SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_1707 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_1707 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
34% identity, 69% coverage: 47:158/162 of query aligns to 74:181/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
D
 
N
V
 
V
I
 
K
V
 
L
G
 
G
E
 
K
D
 
N
S
 
V
V
 
Y
I
 
V
N
 
N
S
 
T
G
 
N
C
 
C
V
 
Y
I
 
F
Y
x
M
T
 
D
G
 
G
N
 
G
G
 
Q
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
F
I
 
I
A
 
G
A
 
P
N
 
N
C
 
C
T
 
G
F
 
F
A
x
Y
P
 
T
V
x
A
N
 
T
H
|
H
E
 
P
F
 
L
S
 
N
R
 
F
R
 
H
D
 
H
V
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
N
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
R
 
E
P
 
K
S
 
A
K
 
-
G
 
G
G
 
P
I
 
I
E
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
S
D
 
N
V
 
T
W
 
W
I
 
F
G
 
G
A
 
G
N
 
H
C
 
V
V
 
A
L
 
V
L
|
L
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
G
C
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
x
T
G
x
K
V
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
P
F
 
H
K
 
S
I
 
L
Y
 
A
G
 
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
C
K
 
K
V
 
V
L
 
V

4husA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with virginiamycin m1 (see paper)
32% identity, 76% coverage: 39:161/162 of query aligns to 20:166/212 of 4husA

query
sites
4husA
I
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
T
G
 
I
G
 
T
S
 
N
G
 
E
D
 
N
V
 
I
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
Y
S
 
S
V
x
Y
I
 
Y
N
x
D
S
 
S
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
G
 
D
C
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
 
Y
T
 
H
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
K
V
 
L
R
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
F
V
 
C
A
 
S
I
 
I
A
 
G
A
 
P
N
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
I
P
 
M
-
 
N
-
 
G
V
 
A
N
 
N
H
 
H
E
 
R
F
 
M
S
 
D
R
 
G
R
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
R
 
H
-
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
W
Q
 
E
G
 
K
F
 
Y
R
 
M
P
 
P
S
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
R
N
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
E
S
 
A
I
 
V
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
N
L
 
V
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
S
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
K
V
 
F
L
 
I
G
 
R
E
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4hurA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
32% identity, 76% coverage: 39:161/162 of query aligns to 20:166/211 of 4hurA

query
sites
4hurA
I
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
T
G
 
I
G
 
T
S
 
N
G
 
E
D
 
N
V
 
I
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
Y
S
 
S
V
 
Y
I
 
Y
N
 
D
S
 
S
G
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
D
C
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
|
Y
T
 
H
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
K
V
 
L
R
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
F
V
 
C
A
x
S
I
|
I
A
x
G
A
 
P
N
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
I
P
 
M
-
 
N
-
 
G
V
x
A
N
|
N
H
 
H
E
 
R
F
 
M
S
 
D
R
 
G
R
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
R
 
H
-
 
L
-
 
F
-
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
W
Q
 
E
G
 
K
F
 
Y
R
 
M
P
 
P
S
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
|
I
G
|
G
A
x
R
N
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
I
L
x
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
I
A
|
A
A
|
A
G
 
E
S
 
A
I
 
V
V
 
V
R
x
T
G
 
K
V
 
N
L
 
V
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
S
I
 
I
Y
 
V
G
|
G
G
 
G
S
 
N
P
|
P
L
 
L
K
 
K
V
 
F
L
x
I
G
x
R
E
 
K
R
 
R

6x3cE Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
32% identity, 76% coverage: 39:161/162 of query aligns to 20:166/203 of 6x3cE

query
sites
6x3cE
I
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
T
G
 
I
G
 
T
S
 
N
G
 
E
D
 
N
V
 
I
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
Y
S
 
S
V
 
Y
I
 
Y
N
 
D
S
 
S
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
G
 
D
C
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
|
Y
T
 
H
-
x
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
K
V
 
L
R
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
F
V
 
C
A
 
S
I
 
I
A
x
G
A
 
P
N
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
I
P
 
M
-
 
N
-
x
G
V
 
A
N
|
N
H
|
H
E
 
R
F
x
M
S
 
D
R
 
G
R
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
R
x
H
-
x
L
-
 
F
-
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
W
Q
 
E
G
 
K
F
 
Y
R
x
M
P
|
P
S
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
R
N
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
I
A
|
A
A
|
A
G
 
E
S
 
A
I
 
V
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
N
L
 
V
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
S
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
G
 
G
S
x
N
P
|
P
L
 
L
K
 
K
V
 
F
L
 
I
G
 
R
E
 
K
R
 
R

6x3cA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
32% identity, 76% coverage: 39:161/162 of query aligns to 20:166/207 of 6x3cA

query
sites
6x3cA
I
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
T
G
 
I
G
 
T
S
 
N
G
 
E
D
 
N
V
 
I
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
Y
S
 
S
V
x
Y
I
 
Y
N
 
D
S
 
S
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
G
 
D
C
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
|
Y
T
 
H
-
x
Y
-
 
E
-
 
V
-
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
K
V
 
L
R
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
F
V
 
C
A
 
S
I
 
I
A
x
G
A
 
P
N
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
I
P
 
M
-
 
N
-
x
G
V
 
A
N
|
N
H
|
H
E
 
R
F
 
M
S
 
D
R
 
G
R
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
R
x
H
-
x
L
-
 
F
-
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
W
Q
 
E
G
 
K
F
 
Y
R
x
M
P
|
P
S
 
S
-
x
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
R
N
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
I
L
x
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
I
A
|
A
A
|
A
G
 
E
S
 
A
I
 
V
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
N
L
 
V
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
S
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
K
V
 
F
L
 
I
G
 
R
E
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6x3jA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f0224 (46) (see paper)
32% identity, 76% coverage: 39:161/162 of query aligns to 20:166/206 of 6x3jA

query
sites
6x3jA
I
 
I
K
 
K
P
 
P
A
 
T
G
 
I
G
 
T
S
 
N
G
 
E
D
 
N
V
 
I
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
Y
S
 
S
V
 
Y
I
 
Y
N
 
D
S
 
S
G
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
D
C
 
Q
V
 
V
I
 
L
Y
|
Y
T
 
H
-
x
Y
-
 
E
-
x
V
-
 
I
G
 
G
N
 
D
G
 
K
V
 
L
R
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
F
V
 
C
A
 
S
I
 
I
A
x
G
A
 
P
N
 
G
C
 
T
T
 
T
F
 
F
A
 
I
P
 
M
-
 
N
-
 
G
V
x
A
N
 
N
H
|
H
E
 
R
F
 
M
S
 
D
R
 
G
R
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
R
x
H
-
x
L
-
 
F
-
 
R
-
 
M
-
 
G
A
 
W
Q
 
E
G
 
K
F
 
Y
R
x
M
P
|
P
S
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
x
L
-
 
P
-
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
R
N
 
D
C
 
V
V
 
T
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
E
S
 
A
I
 
V
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
N
L
 
V
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
S
I
 
I
Y
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
K
V
 
F
L
 
I
G
 
R
E
 
K
R
 
R

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
33% identity, 67% coverage: 50:158/162 of query aligns to 67:171/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
V
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
S
 
T
V
 
F
I
 
I
N
 
N
S
 
M
G
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
Y
 
L
T
 
D
G
 
G
N
 
A
G
 
P
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
H
V
 
V
A
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
P
N
 
S
C
 
T
T
 
Q
F
 
F
A
 
Y
P
 
T
V
 
A
N
 
S
H
 
H
E
 
S
F
 
L
S
 
D
R
 
Y
R
 
R
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
A
F
 
W
R
 
E
P
 
T
S
 
I
K
 
C
G
 
K
G
 
P
I
 
I
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
Q
G
|
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
G
 
R
C
 
S
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
 
N
G
 
Q
V
x
D
L
 
V
E
 
P
A
 
P
F
 
D
K
 
T
I
 
L
Y
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
T
P
 
P
L
 
A
K
 
R
V
 
I
L
 
L

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
33% identity, 67% coverage: 50:158/162 of query aligns to 74:178/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
V
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
S
 
T
V
 
F
I
 
I
N
 
N
S
 
M
G
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
Y
 
L
T
 
D
G
 
G
N
 
A
G
 
P
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
H
V
 
V
A
 
L
I
 
I
A
 
G
A
 
P
N
 
S
C
 
T
T
 
Q
F
 
F
A
x
Y
P
 
T
V
 
A
N
 
S
H
|
H
E
 
S
F
 
L
S
 
D
R
 
Y
R
 
R
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
A
F
 
W
R
 
E
P
 
T
S
 
I
K
 
C
G
 
K
G
 
P
I
 
I
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
Q
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
G
 
R
C
 
S
V
 
V
I
 
V
A
|
A
A
|
A
G
x
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
x
N
G
 
Q
V
 
D
L
 
V
E
 
P
A
 
P
F
 
D
K
 
T
I
 
L
Y
 
V
G
|
G
G
 
G
S
x
T
P
|
P
L
 
A
K
 
R
V
 
I
L
|
L

Sites not aligning to the query:

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
33% identity, 67% coverage: 50:158/162 of query aligns to 77:181/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
V
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
S
 
T
V
 
F
I
 
I
N
 
N
S
 
M
G
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
Y
 
L
T
 
D
G
 
G
N
 
A
G
 
P
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
H
V
 
V
A
 
L
I
 
I
A
x
G
A
 
P
N
 
S
C
 
T
T
 
Q
F
 
F
A
x
Y
P
 
T
V
 
A
N
 
S
H
|
H
E
 
S
F
 
L
S
 
D
R
 
Y
R
 
R
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
R
A
 
R
Q
 
Q
G
 
A
F
 
W
R
 
E
P
 
T
S
 
I
K
 
C
G
 
K
G
 
P
I
 
I
E
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
G
N
 
N
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
Q
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
A
G
 
R
C
 
S
V
 
V
I
 
V
A
|
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
x
N
G
 
Q
V
 
D
L
 
V
E
 
P
A
 
P
F
 
D
K
 
T
I
 
L
Y
 
V
G
|
G
G
 
G
S
x
T
P
|
P
L
 
A
K
 
R
V
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
34% identity, 71% coverage: 46:160/162 of query aligns to 74:184/203 of P07464

query
sites
P07464
G
 
S
D
 
N
V
 
I
I
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
R
D
 
N
S
 
F
V
 
Y
I
 
A
N
|
N
S
 
F
G
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
Y
 
V
T
 
D
G
x
D
N
 
Y
G
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
P
N
 
N
C
 
V
T
 
T
F
 
L
A
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
H
P
 
P
V
 
V
N
 
H
H
 
H
E
 
E
F
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
F
 
E
R
 
M
P
 
Y
S
 
S
K
 
-
G
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
x
S
N
 
H
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
R
x
T
G
x
K
V
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
P
F
 
N
K
 
V
I
 
V
Y
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
V
P
 
P
L
 
C
K
x
R
V
 
V
L
 
I
G
x
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
34% identity, 71% coverage: 46:160/162 of query aligns to 73:183/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
G
 
S
D
 
N
V
 
I
I
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
R
D
 
N
S
 
F
V
 
Y
I
 
A
N
|
N
S
 
F
G
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
Y
 
V
T
 
D
G
 
D
N
 
Y
G
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
L
I
|
I
A
|
A
A
x
P
N
 
N
C
 
V
T
 
T
F
 
L
A
 
S
-
 
V
-
x
T
-
 
G
-
x
H
P
 
P
V
 
V
N
 
H
H
 
H
E
 
E
F
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
F
 
E
R
 
M
P
 
Y
S
 
S
K
 
-
G
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
N
 
H
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
x
N
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
I
 
I
A
x
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
P
F
 
N
K
 
V
I
 
V
Y
 
A
G
x
A
G
 
G
S
 
V
P
|
P
L
 
C
K
 
R
V
 
V
L
 
I
G
x
R
E
 
E

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
34% identity, 71% coverage: 46:160/162 of query aligns to 73:183/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
G
 
S
D
 
N
V
 
I
I
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
R
D
 
N
S
 
F
V
x
Y
I
 
A
N
|
N
S
 
F
G
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
Y
x
V
T
 
D
G
x
D
N
 
Y
G
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
L
I
 
I
A
|
A
A
 
P
N
 
N
C
 
V
T
 
T
F
 
L
A
x
S
-
 
V
-
x
T
-
 
G
-
 
H
P
 
P
V
 
V
N
 
H
H
 
H
E
 
E
F
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
F
 
E
R
x
M
P
 
Y
S
 
S
K
 
-
G
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
N
 
H
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
x
N
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
P
F
 
N
K
 
V
I
 
V
Y
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
V
P
|
P
L
 
C
K
x
R
V
 
V
L
 
I
G
x
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
34% identity, 71% coverage: 46:160/162 of query aligns to 73:183/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
G
 
S
D
 
N
V
 
I
I
 
H
V
 
I
G
 
G
E
 
R
D
 
N
S
 
F
V
x
Y
I
 
A
N
|
N
S
 
F
G
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
Y
x
V
T
 
D
G
x
D
N
 
Y
G
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
N
V
 
V
A
x
L
I
 
I
A
 
A
A
 
P
N
 
N
C
 
V
T
 
T
F
 
L
A
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
H
P
 
P
V
 
V
N
 
H
H
 
H
E
 
E
F
 
-
S
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
F
 
E
R
x
M
P
 
Y
S
 
S
K
 
-
G
 
F
G
 
P
I
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
N
 
H
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
N
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
I
 
I
A
x
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
P
F
 
N
K
 
V
I
 
V
Y
 
A
G
 
A
G
 
G
S
 
V
P
|
P
L
 
C
K
 
R
V
 
V
L
 
I
G
x
R
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
28% identity, 87% coverage: 18:158/162 of query aligns to 44:183/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
D
 
D
S
 
E
V
 
R
R
 
R
G
 
F
T
 
T
R
 
L
I
 
L
E
 
N
I
 
Q
R
 
L
R
 
L
G
 
G
A
 
S
V
 
S
I
 
A
D
 
D
A
 
G
F
 
K
V
 
A
K
 
Q
I
 
I
K
 
N
P
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
R
A
 
C
G
 
D
G
 
Y
S
 
G
G
 
Y
D
 
N
V
 
I
I
 
H
V
 
V
G
 
G
E
 
K
D
 
S
S
 
F
V
x
F
I
 
A
N
 
N
S
 
F
G
 
N
C
 
C
V
 
V
I
 
I
Y
 
L
T
 
D
G
 
V
N
 
C
G
 
E
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
N
 
H
C
 
C
T
 
M
F
 
F
A
|
A
P
 
P
V
 
G
N
 
V
H
 
H
E
 
I
F
x
Y
S
 
T
R
x
A
R
 
T
D
x
H
-
 
P
-
 
L
V
 
H
P
 
P
I
 
V
R
 
E
A
 
R
Q
 
N
G
 
S
F
 
G
R
 
K
P
 
E
S
 
Y
K
 
G
G
 
K
G
 
P
I
 
V
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
V
G
|
G
A
 
G
N
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
I
L
x
N
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
C
 
A
V
 
V
I
 
I
A
|
A
A
x
S
G
 
G
S
 
A
I
 
V
V
 
V
R
x
T
G
 
K
V
 
D
L
 
V
E
 
P
A
 
N
F
 
N
K
 
V
I
 
V
Y
 
V
G
 
G
G
 
G
S
x
N
P
 
P
L
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
I

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
29% identity, 69% coverage: 47:158/162 of query aligns to 74:181/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
D
 
N
V
 
I
I
 
H
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
N
S
 
F
V
 
F
I
 
A
N
|
N
S
 
Y
G
 
D
C
 
C
V
 
I
I
 
F
Y
 
L
T
 
D
G
 
V
N
 
C
G
 
K
V
 
I
R
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
D
G
 
N
V
 
V
A
 
M
I
 
L
A
|
A
A
 
P
N
 
N
C
 
V
T
 
Q
F
 
I
A
 
Y
P
 
T
V
 
A
N
 
Y
H
 
H
E
 
P
F
 
I
S
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
D
V
 
A
P
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
N
Q
 
S
G
 
G
F
 
I
R
 
E
P
 
Y
S
 
G
K
 
-
G
 
S
G
 
P
I
 
V
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
G
N
 
G
C
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
T
D
 
P
G
 
G
A
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
 
T
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
P
A
 
P
F
 
N
K
 
T
I
 
V
Y
 
A
G
x
V
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
C
K
 
R
V
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1kk4A Crystal structure of vat(d) in complex with acetyl-coa (see paper)
39% identity, 36% coverage: 103:161/162 of query aligns to 109:167/205 of 1kk4A

query
sites
1kk4A
P
 
P
S
 
I
K
|
K
G
 
G
G
 
D
I
 
T
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
K
N
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
V
A
|
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
x
V
G
x
K
V
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
M
I
x
L
Y
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
N
P
|
P
L
 
A
K
 
N
V
 
E
L
x
I
G
 
K
E
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3dhoA Structure of streptogramin acetyltransferase in complex with an inhibitor
39% identity, 36% coverage: 103:161/162 of query aligns to 109:167/203 of 3dhoA

query
sites
3dhoA
P
 
P
S
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
T
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
x
I
I
 
V
A
|
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
x
V
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
M
I
x
L
Y
 
A
G
|
G
G
 
G
S
 
N
P
|
P
L
 
A
K
 
N
V
 
E
L
x
I
G
 
K
E
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1khrA Crystal structure of vat(d) in complex with virginiamycin and coenzyme a (see paper)
39% identity, 36% coverage: 103:161/162 of query aligns to 109:167/206 of 1khrA

query
sites
1khrA
P
 
P
S
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
T
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
V
A
|
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
x
V
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
M
I
x
L
Y
 
A
G
|
G
G
 
G
S
 
N
P
|
P
L
 
A
K
 
N
V
 
E
L
x
I
G
 
K
E
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P50870 Streptogramin A acetyltransferase; Virginiamycin acetyltransferase D; Vat(D); EC 2.3.1.- from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see paper)
39% identity, 36% coverage: 103:161/162 of query aligns to 109:167/209 of P50870

query
sites
P50870
P
 
P
S
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
T
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
 
V
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
M
I
 
L
Y
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
A
K
 
N
V
 
E
L
 
I
G
 
K
E
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1mrlA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase with dalfopristin (see paper)
39% identity, 36% coverage: 103:161/162 of query aligns to 109:167/204 of 1mrlA

query
sites
1mrlA
P
 
P
S
 
I
K
 
K
G
 
G
G
 
D
I
 
T
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
M
D
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
I
 
V
V
 
V
R
 
V
G
 
K
V
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
P
F
 
Y
K
 
M
I
 
L
Y
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
L
 
A
K
 
N
V
 
E
L
 
I
G
 
K
E
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>N515DRAFT_1707 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_1707
MIVVDPSARVSPLADIEDSVRGTRIEIRRGAVIDAFVKIKPAGGSGDVIVGEDSVINSGC
VIYTGNGVRIGKGVAIAANCTFAPVNHEFSRRDVPIRAQGFRPSKGGIEIGDDVWIGANC
VLLDGAVIGEGCVIAAGSIVRGVLEAFKIYGGSPLKVLGERQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory