SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_0917 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_0917 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2f02A Crystal structure of lacc from enterococcus faecalis in complex with atp
31% identity, 99% coverage: 1:308/310 of query aligns to 2:312/319 of 2f02A

query
sites
2f02A
M
 
L
I
 
I
T
 
V
V
 
T
A
 
V
G
 
T
F
 
M
N
 
N
T
 
P
A
 
S
I
 
I
D
 
D
R
 
I
L
 
S
Y
 
Y
T
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
H
L
 
L
E
 
K
P
 
L
G
 
D
A
 
T
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
A
 
T
A
 
S
N
 
Q
V
 
V
Q
 
T
A
 
K
Y
 
T
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
T
 
V
I
 
I
A
 
H
A
 
D
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
D
V
 
V
Q
 
I
L
 
A
V
 
T
G
 
G
L
 
V
T
 
L
D
 
G
V
 
G
F
 
F
H
 
H
R
 
G
N
 
A
L
 
F
I
 
I
A
 
A
R
 
N
R
 
E
M
 
L
S
 
K
E
 
K
R
 
A
G
 
N
V
 
I
L
 
P
F
 
Q
H
 
A
G
 
F
V
 
T
E
 
S
I
 
I
A
 
K
G
 
E
E
 
E
L
 
T
R
 
R
H
 
D
C
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
L
E
 
-
R
 
H
D
 
E
G
 
G
R
 
N
M
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
E
P
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
T
L
 
V
P
 
S
P
 
P
R
 
E
A
 
E
Q
 
I
Q
 
S
Q
 
N
L
 
F
L
 
L
D
 
E
T
 
N
L
 
F
W
 
D
R
 
Q
C
 
L
V
 
I
E
 
K
D
 
Q
T
 
A
D
 
E
A
 
I
M
 
V
V
 
T
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
L
E
 
P
A
 
S
D
 
D
T
 
F
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
Q
 
K
I
 
A
A
 
H
P
 
A
R
 
Q
G
 
E
L
 
V
P
 
K
C
 
V
L
 
L
V
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
A
 
S
L
 
L
R
 
R
-
 
Q
-
 
V
L
 
L
A
 
Q
A
 
G
D
 
P
A
 
W
G
 
K
A
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
R
 
L
D
 
E
E
 
E
A
 
L
A
 
E
Q
 
G
L
 
L
A
 
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
D
V
 
F
D
 
S
T
 
E
V
 
N
E
 
P
D
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
-
 
Q
-
 
T
-
 
A
V
 
L
A
 
T
R
 
K
A
 
P
L
 
M
H
 
F
A
 
A
R
 
-
G
 
G
V
 
I
A
 
E
F
 
W
P
 
I
V
 
V
I
 
I
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
 
K
R
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
I
G
 
A
F
 
K
D
 
H
G
 
H
A
 
D
D
 
Q
C
 
F
W
 
Y
H
 
R
A
 
V
S
 
K
L
x
I
A
 
P
I
 
T
A
x
I
H
 
Q
S
 
A
A
 
K
N
 
N
A
 
P
V
 
V
G
|
G
S
|
S
G
|
G
D
 
D
C
 
A
F
x
T
L
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
Y
A
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
K
G
 
D
G
 
A
E
 
P
P
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
W
G
 
G
V
x
M
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
x
M
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Q
H
 
E
E
 
R
E
 
M
T
 
T
G
 
G
Y
 
H
V
 
V
Q
 
D
R
 
V
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
D
 
K
A
 
K
L
 
H
L
 
L
A
 
M
E
 
N
V
 
I
R
 
Q
L
 
V
V
 
V
R
 
E
F
 
I

2jg1C Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
28% identity, 99% coverage: 1:307/310 of query aligns to 6:314/315 of 2jg1C

query
sites
2jg1C
M
 
M
I
 
I
T
 
L
V
 
T
A
 
L
G
 
T
F
 
L
N
 
N
T
 
P
A
 
S
I
 
V
D
|
D
R
 
I
L
 
S
Y
 
Y
T
 
P
L
 
L
D
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
K
P
 
L
G
 
D
A
 
D
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
A
 
V
A
 
Q
N
 
E
V
 
V
Q
 
S
A
 
K
Y
 
T
P
 
A
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
L
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
T
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
L
L
 
A
V
 
S
G
 
G
L
 
F
T
 
I
D
 
G
V
 
G
F
 
E
H
 
L
R
 
G
N
 
Q
L
 
F
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
K
M
 
L
S
 
D
E
 
H
R
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
K
F
 
H
H
 
A
G
 
F
V
 
Y
E
 
N
I
 
I
A
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
T
R
|
R
H
 
N
C
|
C
L
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
L
E
 
-
R
 
H
D
 
E
G
 
G
R
 
Q
M
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
I
L
|
L
D
 
E
P
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
E
L
 
I
P
 
D
P
 
N
R
 
Q
A
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Q
 
G
L
 
F
L
 
I
D
 
K
T
 
H
L
 
F
W
 
E
R
 
Q
C
 
M
V
 
M
E
 
E
D
 
K
T
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
A
L
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
G
F
 
L
E
 
N
A
 
Q
D
 
D
T
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
R
I
 
C
A
 
Q
P
 
N
R
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
L
D
 
D
A
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
A
 
T
L
 
L
R
 
Q
-
 
T
-
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
Y
G
 
K
A
 
P
F
 
T
L
 
V
L
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
I
D
 
S
E
 
E
A
 
L
A
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
N
R
 
Q
A
 
P
V
 
L
D
 
D
-
 
E
T
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
S
A
 
L
A
 
K
V
 
Q
V
 
A
A
 
V
R
 
S
A
 
Q
L
 
P
H
 
L
A
 
F
R
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
E
F
 
W
P
 
I
V
 
I
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
|
A
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
K
D
 
H
G
 
N
A
 
H
D
 
T
C
 
F
W
 
Y
H
 
R
A
 
V
S
 
N
L
x
I
A
 
P
I
 
T
A
x
I
H
 
S
S
x
V
A
 
L
N
 
N
A
 
P
V
|
V
G
|
G
S
|
S
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
x
T
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
V
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
L
R
 
N
G
 
H
G
 
E
E
 
N
P
 
D
A
 
H
Q
 
D
A
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
K
G
 
A
V
x
N
A
 
T
C
 
L
G
|
G
A
x
M
A
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
Q
H
 
E
E
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
N
R
 
L
A
 
N
Q
 
N
V
 
Y
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
N
E
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
V
 
L
R
 
E

2jg1A Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
28% identity, 99% coverage: 1:307/310 of query aligns to 9:317/318 of 2jg1A

query
sites
2jg1A
M
 
M
I
 
I
T
 
L
V
 
T
A
 
L
G
 
T
F
 
L
N
 
N
T
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
I
L
 
S
Y
 
Y
T
 
P
L
 
L
D
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
K
P
 
L
G
 
D
A
 
D
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
A
 
V
A
 
Q
N
 
E
V
 
V
Q
 
S
A
 
K
Y
 
T
P
 
A
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
T
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
L
L
 
A
V
 
S
G
 
G
L
 
F
T
 
I
D
 
G
V
 
G
F
 
E
H
 
L
R
 
G
N
 
Q
L
 
F
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
K
M
 
L
S
 
D
E
 
H
R
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
K
F
 
H
H
 
A
G
 
F
V
 
Y
E
 
N
I
 
I
A
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
T
R
 
R
H
 
N
C
 
C
L
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
L
E
 
-
R
 
H
D
 
E
G
 
G
R
 
Q
M
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
E
P
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
E
L
 
I
P
 
D
P
 
N
R
 
Q
A
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Q
 
G
L
 
F
L
 
I
D
 
K
T
 
H
L
 
F
W
 
E
R
 
Q
C
 
M
V
 
M
E
 
E
D
 
K
T
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
A
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
G
F
 
L
E
 
N
A
 
Q
D
 
D
T
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
R
I
 
C
A
 
Q
P
 
N
R
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
L
D
 
D
A
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
A
 
T
L
 
L
R
 
Q
-
 
T
-
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
Y
G
 
K
A
 
P
F
 
T
L
 
V
L
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
R
 
I
D
 
S
E
 
E
A
 
L
A
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
N
R
 
Q
A
 
P
V
 
L
D
 
D
-
 
E
T
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
S
A
 
L
A
 
K
V
 
Q
V
 
A
A
 
V
R
 
S
A
 
Q
L
 
P
H
 
L
A
 
F
R
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
E
F
 
W
P
 
I
V
 
I
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
 
A
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
K
D
 
H
G
 
N
A
 
H
D
 
T
C
 
F
W
 
Y
H
 
R
A
 
V
S
 
N
L
 
I
A
 
P
I
 
T
A
x
I
H
 
S
S
x
V
A
 
L
N
 
N
A
 
P
V
 
V
G
|
G
S
|
S
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
x
T
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
V
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
L
R
 
N
G
 
H
G
 
E
E
 
N
P
 
D
A
 
H
Q
 
D
A
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
K
G
 
A
V
x
N
A
 
T
C
 
L
G
|
G
A
x
M
A
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
Q
H
 
E
E
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
N
R
 
L
A
 
N
Q
 
N
V
 
Y
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
N
E
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
V
 
L
R
 
E

2jgvB Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase in complex with adp (see paper)
28% identity, 99% coverage: 1:307/310 of query aligns to 5:313/314 of 2jgvB

query
sites
2jgvB
M
 
M
I
 
I
T
 
L
V
 
T
A
 
L
G
 
T
F
 
L
N
 
N
T
 
P
A
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
I
L
 
S
Y
 
Y
T
 
P
L
 
L
D
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
K
P
 
L
G
 
D
A
 
D
V
 
V
Q
 
N
R
 
R
A
 
V
A
 
Q
N
 
E
V
 
V
Q
 
S
A
 
K
Y
 
T
P
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
H
 
N
V
 
V
A
 
T
Q
 
R
T
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
L
L
 
A
V
 
S
G
 
G
L
 
F
T
 
I
D
 
G
V
 
G
F
 
E
H
 
L
R
 
G
N
 
Q
L
 
F
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
K
M
 
L
S
 
D
E
 
H
R
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
K
F
 
H
H
 
A
G
 
F
V
 
Y
E
 
N
I
 
I
A
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
T
R
 
R
H
 
N
C
 
C
L
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
L
E
 
-
R
 
H
D
 
E
G
 
G
R
 
Q
M
 
Q
T
 
T
E
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
E
P
 
Q
G
 
G
P
 
P
L
 
E
L
 
I
P
 
D
P
 
N
R
 
Q
A
 
E
Q
 
A
Q
 
A
Q
 
G
L
 
F
L
 
I
D
 
K
T
 
H
L
 
F
W
 
E
R
 
Q
C
 
L
V
 
L
E
 
E
D
 
K
T
 
V
D
 
E
A
 
A
M
 
V
V
 
A
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
G
F
 
L
E
 
N
A
 
Q
D
 
D
T
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
Q
L
 
I
L
 
I
R
 
E
Q
 
R
I
 
C
A
 
Q
P
 
N
R
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
L
D
 
D
A
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
A
 
T
L
 
L
R
 
Q
-
 
T
-
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
N
D
 
P
A
 
Y
G
 
K
A
 
P
F
 
T
L
 
V
L
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
I
D
 
S
E
 
E
A
 
L
A
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
A
 
L
G
 
N
R
 
Q
A
 
P
V
 
L
D
 
D
-
 
E
T
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
S
A
 
L
A
 
K
V
 
Q
V
 
A
A
 
V
R
 
S
A
 
Q
L
 
P
H
 
L
A
 
F
R
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
E
F
 
W
P
 
I
V
 
I
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
 
G
A
|
A
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
F
G
 
A
F
 
K
D
 
H
G
 
N
A
 
H
D
 
T
C
 
F
W
 
Y
H
 
R
A
 
V
S
 
N
L
 
I
A
 
P
I
 
T
A
x
I
H
 
S
S
 
V
A
 
L
N
 
N
A
x
P
V
 
V
G
|
G
S
|
S
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
T
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
T
V
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
L
R
 
N
G
 
H
G
 
E
E
 
N
P
 
D
A
 
H
Q
 
D
A
 
L
L
 
L
R
 
K
L
 
K
G
 
A
V
x
N
A
 
T
C
 
L
G
|
G
A
x
M
A
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
Q
H
 
E
E
 
A
E
 
Q
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
N
R
 
L
A
 
N
Q
 
N
V
 
Y
D
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
N
E
 
Q
V
 
I
R
 
E
L
 
V
V
 
L
R
 
E

3ie7A The crystal structure of phosphofructokinase (lin2199) from listeria innocua in complex with atp at 1.6a
23% identity, 100% coverage: 1:309/310 of query aligns to 2:309/309 of 3ie7A

query
sites
3ie7A
M
 
L
I
 
I
T
 
Y
V
 
T
A
 
I
G
 
T
F
 
L
N
 
N
T
 
P
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
L
 
L
-
 
L
Y
 
F
T
 
I
L
 
R
D
 
G
A
 
E
L
 
L
E
 
E
P
 
K
G
 
R
A
 
K
V
 
T
Q
 
N
R
 
R
A
 
V
A
 
I
N
 
K
V
 
T
Q
 
E
A
 
F
Y
 
D
P
 
C
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
H
 
H
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
T
 
V
I
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
G
 
G
E
 
I
P
 
K
V
 
N
Q
 
E
L
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
A
D
 
G
V
 
S
F
 
D
H
 
N
R
 
L
N
 
D
L
 
K
I
 
L
A
 
Y
R
 
A
R
 
I
M
 
L
S
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
H
V
 
I
L
 
N
F
 
H
H
 
D
G
 
F
-
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
G
G
 
T
E
 
S
L
 
T
R
 
R
H
 
E
C
 
C
L
 
F
A
 
V
L
 
V
R
 
L
E
 
S
R
 
D
D
 
D
G
 
T
R
 
N
-
 
G
M
 
S
T
 
T
E
 
M
V
 
I
L
 
P
D
 
E
P
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
S
P
 
Q
R
 
T
A
 
N
Q
 
K
Q
 
D
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
I
W
 
A
R
 
K
C
 
K
V
 
V
E
 
K
D
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
M
M
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
P
P
 
P
R
 
P
G
 
H
F
 
Y
E
 
T
A
 
L
D
 
S
T
 
D
Y
 
F
A
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
I
 
V
A
 
K
P
 
A
R
 
T
G
 
G
L
 
A
P
 
F
C
 
L
L
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
Y
L
 
L
R
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
V
F
 
D
L
 
F
L
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
R
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
V
A
 
I
Q
 
A
L
 
I
A
 
L
G
 
D
R
 
E
A
 
K
V
 
T
D
 
N
T
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
E
A
 
N
A
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
T
L
 
L
H
 
-
A
 
A
R
 
E
G
 
K
V
 
I
A
 
P
F
 
Y
P
 
L
V
 
V
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
|
A
R
 
K
G
|
G
A
 
S
L
 
I
G
 
C
F
 
A
D
 
H
G
 
N
A
 
G
D
 
K
C
 
L
W
 
Y
H
 
Q
A
 
V
S
 
I
L
 
P
A
 
P
I
 
K
A
x
V
H
 
Q
S
 
E
A
 
R
N
 
N
A
 
D
V
 
T
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
F
A
 
I
V
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
M
G
 
N
G
 
M
E
 
P
P
 
I
A
 
T
Q
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
A
V
 
T
A
 
G
C
 
C
G
x
S
A
 
A
A
 
S
N
 
K
A
x
V
L
 
M
H
 
Q
E
 
Q
E
 
D
T
 
S
G
 
S
Y
 
S
V
 
F
Q
 
D
R
 
L
A
 
E
Q
 
A
V
 
A
D
 
G
A
 
K
L
 
L
L
 
K
A
 
N
E
 
Q
V
 
V
R
 
S
L
 
I
V
 
I
R
 
Q
F
 
L
D
 
E

3uqdB Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
30% identity, 82% coverage: 35:288/310 of query aligns to 37:292/309 of 3uqdB

query
sites
3uqdB
P
 
P
G
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
x
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
S
V
 
A
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
A
H
 
T
R
 
G
N
 
E
L
 
H
I
 
L
A
 
V
R
 
S
R
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
V
 
V
L
 
P
F
 
V
H
 
A
G
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
K
G
 
D
E
 
W
L
 
T
R
|
R
H
 
Q
C
 
N
L
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
H
-
 
V
E
 
E
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
Q
T
 
Y
E
x
R
V
 
F
L
 
V
D
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
N
P
 
E
R
 
D
A
 
E
Q
 
F
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
E
T
 
Q
L
 
V
W
 
L
R
 
E
C
 
-
V
 
I
E
 
E
D
 
S
T
 
G
D
 
A
A
 
I
M
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
K
A
 
L
D
 
E
T
 
K
Y
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
A
I
 
A
A
 
Q
P
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
N
F
 
I
-
 
E
L
 
L
L
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
R
 
Q
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
T
T
 
Q
V
 
P
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
R
V
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
H
 
V
A
 
N
R
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
K
-
 
R
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
x
P
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
G
 
S
A
 
E
D
 
N
C
 
C
W
 
I
H
 
Q
A
 
V
S
 
V
L
 
P
A
 
P
I
 
P
A
 
V
H
 
K
S
|
S
A
 
Q
N
 
S
A
 
T
V
 
V
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
A
R
 
E
G
 
N
G
 
A
E
 
S
P
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
G
V
|
V
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
A
 
T
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
E
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3uqdA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
30% identity, 82% coverage: 35:288/310 of query aligns to 37:292/309 of 3uqdA

query
sites
3uqdA
P
 
P
G
|
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
x
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
S
V
 
A
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
A
H
 
T
R
 
G
N
 
E
L
 
H
I
 
L
A
 
V
R
 
S
R
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
V
 
V
L
 
P
F
 
V
H
 
A
G
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
K
G
 
D
E
 
W
L
 
T
R
|
R
H
 
Q
C
 
N
L
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
H
-
 
V
E
 
E
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
Q
T
 
Y
E
 
R
V
 
F
L
 
V
D
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
N
P
 
E
R
 
D
A
 
E
Q
 
F
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
E
T
 
Q
L
 
V
W
 
L
R
 
E
C
 
-
V
 
I
E
 
E
D
 
S
T
 
G
D
 
A
A
 
I
M
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
K
A
 
L
D
 
E
T
 
K
Y
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
A
I
 
A
A
 
Q
P
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
N
F
 
I
-
 
E
L
 
L
L
 
V
K
|
K
P
 
P
N
 
N
R
 
Q
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
T
T
 
Q
V
 
P
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
R
V
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
H
 
V
A
 
N
R
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
K
-
 
R
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
x
P
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
G
 
S
A
 
E
D
 
N
C
 
C
W
 
I
H
 
Q
A
 
V
S
 
V
L
 
P
A
 
P
I
 
P
A
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
Q
N
 
S
A
x
T
V
 
V
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
A
R
 
E
G
 
N
G
 
A
E
 
S
P
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
G
V
|
V
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
A
x
T
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
E
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3n1cA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with fructose-6-phosphate (see paper)
30% identity, 82% coverage: 35:288/310 of query aligns to 37:292/309 of 3n1cA

query
sites
3n1cA
P
 
P
G
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
x
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
S
V
 
A
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
A
H
 
T
R
 
G
N
 
E
L
 
H
I
 
L
A
 
V
R
 
S
R
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
V
 
V
L
 
P
F
 
V
H
 
A
G
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
K
G
 
D
E
 
W
L
 
T
R
|
R
H
 
Q
C
 
N
L
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
H
-
 
V
E
 
E
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
Q
T
 
Y
E
 
R
V
 
F
L
 
V
D
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
N
P
 
E
R
 
D
A
 
E
Q
 
F
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
E
T
 
Q
L
 
V
W
 
L
R
 
E
C
 
-
V
 
I
E
 
E
D
 
S
T
 
G
D
 
A
A
 
I
M
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
K
A
 
L
D
 
E
T
 
K
Y
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
A
I
 
A
A
 
Q
P
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
N
F
 
I
-
 
E
L
 
L
L
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
Q
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
T
T
 
Q
V
 
P
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
R
V
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
H
 
V
A
 
N
R
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
K
-
 
R
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
P
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
G
 
S
A
 
E
D
 
N
C
 
C
W
 
I
H
 
Q
A
 
V
S
 
V
L
 
P
A
 
P
I
 
P
A
 
V
H
 
K
S
 
S
A
 
Q
N
 
S
A
 
T
V
 
V
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
A
R
 
E
G
 
N
G
 
A
E
 
S
P
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
G
V
 
V
A
 
A
C
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
N
 
A
A
 
T
L
 
L
H
 
N
E
 
Q
E
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P06999 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; 6-phosphofructokinase isozyme II; Phosphohexokinase 2; EC 2.7.1.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
30% identity, 82% coverage: 35:288/310 of query aligns to 37:292/309 of P06999

query
sites
P06999
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
S
V
 
A
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
A
H
 
T
R
 
G
N
 
E
L
 
H
I
 
L
A
 
V
R
 
S
R
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
V
 
V
L
 
P
F
 
V
H
 
A
G
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
K
G
 
D
E
 
W
L
 
T
R
 
R
H
 
Q
C
 
N
L
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
H
-
 
V
E
 
E
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
Q
T
 
Y
E
 
R
V
 
F
L
 
V
D
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
N
P
 
E
R
 
D
A
 
E
Q
 
F
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
E
T
 
Q
L
 
V
W
 
L
R
 
E
C
 
-
V
 
I
E
 
E
D
 
S
T
 
G
D
 
A
A
 
I
M
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
K
A
 
L
D
 
E
T
 
K
Y
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
A
I
 
A
A
 
Q
P
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
N
F
 
I
-
 
E
L
 
L
L
 
V
K
|
K
P
|
P
N
|
N
R
x
Q
D
x
K
E
|
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
T
T
 
Q
V
 
P
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
R
V
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
H
 
V
A
 
N
R
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
K
-
 
R
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
x
S
L
|
L
G
|
G
A
x
P
R
x
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
G
 
S
A
 
E
D
 
N
C
 
C
W
 
I
H
 
Q
A
 
V
S
 
V
L
 
P
A
 
P
I
 
P
A
 
V
H
 
K
S
|
S
A
 
Q
N
x
S
A
 
T
V
|
V
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
S
F
 
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
A
R
 
E
G
 
N
G
 
A
E
 
S
P
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
G
V
|
V
A
 
A
C
 
A
G
 
G
A
x
S
A
 
A
N
x
A
A
 
T
L
 
L
H
x
N
E
 
Q
E
x
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

3uqeA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 mutant y23d from escherichia coli
29% identity, 81% coverage: 35:286/310 of query aligns to 37:290/307 of 3uqeA

query
sites
3uqeA
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
S
V
 
A
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
A
H
 
T
R
 
G
N
 
E
L
 
H
I
 
L
A
 
V
R
 
S
R
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
V
 
V
L
 
P
F
 
V
H
 
A
G
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
K
G
 
D
E
 
W
L
 
T
R
 
R
H
 
Q
C
 
N
L
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
H
-
 
V
E
 
E
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
Q
T
 
Y
E
 
R
V
 
F
L
 
V
D
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
N
P
 
E
R
 
D
A
 
E
Q
 
F
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
E
T
 
Q
L
 
V
W
 
L
R
 
E
C
 
-
V
 
I
E
 
E
D
 
S
T
 
G
D
 
A
A
 
I
M
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
K
A
 
L
D
 
E
T
 
K
Y
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
A
I
 
A
A
 
Q
P
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
N
F
 
I
-
 
E
L
 
L
L
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
R
 
Q
D
x
K
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
T
T
 
Q
V
 
P
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
R
V
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
H
 
V
A
 
N
R
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
K
-
 
R
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
x
P
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
G
 
S
A
 
E
D
 
N
C
 
C
W
 
I
H
 
Q
A
 
V
S
 
V
L
 
P
A
 
P
I
 
P
A
 
V
H
 
K
S
|
S
A
 
Q
N
 
S
A
 
T
V
 
V
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
A
R
 
E
G
 
N
G
 
A
E
 
S
P
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
G
V
|
V
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
A
x
T
L
 
L
H
 
N
E
 
Q

3cqdA Structure of the tetrameric inhibited form of phosphofructokinase-2 from escherichia coli (see paper)
29% identity, 83% coverage: 35:291/310 of query aligns to 37:298/304 of 3cqdA

query
sites
3cqdA
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
H
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
S
V
 
A
Q
 
T
L
 
A
V
 
I
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
A
H
 
T
R
 
G
N
 
E
L
 
H
I
 
L
A
 
V
R
 
S
R
 
L
M
 
L
S
 
A
E
 
D
R
 
E
G
 
N
V
 
V
L
 
P
F
 
V
H
 
A
G
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
K
G
 
D
E
 
W
L
 
T
R
 
R
H
 
Q
C
 
N
L
 
L
A
 
H
L
 
V
R
 
H
-
 
V
E
 
E
R
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
E
M
 
Q
T
 
Y
E
 
R
V
 
F
L
 
V
D
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
L
P
 
N
P
 
E
R
 
D
A
 
E
Q
 
F
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
E
T
 
Q
L
 
V
W
 
L
R
 
E
C
 
-
V
 
I
E
 
E
D
 
S
T
 
G
D
 
A
A
 
I
M
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
K
A
 
L
D
 
E
T
 
K
Y
 
L
A
 
T
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
S
Q
 
A
I
 
A
A
 
Q
P
 
K
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
N
F
 
I
-
 
E
L
 
L
L
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
R
 
Q
D
x
K
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
G
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
T
T
 
Q
V
 
P
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
R
V
 
K
V
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
L
 
I
H
 
V
A
 
N
R
 
S
G
 
G
V
 
K
A
 
A
F
 
K
-
 
R
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
x
P
R
 
Q
G
|
G
A
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
V
D
 
D
G
 
S
A
 
E
D
 
N
C
 
C
W
 
I
H
 
Q
A
 
V
S
 
V
L
 
P
A
 
P
I
 
P
A
 
V
H
 
K
S
|
S
A
 
Q
N
 
S
A
x
T
V
 
V
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
x
M
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
V
 
L
A
 
K
L
 
L
R
 
A
R
 
E
G
 
N
G
 
A
E
 
S
P
 
L
A
 
E
Q
 
E
A
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
G
V
|
V
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
x
S
A
 
A
N
 
A
A
x
T
L
 
L
-
 
L
-
 
C
-
 
S
H
 
H
E
 
D
E
 
D
T
 
T
G
 
Q
Y
 
K
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P9WID3 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; Phosphofructokinase B; Phosphohexokinase 2; Tagatose-6-phosphate kinase; EC 2.7.1.11; EC 2.7.1.144 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
30% identity, 95% coverage: 2:297/310 of query aligns to 14:310/339 of P9WID3

query
sites
P9WID3
I
 
I
T
 
I
V
 
T
A
 
L
G
 
T
F
 
M
N
 
N
T
 
P
A
 
A
I
 
L
D
 
D
R
 
I
L
 
T
Y
 
T
T
 
S
L
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
V
E
 
R
P
 
P
G
 
T
A
 
E
V
 
K
Q
 
M
R
 
R
A
 
C
A
 
G
N
 
A
V
 
P
Q
 
R
A
 
Y
Y
 
D
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
L
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
T
 
I
I
 
V
A
 
H
A
 
V
L
 
L
G
 
G
E
 
G
P
 
C
V
 
S
Q
 
T
L
 
A
V
 
L
G
 
F
L
 
P
T
 
A
D
 
G
V
 
G
F
 
S
H
 
T
R
 
G
N
 
S
L
 
L
I
 
L
A
 
M
R
 
A
R
 
L
M
 
L
S
 
G
E
 
D
R
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
P
F
 
F
H
 
R
G
 
V
V
 
I
E
 
P
I
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
S
L
 
T
R
 
R
H
 
E
C
 
S
L
 
F
A
 
T
L
 
V
R
 
N
E
 
E
-
 
S
R
 
R
D
 
T
G
 
A
R
 
K
M
 
Q
T
 
Y
E
 
R
V
 
F
L
 
V
D
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
S
L
 
L
P
 
T
P
 
V
R
 
A
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
E
L
 
L
W
 
R
R
 
G
C
 
A
V
 
A
E
 
A
D
 
S
T
 
A
D
 
A
A
 
F
M
 
V
V
 
V
L
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
Y
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
R
L
 
V
L
 
A
R
 
D
Q
 
I
I
 
C
A
 
R
P
 
R
R
 
S
G
 
S
L
 
T
P
 
P
C
 
L
L
 
I
V
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
G
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
H
A
 
I
A
 
S
D
 
-
A
 
S
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
A
N
 
S
R
 
V
D
 
R
E
 
E
A
 
L
A
 
R
Q
 
E
L
 
C
A
 
V
G
 
G
R
 
S
A
 
E
V
 
L
D
 
L
T
 
T
V
 
E
E
 
P
D
 
E
A
 
Q
A
 
L
V
 
A
V
 
A
A
 
A
R
 
H
A
 
E
L
 
L
H
 
I
A
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
R
A
 
A
-
 
E
F
 
V
P
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
S
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
-
F
 
L
D
 
A
G
 
T
A
 
R
D
 
H
C
 
A
W
 
S
H
 
H
A
 
R
S
 
F
L
 
S
A
 
S
I
 
I
A
 
P
H
 
M
S
 
T
A
 
A
-
 
V
N
 
S
A
 
G
V
 
V
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
F
 
M
L
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
I
A
 
T
V
 
V
A
 
G
L
 
L
R
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
W
E
 
S
P
 
L
A
 
I
Q
x
K
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
N
A
 
A
C
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
M
A
 
L
L
 
L
H
 
T
E
 
P
E
 
G
T
 
T
G
 
A
Y
 
A
V
 
C
Q
 
N
R
 
R
A
 
D
Q
 
D
V
 
V
D
 
E

3julA Crystal structure of listeria innocua d-tagatose-6-phosphate kinase bound with substrate
25% identity, 92% coverage: 1:286/310 of query aligns to 2:279/298 of 3julA

query
sites
3julA
M
 
L
I
 
I
T
 
Y
V
 
T
A
 
I
G
 
T
F
 
L
N
 
N
T
 
P
A
 
A
I
 
I
D
|
D
R
 
R
L
 
L
-
 
L
Y
 
F
T
 
I
L
 
R
D
 
G
A
 
E
L
 
L
E
 
E
P
 
K
G
 
R
A
 
K
V
 
T
Q
 
N
R
 
R
A
 
V
A
 
I
N
 
K
V
 
T
Q
 
E
A
 
F
Y
 
D
P
 
C
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
L
H
|
H
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
T
 
V
I
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
G
 
G
E
 
I
P
 
K
V
 
N
Q
 
E
L
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
A
D
 
G
V
 
S
F
 
D
H
 
N
R
 
L
N
 
D
L
 
K
I
 
L
A
 
Y
R
 
A
R
 
I
M
 
L
S
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
H
V
 
I
L
 
N
F
 
H
H
 
D
G
 
F
-
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
A
A
 
G
G
 
T
E
 
S
L
 
T
R
|
R
H
 
E
C
 
C
L
 
F
A
 
V
L
 
V
R
 
L
E
 
S
R
 
D
D
 
D
G
 
T
R
 
N
-
 
G
M
 
S
T
 
T
E
x
M
V
 
I
L
 
P
D
 
E
P
 
A
G
 
G
P
 
F
L
 
T
L
 
V
P
 
S
P
 
Q
R
 
T
A
 
N
Q
 
K
Q
 
D
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
I
W
 
A
R
 
K
C
 
K
V
 
V
E
 
K
D
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
M
M
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
A
G
|
G
S
 
S
L
 
P
P
 
P
R
 
P
G
 
H
F
 
Y
E
 
T
A
 
L
D
 
S
T
 
D
Y
 
F
A
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
T
I
 
V
A
 
K
P
 
A
R
 
T
G
 
G
L
 
A
P
 
F
C
 
L
L
 
G
V
 
C
D
 
D
A
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
Y
L
 
L
R
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
V
F
 
D
L
 
F
L
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
E
D
 
D
E
 
E
A
 
V
A
 
I
Q
 
A
L
 
I
A
 
L
G
 
D
R
 
E
A
 
K
V
 
T
D
 
N
T
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
E
A
 
N
A
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
I
R
 
R
A
 
T
L
 
L
H
 
-
A
 
A
R
 
E
G
 
K
V
 
I
A
 
P
F
 
Y
P
 
L
V
 
V
I
 
V
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
S
L
 
I
G
 
-
F
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
C
 
C
W
 
A
H
 
H
A
 
N
S
 
G
L
 
-
A
 
K
I
 
L
A
 
Y
H
 
Q
S
 
V
A
 
I
N
 
P
A
 
P
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
G
G
 
A
A
 
F
A
 
I
V
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
M
G
 
N
G
 
M
E
 
P
P
 
I
A
 
T
Q
 
E
A
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
V
G
 
A
V
 
T
A
 
G
C
 
C
G
 
S
A
 
A
A
 
S
N
 
K
A
 
V
L
 
M
H
 
Q
E
 
Q

2ajrA Crystal structure of possible 1-phosphofructokinase (ec 2.7.1.56) (tm0828) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
22% identity, 93% coverage: 1:287/310 of query aligns to 2:298/320 of 2ajrA

query
sites
2ajrA
M
 
M
I
 
V
T
 
L
V
 
T
A
 
V
G
 
T
F
 
L
N
 
N
T
 
P
A
 
A
I
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
E
Y
 
I
T
 
F
L
 
I
D
 
E
A
 
D
L
 
F
E
 
Q
P
 
V
G
 
N
A
 
R
V
 
L
Q
 
Y
R
 
R
A
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
L
A
 
S
N
 
K
V
 
T
Q
 
Q
A
 
M
Y
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
I
H
 
N
V
 
V
A
 
S
Q
 
I
T
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
L
G
 
G
E
 
V
P
 
P
V
 
S
Q
 
V
L
 
A
V
 
T
G
 
G
L
 
F
T
 
V
D
 
G
V
 
G
F
 
Y
H
 
M
R
 
G
N
 
K
L
 
I
I
 
L
A
 
V
R
 
E
R
 
E
M
 
L
S
 
R
E
 
K
R
 
I
G
 
S
V
 
K
L
 
L
F
 
I
-
 
T
-
 
T
H
 
N
G
 
F
V
 
V
E
 
Y
I
 
V
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
T
R
 
R
H
 
E
C
 
N
L
 
I
A
 
E
L
 
I
-
 
I
R
 
D
E
 
E
R
 
K
D
 
N
G
 
K
R
 
T
M
 
I
T
 
T
E
 
A
V
 
I
L
 
N
D
 
F
P
 
P
G
 
G
P
 
P
L
 
D
L
 
V
P
 
T
P
 
D
R
 
M
A
 
D
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
H
L
 
F
L
 
L
D
 
R
T
 
R
L
 
Y
W
 
K
R
 
M
C
 
T
V
 
L
E
 
S
D
 
K
T
 
V
D
 
D
A
 
C
M
 
V
V
 
V
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
P
R
 
P
G
 
G
F
 
V
E
 
N
A
 
E
D
 
G
T
 
I
Y
 
C
A
 
N
A
 
E
L
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
L
I
 
A
A
 
R
P
 
E
R
 
R
G
 
G
L
 
V
P
 
F
C
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
E
A
 
Q
S
 
T
G
 
P
E
 
R
A
 
L
L
 
L
R
 
E
L
 
R
A
 
I
A
 
Y
D
 
E
A
 
G
G
 
P
A
 
E
F
 
F
-
 
P
-
 
N
L
 
V
L
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
D
-
 
L
R
 
R
D
 
G
E
 
N
A
 
H
A
 
A
Q
 
S
L
 
F
A
 
L
G
 
G
R
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
F
E
 
D
D
 
D
A
 
Y
A
 
V
V
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
K
L
 
L
H
 
-
A
 
A
R
 
E
G
 
K
V
 
S
A
 
Q
F
 
V
P
 
S
V
 
V
I
 
V
T
 
S
L
 
Y
G
 
E
A
 
V
R
 
K
G
 
N
A
 
D
L
 
I
G
 
V
F
 
A
D
 
T
G
 
R
A
 
E
D
 
G
C
 
V
W
 
W
H
 
L
A
 
I
-
 
R
S
 
S
L
 
K
A
 
E
I
 
E
A
 
I
H
 
D
S
 
T
A
 
S
N
x
H
A
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
F
 
Y
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
V
V
 
Y
A
 
Y
-
 
F
L
 
I
R
 
K
R
 
H
G
 
G
G
 
A
E
 
N
P
 
F
A
 
L
Q
 
E
A
 
M
L
 
A
R
 
K
L
 
F
G
 
G
V
 
F
A
 
A
C
 
S
G
 
A
A
 
L
A
 
A
N
 
A
A
 
T
L
 
R
H
x
R
E
 
K
E
|
E

6ilsB Structure of arabidopsis thaliana ribokinase complexed with ribose and atp (see paper)
25% identity, 82% coverage: 23:277/310 of query aligns to 26:284/313 of 6ilsB

query
sites
6ilsB
G
 
G
A
 
E
V
 
T
Q
 
I
R
 
S
A
 
A
A
 
K
N
 
T
V
 
G
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
L
P
 
A
G
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
L
 
A
H
x
N
V
 
Q
A
 
A
Q
 
A
T
 
C
I
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
M
E
 
Y
P
 
P
V
 
T
Q
 
Y
L
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
R
L
 
L
T
 
G
D
 
E
V
 
D
F
 
A
H
 
H
R
 
G
N
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
L
S
 
G
E
 
D
R
 
D
G
 
G
V
 
C
L
 
G
F
 
V
H
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
V
G
 
N
V
 
N
E
 
E
I
 
P
A
 
T
G
 
G
E
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
H
C
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
M
R
 
L
E
 
Q
R
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
M
 
N
T
 
S
E
 
I
V
 
I
L
 
I
D
 
V
P
 
G
G
 
G
P
 
A
L
 
N
L
 
M
P
 
-
P
 
-
R
 
K
A
 
A
Q
 
W
Q
 
P
Q
 
E
L
 
I
L
 
M
-
 
S
D
 
D
T
 
D
L
 
D
W
 
L
R
 
E
C
 
I
V
 
V
E
 
R
D
 
N
T
 
A
D
 
G
A
 
I
M
 
V
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
R
S
x
E
L
 
I
P
 
P
R
 
D
G
 
S
F
 
I
E
 
N
A
 
I
D
 
Q
T
 
V
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
K
R
 
K
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
A
G
 
G
L
 
V
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
G
G
 
G
E
 
M
A
 
D
L
 
T
R
 
P
L
 
I
A
 
P
A
 
N
D
 
E
A
 
L
-
 
L
-
 
D
G
 
S
A
 
I
F
 
D
L
 
I
L
 
L
K
 
S
P
 
P
N
|
N
R
 
E
D
 
T
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
A
 
P
V
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
F
E
 
E
D
 
Q
A
 
I
A
 
S
V
 
Q
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
K
L
 
C
H
 
H
A
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
F
 
Q
P
 
V
V
 
L
I
 
V
T
x
K
L
 
L
G
|
G
A
 
S
R
 
K
G
 
G
-
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
F
F
 
I
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
D
 
K
C
 
P
W
 
I
H
 
Q
A
 
Q
S
 
S
L
 
I
-
x
I
A
 
P
I
x
A
A
 
A
H
 
Q
S
 
V
A
 
V
N
 
D
A
 
T
V
 
T
G
 
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
T
F
|
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
A
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
M
R
 
V
R
 
E
G
 
G
G
 
K
E
 
S
P
 
H
A
 
E
Q
 
E
A
 
C
L
 
L
R
 
R
L
 
F
G
 
A
V
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

A1A6H3 Ribokinase; AtRBSK; RK; EC 2.7.1.15 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 80% coverage: 32:280/310 of query aligns to 101:353/379 of A1A6H3

query
sites
A1A6H3
Q
 
Q
A
 
T
Y
 
L
P
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
A
H
 
N
V
 
Q
A
 
A
Q
 
A
T
 
C
I
 
G
A
 
A
A
 
K
L
 
L
G
 
M
E
 
Y
P
 
P
V
 
T
Q
 
Y
L
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
R
L
 
L
T
 
G
D
 
E
V
 
D
F
 
A
H
 
H
R
 
G
N
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
A
M
 
L
S
 
G
E
 
D
R
 
D
G
 
G
V
 
C
L
 
G
F
 
V
H
 
H
-
 
L
-
 
D
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
V
G
 
N
V
 
N
E
 
E
I
 
P
A
 
T
G
 
G
E
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
H
C
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
M
R
 
L
E
 
Q
R
 
S
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
M
 
N
T
 
S
E
 
I
V
 
I
L
 
I
D
 
V
P
 
G
G
 
G
P
 
A
L
 
N
L
 
M
P
 
-
P
 
-
R
 
K
A
 
A
Q
 
W
Q
 
P
Q
 
E
L
 
I
L
 
M
-
 
S
D
 
D
T
 
D
L
 
D
W
 
L
R
 
E
C
 
I
V
 
V
E
 
R
D
 
N
T
 
A
D
 
G
A
 
I
M
 
V
V
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
R
S
 
E
L
 
I
P
 
P
R
 
D
G
 
S
F
 
I
E
 
N
A
 
I
D
 
Q
T
 
V
Y
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
K
R
 
K
Q
 
A
I
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
V
P
 
P
C
 
V
L
 
I
V
 
L
D
 
D
A
 
V
S
 
G
G
 
G
E
 
M
A
 
D
L
 
T
R
 
P
L
 
I
A
 
P
A
 
N
D
 
E
A
 
L
-
 
L
-
 
D
G
 
S
A
 
I
F
 
D
L
 
I
L
 
L
K
 
S
P
 
P
N
 
N
R
 
E
D
 
T
E
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
M
A
 
P
V
 
T
D
 
E
T
 
T
V
 
F
E
 
E
D
 
Q
A
 
I
A
 
S
V
 
Q
V
 
A
A
 
V
R
 
A
A
 
K
L
 
C
H
 
H
A
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
K
F
 
Q
P
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
S
R
 
K
G
 
G
-
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
F
F
 
I
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
D
 
K
C
 
P
W
 
I
H
 
Q
A
 
Q
S
 
S
L
 
I
-
 
I
A
 
P
I
 
A
A
 
A
H
 
Q
S
 
V
A
 
V
N
 
D
A
 
T
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
T
F
 
F
L
 
T
A
 
A
G
 
A
A
 
F
A
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
M
R
 
V
R
 
E
G
 
G
G
 
K
E
 
S
P
 
H
A
 
E
Q
 
E
A
 
C
L
 
L
R
 
R
L
 
F
G
 
A
V
 
A
A
 
A
C
 
A
G
 
A
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3kzhA Crystal structure of a putative sugar kinase from clostridium perfringens
22% identity, 98% coverage: 1:304/310 of query aligns to 13:305/316 of 3kzhA

query
sites
3kzhA
M
 
V
I
 
V
T
 
D
V
 
V
A
 
F
G
 
G
F
 
F
N
 
S
T
 
K
A
 
A
I
 
S
D
 
Y
R
 
R
L
 
P
Y
 
Y
T
 
N
L
 
S
D
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
H
V
 
V
Q
 
K
R
 
I
A
 
S
A
 
F
N
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
G
K
 
V
G
 
C
L
 
R
H
 
N
V
 
I
A
 
A
Q
 
E
T
 
N
I
 
M
A
 
A
A
 
R
L
 
V
G
 
G
E
 
V
P
 
N
V
 
T
Q
 
N
L
 
F
V
 
M
-
 
S
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
H
G
 
G
L
 
K
T
 
S
D
 
I
V
 
V
F
 
E
H
 
H
R
 
S
N
 
K
L
 
K
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
R
 
H
M
 
M
S
 
D
E
 
D
R
 
S
G
 
M
V
 
V
L
 
I
F
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
I
 
E
A
 
G
G
 
G
E
 
S
L
 
T
R
 
P
H
 
T
C
 
Y
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
L
E
 
D
R
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
E
M
 
M
T
 
V
E
 
S
V
 
A
L
 
I
D
 
A
P
 
D
G
 
M
P
 
K
L
 
S
L
 
I
P
 
G
P
 
A
R
 
-
A
 
M
Q
 
N
Q
 
T
Q
 
D
L
 
F
L
 
I
D
 
D
T
 
S
L
 
K
W
 
R
R
 
E
C
 
I
V
 
F
E
 
E
D
 
N
T
 
A
D
 
E
A
 
Y
M
 
T
V
 
V
L
 
L
S
 
D
G
 
S
S
 
D
L
 
N
P
 
P
R
 
E
G
 
I
F
 
M
E
 
E
A
 
Y
D
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
K
Q
 
N
I
 
F
A
 
K
P
 
D
R
 
K
G
 
T
L
 
N
P
 
F
C
 
I
L
 
L
V
x
D
D
 
P
A
x
V
S
 
S
G
 
A
E
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
W
A
 
V
L
 
K
R
 
H
L
 
L
A
 
I
A
 
K
D
 
D
A
 
F
G
 
H
A
 
T
F
 
-
L
 
-
L
 
I
K
|
K
P
 
P
N
 
N
R
 
R
D
 
H
E
|
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
F
A
 
P
V
 
I
D
 
T
T
 
D
V
 
T
E
 
D
D
 
D
A
 
L
A
 
I
V
 
K
V
 
A
A
 
S
R
 
N
A
 
Y
L
 
F
H
 
L
A
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
K
F
 
K
P
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
S
L
 
L
G
 
D
A
 
A
R
 
D
G
 
G
A
 
I
L
 
F
G
 
Y
F
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
V
D
 
S
C
 
C
W
 
G
H
 
K
A
 
I
S
 
K
L
 
A
A
 
T
I
 
E
A
 
V
H
 
D
S
 
V
A
 
K
N
 
N
A
 
V
V
 
T
G
|
G
S
x
A
G
|
G
D
|
D
C
 
S
F
 
F
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
G
V
 
Y
A
 
G
L
 
Y
R
 
M
R
 
N
G
 
K
G
 
M
E
 
P
P
 
I
A
 
E
Q
 
D
A
 
I
L
 
V
R
 
K
L
 
F
G
 
A
V
 
M
A
 
T
C
 
M
G
 
S
A
 
N
A
 
I
N
 
T
A
 
I
L
 
S
H
 
H
E
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
I
Y
 
H
V
 
P
Q
 
D
R
 
M
A
 
A
Q
 
-
V
 
L
D
 
D
A
 
T
L
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
K
V
 
L
R
 
E

7vtfA Cytidine bound structure of pseudouridine kinase (puki) from escherichia coli strain b (see paper)
34% identity, 35% coverage: 181:289/310 of query aligns to 177:285/301 of 7vtfA

query
sites
7vtfA
L
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
R
D
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
I
A
 
A
V
 
L
D
 
S
T
 
G
V
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
A
V
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
W
L
 
F
H
 
H
A
 
Q
R
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
N
F
 
R
P
 
L
V
 
V
I
 
L
T
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
Y
G
 
Y
F
 
S
D
 
D
-
 
I
-
 
R
G
 
G
A
 
E
D
 
N
C
 
G
W
 
W
H
 
S
A
 
A
S
 
P
L
 
I
A
 
K
I
 
-
A
 
T
H
 
N
S
 
V
A
 
I
N
 
N
A
 
V
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
F
 
M
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
S
A
 
C
L
 
W
R
 
V
R
 
D
G
 
G
G
 
M
E
 
P
P
 
F
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
A
V
 
Q
A
 
G
C
 
C
G
 
S
A
 
S
A
 
M
N
 
-
A
 
A
L
 
L
H
 
S
E
 
C
E
 
E
T
 
T
G
 
N

Sites not aligning to the query:

7w93A Crystal structure of e.Coli pseudouridine kinase psuk complexed with n1-methyl-pseudouridine (see paper)
33% identity, 32% coverage: 181:280/310 of query aligns to 183:283/307 of 7w93A

query
sites
7w93A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
R
D
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
I
A
 
A
V
 
L
D
 
S
T
 
G
V
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
A
V
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
W
L
 
F
H
 
H
A
 
Q
R
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
N
F
 
R
P
 
L
V
 
V
I
 
L
T
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
Y
G
 
Y
F
 
S
D
 
D
-
 
I
-
 
R
G
 
G
A
 
E
D
 
N
C
 
G
W
 
W
H
 
S
A
 
A
S
 
P
L
 
I
A
 
K
I
 
-
A
 
T
H
 
N
S
 
V
A
 
I
N
 
N
A
 
V
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
|
D
C
 
A
F
 
M
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
S
A
 
C
L
 
W
R
 
V
R
 
D
G
 
G
G
 
M
E
 
P
P
 
F
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
A
V
 
Q
A
 
G
C
 
C
G
 
S
A
 
S

Sites not aligning to the query:

7vteA Uridine bound structure of pseudouridine kinase (puki) from escherichia coli strain b (see paper)
33% identity, 32% coverage: 181:280/310 of query aligns to 177:277/302 of 7vteA

query
sites
7vteA
L
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
R
 
R
D
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
I
A
 
A
V
 
L
D
 
S
T
 
G
V
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
V
A
 
A
V
 
K
V
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
W
L
 
F
H
 
H
A
 
Q
R
 
H
G
 
G
V
 
L
A
 
N
F
 
R
P
 
L
V
 
V
I
 
L
T
 
S
L
 
M
G
 
G
A
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
Y
G
 
Y
F
 
S
D
 
D
-
 
I
-
 
R
G
 
G
A
 
E
D
 
N
C
 
G
W
 
W
H
 
S
A
 
A
S
 
P
L
 
I
A
 
K
I
 
-
A
 
T
H
 
N
S
 
V
A
 
I
N
 
N
A
 
V
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
D
 
D
C
 
A
F
 
M
L
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
S
A
 
C
L
 
W
R
 
V
R
 
D
G
 
G
G
 
M
E
 
P
P
 
F
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
F
G
 
A
V
 
Q
A
 
G
C
 
C
G
 
S
A
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>N515DRAFT_0917 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_0917
MITVAGFNTAIDRLYTLDALEPGAVQRAANVQAYPGGKGLHVAQTIAALGEPVQLVGLTD
VFHRNLIARRMSERGVLFHGVEIAGELRHCLALRERDGRMTEVLDPGPLLPPRAQQQLLD
TLWRCVEDTDAMVLSGSLPRGFEADTYAALLRQIAPRGLPCLVDASGEALRLAADAGAFL
LKPNRDEAAQLAGRAVDTVEDAAVVARALHARGVAFPVITLGARGALGFDGADCWHASLA
IAHSANAVGSGDCFLAGAAVALRRGGEPAQALRLGVACGAANALHEETGYVQRAQVDALL
AEVRLVRFDG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory