SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_1783 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_1783 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3triA Structure of a pyrroline-5-carboxylate reductase (proc) from coxiella burnetii (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:271/274 of query aligns to 3:272/272 of 3triA

query
sites
3triA
T
 
S
R
 
N
I
 
I
A
 
T
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
R
 
R
S
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
K
 
A
T
 
N
G
 
G
I
 
Y
A
 
D
A
 
P
S
 
N
S
 
R
V
 
I
S
 
C
V
 
V
A
 
T
E
x
N
P
x
R
R
x
S
A
 
L
E
 
D
A
x
K
R
 
L
Q
 
D
E
 
F
L
 
F
G
 
K
R
 
E
E
 
K
F
 
C
G
 
G
V
 
V
A
 
H
C
 
T
Y
 
T
A
 
Q
E
 
D
A
x
N
R
 
R
P
 
Q
A
 
G
V
 
A
A
 
L
E
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
x
Q
L
 
I
P
 
K
A
x
M
L
 
V
R
 
C
N
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
K
D
 
D
V
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
E
R
 
T
R
 
K
P
 
I
M
 
L
L
 
V
I
 
I
S
 
S
I
x
L
A
|
A
A
x
V
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
T
D
 
P
Q
 
L
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
K
Q
 
A
L
 
S
P
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
C
 
A
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
S
L
 
S
I
 
V
G
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
C
 
F
A
 
A
N
 
N
G
 
E
R
 
T
V
 
V
S
 
D
P
 
K
P
 
D
Q
 
Q
R
 
K
A
 
N
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
S
I
 
I
L
 
M
D
 
R
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
V
R
 
I
W
 
W
I
 
V
D
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
D
L
 
Q
M
 
I
D
 
E
T
 
K
V
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
F
A
 
L
L
 
I
V
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
E
A
 
Q
Q
 
L
G
 
G
M
 
L
P
 
T
R
 
K
E
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
E
Q
 
Q
T
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
R
M
 
M
L
 
A
A
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
E
E
 
Q
A
 
S
P
 
V
A
 
V
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
R
 
F
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
Q
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
K
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
N
L
 
L
P
 
R
R
 
E
I
 
L
V
 
F
A
 
I
R
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
V
R
 
N
R
 
R
G
 
A
E
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
S
A
 
K
A
 
T
L
 
V
D
 
D

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
41% identity, 96% coverage: 4:266/274 of query aligns to 3:258/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
I
 
V
A
 
Y
F
 
F
I
x
L
G
|
G
G
 
G
G
|
G
N
|
N
M
|
M
A
 
A
R
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
V
K
 
K
T
 
Q
G
 
G
I
 
-
A
 
-
A
 
G
S
 
Y
S
 
R
V
 
I
S
 
Y
V
 
I
A
|
A
E
x
N
P
x
R
R
x
G
A
 
A
E
 
E
A
x
K
R
 
R
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
E
R
 
K
E
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
E
C
 
T
Y
 
S
A
 
A
E
 
-
A
 
T
R
 
L
P
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
H
E
 
S
A
 
D
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
I
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
D
L
 
M
P
 
E
A
 
A
-
x
A
L
 
C
R
 
K
N
 
N
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
I
R
 
R
Q
 
T
R
 
N
R
 
G
P
 
A
M
 
L
L
 
V
I
 
L
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
L
R
 
S
I
 
V
D
 
G
Q
 
T
L
 
L
E
 
S
R
 
R
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
L
 
R
P
 
R
I
 
I
V
 
V
R
 
R
C
 
V
M
|
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
G
L
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
L
G
 
G
A
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
M
C
 
Y
A
 
A
N
 
E
G
 
A
R
 
E
V
 
V
S
 
S
P
 
E
P
 
T
Q
 
D
R
 
R
A
 
R
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
M
D
 
K
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
V
W
 
W
I
 
L
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
E
L
 
K
M
 
M
D
 
H
T
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
V
F
 
F
A
 
Y
L
 
L
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
D
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
M
 
F
P
 
D
R
 
M
E
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
L
Q
 
A
T
 
T
C
 
F
L
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
V
R
 
A
M
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
Q
S
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
D
P
 
F
A
 
E
E
 
K
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
R
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
S
P
 
K
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
Q
 
H
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
S
 
A
F
 
F
A
 
R
A
 
R
D
 
H
G
 
R
L
 
V
P
 
A
R
 
E
I
 
A
V
 
I
A
 
S
R
 
E
A
 
G
V
 
V
A
 
C
A
 
A
A
 
C
T
 
V
R
 
R
R
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
E
L
 
M

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:267/274 of query aligns to 11:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
R
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
K
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
L
A
 
S
-
 
P
S
 
S
S
 
R
V
 
I
S
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
 
H
R
 
S
A
 
N
E
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
T
L
 
A
G
 
F
R
 
E
E
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
T
C
 
V
Y
 
L
A
 
S
E
 
S
A
 
N
R
 
D
P
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
E
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
P
 
K
A
 
D
L
 
V
R
 
V
N
 
L
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
R
 
T
Q
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
K
I
 
M
D
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
G
 
H
Q
 
E
L
 
-
P
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
L
 
M
C
 
S
A
 
L
N
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
A
S
 
T
P
 
E
P
 
E
Q
 
D
R
 
A
A
 
N
L
 
L
A
 
I
Q
 
S
R
 
Q
I
 
L
L
 
F
D
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
L
 
K
T
 
I
R
 
-
W
 
W
I
 
K
D
 
A
D
 
D
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
T
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
A
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
D
T
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
M
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
|
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
S
 
E
F
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:267/274 of query aligns to 11:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
R
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
K
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
L
A
 
S
-
 
P
S
 
S
S
 
R
V
 
I
S
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
x
H
R
x
S
A
x
N
E
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
T
L
 
A
G
 
F
R
 
E
E
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
T
C
 
V
Y
 
L
A
 
S
E
 
S
A
x
N
R
 
D
P
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
E
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
x
L
L
 
L
P
 
K
A
 
D
L
x
V
R
 
V
N
 
L
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
R
 
T
Q
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
R
 
K
I
 
M
D
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
G
 
H
Q
 
E
L
 
-
P
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
L
 
M
C
 
S
A
 
L
N
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
A
S
 
T
P
 
E
P
 
E
Q
 
D
R
 
A
A
 
N
L
 
L
A
 
I
Q
 
S
R
 
Q
I
 
L
L
 
F
D
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
L
 
K
T
 
I
R
 
-
W
 
W
I
 
K
D
 
A
D
 
D
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
T
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
A
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
D
T
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
M
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
S
 
E
F
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:267/274 of query aligns to 11:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
N
x
K
M
|
M
A
 
A
R
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
K
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
L
A
 
S
-
 
P
S
 
S
S
 
R
V
 
I
S
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
x
H
R
 
S
A
 
N
E
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
T
L
 
A
G
 
F
R
 
E
E
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
T
C
 
V
Y
 
L
A
 
S
E
 
S
A
x
N
R
 
D
P
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
E
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
A
x
S
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
Q
V
x
L
L
 
L
P
 
K
A
 
D
L
x
V
R
 
V
N
 
L
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
R
 
T
Q
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
x
V
A
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
R
 
K
I
 
M
D
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
G
 
H
Q
 
E
L
 
-
P
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
|
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
L
 
M
C
 
S
A
 
L
N
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
A
S
 
T
P
 
E
P
 
E
Q
 
D
R
 
A
A
 
N
L
 
L
A
 
I
Q
 
S
R
 
Q
I
 
L
L
 
F
D
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
L
 
K
T
 
I
R
 
-
W
 
W
I
 
K
D
 
A
D
 
D
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
T
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
A
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
D
T
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
M
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
S
 
E
F
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:267/274 of query aligns to 11:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
I
 
L
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
K
M
 
M
A
 
A
R
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
L
 
V
K
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
L
A
 
S
-
 
P
S
 
S
S
 
R
V
 
I
S
 
K
V
 
T
A
 
A
E
 
I
P
 
H
R
 
S
A
 
N
E
 
P
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
T
L
 
A
G
 
F
R
 
E
E
 
S
F
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
T
C
 
V
Y
 
L
A
 
S
E
 
S
A
 
N
R
 
D
P
 
D
A
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
S
E
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
F
A
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
V
 
L
L
 
L
P
 
K
A
 
D
L
 
V
R
 
V
N
 
L
E
 
K
L
 
L
Q
 
K
D
 
P
V
 
L
L
 
L
R
 
T
Q
 
K
R
 
D
R
 
K
P
 
-
M
 
L
L
 
L
I
 
V
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
K
I
 
M
D
 
K
Q
 
D
L
 
L
E
 
Q
R
 
E
W
 
W
L
 
A
G
 
G
G
 
H
Q
 
E
L
 
-
P
 
R
I
 
F
V
 
I
R
 
R
C
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
T
I
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
S
G
 
V
L
 
M
C
 
S
A
 
L
N
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
A
S
 
T
P
 
E
P
 
E
Q
 
D
R
 
A
A
 
N
L
 
L
A
 
I
Q
 
S
R
 
Q
I
 
L
L
 
F
D
 
G
A
 
S
A
 
I
G
 
G
L
 
K
T
 
I
R
 
-
W
 
W
I
 
K
D
 
A
D
 
D
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
M
 
F
D
 
D
T
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
I
F
 
Y
A
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
D
T
 
L
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
M
 
M
L
 
A
A
 
T
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
K
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
D
V
 
V
T
 
T
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
Q
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
V
E
 
H
S
 
E
F
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
M
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
T
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
S
E
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
S

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 5:272/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
L
A
 
A
E
 
T
A
 
V
R
 
S
Q
 
A
E
 
L
L
 
-
G
 
-
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
|
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

5uatC Structure of human pycr-1 complexed with NADPH (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 7:277/277 of 5uatC

query
sites
5uatC
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
R
x
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
x
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
x
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
 
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 6:276/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

6xp1B Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-2-carboxylate (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 9:279/281 of 6xp1B

query
sites
6xp1B
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
|
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

5uavA Structure of human pycr-1 complexed with NADPH and l-tetrahydrofuroic acid (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 7:277/278 of 5uavA

query
sites
5uavA
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
R
x
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
x
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
x
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
|
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 3:273/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
x
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
x
E
D
x
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
|
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 5:275/277 of 2graA

query
sites
2graA
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
x
R
A
x
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
x
S
A
x
S
A
 
V
G
|
G
L
x
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
x
L
E
x
H
S
|
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 5:275/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
 
S
P
 
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
x
R
A
x
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
x
S
A
 
S
A
 
V
G
|
G
L
x
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
x
L
E
x
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
 
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

P32322 Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mitochondrial; P5C reductase 1; P5CR 1; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
34% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 3:273/319 of P32322

query
sites
P32322
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
|
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
 
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
x
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
|
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
Q
 
G
D
 
A
V
 
D
L
 
I
R
 
E
Q
 
D
R
 
R
R
 
H
P
 
-
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
 
M
P
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
x
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
x
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
x
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R
G
 
T
E
x
R
A
 
E
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
M
L
 
A
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2izzA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase
34% identity, 95% coverage: 4:262/274 of query aligns to 4:265/272 of 2izzA

query
sites
2izzA
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
N
x
Q
M
x
L
A
 
A
R
 
F
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
V
-
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
H
S
 
K
V
 
I
S
 
M
V
 
A
A
 
S
E
x
S
P
|
P
R
 
D
A
 
M
E
 
D
-
 
L
A
 
A
R
 
T
Q
 
V
E
 
S
L
 
A
G
 
L
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
K
C
 
L
Y
 
T
A
 
P
E
 
H
A
x
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
|
A
V
|
V
K
|
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
x
I
R
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
-
 
G
Q
 
A
D
 
D
V
 
I
L
 
-
R
 
-
Q
 
E
R
 
D
R
 
R
P
 
H
M
 
I
L
 
V
I
 
V
S
 
S
I
x
C
A
|
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
R
 
K
W
 
K
L
 
L
G
 
S
G
 
A
Q
 
F
L
 
R
P
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
I
 
V
V
 
I
R
 
R
C
 
C
M
|
M
P
x
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
A
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
V
L
 
Y
C
 
A
A
 
T
N
 
G
G
 
T
R
 
H
V
 
A
S
 
Q
P
 
V
P
 
E
Q
 
D
R
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
M
Q
 
E
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
C
R
 
T
W
 
E
I
 
V
D
 
E
D
 
E
E
 
D
A
 
-
L
 
L
M
 
I
D
 
D
T
 
A
V
 
V
T
 
T
A
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
F
 
F
A
 
T
L
 
A
V
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
G
V
 
V
A
 
K
Q
 
M
G
 
G
M
 
L
P
 
P
R
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
C
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
L
E
 
H
S
 
S
G
 
E
E
 
Q
A
 
H
P
 
P
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
R
 
D
R
 
N
V
 
V
T
 
S
S
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
Q
 
I
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
H
S
 
V
F
 
L
A
 
E
A
 
S
D
 
G
G
 
G
L
 
F
P
 
R
R
 
S
I
 
L
V
 
L
A
 
I
R
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
S
T
 
C
R
 
I
R
 
R

Q96C36 Pyrroline-5-carboxylate reductase 2; P5C reductase 2; P5CR 2; EC 1.5.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:271/274 of query aligns to 3:273/320 of Q96C36

query
sites
Q96C36
I
 
V
A
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
N
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
Y
S
 
A
L
 
L
I
 
A
G
 
R
G
 
G
L
 
F
L
 
T
K
 
A
T
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
H
-
 
K
-
 
I
A
 
I
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
P
S
 
E
V
 
M
A
 
N
E
 
L
P
 
P
R
 
T
A
 
V
E
 
S
A
 
A
R
 
L
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
R
E
 
K
F
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
N
C
 
L
Y
 
T
A
 
R
E
 
S
A
 
N
R
 
K
P
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
H
A
 
S
E
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
P
 
P
Q
 
H
V
 
I
L
 
I
P
 
P
A
 
F
L
 
I
R
 
L
N