SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_0211 N515DRAFT_0211 Threonine dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4cpdA Alcohol dehydrogenase tadh from thermus sp. Atn1
30% identity, 99% coverage: 1:336/338 of query aligns to 1:343/346 of 4cpdA

query
sites
4cpdA
M
 
M
K
 
R
G
 
A
T
 
V
V
 
V
L
 
F
H
 
E
G
 
N
P
 
K
N
 
E
D
 
R
I
 
V
R
 
A
F
 
V
E
 
K
E
 
E
V
 
V
P
 
N
E
 
A
P
 
P
K
 
R
I
 
L
E
 
Q
K
 
H
P
 
P
T
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
L
I
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
H
V
 
L
T
 
A
C
 
G
V
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
L
 
L
W
x
H
P
 
L
Y
 
Y
R
 
H
G
 
G
I
 
K
S
 
I
P
 
P
G
 
V
S
 
L
G
 
P
P
 
G
T
 
S
R
 
V
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
C
 
V
G
 
G
Y
 
Q
V
 
V
E
 
E
E
 
A
V
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
G
V
 
I
M
 
Q
A
 
D
I
 
L
K
 
Q
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
W
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
P
F
 
F
A
 
H
T
 
I
S
 
A
D
x
C
N
 
G
T
 
T
C
|
C
P
 
P
T
 
Y
C
|
C
N
 
R
I
 
-
G
 
R
Y
 
H
Q
 
Q
S
 
Y
S
 
N
C
 
L
V
x
C
Q
 
E
R
 
R
E
 
G
F
x
G
V
 
V
-
 
Y
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
M
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
L
S
 
Q
Q
 
G
A
 
A
Q
 
Q
S
 
A
P
 
E
Y
 
I
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
P
H
 
F
A
 
S
D
 
N
G
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
V
A
 
N
T
 
L
R
 
R
E
 
K
A
 
L
P
 
P
D
 
P
A
 
N
S
 
L
M
 
S
V
 
P
P
 
E
G
 
R
L
 
A
L
 
I
A
 
F
S
 
A
S
 
G
D
|
D
V
 
I
L
 
L
G
 
S
T
|
T
G
 
A
W
 
Y
Y
 
G
A
 
G
A
 
L
D
 
I
A
 
Q
A
 
G
R
 
Q
V
 
L
R
 
R
P
 
P
G
 
G
V
 
D
T
 
S
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
A
G
|
G
A
x
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
I
L
 
E
S
 
V
A
 
A
K
 
Q
Q
 
V
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
S
R
 
K
I
 
I
I
 
L
V
 
A
M
 
I
S
x
D
R
|
R
H
 
I
P
 
P
A
 
E
R
|
R
Q
 
L
K
 
E
L
 
R
A
 
A
L
 
A
D
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
I
D
 
P
I
 
I
V
 
N
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
-
E
 
E
E
 
N
G
 
P
V
 
V
A
 
R
R
 
R
I
 
V
M
 
R
E
 
S
L
 
E
T
 
T
R
 
N
G
 
D
L
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
D
S
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
E
C
x
A
V
|
V
G
 
G
T
 
G
G
 
A
E
 
A
S
 
T
M
 
L
Q
 
S
Q
 
L
A
 
A
M
 
L
R
 
E
V
 
M
T
 
V
R
 
R
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
R
M
 
V
S
 
S
F
 
A
V
|
V
G
 
G
V
|
V
P
 
D
H
 
N
G
 
A
-
 
P
-
 
S
V
 
F
E
 
P
I
 
F
E
 
P
G
 
L
Q
 
A
A
 
S
L
 
G
F
 
L
F
 
V
S
 
K
H
 
D
I
 
L
H
 
T
L
 
F
E
 
R
G
 
I
G
 
G
P
x
L
A
|
A
P
 
N
V
 
V
R
 
H
R
 
L
Y
 
Y
L
 
I
P
 
D
D
 
A
L
 
V
I
 
L
D
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
S
Q
 
G
K
 
R
I
 
L
D
 
Q
P
 
P
S
 
E
A
 
R
V
 
I
F
 
V
D
 
S
L
 
H
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
V
 
A
A
 
P
E
 
R
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
A
 
L
M
x
F
D
 
D
E
 
R
R
 
K
R
 
E
A
 
A
I
 
L
K
|
K
A
 
V
L
 
L
L
 
L

5ylnA Zinc dependent alcohol dehydrogenase 2 from streptococcus pneumonia - apo form
31% identity, 97% coverage: 1:328/338 of query aligns to 5:331/348 of 5ylnA

query
sites
5ylnA
M
 
M
K
 
K
G
 
A
T
 
Y
V
 
T
L
 
Y
H
 
V
G
 
K
P
 
P
N
 
G
D
 
L
I
 
A
R
 
S
F
 
F
E
 
V
E
 
D
V
 
V
P
 
D
E
 
K
P
 
P
K
 
V
I
 
I
E
 
R
K
 
K
P
 
P
T
 
T
D
 
-
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
I
A
 
V
V
 
K
T
 
T
C
 
T
V
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
L
 
L
W
x
H
P
 
I
Y
 
I
R
 
K
G
 
G
I
 
D
S
 
V
P
 
P
G
 
T
S
 
C
G
 
Q
P
 
S
-
 
G
T
 
T
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
Y
 
G
C
 
I
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
G
V
 
V
M
 
S
A
 
N
I
 
F
K
 
K
K
 
K
G
 
G
Q
 
D
F
 
K
V
 
V
V
 
L
G
 
I
S
 
S
F
 
C
A
 
V
T
 
C
S
 
A
D
x
C
N
 
G
T
 
K
C
|
C
P
 
Y
T
 
Y
C
|
C
N
 
K
I
 
K
G
 
G
Y
 
I
Q
 
Y
S
 
A
S
 
H
C
|
C
V
 
E
Q
 
D
R
 
E
E
 
G
-
 
G
-
 
W
-
 
I
F
 
F
V
 
I
S
 
D
Q
 
G
A
 
M
Q
 
Q
S
 
A
P
 
E
Y
 
Y
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
P
H
 
H
A
 
A
D
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
L
V
 
Y
A
 
H
T
 
T
R
 
P
E
 
E
A
 
D
P
 
L
D
 
S
A
 
D
S
 
E
M
 
A
V
 
L
P
 
V
G
 
M
L
 
L
L
 
L
A
 
P
S
 
T
S
 
G
D
 
Y
V
 
E
L
 
I
G
 
G
T
 
V
G
 
L
W
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
K
A
 
G
R
 
K
V
 
V
R
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
S
A
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
S
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
A
V
 
L
L
 
L
S
 
T
A
 
A
K
 
Q
Q
 
F
M
 
Y
G
 
S
A
 
P
E
 
A
R
 
K
I
 
L
I
 
I
V
 
M
M
 
V
S
 
D
R
 
L
H
 
D
P
 
D
A
 
N
R
 
R
Q
 
L
K
 
E
L
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
S
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
H
I
 
K
V
 
V
A
 
N
E
 
S
R
 
S
G
 
D
-
 
P
E
 
E
E
 
K
G
 
A
V
 
I
A
 
K
R
 
E
I
 
I
M
 
Y
E
 
D
L
 
L
T
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
R
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
V
V
 
A
L
 
I
E
 
E
C
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
I
G
 
P
E
 
A
S
 
T
M
 
F
Q
 
D
Q
 
F
A
 
C
M
 
Q
R
 
K
V
 
I
T
 
I
R
 
G
K
 
V
G
 
D
G
 
G
H
 
T
M
 
V
S
 
A
F
 
N
V
 
C
G
 
G
V
 
V
P
 
-
H
 
H
G
 
G
-
 
K
-
 
P
V
 
V
E
 
E
I
 
F
E
 
D
G
 
L
Q
 
D
A
 
K
L
 
L
F
 
W
F
 
I
S
 
R
H
 
N
I
 
I
H
 
N
L
 
V
E
 
T
G
 
T
G
 
G
P
 
L
A
 
V
P
 
S
V
 
T
R
 
N
R
 
T
Y
 
-
L
 
T
P
 
P
D
 
Q
L
 
L
I
 
L
D
 
K
L
 
A
I
 
L
L
 
E
D
 
S
Q
 
H
K
 
K
I
 
I
D
 
E
P
 
P
S
 
E
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
Y
L
 
F
P
 
K
L
 
L
D
 
S
Q
 
E
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
Y
K
 
E
A
 
V
M
 
F
D
 
S
E
 
K

4ejmA Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021 bound to NADP
31% identity, 84% coverage: 1:283/338 of query aligns to 4:288/342 of 4ejmA

query
sites
4ejmA
M
 
M
K
 
K
G
 
A
T
 
V
V
 
R
L
 
L
H
 
E
G
 
S
P
 
V
N
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
S
F
 
V
E
 
R
E
 
N
V
 
V
-
 
G
-
 
I
P
 
P
E
 
E
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
D
D
 
D
A
 
L
I
 
L
I
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
E
V
 
A
T
 
C
C
 
G
V
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
R
W
x
H
P
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
G
I
 
E
S
 
F
P
 
P
G
 
S
S
 
T
G
 
P
P
 
P
T
 
V
R
 
T
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
C
 
C
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
R
A
 
D
I
 
I
K
 
A
K
 
P
G
 
G
Q
 
A
F
 
R
V
 
I
V
 
T
G
 
G
S
 
D
F
 
P
A
 
N
T
 
I
S
 
S
D
x
C
N
 
G
T
 
R
C
|
C
P
 
P
T
 
Q
C
|
C
N
 
Q
I
 
A
G
 
G
Y
 
R
Q
 
V
S
 
N
S
 
L
C
|
C
V
 
R
Q
 
N
R
 
L
E
x
R
F
 
A
V
 
I
S
 
G
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
I
H
 
H
A
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
Y
T
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
R
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
P
 
F
D
 
E
A
 
I
S
 
P
M
 
L
V
 
T
-
 
L
-
 
D
P
 
P
G
 
V
L
 
H
L
 
G
A
 
A
S
 
F
S
 
C
D
 
E
V
x
P
L
 
L
G
 
A
T
 
C
G
x
C
W
 
L
Y
 
H
A
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
S
R
 
G
V
 
I
R
 
K
P
 
A
G
 
G
V
 
S
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
|
G
D
 
G
G
|
G
A
x
V
V
x
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
T
V
 
V
L
 
Q
S
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
T
R
 
T
I
 
V
I
 
I
V
 
L
M
 
S
S
x
T
R
|
R
H
x
Q
P
 
A
A
 
T
R
x
K
Q
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
E
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
A
I
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
S
A
 
A
E
 
G
R
 
D
G
 
V
E
 
V
E
 
E
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
G
I
 
P
M
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
V
R
 
P
G
 
G
L
 
-
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
C
|
C
V
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
A
E
|
E
S
x
T
M
 
V
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
S
M
 
T
R
 
R
V
 
L
T
 
A
R
 
K
K
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
V
S
 
V
F
 
I
V
x
L
G
 
G
V
|
V
-
 
L
P
 
P
H
 
Q
G
 
G
-
 
E
-
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
P
Q
 
F
A
 
D
L
 
I
F
 
L
F
 
F
S
 
R
H
 
E
I
 
L
H
 
R
L
 
V
E
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4ej6A Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021
31% identity, 84% coverage: 1:283/338 of query aligns to 4:288/343 of 4ej6A

query
sites
4ej6A
M
 
M
K
 
K
G
 
A
T
 
V
V
 
R
L
 
L
H
 
E
G
 
S
P
 
V
N
 
G
D
 
N
I
 
I
R
 
S
F
 
V
E
 
R
E
 
N
V
 
V
-
 
G
-
 
I
P
 
P
E
 
E
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
D
D
 
D
A
 
L
I
 
L
I
 
V
R
 
K
I
 
V
A
 
E
V
 
A
T
 
C
C
 
G
V
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
L
 
R
W
x
H
P
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
G
I
 
E
S
 
F
P
 
P
G
 
S
S
 
T
G
 
P
P
 
P
T
 
V
R
 
T
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
C
 
C
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
A
G
 
G
S
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
R
A
 
D
I
 
I
K
 
A
K
 
P
G
 
G
Q
 
A
F
 
R
V
 
I
V
 
T
G
 
G
S
 
D
F
 
P
A
 
N
T
 
I
S
 
S
D
x
C
N
 
G
T
 
R
C
|
C
P
 
P
T
 
Q
C
|
C
N
 
Q
I
 
A
G
 
G
Y
 
R
Q
 
V
S
 
N
S
 
L
C
|
C
V
 
R
Q
 
N
R
 
L
E
x
R
F
 
A
V
 
I
S
 
G
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
I
H
 
H
A
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
Y
T
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
R
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
P
 
F
D
 
E
A
 
I
S
 
P
M
 
L
V
 
T
-
 
L
-
 
D
P
 
P
G
 
V
L
 
H
L
 
G
A
 
A
S
 
F
S
 
C
D
 
E
V
x
P
L
 
L
G
 
A
T
 
C
G
x
C
W
 
L
Y
 
H
A
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
S
R
 
G
V
 
I
R
 
K
P
 
A
G
 
G
V
 
S
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
L
G
 
G
D
 
G
G
 
G
A
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
T
V
 
V
L
 
Q
S
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
L
M
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
T
R
 
T
I
 
V
I
 
I
V
 
L
M
 
S
S
 
T
R
 
R
H
 
Q
P
 
A
A
 
T
R
 
K
Q
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
E
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
A
I
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
S
A
 
A
E
 
G
R
 
D
G
 
V
E
 
V
E
 
E
G
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
G
I
 
P
M
 
V
E
 
G
L
 
L
T
 
V
R
 
P
G
 
G
L
 
-
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
C
 
C
V
 
A
G
 
G
T
 
V
G
 
A
E
 
E
S
 
T
M
 
V
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
S
M
 
T
R
 
R
V
 
L
T
 
A
R
 
K
K
 
A
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
V
S
 
V
F
 
I
V
 
L
G
 
G
V
 
V
-
 
L
P
 
P
H
 
Q
G
 
G
-
 
E
-
 
K
V
 
V
E
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
P
Q
 
F
A
 
D
L
 
I
F
 
L
F
 
F
S
 
R
H
 
E
I
 
L
H
 
R
L
 
V
E
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3fsrA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of t. Brockii adh by c. Beijerinckii adh (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 17:347/352 of 3fsrA

query
sites
3fsrA
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
I
T
 
T
S
 
P
D
|
D
N
 
W
T
 
R
C
x
T
P
 
S
T
 
E
C
x
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
x
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
Q
P
 
M
G
 
G
V
 
S
T
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
G
V
 
I
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
G
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
A
 
I
R
 
C
Q
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
N
E
 
G
E
 
H
G
 
I
V
 
V
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
M
 
M
E
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
N
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
R
V
 
V
L
 
I
E
 
M
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
G
G
 
S
E
 
E
S
 
T
M
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
S
V
 
M
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
I
M
 
I
S
 
S
F
 
N
V
 
I
G
 
N
V
 
Y
P
 
-
H
 
H
G
 
G
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
-
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
x
K
P
 
P

3fpcA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-294 of t. Brockii adh by e. Histolytica adh (see paper)
27% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 17:347/352 of 3fpcA

query
sites
3fpcA
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
I
T
 
T
S
 
P
D
|
D
N
 
W
T
 
R
C
x
T
P
 
S
T
 
E
C
x
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
x
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
N
V
 
I
R
 
K
P
 
L
G
 
G
V
 
D
T
 
T
A
 
V
V
 
C
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
S
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
N
Q
 
H
M
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
F
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
K
A
 
H
R
 
C
Q
 
C
K
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
L
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
N
E
 
G
E
 
D
G
 
I
V
 
V
A
 
E
R
 
Q
I
 
I
M
 
L
E
 
K
L
 
A
T
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
D
G
 
V
E
 
H
S
 
T
M
 
F
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
M
T
 
I
R
 
K
K
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
I
G
 
G
H
 
N
M
 
V
S
 
N
F
 
Y
V
 
L
G
 
G
V
 
E
P
 
G
H
 
D
G
 
N
V
 
I
E
 
D
I
 
I
-
 
P
-
 
R
E
 
S
G
 
E
Q
 
W
A
 
G
L
 
V
F
 
G
F
 
M
S
 
G
H
 
H
I
 
K
H
 
H
L
 
I
E
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
x
K
P
 
P

1kevA Structure of NADP-dependent alcohol dehydrogenase (see paper)
29% identity, 97% coverage: 1:329/338 of query aligns to 1:340/351 of 1kevA

query
sites
1kevA
M
 
M
K
 
K
G
 
G
T
 
F
V
 
A
L
 
M
H
 
L
G
 
G
P
 
I
N
 
N
D
 
K
I
 
L
R
 
G
F
 
W
E
 
I
E
 
E
V
 
K
P
 
E
E
 
R
P
 
P
K
 
-
I
 
V
E
 
A
K
 
G
P
 
S
T
 
Y
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
S
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
L
P
 
G
G
 
D
S
 
R
G
 
K
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
V
S
 
P
F
 
C
A
 
T
T
 
T
S
 
P
D
|
D
N
 
W
T
 
R
C
x
S
P
 
L
T
 
E
C
x
V
N
 
Q
I
 
A
G
 
G
Y
 
F
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
x
S
-
 
N
-
 
G
-
 
M
-
 
L
S
 
A
S
 
G
C
 
W
V
 
K
Q
 
F
R
 
S
E
 
N
F
 
F
V
 
K
S
 
D
Q
 
G
A
 
V
Q
 
F
S
 
G
P
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
A
 
N
H
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
M
T
 
N
L
 
L
-
 
A
V
 
I
A
 
L
T
 
P
R
 
K
E
 
D
A
 
M
P
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
N
A
 
A
S
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
T
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
Q
P
 
M
G
 
G
V
 
S
T
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
x
I
G
|
G
A
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
G
V
 
I
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
G
M
 
V
S
 
G
R
x
S
H
x
R
P
 
P
A
 
I
R
 
C
Q
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
N
E
x
Y
R
 
K
G
 
N
E
 
G
E
 
H
G
 
I
V
 
V
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
M
 
M
E
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
N
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
R
V
 
V
L
 
I
E
 
M
C
x
A
V
 
G
G
|
G
T
 
G
G
 
S
E
 
E
S
 
T
M
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
S
V
 
M
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
I
M
 
I
S
 
S
F
 
N
V
 
I
G
x
N
V
x
Y
P
 
-
H
 
H
G
 
G
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
-
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
L
 
R
P
 
A
D
 
E
L
 
M
I
 
L
-
 
R
D
 
D
L
 
M
I
 
V
L
 
V
D
 
Y
Q
 
N
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
Y
P
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
Y
 
L
K
 
L
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
x
K

Sites not aligning to the query:

P25984 NADP-dependent isopropanol dehydrogenase; CbADH; EC 1.1.1.80 from Clostridium beijerinckii (Clostridium MP) (see 3 papers)
29% identity, 97% coverage: 1:329/338 of query aligns to 1:340/351 of P25984

query
sites
P25984
M
 
M
K
 
K
G
 
G
T
 
F
V
 
A
L
 
M
H
 
L
G
 
G
P
 
I
N
 
N
D
 
K
I
 
L
R
 
G
F
 
W
E
 
I
E
 
E
V
 
K
P
 
E
E
 
R
P
 
P
K
 
-
I
 
V
E
 
A
K
 
G
P
 
S
T
 
Y
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
S
V
 
P
C
|
C
G
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
L
P
 
G
G
 
D
S
 
R
G
 
K
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
V
S
 
P
F
 
C
A
 
T
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
S
P
 
L
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
A
G
 
G
Y
 
F
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
M
-
 
L
S
 
A
S
 
G
C
 
W
V
 
K
Q
 
F
R
 
S
E
 
N
F
 
F
V
 
K
S
 
D
Q
 
G
A
 
V
Q
 
F
S
 
G
P
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
A
 
N
H
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
M
T
 
N
L
 
L
-
 
A
V
 
I
A
 
L
T
 
P
R
 
K
E
 
D
A
 
M
P
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
N
A
 
A
S
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
T
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
Q
P
 
M
G
 
G
V
 
S
T
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
x
I
G
|
G
A
|
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
G
V
 
I
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
G
M
 
V
S
x
G
R
x
S
H
x
R
P
 
P
A
 
I
R
 
C
Q
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
N
E
x
Y
R
 
K
G
 
N
E
 
G
E
 
H
G
 
I
V
 
V
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
M
 
M
E
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
N
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
R
V
 
V
L
 
I
E
 
M
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
G
G
 
S
E
 
E
S
 
T
M
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
S
V
 
M
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
I
M
 
I
S
 
S
F
 
N
V
x
I
G
x
N
V
x
Y
P
 
-
H
 
H
G
 
G
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
-
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
L
 
R
P
 
A
D
 
E
L
 
M
I
 
L
-
 
R
D
 
D
L
 
M
I
 
V
L
 
V
D
 
Y
Q
 
N
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
Y
P
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
Y
 
L
K
 
L
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
x
K

6schC Nadh-dependent variant of cbadh (see paper)
29% identity, 97% coverage: 1:329/338 of query aligns to 1:340/355 of 6schC

query
sites
6schC
M
 
M
K
 
K
G
 
G
T
 
F
V
 
A
L
 
M
H
 
L
G
 
G
P
 
I
N
 
N
D
 
K
I
 
L
R
 
G
F
 
W
E
 
I
E
 
E
V
 
K
P
 
E
E
 
R
P
 
P
K
 
-
I
 
V
E
 
A
K
 
G
P
 
S
T
 
Y
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
S
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
L
P
 
G
G
 
D
S
 
R
G
 
K
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
V
S
 
P
F
 
C
A
 
T
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
S
P
 
L
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
A
G
 
G
Y
 
F
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
 
S
-
 
N
-
 
G
-
 
M
-
 
L
S
 
A
S
 
G
C
x
W
V
 
K
Q
 
F
R
 
S
E
 
N
F
 
F
V
 
K
S
 
D
Q
 
G
A
 
V
Q
 
F
S
 
G
P
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
A
 
N
H
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
M
T
 
N
L
 
L
-
 
A
V
 
I
A
 
L
T
 
P
R
 
K
E
 
D
A
 
M
P
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
N
A
 
A
S
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
T
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
Q
P
 
M
G
 
G
V
 
S
T
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
G
|
G
D
 
I
G
 
G
A
 
A
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
G
V
 
I
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
G
M
 
V
S
x
D
R
x
Y
H
x
R
P
 
P
A
 
I
R
 
C
Q
 
V
K
 
E
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
F
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
N
E
 
P
R
 
K
G
 
N
E
 
G
E
 
H
G
 
I
V
 
V
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
M
 
M
E
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
N
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
R
V
 
V
L
 
I
E
 
M
C
x
A
V
x
G
G
|
G
T
 
G
G
 
S
E
 
E
S
 
T
M
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
A
 
A
M
 
V
R
 
S
V
 
M
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
I
M
 
I
S
 
S
F
 
N
V
 
I
G
x
N
V
x
Y
P
 
-
H
 
H
G
 
G
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
-
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
L
 
R
P
 
A
D
 
E
L
 
M
I
 
L
-
 
R
D
 
D
L
 
M
I
 
V
L
 
V
D
 
Y
Q
 
N
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
Y
P
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
Y
 
L
K
 
L
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
x
K

P80360 Alcohol dehydrogenase class-3; Alcohol dehydrogenase class-III; Glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase; FALDH; FDH; GSH-FDH; S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase; EC 1.1.1.1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.284 from Myxine glutinosa (Atlantic hagfish) (see 2 papers)
28% identity, 100% coverage: 1:337/338 of query aligns to 3:375/376 of P80360

query
sites
P80360
M
 
M
K
 
D
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
L
 
I
H
 
H
G
 
C
P
 
K
N
 
A
D
 
A
I
 
V
R
 
A
F
 
W
E
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
P
-
 
L
E
 
S
V
 
L
P
 
E
E
 
E
P
 
I
K
 
E
I
 
V
E
 
A
K
 
P
P
 
P
T
 
K
D
 
A
A
 
H
I
 
E
I
 
V
R
 
R
I
 
M
A
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
A
T
 
T
C
 
A
V
 
V
C
 
C
G
 
H
S
 
T
D
 
D
L
 
A
W
 
Y
P
 
T
Y
 
L
R
 
S
G
 
G
I
 
V
S
 
D
P
 
P
-
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
F
P
 
P
T
 
V
R
 
V
M
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
Y
 
G
C
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
E
A
 
G
V
 
V
M
 
T
A
 
K
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
P
S
 
L
F
 
Y
A
 
I
T
 
P
S
 
Q
D
 
C
N
 
G
T
 
E
C
 
C
P
 
K
T
 
F
C
 
C
N
 
-
I
 
L
G
 
N
Y
 
P
Q
 
K
S
 
T
S
 
N
C
 
L
V
 
C
Q
 
Q
R
 
K
E
 
I
F
 
R
V
 
V
S
 
T
Q
 
Q
A
 
G
Q
 
K
-
 
G
-
 
M
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
C
-
 
R
-
 
G
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
Y
-
 
H
-
 
F
-
 
M
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
T
-
 
F
S
 
S
P
 
E
Y
 
Y
L
 
A
R
 
V
V
 
V
A
 
A
H
 
D
A
 
I
D
 
S
G
 
L
T
 
C
L
 
R
V
 
V
A
 
A
T
 
P
R
 
E
E
 
A
A
 
P
P
 
P
D
 
D
A
 
R
S
 
V
M
 
C
V
 
L
P
 
L
G
 
G
L
 
C
L
 
G
A
 
V
S
 
S
S
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
Y
 
G
A
 
A
A
 
P
-
 
L
D
 
N
A
 
T
A
 
A
R
 
K
V
 
V
R
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
S
T
 
T
A
 
C
V
 
A
V
 
I
V
 
F
G
 
G
D
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
M
S
 
G
A
 
C
K
 
R
Q
 
V
M
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
I
S
 
D
R
 
R
H
 
N
P
 
P
A
 
D
R
 
K
Q
 
F
K
 
E
L
 
K
A
 
A
L
 
R
D
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
-
 
C
I
 
V
V
 
V
A
 
P
E
 
D
R
 
A
G
 
S
E
 
D
E
 
K
G
 
P
V
 
I
A
 
S
R
 
Q
I
 
V
M
 
L
-
 
G
E
 
E
L
 
M
T
 
T
R
 
D
G
 
G
L
 
-
G
 
G
A
 
L
D
 
D
S
 
Y
V
 
T
L
 
F
E
 
E
C
 
C
V
 
V
G
 
G
T
 
N
G
 
V
E
 
G
S
 
I
M
 
M
Q
 
R
Q
 
A
A
 
A
M
 
L
R
 
E
V
 
S
T
 
C
R
 
H
K
 
K
G
 
G
G
 
W
H
 
G
M
 
V
S
 
S
F
 
V
V
 
I
G
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
A
I
 
G
E
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
E
L
 
I
F
 
S
F
 
T
S
 
R
H
 
P
I
 
F
H
 
Q
L
 
L
E
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
W
-
 
K
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
W
A
 
K
P
 
S
V
 
V
R
 
E
R
 
S
Y
 
-
L
 
V
P
 
P
D
 
K
L
 
L
I
 
V
D
 
D
L
 
D
I
 
Y
L
 
M
D
 
A
Q
 
G
K
 
K
I
 
I
D
 
M
P
 
V
S
 
D
A
 
E
V
 
F
F
 
V
D
 
S
L
 
H
V
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
F
D
 
D
Q
 
S
V
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
A
Y
 
F
K
 
D
A
 
L
M
 
M
D
 
H
E
 
A
R
 
G
R
 
K
A
 
S
I
 
I
K
 
R
A
 
T
L
 
V
L
 
L
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7xy9A Cryo-em structure of secondary alcohol dehydrogenases tbsadh after carrier-free immobilization based on weak intermolecular interactions
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 18:340/344 of 7xy9A

query
sites
7xy9A
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
N
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
T
P
 
S
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
x
H
S
 
Q
S
x
H
C
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Y
x
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
 
V
G
 
N
V
 
Y
P
 
F
H
 
P
G
 
R
V
 
L
E
 
E
I
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
W
A
 
G
L
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
x
C
P
 
P
V
x
G
R
x
G
R
 
R
Y
x
L
-
x
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
P
 
P

7ux4A Crystallographic snapshots of ternary complexes of thermophilic secondary alcohol dehydrogenase from thermoanaerobacter pseudoethanolicus reveal the dynamics of ligand exchange and the proton relay network. (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 15:345/350 of 7ux4A

query
sites
7ux4A
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
 
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
A
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
T
P
 
S
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
x
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
|
G
D
x
I
G
|
G
A
x
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
x
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
|
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
|
V
G
x
N
V
x
Y
P
 
F
H
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
x
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
P
 
P

7uutA Ternary complex crystal structure of secondary alcohol dehydrogenases from the thermoanaerobacter ethanolicus mutants c295a and i86a provides better understanding of catalytic mechanism (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 17:347/352 of 7uutA

query
sites
7uutA
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
x
A
A
 
A
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
T
P
 
S
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
x
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
|
G
D
 
I
G
|
G
A
x
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
x
S
H
x
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
x
A
V
x
G
G
|
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
x
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
|
V
G
x
N
V
x
Y
P
 
F
H
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
x
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
x
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
P
 
P

7f3pD Crystal structure of a NADP-dependent alcohol dehydrogenase mutant in apo form (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 20:350/355 of 7f3pD

query
sites
7f3pD
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
S
F
 
A
A
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
T
P
 
S
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
I
-
 
A
H
 
N
M
 
V
S
 
N
F
 
Y
V
 
F
G
 
G
V
 
-
P
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
P
 
P

1ykfA NADP-dependent alcohol dehydrogenase from thermoanaerobium brockii (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 17:347/352 of 1ykfA

query
sites
1ykfA
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
I
T
 
T
S
 
P
D
|
D
N
 
W
T
 
R
C
x
T
P
 
S
T
 
E
C
x
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
x
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
|
G
D
x
I
G
|
G
A
x
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
x
S
H
x
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
x
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
x
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
 
V
G
x
N
V
x
Y
P
 
F
H
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
x
K
P
 
P

1bxzB Crystal structure of a thermophilic alcohol dehydrogenase substrate complex from thermoanaerobacter brockii (see paper)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 17:347/352 of 1bxzB

query
sites
1bxzB
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
I
T
 
T
S
 
P
D
|
D
N
 
W
T
 
R
C
x
T
P
 
S
T
 
E
C
x
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
x
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
 
V
G
 
N
V
 
Y
P
 
F
H
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
x
K
P
 
P

P14941 NADP-dependent isopropanol dehydrogenase; EC 1.1.1.80 from Thermoanaerobacter brockii (Thermoanaerobium brockii) (see 2 papers)
29% identity, 96% coverage: 15:338/338 of query aligns to 17:347/352 of P14941

query
sites
P14941
E
 
K
E
 
E
V
 
K
P
 
P
E
 
A
P
 
P
K
 
G
I
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
P
T
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
A
V
 
P
C
|
C
G
 
T
S
 
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
I
P
 
G
G
 
E
S
 
R
G
 
H
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
V
S
 
P
F
 
A
A
 
I
T
 
T
S
 
P
D
 
D
N
 
W
T
 
R
C
 
T
P
 
S
T
 
E
C
 
V
N
 
Q
I
 
R
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
S
 
Q
S
 
H
C
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
A
Q
 
G
R
 
W
E
 
K
F
 
F
V
 
S
S
 
N
Q
 
V
A
 
K
Q
 
D
S
 
G
P
 
V
Y
 
F
L
 
G
R
 
E
V
 
F
A
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
D
T
 
A
L
 
D
V
 
M
A
 
N
T
 
L
R
 
A
E
 
H
A
 
L
P
 
P
D
 
K
A
 
E
S
 
I
M
 
P
V
 
L
P
 
E
G
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
M
S
 
I
S
 
P
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
D
x
I
G
|
G
A
x
P
V
|
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
x
G
R
x
S
H
x
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
x
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
|
V
G
x
N
V
x
Y
P
 
F
H
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
E
D
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
Y
Q
 
K
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
F
P
 
R
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
K
G
 
A
Y
 
F
K
 
M
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
x
K
R
 
P
A
 
-
I
 
-
K
 
K
A
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
P
 
P

1h2bB Crystal structure of the alcohol dehydrogenase from the hyperthermophilic archaeon aeropyrum pernix at 1.65a resolution (see paper)
27% identity, 90% coverage: 1:304/338 of query aligns to 1:312/344 of 1h2bB

query
sites
1h2bB
M
 
L
K
 
K
G
 
A
T
 
A
V
 
R
L
 
L
H
 
H
G
 
E
P
 
Y
N
 
N
D
 
K
-
 
P
I
 
L
R
 
R
F
 
I
E
 
E
E
 
D
V
 
V
P
 
D
E
 
Y
P
 
P
K
 
R
I
 
L
E
 
E
K
 
G
P
 
R
T
 
F
D
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
G
T
 
A
C
 
G
V
 
V
C
|
C
G
x
H
S
x
T
D
 
D
L
 
L
W
x
H
P
 
L
Y
 
V
R
 
Q
G
 
G
-
 
M
-
x
W
-
 
H
-
 
E
-
 
L
I
 
L
S
 
Q
P
 
P
G
 
-
S
 
K
G
 
L
P
 
P
T
 
Y
R
 
T
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
N
C
 
V
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
S
 
E
A
 
G
V
 
V
M
 
E
A
 
G
I
 
L
K
 
E
K
 
K
G
 
G
Q
 
D
F
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
L
S
 
H
F
 
P
A
 
A
T
 
V
S
 
T
D
|
D
N
 
G
T
 
T
C
|
C
P
 
L
T
 
A
C
|
C
N
 
R
I
 
A
G
 
G
Y
 
E
Q
 
D
S
 
M
S
 
H
C
|
C
V
 
E
Q
 
N
R
 
L
E
|
E
F
 
F
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
N
V
 
I
S
 
D
Q
 
G
A
 
G
Q
 
F
S
 
A
P
 
E
Y
 
F
L
 
M
R
 
R
V
 
T
A
 
S
H
 
H
A
 
R
D
 
S
G
 
V
T
 
I
L
 
K
V
 
L
A
 
P
T
 
K
R
 
D
E
 
I
A
 
S
P
 
R
D
 
E
A
 
K
S
 
L
M
 
V
V
 
E
P
 
M
G
 
A
L
 
P
L
 
L
A
 
A
S
x
D
S
 
A
D
 
G
V
 
I
L
x
T
G
 
A
T
 
Y
G
 
R
W
 
A
Y
 
V
A
 
K
A
 
K
D
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
T
V
 
L
R
 
Y
P
 
P
G
 
G
V
 
A
T
 
Y
A
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
x
V
G
|
G
A
x
G
V
x
L
G
 
G
L
 
H
L
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
Q
S
 
L
A
 
L
K
 
K
Q
 
V
M
 
M
G
 
T
A
 
P
E
 
A
R
 
T
I
 
V
I
 
I
V
 
A
M
 
L
S
x
D
R
x
V
H
 
K
P
 
E
A
 
E
R
x
K
Q
 
L
K
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
E
D
 
R
F
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
D
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
A
R
 
R
G
 
-
E
 
R
E
 
D
G
 
P
V
 
V
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
M
 
M
E
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
R
G
 
G
A
 
V
D
 
N
S
 
V
V
 
A
L
 
M
E
 
D
C
x
F
V
|
V
G
 
G
T
 
S
G
 
Q
E
 
A
S
x
T
M
 
V
Q
 
D
Q
x
Y
A
 
T
M
 
P
R
 
Y
V
 
L
T
 
L
R
 
G
K
 
R
G
 
M
G
 
G
H
 
R
M
 
L
S
 
I
F
 
I
V
|
V
G
|
G
V
x
Y
P
 
G
H
 
G
G
 
E
V
 
L
E
 
R
I
 
F
E
 
P
G
 
T
Q
 
I
A
 
R
L
 
V
F
 
I
F
 
S
S
 
S
H
 
E
I
 
V
H
 
S
L
 
F
E
 
E
G
 
G
G
 
S
P
x
L
A
x
V
P
 
G
V
 
N
R
 
Y
R
 
V
Y
 
E
L
 
L
P
 
H
D
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
T
L
 
L
I
 
A
L
 
L
D
 
Q
Q
 
G
K
 
K
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3fplA Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of c. Beijerinckii adh by t. Brockii adh (see paper)
28% identity, 97% coverage: 1:329/338 of query aligns to 1:340/351 of 3fplA

query
sites
3fplA
M
 
M
K
 
K
G
 
G
T
 
F
V
 
A
L
 
M
H
 
L
G
 
G
P
 
I
N
 
N
D
 
K
I
 
L
R
 
G
F
 
W
E
 
I
E
 
E
V
 
K
P
 
E
E
 
R
P
 
P
K
 
-
I
 
V
E
 
A
K
 
G
P
 
S
T
 
Y
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
V
R
 
R
I
 
P
A
 
L
V
 
A
T
 
V
C
 
S
V
 
P
C
|
C
G
x
T
S
|
S
D
 
D
L
 
I
W
x
H
P
 
T
-
 
V
Y
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
A
S
 
L
P
 
G
G
 
D
S
 
R
G
 
K
P
 
N
T
 
M
R
 
I
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
A
C
 
V
G
 
G
Y
 
E
V
 
V
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
D
I
 
F
K
 
K
K
 
P
G
 
G
Q
 
D
F
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
V
S
 
P
F
 
C
A
 
T
T
 
T
S
 
P
D
|
D
N
 
W
T
 
R
C
x
S
P
 
L
T
 
E
C
x
V
N
 
Q
I
 
A
G
 
G
Y
 
F
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
H
-
x
S
-
 
N
-
 
G
-
 
M
-
 
L
S
 
A
S
 
G
C
 
W
V
 
K
Q
 
F
R
 
S
E
 
N
F
 
F
V
 
K
S
 
D
Q
 
G
A
 
V
Q
 
F
S
 
G
P
 
E
Y
 
Y
L
 
F
R
 
H
V
 
V
A
 
N
H
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
M
T
 
N
L
 
L
-
 
A
V
 
I
A
 
L
T
 
P
R
 
K
E
 
D
A
 
M
P
 
P
-
 
L
-
 
E
D
 
N
A
 
A
S
 
V
M
 
M
V
 
I
P
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
T
D
|
D
V
 
M
L
 
M
G
 
T
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Y
 
H
A
 
G
A
 
A
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
I
R
 
E
P
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
V
 
V
L
 
A
S
 
G
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
M
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
A
M
 
V
S
 
G
R
 
S
H
 
R
P
 
P
A
 
V
R
 
C
Q
 
V
K
 
D
L
 
A
A
 
A
L
 
K
D
 
Y
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
N
E
 
Y
R
 
K
G
 
D
E
 
G
E
 
P
G
 
I
V
 
E
A
 
S
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
E
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
E
G
 
G
L
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
I
C
 
A
V
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
A
E
 
D
S
 
I
M
 
M
Q
 
A
Q
 
T
A
 
A
M
 
V
R
 
K
V
 
I
T
 
V
R
 
K
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
T
M
 
I
S
 
A
F
 
N
V
 
V
G
 
N
V
 
Y
P
 
F
H
 
G
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
C
F
 
G
F
 
M
S
 
A
H
 
H
I
 
K
H
 
T
L
 
I
E
 
K
G
 
G
G
 
G
P
 
L
A
 
C
P
 
P
V
 
G
R
 
G
R
 
R
Y
 
L
L
 
R
P
 
A
D
 
E
L
 
M
I
 
L
-
 
R
D
 
D
L
 
M
I
 
V
L
 
V
D
 
Y
Q
 
N
K
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
K
V
 
L
F
 
V
D
 
T
L
 
H
V
 
V
L
 
Y
P
 
H
-
 
G
L
 
F
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
A
Y
 
L
K
 
L
A
 
L
M
 
M
D
 
K
E
 
D
R
 
K

Sites not aligning to the query:

7y9pA Xylitol dehydrogenase s96c/s99c/y102c mutant(thermostabilized form) from pichia stipitis (see paper)
29% identity, 76% coverage: 5:262/338 of query aligns to 7:270/357 of 7y9pA

query
sites
7y9pA
V
 
V
L
 
L
H
 
N
G
 
K
P
 
I
N
 
D
D
 
D
I
 
I
R
 
S
F
 
F
E
 
E
E
 
T
V
 
Y
P
 
D
E
 
A
P
 
P
K
 
E
I
 
I
E
 
S
K
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
D
A
 
V
I
 
L
I
 
V
R
 
Q
I
 
V
A
 
K
V
 
K
T
 
T
C
 
G
V
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
S
D
 
D
L
 
I
W
 
H
P
 
F
Y
 
Y
R
 
A
G
 
H
I
 
G
S
 
R
P
 
I
G
 
G
-
 
N
-
 
F
-
 
V
-
 
L
S
 
T
G
 
K
P
 
P
T
 
M
R
 
V
M
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
S
C
 
A
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
E
 
V
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
S
 
K
A
 
G
V
 
V
M
 
T
A
 
S
I
 
L
K
 
K
K
 
V
G
 
G
Q
 
D
F
 
N
V
 
V
V
 
A
G
 
I
S
 
E
F
 
P
A
 
G
T
 
I
S
 
P
D
x
C
N
 
R
T
 
F
C
|
C
P
 
D
T
 
E
C
|
C
N
 
K
I
 
S
G
 
G
Y
 
H
Q
 
Y
S
 
N
S
 
L
C
|
C
V
 
P
Q
 
H
R
 
M
E
 
A
F
 
F
V
 
A
S
 
A
Q
 
T
A
 
P
Q
 
N
S
 
E
P
 
P
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
H
 
N
A
 
P
D
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
C
A
 
K
T
 
Y
R
 
F
E
 
K
A
 
S
P
 
P
D
 
E
A
 
D
S
 
F
M
 
L
V
 
V
P
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
L
G
 
E
L
 
L
L
 
G
A
 
A
S
 
L
S
 
V
D
 
E
V
 
P
L
 
L
G
 
S
T
 
V
G
 
G
W
 
V
Y
 
H
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
L
A
 
G
R
 
S
V
 
V
R
 
A
P
 
F
G
 
G
V
 
D
T
 
Y
A
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
F
G
 
G
D
 
A
G
 
G
A
 
P
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
A
S
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
T
M
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
K
R
 
G
I
 
V
I
 
I
V
 
V
M
 
V
S
 
D
R
 
I
H
 
F
P
 
D
A
 
N
R
 
K
Q
 
L
K
 
K
L
 
M
A
 
A
L
 
K
D
 
D
F
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
A
D
 
T
I
 
H
V
 
T
A
 
F
E
 
N
R
 
S
G
 
K
E
 
T
E
 
G
G
 
G
V
 
S
A
 
E
R
 
E
I
 
L
M
 
I
E
 
K
L
 
A
T
 
F
R
 
G
G
 
G
L
 
N
G
 
V
A
 
P
D
 
N
S
 
V
V
 
V
L
 
L
E
 
E
C
 
C
V
 
T
G
 
G
T
 
A
G
 
E
E
 
P
S
 
C
M
 
I
Q
 
K
Q
 
L
A
 
G
M
 
V
R
 
D
V
 
A
T
 
I
R
 
A
K
 
P
G
 
G
G
 
G
H
 
R
M
 
F
S
 
V
F
 
Q
V
 
V
G
 
G

Query Sequence

>N515DRAFT_0211 N515DRAFT_0211 Threonine dehydrogenase
MKGTVLHGPNDIRFEEVPEPKIEKPTDAIIRIAVTCVCGSDLWPYRGISPGSGPTRMGHE
YCGYVEEVGSAVMAIKKGQFVVGSFATSDNTCPTCNIGYQSSCVQREFVSQAQSPYLRVA
HADGTLVATREAPDASMVPGLLASSDVLGTGWYAADAARVRPGVTAVVVGDGAVGLLAVL
SAKQMGAERIIVMSRHPARQKLALDFGATDIVAERGEEGVARIMELTRGLGADSVLECVG
TGESMQQAMRVTRKGGHMSFVGVPHGVEIEGQALFFSHIHLEGGPAPVRRYLPDLIDLIL
DQKIDPSAVFDLVLPLDQVAEGYKAMDERRAIKALLQP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory