SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_1253 N515DRAFT_1253 2-dehydro-3-deoxy-L-fuconate dehydrogenase (EC 1.1.1.-) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
56% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:244/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
E
A
 
-
E
 
N
A
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
I
R
 
Q
T
 
T
E
 
R
R
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
P
 
K
V
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
S
S
 
E
H
 
I
P
 
E
P
 
K
F
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
C
D
 
E
D
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
K
 
D
R
 
F
S
 
S
F
 
M
A
 
N
I
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
S
M
 
M
F
 
Y
H
 
L
L
 
M
C
 
I
Q
 
K
R
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
K
M
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
E
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
S
 
S
T
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
V
K
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
E
R
 
R
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
R
G
 
D
G
 
D
D
 
P
E
 
K
D
 
E
A
 
A
V
 
L
W
 
-
R
 
K
G
 
A
F
 
F
V
 
L
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
N
 
S
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
P
H
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
56% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:244/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
A
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
E
A
 
S
E
 
Y
A
 
R
P
 
G
E
 
-
L
 
I
R
 
Q
T
 
T
E
 
R
R
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
P
 
K
V
 
R
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
S
S
 
E
H
 
I
P
 
E
P
 
R
F
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
C
D
 
E
D
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
K
 
D
R
 
F
S
 
S
F
 
M
A
 
N
I
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
S
M
 
M
F
 
F
H
 
L
L
 
M
C
 
I
Q
 
K
R
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
K
M
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
E
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
S
 
S
T
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
V
K
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
E
R
 
R
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
R
G
 
D
G
 
N
D
 
P
E
 
K
D
 
E
A
 
A
V
 
L
W
 
-
R
 
K
G
 
T
F
 
F
V
 
L
E
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
N
 
S
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
L
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
V
 
P
H
 
V
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

Q9BUT1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
57% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:244/245 of Q9BUT1

query
sites
Q9BUT1
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
I
L
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
A
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
E
A
 
-
E
 
K
A
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
I
R
 
Q
T
 
T
E
 
R
R
 
V
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
D
 
K
P
 
K
V
 
K
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
x
N
S
 
E
H
 
V
P
 
E
P
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
C
D
 
E
D
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
K
 
D
R
 
F
S
 
S
F
 
M
A
 
N
I
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
S
M
 
M
F
 
Y
H
 
L
L
 
M
C
 
I
Q
 
K
R
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
K
M
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
V
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
 
Y
S
 
S
T
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
K
x
D
T
|
T
P
|
P
S
|
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
E
R
 
R
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
R
G
 
G
G
 
N
D
 
P
E
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
-
W
 
R
R
 
N
G
 
D
F
 
F
V
 
L
E
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
N
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
V
 
P
H
 
V
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

2ag5A Crystal structure of human dhrs6 (see paper)
57% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 2:244/246 of 2ag5A

query
sites
2ag5A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
I
L
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
A
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
E
A
 
-
E
 
K
A
 
Y
P
 
P
E
 
G
L
 
I
R
 
Q
T
 
T
E
 
R
R
 
V
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
P
 
K
V
 
K
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
F
V
 
A
A
 
N
S
 
E
H
 
V
P
 
E
P
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
x
V
A
 
A
G
|
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
H
G
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
C
D
 
E
D
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
K
 
D
R
 
F
S
 
S
F
 
M
A
 
N
I
x
L
N
 
N
V
 
V
D
 
R
S
 
S
M
 
M
F
 
Y
H
 
L
L
 
M
C
 
I
Q
 
K
R
 
A
V
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
K
M
 
M
L
 
L
E
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
V
N
 
N
R
|
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
S
 
S
T
 
T
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
G
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
K
 
D
T
|
T
P
 
P
S
|
S
L
 
L
G
 
Q
D
 
E
R
|
R
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
x
R
G
 
G
G
 
N
D
 
P
E
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
-
W
 
R
R
 
N
G
 
D
F
|
F
V
 
L
E
 
K
R
|
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
A
N
 
T
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
C
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
V
 
P
H
 
V
I
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
W
S
 
S

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 1:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
G
 
G
R
 
I
L
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
K
H
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
H
A
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
D
L
 
I
S
 
K
A
 
A
E
 
Q
A
 
G
P
 
G
E
 
E
L
 
A
R
 
S
T
 
F
E
 
V
R
 
K
L
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
D
 
N
P
 
P
V
 
E
Q
 
E
I
 
V
D
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
K
R
 
R
L
 
T
V
 
V
A
 
E
S
 
I
H
 
Y
P
 
G
P
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
-
V
 
I
H
 
G
A
 
G
G
 
E
T
 
Q
I
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
G
D
 
D
D
 
Y
A
 
G
-
 
L
-
 
D
A
 
S
W
 
W
K
 
R
R
 
K
S
 
V
F
 
L
A
 
S
I
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
D
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
Y
L
 
G
C
 
C
Q
 
K
R
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
Q
M
 
M
L
 
E
E
 
K
R
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
|
M
S
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
-
S
 
H
S
 
G
I
 
I
K
 
V
G
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
L
R
 
S
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
T
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
V
 
I
A
 
G
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
G
 
Q
R
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
T
x
Y
V
x
I
K
 
E
T
 
T
P
 
P
S
x
L
L
 
L
G
 
E
D
 
S
R
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
E
L
 
M
G
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
K
R
 
E
G
 
A
F
 
L
V
 
I
E
 
S
R
 
K
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
N
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
E
L
 
L
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
A
 
S
F
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
G
V
 
Y
H
 
Y
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

7v1qA Leifsonia alcohol dehydrogenases lnadh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:247/248 of query aligns to 6:249/251 of 7v1qA

query
sites
7v1qA
L
 
V
A
 
A
G
 
D
K
 
R
H
 
S
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
G
G
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
V
T
 
T
D
|
D
I
x
L
D
 
N
E
 
E
Q
 
E
A
 
H
L
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
V
S
 
V
A
 
A
E
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
A
A
 
G
P
 
G
E
 
K
L
 
A
R
 
A
T
 
A
E
 
L
R
 
A
L
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
E
Q
 
A
I
 
S
D
 
V
R
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
N
S
 
A
H
 
L
P
 
A
P
 
P
F
 
L
D
 
K
V
 
I
L
 
A
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
G
-
 
G
H
 
E
A
 
A
G
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
G
D
 
D
T
 
Y
D
 
S
D
 
L
A
 
D
A
 
S
W
 
W
K
 
R
R
 
K
S
 
V
F
 
I
A
 
E
I
 
V
N
 
N
V
 
L
D
 
N
S
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
Y
L
 
G
C
 
M
Q
 
Q
R
 
P
V
 
Q
L
 
L
P
 
K
A
 
A
M
 
M
L
 
A
E
 
A
R
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
|
M
S
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
L
S
 
G
S
 
S
I
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
F
P
 
A
N
 
N
R
 
S
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
S
 
V
T
 
T
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
N
V
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
E
F
 
Y
V
 
A
G
 
A
R
 
D
G
 
K
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
V
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
|
G
T
x
F
V
x
I
K
 
R
T
 
T
P
 
P
S
 
L
L
 
V
G
 
E
D
 
A
R
 
N
V
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
E
A
 
A
V
 
L
W
 
-
R
 
-
G
 
A
F
 
F
V
 
L
E
 
E
-
 
G
R
 
K
Q
 
H
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
N
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
S
L
 
L
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
Y
H
 
H
I
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
39% identity, 88% coverage: 29:247/248 of query aligns to 27:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
L
D
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
T
E
 
G
A
 
G
P
 
A
E
 
V
L
 
A
R
 
K
T
 
G
E
 
F
R
 
G
L
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
P
 
A
V
 
A
Q
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
S
 
S
H
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
-
 
G
P
 
S
F
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
G
A
 
F
G
 
G
T
 
S
I
 
V
L
 
H
D
 
D
T
 
A
D
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
K
 
D
R
 
R
S
 
I
F
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
V
 
V
D
 
T
S
 
G
M
 
T
F
 
F
H
 
L
L
 
A
C
 
S
Q
 
K
R
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
G
S
 
L
I
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
T
R
 
M
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
C
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
|
T
V
|
V
K
 
T
T
 
S
P
x
T
S
 
G
L
x
M
G
 
G
D
 
Q
R
 
Q
V
 
L
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
T
D
 
S
-
 
P
A
 
E
V
 
V
W
 
Q
R
 
A
G
 
R
F
x
R
V
 
L
E
 
A
R
 
K
Q
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
N
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
E
L
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
H
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
39% identity, 88% coverage: 29:247/248 of query aligns to 29:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
 
L
D
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
T
E
 
G
A
 
G
P
 
A
E
 
V
L
 
A
R
 
K
T
 
G
E
 
F
R
 
G
L
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
P
 
A
V
 
A
Q
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
S
 
S
H
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
-
 
G
P
 
S
F
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
G
A
 
F
G
 
G
T
 
S
I
 
V
L
 
H
D
 
D
T
 
A
D
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
K
 
D
R
 
R
S
 
I
F
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
T
S
 
G
M
 
T
F
 
F
H
 
L
L
 
A
C
 
S
Q
 
K
R
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
G
S
 
L
I
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
T
R
 
M
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
C
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
|
T
V
|
V
K
x
T
T
x
S
P
x
T
S
x
G
L
 
M
G
 
G
D
 
Q
R
 
Q
V
 
L
R
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
T
D
 
S
-
 
P
A
 
E
V
 
V
W
 
Q
R
 
A
G
 
R
F
x
R
V
 
L
E
 
A
R
x
K
Q
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
N
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
E
L
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
H
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
37% identity, 99% coverage: 2:247/248 of query aligns to 1:258/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
S
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
C
-
 
I
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
W
G
|
G
I
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
R
F
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
V
D
 
D
I
 
R
D
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
M
E
 
D
Q
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
L
L
 
V
S
 
R
A
 
A
E
 
A
A
 
G
P
 
G
E
 
S
L
 
V
R
 
T
T
 
P
E
 
C
R
 
L
L
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
D
P
 
S
V
 
A
Q
 
S
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
D
H
 
S
P
 
V
P
 
A
-
 
R
-
 
C
-
 
G
-
 
R
F
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
A
V
 
P
H
 
S
A
 
P
G
 
G
T
 
G
I
 
P
L
 
V
D
 
A
T
 
L
D
 
D
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
W
 
W
K
 
A
R
 
M
S
 
Q
F
 
L
A
 
E
I
 
L
N
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
T
M
 
A
F
 
F
H
 
L
L
 
M
C
 
C
Q
 
K
R
 
Y
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
V
M
 
M
L
 
E
E
 
Q
R
 
Q
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
T
A
 
S
S
 
G
S
 
I
I
 
R
K
 
W
G
 
T
V
 
G
P
 
A
N
 
A
R
 
Q
F
 
V
A
 
G
Y
|
Y
S
 
A
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
M
I
 
I
G
 
Q
L
 
M
T
 
G
K
 
R
S
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
E
F
 
Y
V
 
A
G
 
A
R
 
K
G
 
N
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
L
V
 
L
K
 
H
T
 
T
P
|
P
S
x
M
L
 
V
G
 
D
D
 
T
R
 
K
V
 
I
R
 
-
A
 
A
L
 
H
G
 
N
G
 
G
D
 
D
E
 
V
D
 
E
A
 
L
V
 
L
W
 
L
R
 
R
G
 
K
F
 
R
V
 
Q
E
 
A
R
 
R
Q
 
I
P
 
P
M
 
M
G
 
P
R
 
F
L
 
M
G
 
G
N
 
D
P
 
G
E
 
R
E
 
D
I
 
T
A
 
A
M
 
N
L
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
R
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
E
H
 
I
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
S
 
S

3lqfA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol- dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD and erythritol (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:247/248 of query aligns to 8:252/254 of 3lqfA

query
sites
3lqfA
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
A
H
 
C
A
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
C
L
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
R
D
 
E
E
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
R
L
 
A
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
L
P
 
G
E
 
A
L
 
A
R
 
V
T
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
P
 
A
V
 
E
Q
 
A
I
 
M
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
A
P
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
F
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
R
A
 
L
G
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
T
W
 
W
K
 
R
R
 
Q
S
 
V
F
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
G
M
 
M
F
 
F
H
 
W
L
 
A
C
 
S
Q
 
R
R
 
A
V
 
F
L
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
L
S
 
G
S
|
S
V
 
M
A
 
S
S
 
G
S
 
T
I
 
I
K
 
V
G
x
N
V
 
R
P
 
P
N
 
-
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
S
 
M
T
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
W
V
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
A
P
|
P
G
 
G
T
x
Y
V
|
V
K
 
A
T
|
T
P
 
-
S
 
E
L
x
M
G
x
T
D
 
L
R
 
K
V
x
M
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
E
E
 
R
D
 
P
A
 
E
V
 
L
W
 
F
R
 
E
G
 
T
F
 
W
V
 
L
E
 
D
R
 
M
Q
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
N
 
E
P
 
P
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
I
H
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

2wsbA Crystal structure of the short-chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:247/248 of query aligns to 8:252/254 of 2wsbA

query
sites
2wsbA
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
A
H
 
C
A
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
C
L
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
R
D
 
E
E
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
R
L
 
A
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
L
P
 
G
E
 
A
L
 
A
R
 
V
T
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
P
 
A
V
 
E
Q
 
A
I
 
M
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
A
P
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
F
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
S
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
R
A
 
L
G
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
T
W
 
W
K
 
R
R
 
Q
S
 
V
F
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
G
M
 
M
F
 
F
H
 
W
L
 
A
C
 
S
Q
 
R
R
 
A
V
 
F
L
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
L
S
 
G
S
|
S
V
x
M
A
 
S
S
 
G
S
 
T
I
 
I
K
 
V
G
x
N
V
 
R
P
 
P
N
 
-
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
S
 
M
T
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
W
V
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
A
P
|
P
G
 
G
T
x
Y
V
|
V
K
 
A
T
|
T
P
 
-
S
 
E
L
x
M
G
x
T
D
 
L
R
 
K
V
 
M
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
E
E
 
R
D
 
P
A
 
E
V
 
L
W
 
F
R
 
E
G
 
T
F
 
W
V
 
L
E
 
D
R
 
M
Q
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
N
 
E
P
 
P
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
I
H
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

2wdzA Crystal structure of the short chain dehydrogenase galactitol-dehydrogenase (gatdh) of rhodobacter sphaeroides in complex with NAD+ and 1,2-pentandiol (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:247/248 of query aligns to 8:252/254 of 2wdzA

query
sites
2wdzA
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
A
H
 
C
A
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
C
L
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
R
D
 
E
E
x
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
x
D
A
 
R
L
 
A
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
L
P
 
G
E
 
A
L
 
A
R
 
V
T
 
A
E
 
A
R
|
R
L
 
I
-
 
V
-
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
P
 
A
V
 
E
Q
 
A
I
 
M
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
A
P
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
F
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
S
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
R
A
 
L
G
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
T
W
 
W
K
 
R
R
 
Q
S
 
V
F
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
G
M
 
M
F
 
F
H
 
W
L
 
A
C
 
S
Q
 
R
R
 
A
V
 
F
L
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
L
S
 
G
S
|
S
V
 
M
A
x
S
S
 
G
S
 
T
I
 
I
K
 
V
G
 
N
V
 
R
P
 
P
N
 
-
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
S
 
M
T
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
W
V
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
Y
V
|
V
K
 
A
T
|
T
P
 
-
S
 
E
L
x
M
G
x
T
D
 
L
R
 
K
V
 
M
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
E
E
 
R
D
 
P
A
 
E
V
 
L
W
 
F
R
 
E
G
 
T
F
 
W
V
 
L
E
 
D
R
 
M
Q
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
N
 
E
P
 
P
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
I
H
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

C0KTJ6 Galactitol 2-dehydrogenase (L-tagatose-forming); Galactitol dehydrogenase; GDH; GatDH; Galactitol:NAD(+) 5-oxidoreductase; EC 1.1.1.406 from Cereibacter sphaeroides (Rhodobacter sphaeroides) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:247/248 of query aligns to 8:252/254 of C0KTJ6

query
sites
C0KTJ6
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
A
H
 
C
A
 
A
L
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
A
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
C
L
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
 
R
D
 
E
E
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
R
L
 
A
S
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
L
P
 
G
E
 
A
L
 
A
R
 
V
T
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
V
-
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
P
 
A
V
 
E
Q
 
A
I
 
M
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
A
P
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
A
P
 
P
F
 
V
D
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
 
S
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
R
A
 
L
G
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
A
 
T
W
 
W
K
 
R
R
 
Q
S
 
V
F
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
D
S
 
G
M
 
M
F
 
F
H
 
W
L
 
A
C
 
S
Q
 
R
R
 
A
V
 
F
L
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
V
E
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
L
S
 
G
S
 
S
V
 
M
A
 
S
S
 
G
S
 
T
I
 
I
K
 
V
G
 
N
V
 
R
P
 
P
N
 
-
R
 
Q
F
 
F
A
 
A
-
 
S
-
 
S
Y
|
Y
S
 
M
T
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
H
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
E
F
 
W
V
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
Y
V
|
V
K
x
A
T
|
T
P
 
-
S
 
E
L
 
M
G
 
T
D
 
L
R
 
K
V
 
M
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
E
E
 
R
D
 
P
A
 
E
V
 
L
W
 
F
R
 
E
G
 
T
F
 
W
V
 
L
E
 
D
R
 
M
Q
 
T
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
C
G
 
G
N
 
E
P
 
P
E
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
M
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
I
H
 
L
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
39% identity, 88% coverage: 29:247/248 of query aligns to 27:246/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
A
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
L
D
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
A
E
 
E
Q
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
A
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
T
E
 
G
A
 
G
P
 
A
E
 
V
L
 
A
R
 
K
T
 
G
E
 
F
R
 
G
L
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
P
 
A
V
 
A
Q
 
D
I
 
I
D
 
T
R
 
A
L
 
A
V
 
I
A
 
T
S
 
S
H
 
A
P
 
E
-
 
Q
-
 
T
-
 
I
-
 
G
P
 
S
F
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
G
A
 
F
G
 
G
T
 
S
I
 
V
L
 
H
D
 
D
T
 
A
D
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
K
 
D
R
 
R
S
 
I
F
 
M
A
 
A
I
x
V
N
|
N
V
 
V
D
 
T
S
 
G
M
 
T
F
 
F
H
 
L
L
 
A
C
 
S
Q
 
K
R
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
A
A
 
G
M
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
G
S
 
L
I
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
T
R
 
M
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
S
 
C
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
K
 
T
T
 
S
P
x
T
S
x
G
L
x
M
G
 
G
D
 
Q
R
 
Q
V
 
L
R
 
L
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
P
E
 
E
D
 
V
A
 
Q
V
 
A
W
 
R
R
 
R
G
 
-
F
 
-
V
 
L
E
 
A
R
 
K
Q
 
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
N
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
M
 
E
L
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
A
H
 
F
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 3:245/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
|
G
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
S
E
 
D
Q
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
I
S
 
E
A
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
G
E
 
K
L
 
A
R
 
V
T
 
F
E
 
Q
R
 
H
L
 
A
D
|
D
V
x
T
T
 
A
D
 
H
P
 
P
V
 
E
Q
 
D
I
 
H
D
 
D
R
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
A
H
 
A
P
 
K
P
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
V
 
S
H
x
G
A
 
E
G
 
F
T
 
T
-
 
P
I
 
T
L
 
A
D
 
E
T
 
T
D
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
W
 
W
K
 
Q
R
|
R
S
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
S
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
Y
L
 
G
C
 
V
Q
 
R
R
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
S
 
G
S
 
Q
I
 
I
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
E
N
 
G
R
x
I
F
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
W
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
G
 
S
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
|
R
C
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
T
 
F
V
x
I
K
 
N
T
|
T
P
 
T
S
 
L
L
 
V
G
 
Q
D
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
L
R
 
E
V
 
T
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
R
G
 
Q
F
 
L
V
 
E
E
 
Q
R
 
M
Q
 
H
P
 
A
M
x
L
G
x
R
R
|
R
L
 
L
G
 
G
N
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
Y
H
 
Y
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 3:245/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
|
G
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
S
E
 
D
Q
 
E
-
x
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
I
S
 
E
A
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
G
E
 
K
L
 
A
R
 
V
T
 
F
E
 
Q
R
 
H
L
 
A
D
|
D
V
x
T
T
 
A
D
 
H
P
 
P
V
 
E
Q
 
D
I
 
H
D
 
D
R
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
A
H
 
A
P
 
K
P
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
V
x
S
H
x
G
A
x
E
G
 
F
T
|
T
-
 
P
I
 
T
L
 
A
D
x
E
T
 
T
D
x
T
D
 
D
A
 
A
A
x
Q
W
 
W
K
 
Q
R
|
R
S
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
S
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
Y
L
 
G
C
 
V
Q
 
R
R
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
S
 
G
S
 
Q
I
 
I
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
E
N
 
G
R
x
I
F
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
W
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
G
x
S
R
 
K
G
|
G
I
 
I
R
 
R
C
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
 
A
T
 
F
V
x
I
K
 
N
T
|
T
P
 
T
S
 
L
L
 
V
G
 
Q
D
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
L
R
 
E
V
 
T
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
R
G
 
Q
F
 
L
V
 
E
E
 
Q
R
 
M
Q
 
H
P
 
A
M
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
N
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
x
S
V
x
Y
H
 
Y
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 3:245/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
A
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
T
T
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
S
E
 
D
Q
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
R
-
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
L
L
 
I
S
 
E
A
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
G
E
 
K
L
 
A
R
 
V
T
 
F
E
 
Q
R
 
H
L
 
A
D
 
D
V
 
T
T
 
A
D
 
H
P
 
P
V
 
E
Q
 
D
I
 
H
D
 
D
R
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
S
 
A
H
 
A
P
 
K
P
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
R
F
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
Y
 
I
V
 
S
H
 
G
A
 
E
G
 
F
T
 
T
-
 
P
I
 
T
L
 
A
D
 
E
T
 
T
D
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
W
 
W
K
 
Q
R
 
R
S
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
S
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
Y
L
 
G
C
 
V
Q
 
R
R
 
A
V
 
Q
L
 
I
P
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
L
E
 
E
R
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
S
 
G
S
 
Q
I
 
I
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
E
N
 
G
R
x
I
F
 
T
A
 
P
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
W
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
G
 
S
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
T
 
F
V
 
I
K
 
N
T
 
T
P
 
T
S
 
L
L
 
V
G
 
Q
D
 
N
-
 
V
-
 
P
-
 
L
R
 
E
V
 
T
R
 
R
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
R
G
 
Q
F
 
L
V
 
E
E
 
Q
R
 
M
Q
 
H
P
 
A
M
 
L
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
N
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
M
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
S
F
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
S
V
 
Y
H
 
Y
I
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:245/248 of query aligns to 1:237/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
M
 
M
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
x
I
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
A
 
G
A
 
G
G
 
A
A
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
A
A
 
S
T
 
H
A
 
V
L
 
R
A
 
A
F
 
M
A
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
F
T
 
G
D
|
D
I
 
I
-
 
L
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
L
 
K
A
 
A
A
x
V
L
 
A
S
 
A
A
 
E
E
 
L
A
 
A
P
 
D
E
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
Y
E
 
V
R
 
H
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
P
 
P
V
 
A
Q
 
Q
-
 
W
-
x
T
-
 
A
-
 
A
I
 
V
D
 
D
R
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
T
S
 
A
H
 
F
P
 
G
P
 
G
F
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
L
H
 
N
A
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
E
D
 
D
T
 
Y
D
 
A
D
 
L
A
 
T
A
 
E
W
 
W
K
 
Q
R
 
R
S
 
I
F
 
L
A
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
L
L
 
G
C
 
I
Q
 
R
R
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
K
A
 
P
M
 
M
L
 
K
E
 
E
R
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
-
S
 
E
S
 
G
I
 
L
K
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
V
N
 
A
R
 
C
F
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
T
A
 
A
A
 
L
D
 
E
F
 
L
V
 
G
G
 
P
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
C
 
H
P
|
P
G
|
G
T
x
L
V
|
V
K
|
K
T
|
T
P
|
P
S
 
-
L
x
M
G
x
T
D
 
D
R
 
W
V
 
V
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
P
E
 
E
D
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
I
E
 
F
R
 
Q
Q
 
T
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
N
 
E
P
 
P
E
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
S
M
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
E
H
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:245/248 of query aligns to 1:236/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
A
 
G
A
 
G
G
 
A
A
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
A
A
 
S
T
 
H
A
 
V
L
 
R
A
 
A
F
 
M
A
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
F
T
 
G
D
|
D
I
 
I
-
x
L
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
L
 
K
A
 
A
A
 
M
L
 
A
S
 
A
A
 
E
E
 
L
A
 
A
P
 
D
E
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
Y
E
 
V
R
 
H
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
P
 
P
V
 
A
Q
 
Q
-
 
W
-
 
K
-
 
A
-
 
A
I
 
V
D
 
D
R
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
T
S
 
A
H
 
F
P
 
G
P
 
G
F
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
x
L
H
 
N
A
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
E
D
 
D
T
 
Y
D
 
A
D
 
L
A
 
T
A
 
E
W
 
W
K
 
Q
R
 
R
S
 
I
F
 
L
A
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
L
L
 
G
C
 
I
Q
 
R
R
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
K
A
 
P
M
 
M
L
 
K
E
 
E
R
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
-
S
x
E
S
 
G
I
 
L
K
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
V
N
 
A
R
x
C
F
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
T
A
 
A
A
 
L
D
 
E
F
 
L
V
 
G
G
 
P
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
C
 
H
P
|
P
G
 
G
T
 
L
V
|
V
K
 
K
T
|
T
P
|
P
S
 
-
L
x
M
G
x
T
D
 
D
R
 
W
V
|
V
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
P
E
 
E
D
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
V
x
I
E
x
F
R
 
Q
Q
 
T
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
N
 
E
P
 
P
E
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
S
M
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
E
H
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:245/248 of query aligns to 1:236/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
S
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
K
 
K
H
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
A
x
G
A
 
G
G
 
A
A
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
A
A
 
S
T
 
H
A
 
V
L
 
R
A
 
A
F
 
M
A
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
F
T
 
G
D
|
D
I
|
I
-
x
L
D
 
D
E
 
E
Q
 
E
A
 
G
L
 
K
A
 
A
A
 
M
L
 
A
S
 
A
A
 
E
E
 
L
A
 
A
P
 
D
E
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
Y
E
 
V
R
 
H
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
P
 
P
V
 
A
Q
 
Q
-
 
W
-
 
K
-
 
A
-
 
A
I
 
V
D
 
D
R
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
T
S
 
A
H
 
F
P
 
G
P
 
G
F
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
x
I
V
 
L
H
 
N
A
 
I
G
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
E
D
 
D
T
 
Y
D
 
A
D
 
L
A
 
T
A
 
E
W
 
W
K
 
Q
R
 
R
S
 
I
F
 
L
A
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
L
D
 
T
S
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
L
L
 
G
C
 
I
Q
 
R
R
 
A
V
 
V
L
 
V
P
 
K
A
 
P
M
 
M
L
 
K
E
 
E
R
 
A
G
 
G
G
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
-
S
 
E
S
 
G
I
 
L
K
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
V
N
 
A
R
 
C
F
 
H
A
 
G
Y
|
Y
S
 
T
T
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
I
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
T
A
 
A
A
 
L
D
 
E
F
 
L
V
 
G
G
 
P
R
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
C
 
H
P
|
P
G
 
G
T
 
L
V
|
V
K
 
K
T
|
T
P
|
P
S
 
-
L
x
M
G
x
T
D
 
D
R
 
W
V
 
V
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
P
E
 
E
D
 
D
A
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
I
E
 
F
R
 
Q
Q
 
T
P
 
A
M
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
A
N
 
E
P
 
P
E
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
S
M
 
N
L
 
L
A
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
S
F
 
Y
T
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
A
V
 
E
H
 
F
I
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>N515DRAFT_1253 N515DRAFT_1253 2-dehydro-3-deoxy-L-fuconate dehydrogenase (EC 1.1.1.-)
MSGRLAGKHALVTAAGAGIGRATALAFAREGARVLATDIDEQALAALSAEAPELRTERLD
VTDPVQIDRLVASHPPFDVLFNCAGYVHAGTILDTDDAAWKRSFAINVDSMFHLCQRVLP
AMLERGGGSIVNMSSVASSIKGVPNRFAYSTTKAAVIGLTKSVAADFVGRGIRCNAICPG
TVKTPSLGDRVRALGGDEDAVWRGFVERQPMGRLGNPEEIAMLALYLASDEAAFTTGTVH
IVDGGWSN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory