SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS19905 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS19905 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7on9A Crystal structure of para-hydroxybenzoate-3-hydroxylase prai (see paper)
65% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:389/393 of 7on9A

query
sites
7on9A
M
 
M
R
 
R
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
I
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
Y
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
I
 
I
E
 
E
S
 
S
V
 
I
V
 
I
L
 
I
E
|
E
T
x
N
R
|
R
S
 
T
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
E
S
 
G
T
 
T
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
|
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
M
T
 
N
E
 
Q
T
 
M
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
A
R
 
R
M
 
M
K
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
H
L
 
F
H
 
H
H
 
E
G
 
G
I
 
F
E
 
E
L
 
L
A
 
R
F
 
F
G
 
N
G
 
G
R
 
R
R
 
G
H
 
H
R
 
R
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
Y
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Q
|
Q
H
 
H
E
 
E
V
 
V
I
 
I
K
 
K
D
 
D
L
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
A
 
T
Q
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
I
L
 
H
F
 
F
S
 
N
V
 
V
S
 
G
G
 
D
T
 
V
S
 
S
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
V
E
 
D
T
 
T
D
 
S
K
 
S
P
 
P
R
 
K
V
 
I
R
 
R
F
 
F
M
 
R
-
 
P
-
 
N
H
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
H
 
Q
T
 
E
L
 
I
E
 
E
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
V
x
P
S
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
A
I
 
I
P
 
P
D
 
Q
S
 
S
K
 
V
R
 
R
Q
 
K
D
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
K
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
S
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
S
S
 
A
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
S
 
S
P
 
P
T
 
Q
V
 
I
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
C
 
V
D
 
D
P
 
A
K
 
Q
D
 
D
S
 
H
V
 
I
D
 
D
N
 
N
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
I
W
 
W
N
 
S
E
 
E
F
 
L
H
 
H
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
E
N
 
T
G
 
R
D
 
D
G
 
G
W
 
F
R
 
K
L
 
L
K
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
P
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
x
V
G
 
S
M
 
M
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
C
T
 
D
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
 
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
A
D
 
D
V
 
V
K
 
Q
R
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
L
D
 
E
D
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
K
S
 
A
A
 
G
S
 
K
E
 
M
A
 
E
G
 
I
L
 
L
A
 
N
S
 
R
Y
 
C
T
 
T
E
 
E
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
F
M
 
M
T
 
T
S
 
T
M
 
M
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
D
E
 
Q
D
 
G
A
 
H
S
 
T
P
 
P
F
 
F
Q
 
E
R
 
R
Q
 
G
I
 
I
Q
 
Q
R
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
D
N
 
Y
V
 
V
V
 
T
N
 
S
S
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
I
G
 
G

1iusA P-hydroxybenzoate hydroxylase complexed with 4-aminobenzoate at ph 5.0 (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of 1iusA

query
sites
1iusA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
 
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
|
L
V
 
C
S
|
S
T
 
Q
R
|
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

1dodA The mobil flavin of 4-oh benzoate hydroxylase: motion of a prosthetic group regulates catalysis (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of 1dodA

query
sites
1dodA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
 
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
|
S
T
 
Q
R
|
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
|
T
G
 
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

1d7lA Structure-function correlations of the reaction of reduced nicotinamide analogs with p-hydroxybenzoate hydroxylase substituted with a series of 8-substituted flavins (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of 1d7lA

query
sites
1d7lA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
|
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
x
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

P20586 p-hydroxybenzoate hydroxylase; PHBH; 4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase; EC 1.14.13.2 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 7 papers)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of P20586

query
sites
P20586
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
 
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
|
I
R
|
R
A
|
A
G
|
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
 
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
 
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
|
S
T
x
Q
R
|
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
|
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

1bf3A P-hydroxybenzoate hydroxylase (phbh) mutant with cys 116 replaced by ser (c116s) and arg 42 replaced by lys (r42k), in complex with fad and 4-hydroxybenzoic acid (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/391 of 1bf3A

query
sites
1bf3A
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
 
K
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
|
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
S
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
A
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

1pbcA Crystal structures of wild-type p-hydroxybenzoate hydroxylase complexed with 4-aminobenzoate, 2,4-dihydroxybenzoate and 2-hydroxy- 4-aminobenzoate and of the try222ala mutant, complexed with 2- hydroxy-4-aminobenzoate. Evidence for a proton channel and a new binding mode of the flavin ring (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/391 of 1pbcA

query
sites
1pbcA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
|
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
 
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
S
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
x
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
|
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
|
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
|
L
V
 
C
S
|
S
T
 
Q
R
|
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
A
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
|
T
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

2phhA The coenzyme analogue adenosine 5-diphosphoribose displaces fad in the active site of p-hydroxybenzoate hydroxylase. An x-ray crystallographic investigation (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/391 of 2phhA

query
sites
2phhA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
x
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
A
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

1pdhA Crystal structure of p-hydroxybenzoate hydroxylase reconstituted with the modified fad present in alcohol oxidase from methylotrophic yeasts: evidence for an arabinoflavin (see paper)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/391 of 1pdhA

query
sites
1pdhA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
A
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

P00438 p-hydroxybenzoate hydroxylase; PHBH; PHBHase; 4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase; EC 1.14.13.2 from Pseudomonas fluorescens (see 11 papers)
51% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of P00438

query
sites
P00438
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
x
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
x
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
|
I
R
|
R
A
|
A
G
|
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
 
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
x
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
 
D
G
 
G
F
|
F
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
|
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
|
S
T
x
Q
R
|
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
T
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
A
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
|
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G

1k0lA Pseudomonas aeruginosa phbh r220q free of p-ohb (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of 1k0lA

query
sites
1k0lA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
x
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
x
D
V
 
L
E
x
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
|
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
Q
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

1k0jA Pseudomonas aeruginosa phbh r220q in complex with NADPH and free of p- ohb (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/394 of 1k0jA

query
sites
1k0jA
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
 
A
G
|
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
 
A
G
 
E
T
 
V
S
 
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
|
F
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
Q
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
|
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

8jqoA Protocatecuate hydroxylase from xylophilus ampelinus complexed with imidazole (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:387/391 of 8jqoA

query
sites
8jqoA
M
 
M
R
 
R
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
A
H
 
H
L
 
L
L
 
L
H
 
R
L
 
R
K
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
E
|
E
T
x
R
R
 
A
S
 
A
R
 
R
E
 
E
E
 
H
I
 
V
E
 
R
S
 
T
T
x
R
I
 
L
R
|
R
A
 
A
G
 
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
M
 
V
D
 
E
I
 
M
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
G
R
 
R
M
 
I
K
 
D
R
 
A
E
 
V
G
 
G
A
 
M
L
 
E
H
 
M
H
 
H
G
 
A
I
 
I
E
 
D
L
 
F
A
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
S
H
 
H
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
F
T
 
H
E
 
E
L
 
A
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
R
A
 
R
I
 
A
T
 
W
V
 
V
Y
 
Y
A
 
P
Q
|
Q
H
 
H
E
 
E
V
 
V
I
 
V
K
 
T
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
S
A
 
A
R
 
C
L
 
D
A
 
A
A
 
G
Q
 
D
G
 
V
Q
 
P
L
 
I
L
 
L
F
 
Y
S
 
E
V
 
A
S
 
P
G
x
V
T
 
E
S
 
R
I
 
I
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
D
D
 
D
K
 
R
P
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
V
F
 
F
M
 
G
H
 
Q
E
 
D
G
 
G
E
 
A
Q
 
A
H
 
G
T
 
E
L
 
I
E
 
T
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
|
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
G
A
 
S
I
 
M
P
 
P
D
 
A
S
 
G
K
 
I
R
 
A
Q
 
R
D
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
T
Y
 
W
A
 
G
Q
 
C
H
 
S
E
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
M
V
 
M
S
 
S
T
 
M
R
 
R
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
V
Q
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
C
 
C
D
 
E
P
 
P
K
 
D
D
 
E
S
 
D
V
 
P
D
 
D
N
 
A
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
I
W
 
W
N
 
S
E
 
E
F
 
L
H
 
H
T
 
R
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
V
G
 
E
D
 
G
G
 
M
W
 
P
R
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
P
I
 
I
F
 
R
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
T
G
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
L
S
 
S
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
S
A
 
A
V
 
M
G
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
K
R
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
A
I
 
L
D
 
V
D
 
D
F
 
H
Y
 
Y
R
 
R
S
 
H
A
 
G
S
 
R
E
 
S
A
 
D
G
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
T
Y
 
Y
T
 
S
E
 
E
Q
 
R
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
M
W
 
W
R
 
L
A
 
V
E
 
Q
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
A
W
 
A
M
 
L
T
 
C
S
 
T
M
 
M
L
 
V
H
 
H
T
 
Q
F
 
F
E
 
P
D
 
G
A
 
Q
S
 
N
P
 
E
F
 
F
Q
 
V
R
 
R
Q
 
R
I
 
L
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
D
N
 
Y
V
 
M
V
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
A
 
A
L
 
G
S
 
R
T
 
L
A
 
Q
L
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
V
 
T
G
 
G

1ykjB A45g p-hydroxybenzoate hydroxylase with p-hydroxybenzoate bound (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 1:385/392 of 1ykjB

query
sites
1ykjB
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
|
I
G
|
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
L
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
P
E
 
D
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
x
G
G
 
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
M
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
D
E
 
R
R
 
R
M
 
M
K
 
A
R
 
R
E
 
-
G
 
-
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
A
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
H
 
R
R
 
R
I
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
R
L
 
L
T
 
S
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
E
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
C
Q
 
G
G
 
A
Q
 
T
L
 
T
L
 
V
F
 
Y
S
 
Q
V
 
A
S
x
A
G
x
E
T
 
V
S
x
R
I
 
L
E
 
H
G
 
D
V
 
L
E
 
Q
T
 
G
D
 
E
K
 
R
P
 
P
R
 
Y
V
 
V
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
H
 
L
T
 
R
L
 
L
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
|
G
F
 
F
H
|
H
G
 
G
V
 
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
A
S
 
E
K
 
R
R
 
L
Q
 
K
D
 
V
Y
 
F
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
S
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
N
H
 
H
E
 
P
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
A
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
 
Y
F
 
V
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
S
D
 
E
S
 
K
V
 
V
D
 
E
N
 
D
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
T
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
S
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
E
R
 
K
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
S
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
x
P
M
 
L
R
|
R
S
 
S
F
 
F
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
S
R
 
T
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
L
I
 
L
D
 
L
D
 
K
F
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
G
A
 
E
G
 
L
L
 
L
A
 
E
S
 
R
Y
 
Y
T
 
S
E
 
A
Q
 
I
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
I
W
 
W
R
 
K
A
 
A
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
W
M
 
M
T
 
T
S
 
S
M
 
V
L
 
L
H
 
H
T
 
R
F
 
F
E
 
P
D
 
D
A
 
T
S
 
D
P
 
A
F
 
F
Q
 
S
R
 
Q
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
E
N
 
Y
V
 
Y
V
 
L
N
 
G
S
 
S
R
 
E
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
A
A
 
T
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

6dllB 2.2 angstrom resolution crystal structure of p-hydroxybenzoate hydroxylase from pseudomonas putida in complex with fad. (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:386/388 of query aligns to 4:391/398 of 6dllB

query
sites
6dllB
M
 
M
R
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
x
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
D
S
 
N
V
 
I
V
 
I
L
 
V
E
|
E
T
x
R
R
 
Q
S
 
T
R
 
A
E
 
E
E
 
Y
I
 
V
E
 
L
S
 
G
T
x
R
I
 
I
R
|
R
A
|
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
M
 
V
D
 
D
I
 
L
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
M
K
 
D
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
L
L
 
V
H
|
H
H
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
L
F
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
G
Q
 
K
A
 
T
I
 
V
T
 
M
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
Q
|
Q
H
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
T
K
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
M
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
E
A
 
A
A
 
S
Q
 
G
G
 
A
Q
 
P
L
 
I
L
 
I
F
 
Y
S
 
S
V
 
A
S
 
A
G
 
N
T
 
V
S
 
Q
I
 
P
E
 
H
G
 
E
V
 
L
E
 
K
T
 
G
D
 
E
K
 
K
P
 
P
R
 
Y
V
 
L
R
 
T
F
 
F
M
 
E
H
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
R
Q
 
V
H
 
Q
T
 
R
L
 
I
E
 
D
A
 
C
D
 
D
F
 
Y
I
 
I
A
 
A
G
 
G
C
|
C
D
|
D
G
 
G
F
 
F
H
 
H
G
 
G
V
x
I
S
 
S
R
 
R
P
 
Q
A
 
S
I
 
I
P
 
P
D
 
E
S
 
G
K
 
V
R
 
L
Q
 
K
D
 
Q
Y
 
Y
Q
 
E
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
V
 
S
E
 
D
A
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
V
S
 
N
D
 
H
E
 
E
L
 
L
I
 
I
Y
|
Y
A
 
A
Q
 
H
H
 
H
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
L
V
 
C
S
 
S
T
 
Q
R
 
R
S
 
S
P
 
Q
T
 
T
V
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
Y
Y
|
Y
F
 
L
Q
 
Q
C
 
V
D
 
P
P
 
L
K
 
Q
D
 
D
S
 
R
V
 
V
D
 
E
N
 
E
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
R
 
R
I
 
F
W
 
W
N
 
D
E
 
E
F
 
L
H
 
K
T
 
A
R
 
R
L
 
L
E
 
P
N
 
A
G
 
E
D
 
V
G
 
A
W
 
A
R
 
D
L
 
L
K
 
V
E
 
T
G
 
G
K
 
P
I
 
A
F
 
L
Q
 
E
K
 
K
G
 
S
I
 
I
I
 
A
G
 
P
M
 
L
R
 
R
S
 
S
F
 
L
V
 
V
S
 
V
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
Y
G
 
G
R
 
H
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
V
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
|
P
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
|
G
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
A
V
 
A
G
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
N
R
 
Y
L
 
L
A
 
Y
Q
 
R
G
 
I
I
 
L
D
 
V
D
 
K
F
 
V
Y
 
Y
R
 
H
S
 
E
A
 
G
S
 
R
E
 
V
A
 
D
G
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
E
 
P
Q
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
V
W
 
W
R
 
K
A
 
G
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
W
W
 
F
M
 
M
T
 
T
S
 
Q
M
 
L
L
 
L
H
 
H
T
 
D
F
 
F
-
 
G
E
 
S
D
 
H
A
 
K
S
 
D
P
 
A
F
 
W
Q
 
D
R
 
Q
Q
 
K
I
 
M
Q
 
Q
R
 
E
A
 
A
E
 
D
L
 
R
E
 
E
N
 
Y
V
 
F
V
 
L
N
 
T
S
 
S
R
 
P
A
 
A
L
 
G
S
 
L
T
 
V
A
 
N
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
|
Y
V
 
V
G
 
G

8jqoD Protocatecuate hydroxylase from xylophilus ampelinus complexed with imidazole (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:386/388 of query aligns to 1:305/309 of 8jqoD

query
sites
8jqoD
T
 
T
Q
 
Q
V
 
V
A
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
A
H
 
H
L
 
-
L
 
-
H
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
S
 
-
T
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
G
V
|
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
M
 
V
D
 
E
I
 
M
L
 
L
T
 
R
E
 
E
T
 
E
G
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
M
H
 
H
G
 
A
I
 
I
E
 
D
L
 
F
A
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
S
H
 
H
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
F
T
 
H
E
 
E
L
 
A
T
 
S
G
 
G
Q
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
V
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
E
 
-
V
 
-
I
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
G
Q
 
R
L
 
R
L
 
A
F
 
W
S
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
I
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
L
E
 
E
T
 
D
D
 
D
K
 
R
P
 
A
R
 
R
V
 
I
R
 
-
F
 
-
M
 
-
H
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
H
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
V
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
|
G
F
 
F
H
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
G
A
 
S
I
 
M
P
 
P
D
 
G
S
 
I
K
 
A
R
 
R
Q
 
-
D
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
P
 
P
F
 
F
G
 
G
W
 
W
F
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
L
V
 
A
E
 
D
A
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
D
L
 
V
I
 
T
Y
 
W
A
 
G
Q
 
C
H
 
S
E
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
L
 
M
V
 
M
S
 
S
T
 
M
R
 
R
S
 
S
P
 
P
T
 
T
V
 
V
Q
 
T
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
F
 
L
Q
 
Q
C
 
C
D
 
E
P
 
P
K
 
D
D
 
E
S
 
D
V
 
P
D
 
D
N
 
A
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
I
W
 
W
N
 
S
E
 
E
F
 
L
H
 
H
T
 
R
R
 
R
L
 
L
E
 
D
N
 
V
G
 
E
D
 
G
G
 
M
W
 
P
R
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
E
G
 
G
K
 
P
I
 
I
F
 
R
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
V
I
x
T
G
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
F
 
F
V
 
L
S
 
S
T
 
E
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
R
 
R
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
|
A
K
 
K
G
|
G
L
|
L
N
|
N
L
 
S
A
 
A
V
 
M
G
 
A
D
 
D
V
 
I
K
 
K
R
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
A
I
 
L
D
 
V
D
 
D
F
 
H
Y
 
Y
R
 
R
S
 
H
A
 
G
S
 
R
E
 
S
A
 
D
G
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
T
Y
 
Y
T
 
S
E
 
E
Q
 
R
A
 
C
L
 
L
K
 
R
R
 
R
I
 
M
W
 
W
R
 
L
A
 
V
E
 
Q
Y
 
R
F
 
F
S
 
S
W
 
A
W
 
A
M
 
L
T
 
C
S
 
T
M
 
M
L
 
V
H
 
H
T
 
Q
F
 
F
E
 
P
D
 
G
A
 
Q
S
 
N
P
 
E
F
 
F
Q
 
V
R
 
R
Q
 
R
I
 
L
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
D
N
 
Y
V
 
M
V
 
T
N
 
G
S
 
T
R
 
H
A
 
A
L
 
G
S
 
R
T
 
L
A
 
Q
L
 
F
A
 
A
E
 
E
N
 
N
Y
 
F
V
 
T
G
 
G

6brdA Crystal structure of rifampin monooxygenase from streptomyces venezuelae, complexed with rifampin and fad (see paper)
26% identity, 78% coverage: 5:308/388 of query aligns to 4:300/474 of 6brdA

query
sites
6brdA
V
 
V
A
 
I
I
 
V
I
x
V
G
 
G
A
 
G
G
|
G
P
|
P
A
x
T
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
A
H
 
G
L
 
E
L
 
L
H
 
R
L
 
L
K
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
R
S
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
E
|
E
T
x
K
R
 
E
S
 
T
R
 
E
E
 
P
E
 
T
I
 
R
E
 
Q
S
 
S
T
 
-
I
 
-
R
|
R
A
|
A
G
x
Q
V
 
G
L
 
L
E
x
H
Q
 
V
G
 
R
T
 
S
M
 
I
D
 
E
I
 
V
L
 
M
T
 
A
E
 
Q
T
 
R
G
 
G
V
 
L
G
 
L
E
 
E
R
 
R
M
 
F
K
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
H
 
E
H
 
R
G
 
G
I
 
H
E
 
T
L
 
V
A
 
A
F
 
V
G
 
G
G
 
G
R
x
F
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
W
R
 
P
H
 
E
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
T
G
 
A
Q
 
H
A
 
S
I
 
Y
T
 
V
V
 
L
Y
 
A
A
 
V
Q
 
P
H
x
Q
E
 
V
V
 
I
I
 
T
K
 
E
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
L
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
I
F
 
R
S
 
-
V
 
-
S
 
R
G
 
G
T
 
R
S
 
A
I
x
L
E
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
R
T
 
Q
D
 
D
K
 
E
P
 
D
R
 
G
V
 
V
R
 
T
F
 
V
-
 
D
M
 
L
H
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
-
T
 
-
L
 
L
E
 
R
A
 
A
D
 
R
F
 
Y
I
 
V
A
 
V
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
|
G
-
 
G
-
 
R
-
 
S
-
x
T
-
 
V
-
 
R
-
 
K
F
 
L
H
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
A
R
 
F
P
 
P
A
 
G
I
 
E
P
 
P
D
 
S
S
 
R
K
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
E
A
 
T
P
 
L
P
 
L
S
 
G
S
 
E
D
 
M
E
 
E
L
 
M
I
 
T
Y
 
A
A
 
S
Q
 
Q
H
 
E
E
 
E
R
 
L
G
 
T
F
 
S
V
 
V
L
 
M
V
 
T
S
 
E
T
 
V
R
|
R
S
 
K
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
x
R
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
x
M
P
 
P
T
x
L
V
 
G
Q
 
D
R
 
G
L
 
V
Y
 
F
F
 
R
Q
 
V
C
x
V
D
 
V
P
 
P
K
 
A
D
 
E
S
 
G
V
 
V
-
 
A
D
 
E
N
 
D
W
 
R
S
 
T
D
 
A
D
 
S
R
 
P
I
 
T
W
 
L
N
 
D
E
 
E
F
 
F
H
 
K
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
E
 
R
N
 
A
G
 
H
D
 
A
G
 
G
W
 
T
R
 
D
L
 
F
K
 
G
E
 
V
G
 
H
K
 
S
I
 
P
F
 
R
Q
 
W
K
 
L
G
 
S
I
 
R
I
 
F
G
 
G
M
 
D
R
 
A
S
 
T
F
 
R
V
 
Q
S
 
A
T
 
E
P
 
R
M
 
Y
Q
 
R
H
 
V
G
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
H
P
 
P
P
|
P
T
|
T
G
|
G
A
x
G
K
x
Q
G
|
G
L
|
L
N
 
N
L
 
L
A
 
G
V
 
I
G
 
Q
D
 
D
V
 
A
K
 
F
R
 
N
L
 
L

Sites not aligning to the query:

F2R776 Rifampicin monooxygenase; RIFMO; EC 1.14.13.211 from Streptomyces venezuelae (strain ATCC 10712 / CBS 650.69 / DSM 40230 / JCM 4526 / NBRC 13096 / PD 04745) (see paper)
26% identity, 78% coverage: 5:308/388 of query aligns to 4:300/476 of F2R776

query
sites
F2R776
V
 
V
A
 
I
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
P
A
x
T
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
A
H
 
G
L
 
E
L
 
L
H
 
R
L
 
L
K
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
R
S
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
E
|
E
T
x
K
R
 
E
S
 
T
R
 
E
E
 
P
E
 
T
I
 
R
E
 
Q
S
 
S
T
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
A
G
 
Q
V
 
G
L
 
L
E
 
H
Q
 
V
G
 
R
T
 
S
M
 
I
D
 
E
I
 
V
L
 
M
T
 
A
E
 
Q
T
 
R
G
 
G
V
 
L
G
 
L
E
 
E
R
 
R
M
 
F
K
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
H
 
E
H
 
R
G
 
G
I
 
H
E
 
T
L
 
V
A
 
A
F
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
F
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
S
-
 
W
R
 
P
H
 
E
R
 
R
I
 
L
D
 
D
L
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
T
G
 
A
Q
 
H
A
 
S
I
 
Y
T
 
V
V
 
L
Y
 
A
A
 
V
Q
 
P
H
x
Q
E
 
V
V
 
I
I
 
T
K
 
E
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
H
L
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
Q
 
A
L
 
E
L
 
I
F
 
R
S
 
-
V
 
-
S
 
R
G
 
G
T
 
R
S
 
A
I
x
L
E
 
V
G
 
G
V
 
L
E
 
R
T
 
Q
D
 
D
K
 
E
P
 
D
R
 
G
V
 
V
R
 
T
F
 
V
-
 
D
M
 
L
H
 
A
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
H
 
-
T
 
-
L
 
L
E
 
R
A
 
A
D
 
R
F
 
Y
I
 
V
A
 
V
G
 
G
C
 
C
D
 
D
G
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
S
-
x
T
-
 
V
-
 
R
-
 
K
F
 
L
H
 
L
G
 
G
V
 
V
S
 
A
R
 
F
P
 
P
A
 
G
I
 
E
P
 
P
D
 
S
S
 
R
K
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
W
 
-
F
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
E
A
 
T
P
 
L
P
 
L
S
 
G
S
 
E
D
 
M
E
 
E
L
 
M
I
 
T
Y
 
A
A
 
S
Q
 
Q
H
 
E
E
 
E
R
 
L
G
 
T
F
 
S
V
 
V
L
 
M
V
 
T
S
 
E
T
 
V
R
|
R
S
 
K
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
-
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
M
P
 
P
T
 
L
V
 
G
Q
 
D
R
 
G
L
 
V
Y
 
F
F
x
R
Q
 
V
C
 
V
D
 
V
P
 
P
K
 
A
D
 
E
S
 
G
V
 
V
-
 
A
D
 
E
N
 
D
W
 
R
S
 
T
D
 
A
D
 
S
R
 
P
I
 
T
W
 
L
N
 
D
E
 
E
F
 
F
H
 
K
T
 
Q
R
 
Q
L
 
L
E
 
R
N
 
A
G
 
H
D
 
A
G
 
G
W
 
T
R
 
D
L
 
F
K
 
G
E
 
V
G
 
H
K
 
S
I
 
P
F
 
R
Q
 
W
K
 
L
G
 
S
I
 
R
I
 
F
G
 
G
M
 
D
R
 
A
S
 
T
F
 
R
V
 
Q
S
 
A
T
 
E
P
 
R
M
 
Y
Q
 
R
H
 
V
G
 
D
R
 
R
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
I
V
 
H
P
 
P
P
 
P
T
 
T
G
 
G
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
|
L
N
|
N
L
 
L
A
 
G
V
 
I
G
 
Q
D
 
D
V
 
A
K
 
F
R
 
N
L
 
L

6ui5A Tmn9 in complex with cofactor fad
24% identity, 79% coverage: 5:312/388 of query aligns to 3:309/497 of 6ui5A

query
sites
6ui5A
V
 
V
A
 
V
I
 
V
I
x
V
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
 
P
A
|
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
A
H
 
C
L
 
E
L
 
L
H
 
A
L
 
M
K
 
R
G
 
D
I
 
V
E
 
P
S
 
A
V
 
V
V
 
L
L
 
V
E
x
D
T
x
I
R
x
H
S
 
P
R
 
T
E
 
Q
E
x
R
I
 
A
E
 
E
S
 
A
T
x
P
I
x
A
R
 
M
A
 
A
G
 
-
V
 
-
L
 
I
E
 
N
Q
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
D
 
E
I
 
M
L
 
L
T
 
D
E
 
Q
T
 
R
G
 
G
V
 
L
G
 
A
E
 
A
R
 
G
M
 
L
K
 
-
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
T
L
 
V
H
 
T
H
 
F
G
 
-
I
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
R
F
 
F
G
 
A
G
 
D
R
 
L
R
 
R
H
 
L
R
 
A
I
 
F
D
 
E
L
 
K
T
 
V
E
 
Q
L
 
G
T
 
P
G
 
R
Q
 
E
A
 
P
I
 
T
T
 
H
V
 
M
Y
 
V
A
 
L
Q
 
Q
H
 
S
E
 
R
V
 
L
I
 
E
K
 
K
D
 
V
L
 
L
V
 
I
A
 
D
A
 
R
R
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
L
Q
 
G
G
 
V
Q
 
D
L
 
L
L
 
R
F
 
W
S
 
A
V
 
T
S
 
R
G
x
L
T
 
T
S
 
G
I
 
F
E
 
E
-
 
E
G
 
A
V
 
A
E
 
D
T
 
G
D
 
S
K
 
G
P
 
V
R
 
T
V
 
V
R
 
T
F
 
L
M
 
A
H
 
S
E
 
D
G
 
A
E
 
G
Q
 
E
H
 
E
T
 
Q
L
 
L
E
 
R
A
 
C
D
 
R
F
 
Y
I
 
L
A
 
V
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
R
H
 
E
G
 
S
V
 
I
S
 
V
R
 
R
P
 
K
-
 
Q
A
 
A
I
 
G
P
 
I
D
 
D
S
 
Y
K
 
V
R
 
G
Q
 
D
D
 
D
Y
 
W
Q
 
-
R
 
-
I
 
V
Y
 
I
P
 
V
F
 
R
G
 
G
W
 
I
F
 
V
G
 
G
V
 
D
L
 
V
V
 
A
-
 
I
-
 
N
-
 
R
-
 
E
E
 
D
A
 
V
P
 
A
P
 
P
S
 
E
S
 
Q
D
 
Y
E
 
G
L
 
L
I
 
S
Y
 
Y
A
 
T
Q
 
D
H
 
N
E
 
G
R
 
D
G
 
Q
F
 
F
V
 
-
L
 
L
V
 
G
S
 
A
T
 
P
R
 
L
S
 
S
P
 
P
T
 
D
V
 
V
Q
 
M
R
 
R
L
 
V
Y
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
E
F
 
F
Q
 
S
C
 
T
D
 
E
P
 
P
K
 
P
D
 
E
S
 
F
V
 
E
D
 
D
N
 
G
W
 
P
S
 
A
D
 
T
D
 
L
R
 
E
I
 
Q
W
 
L
N
 
G
E
 
D
F
 
A
H
 
V
T
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
-
N
 
T
G
 
G
D
 
K
G
 
E
W
 
L
R
 
K
L
 
A
K
 
T
E
 
E
G
 
A
K
 
H
I
 
W
F
 
L
Q
 
Q
K
 
H
G
x
Y
I
 
S
I
 
I
G
 
V
M
 
T
R
 
R
S
 
N
F
 
-
V
 
-
S
 
A
T
 
E
P
 
Q
M
 
Y
Q
 
R
H
 
K
G
 
G
R
 
R
L
 
V
F
 
F
L
 
I
A
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
H
P
 
Y
P
|
P
T
 
Y
G
 
N
A
 
G
K
 
Q
G
|
G
L
|
L
N
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
A
K
 
V
R
 
N
L
 
L
A
 
G
Q
 
W
G
 
K
I
 
I

4x4jA Structural and functional studies of bexe: insights into oxidation during be-7585a biosynthesis
27% identity, 82% coverage: 5:324/388 of query aligns to 4:310/482 of 4x4jA

query
sites
4x4jA
V
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
L
S
 
A
H
 
G
L
 
E
L
 
L
H
 
R
L
 
L
K
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
G
S
 
V
V
 
V
V
 
V
L
|
L
E
|
E
T
x
R
R
 
L
S
 
P
R
 
A
E
 
R
E
 
T
I
 
G
E
 
E
S
 
S
T
 
-
I
 
-
R
|
R
A
x
G
G
x
L
V
 
G
L
 
F
E
 
T
Q
 
A
G
 
R
T
 
T
M
 
M
D
 
E
I
 
V
L
 
F
T
 
D
E
 
Q
T
 
R
G
 
G
V
 
L
G
 
-
E
 
-
R
 
-
M
 
L
K
 
R
R
 
R
E
 
F
G
 
G
A
 
E
L
 
V
H
 
Q
H
 
T
G
 
S
I
 
D
E
 
Q
L
 
G
A
 
H
F
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
I
R
 
P
H
 
V
R
 
D
I
 
F
D
 
G
L
 
L
T
 
L
E
 
D
L
 
G
T
 
A
G
 
H
Q
 
Q
A
 
A
I
 
A
T
 
K
V
 
T
Y
 
I
A
 
P
Q
|
Q
H
 
S
-
 
A
-
 
T
E
 
E
V
 
A
I
 
V
K
 
L
D
 
E
L
 
A
V
 
W
A
 
A
A
 
G
R
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
D
G
 
I
Q
 
R
L
 
R
L
 
G
F
 
H
S
x
E
V
x
L
S
 
T
G
 
G
T
 
V
S
 
R
I
 
D
E
 
D
G
 
G
V
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
D
K
 
G
P
 
V
R
 
A
V
 
V
R
 
T
F
 
V
M
 
R
H
 
G
E
 
P
G
 
A
E
 
G
Q
 
E
H
 
H
T
 
V
L
 
L
E
 
R
A
 
A
D
 
G
F
 
W
I
 
L
A
 
V
G
 
G
C
 
C
D
|
D
G
 
G
F
 
G
H
 
R
G
 
S
V
 
A
S
 
V
R
 
R
P
 
K
A
 
A
I
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
D
-
 
F
P
 
P
D
 
G
S
 
T
K
 
A
R
 
A
Q
 
T
D
 
-
Y
 
-
Q
 
R
R
 
E
I
 
M
Y
 
F
P
 
L
F
 
A
G
 
D
W
 
L
F
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
E
V
 
L
E
 
E
A
 
P
P
 
R
P
 
M
S
 
S
S
 
L
D
 
P
E
 
G
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
G
F
 
M
V
 
V
L
 
M
V
 
V
S
 
G
T
 
P
R
x
L
S
 
P
P
 
G
T
 
G
V
 
V
Q
 
T
R
 
R
L
 
I
Y
x
I
F
 
V
Q
 
-
C
 
C
D
 
E
P
 
-
K
 
R
D
 
D
S
 
A
V
 
P
D
 
P
N
 
R
W
 
R
S
 
R
D
 
T
D
 
G
R
 
P
I
 
-
W
 
-
N
 
P
E
 
P
F
 
F
H
 
H
T
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
E
N
 
V
G
 
A
D
 
D
G
 
A
W
 
W
R
 
K
L
 
R
K
 
I
E
 
T
G
 
G
-
 
I
K
 
D
I
 
I
F
 
S
Q
 
A
K
 
A
G
 
E
I
 
P
I
 
V
G
 
W
M
 
L
R
 
S
S
 
A
F
 
F
V
 
G
S
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
P
 
E
M
 
Y
Q
 
R
H
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
D
|
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
I
 
V
V
 
H
P
 
L
P
|
P
T
 
A
G
 
G
A
x
G
K
x
Q
G
|
G
L
x
M
N
|
N
L
 
A
A
 
G
V
 
I
G
 
Q
D
 
D
V
 
A
K
 
V
R
 
N
L
 
L
A
 
G
Q
 
W
G
 
K
I
 
L
D
 
A
D
 
A
F
 
V
Y
 
V
R
 
R
S
 
G
A
 
T
S
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
D
L
 
L

Query Sequence

>HSERO_RS19905 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS19905
MRTQVAIIGAGPAGLLLSHLLHLKGIESVVLETRSREEIESTIRAGVLEQGTMDILTETG
VGERMKREGALHHGIELAFGGRRHRIDLTELTGQAITVYAQHEVIKDLVAARLAAQGQLL
FSVSGTSIEGVETDKPRVRFMHEGEQHTLEADFIAGCDGFHGVSRPAIPDSKRQDYQRIY
PFGWFGVLVEAPPSSDELIYAQHERGFVLVSTRSPTVQRLYFQCDPKDSVDNWSDDRIWN
EFHTRLENGDGWRLKEGKIFQKGIIGMRSFVSTPMQHGRLFLAGDAAHIVPPTGAKGLNL
AVGDVKRLAQGIDDFYRSASEAGLASYTEQALKRIWRAEYFSWWMTSMLHTFEDASPFQR
QIQRAELENVVNSRALSTALAENYVGAF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory