SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2222 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2222 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

4v15A Crystal structure of d-threonine aldolase from alcaligenes xylosoxidans (see paper)
27% identity, 86% coverage: 49:414/426 of query aligns to 21:357/373 of 4v15A

query
sites
4v15A
P
 
P
V
 
S
A
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
D
Q
 
L
S
 
P
R
 
A
L
 
F
E
 
E
H
 
A
N
 
N
L
 
L
A
 
R
W
 
A
M
 
M
Q
 
Q
R
 
A
F
 
W
A
 
A
S
 
D
E
 
R
Y
 
H
G
 
E
A
 
V
R
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
A
K
|
K
T
 
A
T
 
H
M
 
K
A
 
C
P
 
P
R
 
E
L
 
I
F
 
A
A
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
C
L
 
C
A
x
Q
T
 
K
A
 
V
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
R
 
L
A
 
P
A
 
F
Y
 
V
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
D
I
 
I
L
 
H
L
 
I
A
x
S
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
P
R
 
A
N
 
K
M
 
L
A
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
G
E
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
R
D
 
-
P
 
-
S
 
A
F
 
A
E
 
K
F
 
I
F
 
S
C
 
V
L
 
C
V
 
V
D
 
D
A
 
N
A
 
A
E
 
E
Q
 
N
V
 
L
R
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
A
F
 
M
G
 
T
A
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
A
R
 
E
I
 
I
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
E
L
 
V
G
 
D
V
 
V
P
 
G
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
T
 
C
G
 
G
V
 
V
R
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
A
V
 
T
L
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
A
G
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
G
V
 
L
S
 
N
L
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
L
E
 
Q
V
 
A
Y
|
Y
E
 
H
G
 
G
V
 
S
L
 
V
K
 
Q
D
 
H
-
 
Y
-
 
R
E
 
T
T
 
R
A
 
E
I
 
E
R
 
R
A
 
A
F
 
A
L
 
V
Q
 
C
R
 
R
G
 
-
V
 
-
E
 
Q
A
 
A
V
 
A
Q
 
R
V
 
I
L
 
A
A
 
A
R
 
S
D
 
Y
G
 
A
R
 
Q
L
 
L
Q
 
L
R
 
R
T
 
E
P
 
S
A
 
G
V
 
I
L
 
A
S
 
C
-
 
D
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
G
G
|
G
A
x
T
G
 
G
S
 
S
A
 
V
W
 
E
Y
 
F
D
 
D
V
 
A
V
 
A
A
 
S
E
 
G
E
 
V
F
 
Y
A
 
T
K
 
E
A
 
L
Q
|
Q
I
x
A
G
|
G
A
x
S
P
 
Y
L
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
C
 
A
Y
 
F
L
 
M
T
 
D
H
 
S
D
 
D
V
x
Y
G
 
G
A
 
A
Y
 
N
R
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
E
A
 
W
S
 
N
N
 
G
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
R
 
L
R
 
K
M
 
F
R
 
Q
S
 
N
S
 
S
L
 
L
L
 
F
P
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
V
W
 
L
A
 
S
Y
 
T
V
 
V
Q
 
M
S
 
S
V
 
T
P
 
P
E
 
A
P
 
P
E
 
G
C
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
L
A
 
D
M
 
A
G
 
G
K
 
L
R
 
K
D
 
S
A
 
T
A
 
T
F
 
A
D
 
E
A
 
C
G
 
G
F
 
-
P
 
-
S
 
P
P
 
P
A
 
A
A
 
V
H
 
Y
F
 
G
R
 
E
P
 
P
G
 
G
G
 
-
S
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
W
 
L
E
 
T
V
 
Y
T
 
A
G
 
A
M
 
I
M
 
N
D
 
D
Q
 
E
H
 
H
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
K
 
R
I
 
V
A
 
E
A
 
P
G
 
G
D
 
A
D
 
Q
L
 
A
-
 
P
R
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
A
M
 
V
L
 
L
A
 
R
F
 
L
D
 
V
I
 
P
S
 
S
H
|
H
P
 
V
C
x
D
L
 
P
T
 
T
F
 
F
D
 
N
K
 
L
W
 
H
R
 
D
Q
 
G
L
 
L
P
 
V
V
 
V
I
 
V
D
 
K
D
 
D

A1B8Z1 3-hydroxy-D-aspartate aldolase; beta-hydroxyaspartate aldolase; EC 4.1.3.41 from Paracoccus denitrificans (strain Pd 1222) (see paper)
22% identity, 71% coverage: 43:346/426 of query aligns to 24:316/387 of A1B8Z1

query
sites
A1B8Z1
K
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
I
S
 
Q
L
 
T
P
 
P
V
 
C
A
 
L
V
 
I
L
 
L
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
A
L
 
L
E
 
E
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
R
W
 
K
M
 
M
Q
 
G
R
 
D
F
 
Y
A
 
A
S
 
K
E
 
A
Y
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
R
L
 
H
A
 
R
P
 
S
H
 
H
G
 
G
K
|
K
T
 
-
T
 
-
M
 
M
A
 
H
P
 
K
R
 
S
L
 
V
F
 
D
A
 
V
R
 
Q
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
S
W
 
V
G
 
G
I
 
V
T
 
C
L
 
C
A
x
Q
T
 
K
A
 
V
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
F
Y
 
A
V
 
R
H
 
G
G
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
T
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
V
 
R
G
 
E
R
 
P
R
 
A
N
 
K
M
 
I
A
 
D
I
 
R
V
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
L
 
P
A
 
K
D
 
T
P
 
G
S
 
A
F
 
T
E
 
V
F
 
T
F
 
V
C
 
C
L
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
D
A
 
V
E
 
Q
Q
 
N
V
 
I
R
 
A
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
A
F
 
A
G
 
Q
A
 
K
A
 
H
G
 
G
R
 
T
R
 
E
I
 
L
Q
 
G
V
 
I
L
 
F
I
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
C
P
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
C
G
 
G
V
 
V
R
 
T
D
 
T
E
 
K
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
E
A
 
I
L
 
A
A
 
K
Q
 
A
S
 
A
G
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
P
-
 
N
V
 
L
S
 
T
L
 
F
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
E
 
Q
G
 
G
V
 
A
L
 
M
K
 
Q
D
 
H
-
 
M
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
E
 
K
T
 
A
A
 
K
I
 
L
R
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
I
Q
 
A
R
 
Q
G
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
L
T
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
F
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
x
T
A
 
G
W
 
S
Y
 
Y
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
Y
A
 
F
K
 
E
A
 
S
Q
 
N
I
 
S
G
 
G
A
 
I
P
 
Y
L
 
N
D
 
E
V
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
Q
P
 
C
G
|
G
C
x
S
Y
 
Y
L
 
A
T
 
F
H
 
M
D
 
D
V
 
A
G
 
D
A
x
Y
Y
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
H
Q
 
D
A
 
A
R
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
E
A
 
G
R
 
K
R
 
R
M
 
I
-
 
D
R
 
Q
S
 
G
S
 
E
L
 
W
L
 
E
P
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
V
 
I
W
 
L
A
 
T
Y
 
S
V
 
V
Q
 
M
S
 
S
V
 
H
P
 
A
E
 
K
P
 
P
E
 
H
C
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
D
M
 
A
G
 
G
K
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
Q
A
 
S
F
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6qkbA Crystal structure of the beta-hydroxyaspartate aldolase of paracoccus denitrificans (see paper)
22% identity, 71% coverage: 43:346/426 of query aligns to 21:313/384 of 6qkbA

query
sites
6qkbA
K
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
I
S
 
Q
L
 
T
P
 
P
V
 
C
A
 
L
V
 
I
L
 
L
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
A
L
 
L
E
 
E
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
R
W
 
K
M
 
M
Q
 
G
R
 
D
F
 
Y
A
 
A
S
 
K
E
 
A
Y
 
H
G
 
G
A
 
M
R
 
R
L
 
H
A
 
R
P
 
S
H
|
H
G
 
G
K
|
K
T
 
-
T
 
-
M
 
M
A
 
H
P
 
K
R
 
S
L
 
V
F
 
D
A
 
V
R
 
Q
Q
 
K
L
 
L
E
 
Q
-
 
E
-
 
S
-
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
S
W
 
V
G
 
G
I
 
V
T
 
C
L
 
C
A
x
Q
T
 
K
A
 
V
Q
 
S
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
F
Y
 
A
V
 
R
H
 
G
G
 
G
V
 
I
R
 
K
R
 
D
I
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
T
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
V
 
R
G
 
E
R
 
P
R
 
A
N
 
K
M
 
I
A
 
D
I
 
R
V
 
L
A
 
A
E
 
R
L
 
L
L
 
P
A
 
K
D
 
T
P
 
G
S
 
A
F
 
T
E
 
V
F
 
T
F
 
V
C
 
C
L
 
-
V
 
V
D
 
D
A
 
D
A
 
V
E
 
Q
Q
 
N
V
 
I
R
 
A
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
A
F
 
A
G
 
Q
A
 
K
A
 
H
G
 
G
R
 
T
R
 
E
I
 
L
Q
 
G
V
 
I
L
 
F
I
 
V
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
C
P
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
C
G
 
G
V
 
V
R
 
T
D
 
T
E
 
K
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
V
D
 
E
A
 
I
L
 
A
A
 
K
Q
 
A
S
 
A
G
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
P
-
 
N
V
 
L
S
 
T
L
 
F
A
 
K
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
V
 
A
Y
|
Y
E
 
Q
G
 
G
V
 
A
L
 
M
K
 
Q
D
 
H
-
 
M
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
E
 
K
T
 
A
A
 
K
I
 
L
R
 
D
A
 
A
F
 
A
L
 
I
Q
 
A
R
 
Q
G
 
V
V
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
D
V
 
A
L
 
L
A
 
E
R
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
L
T
 
A
P
 
P
A
 
E
V
 
F
L
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
x
T
A
 
G
W
 
S
Y
 
Y
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
Y
A
 
F
K
 
E
A
 
S
Q
 
N
I
 
S
G
 
G
A
 
I
P
 
Y
L
 
N
D
 
E
V
 
-
V
 
-
L
 
L
R
x
Q
P
 
C
G
|
G
C
x
S
Y
 
Y
L
 
A
T
 
F
H
 
M
D
 
D
V
 
A
G
 
D
A
x
Y
Y
 
G
R
 
R
I
 
I
A
 
H
Q
 
D
A
 
A
R
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
E
A
 
G
R
 
K
R
 
R
M
 
I
-
 
D
R
 
Q
S
 
G
S
 
E
L
 
W
L
 
E
P
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
V
 
I
W
 
L
A
 
T
Y
 
S
V
 
V
Q
 
M
S
 
S
V
 
H
P
 
A
E
 
K
P
 
P
E
 
H
C
 
L
A
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
D
M
 
A
G
 
G
K
 
L
R
 
K
D
 
A
A
 
Q
A
 
S
F
 
V
D
 
D
A
 
S
G
 
G
F
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7yqaB Crystal structure of d-threonine aldolase from chlamydomonas reinhardtii (see paper)
27% identity, 43% coverage: 44:228/426 of query aligns to 19:203/398 of 7yqaB

query
sites
7yqaB
E
 
H
D
 
D
L
 
V
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
L
V
 
I
L
 
L
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
A
L
 
F
E
 
D
H
 
R
N
 
N
L
 
C
A
 
E
W
 
K
M
 
L
Q
 
K
R
 
G
F
 
V
A
 
M
S
 
A
E
 
G
Y
 
F
-
 
P
G
 
G
A
 
V
R
 
A
L
 
V
A
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
A
K
 
K
T
 
A
T
 
H
M
 
K
A
 
C
P
 
A
R
 
E
L
 
V
F
 
A
A
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
A
 
L
-
 
L
G
 
G
A
 
A
W
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
C
L
 
C
A
 
Q
T
 
K
A
 
V
Q
 
I
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
M
Y
 
A
V
 
E
H
 
G
G
 
G
V
 
V
R
 
S
R
 
D
I
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
S
N
 
N
Q
 
E
L
 
V
V
 
I
G
 
A
R
 
P
R
 
R
N
 
K
M
 
I
A
 
D
I
 
R
V
 
L
A
 
V
E
 
G
L
 
L
L
 
A
A
 
A
D
 
A
P
 
G
S
 
A
F
 
R
E
 
V
F
 
G
F
 
V
C
 
C
L
 
Y
V
 
-
D
 
E
A
 
R
A
 
E
E
 
D
Q
 
N
V
 
L
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
N
A
 
A
F
 
A
F
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
T
R
 
H
I
 
L
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
E
 
E
L
 
L
G
 
N
V
 
V
P
 
G
G
 
Q
G
 
D
R
 
R
T
 
C
G
 
G
V
 
V
R
 
-
D
 
N
E
 
S
A
 
A
Q
 
D
W
 
E
Q
 
V
A
 
V
V
 
Q
L
 
L
D
 
A
A
 
R
L
 
A
A
 
A
Q
 
A
S
 
G
G
 
L
G
 
D
A
 
N
V
 
V
S
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
E
 
H
G
 
G
V
 
G
L
 
L
K
 
Q
D
 
H
E
 
V
T
 
R
A
 
D
I
 
P
R
 
R
A
 
D
F
 
R
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3wqeA D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from delftia sp. Ht23 complexed with d-allothreonine (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 7:143/379 of 3wqeA

query
sites
3wqeA
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
A
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
x
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3wqdA D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from delftia sp. Ht23 complexed with d-erythro-3-hydroxyaspartate (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 7:143/379 of 3wqdA

query
sites
3wqdA
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
A
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3wqcA D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from delftia sp. Ht23 (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 7:143/379 of 3wqcA

query
sites
3wqcA
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
A
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

B2DFG5 D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase; D-THA DH; D-THA dehydratase; Threo-3-hydroxy-D-aspartate ammonia-lyase; EC 4.3.1.27 from Delftia sp. (strain HT23) (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 8:144/380 of B2DFG5

query
sites
B2DFG5
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
A
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
 
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

4pb3B D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase h351a mutant (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 17:153/389 of 4pb3B

query
sites
4pb3B
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
-
M
 
-
A
 
L
I
 
P
V
 
Q
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4pb5A D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase h351a mutant complexed with l- erythro-3-hydroxyaspartate (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 7:143/379 of 4pb5A

query
sites
4pb5A
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
A
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4pb4A D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase h351a mutant complexed with 2- amino maleic acid (see paper)
33% identity, 33% coverage: 46:184/426 of query aligns to 7:143/379 of 4pb4A

query
sites
4pb4A
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
P
V
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
I
S
 
D
Q
 
L
S
 
D
R
 
R
L
 
M
E
 
Q
H
 
R
N
 
N
L
 
I
A
 
A
W
 
R
M
 
M
Q
 
Q
R
 
Q
F
 
R
A
 
M
S
 
D
E
 
A
Y
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
P
H
|
H
G
 
V
K
|
K
T
 
T
T
 
S
M
 
K
A
 
S
P
 
V
R
 
P
L
 
V
F
 
A
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
L
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
V
A
 
S
T
 
T
A
 
L
Q
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
A
 
F
Y
 
F
V
 
A
H
 
A
G
 
G
V
 
T
R
 
T
R
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
Y
A
 
A
N
 
V
Q
 
S
L
 
M
V
 
A
G
 
P
R
 
H
R
 
R
N
 
L
M
 
P
A
 
Q
I
 
-
V
 
-
A
 
A
E
 
L
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
D
 
R
P
 
R
S
 
G
F
 
C
E
 
D
F
 
L
F
 
K
C
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
S
A
 
V
E
 
A
Q
 
A
V
 
A
R
 
Q
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
F
 
F
F
 
G
G
 
R
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
A
I
 
F
Q
 
E
V
 
V
L
 
W
I
 
I
E
 
E
L
 
I
G
 
D
V
 
T
P
 
D
G
 
G
G
 
H
R
|
R
T
 
S
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>N515DRAFT_2222 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2222
MSDNASRSEQLAPFVHPLDKGIGALDAPCAPEAIASHGWNLLKEDLSLPVAVLSQSRLEH
NLAWMQRFASEYGARLAPHGKTTMAPRLFARQLEAGAWGITLATAQQARAAYVHGVRRIL
LANQLVGRRNMAIVAELLADPSFEFFCLVDAAEQVRQLAAFFGAAGRRIQVLIELGVPGG
RTGVRDEAQWQAVLDALAQSGGAVSLAGVEVYEGVLKDETAIRAFLQRGVEAVQVLARDG
RLQRTPAVLSGAGSAWYDVVAEEFAKAQIGAPLDVVLRPGCYLTHDVGAYRIAQARIDAS
NPQARRMRSSLLPALQVWAYVQSVPEPECAIVAMGKRDAAFDAGFPSPAAHFRPGGSAPS
PVPPHWEVTGMMDQHAYLKIAAGDDLRVGDMLAFDISHPCLTFDKWRQLPVIDDAYDVVD
VVQTYF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory