SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2155 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2155 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4jdrA Dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase from escherichia coli (see paper)
63% identity, 79% coverage: 124:594/594 of query aligns to 1:471/471 of 4jdrA

query
sites
4jdrA
T
 
S
A
 
T
D
 
E
I
 
I
E
 
K
C
 
T
K
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
|
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
x
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
R
 
R
A
 
C
A
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
E
T
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
V
E
|
E
R
|
R
Y
|
Y
A
 
N
T
 
T
L
|
L
G
 
G
G
 
G
V
|
V
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
V
A
 
A
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
V
F
 
F
G
 
G
K
x
E
P
|
P
K
 
K
L
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
I
R
 
R
S
 
T
F
 
W
K
 
K
N
 
E
K
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
S
 
A
R
 
K
Q
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
V
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
V
x
L
G
|
G
S
 
K
F
 
F
V
 
T
S
 
G
P
 
A
H
 
N
E
 
T
L
 
L
E
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
G
A
 
E
E
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
V
V
 
I
R
 
N
F
 
F
E
 
D
H
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
|
A
G
|
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
I
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
F
F
 
I
P
 
P
W
 
H
D
 
E
D
 
D
E
 
P
R
 
R
V
 
I
M
 
W
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
|
I
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
M
A
 
G
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
V
 
I
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
M
M
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
K
D
 
D
L
 
I
I
 
V
K
 
K
P
 
V
L
 
F
A
 
T
K
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
S
G
 
K
K
 
K
L
 
F
K
 
N
G
 
-
V
 
L
H
 
M
L
 
L
K
 
E
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
A
 
V
K
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
E
K
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
G
 
G
D
 
K
S
 
K
I
 
A
P
 
P
-
 
A
E
 
E
T
 
P
K
 
Q
L
 
R
F
 
Y
D
 
D
R
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
V
P
 
P
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
N
I
 
L
G
 
D
A
 
A
D
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
D
E
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
K
Q
 
Q
M
 
L
R
 
R
T
 
T
N
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
G
T
x
V
H
 
H
E
 
E
A
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
K
K
 
K
S
 
H
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
A
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
D
 
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
Y
G
 
E
V
 
T
G
 
A
K
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
S
D
 
D
R
 
C
T
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
K
E
 
E
T
 
S
H
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
T
H
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
G
H
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
C
E
 
D
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
H
|
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
H
E
|
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
S
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
L
Y
 
P
M
x
N
P
|
P
K
 
K
R
 
A
K
 
K

P0A9P0 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2-oxoglutarate dehydrogenases complexes; Glycine cleavage system L protein; EC 1.8.1.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
63% identity, 79% coverage: 124:594/594 of query aligns to 2:472/474 of P0A9P0

query
sites
P0A9P0
T
 
S
A
 
T
D
 
E
I
 
I
E
 
K
C
 
T
K
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
R
 
R
A
 
C
A
 
A
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
E
T
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
V
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
N
T
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
V
A
 
A
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
K
A
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
K
L
 
I
R
 
R
S
 
T
F
 
W
K
 
K
N
 
E
K
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
S
 
A
R
 
K
Q
 
G
R
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
K
T
 
V
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
V
 
L
G
 
G
S
 
K
F
 
F
V
 
T
S
 
G
P
 
A
H
 
N
E
 
T
L
 
L
E
 
E
V
 
V
E
 
E
T
 
G
A
 
E
E
 
N
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
V
V
 
I
R
 
N
F
 
F
E
 
D
H
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
I
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
F
F
 
I
P
 
P
W
 
H
D
 
E
D
 
D
E
 
P
R
 
R
V
 
I
M
 
W
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
G
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
H
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
V
 
I
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
M
M
 
F
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
K
D
 
D
L
 
I
I
 
V
K
|
K
P
 
V
L
 
F
A
 
T
K
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
S
G
 
K
K
 
K
L
 
F
K
 
N
G
 
-
V
 
L
H
 
M
L
 
L
K
 
E
T
 
T
K
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
A
 
V
K
 
E
A
 
A
T
 
K
K
 
E
K
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
Y
V
 
V
A
 
T
Y
 
M
E
 
E
G
 
G
D
 
K
S
 
K
I
 
A
P
 
P
-
 
A
E
 
E
T
 
P
K
 
Q
L
 
R
F
 
Y
D
 
D
R
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
V
P
 
P
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
N
I
 
L
G
 
D
A
 
A
D
 
G
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
D
E
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
K
Q
 
Q
M
 
L
R
 
R
T
 
T
N
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
L
 
L
A
 
A
H
 
H
K
 
K
A
 
G
T
 
V
H
 
H
E
 
E
A
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
K
K
 
K
S
 
H
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
A
 
P
R
 
K
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
D
 
E
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
K
E
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
I
K
 
S
I
 
Y
G
 
E
V
 
T
G
 
A
K
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
S
D
 
D
R
 
C
T
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
K
E
 
E
T
 
S
H
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
T
H
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
G
E
 
E
I
 
I
T
 
G
H
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
C
E
 
D
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
H
 
H
P
 
A
H
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
H
E
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
S
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
L
Y
 
P
M
 
N
P
 
P
K
 
K
R
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

1bhyA Low temperature middle resolution structure of p64k from masc data (see paper)
60% identity, 76% coverage: 141:594/594 of query aligns to 19:482/482 of 1bhyA

query
sites
1bhyA
Y
 
Y
T
 
S
A
 
A
A
 
A
F
 
F
R
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
E
G
 
G
V
 
L
D
 
K
T
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
V
E
|
E
R
|
R
Y
|
Y
A
 
K
T
 
T
L
|
L
G
 
G
G
|
G
V
|
V
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
R
A
 
H
M
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
N
G
 
G
V
 
I
S
 
K
F
 
Y
G
 
P
K
 
E
P
 
P
K
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
M
L
 
L
R
 
R
S
 
A
F
 
Y
K
 
K
N
 
D
K
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
S
 
A
R
 
K
Q
 
S
R
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
D
T
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
V
x
D
G
|
G
S
 
Q
F
 
F
V
 
L
S
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
H
L
 
L
E
 
E
V
 
V
E
 
S
T
 
L
A
 
T
E
 
A
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
x
Y
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
E
K
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
V
R
 
A
F
 
F
E
 
K
H
 
N
A
 
C
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
|
A
G
|
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
V
V
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
F
F
 
I
P
 
P
W
 
-
D
 
E
D
 
D
E
 
P
R
 
R
V
 
I
M
 
I
D
 
D
S
 
S
T
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
|
I
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
M
A
 
G
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
G
S
 
S
E
 
R
V
 
L
T
 
D
V
 
V
V
 
V
E
 
E
F
 
M
M
 
M
D
 
D
Q
 
G
L
 
L
I
 
M
P
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
R
D
 
D
L
 
L
I
 
V
K
 
K
P
 
V
L
 
W
A
 
Q
K
 
K
R
 
Q
L
 
N
G
 
E
G
 
Y
K
 
R
L
 
F
K
 
D
G
 
N
V
 
I
H
 
M
L
 
V
K
 
N
T
 
T
K
 
K
V
 
T
T
 
V
E
 
A
A
 
V
K
 
E
A
 
P
T
 
K
K
 
E
K
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
Y
V
 
V
A
 
T
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
D
 
A
S
 
N
I
 
A
P
 
P
-
 
K
E
 
E
T
 
P
K
 
Q
L
 
R
F
 
Y
D
 
D
R
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
R
 
R
S
 
A
P
 
P
N
 
N
G
 
G
G
 
K
K
 
L
I
 
I
G
 
S
A
 
A
D
 
E
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
T
E
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
E
V
 
V
D
 
D
T
 
K
Q
 
Q
M
 
M
R
 
R
T
 
T
N
 
N
V
 
V
P
 
P
H
 
H
I
 
I
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
I
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
L
|
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
T
 
V
H
 
H
E
 
E
A
 
G
R
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
N
V
 
C
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
K
S
 
A
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
I
P
 
P
S
 
G
V
 
V
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
E
T
 
T
E
 
E
R
 
L
E
 
S
A
 
A
K
 
K
E
 
A
K
 
S
G
 
A
L
 
R
K
 
K
I
 
I
G
 
T
V
 
K
G
 
A
K
 
N
F
 
F
P
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
N
D
 
G
R
 
C
T
 
D
E
 
K
G
 
P
F
 
F
T
 
T
K
 
K
L
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
D
E
 
A
E
 
E
T
 
T
H
 
G
R
 
R
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
M
I
 
I
A
 
G
E
 
E
I
 
V
T
 
Y
H
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
M
 
M
G
 
G
S
 
C
E
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
L
 
K
T
 
T
I
 
I
H
|
H
P
 
P
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
|
E
S
 
S
V
 
I
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
Y
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
I
 
C
T
 
T
D
 
D
L
 
L
Y
 
-
M
 
P
P
|
P
K
x
Q
R
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P11959 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate complex; EC 1.8.1.4 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
45% identity, 77% coverage: 127:584/594 of query aligns to 8:463/470 of P11959

query
sites
P11959
I
 
I
E
 
E
C
 
T
K
 
E
L
 
T
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
K
T
 
V
V
 
T
L
 
I
V
 
V
E
|
E
R
x
K
Y
 
-
A
x
G
T
x
N
L
|
L
G
|
G
G
|
G
V
|
V
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
H
V
 
R
I
 
Y
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
A
 
H
M
 
S
A
 
E
A
 
E
H
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
K
F
 
A
G
 
E
K
 
N
P
 
V
K
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
F
D
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
Q
S
 
E
F
 
W
K
 
K
N
 
A
K
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
K
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
E
G
 
G
M
 
L
S
 
L
R
 
K
Q
 
G
R
 
N
K
 
K
V
 
V
R
 
E
T
 
I
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
V
 
E
G
 
A
S
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
D
P
 
A
H
 
N
E
 
T
L
 
V
E
 
R
V
 
V
E
 
V
T
 
N
A
 
G
E
 
D
G
 
S
K
 
A
K
 
Q
L
 
T
V
 
Y
R
 
T
F
 
F
E
 
K
H
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
T
G
 
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
I
K
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
N
F
 
F
P
 
K
W
 
F
D
 
S
D
 
N
E
 
-
R
 
R
V
 
I
M
 
L
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
N
L
 
L
K
 
G
D
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
K
K
 
S
L
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
N
L
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
I
V
 
L
E
 
E
F
 
G
M
 
A
D
 
G
Q
 
E
L
 
I
I
 
L
P
 
S
G
 
G
A
 
F
D
 
E
A
 
K
D
 
Q
L
 
M
I
 
A
K
 
A
P
 
I
L
 
I
A
 
K
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
-
G
 
-
K
 
K
L
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
V
H
 
E
L
 
V
K
 
V
T
 
T
K
 
N
V
 
A
T
 
L
E
 
A
A
 
K
K
 
G
A
 
A
T
 
E
K
 
E
K
 
R
-
 
E
-
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
G
 
A
D
 
N
S
 
G
I
 
E
P
 
T
E
 
K
T
 
T
K
 
I
L
 
D
F
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
R
P
 
P
N
 
N
G
 
T
G
 
D
K
 
E
I
 
L
G
 
G
A
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
K
V
 
M
T
 
T
E
 
N
R
 
R
G
 
G
F
 
L
I
 
I
N
 
E
V
 
V
D
 
D
T
 
Q
Q
 
Q
M
 
C
R
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
N
I
 
I
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
I
V
 
V
G
 
P
Q
 
G
P
 
P
M
 
A
L
 
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
T
 
S
H
 
Y
E
 
E
A
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
P
S
 
S
H
 
A
F
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
V
V
 
A
I
 
I
P
 
P
S
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
C
A
 
A
W
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
Y
T
 
F
E
 
E
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
E
 
D
K
 
E
G
 
G
L
 
I
K
 
D
I
 
V
G
 
I
V
 
A
G
 
A
K
 
K
F
 
F
P
 
P
W
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
V
F
 
V
D
 
R
E
 
K
E
 
E
T
 
D
H
 
G
R
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
S
D
 
D
L
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
L
T
 
G
H
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
M
 
A
G
 
G
S
 
M
E
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
H
 
H
P
 
A
H
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
 
E
S
 
I
V
 
A
G
 
M
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
Y
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T

1ebdA Dihydrolipoamide dehydrogenase complexed with the binding domain of the dihydrolipoamide acetylase (see paper)
45% identity, 76% coverage: 127:580/594 of query aligns to 2:453/455 of 1ebdA

query
sites
1ebdA
I
 
I
E
 
E
C
 
T
K
 
E
L
 
T
V
 
L
V
 
V
L
 
V
G
|
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
K
T
 
V
V
 
T
L
 
I
V
|
V
E
|
E
R
x
K
Y
 
-
A
 
G
T
 
N
L
|
L
G
 
G
G
|
G
V
|
V
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
I
H
 
S
A
 
A
A
 
S
A
 
H
V
 
R
I
 
Y
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
E
 
K
A
 
H
M
 
S
A
 
E
A
 
E
H
 
M
G
 
G
V
 
I
S
 
K
F
 
A
G
 
E
K
x
N
P
x
V
K
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
F
D
 
A
K
 
K
L
 
V
R
 
Q
S
 
E
F
 
W
K
 
K
N
 
A
K
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
K
Q
 
K
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
E
G
 
G
M
 
L
S
 
L
R
 
K
Q
 
G
R
 
N
K
 
K
V
 
V
R
 
E
T
 
I
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
V
x
E
G
x
A
S
 
Y
F
 
F
V
 
V
S
 
D
P
 
A
H
 
N
E
 
T
L
 
V
E
 
R
V
 
V
E
 
V
T
 
N
A
 
G
E
 
D
G
 
S
K
 
A
K
 
Q
L
 
T
V
 
Y
R
 
T
F
 
F
E
 
K
H
 
N
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
x
T
G
|
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
I
K
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
N
F
 
F
P
 
K
W
 
F
D
 
S
D
 
N
E
 
-
R
 
R
V
 
I
M
 
L
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
N
L
 
L
K
 
G
D
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
K
K
 
S
L
 
L
L
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
x
Y
I
|
I
G
 
G
L
 
I
E
|
E
M
 
L
A
 
G
T
 
T
V
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
N
L
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
I
V
 
L
E
 
E
F
 
G
M
 
A
D
 
G
Q
 
E
L
 
I
I
 
L
P
 
S
G
 
G
A
 
F
D
 
E
A
 
K
D
 
Q
L
 
M
I
 
A
K
 
A
P
 
I
L
 
I
A
 
K
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
-
G
 
-
K
 
K
L
 
K
K
 
K
G
 
G
V
 
V
H
 
E
L
 
V
K
 
V
T
 
T
K
 
N
V
 
A
T
 
L
E
 
A
A
 
K
K
 
G
A
 
A
T
 
E
K
 
E
K
 
R
-
 
E
-
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
T
Y
 
Y
E
 
E
G
 
A
D
 
N
S
 
G
I
 
E
P
 
T
E
 
K
T
 
T
K
 
I
L
 
D
F
 
A
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
G
R
|
R
S
 
R
P
 
P
N
 
N
G
 
T
G
 
D
K
 
E
I
 
L
G
 
G
A
 
L
D
 
E
K
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
K
V
 
M
T
 
T
E
 
N
R
 
R
G
 
G
F
 
L
I
 
I
N
 
E
V
 
V
D
 
D
T
 
Q
Q
 
Q
M
 
C
R
 
R
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
N
I
 
I
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
I
V
 
V
G
 
P
Q
 
G
P
 
P
M
x
A
L
|
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
T
x
S
H
 
Y
E
 
E
A
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
P
S
 
S
H
 
A
F
 
V
D
 
D
A
 
Y
R
 
V
V
 
A
I
 
I
P
 
P
S
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
C
A
 
A
W
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
Y
T
 
F
E
 
E
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
K
 
K
E
 
D
K
 
E
G
 
G
L
 
I
K
 
D
I
 
V
G
 
I
V
 
A
G
 
A
K
 
K
F
 
F
P
 
P
W
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
D
T
 
T
E
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
L
K
 
K
L
 
L
I
 
V
F
 
V
D
 
R
E
 
K
E
 
E
T
 
D
H
 
G
R
 
V
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
Q
I
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
S
D
 
D
L
 
M
I
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
L
T
 
G
H
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
M
 
A
G
 
G
S
 
M
E
 
T
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
I
G
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
H
|
H
P
 
A
H
|
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
G
E
|
E
S
 
I
V
 
A
G
 
M
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V

P14218 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex; EC 1.8.1.4 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
42% identity, 78% coverage: 131:594/594 of query aligns to 7:478/478 of P14218

query
sites
P14218
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
C
V
 
I
E
|
E
R
x
K
Y
|
Y
-
x
I
-
x
G
-
x
K
-
x
E
-
x
G
-
x
K
A
x
V
T
x
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
V
x
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
 
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
A
 
S
A
 
Y
V
 
K
I
 
Y
D
 
H
E
 
E
A
 
A
-
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
V
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
F
 
A
G
 
K
K
 
G
P
 
V
K
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
M
R
 
V
S
 
A
F
 
R
K
 
K
N
 
A
K
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
K
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
A
G
 
T
M
 
L
S
 
F
R
 
K
Q
 
A
R
 
N
K
 
G
V
 
V
R
 
T
T
 
S
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
V
 
H
G
|
G
S
 
K
F
 
L
V
 
L
S
 
A
P
 
N
H
 
K
E
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
T
T
 
G
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
E
F
 
A
E
 
E
H
 
N
A
 
V
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
P
F
 
A
P
 
P
W
 
L
D
 
S
D
 
D
E
 
D
R
 
I
V
 
I
M
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
K
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
G
T
 
S
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
A
M
 
L
D
 
D
Q
 
K
L
 
F
I
 
L
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
L
 
I
I
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
A
A
 
L
K
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
K
K
 
Q
L
 
G
K
 
L
G
 
N
V
 
I
H
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
T
 
T
E
 
A
A
 
S
K
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
K
K
 
K
G
 
Q
I
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
T
Y
 
F
E
 
T
G
 
D
D
 
A
S
 
N
I
 
G
P
 
E
E
 
Q
T
 
K
K
 
E
L
 
T
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
R
P
 
P
N
 
V
G
 
T
G
 
T
K
 
D
I
 
L
G
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
L
T
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
M
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
 
G
D
|
D
L
 
V
V
 
V
G
 
R
Q
 
G
P
 
A
M
 
M
L
 
L
A
|
A
H
 
H
K
 
K
A
 
A
T
 
S
H
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
V
V
 
M
A
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
K
S
 
A
H
 
Q
F
 
M
D
 
N
A
 
Y
R
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
A
 
I
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
K
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
E
 
T
A
 
L
K
 
K
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
K
 
E
I
 
V
G
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
A
I
 
A
D
 
N
R
 
D
T
 
T
E
 
T
G
 
G
F
 
L
T
 
V
K
 
K
L
 
V
I
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
A
E
 
K
T
 
T
H
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
V
A
 
H
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
S
A
 
A
G
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
Q
I
 
G
T
 
A
H
 
I
A
 
G
I
 
M
E
 
E
M
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
M
I
 
V
H
 
F
P
 
S
H
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
 
E
S
 
A
V
 
L
G
 
H
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
A
Y
 
V
E
 
N
G
 
G
T
 
H
I
 
A
T
 
I
D
 
H
L
 
I
Y
 
A
M
 
N
P
 
R
K
 
K
R
 
K
K
 
R

Sites not aligning to the query:

5u8uD Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa (see paper)
43% identity, 76% coverage: 131:583/594 of query aligns to 9:469/477 of 5u8uD

query
sites
5u8uD
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
x
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
C
V
 
I
E
|
E
R
x
K
Y
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
V
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
V
x
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
A
 
S
A
 
Y
V
 
K
I
 
Y
D
 
H
E
 
E
A
 
A
-
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
V
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
F
 
A
G
 
K
K
x
G
P
x
V
K
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
M
R
 
V
S
 
A
F
 
R
K
 
K
N
 
A
K
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
K
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
A
G
 
T
M
 
L
S
 
F
R
 
K
Q
 
A
R
 
N
K
 
G
V
 
V
R
 
T
T
 
S
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
V
x
H
G
|
G
S
 
K
F
 
L
V
 
L
S
 
A
P
 
N
H
 
K
E
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
T
T
 
G
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
E
F
 
A
E
 
E
H
 
N
A
 
V
I
 
I
I
 
I
A
|
A
A
x
S
G
|
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
P
F
 
A
P
 
P
W
 
L
D
 
T
D
 
D
E
 
D
R
 
I
V
 
I
M
 
V
D
 
D
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
K
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
T
 
S
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
A
M
 
L
D
 
D
Q
 
K
L
 
F
I
 
L
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
L
 
I
I
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
A
A
 
L
K
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
K
K
 
Q
L
 
G
K
 
L
G
 
N
V
 
I
H
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
T
 
T
E
 
A
A
 
S
K
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
K
K
 
K
G
 
Q
I
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
T
Y
 
F
E
 
T
G
 
D
D
 
A
S
 
N
I
 
G
P
 
E
E
 
Q
T
 
K
K
 
E
L
 
T
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
R
|
R
S
 
R
P
 
P
N
 
V
G
 
T
G
 
T
K
 
D
I
 
L
G
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
L
T
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
M
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
L
 
V
V
 
V
G
 
R
Q
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
T
x
S
H
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
V
V
 
M
A
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
K
S
 
A
H
 
Q
F
 
M
D
 
N
A
 
Y
R
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
A
 
I
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
K
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
E
 
T
A
 
L
K
 
K
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
K
 
E
I
 
V
G
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
A
I
 
A
D
 
N
R
 
D
T
 
T
E
 
T
G
 
G
F
 
L
T
 
V
K
 
K
L
 
V
I
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
A
E
 
K
T
 
T
H
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
V
A
 
H
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
S
A
 
A
G
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
Q
I
 
G
T
 
A
H
 
I
A
 
G
I
 
M
E
 
E
M
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
M
I
 
V
H
x
F
P
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
|
E
S
 
A
V
 
L
G
 
H
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
A
Y
 
V
E
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5u8vA Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa bound to NAD+ (see paper)
43% identity, 76% coverage: 131:583/594 of query aligns to 5:465/472 of 5u8vA

query
sites
5u8vA
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
x
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
C
V
 
I
E
|
E
R
 
K
Y
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
V
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
V
x
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
A
 
S
A
 
Y
V
 
K
I
 
Y
D
 
H
E
 
E
A
 
A
-
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
V
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
F
 
A
G
 
K
K
x
G
P
x
V
K
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
M
R
 
V
S
 
A
F
 
R
K
 
K
N
 
A
K
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
K
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
A
G
 
T
M
 
L
S
 
F
R
 
K
Q
 
A
R
 
N
K
 
G
V
 
V
R
 
T
T
 
S
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
V
x
H
G
|
G
S
 
K
F
 
L
V
 
L
S
 
A
P
 
N
H
 
K
E
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
T
T
 
G
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
E
F
 
A
E
 
E
H
 
N
A
 
V
I
 
I
I
 
I
A
|
A
A
x
S
G
|
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
P
F
 
A
P
 
P
W
 
L
D
 
T
D
 
D
E
 
D
R
 
I
V
 
I
M
 
V
D
 
D
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
K
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
G
V
 
V
V
x
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
I
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
T
 
S
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
x
L
E
|
E
F
x
A
M
 
L
D
 
D
Q
 
K
L
 
F
I
 
L
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
L
 
I
I
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
A
A
 
L
K
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
K
K
 
Q
L
 
G
K
 
L
G
 
N
V
 
I
H
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
A
K
 
R
V
|
V
T
 
T
E
 
A
A
 
S
K
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
K
K
 
K
G
 
Q
I
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
T
Y
 
F
E
 
T
G
 
D
D
 
A
S
 
N
I
 
G
P
 
E
E
 
Q
T
 
K
K
 
E
L
 
T
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
V
|
V
G
|
G
R
|
R
S
 
R
P
 
P
N
 
V
G
 
T
G
 
T
K
 
D
I
 
L
G
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
L
T
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
M
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
L
 
V
V
 
V
G
 
R
Q
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
T
x
S
H
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
V
V
 
M
A
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
K
S
 
A
H
 
Q
F
 
M
D
 
N
A
 
Y
R
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
V
A
 
I
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
K
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
E
 
T
A
 
L
K
 
K
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
K
 
E
I
 
V
G
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
A
I
 
A
D
 
N
R
 
D
T
 
T
E
 
T
G
 
G
F
 
L
T
 
V
K
 
K
L
 
V
I
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
A
E
 
K
T
 
T
H
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
V
A
 
H
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
S
A
 
A
G
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
Q
I
 
G
T
 
A
H
 
I
A
 
G
I
 
M
E
 
E
M
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
M
I
 
V
H
x
F
P
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
|
E
S
 
A
V
 
L
G
 
H
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
A
Y
 
V
E
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5u8wA Dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdg) from pseudomonas aeruginosa bound to nadh (see paper)
43% identity, 76% coverage: 131:583/594 of query aligns to 6:466/473 of 5u8wA

query
sites
5u8wA
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
x
I
G
 
G
S
 
A
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
K
T
 
T
V
 
A
L
 
C
V
 
I
E
|
E
R
x
K
Y
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
V
T
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
V
x
T
C
|
C
L
 
L
N
 
N
V
 
V
G
|
G
C
|
C
I
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
D
A
 
S
A
 
S
A
 
Y
V
 
K
I
 
Y
D
 
H
E
 
E
A
 
A
-
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
F
A
 
K
A
 
V
H
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
E
F
 
A
G
 
K
K
x
G
P
x
V
K
 
T
L
 
I
D
 
D
L
 
V
D
 
P
K
 
A
L
 
M
R
 
V
S
 
A
F
 
R
K
 
K
N
 
A
K
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
K
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
A
 
A
G
 
T
M
 
L
S
 
F
R
 
K
Q
 
A
R
 
N
K
 
G
V
 
V
R
 
T
T
 
S
V
 
F
Q
 
E
G
 
G
V
x
H
G
|
G
S
 
K
F
 
L
V
 
L
S
 
A
P
 
N
H
 
K
E
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
V
E
 
T
T
 
G
A
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
-
 
T
K
 
Q
L
 
V
V
 
L
R
 
E
F
 
A
E
 
E
H
 
N
A
 
V
I
 
I
I
 
I
A
|
A
A
x
S
G
|
G
S
 
S
Q
 
R
S
 
P
V
 
V
K
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
P
F
 
A
P
 
P
W
 
L
D
 
T
D
 
D
E
 
D
R
 
I
V
 
I
M
 
V
D
 
D
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
K
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
K
K
 
K
L
 
L
L
 
G
V
 
V
V
x
I
G
 
G
G
 
A
G
|
G
I
x
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
T
 
S
V
 
V
Y
 
W
A
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
V
 
V
V
 
L
E
|
E
F
x
A
M
x
L
D
 
D
Q
 
K
L
 
F
I
 
L
P
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
E
D
 
Q
L
 
I
I
 
A
K
 
K
P
 
E
L
 
A
A
 
L
K
 
K
R
 
V
L
 
L
G
 
T
G
 
K
K
 
Q
L
 
G
K
 
L
G
 
N
V
 
I
H
 
R
L
 
L
K
 
G
T
 
A
K
 
R
V
 
V
T
 
T
E
 
A
A
 
S
K
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
K
K
 
K
G
 
Q
I
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
T
Y
 
F
E
 
T
G
 
D
D
 
A
S
 
N
I
 
G
P
 
E
E
 
Q
T
 
K
K
 
E
L
 
T
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
I
V
 
V
A
|
A
V
|
V
G
|
G
R
|
R
S
 
R
P
 
P
N
 
V
G
 
T
G
 
T
K
 
D
I
 
L
G
 
L
A
 
A
D
 
A
K
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
L
T
 
D
E
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
F
I
 
I
N
 
Y
V
 
V
D
 
D
T
 
D
Q
 
H
M
 
C
R
 
K
T
 
T
N
 
S
V
 
V
P
 
P
H
 
G
I
 
V
F
 
F
A
 
A
I
 
I
G
|
G
D
|
D
L
 
V
V
 
V
G
 
R
Q
 
G
P
 
A
M
|
M
L
|
L
A
|
A
H
|
H
K
 
K
A
 
A
T
x
S
H
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
V
V
 
M
A
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
R
V
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
H
K
 
K
S
 
A
H
 
Q
F
 
M
D
 
N
A
 
Y
R
 
D
V
 
L
I
 
I
P
 
P
S
 
S
V
|
V
A
 
I
F
x
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
W
 
W
V
 
V
G
 
G
V
 
K
T
 
T
E
 
E
R
 
Q
E
 
T
A
 
L
K
 
K
E
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
V
K
 
E
I
 
V
G
 
N
V
 
V
G
 
G
K
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
F
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
A
I
 
A
D
 
N
R
 
D
T
 
T
E
 
T
G
 
G
F
 
L
T
 
V
K
 
K
L
 
V
I
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
A
E
 
K
T
 
T
H
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
G
 
G
G
 
V
A
 
H
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
S
A
 
A
G
 
A
D
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
Q
E
 
Q
I
 
G
T
 
A
H
 
I
A
 
G
I
 
M
E
 
E
M
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
S
A
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
M
I
 
V
H
x
F
P
 
S
H
|
H
P
|
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
E
|
E
S
 
A
V
 
L
G
 
H
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
L
V
 
A
Y
 
V
E
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6uziC Crystal structure of dihydrolipoyl dehydrogenase from elizabethkingia anophelis nuhp1
45% identity, 75% coverage: 133:578/594 of query aligns to 11:459/470 of 6uziC

query
sites
6uziC
V
 
V
L
x
I
G
|
G
S
 
S
G
|
G
P
|
P
G
|