SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_1376 N515DRAFT_1376 triosephosphate isomerase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
54% identity, 100% coverage: 1:248/249 of query aligns to 1:249/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
K
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
H
A
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
S
D
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
K
G
 
E
M
 
L
P
 
A
-
 
G
-
 
V
A
 
A
S
 
G
V
 
C
D
 
A
A
 
V
V
 
A
V
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
E
P
 
M
Y
 
Y
I
 
I
A
 
D
E
 
M
L
 
A
A
 
K
A
 
R
Q
 
E
H
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
H
L
 
I
G
 
M
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
-
E
 
D
H
 
L
E
 
N
G
 
L
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
W
 
Y
T
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
H
 
H
H
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
L
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
K
L
 
T
N
 
Q
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
F
D
 
E
T
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
V
H
 
H
G
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
K
E
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
Q
T
 
V
R
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
K
S
 
A
A
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
54% identity, 100% coverage: 1:248/249 of query aligns to 1:249/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
K
 
H
K
 
P
L
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
H
M
 
M
A
 
V
A
 
H
A
 
E
L
 
L
A
 
V
S
 
S
D
 
N
I
 
L
A
 
R
A
 
K
G
 
E
M
 
L
P
 
A
-
 
G
-
 
V
A
 
A
S
 
G
V
 
C
D
 
A
A
 
V
V
 
A
V
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
E
P
 
M
Y
 
Y
I
 
I
A
 
D
E
 
M
L
 
A
A
 
K
A
 
R
Q
 
E
H
 
A
A
 
E
G
 
G
S
 
S
G
 
H
L
 
I
G
 
M
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
-
E
 
D
H
 
L
E
 
N
G
 
L
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
W
 
Y
T
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
Y
H
 
H
H
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
L
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
K
L
 
T
N
 
Q
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
F
D
 
E
T
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
V
H
 
H
G
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
K
E
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
N
I
 
I
A
 
A
R
 
E
L
 
Q
T
 
V
R
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
K
S
 
A
A
 
D
D
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
50% identity, 95% coverage: 1:236/249 of query aligns to 1:239/256 of P50921

query
sites
P50921
M
 
M
R
 
R
K
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
K
S
 
E
M
 
M
A
 
V
A
 
V
A
 
D
L
 
L
A
 
L
S
 
N
D
 
G
I
 
L
A
 
N
A
 
A
G
 
E
M
 
L
P
 
E
-
 
G
-
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
A
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
P
 
V
Y
 
D
I
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
A
 
T
A
 
L
Q
 
T
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
A
L
 
I
G
 
I
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
-
S
 
T
E
 
D
H
 
L
E
 
N
G
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
S
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
E
V
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
H
T
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
H
 
H
H
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
F
A
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
A
 
A
Q
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
T
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
E
S
 
A
F
 
L
D
 
E
T
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
V
 
I
H
 
H
G
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
A
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
E
E
 
K
D
 
S
A
 
E
M
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
N
T
 
V
R
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
x
A
L
 
L

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
50% identity, 94% coverage: 2:236/249 of query aligns to 1:238/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
K
 
H
K
 
P
L
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
K
S
 
E
M
 
M
A
 
V
A
 
V
A
 
D
L
 
L
A
 
L
S
 
N
D
 
G
I
 
L
A
 
N
A
 
A
G
 
E
M
 
L
P
 
E
-
 
G
-
 
V
A
 
T
S
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
V
V
 
A
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
-
 
A
-
 
L
F
 
F
P
 
V
Y
 
D
I
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
R
A
 
T
A
 
L
Q
 
T
H
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
A
L
 
I
G
 
I
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
-
S
 
T
E
 
D
H
 
L
E
 
N
G
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
S
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
E
V
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
H
T
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
H
 
H
H
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
F
A
 
L
R
 
K
A
 
E
G
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
A
 
A
Q
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
M
A
 
A
V
 
V
I
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
D
A
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
N
L
 
T
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
E
S
 
A
F
 
L
D
 
E
T
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
R
V
 
I
H
 
H
G
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
A
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
R
 
E
E
 
K
D
 
S
A
 
E
M
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
N
T
 
V
R
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
A
L
 
L

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
49% identity, 99% coverage: 2:248/249 of query aligns to 2:249/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
K
 
K
K
 
K
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
T
S
 
T
R
 
L
S
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
S
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
K
G
 
G
M
 
V
P
 
T
A
 
D
S
 
D
-
 
R
V
 
V
D
 
T
A
 
V
V
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
Y
 
W
I
 
L
A
 
T
E
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
V
H
 
L
A
 
K
G
 
G
S
 
S
G
 
P
L
 
V
G
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
S
 
S
E
 
S
H
 
-
E
 
E
G
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
L
Q
 
L
D
 
E
V
 
T
G
 
G
A
 
C
Q
 
K
W
 
Y
T
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
I
H
 
I
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
E
E
 
T
L
 
F
V
 
I
A
 
N
R
 
H
K
 
K
F
 
V
A
 
H
A
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
E
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
E
 
L
T
 
Q
E
 
E
A
 
R
V
 
V
I
 
F
A
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
V
L
 
Y
A
 
A
V
 
A
L
 
C
A
 
A
L
 
G
N
 
L
G
 
T
V
 
D
A
 
E
S
 
Q
F
 
F
D
 
G
T
 
R
A
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
A
H
 
H
G
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
S
 
S
Q
 
K
L
 
L
-
 
R
A
 
L
R
 
L
E
 
Y
D
 
G
A
 
D
M
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
S
T
 
T
R
 
P
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
T
A
 
V
E
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
K
S
 
A
A
 
D
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
I
 
I
C
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
46% identity, 96% coverage: 2:239/249 of query aligns to 402:641/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
K
 
K
K
 
L
L
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
S
 
T
R
 
I
S
 
S
M
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
K
L
 
F
A
 
V
S
 
S
D
 
L
I
 
L
A
 
V
A
 
N
G
 
E
M
 
L
-
 
H
-
 
D
P
 
V
A
 
K
S
 
E
V
 
F
D
 
E
A
 
I
V
 
V
V
 
V
F
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
T
Y
 
A
I
 
L
A
 
S
E
 
E
L
 
V
A
 
G
A
 
E
Q
 
I
H
 
L
A
 
S
G
 
G
S
 
R
G
 
N
L
 
I
G
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
S
 
F
E
 
-
H
 
Y
E
 
E
G
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
L
M
 
M
L
 
L
Q
 
Q
D
 
E
V
 
I
G
 
G
A
 
V
Q
 
E
W
 
Y
T
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
Y
 
I
H
 
F
H
 
K
E
 
E
S
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
I
A
 
N
R
 
R
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
L
A
 
E
G
 
K
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
E
 
L
T
 
T
E
 
F
A
 
C
V
 
V
I
 
V
A
 
E
R
 
K
Q
 
Q
L
 
V
L
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
F
A
 
Y
S
 
G
F
 
L
D
 
D
T
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
G
 
A
F
 
F
I
 
I
R
 
R
S
 
K
Q
 
L
L
 
L
A
 
S
R
 
E
-
 
M
E
 
Y
D
 
D
A
 
E
M
 
E
I
 
T
A
 
A
R
 
G
L
 
S
T
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
F
A
 
L
E
 
G
L
 
L
F
 
I
A
 
V
Q
 
Q
A
 
K
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
K
S
 
E
A
 
S

Sites not aligning to the query:

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
46% identity, 99% coverage: 1:247/249 of query aligns to 1:249/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
K
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
H
|
H
G
x
K
S
 
T
R
 
L
S
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
Q
L
 
F
A
 
V
S
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
K
A
 
G
G
 
H
M
 
V
P
 
P
A
 
P
S
 
A
-
 
D
-
 
E
V
 
V
D
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
F
P
 
L
Y
 
F
I
 
L
A
 
D
E
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
Q
Q
 
A
H
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
S
 
-
E
 
H
H
 
F
E
 
A
G
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
T
W
 
Y
T
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
M
H
 
F
H
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
F
A
 
T
G
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
E
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
E
A
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
G
N
 
L
G
 
T
V
 
P
A
 
E
S
 
Q
F
 
V
D
 
K
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
Q
 
S
V
 
V
H
 
C
G
 
G
F
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
S
Q
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
L
-
 
F
D
 
G
A
 
P
M
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
E
L
 
A
T
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
I
A
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
D
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
C
 
V
A
 
E
A
 
A

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 1:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
R
 
R
K
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
S
 
T
R
 
L
S
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
Q
L
 
F
A
 
V
S
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
K
A
 
G
G
 
H
M
 
V
P
 
P
A
 
P
S
 
A
-
 
D
-
 
E
V
 
V
D
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
F
P
 
L
Y
 
F
I
 
L
A
 
D
E
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
Q
Q
 
A
H
 
A
A
 
D
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
S
 
-
E
 
H
H
 
F
E
 
A
G
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
T
W
 
Y
T
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
M
H
 
F
H
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
F
A
 
T
G
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
E
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
L
 
V
L
 
E
A
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
G
N
 
L
G
 
T
V
 
P
A
 
E
S
 
Q
F
 
V
D
 
K
T
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
Q
 
S
V
 
V
H
 
C
G
 
G
F
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
S
Q
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
L
-
 
F
D
 
G
A
 
P
M
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
E
L
 
A
T
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
I
A
 
R
E
 
D
L
 
F
F
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
Q
D
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
Q
I
 
L
C
 
V
A
 
E
A
 
A

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
T
R
 
L
S
 
E
M
 
S
A
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
S
 
E
D
 
T
I
 
L
-
 
N
A
 
S
A
 
A
G
 
Q
M
 
L
P
 
D
A
 
P
S
 
N
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
A
P
 
I
Y
 
Y
I
 
L
A
 
P
E
 
F
L
 
A
A
 
R
A
 
S
Q
 
K
-
 
L
H
 
K
A
 
K
G
 
P
S
 
K
G
 
E
L
 
I
G
 
Q
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
-
H
 
T
E
 
K
G
 
P
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
M
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
P
W
 
W
T
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
Y
 
I
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
Y
A
 
A
R
 
L
A
 
D
G
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
M
A
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
L
 
L
A
 
K
V
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
-
N
 
D
G
 
K
V
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
G
 
A
F
 
A
I
 
L
R
 
R
S
 
K
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
R
 
E
E
 
N
-
 
V
D
 
S
A
 
P
M
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
K
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
K
S
 
A
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 8:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
R
S
 
D
M
 
D
A
 
N
A
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
L
S
 
K
D
 
L
I
 
L
A
 
S
-
 
E
A
 
A
G
 
H
M
 
F
P
 
D
A
 
D
S
 
N
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
L
V
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
S
P
 
V
Y
 
F
I
 
L
A
 
H
E
 
E
L
 
I
A
 
R
A
 
-
Q
 
K
H
 
S
A
 
L
G
 
K
S
 
K
G
 
E
L
 
I
G
 
H
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
-
E
 
V
G
 
S
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
I
Q
 
R
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
C
Q
 
D
W
 
W
T
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
Y
 
I
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
E
 
K
T
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
-
A
 
-
L
 
A
N
 
N
G
 
K
V
 
I
A
 
K
S
 
S
F
 
A
D
 
D
T
 
E
-
 
W
-
 
K
-
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
G
 
N
F
 
F
I
 
L
R
 
R
S
 
K
Q
 
W
L
 
F
A
 
K
R
 
T
E
 
N
D
 
A
A
 
P
M
 
N
-
 
G
I
 
V
A
 
D
R
 
E
L
 
K
T
 
I
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
H
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
T
A
 
E
I
 
I
C
 
C
A
 
K
A
 
A

1htiB Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. Triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme (see paper)
46% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 4:248/248 of 1htiB

query
sites
1htiB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
-
 
Q
S
 
S
M
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
G
S
 
T
D
 
L
I
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
K
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
G
 
G
F
 
W
I
 
L
R
 
K
S
 
S
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
46% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 5:249/249 of P60174

query
sites
P60174
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
-
 
Q
S
 
S
M
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
G
S
 
T
D
 
L
I
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
K
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
|
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
x
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
G
 
G
F
 
W
I
 
L
R
 
K
S
 
S
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
|
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
45% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 2:246/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
S
 
K
M
 
N
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
I
S
 
T
D
 
T
I
 
L
-
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
K
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
S
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
G
 
G
F
 
W
I
 
L
R
 
K
S
 
S
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 3:247/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
S
 
K
M
 
N
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
I
S
 
T
D
 
T
I
 
L
-
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
K
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
|
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
S
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
|
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
G
 
G
F
 
W
I
 
L
R
 
K
S
 
S
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

P17751 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
45% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 5:249/249 of P17751

query
sites
P17751
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
S
 
K
M
 
C
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
I
S
 
C
D
 
T
I
 
L
-
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
N
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
G
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
S
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
x
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
G
 
E
F
 
K
I
 
L
R
 
R
S
 
G
Q
 
W
L
|
L
A
 
K
R
 
S
E
 
N
-
 
V
D
 
N
A
 
D
M
 
G
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

4pocB Structure of triosephosphate isomerase wild type human enzyme. (see paper)
46% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 3:247/247 of 4pocB

query
sites
4pocB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
-
 
Q
S
 
S
M
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
G
S
 
T
D
 
L
I
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
K
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
G
 
E
F
 
K
I
 
L
R
 
R
S
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
R
 
S
E
 
N
-
 
V
-
 
S
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
45% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 5:249/249 of P00939

query
sites
P00939
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
x
N
G
 
G
S
 
R
R
 
K
S
 
K
M
 
N
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
I
S
 
T
D
 
T
I
 
L
-
 
N
A
 
A
A
 
A
G
 
K
M
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
Y
 
Y
I
 
I
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
P
G
 
K
L
 
I
G
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
T
G
 
-
Q
x
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
G
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
W
 
W
T
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
S
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
-
L
 
T
A
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
D
N
 
N
G
 
-
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
G
 
G
F
 
W
I
 
L
R
 
K
S
 
S
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
R
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
Q

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:244/249 of query aligns to 1:246/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
K
 
K
K
 
P
L
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
R
 
L
S
 
G
M
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
S
L
 
F
A
 
V
S
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
K
A
 
S
G
 
S
M
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
A
-
 
D
-
 
K
V
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
L
Y
 
F
I
 
L
A
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
A
H
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
T
G
 
D
L
 
L
G
 
K
F
 
V
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
M
S
 
-
E
 
H
H
 
F
E
 
E
G
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
V
M
 
A
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
W
 
Y
T
 
C
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
Y
 
M
H
 
F
H
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
A
R
 
F
A
 
K
G
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
N
A
 
D
V
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
D
Q
 
Q
L
 
V
L
 
K
A
 
K
V
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
G
N
 
L
G
 
S
V
 
E
A
 
E
S
 
Q
F
 
V
D
 
A
T
 
A
A
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
A
E
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
Q
 
D
V
 
V
H
 
C
G
 
A
F
 
H
I
 
I
R
 
R
S
 
K
Q
 
T
L
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
S
D
 
F
A
 
S
M
 
Q
-
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
D
L
 
K
T
 
L
R
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
E
S
 
P
A
 
Q
D
 
S
F
 
F
L
 
V
A
 
Q
I
 
L

P00940 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Gallus gallus (Chicken) (see 3 papers)
44% identity, 100% coverage: 2:249/249 of query aligns to 4:248/248 of P00940

query
sites
P00940
R
 
R
K
 
K
K
 
F
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
-
 
D
S
 
K
R
 
K
S
 
S
M
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
H
S
 
T
D
 
L
I
 
N
A
 
G
A
 
A
G
 
K
M
 
L
P
 
S
A
 
A
S
 
D
V
 
T
D
 
E
A
 
V
V
 
V
V
 
C
F
 
G
P
 
A
P
 
P
F
 
S
P
 
I
Y
 
Y
I
 
L
A
 
-
E
 
D
L
 
F
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
H
 
K
A
 
L
G
 
D
S
 
A
G
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
V
E
 
P
G
 
-
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
S
 
A
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
W
 
W
T
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
V
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
D
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
I
T
 
T
E
 
E
A
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
L
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
-
A
 
-
L
 
A
N
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
K
S
 
D
F
 
W
D
 
S
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
G
 
G
F
 
W
I
 
L
R
 
K
S
 
S
Q
 
H
L
 
V
A
 
S
R
 
-
E
 
-
D
 
D
A
 
A
M
 
-
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
S
T
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
A
 
G
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
Q
 
Q
A
 
H
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
E
F
 
F
L
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A
A
 
K
H
 
H

Sites not aligning to the query:

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
44% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 5:250/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
R
 
R
K
 
K
K
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
S
R
 
Y
S
 
S
M
 
H
A
 
I
A
 
N
A
 
T
L
 
F
A
 
F
S
 
D
D
 
T
I
 
L
-
 
Q
A
 
K
A
 
A
G
 
D
M
 
T
P
 
D
A
 
P
S
 
N
V
 
A
D
 
D
A
 
I
V
 
V
V
 
I
F
 
G
P
 
V
P
 
P
F
 
A
P
 
C
Y
 
Y
I
 
L
A
 
-
E
 
K
L
 
Y
A
 
A
A
 
Q
Q
 
D
H
 
K
A
 
A
G
 
P
S
 
K
G
 
G
L
 
I
G
 
K
F
 
I
G
 
A
G
 
A
Q
 
E
D
 
N
V
 
C
S
 
Y
E
 
K
H
 
-
E
 
V
G
 
G
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
T
S
 
E
M
 
M
L
 
I
Q
 
K
D
 
D
V
 
C
G
 
G
A
 
C
Q
 
E
W
 
W
T
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
Y
 
I
H
 
F
H
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
G
R
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
H
A
 
A
R
 
L
A
 
D
G
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
V
V
 
I
L
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
E
 
N
A
 
D
V
 
V
I
 
C
A
 
F
R
 
A
Q
 
Q
L
 
M
L
 
D
A
 
A
V
 
I
L
 
A
A
 
K
-
 
N
L
 
V
N
 
P
G
 
S
V
 
K
A
 
E
S
 
A
F
 
W
D
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
E
V
 
V
H
 
H
G
 
K
F
 
V
I
 
V
R
 
R
S
 
D
Q
 
W
L
 
I
A
 
R
R
 
K
E
 
H
-
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
D
L
 
K
T
 
V
R
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
K
E
 
D
L
 
L
F
 
G
A
 
T
Q
 
Q
A
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
C
 
S
L
 
L
T
 
-
S
 
K
A
 
P
D
 
D
F
 
F
L
 
I
A
 
T
I
 
I
C
 
I
A
 
N
A
 
A

Query Sequence

>N515DRAFT_1376 N515DRAFT_1376 triosephosphate isomerase
MRKKLVAGNWKMHGSRSMAAALASDIAAGMPASVDAVVFPPFPYIAELAAQHAGSGLGFG
GQDVSEHEGQGAYTGEVSASMLQDVGAQWTLVGHSERRQYHHESDELVARKFAAARAGGL
TPVLCVGETLAQREAGETEAVIARQLLAVLALNGVASFDTAVIAYEPVWAIGTGRTATPE
QAQQVHGFIRSQLAREDAMIARLTRLLYGGSVKPANAAELFAQADVDGGLVGGACLTSAD
FLAICAAAH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory