SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2182 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2182 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P76558 NADP-dependent malic enzyme; NADP-ME; EC 1.1.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
59% identity, 99% coverage: 5:755/761 of query aligns to 3:757/759 of P76558

query
sites
P76558
E
 
D
E
 
Q
L
 
L
R
 
K
L
 
Q
A
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
D
Y
 
F
H
 
H
R
 
E
L
 
F
P
 
P
R
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
A
 
P
T
 
T
K
 
K
A
 
P
M
 
L
V
 
A
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
A
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
A
 
P
C
 
C
E
 
L
A
 
E
I
 
I
V
 
E
E
 
K
D
 
D
A
 
P
N
 
L
A
x
K
A
 
A
S
 
Y
E
 
K
M
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
D
 
D
E
 
E
R
 
L
D
 
D
P
 
P
D
 
D
K
 
K
L
 
F
V
 
I
D
 
E
I
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
I
 
Y
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
K
 
K
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
M
 
M
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
 
D
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
S
G
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
G
L
 
L
E
 
R
V
 
V
V
 
V
G
 
E
K
 
K
K
 
N
I
 
I
E
 
S
D
 
D
V
 
V
K
 
R
L
 
M
A
 
V
T
 
V
A
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
I
A
 
A
C
 
C
L
 
M
D
 
N
M
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
P
 
K
E
 
H
H
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
V
Y
 
C
D
 
D
R
 
S
E
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
D
 
E
-
 
P
H
 
N
M
 
M
D
 
A
P
 
E
D
 
T
K
 
K
Q
 
A
R
 
A
Y
 
Y
A
 
A
R
 
V
-
 
V
D
 
D
T
 
D
K
 
G
A
 
K
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
D
E
 
D
I
 
V
V
 
I
D
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
C
S
 
S
A
 
G
G
 
P
G
 
K
V
 
V
L
 
L
K
 
T
P
 
Q
E
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
K
T
 
K
M
 
M
G
 
A
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
I
 
M
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
N
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
P
D
 
L
A
 
A
Q
 
K
R
 
E
V
 
V
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
C
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
C
F
 
F
P
 
P
Y
 
F
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
A
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
T
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
H
M
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
S
D
 
E
L
 
V
-
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
D
D
 
Q
V
 
D
P
 
L
T
 
S
F
 
F
G
 
G
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
V
M
 
K
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
E
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R
P
 
P
I
 
I
T
 
A
D
 
D
M
 
F
D
 
D
A
 
V
Y
 
Y
K
 
I
E
 
D
K
 
K
L
 
L
G
 
T
Q
 
E
F
 
F
I
 
V
Y
 
Y
R
 
K
T
 
T
G
 
N
L
 
L
L
 
F
M
 
M
K
 
K
P
 
P
V
 
I
Y
 
F
E
 
S
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
K
D
 
A
R
 
P
K
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
V
Y
 
L
A
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
E
E
 
A
T
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
H
A
 
A
V
 
T
Q
 
Q
T
 
E
V
 
L
I
 
V
D
 
T
E
 
L
R
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
K
P
 
P
I
 
I
L
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
P
 
P
S
 
N
V
 
V
I
 
I
E
 
E
T
 
M
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
M
 
I
K
 
K
E
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
F
E
 
E
L
 
I
T
 
V
N
 
N
I
 
N
D
 
E
D
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
F
 
F
N
 
K
D
 
E
Y
 
Y
W
 
W
Q
 
T
Q
 
E
Y
 
Y
H
 
F
A
 
Q
L
 
I
T
 
M
E
 
K
R
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
V
S
 
T
P
 
Q
A
 
E
A
 
Q
A
 
A
K
 
Q
N
 
R
L
 
A
L
 
L
R
 
I
S
 
S
R
 
N
P
 
P
T
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
G
S
 
A
L
 
I
M
 
M
V
 
V
E
 
Q
R
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
I
 
I
C
 
C
G
 
G
L
 
T
V
 
V
G
 
G
R
 
D
F
 
Y
H
 
H
K
 
E
K
 
H
L
 
F
G
 
S
Y
 
V
M
 
V
R
 
K
S
 
N
V
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
Y
D
 
R
P
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
C
 
T
T
 
A
S
 
G
A
 
A
M
 
M
T
 
N
G
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
L
D
 
P
Q
 
S
G
 
G
A
 
N
W
 
T
F
 
F
F
 
I
L
 
A
D
 
D
T
 
T
H
 
Y
V
 
V
Q
 
N
V
 
D
D
 
E
P
 
P
S
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
I
T
 
T
L
 
L
Q
 
M
A
 
A
S
 
A
Y
 
E
R
 
T
L
 
V
K
 
R
L
 
R
F
 
F
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
H
 
H
S
 
S
N
 
N
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
H
 
S
D
 
D
N
 
C
P
 
P
S
 
S
A
 
S
A
 
S
K
 
K
M
 
M
R
 
R
K
 
Q
V
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
V
K
 
R
S
 
E
R
 
R
L
 
A
P
 
P
K
 
E
L
 
L
E
 
M
M
 
I
D
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
M
Q
 
H
A
 
G
D
 
D
T
 
A
A
 
A
W
 
L
D
 
V
E
 
E
G
 
A
L
 
I
R
 
R
T
 
N
R
 
D
M
 
R
F
 
M
P
 
P
N
 
D
T
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
K
G
 
G
R
 
S
A
 
A
N
 
N
L
 
I
F
 
L
V
 
V
M
 
M
P
 
P
N
 
N
L
 
M
D
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
R
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
N
 
N
M
 
L
V
 
L
R
 
R
V
 
V
-
 
S
M
 
S
T
 
S
D
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
T
I
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
L
 
L
M
 
M
G
 
G
I
 
V
D
 
A
K
 
K
P
 
P
A
 
V
H
 
H
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
I
S
 
A
T
 
S
P
 
V
R
 
R
R
 
R
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
M
T
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
A
 
V
V
 
V
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
I
 
T
R
 
Q

6zngF Maeb full-length acetyl-coa bound state (see paper)
45% identity, 99% coverage: 11:761/761 of query aligns to 8:753/753 of 6zngF

query
sites
6zngF
A
 
A
L
 
L
E
 
L
Y
 
Y
H
 
H
R
 
Q
L
 
Q
P
 
G
R
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
E
V
 
V
S
 
I
A
 
S
T
 
S
K
 
K
A
 
P
M
 
C
V
 
A
T
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
A
 
P
C
 
C
E
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
D
 
D
A
 
P
N
 
A
A
 
K
A
 
V
S
 
Y
E
 
D
M
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
D
 
A
E
 
A
R
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
L
 
F
V
 
C
D
 
N
I
 
A
I
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
I
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
K
R
 
E
M
 
M
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
C
E
 
S
V
 
I
V
 
T
G
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
M
E
 
E
D
 
T
V
 
V
K
 
R
L
 
I
A
 
V
T
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
G
 
A
I
 
N
A
 
S
C
 
C
L
 
A
D
 
K
M
 
I
L
 
F
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
R
P
 
R
E
 
E
H
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
M
Y
 
C
D
 
D
R
 
S
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
T
 
K
G
 
G
R
 
R
D
 
T
H
 
A
-
 
G
M
 
M
D
 
N
P
 
K
D
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
S
D
 
E
T
 
T
K
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
I
 
A
V
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
L
A
 
K
T
 
D
M
 
M
G
 
A
R
 
K
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
D
D
 
K
A
 
A
Q
 
R
R
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
T
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
M
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
E
G
 
G
G
 
G
D
 
K
V
 
S
P
 
F
T
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
L
V
 
L
M
 
W
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R
P
 
A
I
 
I
T
 
E
D
 
D
M
 
W
D
 
D
A
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
S
L
 
L
G
 
E
Q
 
A
F
 
L
I
 
Q
Y
 
G
R
 
P
T
 
S
G
 
K
L
 
V
L
 
F
M
 
I
K
 
R
P
 
S
V
 
A
Y
 
I
E
 
N
R
 
R
A
 
V
R
 
H
A
 
Q
D
 
N
R
 
S
K
 
A
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
R
 
R
V
 
I
V
 
V
Y
 
F
A
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
T
E
 
S
E
 
T
T
 
K
V
 
V
L
 
L
R
 
K
A
 
A
V
 
L
Q
 
A
T
 
T
V
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
E
R
 
K
L
 
I
A
 
C
F
 
Q
P
 
P
I
 
I
L
 
L
I
 
L
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
S
 
E
V
 
R
I
 
V
E
 
K
T
 
E
R
 
K
I
 
I
Q
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
D
L
 
I
R
 
P
M
 
L
K
 
L
E
 
N
G
 
-
V
 
-
D
 
D
F
 
V
E
 
S
L
 
I
T
 
V
N
 
H
I
 
P
D
 
S
D
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
K
F
 
Y
N
 
F
D
 
S
Y
 
F
W
 
V
Q
 
E
Q
 
K
Y
 
L
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
T
x
R
E
 
Q
R
 
R
R
x
K
G
 
G
V
 
I
S
 
N
P
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
A
K
 
E
N
 
R
L
 
L
L
 
M
R
 
-
S
 
A
R
 
D
P
 
P
T
 
N
L
 
Y
I
 
F
A
 
A
S
 
A
L
 
M
M
 
M
V
 
V
E
 
N
R
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
G
M
 
M
I
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
S
V
 
S
G
 
I
R
 
N
F
x
Y
H
x
A
K
 
D
K
 
A
L
 
V
G
x
R
Y
 
P
M
 
I
R
x
L
S
 
Q
V
 
T
F
 
I
G
 
G
L
 
V
-
 
Y
D
 
K
P
 
E
G
 
G
V
 
I
Q
 
-
C
 
-
T
x
P
S
 
A
A
 
G
M
 
L
T
 
N
G
 
F
V
 
V
I
 
L
N
 
L
D
 
E
Q
 
D
G
 
K
A
 
F
W
 
L
F
 
V
F
 
L
L
 
A
D
 
D
T
 
T
H
x
T
V
|
V
Q
x
N
V
x
L
D
 
N
P
 
P
S
 
T
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
I
 
C
A
 
A
E
 
Q
A
 
I
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
Y
 
K
R
 
I
L
 
V
K
 
E
L
 
Y
F
 
F
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
H
x
Y
S
 
S
N
 
N
Y
 
F
-
 
S
G
 
G
S
 
A
H
 
E
D
 
G
N
 
T
P
 
P
S
 
R
A
 
-
A
 
-
K
 
K
M
 
M
R
 
K
K
 
K
V
 
A
Y
 
A
E
 
E
L
 
I
L
 
A
K
 
R
S
 
S
R
 
L
L
 
R
P
 
P
K
 
D
L
 
L
E
 
M
M
 
I
D
 
E
G
 
G
E
 
D
M
 
M
Q
|
Q
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
W
 
V
D
 
N
E
 
P
G
 
E
L
 
I
R
 
M
T
 
E
R
 
R
M
 
L
F
 
F
P
 
P
N
 
F
T
 
S
T
 
G
L
 
L
T
 
K
G
 
G
R
 
G
A
 
A
N
 
N
L
 
V
F
 
L
V
 
V
M
 
F
P
 
P
N
 
N
L
|
L
D
 
E
A
 
S
A
 
S
N
|
N
I
 
I
T
 
A
Y
 
Y
N
 
K
M
 
L
V
 
I
R
 
Q
V
 
Q
M
 
I
T
 
G
D
 
K
G
 
A
V
 
E
A
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
I
 
F
L
 
L
M
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
R
K
 
R
P
 
S
A
 
A
H
 
N
I
 
V
L
 
L
T
x
Q
P
 
R
A
 
T
S
 
T
T
 
T
P
 
V
R
 
D
R
 
G
V
 
I
V
 
V
N
 
N
M
 
S
T
 
V
A
 
V
I
 
F
A
 
T
A
 
A
V
 
L
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
-
 
Y
I
 
I
R
 
K
G
 
E
Q
 
V
Q
 
L
K
 
K
S
 
S
R
 
R

6zn4A Maeb malic enzyme domain apoprotein (see paper)
59% identity, 52% coverage: 11:407/761 of query aligns to 7:405/406 of 6zn4A

query
sites
6zn4A
A
 
A
L
 
L
E
 
L
Y
 
Y
H
 
H
R
 
Q
L
 
Q
P
 
G
R
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
E
V
 
V
S
 
I
A
 
S
T
 
S
K
 
K
A
 
P
M
 
C
V
 
A
T
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
A
 
P
C
 
C
E
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
D
 
D
A
 
P
N
 
A
A
 
K
A
 
V
S
 
Y
E
 
D
M
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
D
 
A
E
 
A
R
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
L
 
F
V
 
C
D
 
N
I
 
A
I
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
I
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
K
R
 
E
M
 
M
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
C
E
 
S
V
 
I
V
 
T
G
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
M
E
 
E
D
 
T
V
 
V
K
 
R
L
 
I
A
 
V
T
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
G
 
A
I
 
N
A
 
S
C
 
C
L
 
A
D
 
K
M
 
I
L
 
F
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
R
P
 
R
E
 
E
H
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
M
Y
 
C
D
 
D
R
 
S
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
T
 
K
G
 
G
R
 
R
D
 
T
H
 
A
-
 
G
M
 
M
D
 
N
P
 
K
D
 
Y
K
 
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
S
D
 
E
T
 
T
K
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
I
 
A
V
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
L
A
 
K
T
 
D
M
 
M
G
 
A
R
 
K
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
D
D
 
K
A
 
A
Q
 
R
R
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
T
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
M
 
E
E
 
D
A
 
V
G
 
P
D
 
D
L
 
K
A
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
K
V
 
S
P
 
F
T
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
L
V
 
L
M
 
W
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R

6zn7A Maeb malic enzyme domain apoprotein (see paper)
59% identity, 52% coverage: 11:407/761 of query aligns to 7:405/405 of 6zn7A

query
sites
6zn7A
A
 
A
L
 
L
E
 
L
Y
 
Y
H
 
H
R
 
Q
L
 
Q
P
 
G
R
 
K
P
 
P
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
E
V
 
V
S
 
I
A
 
S
T
 
S
K
 
K
A
 
P
M
 
C
V
 
A
T
 
T
Q
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
S
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
A
 
P
C
 
C
E
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
D
 
D
A
 
P
N
 
A
A
 
K
A
 
V
S
 
Y
E
 
D
M
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
Q
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
V
D
 
A
E
 
A
R
 
T
D
 
D
P
 
V
D
 
D
K
 
V
L
 
F
V
 
C
D
 
N
I
 
A
I
 
V
A
 
R
S
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
A
P
 
P
E
 
E
C
 
C
F
 
F
I
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
K
E
 
K
R
 
E
M
 
M
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
C
E
 
S
V
 
I
V
 
T
G
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
M
E
 
E
D
 
T
V
 
V
K
 
R
L
 
I
A
 
V
T
 
V
A
x
N
G
 
G
A
|
A
G
|
G
A
|
A
A
x
S
G
 
A
I
 
N
A
 
S
C
 
C
L
 
A
D
 
K
M
 
I
L
 
F
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
R
P
 
R
E
 
E
H
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
M
Y
 
C
D
|
D
R
x
S
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
T
 
K
G
 
G
R
 
R
D
 
T
H
 
A
-
 
G
M
 
M
D
 
N
P
 
K
D
 
Y
K
|
K
Q
 
E
R
 
Y
Y
 
F
A
 
A
R
 
S
D
 
E
T
 
T
K
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
I
 
A
V
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
V
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
|
L
S
|
S
A
x
V
G
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
M
V
 
L
A
 
K
T
 
D
M
 
M
G
 
A
R
 
K
Q
 
D
P
 
P
I
 
I
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
x
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
E
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
D
D
 
K
A
 
A
Q
 
R
R
 
A
V
 
A
R
 
R
P
 
P
D
 
D
C
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
|
V
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
T
G
 
R
A
 
S
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
N
 
N
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
T
 
L
A
 
A
C
 
A
V
 
V
R
 
H
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
M
 
E
E
 
D
A
 
V
G
 
P
D
 
D
L
 
K
A
 
V
S
 
S
A
 
A
-
 
T
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
K
V
 
S
P
 
F
T
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
R
 
K
P
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
T
R
 
R
L
 
V
L
 
L
V
 
L
M
 
W
L
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
R
 
R

5ceeA Malic enzyme from candidatus phytoplasma aywb in complex with NAD and mg2+ (see paper)
46% identity, 48% coverage: 36:404/761 of query aligns to 29:385/387 of 5ceeA

query
sites
5ceeA
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
V
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
E
A
 
P
C
 
C
E
 
L
A
 
K
I
 
I
V
 
K
E
 
E
D
 
N
A
 
P
N
 
S
A
 
D
A
 
V
S
 
Y
E
 
R
M
 
Y
T
 
T
A
 
M
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
M
V
 
V
A
 
G
V
 
V
I
 
I
T
 
T
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
K
A
 
A
G
 
S
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
I
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
E
F
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
V
 
S
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
I
 
I
D
 
D
E
 
S
R
 
T
D
 
D
P
 
S
D
 
Q
K
 
E
L
 
I
V
 
V
D
 
N
I
 
I
I
 
V
A
 
S
S
 
K
L
 
I
E
 
S
P
 
T
T
 
V
F
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
K
A
 
S
P
 
P
E
 
Q
C
 
C
F
 
I
I
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
D
K
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
A
R
 
K
M
 
L
K
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
I
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
K
K
 
K
K
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
V
A
 
V
T
 
I
A
x
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
 
S
A
|
A
G
 
G
I
 
M
A
 
A
C
 
I
L
 
A
D
 
K
M
 
M
L
 
L
V
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
V
E
 
N
H
 
N
I
 
V
L
 
V
A
 
L
Y
 
V
D
|
D
R
x
K
E
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
T
 
K
G
 
G
R
 
V
D
 
A
H
 
N
M
 
L
D
 
N
P
 
E
D
 
P
K
 
Q
Q
 
K
R
 
K
Y
 
L
A
 
V
R
 
E
D
 
V
T
 
T
K
 
N
A
 
K
R
 
Y
-
 
Q
-
 
E
-
 
K
-
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
K
E
 
E
I
 
V
V
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
D
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
x
V
S
|
S
A
 
A
G
 
P
G
 
G
V
x
I
L
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
E
M
 
M
V
 
V
A
 
A
T
 
T
M
 
M
G
 
A
R
 
K
Q
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
A
L
|
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
M
P
 
P
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
V
 
G
R
 
G
P
 
A
D
 
R
C
 
-
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
|
V
N
 
N
N
|
N
A
 
C
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
V
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
K
A
 
A
T
 
T
G
 
Q
I
 
I
N
 
T
E
 
E
A
 
E
M
 
M
K
 
K
T
 
K
A
 
A
C
 
A
V
 
T
R
 
Y
A
 
A
I
 
L
A
 
K
Q
 
N
L
 
I
A
 
I
R
 
K
M
 
E
E
 
Q
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
D
F
 
L
G
 
N
P
 
E
D
 
N
Y
 
N
L
 
I
I
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
S
F
 
F
D
 
N
P
 
K
R
 
E
L
 
V
L
 
V
V
 
K
M
 
Q
L
 
I
A
 
A
P
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
C
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
M
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
V
 
V

2dvmA NAD complex structure of ph1275 protein from pyrococcus horikoshii
41% identity, 58% coverage: 7:448/761 of query aligns to 1:433/438 of 2dvmA

query
sites
2dvmA
L
 
I
R
 
R
L
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
H
 
H
R
 
K
-
 
N
-
 
N
L
 
F
P
 
P
R
 
G
P
 
N
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
E
V
 
V
S
 
I
A
 
P
T
 
K
K
 
V
A
 
S
M
 
L
V
 
E
T
 
S
Q
 
R
R
 
E
D
 
E
L
 
L
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
E
A
 
P
C
 
C
E
 
K
A
 
E
I
 
I
V
 
A
E
 
R
D
 
D
A
 
P
N
 
G
A
 
K
A
 
V
S
 
Y
E
 
E
M
 
Y
T
 
T
A
 
S
R
 
K
G
 
G
N
 
N
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
x
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
L
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
R
F
 
F
A
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
M
I
 
I
D
 
K
E
 
E
R
 
Q
D
 
E
P
 
P
D
 
N
K
 
K
L
 
F
V
 
I
D
 
D
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
I
E
 
A
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
A
A
 
S
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
I
 
Y
V
 
I
E
 
L
R
 
E
K
 
R
L
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
E
M
 
L
K
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
S
D
 
E
V
 
I
K
 
T
L
 
L
A
 
A
T
 
L
A
 
F
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
F
A
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
R
M
 
I
L
 
L
V
 
T
A
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
H
 
N
I
 
V
-
 
R
-
 
V
-
x
V
-
x
E
L
|
L
A
 
V
Y
 
N
D
 
G
R
 
K
E
x
P
G
 
R
V
 
I
L
 
L
Y
 
T
T
 
S
G
 
D
R
 
L
D
 
D
-
 
L
-
 
E
H
 
K
M
 
L
D
 
F
P
 
P
D
 
Y
K
 
R
Q
 
G
R
 
W
Y
 
L
A
 
L
R
 
K
D
 
K
T
 
T
K
 
N
A
 
G
R
 
E
T
 
N
L
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
P
A
 
Q
E
 
E
I
 
A
V
 
L
D
 
K
G
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
F
 
L
L
 
I
G
 
S
L
x
F
S
x
T
-
 
R
-
 
P
A
 
G
G
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
I
K
 
K
P
 
P
E
 
Q
M
 
W
V
 
I
A
 
E
T
 
K
M
 
M
G
 
N
R
 
E
Q
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
P
L
|
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
E
D
 
E
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
R
C
 
-
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
L
L
 
L
C
 
G
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
G
 
R
A
 
A
T
 
R
G
 
T
I
 
I
N
 
T
E
 
D
A
 
S
M
 
M
K
 
I
T
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
A
R
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
L
 
I
A
 
V
R
 
E
M
 
E
E
 
P
A
 
S
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
E
D
 
E
Y
 
N
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
S
P
 
P
F
 
L
D
 
N
P
 
P
R
 
I
L
 
V
L
 
Y
V
 
A
M
 
R
L
 
E
A
 
A
P
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
E
A
 
A
M
 
M
D
 
K
S
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
R
R
 
T
P
 
K
I
 
V
T
 
K
D
 
-
M
 
-
D
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
Q
 
E
F
 
W
I
 
V
Y
 
E
R
 
E
T
 
H
G
 
T
L
 
I
L
 
R
M
 
L
K
 
I
P
 
E
V
 
F
Y
 
Y
E
 
E
R
 
N
A
 
V
R
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
I
D
 
N
R
 
K
K
 
K
R
 
R
V
 
R
V
 
E
Y
 
Y
A
 
S
E
 
K

2a9fA Crystal structure of a putative malic enzyme ((s)-malate:nad+ oxidoreductase (decarboxylating))
47% identity, 44% coverage: 21:354/761 of query aligns to 18:350/383 of 2a9fA

query
sites
2a9fA
G
 
G
K
 
K
I
 
L
K
 
E
V
 
V
S
 
Q
A
 
P
T
 
K
K
 
V
A
 
D
M
 
I
V
 
K
T
 
T
Q
 
K
R
 
H
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
S
A
 
V
C
 
S
E
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
A
E
 
K
D
 
D
A
 
K
N
 
T
A
 
L
A
 
A
S
 
Y
E
 
D
M
 
L
T
 
T
A
 
T
R
 
K
G
 
K
N
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
E
A
 
A
G
 
A
K
 
M
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
A
F
 
I
D
 
P
I
 
I
E
 
V
I
 
L
D
 
D
E
 
T
R
 
K
D
 
D
P
 
T
D
 
E
K
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
S
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
L
E
 
A
P
 
P
T
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
S
A
 
A
P
 
P
E
 
R
C
 
C
F
 
F
I
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
I
E
 
K
R
 
E
M
 
C
K
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
V
G
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
F
N
 
N
A
 
S
L
 
L
E
 
K
V
 
L
V
 
L
G
 
K
K
 
K
K
 
S
I
 
L
E
 
D
D
 
E
V
 
V
K
 
S
L
 
I
A
 
V
T
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
S
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
S
C
 
I
L
 
T
D
 
R
M
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
L
 
A
G
 
G
L
 
-
K
 
-
P
 
A
E
 
T
H
 
K
I
 
V
L
 
T
A
 
V
Y
 
V
D
 
D
R
 
K
E
 
F
G
 
G
V
 
I
L
 
I
Y
 
N
T
 
E
G
 
Q
R
 
E
-
 
A
D
 
A
H
 
Q
M
 
L
D
 
A
P
 
P
D
 
D
K
 
I
Q
 
A
R
 
K
Y
 
V
A
 
T
-
 
N
R
 
R
D
 
E
T
 
F
K
 
K
A
 
S
R
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
S
A
 
A
G
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
K
 
K
P
 
A
E
 
E
M
 
W
V
 
I
A
 
S
T
 
K
M
 
M
G
 
A
R
 
A
Q
 
R
P
 
P
I
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
M
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
I
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
Y
P
 
P
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
C
 
Y
I
 
I
I
 
V
A
 
G
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
V
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
A
G
 
R
A
 
A
T
 
K
G
 
T
I
 
I
N
 
T
E
 
V
A
 
E
M
 
M
K
 
Q
T
 
I
A
 
A
C
 
A
V
 
A
R
 
K
A
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
L
 
L

2haeD Crystal structure of a putative malic enzyme (malate oxidoreductase)
45% identity, 51% coverage: 11:399/761 of query aligns to 2:373/373 of 2haeD

query
sites
2haeD
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
L
H
 
H
R
 
R
L
 
F
P
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
T
S
 
A
A
 
L
T
 
P
K
 
V
A
 
E
M
 
K
V
 
V
T
 
D
Q
 
R
R
 
E
D
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
D
A
 
V
C
 
A
E
 
R
A
 
A
I
 
C
V
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
E
A
 
K
A
 
T
S
 
Y
E
 
V
M
 
Y
T
 
T
A
 
S
R
 
R
G
 
W
N
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
G
 
A
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
F
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
D
I
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
I
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
S
D
 
E
P
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
S
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
I
 
R
V
 
I
E
 
L
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
E
M
 
M
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
L
V
 
T
G
 
E
K
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
K
 
K
L
 
V
A
 
V
T
 
V
A
 
N
G
 
G
A
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
Y
A
 
N
C
 
I
L
 
V
D
 
K
M
 
F
L
 
L
V
 
L
A
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
-
E
 
-
H
 
N
I
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
Y
 
N
T
 
E
G
 
N
R
 
D
D
 
P
H
 
E
M
 
T
D
 
C
P
 
L
D
 
N
K
 
E
Q
 
Y
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
I
T
 
T
K
 
N
A
 
P
R
 
E
T
 
R
L
 
L
A
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
E
E
 
T
I
 
A
V
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
F
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
V
S
 
S
A
 
R
G
 
G
G
 
N
V
 
I
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
W
V
 
I
A
 
K
T
 
K
M
 
M
G
 
S
R
 
R
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
|
N
P
 
P
N
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
C
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
L
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
M
R
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
-
G
 
K
A
 
R
T
 
S
G
 
K
I
 
I
N
 
T
E
 
K
A
 
N
M
 
M
K
 
L
T
 
L
A
 
S
C
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
L
 
S
A
 
C
R
 
E
M
 
P
E
 
E
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
P
D
 
E
Y
 
R
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
E
P
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
M
R
 
K
L
 
V
L
 
H
V
 
L
M
 
N
L
 
V
A
 
Y
P
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
K
Q
 
G
A
 
S
A
 
A

2haeB Crystal structure of a putative malic enzyme (malate oxidoreductase)
45% identity, 51% coverage: 11:399/761 of query aligns to 2:373/373 of 2haeB

query
sites
2haeB
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
L
H
 
H
R
 
R
L
 
F
P
 
L
R
 
K
P
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
K
 
R
V
 
T
S
 
A
A
 
L
T
 
P
K
 
V
A
 
E
M
 
K
V
 
V
T
 
D
Q
 
R
R
 
E
D
 
T
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
V
A
 
A
Y
 
D
A
 
V
C
 
A
E
 
R
A
 
A
I
 
C
V
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
P
N
 
E
A
 
K
A
 
T
S
 
Y
E
 
V
M
 
Y
T
 
T
A
 
S
R
 
R
G
 
W
N
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
S
N
 
D
G
 
G
T
 
S
A
|
A
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
G
 
A
K
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
E
 
E
G
 
G
K
|
K
G
 
A
V
 
F
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
K
 
A
F
 
F
A
 
A
G
 
D
I
 
I
D
 
D
V
 
A
F
 
F
D
 
P
I
 
I
E
 
C
I
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
S
D
 
E
P
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
I
V
 
I
D
 
S
I
 
I
I
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
L
E
|
E
D
|
D
I
 
I
K
 
G
A
 
A
P
 
P
E
 
K
C
 
C
F
 
F
I
 
R
V
 
I
E
 
L
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
R
 
S
E
 
E
R
 
E
M
 
M
K
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
H
D
|
D
D
|
D
Q
 
Q
H
 
Q
G
 
G
T
|
T
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
L
V
 
T
G
 
E
K
 
K
K
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
K
 
K
L
 
V
A
 
V
T
 
V
A
x
N
G
 
G
A
 
I
G
|
G
A
|
A
A
|
A
G
 
G
I
 
Y
A
 
N
C
 
I
L
 
V
D
 
K
M
 
F
L
 
L
V
 
L
A
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
V
K
 
K
P
 
-
E
 
-
H
 
N
I
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
V
D
|
D
R
|
R
E
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
Y
 
N
T
 
E
G
 
N
R
 
D
D
 
P
H
 
E
M
 
T
D
 
C
P
 
L
D
 
N
K
 
E
Q
 
Y
R
 
E
Y
 
I
A
 
A
R
 
R
D
 
I
T
 
T
K
 
N
A
 
P
R
 
E
T
 
R
L
 
L
A
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
E
E
 
T
I
 
A
V
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
F
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
x
V
S
|
S
A
x
R
G
 
G
G
 
N
V
 
I
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
M
 
W
V
 
I
A
 
K
T
 
K
M
 
M
G
 
S
R
 
R
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
A
L
|
L
A
|
A
N
|
N
P
 
P
N
 
V
P
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
V
 
A
R
 
G
P
 
A
D
 
-
C
 
F
I
 
I
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
L
L
 
L
C
 
A
F
 
F
P
 
P
Y
 
G
I
 
I
F
 
M
R
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
E
V
 
-
G
 
K
A
 
R
T
 
S
G
 
K
I
 
I
N
 
T
E
 
K
A
 
N
M
 
M
K
 
L
T
 
L
A
 
S
C
 
A
V
 
V
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
L
 
S
A
 
C
R
 
E
M
 
P
E
 
E
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
P
D
 
E
Y
 
R
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
E
P
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
M
R
 
K
L
 
V
L
 
H
V
 
L
M
 
N
L
 
V
A
 
Y
P
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
K
Q
 
G
A
 
S
A
 
A

1xcoD Crystal structure of a phosphotransacetylase from bacillus subtilis in complex with acetylphosphate (see paper)
28% identity, 43% coverage: 429:752/761 of query aligns to 6:324/325 of 1xcoD

query
sites
1xcoD
L
 
L
M
 
F
K
 
S
P
 
T
V
 
V
Y
 
Q
E
 
E
R
 
K
A
 
V
R
 
A
A
 
G
D
 
K
R
 
D
K
 
V
R
 
K
V
 
I
V
 
V
Y
 
F
A
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
L
E
 
D
E
 
E
T
 
R
V
 
I
L
 
L
R
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
T
 
K
V
 
L
I
 
A
D
 
G
E
 
N
R
 
K
L
 
V
A
 
L
F
 
N
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
N
P
 
E
S
 
N
V
 
E
I
 
I
E
 
Q
T
 
A
R
 
K
I
 
A
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
G
 
N
L
 
L
R
 
T
M
 
L
K
 
G
E
 
-
G
 
G
V
 
V
D
 
-
F
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
N
 
K
I
 
I
D
 
Y
D
 
D
D
 
P
P
 
H
R
 
T
F
 
Y
N
 
E
D
 
G
Y
 
M
W
 
E
Q
 
D
Q
 
L
Y
 
V
H
 
Q
A
 
A
L
 
F
T
 
V
E
 
E
R
|
R
R
|
R
-
 
K
-
 
G
-
x
K
G
 
A
V
 
T
S
 
E
P
 
E
A
 
Q
A
 
A
A
 
R
K
 
K
N
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
D
S
 
E
R
 
-
P
 
-
T
 
N
L
 
Y
I
 
F
A
 
G
S
 
T
L
 
M
M
 
L
V
 
V
E
 
Y
R
 
K
G
 
G
E
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
G
M
 
L
I
 
V
C
 
S
G
 
G
L
 
A
V
 
A
G
 
H
R
 
S
F
x
T
H
 
A
K
 
D
K
 
T
L
 
V
G
 
R
Y
 
P
M
 
A
R
 
L
S
 
Q
V
 
I
F
 
I
G
x
K
L
 
T
D
 
K
P
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
C
 
K
T
 
T
S
 
S
A
 
G
M
 
V
T
 
F
G
 
I
V
 
M
I
 
A
N
 
R
D
 
G
Q
 
E
G
 
E
A
 
Q
W
 
Y
F
 
V
F
 
F
L
 
A
D
 
D
T
 
C
H
 
A
V
 
I
Q
 
N
V
 
I
D
 
A
P
 
P
S
 
D
A
 
S
E
 
Q
Q
 
D
I
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
I
T
 
A
L
 
I
Q
 
E
A
 
S
S
 
A
Y
 
N
R
 
T
L
 
A
K
 
K
L
 
M
F
 
F
G
 
D
I
 
I
E
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
H
 
F
S
 
S
N
 
T
Y
 
K
G
 
G
S
 
S
H
 
A
D
 
K
N
 
S
P
 
D
S
 
E
A
 
T
A
 
E
K
 
K
M
 
V
R
 
A
K
 
D
V
 
A
Y
 
V
E
 
K
L
 
I
L
 
A
K
 
K
S
 
E
R
 
K
L
 
A
P
 
P
K
 
E
L
 
L
E
 
T
M
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
E
M
 
F
Q