SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_1539 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_1539 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

6b2wA C. Jejuni c315s agmatine deiminase with substrate bound (see paper)
32% identity, 96% coverage: 3:333/345 of query aligns to 8:322/333 of 6b2wA

query
sites
6b2wA
H
 
H
A
 
M
T
 
I
L
 
K
R
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
-
E
 
E
W
 
W
E
 
S
P
 
E
Q
 
Q
S
 
E
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
I
 
L
A
 
S
W
 
L
P
 
P
H
 
H
A
 
E
D
 
K
T
 
S
D
 
D
W
 
W
A
 
N
D
 
P
R
 
Y
L
 
L
A
 
E
E
 
E
V
 
I
E
 
L
T
 
Q
T
 
S
Y
 
Y
V
 
K
A
 
E
L
 
F
A
 
V
A
 
K
A
 
V
V
 
V
T
 
S
R
 
E
F
 
F
E
 
Q
P
 
K
L
 
V
I
 
L
V
 
L
V
 
I
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
P
L
 
K
R
 
Q
A
 
S
H
 
D
V
 
F
E
 
E
G
 
N
K
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
F
V
 
K
D
 
D
L
 
I
G
 
K
R
 
N
V
 
V
R
 
E
L
 
F
I
 
F
E
 
K
L
 
C
P
 
D
Y
 
T
D
 
N
D
 
D
T
 
T
W
|
W
L
 
I
R
 
R
D
|
D
S
 
F
G
 
G
P
 
A
I
 
I
T
 
D
L
 
I
K
 
V
D
 
E
D
 
N
R
 
-
G
 
G
A
 
R
F
 
L
Q
 
K
L
 
A
T
 
L
D
 
D
F
 
F
R
 
T
F
 
F
T
 
N
G
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
N
K
 
K
F
|
F
G
 
Q
A
 
S
E
 
E
Q
 
L
D
 
D
D
 
N
A
 
A
L
 
V
V
 
N
A
 
S
G
 
K
L
 
L
V
 
F
K
 
K
A
 
E
G
 
K
V
 
F
F
 
-
G
 
-
R
 
K
A
 
E
A
 
E
H
 
L
R
 
K
R
 
K
I
 
V
D
 
D
W
 
F
A
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
I
 
I
E
 
D
S
 
F
D
 
N
G
 
G
A
 
E
G
 
G
T
 
V
V
 
M
L
 
L
T
 
T
T
 
S
W
 
S
R
 
H
C
 
C
L
 
L
V
 
L
Q
 
N
-
 
E
-
 
N
R
 
R
H
 
N
P
 
S
E
 
H
Q
 
L
S
 
N
R
 
K
E
 
T
E
 
Q
M
 
I
S
 
D
A
 
T
I
 
K
L
 
L
R
 
K
D
 
E
G
 
I
L
 
F
H
 
G
A
 
L
S
 
K
R
 
Q
I
 
I
L
 
I
W
 
W
L
 
L
D
 
E
Y
 
N
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
E
 
K
G
 
G
D
 
D
D
|
D
T
|
T
D
 
D
A
 
H
H
|
H
I
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
A
 
I
P
 
D
D
 
K
G
 
N
R
 
T
I
 
I
V
 
A
F
 
H
Q
 
C
A
 
I
C
 
C
D
 
E
D
 
D
L
 
E
D
 
E
D
 
D
A
 
E
H
 
H
H
 
Y
D
 
L
E
 
P
L
 
L
S
 
Q
R
 
K
M
 
M
A
 
K
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
K
A
 
K
L
 
-
C
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
T
P
 
G
Y
 
F
E
 
D
L
 
L
Y
 
L
P
 
E
L
 
L
P
 
P
W
 
I
A
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
Y
D
 
Y
E
 
E
G
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
F
L
 
V
I
 
F
V
 
I
N
 
N
G
 
N
G
 
A
V
 
L
L
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
F
Y
 
Y
G
 
K
D
 
D
P
 
K
A
 
N
D
 
D
D
 
E
E
 
I
A
 
I
A
 
A
R
 
K
I
 
R
I
 
L
G
 
S
A
 
K
A
 
A
H
 
L
P
 
P
G
 
N
R
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
V
 
V
P
 
D
C
 
A
R
 
R
P
 
V
L
 
F
I
 
L
W
 
R
Q
|
Q
N
|
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H

Sites not aligning to the query:

G7JT50 Agmatine deiminase; Agmatine iminohydrolase; MtAIH; EC 3.5.3.12 from Medicago truncatula (Barrel medic) (Medicago tribuloides) (see paper)
30% identity, 97% coverage: 6:341/345 of query aligns to 13:373/374 of G7JT50

query
sites
G7JT50
L
 
F
R
 
H
L
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
W
 
W
E
 
E
P
 
P
Q
 
H
S
 
S
A
 
Q
V
 
C
L
 
W
I
 
I
A
 
G
W
 
W
P
 
P
H
 
E
A
 
R
D
 
A
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
R
D
 
D
R
 
G
L
 
A
A
 
V
E
 
H
V
 
A
E
 
Q
T
 
L
T
 
V
Y
 
F
V
 
T
A
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
S
R
 
R
F
 
F
E
 
E
P
 
K
L
 
V
I
 
T
V
 
V
V
 
C
V
 
A
A
 
S
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
L
 
W
R
 
E
A
 
-
H
 
N
V
 
A
E
 
R
G
 
N
K
 
Q
L
 
L
R
 
P
E
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
L
 
I
P
 
S
Y
 
S
D
 
N
D
 
D
T
 
S
W
 
W
L
 
F
R
 
R
D
 
D
S
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
E
T
 
T
L
 
S
K
 
K
D
 
S
D
 
D
R
 
D
G
 
A
A
 
E
F
 
H
Q
 
R
L
 
I
T
 
A
-
 
G
-
 
I
D
 
D
F
 
W
R
 
T
F
 
F
T
 
N
G
 
S
W
 
W
G
 
G
G
 
G
K
 
L
F
 
E
G
 
D
A
 
G
E
 
C
Q
 
Y
D
 
C
D
 
D
A
 
W
L
 
S
V
 
L
A
 
D
G
 
S
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
K
V
 
I
F
 
L
G
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
P
R
 
R
A
 
F
A
 
S
H
 
H
R
 
S
R
 
M
I
 
V
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
I
 
I
E
 
H
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
C
L
 
I
T
 
T
T
 
T
W
 
E
R
 
E
C
 
C
L
 
L
V
 
L
-
 
N
-
 
K
Q
 
N
R
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
H
Q
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
S
E
 
Q
M
 
I
S
 
E
A
 
D
I
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
A
G
 
Y
L
 
L
H
 
G
A
 
V
S
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
I
W
 
W
L
 
L
D
 
P
Y
 
R
G
 
G
Y
 
L
L
 
Y
E
 
G
G
 
D
D
 
D
D
|
D
T
 
T
D
 
N
A
 
G
H
 
H
I
 
V
D
|
D
T
 
N
L
 
M
A
 
C
R
 
C
F
 
F
A
 
V
P
 
R
D
 
P
G
 
G
R
 
A
I
 
V
V
 
L
F
 
L
Q
 
S
A
 
W
C
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
K
D
 
T
D
 
D
A
 
P
H
 
Q
H
 
Y
D
 
E
E
 
R
L
 
S
S
 
E
R
 
E
M
 
A
A
 
Y
G
 
S
E
 
L
L
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
V
C
 
T
M
 
D
A
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
R
P
 
K
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
Y
 
I
P
 
K
L
 
L
P
 
H
W
 
V
A
 
P
K
 
G
P
 
P
I
 
L
V
 
Y
D
 
M
E
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
P
G
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
N
 
N
Y
 
F
L
 
Y
I
 
I
V
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
A
V
 
I
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
Q
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
K
-
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
K
A
 
T
H
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
E
V
 
V
V
 
V
Q
 
G
V
 
I
P
 
E
-
 
G
C
 
S
R
 
R
P
 
E
L
 
I
I
 
V
W
 
L
Q
 
S
N
 
G
G
 
G
S
 
N
L
 
I
H
 
H
C
 
C
I
 
I
T
 
T
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
Q
P
 
P
A
 
A

6nicD Crystal structure of medicago truncatula agmatine iminohydrolase (deiminase) in complex with 6-aminohexanamide (see paper)
30% identity, 97% coverage: 6:341/345 of query aligns to 3:359/360 of 6nicD

query
sites
6nicD
L
 
F
R
 
H
L
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
W
 
W
E
 
E
P
 
P
Q
 
H
S
 
S
A
 
Q
V
 
C
L
 
W
I
 
I
A
 
G
W
 
W
P
 
P
H
 
E
A
 
R
D
 
A
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
R
D
 
D
R
 
G
L
 
A
A
 
V
E
 
H
V
 
A
E
 
Q
T
 
L
T
 
V
Y
 
F
V
 
T
A
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
S
R
 
R
F
 
F
E
 
E
P
 
K
L
 
V
I
 
T
V
 
V
V
 
C
V
 
A
A
 
S
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
L
 
W
R
 
E
A
 
-
H
 
N
V
 
A
E
 
R
G
 
N
K
 
Q
L
 
L
R
 
P
E
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
L
 
I
P
 
S
Y
 
S
D
 
N
D
 
D
T
 
S
W
|
W
L
 
F
R
 
R
D
|
D
S
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
T
T
 
F
L
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
E
K
 
T
D
 
D
D
 
A
R
 
E
G
 
H
A
 
R
F
 
I
Q
 
A
L
 
G
T
 
I
D
 
D
F
 
W
R
 
T
F
 
F
T
 
N
G
 
S
W
|
W
G
 
G
G
 
G
K
 
L
F
 
E
G
 
D
A
 
G
E
 
C
Q
 
Y
D
 
C
D
 
D
A
 
W
L
 
S
V
 
L
A
 
D
G
 
S
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
K
G
 
K
V
 
I
F
 
L
G
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
P
R
 
R
A
 
F
A
 
S
H
 
H
R
 
S
R
 
M
I
 
V
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
I
 
I
E
 
H
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
C
L
 
I
T
 
T
T
 
T
W
 
E
R
 
E
C
 
C
L
 
L
V
 
L
-
 
N
-
 
K
Q
 
N
R
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
H
Q
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
S
E
 
Q
M
 
I
S
 
E
A
 
D
I
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
A
G
 
Y
L
 
L
H
 
G
A
 
V
S
 
R
R
 
K
I
 
V
L
 
I
W
 
W
L
 
L
D
 
P
Y
 
R
G
 
G
Y
 
L
L
 
Y
E
 
G
G
 
D
D
 
D
D
 
D
T
|
T
D
 
N
A
 
G
H
|
H
I
 
V
D
|
D
T
 
N
L
 
M
A
 
C
R
 
C
F
 
F
A
 
V
P
 
R
D
 
P
G
 
G
R
 
A
I
 
V
V
 
L
F
 
L
Q
 
S
A
 
W
C
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
K
D
 
T
D
 
D
A
 
P
H
 
Q
H
 
Y
D
 
E
E
 
R
L
 
S
S
 
E
R
 
E
M
 
A
A
 
Y
G
 
S
E
 
L
L
 
F
A
 
S
A
 
S
L
 
V
C
 
T
M
 
D
A
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
R
P
 
K
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
Y
 
I
P
 
K
L
 
L
P
 
H
W
 
V
A
 
P
K
 
G
P
 
P
I
 
L
V
 
Y
D
 
M
E
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
P
G
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
N
 
N
Y
 
F
L
 
Y
I
 
I
V
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
A
V
 
I
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
Q
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
K
-
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
K
A
 
T
H
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
E
V
 
V
V
 
V
Q
 
G
V
 
I
P
 
E
-
 
G
C
 
S
R
 
R
P
 
E
L
 
I
I
 
V
W
 
L
Q
 
S
N
 
G
G
 
G
S
 
N
L
 
I
H
 
H
C
|
C
I
 
I
T
 
T
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
Q
P
 
P
A
 
A

Q837U5 Putative agmatine deiminase; Agmatine iminohydrolase; EC 3.5.3.12 from Enterococcus faecalis (strain ATCC 700802 / V583) (see paper)
29% identity, 97% coverage: 6:340/345 of query aligns to 15:363/365 of Q837U5

query
sites
Q837U5
L
 
F
R
 
R
L
 
M
P
 
P
A
 
G
E
 
E
W
 
F
E
 
E
P
 
P
Q
 
Q
S
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
W
I
 
M
A
 
I
W
 
W
P
 
P
H
 
E
A
 
R
D
 
P
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
R
D
 
D
R
 
G
L
 
G
A
 
K
E
 
P
V
 
V
E
 
Q
T
 
E
T
 
A
Y
 
F
V
 
T
A
 
N
L
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
S
R
 
Q
F
 
F
E
 
T
P
 
P
L
 
M
I
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
S
D
 
Q
A
 
Q
E
 
Q
L
 
F
R
 
Q
A
 
N
H
 
C
V
 
R
E
 
R
G
 
Q
K
 
L
L
 
P
R
 
P
E
 
E
A
 
-
G
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
R
 
T
L
 
V
I
 
Y
E
 
E
L
 
M
P
 
S
Y
 
N
D
 
N
D
 
D
T
 
A
W
 
W
L
 
V
R
 
R
D
 
D
S
 
C
G
 
G
P
 
P
I
 
S
T
 
F
L
 
V
K
 
I
D
 
N
D
 
D
R
 
H
G
 
G
A
 
E
F
 
I
Q
 
R
L
 
G
T
 
V
D
 
D
F
 
W
R
 
T
F
 
F
T
 
N
G
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
L
K
 
Y
F
 
F
G
 
P
A
 
W
E
 
D
Q
 
Q
D
 
D
D
 
D
A
 
L
L
 
V
V
 
A
A
 
Q
G
 
K
L
 
I
V
 
C
K
 
E
A
 
-
G
 
-
V
 
I
F
 
E
G
 
H
R
 
V
A
 
D
A
 
S
H
 
Y
R
 
R
R
 
T
I
 
D
D
 
D
W
 
F
A
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
I
 
F
E
 
H
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
T
W
 
E
R
 
M
C
 
C
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
-
 
E
-
 
G
R
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
Q
Q
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
A
M
 
I
S
 
E
A
 
Q
I
 
K
L
 
L
R
 
C
D
 
D
G
 
Y
L
 
L
H
 
N
A
 
V
S
 
E
R
 
K
I
 
V
L
 
L
W
 
W
L
 
L
D
 
G
Y
 
D
G
 
G
Y
 
-
L
 
I
E
 
D
G
 
P
D
 
E
D
 
E
T
 
T
D
 
N
A
 
G
H
 
H
I
 
V
D
 
D
T
 
D
L
 
V
A
 
A
R
 
C
F
 
F
A
 
I
P
 
A
D
 
P
G
 
G
R
 
E
I
 
V
V
 
A
F
 
C
Q
 
I
A
 
Y
C
 
T
D
 
E
D
 
D
L
 
Q
D
 
N
D
 
S
A
 
P
H
 
F
H
 
Y
D
 
E
E
 
A
L
 
A
S
 
Q
R
 
D
M
 
A
A
 
Y
G
 
Q
E
 
R
L
 
L
A
 
L
A
 
K
L
 
M
C
 
T
M
 
D
A
 
A
D
 
K
G
 
G
K
 
R
P
 
Q
Y
 
L
E
 
K
L
 
V
Y
 
H
P
 
K
L
 
L
P
 
C
W
 
C
A
 
P
K
 
V
P
 
K
I
 
N
V
 
V
-
 
T
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
T
-
 
M
-
 
P
-
 
R
D
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
D
R
 
I
L
 
C
A
 
I
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
M
N
 
N
Y
 
F
L
 
L
I
 
I
V
 
T
N
 
N
G
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
P
 
E
A
 
N
D
 
D
D
 
H
E
 
L
A
 
A
A
 
L
R
 
E
I
 
Q
I
 
V
G
 
Q
A
 
T
A
 
M
H
 
F
P
 
P
G
 
D
R
 
K
E
 
K
V
 
I
V
 
V
Q
 
G
V
 
V
P
 
N
C
 
T
R
 
V
P
 
E
L
 
V
I
 
V
W
 
Y
Q
 
G
N
 
G
G
 
G
S
 
N
L
 
I
H
 
H
C
|
C
I
 
I
T
 
T
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
E
P
 
P

3h7cX Crystal structure of arabidopsis thaliana agmatine deiminase from cell free expression
31% identity, 97% coverage: 8:341/345 of query aligns to 15:366/369 of 3h7cX

query
sites
3h7cX
L
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
W
 
W
E
 
D
P
 
S
Q
 
H
S
 
A
A
 
Q
V
 
T
L
 
W
I
 
I
A
 
G
W
 
W
P
 
P
H
 
E
A
 
R
D
 
Q
T
 
D
D
x
N
W
 
W
A
 
R
D
 
H
R
 
N
L
 
A
A
 
L
E
 
P
V
 
A
E
 
Q
T
 
R
T
 
V
Y
 
F
V
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
S
R
 
K
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
T
V
 
V
V
 
C
V
 
A
A
 
S
D
 
P
A
 
A
E
 
Q
L
 
W
R
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
E
 
E
G
 
N
K
 
A
L
 
R
R
 
K
E
 
Q
A
 
L
G
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
L
 
M
P
 
S
Y
 
M
D
 
N
D
 
D
T
 
S
W
|
W
L
 
F
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
F
I
 
I
T
 
V
L
 
R
K
 
K
D
 
R
D
 
N
R
 
R
G
 
N
A
 
I
F
 
A
Q
 
G
L
 
I
T
 
-
D
|
D
F
x
W
R
 
N
F
 
F
T
 
N
G
 
A
W
|
W
G
 
G
G
 
G
K
 
A
F
 
N
G
 
D
A
 
G
E
x
C
Q
 
Y
D
 
N
D
 
D
A
 
W
L
 
S
V
 
H
A
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
S
A
 
R
G
 
K
V
 
I
F
 
L
G
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
P
R
 
R
A
 
F
A
 
Q
H
 
H
R
 
S
R
 
M
I
 
I
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
I
 
I
E
 
H
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
C
L
 
L
T
 
V
T
 
T
W
 
E
R
 
E
C
 
C
L
 
L
V
 
L
Q
 
N
-
 
K
-
 
N
R
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
H
Q
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
Q
M
 
I
S
 
E
A
 
E
I
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
Y
L
 
L
H
 
G
A
 
V
S
 
Q
R
 
S
I
 
F
L
 
I
W
 
W
L
 
L
D
 
P
Y
 
R
G
 
G
Y
 
L
L
 
Y
E
 
G
G
 
D
D
 
E
D
|
D
T
|
T
D
 
N
A
 
G
H
 
H
I
 
I
D
 
D
T
 
N
L
 
M
A
 
C
R
 
C
F
 
F
A
 
A
P
 
R
D
 
P
G
 
G
R
 
V
I
 
V
V
 
L
F
 
L
Q
 
S
A
 
W
C
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
E
D
 
T
D
 
D
A
 
P
H
 
Q
H
 
Y
D
 
E
E
 
R
L
 
S
S
 
V
R
 
E
M
 
A
A
 
L
G
 
S
E
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
N
L
 
S
C
 
I
M
 
D
A
 
A
D
 
R
G
 
G
K
 
R
P
 
K
Y
 
I
E
 
Q
L
 
V
Y
 
I
P
 
K
L
 
L
P
 
Y
W
 
I
A
 
P
K
 
E
P
 
P
I
 
L
-
 
Y
-
 
M
V
 
T
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
P
-
x
R
-
 
L
-
 
A
G
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
N
 
N
Y
 
F
L
 
Y
I
 
I
V
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
Q
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
I
-
 
R
D
 
D
D
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
D
A
 
T
H
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
G
V
 
I
P
 
E
-
 
N
C
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
I
I
 
V
W
 
L
Q
x
A
N
x
G
G
 
G
S
 
N
L
 
I
H
 
H
C
 
C
I
 
I
T
 
T
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
Q
P
 
P
A
 
A

Q8GWW7 Agmatine deiminase; Agmatine iminohydrolase; Protein EMBRYO DEFECTIVE 1873; EC 3.5.3.12 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 97% coverage: 8:341/345 of query aligns to 15:373/383 of Q8GWW7

query
sites
Q8GWW7
L
 
M
P
 
P
A
 
A
E
 
E
W
 
W
E
 
D
P
 
S
Q
 
H
S
 
A
A
 
Q
V
 
T
L
 
W
I
 
I
A
 
G
W
 
W
P
 
P
H
 
E
A
 
R
D
 
Q
T
 
D
D
 
N
W
 
W
A
 
R
D
 
H
R
 
N
L
 
A
A
 
L
E
 
P
V
 
A
E
 
Q
T
 
R
T
 
V
Y
 
F
V
 
A
A
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
S
R
 
K
F
 
F
E
 
E
P
 
P
L
 
V
I
 
T
V
 
V
V
 
C
V
 
A
A
 
S
D
 
P
A
 
A
E
 
Q
L
 
W
R
 
-
A
 
-
H
 
-
V
 
-
E
 
E
G
 
N
K
 
A
L
 
R
R
 
K
E
 
Q
A
 
L
G
 
P
V
 
E
D
 
D
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
L
 
M
P
 
S
Y
 
M
D
 
N
D
 
D
T
 
S
W
 
W
L
 
F
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
P
 
P
-
 
T
-
 
F
-
 
I
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
P
I
 
V
T
 
K
L
 
L
K
 
S
D
 
S
D
 
L
R
 
N
G
 
R
A
 
N
F
 
I
Q
 
A
L
 
G
T
 
I
D
 
D
F
 
W
R
 
N
F
 
F
T
 
N
G
 
A
W
 
W
G
 
G
G
 
G
K
 
A
F
 
N
G
 
D
A
 
G
E
 
C
Q
 
Y
D
 
N
D
 
D
A
 
W
L
 
S
V
 
H
A
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
S
A
 
R
G
 
K
V
 
I
F
 
L
G
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
P
R
 
R
A
 
F
A
 
Q
H
 
H
R
 
S
R
 
M
I
 
I
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
S
I
 
I
E
 
H
S
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
C
L
 
L
T
 
V
T
 
T
W
 
E
R
 
E
C
|
C
L
 
L
V
 
L
Q
 
N
-
 
K
-
 
N
R
 
R
H
 
N
P
 
P
E
 
H
Q
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
E
E
 
Q
M
 
I
S
 
E
A
 
E
I
 
E
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
Y
L
 
L
H
 
G
A
 
V
S
 
Q
R
 
S
I
 
F
L
 
I
W
 
W
L
 
L
D
 
P
Y
 
R
G
 
G
Y
 
L
L
 
Y
E
 
G
G
 
D
D
 
E
D
 
D
T
 
T
D
 
N
A
 
G
H
 
H
I
 
I
D
 
D
T
 
N
L
 
M
A
x
C
R
x
C
F
 
F
A
 
A
P
 
R
D
 
P
G
 
G
R
 
V
I
 
V
V
 
L
F
 
L
Q
 
S
A
 
W
C
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
E
D
 
T
D
 
D
A
 
P
H
 
Q
H
 
Y
D
 
E
E
 
R
L
 
S
S
 
V
R
 
E
M
 
A
A
 
L
G
 
S
E
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
N
L
 
S
C
 
I
M
 
D
A
 
A
D
 
R
G
 
G
K
 
R
P
 
K
Y
 
I
E
 
Q
L
 
V
Y
 
I
P
 
K
L
 
L
P
 
Y
W
 
I
A
 
P
K
 
E
P
 
P
I
 
L
-
 
Y
-
 
M
V
 
T
D
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
A
G
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
N
 
N
Y
 
F
L
 
Y
I
 
I
V
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
Q
Y
 
F
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
I
-
 
R
D
 
D
D
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
S
A
 
D
A
 
T
H
 
F
P
 
P
G
 
H
R
 
H
E
 
S
V
 
V
V
 
V
Q
 
G
V
 
I
P
 
E
-
 
N
C
 
A
R
 
R
P
 
E
L
 
I
I
 
V
W
 
L
Q
 
A
N
 
G
G
 
G
S
 
N
L
 
I
H
 
H
C
|
C
I
 
I
T
 
T
M
 
Q
Q
 
Q
L
 
Q
P
 
P
A
 
A

6i0xB Porphyromonas gingivalis peptidylarginine deminase (ppad) mutant g231n/e232t/n235d in complex with cl-amidine. (see paper)
23% identity, 91% coverage: 6:320/345 of query aligns to 12:292/422 of 6i0xB

query
sites
6i0xB
L
 
V
R
 
R
L
 
A
P
 
I
A
 
A
E
 
E
W
 
Y
E
 
E
P
 
R
Q
 
S
S
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
R
W
 
Y
P
 
P
H
 
F
A
 
G
D
 
I
T
 
P
D
 
-
W
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
L
T
 
A
R
 
K
F
 
N
E
 
D
P
 
K
L
 
V
I
 
I
V
 
T
V
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
E
E
 
S
L
 
Q
R
 
K
A
 
N
H
 
T
V
 
V
E
 
I
G
 
T
K
 
Q
L
 
Y
R
 
T
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
N
L
 
L
G
 
S
R
 
N
V
 
C
R
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
I
L
 
A
P
 
K
Y
 
T
D
 
D
D
 
S
T
 
Y
W
|
W
L
 
T
R
 
R
D
|
D
S
 
Y
G
 
T
P
 
G
I
 
W
T
 
F
L
 
A
K
 
M
D
 
Y
D
 
D
R
 
T
G
 
N
A
 
K
F
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
I
F
 
Y
T
 
N
G
 
-
W
 
-
G
x
R
G
 
P
K
x
R
F
 
P
G
 
N
A
 
D
E
 
D
Q
 
E
D
 
F
D
 
P
A
 
K
L
 
Y
V
 
E
A
 
A
G
 
Q
L
 
Y
V
 
L
K
 
G
A
 
I
G
 
E
V
 
M
F
 
F
G
 
G
R
 
M
A
 
K
A
 
L
H
 
K
R
 
Q
R
 
T
I
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
N
I
 
Y
E
 
M
S
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
S
V
 
A
L
 
V
T
 
Q
T
 
S
W
 
H
R
 
I
C
 
A
L
 
Y
V
 
T
Q
 
E
R
 
-
H
 
N
P
 
S
E
 
S
Q
 
L
S
 
S
R
 
Q
E
 
A
E
 
Q
M
 
V
S
 
N
A
 
Q
I
 
K
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
Y
L
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
T
H
 
H
A
 
H
S
 
D
R
 
V
I
 
V
L
 
Q
W
 
D
L
 
P
D
 
N
Y
 
N
G
 
T
Y
|
Y
L
x
I
E
 
D
G
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
H
|
H
I
 
V
D
|
D
T
 
C
L
 
W
A
 
G
R
 
K
F
 
Y
A
 
L
P
 
A
D
 
P
G
 
N
R
 
K
I
 
I
V
 
L
F
 
I
Q
 
R
A
 
K
C
 
V
D
 
P
D
 
D
L
 
-
D
 
N
D
 
H
A
 
P
H
 
Q
H
 
H
D
 
Q
E
 
A
L
 
L
S
 
E
R
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
A
E
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
C
 
T
M
 
C
A
 
A
D
 
W
G
 
G
K
 
T
P
 
K
Y
 
Y
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
P
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
S
 
N
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
Y
 
Y
A
 
T
N
 
N
Y
 
S
L
 
L
I
 
I
V
 
L
N
 
N
G
 
N
G
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
V
Y
 
N
G
 
G
D
 
-
P
 
P
A
 
A
-
 
S
-
 
V
D
 
D
D
 
N
E
 
D
A
 
A
A
 
L
R
 
N
I
 
V
I
 
Y
G
 
K
A
 
T
A
 
A
H
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4ytgA Crystal structure of porphyromonas gingivalis peptidylarginine deiminase (ppad) mutant c351a in complex with dipeptide met-arg. (see paper)
23% identity, 91% coverage: 6:320/345 of query aligns to 12:292/417 of 4ytgA

query
sites
4ytgA
L
 
V
R
 
R
L
 
A
P
 
I
A
 
A
E
 
E
W
 
Y
E
 
E
P
 
R
Q
 
S
S
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
R
W
 
Y
P
 
P
H
 
F
A
 
G
D
 
I
T
 
P
D
 
-
W
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
L
T
 
A
R
 
K
F
 
N
E
 
D
P
 
K
L
 
V
I
 
I
V
 
T
V
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
E
E
 
S
L
 
Q
R
 
K
A
 
N
H
 
T
V
 
V
E
 
I
G
 
T
K
 
Q
L
 
Y
R
 
T
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
N
L
 
L
G
 
S
R
 
N
V
 
C
R
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
I
L
 
A
P
 
K
Y
 
T
D
 
D
D
 
S
T
 
Y
W
|
W
L
 
T
R
 
R
D
|
D
S
 
Y
G
 
T
P
 
G
I
 
W
T
 
F
L
 
A
K
 
M
D
 
Y
D
 
D
R
 
T
G
 
N
A
 
K
F
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
I
F
 
Y
T
 
N
G
 
-
W
 
-
G
x
R
G
 
P
K
x
R
F
 
P
G
 
N
A
 
D
E
 
D
Q
 
E
D
 
F
D
 
P
A
 
K
L
 
Y
V
 
E
A
 
A
G
 
Q
L
 
Y
V
 
L
K
 
G
A
 
I
G
 
E
V
 
M
F
 
F
G
 
G
R
 
M
A
 
K
A
 
L
H
 
K
R
 
Q
R
 
T
I
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
N
I
 
Y
E
 
M
S
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
S
V
 
A
L
 
V
T
 
Q
T
 
S
W
 
H
R
 
I
C
 
A
L
 
Y
V
 
T
Q
 
E
R
 
-
H
 
N
P
 
S
E
 
S
Q
 
L
S
 
S
R
 
Q
E
 
A
E
 
Q
M
 
V
S
 
N
A
 
Q
I
 
K
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
Y
L
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
T
H
 
H
A
 
H
S
 
D
R
 
V
I
 
V
L
 
Q
W
 
D
L
 
P
D
 
N
Y
 
G
G
 
E
Y
|
Y
L
x
I
E
 
N
G
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
H
|
H
I
 
V
D
|
D
T
 
C
L
 
W
A
 
G
R
 
K
F
 
Y
A
 
L
P
 
A
D
 
P
G
 
N
R
x
K
I
 
I
V
 
L
F
 
I
Q
 
R
A
 
K
C
 
V
D
 
P
D
 
D
L
 
-
D
 
N
D
 
H
A
 
P
H
 
Q
H
 
H
D
 
Q
E
 
A
L
 
L
S
 
E
R
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
A
E
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
C
 
T
M
 
C
A
 
A
D
 
W
G
 
G
K
 
T
P
 
K
Y
 
Y
E
|
E
L
 
V
Y
 
Y
P
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
S
 
N
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
Y
 
Y
A
 
T
N
 
N
Y
 
S
L
 
L
I
 
I
V
 
L
N
 
N
G
 
N
G
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
V
Y
 
N
G
 
G
D
 
-
P
 
P
A
 
A
-
 
S
-
 
V
D
 
D
D
 
N
E
 
D
A
 
A
A
 
L
R
 
N
I
 
V
I
 
Y
G
 
K
A
 
T
A
 
A
H
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4ytbA Crystal structure of porphyromonas gingivalis peptidylarginine deiminase (ppad) in complex with dipeptide asp-gln. (see paper)
23% identity, 91% coverage: 6:320/345 of query aligns to 12:292/422 of 4ytbA

query
sites
4ytbA
L
 
V
R
 
R
L
 
A
P
 
I
A
 
A
E
 
E
W
 
Y
E
 
E
P
 
R
Q
 
S
S
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
R
W
 
Y
P
 
P
H
 
F
A
 
G
D
 
I
T
 
P
D
 
-
W
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Y
 
-
V
 
M
A
 
E
L
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
E
V
 
L
T
 
A
R
 
K
F
 
N
E
 
D
P
 
K
L
 
V
I
 
I
V
 
T
V
 
I
V
 
V
A
 
A
D
 
S
A
 
E
E
 
S
L
 
Q
R
 
K
A
 
N
H
 
T
V
 
V
E
 
I
G
 
T
K
 
Q
L
 
Y
R
 
T
E
 
Q
A
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
N
L
 
L
G
 
S
R
 
N
V
 
C
R
 
D
L
 
F
I
 
I
E
 
I
L
 
A
P
 
K
Y
 
T
D
 
D
D
 
S
T
 
Y
W
|
W
L
 
T
R
 
R
D
|
D
S
 
Y
G
 
T
P
 
G
I
 
W
T
 
F
L
 
A
K
 
M
D
 
Y
D
 
D
R
 
T
G
 
N
A
 
K
F
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
I
F
 
Y
T
 
N
G
 
-
W
 
-
G
x
R
G
 
P
K
 
R
F
 
P
G
 
N
A
 
D
E
 
D
Q
 
E
D
 
F
D
 
P
A
 
K
L
 
Y
V
 
E
A
 
A
G
 
Q
L
 
Y
V
 
L
K
 
G
A
 
I
G
 
E
V
 
M
F
 
F
G
 
G
R
 
M
A
 
K
A
 
L
H
 
K
R
 
Q
R
 
T
I
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
G
G
 
N
I
 
Y
E
 
M
S
 
T
D
 
D
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
T
 
S
V
 
A
L
 
V
T
 
Q
T
 
S
W
 
H
R
 
I
C
 
A
L
 
Y
V
 
T
Q
 
E
R
 
-
H
 
N
P
 
S
E
 
S
Q
 
L
S
 
S
R
 
Q
E
 
A
E
 
Q
M
 
V
S
 
N
A
 
Q
I
 
K
L
 
M
R
 
K
D
 
D
G
 
Y
L
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
T
H
 
H
A
 
H
S
 
D
R
 
V
I
 
V
L
 
Q
W
 
D
L
 
P
D
 
N
Y
 
G
G
 
E
Y
|
Y
L
x
I
E
 
N
G
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
H
I
 
V
D
 
D
T
 
C
L
 
W
A
 
G
R
 
K
F
 
Y
A
 
L
P
 
A
D
 
P
G
 
N
R
 
K
I
 
I
V
 
L
F
 
I
Q
 
R
A
 
K
C
 
V
D
 
P
D
 
D
L
 
-
D
 
N
D
 
H
A
 
P
H
 
Q
H
 
H
D
 
Q
E
 
A
L
 
L
S
 
E
R
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
A
E
 
Y
L
 
F
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
C
 
T
M
 
C
A
 
A
D
 
W
G
 
G
K
 
T
P
 
K
Y
 
Y
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
P
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
A
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
S
 
N
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
Y
 
Y
A
 
T
N
 
N
Y
 
S
L
 
L
I
 
I
V
 
L
N
 
N
G
 
N
G
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
P
 
P
A
 
V
Y
 
N
G
 
G
D
 
-
P
 
P
A
 
A
-
 
S
-
 
V
D
 
D
D
 
N
E
 
D
A
 
A
A
 
L
R
 
N
I
 
V
I
 
Y
G
 
K
A
 
T
A
 
A
H
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
Y
E
 
E
V
 
I
V
 
I
Q
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>N515DRAFT_1539 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_1539
MSHATLRLPAEWEPQSAVLIAWPHADTDWADRLAEVETTYVALAAAVTRFEPLIVVVADA
ELRAHVEGKLREAGVDLGRVRLIELPYDDTWLRDSGPITLKDDRGAFQLTDFRFTGWGGK
FGAEQDDALVAGLVKAGVFGRAAHRRIDWALEGGGIESDGAGTVLTTWRCLVQRHPEQSR
EEMSAILRDGLHASRILWLDYGYLEGDDTDAHIDTLARFAPDGRIVFQACDDLDDAHHDE
LSRMAGELAALCMADGKPYELYPLPWAKPIVDEGRRLAASYANYLIVNGGVLVPAYGDPA
DDEAARIIGAAHPGREVVQVPCRPLIWQNGSLHCITMQLPAGIYG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory