SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_0537 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_0537 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q7XSN8 Serine racemase; D-serine dehydratase; D-serine ammonia-lyase; L-serine dehydratase; L-serine ammonia-lyase; EC 5.1.1.18; EC 4.3.1.18; EC 4.3.1.17 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:315/315 of query aligns to 20:333/339 of Q7XSN8

query
sites
Q7XSN8
D
 
D
L
 
I
D
 
H
Q
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
V
A
 
H
V
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
S
 
S
A
 
T
R
 
S
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
C
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
K
 
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
S
N
 
N
A
 
S
V
 
I
W
 
F
S
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
D
Q
 
E
A
 
A
A
 
S
R
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
G
 
A
N
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
R
G
 
N
A
 
A
V
 
P
R
 
A
A
 
C
K
 
K
L
 
V
E
 
D
A
 
N
I
 
V
E
 
K
Q
 
R
A
 
Y
G
 
G
A
 
G
V
 
H
L
 
I
H
 
I
R
 
W
C
 
S
A
 
D
P
 
V
T
 
S
T
 
I
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
S
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
Q
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
I
L
 
L
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
F
A
 
N
D
 
N
A
 
K
R
 
N
V
 
T
M
 
I
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
V
V
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
M
 
L
R
 
E
Q
 
E
V
 
V
E
 
P
G
 
E
L
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
V
P
 
P
V
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
I
A
 
S
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
K
G
 
A
L
 
I
K
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
I
A
 
R
M
 
I
Y
 
L
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
D
D
|
D
A
 
S
A
 
A
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
I
V
 
I
E
 
T
P
 
L
F
 
P
Q
 
S
A
 
T
D
 
N
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
A
 
D
P
 
L
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
I
T
 
V
V
 
V
S
 
D
D
 
D
E
 
N
E
 
A
T
 
I
I
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
M
K
 
K
L
 
M
L
 
C
W
 
Y
R
 
E
E
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
V
V
 
A
V
 
V
E
 
E
V
 
P
S
 
S
S
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
F
K
 
K
Q
 
Q
A
 
S
E
 
S
H
 
A
F
 
W
-
 
H
A
 
E
G
 
S
R
 
S
R
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
V
L
 
L
P
 
-
W
 
W

5cvcA Structure of maize serine racemase (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:313/315 of query aligns to 4:316/329 of 5cvcA

query
sites
5cvcA
D
 
D
L
 
I
D
 
D
Q
 
S
I
 
I
R
 
R
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
A
 
V
A
 
H
V
 
R
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
M
R
 
S
S
 
S
A
 
T
R
 
S
L
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
G
A
 
K
Q
 
K
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
C
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
A
G
 
G
A
 
A
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
S
N
 
N
A
 
S
V
 
I
W
 
F
S
 
A
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
E
Q
 
Q
A
 
V
A
 
S
R
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
 
A
N
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
H
V
 
I
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
R
G
 
N
A
 
A
V
 
P
R
 
A
A
 
S
K
 
K
L
 
V
E
 
E
A
 
N
I
 
V
E
 
K
Q
 
C
A
 
Y
G
 
G
A
 
G
V
 
H
L
 
I
H
 
I
R
 
W
C
 
S
A
 
D
P
 
A
T
 
S
T
 
I
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
Y
M
 
V
T
 
S
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
Q
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
A
E
 
V
L
 
L
V
 
I
H
 
H
P
 
P
Y
 
I
A
 
N
D
 
S
A
 
K
R
 
Y
V
 
T
M
 
I
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
V
V
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
M
 
L
R
 
E
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
E
L
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
V
P
 
P
V
 
I
G
x
S
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
 
L
A
 
I
A
 
S
G
 
G
C
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
K
G
 
A
L
 
I
K
 
N
P
 
P
E
 
S
L
 
I
A
 
R
M
 
I
Y
 
L
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
K
G
 
G
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
S
A
 
A
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
I
V
 
I
E
 
T
P
 
L
F
 
P
Q
 
S
A
 
T
D
 
N
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
|
L
R
 
R
T
 
A
L
 
F
I
 
L
G
 
G
A
 
D
P
 
L
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
V
L
 
V
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
T
 
V
V
 
V
S
 
D
D
 
D
E
 
T
E
 
A
T
 
I
I
 
V
A
 
D
A
 
A
M
 
M
K
 
K
L
 
M
L
 
C
W
 
Y
R
 
E
E
 
I
L
 
L
K
 
K
L
 
V
V
 
A
V
 
V
E
|
E
V
 
P
S
 
S
S
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
F
K
 
K
Q
 
Q
A
 
S
E
 
S
H
 
A
F
 
W
-
 
H
A
 
E
G
 
S
R
 
S
R
 
K
V
 
I
G
 
G
L
 
I
V
 
I
L
x
V
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
G
A
 
T
L
 
L

3l6bA X-ray crystal structure of human serine racemase in complex with malonate a potent inhibitor (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 23:318/322 of 3l6bA

query
sites
3l6bA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
-
D
 
-
A
 
V
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
|
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
|
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
|
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
|
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

6zspAAA serine racemase bound to atp and malonate. (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 22:315/320 of 6zspAAA

query
sites
6zspAAA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
|
S
A
x
S
R
x
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
x
K
G
x
T
G
 
G
A
 
S
F
 
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
K
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
|
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
|
H
G
 
G
N
x
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
x
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
|
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
 
V
R
 
K
T
x
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
x
E
E
x
R
L
 
M
K
|
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
 
G
G
 
G
N
|
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

7nbfAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z126932614, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 22:322/323 of 7nbfAAA

query
sites
7nbfAAA
V
x
L
T
|
T
P
|
P
V
 
V
L
|
L
R
x
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
x
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
x
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

Sites not aligning to the query:

7nbdAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z235449082, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 22:322/323 of 7nbdAAA

query
sites
7nbdAAA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
x
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
|
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
x
L
V
 
I
E
|
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
|
V
D
 
D
L
|
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

Sites not aligning to the query:

7nbcCCC structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 22:322/323 of 7nbcCCC

query
sites
7nbcCCC
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
H
|
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
|
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
|
V
H
|
H
P
|
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

7nbcAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 22:322/323 of 7nbcAAA

query
sites
7nbcAAA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
x
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

Sites not aligning to the query:

7nbgAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 22:322/322 of 7nbgAAA

query
sites
7nbgAAA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
|
G
N
x
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
x
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
|
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
|
I
E
 
Q
Q
 
A
A
x
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
T
D
 
S
A
 
S
L
 
I
P
 
T
W
 
W

7nbhAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z26781964, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 92% coverage: 23:312/315 of query aligns to 22:318/320 of 7nbhAAA

query
sites
7nbhAAA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
 
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
-
 
V
D
 
P
D
 
D
A
 
A
-
 
L
-
 
E
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
G
|
G
N
x
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
|
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
|
I
E
 
Q
Q
 
A
A
x
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
|
D
G
|
G
L
 
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
x
P
S
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
 
G
G
 
G
N
|
N
V
|
V
D
|
D
L
 
L
D
 
T
A
 
S

7nbgDDD structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
42% identity, 91% coverage: 23:309/315 of query aligns to 22:310/310 of 7nbgDDD

query
sites
7nbgDDD
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
V
W
 
R
S
 
S
L
 
L
D
 
-
D
 
-
A
 
V
Q
 
R
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
 
G
N
x
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
x
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
x
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
K
E
 
R
L
 
V
Q
 
T
R
 
E
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
M
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
V
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
-
R
 
K
V
 
L
E
 
M
P
 
P
-
 
N
-
 
L
F
 
Y
Q
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
x
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
I
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
|
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9QZX7 Serine racemase; D-serine ammonia-lyase; D-serine dehydratase; L-serine ammonia-lyase; L-serine dehydratase; EC 5.1.1.18; EC 4.3.1.18; EC 4.3.1.17 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
43% identity, 93% coverage: 23:315/315 of query aligns to 25:324/339 of Q9QZX7

query
sites
Q9QZX7
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
 
F
K
 
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
I
W
 
R
S
 
G
L
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
D
D
 
T
D
 
P
A
 
E
Q
 
E
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
N
A
x
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
C
A
 
D
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
K
M
 
V
T
 
T
A
 
Q
E
 
R
L
 
I
Q
 
M
R
 
Q
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
L
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
A
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
I
H
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
E
R
 
L
V
 
T
E
 
P
P
 
N
F
 
L
Q
 
H
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
Y
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
G
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
 
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
V
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
S
L
 
L
P
 
N
W
 
W

3hmkA Crystal structure of serine racemase (see paper)
42% identity, 92% coverage: 23:313/315 of query aligns to 23:320/321 of 3hmkA

query
sites
3hmkA
V
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
T
S
 
S
A
 
S
R
 
I
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
L
 
L
H
 
F
F
 
F
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
L
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
|
F
K
|
K
F
 
I
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
L
N
 
N
A
 
A
V
 
I
W
 
R
S
 
G
L
 
L
-
 
I
-
 
P
D
 
D
D
 
T
A
 
L
Q
 
E
-
 
G
A
 
K
A
 
P
R
 
K
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
H
 
H
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
L
R
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
P
A
 
A
H
 
Y
V
 
I
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
G
 
T
A
 
A
V
 
P
R
 
N
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
Q
Q
 
A
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
S
L
 
I
H
 
V
R
 
Y
C
 
S
A
 
E
P
 
P
T
 
S
T
 
D
A
 
E
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
N
M
 
V
T
 
A
A
 
Q
E
 
R
L
 
I
Q
 
I
R
 
Q
Q
 
E
T
 
T
G
 
E
A
 
G
E
 
I
L
 
L
V
 
V
H
 
H
P
 
P
Y
 
N
A
 
Q
D
 
E
A
 
P
R
 
A
V
 
V
M
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
M
 
L
R
 
N
Q
 
Q
V
 
V
E
 
P
G
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
M
A
 
V
A
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
I
H
 
K
G
 
T
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
S
L
 
V
A
 
K
M
 
V
Y
 
Y
G
 
A
A
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
S
G
 
N
A
|
A
D
 
D
D
|
D
A
 
C
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
L
 
K
A
 
L
Q
 
K
G
 
G
A
 
E
R
 
L
V
 
T
E
 
P
P
 
N
F
 
L
Q
 
H
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
A
D
 
D
G
|
G
L
x
V
R
 
K
T
 
S
L
 
S
I
 
I
G
 
G
A
 
L
P
 
N
N
 
T
F
 
W
D
 
P
A
 
I
L
 
I
R
 
R
T
 
D
H
 
L
R
 
V
T
 
D
Q
 
D
V
 
V
I
 
F
T
 
T
V
 
V
S
 
T
D
 
E
E
 
D
E
 
E
T
 
I
I
 
K
A
 
Y
A
 
A
M
 
T
K
 
Q
L
 
L
L
 
V
W
 
W
R
 
E
E
 
R
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
V
 
P
S
x
T
S
 
A
A
 
G
T
 
V
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
K
 
S
Q
 
Q
A
 
-
E
 
-
H
 
H
F
 
F
A
 
Q
G
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
G
 
C
L
 
I
V
 
V
L
|
L
T
x
S
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
D
 
T
A
 
S
L
 
L

A4F2N8 L-threo-3-hydroxyaspartate ammonia-lyase; L-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase; L-THA DH; EC 4.3.1.16 from Pseudomonas sp. (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:311/315 of query aligns to 3:311/319 of A4F2N8

query
sites
A4F2N8
L
 
L
P
 
S
D
 
S
L
 
Y
D
 
H
Q
 
D
I
 
V
R
 
I
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
E
P
 
G
Y
 
F
A
 
A
A
 
N
V
 
R
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
F
R
 
T
S
 
S
A
 
R
R
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
L
 
V
H
 
F
F
 
I
K
 
K
C
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
G
 
T
G
 
G
A
 
S
F
 
F
K
|
K
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
C
 
F
N
 
N
A
 
A
V
 
L
W
 
S
S
 
R
L
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
R
A
 
K
R
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
A
H
 
F
S
 
S
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
G
 
A
N
 
Q
A
 
G
L
 
I
A
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
T
 
L
R
 
L
G
 
Q
I
 
M
A
 
P
A
 
A
H
 
T
V
 
I
V
 
V
V
 
M
P
 
P
E
 
T
G
 
D
A
 
A
V
 
P
R
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
E
 
A
A
 
A
I
 
T
E
 
R
Q
 
E
A
 
Y
G
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
V
H
 
V
R
 
F
C
 
Y
A
 
D
P
 
R
T
 
I
T
 
T
A
 
E
A
 
D
R
 
R
E
 
E
A
 
Q
M
 
I
T
 
G
A
 
R
E
 
T
L
 
L
Q
 
A
R
 
E
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
A
 
M
E
 
T
L
 
L
V
 
I
H