SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS19365 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS19365 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
58% identity, 98% coverage: 6:253/254 of query aligns to 2:244/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
S
 
N
K
 
E
P
 
A
H
 
K
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
N
I
 
Y
A
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
T
 
T
H
 
R
L
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
D
 
K
A
 
R
A
 
Q
I
 
I
K
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
S
K
 
E
I
 
I
G
 
E
T
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
H
A
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
D
C
 
C
D
 
E
D
 
E
K
 
K
A
 
D
W
 
W
D
 
D
F
 
F
S
 
S
F
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
M
F
 
Y
H
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
E
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
V
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
N
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
E
 
D
T
 
D
G
 
P
K
 
K
S
 
-
E
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
A
R
 
L
A
 
K
A
 
A
F
 
F
V
 
L
G
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
K
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
N
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
T
I
 
P
H
 
V
M
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
58% identity, 98% coverage: 6:253/254 of query aligns to 2:244/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
S
 
N
K
 
E
P
 
S
H
 
K
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
S
I
 
Y
A
 
R
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
T
 
T
H
 
R
L
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
D
 
K
A
 
R
A
 
Q
I
 
I
K
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
S
K
 
E
I
 
I
G
 
E
T
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
H
A
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
D
C
 
C
D
 
E
D
 
E
K
 
K
A
 
D
W
 
W
D
 
D
F
 
F
S
 
S
F
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
M
F
 
F
H
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
E
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
V
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
N
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
-
T
 
-
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
E
 
D
T
 
N
G
 
P
K
 
K
S
 
-
E
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
A
R
 
L
A
 
K
A
 
T
F
 
F
V
 
L
G
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
K
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
N
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
N
I
 
P
H
 
V
M
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

Q9BUT1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
54% identity, 98% coverage: 6:253/254 of query aligns to 2:244/245 of Q9BUT1

query
sites
Q9BUT1
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
I
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
A
T
 
A
E
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
 
I
S
 
N
K
 
E
P
 
S
H
 
K
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
K
I
 
Y
A
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
T
 
T
H
 
R
L
 
V
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
D
 
K
A
 
K
A
 
Q
I
 
I
K
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
x
N
K
 
E
I
 
V
G
 
E
T
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
H
A
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
D
C
 
C
D
 
E
D
 
E
K
 
K
A
 
D
W
 
W
D
 
D
F
 
F
S
 
S
F
 
M
N
 
N
L
 
L
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
M
F
 
Y
H
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
 
Y
G
 
S
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
x
V
E
x
D
S
x
T
P
|
P
S
|
S
L
 
L
N
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
S
 
Q
T
 
A
Q
 
R
A
 
G
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
N
E
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
N
A
 
D
F
 
F
V
 
L
G
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
K
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
N
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
N
I
 
P
H
 
V
M
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

2ag5A Crystal structure of human dhrs6 (see paper)
54% identity, 98% coverage: 6:253/254 of query aligns to 2:244/246 of 2ag5A

query
sites
2ag5A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
I
L
 
I
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
S
 
A
T
 
A
E
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
|
I
S
 
N
K
 
E
P
 
S
H
 
K
L
 
L
D
 
Q
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
K
I
 
Y
A
 
P
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
T
 
T
H
 
R
L
 
V
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
D
 
K
A
 
K
A
 
Q
I
 
I
K
 
D
A
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
N
K
 
E
I
 
V
G
 
E
T
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
x
V
A
 
A
G
|
G
Y
 
F
V
 
V
A
 
H
A
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
V
L
 
L
E
 
D
C
 
C
D
 
E
D
 
E
K
 
K
A
 
D
W
 
W
D
 
D
F
 
F
S
 
S
F
 
M
N
 
N
L
|
L
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
S
M
 
M
F
 
Y
H
 
L
T
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
K
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
|
S
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
V
N
 
N
R
|
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
G
 
S
A
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
A
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
T
I
x
V
E
 
D
S
x
T
P
 
P
S
|
S
L
 
L
N
 
Q
Q
 
E
R
|
R
I
 
I
S
 
Q
T
 
A
Q
x
R
A
 
G
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
N
E
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
A
R
 
R
A
 
N
A
 
D
F
|
F
V
 
L
G
 
K
R
|
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
K
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
S
N
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
N
I
 
P
H
 
V
M
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
36% identity, 97% coverage: 8:253/254 of query aligns to 5:246/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
L
 
L
A
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
I
T
 
A
E
 
E
L
 
R
F
 
F
A
 
V
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
D
T
 
L
D
 
S
I
 
I
S
 
H
K
 
D
P
 
P
H
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
I
 
E
A
 
A
G
 
K
V
 
Y
E
 
D
T
 
H
H
 
I
L
 
E
L
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
N
D
 
P
A
 
D
A
 
Q
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
S
V
 
I
A
 
D
K
 
H
I
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
E
A
 
S
A
 
Y
G
 
G
N
 
K
I
 
I
L
 
E
E
 
S
C
 
M
D
 
S
D
 
M
K
 
G
A
 
E
W
 
W
D
 
R
F
 
R
S
 
I
F
 
I
N
 
D
L
 
V
N
 
N
A
 
L
K
 
F
A
 
G
M
 
Y
F
 
Y
H
 
Y
T
 
A
I
 
S
R
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
L
 
I
A
 
R
K
 
S
K
 
R
A
 
D
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
A
x
V
A
x
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
K
 
I
G
 
-
V
 
T
A
 
K
N
 
N
R
 
A
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
I
A
 
A
A
 
L
D
 
D
F
 
Y
V
 
-
A
 
A
Q
 
P
G
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
A
T
|
T
I
 
I
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
L
L
 
V
N
 
R
Q
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
V
K
 
G
E
 
S
T
 
D
G
 
P
K
 
M
S
 
R
E
 
I
E
 
E
E
 
K
V
 
K
R
 
I
A
 
S
A
 
E
F
 
W
V
 
G
G
 
H
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
R
E
 
E
S
 
A
N
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
T
I
 
C
H
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L
S
 
S

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
36% identity, 97% coverage: 8:253/254 of query aligns to 5:246/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
L
 
L
A
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
M
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
I
T
 
A
E
 
E
L
 
R
F
 
F
A
 
V
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
D
T
 
L
D
x
S
I
|
I
S
 
H
K
 
D
P
 
P
H
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
I
 
E
A
 
A
G
 
K
V
 
Y
E
 
D
T
 
H
H
 
I
L
 
E
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
N
D
 
P
A
 
D
A
 
Q
I
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
S
V
 
I
A
 
D
K
 
H
I
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
E
A
 
S
A
 
Y
G
 
G
N
 
K
I
 
I
L
 
E
E
 
S
C
 
M
D
 
S
D
 
M
K
 
G
A
 
E
W
 
W
D
 
R
F
 
R
S
 
I
F
 
I
N
 
D
L
 
V
N
 
N
A
 
L
K
 
F
A
 
G
M
 
Y
F
 
Y
H
 
Y
T
 
A
I
 
S
R
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
L
 
I
A
 
R
K
 
S
K
 
R
A
 
D
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
A
 
V
A
 
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
K
 
I
G
 
-
V
 
T
A
 
K
N
 
N
R
 
A
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
I
A
 
A
A
 
L
D
 
D
F
 
Y
V
 
-
A
 
A
Q
 
P
G
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
A
T
|
T
I
|
I
E
 
D
S
x
T
P
|
P
S
x
L
L
x
V
N
 
R
Q
 
K
R
 
A
I
 
A
S
 
E
T
 
L
Q
 
E
A
 
V
K
 
G
E
 
S
T
 
D
G
 
P
K
 
M
S
 
R
E
 
I
E
 
E
E
 
K
V
 
K
R
 
I
A
 
S
A
 
E
F
 
W
V
 
G
G
 
H
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
R
E
 
E
S
 
A
N
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
T
I
 
C
H
 
L
M
 
Y
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L
S
 
S

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
37% identity, 96% coverage: 11:253/254 of query aligns to 3:248/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
S
 
I
T
 
A
E
 
T
L
 
R
F
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
I
x
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
H
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
R
T
 
T
H
 
H
L
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
R
L
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
D
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
M
A
 
E
K
 
Q
I
 
F
G
 
G
T
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
I
V
 
T
A
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
V
I
 
L
L
 
H
E
 
T
C
 
T
D
 
P
D
 
V
K
 
E
A
 
Q
W
 
F
D
 
D
F
 
K
S
 
V
F
 
M
N
 
A
L
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
G
M
 
I
F
 
F
H
 
L
T
 
G
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
K
 
Q
K
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
A
V
x
F
A
 
P
N
 
G
R
|
R
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
M
I
|
I
E
 
E
S
x
T
P
|
P
S
x
M
L
x
T
N
 
Q
Q
x
W
R
|
R
I
 
L
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
D
E
 
Q
E
 
P
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
D
A
 
Q
F
 
V
V
 
L
G
 
A
R
 
R
Q
 
I
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
A
A
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
S
 
A
N
 
T
F
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
A
I
 
A
H
 
L
M
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
S
 
T

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
37% identity, 96% coverage: 11:253/254 of query aligns to 3:248/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
T
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
S
 
I
T
 
A
E
 
T
L
 
R
F
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
I
 
L
S
 
S
K
 
A
P
 
E
H
 
T
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
A
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
R
T
 
T
H
 
H
L
 
W
-
 
H
-
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
R
L
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
D
 
E
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
I
K
 
A
A
 
A
L
 
T
V
 
M
A
 
E
K
 
Q
I
 
F
G
 
G
T
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
T
A
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
V
I
 
L
L
 
H
E
 
T
C
 
T
D
 
P
D
 
V
K
 
E
A
 
Q
W
 
F
D
 
D
F
 
K
S
 
V
F
 
M
N
 
A
L
 
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
G
M
 
I
F
 
F
H
 
L
T
 
G
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
K
 
Q
K
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
A
V
 
F
A
 
P
N
 
G
R
|
R
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
A
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
M
I
|
I
E
|
E
S
x
T
P
|
P
S
x
M
L
 
T
N
 
Q
Q
x
W
R
|
R
I
 
L
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
D
E
 
Q
E
 
P
E
 
E
V
 
L
R
|
R
A
 
D
A
 
Q
F
 
V
V
 
L
G
 
A
R
|
R
Q
 
I
P
 
P
M
 
Q
G
 
K
R
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
A
A
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
S
 
A
N
 
T
F
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
S
 
A
I
 
A
H
 
L
M
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
S
 
T

Sites not aligning to the query:

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 97% coverage: 7:253/254 of query aligns to 4:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
R
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
A
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
S
 
A
T
 
V
E
 
Q
L
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
A
D
|
D
I
|
I
S
 
-
K
 
-
P
 
-
H
 
-
L
 
-
D
 
D
E
 
E
L
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
E
A
 
A
G
 
M
V
 
V
E
 
R
T
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
L
H
 
H
L
 
F
L
 
V
-
 
Q
-
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
C
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
I
 
V
K
 
E
A
 
S
L
 
A
V
 
V
A
 
H
K
 
T
I
 
F
G
 
G
T
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
I
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
Y
 
I
V
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
A
N
 
P
I
 
I
L
 
H
E
 
E
C
 
M
D
 
E
D
 
L
K
 
S
A
 
D
W
 
W
D
 
N
F
 
K
S
 
V
F
 
L
N
 
Q
L
 
V
N
 
N
A
 
L
K
 
T
A
 
G
M
 
M
F
 
F
H
 
L
T
 
M
I
 
S
R
 
K
A
 
H
V
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
A
 
V
A
 
G
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
A
V
 
W
A
 
P
N
 
D
R
 
I
F
 
P
A
 
A
Y
|
Y
G
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
M
A
 
A
A
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
A
 
K
Q
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
I
I
|
I
E
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
-
L
 
L
N
 
N
Q
 
E
R
 
K
I
 
S
S
 
F
T
 
L
Q
 
E
A
 
N
K
 
N
E
 
E
T
 
-
G
 
-
K
 
G
S
 
T
E
 
L
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
K
A
 
K
A
 
E
F
 
K
V
 
A
G
 
K
R
 
V
Q
 
N
P
 
P
M
 
L
G
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
V
A
 
M
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
A
H
 
I
M
 
T
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
34% identity, 98% coverage: 6:253/254 of query aligns to 1:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
G
 
G
R
 
I
L
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
S
 
V
T
 
A
E
 
H
L
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
|
I
S
 
N
K
 
E
P
 
D
H
 
H
-
 
G
-
 
N
-
 
K
-
 
A
L
 
V
D
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
K
G
 
A
I
 
Q
A
 
G
G
 
G
V
 
E
E
 
A
T
 
S
H
 
F
L
 
V
-
 
K
L
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
D
 
N
D
 
P
A
 
E
A
 
E
I
 
V
K
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
K
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
I
I
 
Y
G
 
G
T
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
-
V
 
I
A
 
G
A
 
G
G
 
E
N
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
A
C
 
G
D
 
D
D
 
Y
-
 
G
-
 
L
K
 
D
A
 
S
W
 
W
D
 
R
F
 
K
S
 
V
F
 
L
N
 
S
L
 
I
N
 
N
A
 
L
K
 
D
A
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
Y
T
 
G
I
 
C
R
 
K
A
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
G
 
Q
M
 
M
L
 
E
A
 
K
K
 
N
K
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
A
 
I
A
 
H
S
 
G
S
 
I
V
 
V
K
 
A
G
 
A
V
 
P
A
 
L
N
 
S
R
 
S
F
 
-
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
V
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
A
 
Q
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
T
x
Y
I
|
I
E
 
E
S
 
T
P
 
P
S
x
L
L
 
L
N
 
E
Q
 
S
R
 
L
I
 
T
S
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
K
E
 
E
V
 
M
R
 
K
A
 
E
A
 
A
F
 
L
V
 
I
G
 
S
R
 
K
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
S
 
S
N
 
S
F
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
S
 
G
I
 
Y
H
 
Y
M
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:252/254 of query aligns to 2:252/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
S
A
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
S
 
I
T
 
A
E
 
Q
L
 
V
F
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
I
 
V
A
 
L
T
 
N
D
 
G
I
x
F
S
 
G
K
 
D
P
 
P
H
 
A
-
 
P
-
 
A
L
 
L
D
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
-
 
R
-
 
H
G
 
G
I
 
V
A
 
K
G
 
A
V
 
V
E
 
H
T
 
-
H
 
H
L
 
P
L
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
D
 
D
D
 
V
A
 
A
A
 
Q
I
 
I
K
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
K
 
E
I
 
F
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
Y
 
I
V
 
Q
A
 
H
A
 
V
G
 
A
N
 
P
I
 
V
L
 
E
E
 
Q
C
 
F
D
 
P
D
 
L
K
 
E
A
 
S
W
 
W
D
 
D
F
 
K
S
 
I
F
 
I
N
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
L
K
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
R
 
R
A
 
L
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
R
A
 
A
K
 
R
K
 
N
A
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
H
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
S
A
 
T
N
 
G
R
 
K
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
G
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
L
D
 
E
F
 
T
V
 
A
A
 
T
Q
 
S
G
 
N
I
 
V
R
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
I
x
V
E
 
L
S
x
T
P
 
P
S
x
L
L
x
V
N
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
I
 
I
S
 
D
T
 
D
Q
x
R
A
 
A
K
 
A
E
 
N
T
 
G
G
 
G
K
 
D
S
 
P
E
 
L
E
 
Q
E
 
A
V
 
Q
R
 
H
A
 
D
A
 
L
F
 
L
V
 
A
G
 
E
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
M
 
S
G
 
L
R
 
A
I
 
F
G
 
V
K
 
T
A
 
P
E
 
E
E
 
H
V
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
E
 
A
S
 
G
N
 
S
F
 
Q
T
 
V
T
 
R
G
 
G
S
 
A
I
 
A
H
 
W
M
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
36% identity, 98% coverage: 6:253/254 of query aligns to 2:258/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
A
 
G
-
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
G
Q
 
W
G
|
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
I
T
 
A
E
 
V
L
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
V
D
 
D
I
 
R
S
 
D
K
 
L
P
 
A
H
 
S
L
 
M
D
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
R
I
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
S
V
 
V
E
 
T
T
 
P
H
 
C
L
 
L
L
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
D
D
 
S
A
 
A
A
 
S
I
 
V
K
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
A
K
 
R
I
 
C
G
 
G
T
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
A
V
 
P
A
 
S
A
 
P
G
 
G
N
 
G
I
 
P
L
 
V
E
 
A
C
 
L
D
 
D
D
 
E
K
 
A
A
 
Q
W
 
W
D
 
A
F
 
M
S
 
Q
F
 
L
N
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
L
K
 
T
A
 
T
M
 
A
F
 
F
H
 
L
T
 
M
I
 
C
R
 
K
A
 
Y
V
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
V
M
 
M
L
 
E
A
 
Q
K
 
Q
K
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
|
S
A
 
T
A
 
S
S
 
G
S
 
I
V
 
R
K
 
W
G
 
T
V
 
G
A
 
A
N
 
A
R
 
Q
F
 
V
A
 
G
Y
|
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
M
V
 
I
G
 
Q
L
 
M
T
 
G
K
 
R
S
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
E
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
 
K
G
 
N
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
L
I
 
L
E
 
H
S
 
T
P
|
P
S
x
M
L
 
V
N
 
D
Q
 
T
R
 
K
I
 
I
S
 
A
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
H
T
 
N
G
 
G
K
 
D
S
 
V
E
 
E
E
 
L
E
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
R
F
 
Q
V
 
-
G
 
A
R
 
R
Q
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
P
R
 
F
I
 
M
G
 
G
K
 
D
A
 
G
E
 
R
E
 
D
V
 
T
A
 
A
A
 
N
L
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
S
 
A
N
 
R
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
T
I
 
E
H
 
I
M
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
S
 
S

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
32% identity, 98% coverage: 7:254/254 of query aligns to 3:248/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
R
 
R
L
 
L
A
 
L
G
 
N
K
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
A
x
N
Q
x
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
S
 
T
T
 
A
E
 
K
L
 
R
F
 
F
A
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
I
 
F
A
 
I
T
 
V
D
 
G
I
x
R
S
x
R
K
 
R
P
 
K
H
 
E
L
 
L
D
 
E
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
R
G
 
N
I
 
V
A
 
T
G
 
A
V
 
V
E
 
K
T
x
A
H
x
D
L
x
V
L
 
T
D
 
K
V
 
L
T
 
E
D
 
D
D
 
L
A
 
D
A
 
R
I
 
L
K
 
Y
A
 
A
L
 
I
V
 
V
-
 
R
A
 
E
K
 
Q
I
 
R
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
A
C
x
N
A
x
S
G
|
G
Y
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
Q
G
 
K
N
 
T
I
 
L
L
 
E
E
 
E
C
 
I
D
 
T
D
 
P
K
 
E
A
 
H
W
 
Y
D
 
D
F
 
R
S
 
T
F
 
F
N
 
D
L
x
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
G
M
 
L
F
 
I
H
 
F
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
-
M
 
-
L
 
L
A
 
L
K
 
R
K
 
D
A
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
I
N
 
-
I
 
L
A
 
T
S
 
S
A
x
S
A
 
V
S
 
A
S
 
G
V
 
V
K
 
L
G
 
G
V
 
L
A
 
Q
N
 
A
R
x
H
F
 
D
A
 
T
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
A
K
 
R
S
 
T
V
 
W
A
 
T
A
 
T
D
 
E
F
 
L
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
S
P
 
P
G
|
G
T
 
A
I
|
I
E
 
D
S
x
T
P
 
P
S
x
I
L
 
I
N
 
E
Q
 
N
R
 
Q
I
 
V
S
 
S
T
 
T
Q
|
Q
A
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
E
S
 
E
E
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
K
F
 
F
V
 
A
G
 
A
R
 
A
Q
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
I
I
 
E
H
 
L
M
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
L
S
 
T
N
 
Q

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
33% identity, 98% coverage: 7:254/254 of query aligns to 3:248/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
R
 
R
L
 
L
A
 
L
G
 
N
K
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
A
x
N
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
S
 
T
T
 
A
E
 
K
L
 
R
F
 
F
A
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
I
 
F
A
 
I
T
 
V
D
 
G
I
x
R
S
x
R
K
 
R
P
 
K
H
 
E
L
 
L
D
 
E
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
R
G
 
N
I
 
V
A
 
T
G
 
A
V
 
V
E
 
K
T
 
A
H
x
D
L
x
V
L
 
T
D
 
K
V
 
L
T
 
E
D
 
D
D
 
L
A
 
D
A
 
R
I
 
L
K
 
Y
A
 
A
L
 
I
V
 
V
-
 
R
A
 
E
K
 
Q
I
 
R
G
 
G
T
 
S
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
A
C
x
N
A
x
S
G
|
G
Y
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
Q
G
 
K
N
 
T
I
 
L
L
 
E
E
 
E
C
 
I
D
 
T
D
 
P
K
 
E
A
 
H
W
 
Y
D
 
D
F
 
R
S
 
T
F
 
F
N
 
D
L
x
V
N
 
N
A
 
V
K
 
R
A
 
G
M
 
L
F
 
I
H
 
F
T
 
T
I
 
V
R
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
-
M
 
-
L
 
L
A
 
L
K
 
R
K
 
D
A
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
I
N
 
-
I
 
L
A
x
T
S
 
S
A
x
S
A
 
V
S
 
A
S
 
G
V
 
V
K
 
L
G
 
G
V
 
L
A
 
Q
N
 
A
R
x
H
F
 
D
A
 
T
Y
|
Y
G
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
A
K
 
R
S
 
T
V
 
W
A
 
T
A
 
T
D
 
E
F
 
L
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
T
x
A
I
|
I
E
 
D
S
x
T
P
 
P
S
|
S
L
|
L
N
 
E
Q
 
N
R
 
N
I
 
V
S
 
S
T
 
T
Q
 
Q
A
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
E
S
 
E
E
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
K
F
 
A
V
 
A
G
 
A
R
 
A
Q
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
S
N
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
I
I
 
E
H
 
L
M
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
x
L
S
 
T
N
 
Q

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
33% identity, 98% coverage: 5:254/254 of query aligns to 5:252/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
T
 
T
G
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
A
|
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
S
 
T
T
 
G
E
 
R
L
 
R
F
 
L
A
 
R
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
G
D
|
D
I
|
I
S
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
T
-
 
G
K
 
K
P
 
A
H
 
A
L
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
F
H
 
V
L
 
P
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
E
D
 
Q
A
 
E
A
 
A
I
 
V
K
 
D
A
 
N
L
 
L
V
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
A
A
 
S
K
 
T
I
 
F
G
 
G
T
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
F
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
S
A
 
P
A
 
P
G
 
E
N
 
D
-
 
D
-
 
L
I
 
I
L
 
E
E
 
N
C
 
T
D
 
D
D
 
L
K
 
P
A
 
A
W
 
W
D
 
Q
F
 
R
S
 
V
F
 
Q
N
 
D
L
 
I
N
 
N
A
 
L
K
 
K
A
 
S
M
 
V
F
 
Y
H
 
L
T
 
S
I
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
R
G
 
H
M
 
M
L
 
V
A
 
P
K
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
A
 
F
A
 
V
S
 
A
S
 
V
V
 
M
K
 
G
G
 
S
V
 
A
A
 
T
N
 
S
R
x
Q
F
 
I
A
 
S
Y
|
Y
G
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
A
L
 
M
T
 
S
K
 
R
S
 
E
V
 
L
A
 
G
A
 
V
D
 
Q
F
 
Y
V
 
A
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
x
P
I
x
V
E
 
N
S
 
T
P
 
P
S
 
L
L
 
L
N
 
Q
Q
 
E
R
 
L
I
 
F
S
 
A
T
 
K
Q
 
D
A
 
P
K
 
E
E
 
R
T
 
A
G
 
A
K
 
R
S
 
R
E
 
L
E
 
V
E
 
H
V
 
I
R
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
P
M
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
K
 
E
A
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
N
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
T
H
 
F
M
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
I
S
 
S
N
 
S

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:253/254 of query aligns to 5:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
S
 
S
A
 
S
S
 
P
T
 
T
G
 
T
R
 
R
L
 
F
A
 
T
G
 
D
K
 
R
T
 
V
V
 
V
L
|
L
I
|
I
T
|
T
A
x
G
A
x
G
A
x
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
S
x
T
T
x
A
E
x
V
L
x
R
F
x
L
A
|
A
R
x
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
I
x
S
A
x
L
T
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
S
K
 
S
P
 
E
H
 
G
L
 
L
D
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
L
E
 
E
L
 
T
A
 
A
G
 
P
I
 
D
A
 
A
G
 
E
V
 
V
E
 
L
T
 
T
H
 
T
L
 
V
L
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
I
 
V
K
 
E
A
 
A
L
 
Y
V
 
V
A
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
T
-
 
E
K
 
R
I
 
F
G
 
G
T
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
G
L
 
F
F
 
F
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
x
E
A
 
G
A
 
K
G
 
Q
N
 
N
I
 
P
L
 
T
E
 
E
C
 
S
D
 
F
D
 
T
K
 
A
A
 
A
-
 
E
W
 
F
D
 
D
F
 
K
S
 
V
F
 
V
N
 
S
L
 
I
N
 
N
A
 
L
K
 
R
A
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
L
T
 
G
I
 
L
R
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
G
 
I
M
 
M
L
 
R
A
 
E
K
 
Q
K
 
G
A
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
V
A
 
G
S
 
G
S
 
-
V
 
I
K
 
R
G
 
G
V
 
I
A
 
G
N
 
N
R
 
Q
F
 
S
A
 
G
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
N
V
 
S
A
 
A
A
 
V
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
A
 
R
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
A
I
 
I
E
 
W
S
 
T
P
 
P
S
 
M
L
 
V
N
 
E
Q
 
N
R
 
S
I
 
M
S
 
K
T
 
Q
Q
 
L
A
 
D
K
 
P
E
 
E
T
 
N
G
 
P
K
 
R
S
 
K
E
 
A
E
 
A
E
 
E
V
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
E
F
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
V
Q
 
N
P
 
P
M
 
S
G
 
K
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
K
 
E
A
 
A
E
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
S
 
A
N
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
A
S
 
T
I
 
V
H
 
V
M
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Q
S
 
S

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:251/254 of query aligns to 6:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
S
 
I
T
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
T
 
T
D
 
A
I
x
T
S
 
S
K
 
E
P
 
S
H
 
G
L
 
A
D
 
Q
E
 
A
L
 
I
A
 
S
G
 
D
I
 
Y
A
 
L
G
 
G
V
 
D
-
 
N
-
 
G
E
 
K
T
 
G
H
 
M
L
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
I
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
T
A
 
D
K
 
E
I
 
F
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
x
I
V
 
T