SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing HSERO_RS22255 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS22255 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
42% identity, 94% coverage: 16:306/308 of query aligns to 9:302/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
L
 
L
A
 
H
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
L
 
V
L
 
L
R
 
K
D
 
D
-
 
A
-
 
G
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
V
 
I
Y
 
Y
A
 
E
G
 
-
A
 
E
K
 
Y
P
 
P
T
 
D
E
 
E
D
 
D
D
 
R
M
 
L
V
 
V
K
 
E
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
L
 
D
H
 
V
Q
 
E
P
 
-
V
 
-
A
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
K
-
 
P
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
R
R
 
R
V
 
V
M
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
A
P
 
P
I
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
I
 
I
S
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
N
I
 
I
D
 
D
S
 
V
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
V
K
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
S
P
 
R
A
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
A
W
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
M
M
 
F
A
 
S
C
 
V
A
 
A
K
 
R
N
 
K
V
 
I
V
 
A
G
 
F
L
 
A
D
 
D
Q
 
R
R
 
K
M
 
M
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
V
W
 
W
D
 
A
K
 
K
S
 
K
T
 
E
H
 
A
K
 
M
S
 
G
L
 
I
E
 
E
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
L
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
Y
A
 
P
K
 
N
E
 
E
A
 
E
P
 
R
Q
 
A
G
 
K
V
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
Q
 
K
L
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
E
T
 
T
L
 
L
F
 
L
A
 
K
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
A
 
E
E
 
S
N
x
T
K
 
Y
H
 
H
M
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
E
Q
 
E
S
 
R
L
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
M
K
 
K
D
 
K
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
W
L
 
I
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
E
E
|
E
P
 
P
F
 
L
T
 
P
A
 
K
P
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
T
R
 
K
V
 
F
G
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
V
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
E
A
 
R
M
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
E
N
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
K
V
 
I
L
 
L

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 95% coverage: 9:302/308 of query aligns to 4:298/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
I
G
 
A
V
 
D
D
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
A
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
G
D
 
D
Y
 
Q
E
 
V
L
 
E
V
 
V
Y
 
R
A
 
W
G
 
V
A
 
D
K
 
G
P
 
P
T
 
D
E
 
R
D
 
D
D
 
K
M
 
L
V
 
-
K
 
-
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
V
H
 
P
Q
 
E
P
 
A
V
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
G
 
T
-
 
T
V
 
V
S
 
D
A
 
A
R
 
E
V
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
I
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
I
I
 
V
S
 
A
K
x
R
H
 
A
G
 
G
T
x
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
V
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
L
V
 
V
K
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
P
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
A
W
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
C
 
A
A
 
S
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
A
L
 
A
D
 
D
Q
 
A
R
 
S
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
H
H
 
T
W
 
W
D
 
K
K
 
R
S
 
S
T
 
S
H
 
F
K
 
S
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
I
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
V
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
P
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
P
A
 
A
K
 
R
E
 
A
A
 
A
P
 
Q
Q
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
E
N
 
T
K
 
A
H
 
G
M
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
K
Q
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
T
K
 
K
D
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
T
S
 
G
G
 
G
K
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
F
E
 
A
K
 
T
E
|
E
P
 
P
F
 
C
T
 
T
A
 
-
P
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
R
 
E
V
 
L
G
 
A
N
 
Q
A
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
G
x
A
V
 
S
T
 
T
S
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
x
Q
I
 
D
A
 
R
M
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
D
A
 
V
A
 
A
S
 
E
N
 
S
V
 
V

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 95% coverage: 9:302/308 of query aligns to 3:297/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
V
 
V
I
 
V
V
 
L
T
 
I
G
 
A
V
 
D
D
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
P
A
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
G
D
 
D
Y
 
Q
E
 
V
L
 
E
V
 
V
Y
 
R
A
 
W
G
 
V
A
 
D
K
 
G
P
 
P
T
 
D
E
 
R
D
 
D
D
 
K
M
 
L
V
 
-
K
 
-
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
V
H
 
P
Q
 
E
P
 
A
V
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
G
 
T
-
 
T
V
 
V
S
 
D
A
 
A
R
 
E
V
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
I
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
I
I
 
V
S
 
A
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
V
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
A
 
L
V
 
V
K
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
P
G
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
P
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
H
T
 
A
W
 
L
A
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
C
 
A
A
 
S
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
A
L
 
A
D
 
D
Q
 
A
R
 
S
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
H
H
 
T
W
 
W
D
 
K
K
 
R
S
 
S
T
 
S
H
 
F
K
 
S
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
I
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
R
 
L
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
V
 
R
A
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
A
P
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
Y
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
P
A
 
A
K
 
R
E
 
A
A
 
A
P
 
Q
Q
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
D
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Q
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
A
 
P
E
 
E
N
 
T
K
 
A
H
 
G
M
 
L
I
 
I
N
 
D
A
 
K
Q
 
E
S
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
M
 
T
K
 
K
D
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
T
S
 
G
G
 
G
K
 
H
L
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
F
E
 
A
K
 
T
E
|
E
P
 
P
F
 
C
T
 
T
A
 
-
P
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
L
Q
 
F
R
 
E
V
 
L
G
 
A
N
 
Q
A
 
V
V
 
V
L
 
V
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
A
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
D
A
 
R
M
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
D
A
 
V
A
 
A
S
 
E
N
 
S
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
38% identity, 80% coverage: 60:305/308 of query aligns to 57:311/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
V
 
I
S
 
D
A
 
Q
R
 
E
V
 
V
M
 
F
D
 
E
A
 
N
A
 
A
P
 
P
I
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
V
S
 
A
K
 
N
H
x
Y
G
x
A
T
x
V
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
I
D
 
D
S
 
V
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
K
 
T
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
D
A
 
V
N
x
L
A
 
T
P
 
N
A
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
H
T
 
A
W
 
F
A
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
C
 
T
A
 
A
K
 
R
N
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
K
L
 
G
D
 
D
Q
 
K
R
 
F
M
 
V
R
 
R
E
 
S
G
 
G
H
 
E
W
 
W
D
 
K
K
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
I
S
 
A
T
 
W
H
 
H
K
 
P
S
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
-
 
G
L
 
Y
E
 
E
L
 
L
Q
 
Y
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
G
L
 
F
G
 
N
M
 
M
P
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
H
 
Y
D
x
S
P
x
R
Y
 
T
A
 
R
K
 
K
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
E
 
E
A
 
K
P
 
E
Q
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
E
L
 
Y
V
 
R
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
K
Q
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
A
 
K
E
 
E
N
x
T
K
 
M
H
 
Y
M
 
M
I
 
I
N
 
N
A
 
E
Q
 
E
S
 
R
L
 
L
A
 
K
R
 
L
M
 
M
K
 
K
D
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
W
L
 
I
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
F
E
 
E
K
 
E
E
|
E
P
 
P
F
 
Y
T
 
Y
A
 
N
P
 
-
H
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
F
R
 
S
V
 
L
G
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
L
 
L
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
G
 
S
V
 
A
T
 
T
S
 
F
D
 
E
A
 
A
Y
 
R
I
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
A
T
 
E
G
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
A
V
 
F

Sites not aligning to the query:

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 36:290/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
A
x
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
x
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 36:290/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
|
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
A
 
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
x
T
K
 
T
H
 
G
M
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 34:288/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
 
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
A
x
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
x
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 38:292/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
x
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
A
 
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
x
T
K
 
T
H
 
G
M
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
|
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 37:291/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
|
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
Y
 
I
A
 
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 37:291/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
A
x
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
x
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 38:292/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
I
A
 
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
|
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
x
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 37:291/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
x
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
|
P
Y
x
I
A
x
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
x
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 37:291/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
x
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
I
A
x
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
x
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

8atiA Human ctbp2(31-364) in complex with rai2 peptide(315-322)
40% identity, 75% coverage: 71:302/308 of query aligns to 66:309/330 of 8atiA

query
sites
8atiA
L
 
L
R
 
R
V
 
V
I
 
I
S
 
V
K
 
R
H
 
I
G
 
G
T
x
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
G
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
C
A
 
N
A
 
I
A
 
P
G
 
S
A
 
A
N
 
A
A
 
V
P
 
E
A
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
S
T
 
T
W
 
I
A
 
C
L
 
H
I
 
I
M
 
L
A
 
N
C
 
L
A
 
Y
K
 
R
N
 
R
V
 
N
V
 
T
G
 
W
L
 
L
D
 
Y
Q
 
Q
R
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
W
 
R
D
 
V
K
 
Q
S
 
S
T
 
V
H
 
E
K
 
Q
S
 
I
L
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
I
G
|
G
L
 
F
G
|
G
A
x
R
I
x
T
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
P
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
F
H
 
Y
D
|
D
P
|
P
Y
|
Y
A
 
L
K
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
I
E
 
E
A
 
R
P
 
S
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
R
V
 
V
-
 
Y
D
 
T
L
 
L
D
 
Q
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
V
 
C
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
N
L
 
L
T
 
N
A
 
E
E
 
H
N
 
N
K
 
H
H
 
H
M
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
Q
 
F
S
 
T
L
 
I
A
 
K
R
 
Q
M
 
M
K
 
R
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
H
E
 
E
K
 
S
E
 
E
P
 
P
F
 
F
T
 
S
-
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
R
 
D
V
 
A
G
 
P
N
 
N
A
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
G
x
A
G
x
W
V
 
Y
T
 
S
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Y
 
S
I
 
L
A
 
E
M
 
M
G
 
R
T
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
E
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4lcjA Ctbp2 in complex with substrate mtob (see paper)
40% identity, 75% coverage: 71:302/308 of query aligns to 66:309/330 of 4lcjA

query
sites
4lcjA
L
 
L
R
 
R
V
 
V
I
 
I
S
 
V
K
 
R
H
x
I
G
|
G
T
x
S
G
|
G
I
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
I
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
G
Q
 
E
R
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
C
A
 
N
A
 
I
A
 
P
G
 
S
A
 
A
N
x
A
A
 
V
P
 
E
A
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
S
T
 
T
W
 
I
A
 
C
L
 
H
I
 
I
M
 
L
A
 
N
C
 
L
A
 
Y
K
 
R
N
 
R
V
 
N
V
 
T
G
 
W
L
 
L
D
 
Y
Q
 
Q
R
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
W
 
R
D
 
V
K
 
Q
S
 
S
T
 
V
H
 
E
K
 
Q
S
 
I
L
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
V
x
I
G
|
G
L
 
F
G
|
G
A
x
R
I
x
T
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
P
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
F
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
Y
|
Y
A
 
L
K
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
I
E
 
E
A
 
R
P
 
S
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
R
V
 
V
-
 
Y
D
 
T
L
 
L
D
 
Q
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
D
 
D
V
 
C
V
 
V
S
 
S
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
N
L
 
L
T
x
N
A
 
E
E
 
H
N
|
N
K
 
H
H
 
H
M
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
Q
 
F
S
 
T
L
 
I
A
 
K
R
 
Q
M
 
M
K
 
R
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
H
E
 
E
K
 
S
E
|
E
P
 
P
F
 
F
T
 
S
-
 
F
A
 
A
P
 
Q
H
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
R
 
D
V
 
A
G
 
P
N
 
N
A
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
T
G
 
A
G
x
W
V
 
Y
T
 
S
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Y
 
S
I
 
L
A
 
E
M
 
M
G
 
R
T
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
T
N
 
E
V
 
I

Sites not aligning to the query:

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
35% identity, 82% coverage: 44:295/308 of query aligns to 42:296/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
A
-
 
T
G
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
x
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
Y
 
I
A
 
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
 
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
 
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
 
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
S
x
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
G
|
G
G
x
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
34% identity, 85% coverage: 33:295/308 of query aligns to 21:282/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
G
 
G
A
 
L
K
 
Q
P
 
V
T
 
V
E
 
E
D
 
K
D
 
Q
M
 
N
V
 
L
K
 
L
L
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
H
 
Q
Q
 
D
P
 
C
V
 
E
A
 
G
I
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
Y
 
S
G
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
A
A
 
A
R
 
D
V
 
V
M
 
I
D
 
N
A
 
A
A
 
A
P
 
E
I
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
S
 
G
K
 
R
H
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
N
I
 
V
D
 
D
S
 
L
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
Q
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
K
 
M
A
 
N
A
 
T
A
 
P
G
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
P
 
L
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
L
T
 
T
W
 
C
A
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
C
 
L
A
 
A
K
 
R
N
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
Q
L
 
A
D
 
T
Q
 
A
R
 
S
M
 
M
R
 
K
E
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
D
 
E
K
 
R
S
 
K
T
 
K
H
 
F
K
 
M
S
 
G
L
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
x
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
T
V
 
R
A
 
M
A
 
Q
A
 
S
L
 
F
G
 
G
M
 
M
P
 
K
V
 
T
L
 
I
A
 
G
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
 
I
A
x
I
K
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
E
 
S
A
 
A
P
 
S
Q
 
F
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
V
 
L
D
 
P
L
|
L
D
 
E
T
 
E
L
 
I
F
 
W
A
 
P
Q
 
L
S
 
C
D
 
D
V
 
F
V
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
A
 
P
E
x
S
N
 
T
K
 
T
H
 
G
M
x
L
I
 
L
N
 
N
A
 
D
Q
 
N
S
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
M
 
C
K
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
L
 
C
R
 
A
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
V
F
 
F
E
 
T
K
 
E
E
 
E
P
 
P
F
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
R
Q
 
D
R
 
R
V
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
H
G
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
I
L
 
S
S
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
S
T
 
T
S
 
K
D
 
E
A
 
A
Y
 
Q
I
 
S
A
 
R
M
 
C
G
 
G

1hl3A Ctbp/bars in ternary complex with NAD(h) and pidlskk peptide (see paper)
39% identity, 75% coverage: 71:302/308 of query aligns to 67:310/331 of 1hl3A

query
sites
1hl3A
L
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
V
K
 
R
H
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
F
D
 
D
S
 
N
I
 
I
D
 
D
S
 
I
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
G
Q
 
D
R
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
C
A
 
N
A
 
V
A
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
V
P
 
E
A
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
S
T
 
T
W
 
L
A
 
C
L
 
H
I
 
I
M
 
L
A
 
N
C
 
L
A
 
Y
K
 
R
N
 
R
V
 
T
V
 
T
G
 
W
L
 
L
D
 
H
Q
 
Q
R
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
W
 
R
D
 
V
K
 
Q
S
 
S
T
 
V
H
 
E
K
 
Q
S
 
I
L
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
x
R
I
x
V
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
P
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
F
H
 
Y
D
|
D
P
 
P
Y
|
Y
A
 
L
K
 
S
E
 
D
A
 
G
P
 
I
Q
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
S
-
 
T
L
 
L
D
 
Q
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
F
Q
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
C
V
 
V
S
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
G
L
 
L
T
 
N
A
 
E
E
 
H
N
|
N
K
 
H
H
 
H
M
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
Q
 
F
S
 
T
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
M
 
M
K
 
R
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
H
E
 
E
K
 
S
E
|
E
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
F
P
 
S
H
 
Q
-
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
R
 
D
V
 
A
G
 
P
N
 
N
A
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
A
G
 
A
G
 
W
V
 
Y
T
 
S
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Y
 
S
I
 
I
A
 
E
M
 
M
G
 
R
T
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
R
N
 
E
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1hkuA Ctbp/bars: a dual-function protein involved in transcription corepression and golgi membrane fission (see paper)
39% identity, 75% coverage: 71:302/308 of query aligns to 67:310/331 of 1hkuA

query
sites
1hkuA
L
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
V
K
 
R
H
 
I
G
 
G
T
x
S
G
 
G
I
 
F
D
 
D
S
 
N
I
 
I
D
 
D
S
 
I
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
G
Q
 
D
R
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
C
A
 
N
A
 
V
A
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
V
P
 
E
A
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
S
T
 
T
W
 
L
A
 
C
L
 
H
I
 
I
M
 
L
A
 
N
C
 
L
A
 
Y
K
 
R
N
 
R
V
 
T
V
 
T
G
 
W
L
 
L
D
 
H
Q
 
Q
R
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
W
 
R
D
 
V
K
 
Q
S
 
S
T
 
V
H
 
E
K
 
Q
S
 
I
L
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
A
x
R
I
x
V
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
P
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
F
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
|
Y
A
 
L
K
 
S
E
 
D
A
 
G
P
 
I
Q
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
S
-
 
T
L
 
L
D
 
Q
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
F
Q
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
C
V
 
V
S
 
T
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
 
G
L
 
L
T
 
N
A
 
E
E
 
H
N
|
N
K
 
H
H
 
H
M
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
Q
 
F
S
 
T
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
M
 
M
K
 
R
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
H
E
 
E
K
 
S
E
|
E
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
F
P
 
S
H
 
Q
-
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
R
 
D
V
 
A
G
 
P
N
 
N
A
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
A
G
 
A
G
x
W
V
 
Y
T
 
S
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Y
 
S
I
 
I
A
 
E
M
 
M
G
 
R
T
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
R
N
 
E
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4lceA Ctbp1 in complex with substrate mtob (see paper)
39% identity, 75% coverage: 71:302/308 of query aligns to 66:309/327 of 4lceA

query
sites
4lceA
L
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
I
S
 
V
K
x
R
H
 
I
G
|
G
T
x
S
G
|
G
I
 
F
D
 
D
S
 
N
I
 
I
D
 
D
S
 
I
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
Q
 
G
Q
 
D
R
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
C
A
 
N
A
 
V
A
 
P
G
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
V
P
 
E
A
 
E
V
x
T
A
 
A
E
 
D
H
 
S
T
 
T
W
 
L
A
 
C
L
 
H
I
 
I
M
 
L
A
 
N
C
 
L
A
 
Y
K
 
R
N
 
R
V
 
A
V
 
T
G
 
W
L
 
L
D
 
H
Q
 
Q
R
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
T
W
 
R
D
 
V
K
 
Q
S
 
S
T
 
V
H
 
E
K
 
Q
S
 
I
L
 
R
E
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
R
L
 
I
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
V
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
A
x
R
I
x
V
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
L
V
 
R
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
F
G
 
G
M
 
F
P
 
N
V
 
V
L
 
L
A
 
F
H
x
Y
D
|
D
P
|
P
Y
|
Y
A
 
L
K
 
S
E
 
D
A
 
G
P
 
V
Q
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
L
 
R
V
 
V
D
 
S
-
 
T
L
 
L
D
 
Q
T
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
F
Q
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
C
V
 
V
S
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
 
G
L
 
L
T
x
N
A
 
E
E
 
H
N
|
N
K
 
H
H
 
H
M
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
D
Q
 
F
S
 
T
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
M
 
M
K
 
R
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
S
 
E
G
 
G
K
 
R
L
 
I
R
 
R
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
|
D
S
 
V
F
 
H
E
 
E
K
 
S
E
|
E
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
F
P
 
S
H
 
Q
-
 
G
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
R
 
D
V
 
A
G
 
P
N
 
N
A
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
A
G
 
A
G
x
W
V
 
Y
T
 
S
S
 
E
D
 
Q
A
 
A
Y
 
S
I
 
I
A
 
E
M
 
M
G
 
R
T
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
R
N
 
E
V
 
I

Query Sequence

>HSERO_RS22255 FitnessBrowser__HerbieS:HSERO_RS22255
VSAAKKEVVIVTGVDLAQAAVELLRDYELVYAGAKPTEDDMVKLAQLHQPVAIIVRYGGV
SARVMDAAPILRVISKHGTGIDSIDSQAAQQRGIAVKAAAGANAPAVAEHTWALIMACAK
NVVGLDQRMREGHWDKSTHKSLELQGRTLGLVGLGAIGRRVAAVAAALGMPVLAHDPYAK
EAPQGVQLVDLDTLFAQSDVVSLHCPLTAENKHMINAQSLARMKDGAILVNTARGGLIDE
QALIAALDSGKLRAAGLDSFEKEPFTAPHPLQRVGNAVLSPHIGGVTSDAYIAMGTGAAS
NVLAVLGA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory