H
L
 
-
G
 
-
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
G
I
 
M
L
 
K
A
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
N
 
T
V
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
x
V
N
 
N
C
 
N
V
 
I
L
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
A
M
 
I
D
 
N
T
 
T
P
|
P
M
 
I
I
 
N
R
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
F
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
A
D
 
D
I
 
P
E
 
E
Q
 
Q
M
 
-
R
 
R
A
 
A
K
 
D
R
 
V
N
x
E
A
 
S
Q
 
M
C
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
F
x
Y
M
 
I
G
 
G
D
 
E
A
 
P
W
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
H
 
A
A
 
V
S
 
A
L
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
H
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
T
M
 
L
I
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
37% identity, 95% coverage: 8:261/266 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
A
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
|
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
R
Y
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
R
x
L
S
 
S
I
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
L
L
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
Q
 
D
D
 
K
I
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
V
A
 
R
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
D
N
 
E
T
 
G
E
 
D
V
 
V
K
 
N
A
 
A
I
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
M
D
 
E
H
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
A
 
S
D
 
E
V
 
A
G
 
G
G
 
V
P
 
L
V
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
V
E
 
E
S
 
Q
W
 
F
N
 
D
R
 
K
L
 
V
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
V
T
 
R
S
 
G
L
 
I
F
 
F
L
 
L
T
 
G
H
 
C
K
 
R
H
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
H
M
 
M
E
 
L
K
 
L
Q
 
Q
R
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
A
F
|
F
P
 
P
-
 
G
Y
x
R
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
V
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
G
M
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
|
G
M
|
M
M
x
I
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
I
x
T
R
 
Q
E
x
W
P
x
R
L
 
L
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
Q
E
 
P
Q
 
E
M
 
L
R
 
R
A
 
D
K
 
Q
R
 
V
N
 
L
A
 
A
Q
 
R
C
 
I
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
F
 
E
M
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
A
W
 
A
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
A
 
A
S
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
H
 
D
A
 
A
R
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
L
 
A
D
 
A
M
 
L
I
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
Y
S
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
37% identity, 95% coverage: 8:261/266 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
A
 
V
I
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
|
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
T
L
 
R
Y
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
R
 
L
S
 
S
I
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
L
L
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
Q
 
D
D
 
K
I
 
V
I
 
L
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
V
A
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
R
 
D
N
 
E
T
 
G
E
 
D
V
 
V
K
 
N
A
 
A
I
 
A
A
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
M
D
 
E
H
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
A
 
S
D
 
E
V
 
A
G
 
G
G
 
V
P
 
L
V
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
V
E
 
E
S
 
Q
W
 
F
N
 
D
R
 
K
L
 
V
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
V
T
 
R
S
 
G
L
 
I
F
 
F
L
 
L
T
 
G
H
 
C
K
 
R
H
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
I
 
H
M
 
M
E
 
L
K
 
L
Q
 
Q
R
 
G
K
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
A
F
 
F
P
 
P
-
 
G
Y
x
R
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
V
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
G
M
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
M
 
M
M
x
I
D
x
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
I
 
T
R
 
Q
E
x
W
P
x
R
L
 
L
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
Q
E
 
P
Q
 
E
M
 
L
R
|
R
A
 
D
K
 
Q
R
 
V
N
 
L
A
 
A
Q
x
R
C
 
I
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
F
 
E
M
 
I
G
 
G
D
 
T
A
 
A
W
 
A
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
H
 
D
A
 
A
S
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
H
 
D
A
 
A
R
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
L
 
A
D
 
A
M
 
L
I
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
Y
S
 
T

Sites not aligning to the query:

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:262/266 of query aligns to 4:245/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
M
 
L
Q
 
D
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
Q
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
G
N
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
A
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
D
R
 
I
S
 
N
I
 
-
E
 
E
A
 
S
A
 
K
L
 
L
Q
 
Q
T
 
E
Q
 
L
D
 
E
I
 
S
I
 
Y
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
I
V
 
Q
C
 
T
E
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
-
A
 
-
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
K
N
 
K
T
 
R
E
 
Q
V
 
I
K
 
D
A
 
Q
I
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
-
A
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
E
F
 
I
G
 
E
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
F
N
 
N
N
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
F
A
 
V
D
 
H
V
 
H
G
 
G
G
 
T
P
 
I
V
 
L
E
 
D
T
 
C
S
 
E
E
 
E
E
 
K
S
 
D
W
 
W
N
 
D
R
 
F
L
 
S
V
 
M
A
 
N
V
 
L
N
 
N
Q
 
V
T
 
R
S
 
S
L
 
M
F
 
F
L
 
L
T
 
M
H
 
I
K
 
K
H
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
I
 
K
M
 
M
E
 
L
K
 
A
Q
 
Q
R
 
K
K
 
S
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
S
R
 
I
W
 
K
I
 
G
G
 
V
F
 
E
P
 
N
Y
 
R
L
 
C
G
 
V
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
A
Q
 
D
Y
 
F
A
 
I
P
 
Q
M
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
C
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
M
 
T
M
 
V
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
S
I
 
L
R
 
Q
E
 
E
P
 
R
L
 
I
K
 
Q
A
 
A
S
 
R
Y
 
D
G
 
N
G
 
P
D
 
K
I
 
-
E
 
E
Q
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
T
K
 
F
R
 
L
N
 
N
A
 
R
Q
 
Q
C
 
-
P
 
K
M
 
T
G
 
G
F
 
R
M
 
F
G
 
A
D
 
S
A
 
A
W
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
L
A
 
L
S
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
R
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
N
D
 
P
M
 
V
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
S
 
S
L
 
L

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:262/266 of query aligns to 4:245/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
M
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
Q
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
G
N
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
L
L
 
A
Y
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
T
D
 
D
R
 
I
S
 
N
I
 
-
E
 
E
A
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
Q
T
 
E
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
I
 
L
R
 
E
S
 
N
E
 
Y
G
 
P
G
 
G
V
 
I
C
 
-
E
 
Q
V
 
T
L
 
R
A
 
V
A
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
K
N
 
K
T
 
R
E
 
Q
V
 
I
K
 
D
A
 
Q
I
 
F
A
 
A
E
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
D
 
S
H
 
E
F
 
I
G
 
E
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
F
N
 
N
N
 
V
V
 
A
G
 
G
I
 
F
A
 
V
D
 
H
V
 
H
G
 
G
G
 
T
P
 
I
V
 
L
E
 
D
T
 
C
S
 
E
E
 
E
E
 
K
S
 
D
W
 
W
N
 
D
R
 
F
L
 
S
V
 
M
A
 
N
V
 
L
N
 
N
Q
 
V
T
 
R
S
 
S
L
 
M
F
 
Y
L
 
L
T
 
M
H
 
I
K
 
K
H
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
I
 
K
M
 
M
E
 
L
K
 
A
Q
 
Q
R
 
K
K
 
S
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
S
R
 
I
W
 
K
I
 
G
G
 
V
F
 
E
P
 
N
Y
 
R
L
 
C
G
 
V
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
V
A
 
A
M
 
A
Q
 
D
Y
 
F
A
 
I
P
 
Q
M
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
C
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
M
 
T
M
 
V
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
S
I
 
L
R
 
Q
E
 
E
P
 
R
L
 
I
K
 
Q
A
 
A
S
 
R
Y
 
D
G
 
D
G
 
P
D
 
K
I
 
-
E
 
E
Q
 
A
M
 
L
R
 
K
A
 
A
K
 
F
R
 
L
N
 
N
A
 
R
Q
 
Q
C
 
-
P
 
K
M
 
T
G
 
G
F
 
R
M
 
F
G
 
A
D
 
S
A
 
A
W
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
L
A
 
L
S
 
C
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
E
A
 
S
R
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
T
D
 
P
M
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
W
S
 
S
L
 
L

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
33% identity, 97% coverage: 4:260/266 of query aligns to 2:241/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
M
 
L
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
A
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
|
S
V
 
E
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
R
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
A
V
 
E
L
 
I
Y
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
I
V
 
V
D
|
D
R
x
L
S
 
D
I
 
L
E
 
A
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
Q
T
 
S
Q
 
Q
D
 
N
I
 
A
I
 
A
R
 
K
S
 
A
E
 
L
G
 
G
G
 
E
V
 
G
C
 
H
E
 
M
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
|
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
R
 
N
N
 
E
T
 
E
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
A
A
 
V
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
D
 
Q
H
 
H
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
D
 
Q
V
 
P
G
 
I
G
 
K
P
 
T
V
 
L
E
 
D
T
 
I
S
 
Q
E
 
R
E
 
S
S
 
D
W
 
Y
N
 
D
R
 
R
L
 
V
V
 
L
A
 
D
V
|
V
N
 
S
Q
 
L
T
 
R
S
 
G
L
 
T
F
 
L
L
 
I
T
 
M
H
 
S
K
 
Q
H
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
I
 
S
M
 
M
E
 
K
K
 
A
Q
 
N
R
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
I
 
L
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
R
-
 
G
-
 
G
-
 
G
W
 
I
I
 
F
G
 
G
F
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
-
G
 
-
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
L
 
L
A
 
G
F
 
L
T
 
A
K
 
K
N
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
R
Q
 
E
Y
 
F
A
 
G
P
 
G
M
 
D
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
S
V
 
L
L
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
L
M
x
I
D
 
Q
T
|
T
P
 
D
M
 
M
I
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
N
E
 
D
Q
 
D
M
 
R
R
 
R
A
 
H
K
 
D
R
 
I
N
 
L
A
 
A
Q
 
G
C
 
I
P
 
P
M
 
L
G
 
G
F
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
K
A
 
A
W
 
Q
D
 
D
V
 
V
A
 
A
H
 
N
A
 
A
S
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
S
R
 
A
Y
 
Y
I
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
T
M
 
L
I
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:261/266 of query aligns to 11:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
M
 
L
Q
 
K
G
 
D
K
 
K
A
 
V
I
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
S
x
T
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
R
Y
 
F
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
E
G
 
A
R
 
K
V
 
V
-
 
V
L
 
I
A
 
N
V
 
Y
D
x
Y
R
 
N
S
 
N
I
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
T
 
A
Q
 
K
D
 
K
I
 
E
I
 
V
R
 
E
S
 
E
E
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
C
 
A
E
 
I
V
 
I
L
 
V
A
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
N
 
E
T
 
E
E
 
D
V
 
V
K
 
V
A
 
N
I
 
L
A
 
V
E
 
Q
A
 
T
A
 
A
M
 
I
D
 
K
H
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
x
V
A
x
E
D
 
N
V
 
P
G
 
V
G
 
P
P
 
S
V
 
H
E
 
E
T
 
L
S
 
S
E
 
L
E
 
D
S
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
K
L
 
V
V
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
Q
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
H
 
S
K
 
R
H
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
-
 
Y
I
 
F
M
 
V
E
 
E
K
 
N
Q
 
D
R
 
I
K
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
x
H
A
 
E
L
 
M
R
 
-
W
 
-
I
 
I
G
 
P
F
x
W
P
 
P
-
 
L
Y
 
F
L
 
V
G
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
M
L
 
K
A
 
L
F
 
M
T
 
T
K
 
E
N
 
T
V
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
N
V
 
I
L
 
G
P
|
P
G
|
G
M
 
A
M
|
M
D
 
N
T
|
T
P
|
P
M
x
I
I
x
N
R
 
A
E
 
E
P
x
K
L
 
F
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
A
D
 
D
I
 
P
E
 
V
Q
 
Q
M
 
-
R
 
R
A
 
A
K
 
D
R
 
V
N
 
E
A
 
S
Q
 
M
C
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
G
F
 
Y
M
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
P
W
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
A
A
 
V
S
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
H
 
Q
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
D
 
T
M
 
L
I
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 3:260/266 of query aligns to 1:251/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
I
G
 
D
K
 
K
A
 
T
I
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
x
R
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
R
L
 
E
Y
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
H
-
x
S
A
 
G
V
 
S
D
 
D
R
 
E
S
 
G
I
 
R
E
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
T
 
L
Q
 
A
D
 
E
I
 
E
I
 
I
R
 
A
S
 
A
E
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
T
C
 
A
E
 
I
V
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
R
 
D
N
 
L
T
 
D
E
 
S
V
 
G
K
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
D
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
|
I
A
 
C
D
 
P
V
x
F
G
 
H
G
 
S
P
 
F
V
 
L
E
 
D
T
 
M
S
 
P
E
 
R
E
 
E
S
 
L
W
 
Y
N
 
L
R
 
K
L
 
T
V
 
V
A
 
G
V
 
T
N
 
N
Q
 
L
T
 
N
S
 
G
L
 
A
F
 
Y
L
 
F
T
 
T
H
 
V
K
 
Q
H
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
R
I
 
R
M
 
M
E
 
K
K
 
E
Q
 
Q
-
 
G
R
 
R
K
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
I
x
V
S
|
S
S
|
S
L
 
I
A
x
S
A
 
A
L
 
L
R
 
V
W
 
G
I
 
-
G
 
G
F
 
A
P
 
M
Y
x
Q
L
 
T
G
 
H
Y
|
Y
T
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
S
F
 
L
T
 
M
K
 
Q
N
 
S
V
 
C
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
Y
 
L
A
 
G
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
M
 
T
M
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
I
x
N
R
 
K
E
 
E
P
 
D
L
 
L
K
 
S
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
L
E
 
E
Q
 
K
M
 
-
R
 
R
A
 
E
K
 
R
R
 
M
N
 
T
A
 
S
Q
 
R
C
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
F
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
P
W
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
H
 
G
A
 
P
S
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
|
D
H
x
M
A
 
A
R
|
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
A
D
 
S
M
 
L
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 3:260/266 of query aligns to 1:251/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
S
L
 
L
M
 
L
Q
 
I
G
 
D
K
 
K
A
 
T
I
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
x
R
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
R
L
 
E
Y
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
H
-
 
S
A
 
G
V
 
S
D
 
D
R
 
E
S
 
G
I
 
R
E
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
T
 
L
Q
 
A
D
 
E
I
 
E
I
 
I
R
 
A
S
 
A
E
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
T
C
 
A
E
 
I
V
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
R
 
D
N
 
L
T
 
D
E
 
S
V
 
G
K
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
V
E
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
V
D
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
|
I
A
 
C
D
 
P
V
 
F
G
 
H
G
 
S
P
 
F
V
 
L
E
 
D
T
 
M
S
 
P
E
 
R
E
 
E
S
 
L
W
 
Y
N
 
L
R
 
K
L
 
T
V
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
Q
 
L
T
 
N
S
 
G
L
 
A
F
 
Y
L
 
F
T
 
T
H
 
V
K
 
Q
H
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
R
I
 
R
M
 
M
E
 
K
K
 
E
Q
 
Q
-
 
G
R
 
R
K
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
I
x
V
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
L
R
 
V
W
 
G
I
 
-
G
 
G
F
 
A
P
 
M
Y
 
Q
L
 
T
G
 
H
Y
|
Y
T
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
L
 
L
A
 
S
F
 
L
T
 
M
K
 
Q
N
 
S
V
 
C
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
Y
 
L
A
 
G
P
 
P
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
M
 
T
M
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
D
M
x
I
I
 
N
R
 
K
E
 
E
P
 
D
L
 
L
K
 
S
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
I
 
L
E
 
E
Q
 
K
M
 
-
R
 
R
A
 
E
K
 
R
R
 
M
N
 
T
A
 
S
Q
 
R
C
 
V
P
 
P
M
 
L
G
 
G
F
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
P
W
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
H
 
G
A
 
P
S
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
M
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
A
D
 
S
M
 
L
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
32% identity, 97% coverage: 5:261/266 of query aligns to 5:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
L
Q
 
T
G
 
D
K
 
K
A
 
T
I
 
V
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
|
S
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
Q
L
 
A
Y
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
G
 
A
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
V
 
A
D
|
D
R
 
-
S
 
-
I
|
I
E
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
-
Q
 
Q
T
 
G
Q
 
E
D
 
A
I
 
M
I
 
V
R
 
R
S
 
K
E
 
E
G
 
N
G
 
N
-
 
D
V
 
R
C
 
L
E
 
H
V
 
F
L
 
V
A
 
Q
A
x
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
R
 
D
N
 
E
T
 
A
E
 
A
V
 
C
K
 
Q
A
 
H
I
 
A
A
 
V
E
 
E
A
 
S
A
 
A
M
 
V
D
 
H
H
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
E
D
 
I
V
 
V
G
 
A
G
 
P
P
 
I
V
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
E
E
 
L
E
 
S
S
 
D
W
 
W
N
 
N
R
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
M
F
 
F
L
 
L
T
 
M
H
 
S
K
 
K
H
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
I
 
H
M
 
M
E
 
L
K
 
A
Q
 
A
R
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
C
S
|
S
L
 
V
A
 
G
A
 
G
L
 
L
-
 
V
R
 
A
W
 
W
I
 
P
G
 
D
F
 
I
P
 
P
Y
 
-
L
 
-
G
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
I
 
V
L
 
L
A
 
Q
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
M
A
 
A
M
 
V
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
K
M
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
C
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
|
G
M
x
I
M
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
N
R
 
E
E
 
K
P
 
S
L
 
F
K
 
L
A
 
E
S
 
N
Y
 
N
G
 
E
G
 
G
D
 
T
I
 
L
E
 
E
Q
 
E
M
 
I
R
 
K
A
 
K
K
 
E
R
 
K
N
 
A
A
 
K
Q
 
V
C
 
N
P
 
P
M
 
L
G
 
L
F
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
K
A
 
P
W
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
H
 
N
A
 
V
S
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
L
A
 
S
R
 
S
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
L
 
S
D
 
A
M
 
I
I
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
34% identity, 86% coverage: 34:261/266 of query aligns to 27:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
V
 
I
D
|
D
R
x
L
S
 
D
I
 
Q
E
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
E
Q
 
R
T
 
S
Q
 
A
D
 
A
I
 
M
I
 
L
R
 
S
S
 
T
E
 
G
G
 
G
G
 
A
V
 
V
C
 
A
E
 
K
V
 
G
L
 
F
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
N
 
A
T
 
A
E
 
D
V
 
I
K
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
I
E
 
T
A
 
S
A
 
A
M
 
E
D
 
Q
H
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
S
P
 
V
V
 
H
E
 
D
T
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
A
S
 
A
W
 
W
N
 
D
R
 
R
L
 
I
V
 
M
A
 
A
V
|
V
N
|
N
Q
 
V
T
 
T
S
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
A
H
 
S
K
 
K
H
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
I
 
G
M
 
M
E
 
L
K
 
E
Q
 
R
R
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
F
S
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
G
F
 
I
P
 
P
Y
 
T
L
 
M
-
 
A
G
 
A
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
Q
V
 
M
A
 
A
M
 
A
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
S
P
 
G
M
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
 
G
M
x
T
M
x
V
D
 
T
T
 
S
P
x
T
M
 
G
I
x
M
R
 
G
E
 
Q
P
 
Q
L
 
L
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
I
 
T
E
 
S
-
 
P
Q
 
E
M
 
V
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
R
|
R
N
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
F
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
T
A
 
P
W
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
H
 
E
A
 
A
S
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
R
 
A
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
A
D
 
A
M
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
34% identity, 86% coverage: 34:261/266 of query aligns to 29:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
V
 
I
D
|
D
R
 
L
S
 
D
I
 
Q
E
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
E
Q
 
R
T
 
S
Q
 
A
D
 
A
I
 
M
I
 
L
R
 
S
S
 
T
E
 
G
G
 
G
G
 
A
V
 
V
C
 
A
E
 
K
V
 
G
L
 
F
A
 
G
A
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
N
 
A
T
 
A
E
 
D
V
 
I
K
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
I
E
 
T
A
 
S
A
 
A
M
 
E
D
 
Q
H
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
S
P
 
V
V
 
H
E
 
D
T
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
A
S
 
A
W
 
W
N
 
D
R
 
R
L
 
I
V
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
V
T
 
T
S
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
A
H
 
S
K
 
K
H
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
I
 
G
M
 
M
E
 
L
K
 
E
Q
 
R
R
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
G
F
 
I
P
 
P
Y
 
T
L
 
M
-
 
A
G
 
A
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
Q
V
 
M
A
 
A
M
 
A
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
S
P
 
G
M
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
M
x
T
M
x
V
D
x
T
T
x
S
P
x
T
M
x
G
I
 
M
R
 
G
E
 
Q
P
 
Q
L
 
L
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
I
 
T
E
 
S
-
 
P
Q
 
E
M
 
V
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
R
|
R
N
 
L
A
 
A
Q
x
K
C
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
F
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
T
A
 
P
W
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
H
 
E
A
 
A
S
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
R
 
A
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
A
D
 
A
M
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:263/266 of query aligns to 5:248/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
M
 
L
Q
 
R
G
 
D
K
 
K
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
M
G
|
G
N
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
E
L
 
R
Y
 
F
A
 
V
R
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
-
A
 
-
V
 
I
D
 
D
R
 
L
S
 
S
I
 
I
E
 
H
A
 
D
A
 
P
L
 
G
Q
 
E
T
 
A
Q
 
K
D
 
-
I
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
Y
E
 
D
V
 
H
L
 
I
A
 
E
A
 
C
D
 
D
V
 
V
S
 
T
R
 
N
N
 
P
T
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
S
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
I
M
 
F
D
 
K
H
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
V
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
D
 
S
V
 
Y
G
 
G
G
 
K
P
 
I
V
 
E
E
 
S
T
 
M
S
 
S
E
 
M
E
 
G
S
 
E
W
 
W
N
 
R
R
 
R
L
 
I
V
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
T
 
F
S
 
G
L
 
Y
F
 
Y
L
 
Y
T
 
A
H
 
S
K
 
K
H
 
F
V
 
A
L
 
I
P
 
P
I
 
Y
M
 
M
E
 
I
K
 
R
Q
 
S
R
 
R
K
 
D
G
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
L
x
V
A
x
Q
A
 
A
L
 
-
R
 
S
W
 
I
I
 
I
G
 
T
F
 
K
P
 
N
Y
 
A
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
T
 
V
A
 
T
T
x
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
 
P
G
x
A
M
x
T
M
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
K
P
 
A
L
 
A
K
 
E
A
 
L
S
 
E
Y
 
V
G
 
G
G
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
M
-
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
K
M
 
K
R
 
I
A
 
S
K
 
E
R
 
W
N
 
G
A
 
H
Q
 
E
C
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
Q
F
 
R
M
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
P
W
 
Q
D
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
S
A
 
A
S
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
R
H
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
T
D
 
C
M
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
I
R
 
R

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
34% identity, 97% coverage: 5:263/266 of query aligns to 5:248/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
M
 
L
Q
 
R
G
 
D
K
 
K
A
 
V
I
 
V
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
x
M
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
A
V
 
E
L
 
R
Y
 
F
A
 
V
R
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
-
A
 
-
V
 
I
D
 
D
R
 
L
S
|
S
I
|
I
E
 
H
A
 
D
A
 
P
L
 
G
Q
 
E
T
 
A
Q
 
K
D
 
-
I
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
Y
E
 
D
V
 
H
L
 
I
A
 
E
A
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
N
N
 
P
T
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
K
A
 
A
I
 
S
A
 
I
E
 
D
A
 
H
A
 
I
M
 
F
D
 
K
H
 
E
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
V
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
A
 
E
D
 
S
V
 
Y
G
 
G
G
 
K
P
 
I
V
 
E
E
 
S
T
 
M
S
 
S
E
 
M
E
 
G
S
 
E
W
 
W
N
 
R
R
 
R
L
 
I
V
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
T
 
F
S
 
G
L
 
Y
F
 
Y
L
 
Y
T
 
A
H
 
S
K
 
K
H
 
F
V
 
A
L
 
I
P
 
P
I
 
Y
M
 
M
E
 
I
K
 
R
Q
 
S
R
 
R
K
 
D
G
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
-
R
 
S
W
 
I
I
 
I
G
 
T
F
 
K
P
 
N
Y
 
A
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
T
 
V
A
 
T
T
x
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
I
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
S
V
 
I
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
M
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
x
A
M
x
T
M
x
I
D
 
D
T
|
T
P
|
P
M
x
L
I
x
V
R
 
R
E
 
K
P
 
A
L
 
A
K
 
E
A
 
L
S
 
E
Y
 
V
G
 
G
G
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
M
-
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
K
M
 
K
R
 
I
A
 
S
K
 
E
R
 
W
N
 
G
A
 
H
Q
 
E
C
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
Q
F
 
R
M
 
I
G
 
G
D
 
K
A
 
P
W
 
Q
D
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
S
A
 
A
S
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
R
H
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
T
D
 
C
M
 
L
I
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
S
L
 
I
R
 
R

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
32% identity, 97% coverage: 4:261/266 of query aligns to 2:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
I
M
 
L
Q
 
D
G
 
N
K
 
K
A
 
V
I
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
V
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
H
L
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
V
V
 
S
D
|
D
R
x
I
S
 
N
I
 
E
E
 
D
A
 
H
A
 
G
L
 
N
Q
 
K
T
 
A
Q
 
V
D
 
E
I
 
D
I
 
I
R
 
K
S
 
A
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
E
C
 
A
E
 
S
V
 
F
L
 
V
A
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
R
 
N
N
 
P
T
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
V
E
 
K
A
 
R
A
 
T
M
 
V
D
 
E
H
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
H
 
C
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
A
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
G
G
 
G
P
 
E
V
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
E
 
D
T
 
Y
S
 
G
E
 
L
E
 
D
S
 
S
W
 
W
N
 
R
R
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
T
 
D
S
 
G
L
 
V
F
 
F
L
 
Y
T
 
G
H
 
C
K
 
K
H
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
I
 
Q
M
 
M
E
 
E
K
 
K
Q
 
N
R
 
G
K
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
S
 
A
S
|
S
L
 
I
A
 
H
A
 
G
L
 
I
R
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
A
F
 
A
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
L
 
S
G
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
N
V
 
I
A
 
G
M
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
Q
M
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
G
P
|
P
G
x
A
M
x
Y
M
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
I
 
L
R
 
E
E
 
S
P
 
L
L
 
T
K
 
K
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
E
M
 
M
R
 
K
A
 
E
K
 
A
R
 
L
N
 
I
A
 
S
Q
 
K
C
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
F
 
R
M
 
L
G
 
G
D
 
K
A
 
P
W
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
H
 
E
A
 
L
S
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
H
 
K
A
 
S
R
 
S
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
L
 
G
D
 
Y
M
 
Y
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
34% identity, 86% coverage: 34:261/266 of query aligns to 27:246/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
V
 
I
D
|
D
R
x
L
S
 
D
I
 
Q
E
 
G
A
 
L
A
 
A
L
 
E
Q
 
R
T
 
S
Q
 
A
D
 
A
I
 
M
I
 
L
R
 
S
S
 
T
E
 
G
G
 
G
G
 
A
V
 
V
C
 
A
E
 
K
V
 
G
L
 
F
A
 
G
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
T
R
 
K
N
 
A
T
 
A
E
 
D
V
 
I
K
 
T
A
 
A
I
 
A
A
 
I
E
 
T
A
 
S
A
 
A
M
 
E
D
 
Q
H
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
D
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
S
P
 
V
V
 
H
E
 
D
T
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
A
S
 
A
W
 
W
N
 
D
R
 
R
L
 
I
V
 
M
A
 
A
V
|
V
N
|
N
Q
 
V
T
 
T
S
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
A
H
 
S
K
 
K
H
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
I
 
G
M
 
M
E
 
L
K
 
E
Q
 
R
R
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
F
S
 
G
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
-
W
 
-
I
 
V
G
 
G
F
 
I
P
 
P
Y
 
T
L
 
M
-
 
A
G
 
A
Y
|
Y
T
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
A
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
Q
V
 
M
A
 
A
M
 
A
Q
 
D
Y
 
Y
A
 
S
P
 
G
M
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
C
 
A
V
 
V
L
 
C
P
|
P
G
 
G
M
 
T
M
x
V
D
 
T
T
 
S
P
x
T
M
x
G
I
x
M
R
 
G
E
 
Q
P
 
Q
L
 
L
K
 
-
A
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
L
E
 
P
Q
 
E
M
 
V
R
 
Q
A
 
A
K
 
R
R
 
R
N
 
L
A
 
A
Q
 
K
C
 
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
F
 
R
M
 
F
G
 
G
D
 
T
A
 
P
W
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
H
 
E
A
 
A
S
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
H
 
Q
A
 
A
R
 
A
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
A
D
 
A
M
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>HSERO_RS19050 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS19050
MDKLMQGKAIIVTGAGSVGEGWGNGKAAAVLYAREGGRVLAVDRSIEAALQTQDIIRSEG
GVCEVLAADVSRNTEVKAIAEAAMDHFGRVDVLHNNVGIADVGGPVETSEESWNRLVAVN
QTSLFLTHKHVLPIMEKQRKGAIVNISSLAALRWIGFPYLGYTATKAAILAFTKNVAMQY
APMGIRANCVLPGMMDTPMIREPLKASYGGDIEQMRAKRNAQCPMGFMGDAWDVAHASLF
LASDHARYITGLDMIVDGGLSLRCAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory