SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2292 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2292 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4tv5A Crystal structure of citrate synthase sbng (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:242/242 of query aligns to 16:239/245 of 4tv5A

query
sites
4tv5A
G
 
G
L
 
I
L
 
F
Q
 
N
S
 
S
V
 
I
P
 
P
S
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
M
C
 
I
E
 
E
M
 
V
L
 
I
G
 
A
H
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
T
E
 
E
H
|
H
V
 
V
L
 
A
L
 
I
S
 
N
P
 
D
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
Q
 
A
H
 
H
A
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
A
C
 
A
E
 
E
L
 
A
G
 
A
G
 
H
C
 
I
A
 
I
P
 
P
W
 
I
V
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
T
E
 
A
V
 
V
D
 
I
E
 
D
K
 
R
L
 
D
I
 
I
G
 
I
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
 
M
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
S
 
P
R
 
H
L
 
V
E
 
K
T
 
D
V
 
R
E
 
E
Q
 
T
A
 
V
E
 
E
R
 
H
A
 
I
V
 
V
A
 
K
A
 
L
A
 
S
R
 
R
F
 
Y
P
 
Y
P
 
P
L
 
Q
G
 
G
R
 
L
R
 
R
G
 
S
I
 
L
T
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
N
A
 
P
L
 
L
P
 
L
D
 
D
Y
 
A
I
 
M
E
 
E
Q
 
M
A
 
A
N
 
N
R
 
E
E
x
H
I
 
I
H
 
M
V
 
V
V
 
I
P
 
A
M
 
M
I
 
I
E
|
E
S
 
D
E
 
V
A
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
M
A
 
A
L
 
I
P
 
D
Q
 
D
I
 
I
L
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
M
V
 
I
M
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
D
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
P
P
 
W
Q
 
Q
P
 
T
L
 
R
H
 
D
A
 
D
D
 
Q
V
 
V
W
 
T
Q
 
S
R
 
H
L
 
V
Q
 
Q
D
 
H
I
 
I
A
 
F
D
 
E
C
 
V
C
 
V
D
 
N
T
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
K
P
 
H
F
 
F
C
 
C
P
 
A
N
 
L
P
 
P
R
 
R
N
 
E
E
 
D
Q
 
E
Q
 
D
L
 
I
R
 
A
Y
 
K
W
 
W
A
 
Q
A
 
A
R
 
Q
E
 
G
V
 
V
R
 
Q
W
 
T
M
 
F
L
 
I
A
 
L
G
 
G
E
 
D
D
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
K
L
 
I
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
Y
R
 
R
D
 
H
R
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
A
A
 
T
S
 
S

Sites not aligning to the query:

4tv6A Crystal structure of citrate synthase variant sbng e151q (see paper)
32% identity, 98% coverage: 6:242/242 of query aligns to 14:220/225 of 4tv6A

query
sites
4tv6A
G
 
G
L
 
I
L
 
F
Q
 
N
S
 
S
V
 
I
P
 
P
S
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
M
C
 
I
E
 
E
M
 
V
L
 
I
G
 
A
H
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
T
E
|
E
H
|
H
V
 
V
L
 
A
L
 
I
S
 
N
P
 
D
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
Q
 
A
H
 
H
A
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
A
C
 
A
E
 
E
L
 
A
G
 
A
G
 
H
C
 
I
A
 
I
P
 
P
W
 
I
V
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
T
E
 
D
V
 
-
D
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
I
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
V
S
 
P
R
x
H
L
 
V
E
 
K
T
 
D
V
 
R
E
 
E
Q
 
T
A
 
V
E
 
E
R
 
H
A
 
I
V
 
V
A
 
K
A
 
L
A
 
S
R
 
R
F
 
Y
P
 
Y
P
 
P
L
 
Q
G
 
G
R
 
L
R
 
R
G
 
S
I
 
L
T
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
H
I
 
I
H
 
M
V
 
V
V
 
I
P
 
A
M
 
M
I
 
I
E
x
Q
S
 
D
E
 
V
A
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
M
A
 
A
L
 
I
P
 
D
Q
 
D
I
 
I
L
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
L
S
 
D
L
 
M
V
 
I
M
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
Q
D
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
P
P
 
W
Q
 
Q
P
 
T
L
 
R
H
 
D
A
 
D
D
 
Q
V
 
V
W
 
T
Q
 
S
R
 
H
L
 
V
Q
 
Q
D
 
H
I
 
I
A
 
F
D
 
E
C
 
V
C
 
V
D
 
N
T
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
K
P
 
H
F
 
F
C
 
C
P
 
A
N
 
L
P
 
P
R
 
R
N
 
E
E
 
D
Q
 
E
Q
 
D
L
 
I
R
 
A
Y
 
K
W
 
W
A
 
Q
A
 
A
R
 
Q
E
 
G
V
 
V
R
 
Q
W
 
T
M
 
F
L
 
I
A
 
L
G
 
G
E
 
D
D
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
K
L
 
I
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
Y
R
 
R
D
 
H
R
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
A
A
 
T
S
 
S

P23522 5-keto-4-deoxy-D-glucarate aldolase; KDGluc aldolase; KDGlucA; 2-dehydro-3-deoxy-D-glucarate aldolase; 2-keto-3-deoxy-D-glucarate aldolase; 5-dehydro-4-deoxy-D-glucarate aldolase; Alpha-keto-beta-deoxy-D-glucarate aldolase; EC 4.1.2.20 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:240/242 of query aligns to 21:255/256 of P23522

query
sites
P23522
I
 
I
G
 
G
L
 
C
L
 
W
Q
 
S
S
 
A
V
 
L
P
 
S
S
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
S
C
 
T
E
 
E
M
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
A
L
 
P
L
 
N
S
 
D
P
 
I
D
 
S
Q
 
T
L
 
F
Q
 
I
H
 
P
A
 
Q
I
 
L
R
 
M
A
 
A
C
 
L
E
 
K
L
 
G
G
 
S
G
 
A
C
 
S
A
 
A
P
 
P
W
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
V
P
 
P
E
 
T
V
 
N
D
 
E
E
 
P
K
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
F
R
 
Y
G
 
N
V
 
F
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
F
L
 
V
E
 
E
T
 
T
V
 
K
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
S
-
 
V
G
 
S
G
 
H
R
 
R
V
 
A
T
 
N
G
 
M
F
 
F
G
 
G
K
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
D
Y
 
Y
I
 
F
E
 
A
Q
 
Q
A
 
S
N
 
N
R
 
K
E
 
N
I
 
I
H
 
T
V
 
I
V
 
L
P
 
V
M
x
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
S
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
N
L
 
V
P
 
D
Q
 
A
I
 
I
L
 
A
A
 
A
V
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
V
G
 
G
A
 
P
L
x
S
D
|
D
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
H
G
 
L
P
 
G
Q
 
N
P
 
A
L
 
S
H
 
H
A
 
P
D
 
D
V
 
V
W
 
Q
Q
 
K
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
D
 
H
I
 
I
A
 
F
D
 
N
C
 
R
C
 
A
D
 
S
T
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
K
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
I
F
 
L
C
 
A
P
 
P
N
 
V
P
 
E
R
 
A
N
 
D
E
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
Y
R
 
L
Y
 
E
W
 
W
A
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
T
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
D
 
K
R
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
T
L
 
F
R
 
K

1dxfA 2-dehydro-3-deoxy-galactarate aldolase from escherichia coli in complex with pyruvate (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:240/242 of query aligns to 18:252/253 of 1dxfA

query
sites
1dxfA
I
 
I
G
 
G
L
 
C
L
 
W
Q
 
S
S
 
A
V
 
L
P
 
S
S
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
S
C
 
T
E
 
E
M
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
A
L
 
P
L
 
N
S
 
D
P
 
I
D
 
S
Q
 
T
L
 
F
Q
 
I
H
 
P
A
 
Q
I
 
L
R
 
M
A
 
A
C
 
L
E
 
K
L
 
G
G
 
S
G
 
A
C
 
S
A
 
A
P
 
P
W
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
P
E
 
T
V
 
N
D
 
E
E
 
P
K
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
I
G
 
G
A
 
F
R
 
Y
G
 
N
V
 
F
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
F
L
 
V
E
 
E
T
 
T
V
 
K
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
S
-
 
V
G
 
S
G
 
H
R
 
R
V
 
A
T
 
N
G
 
M
F
 
F
G
 
G
K
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
D
Y
 
Y
I
 
F
E
 
A
Q
 
Q
A
 
S
N
 
N
R
 
K
E
 
N
I
 
I
H
 
T
V
 
I
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
S
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
N
L
 
V
P
 
D
Q
 
A
I
 
I
L
 
A
A
 
A
V
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
V
G
|
G
A
x
P
L
x
S
D
|
D
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
H
G
 
L
P
 
G
Q
 
N
P
 
A
L
 
S
H
 
H
A
 
P
D
 
D
V
 
V
W
 
Q
Q
 
K
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
D
 
H
I
 
I
A
 
F
D
 
N
C
 
R
C
 
A
D
 
S
T
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
K
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
I
F
 
L
C
 
A
P
 
P
N
 
V
P
 
E
R
 
A
N
 
D
E
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
Y
R
 
L
Y
 
E
W
 
W
A
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
T
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
D
 
K
R
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
T
L
 
F
R
 
K

1dxeA 2-dehydro-3-deoxy-galactarate aldolase from escherichia coli (see paper)
33% identity, 98% coverage: 5:240/242 of query aligns to 18:252/253 of 1dxeA

query
sites
1dxeA
I
 
I
G
 
G
L
 
C
L
x
W
Q
 
S
S
 
A
V
 
L
P
 
S
S
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
S
C
 
T
E
 
E
M
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
A
L
 
P
L
 
N
S
 
D
P
 
I
D
 
S
Q
 
T
L
 
F
Q
 
I
H
 
P
A
 
Q
I
 
L
R
 
M
A
 
A
C
 
L
E
 
K
L
 
G
G
 
S
G
 
A
C
 
S
A
 
A
P
 
P
W
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
P
E
 
T
V
 
N
D
 
E
E
 
P
K
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
K
R
 
R
V
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
I
G
 
G
A
 
F
R
 
Y
G
 
N
V
 
F
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
F
L
 
V
E
 
E
T
 
T
V
 
K
E
 
E
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
S
-
 
V
G
 
S
G
 
H
R
 
R
V
 
A
T
 
N
G
 
M
F
 
F
G
 
G
K
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
-
P
 
-
D
 
D
Y
 
Y
I
 
F
E
 
A
Q
 
Q
A
 
S
N
 
N
R
 
K
E
 
N
I
 
I
H
 
T
V
 
I
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
S
E
 
Q
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
N
L
 
V
P
 
D
Q
 
A
I
 
I
L
 
A
A
 
A
V
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
V
G
|
G
A
 
P
L
 
S
D
|
D
L
 
L
A
 
A
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
H
G
 
L
P
 
G
Q
 
N
P
 
A
L
 
S
H
 
H
A
 
P
D
 
D
V
 
V
W
 
Q
Q
 
K
R
 
A
L
 
I
Q
 
Q
D
 
H
I
 
I
A
 
F
D
 
N
C
 
R
C
 
A
D
 
S
T
 
A
A
 
H
G
 
G
I
 
K
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
I
F
 
L
C
 
A
P
 
P
N
 
V
P
 
E
R
 
A
N
 
D
E
 
A
Q
 
R
Q
 
R
L
 
Y
R
 
L
Y
 
E
W
 
W
A
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
T
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
D
R
 
L
G
 
G
L
 
V
L
 
F
L
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
D
 
K
R
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
T
L
 
F
R
 
K

2v5kA Class ii aldolase hpch - magnesium - oxamate complex (see paper)
33% identity, 73% coverage: 5:180/242 of query aligns to 25:200/260 of 2v5kA

query
sites
2v5kA
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
W
Q
 
L
S
 
G
V
 
L
P
 
S
S
 
S
P
 
S
L
 
Y
L
 
S
C
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
A
H
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
N
L
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
Q
G
 
A
C
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
V
 
P
R
 
S
V
 
Q
P
 
P
E
 
V
V
 
V
-
x
R
-
 
P
-
 
S
-
 
W
-
 
N
D
 
D
E
 
P
K
 
V
L
 
Q
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
Q
T
 
N
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
S
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
R
 
D
E
 
Q
I
 
M
H
 
C
V
 
V
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
T
E
 
R
A
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
K
A
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
 
F
E
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
Q
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V

4b5vA Crystal structures of divalent metal dependent pyruvate aldolase, hpai, in complex with 4-hydroxyl-2-ketoheptane-1,7-dioate (see paper)
33% identity, 73% coverage: 5:180/242 of query aligns to 16:191/251 of 4b5vA

query
sites
4b5vA
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
W
Q
 
L
S
 
G
V
 
L
P
 
S
S
 
S
P
 
S
L
 
Y
L
 
S
C
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
A
H
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
N
L
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
Q
G
 
A
C
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
V
 
P
R
 
S
V
 
Q
P
 
P
E
 
V
V
 
V
-
x
R
-
 
P
-
 
S
-
 
W
-
 
N
D
 
D
E
 
P
K
 
V
L
 
Q
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
Q
T
 
N
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
S
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
R
 
D
E
 
Q
I
 
M
H
 
C
V
 
V
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
T
E
 
R
A
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
K
A
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
x
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
Q
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4b5tA Crystal structures of divalent metal dependent pyruvate aldolase, hpai, in complex with ketobutyrate (see paper)
33% identity, 73% coverage: 5:180/242 of query aligns to 16:191/251 of 4b5tA

query
sites
4b5tA
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
x
W
Q
 
L
S
 
G
V
 
L
P
 
S
S
 
S
P
 
S
L
 
Y
L
 
S
C
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
A
H
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
N
L
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
Q
G
 
A
C
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
V
 
P
R
 
S
V
 
Q
P
 
P
E
 
V
V
 
V
-
x
R
-
 
P
-
 
S
-
 
W
-
 
N
D
 
D
E
 
P
K
 
V
L
 
Q
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
Q
T
 
N
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
S
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
R
 
D
E
 
Q
I
 
M
H
 
C
V
 
V
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
T
E
 
R
A
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
K
A
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
x
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
Q
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4b5sA Crystal structures of divalent metal dependent pyruvate aldolase, hpai, in complex with pyruvate (see paper)
33% identity, 73% coverage: 5:180/242 of query aligns to 16:191/251 of 4b5sA

query
sites
4b5sA
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
W
Q
 
L
S
 
G
V
 
L
P
 
S
S
 
S
P
 
S
L
 
Y
L
 
S
C
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
A
H
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
N
L
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
Q
G
 
A
C
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
V
 
P
R
 
S
V
 
Q
P
 
P
E
 
V
V
 
V
-
x
R
-
 
P
-
 
S
-
 
W
-
 
N
D
 
D
E
 
P
K
 
V
L
 
Q
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
|
D
A
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
Q
T
 
N
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
S
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
R
 
D
E
 
Q
I
 
M
H
 
C
V
 
V
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
T
E
 
R
A
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
K
A
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
x
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
Q
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V

Q47098 4-hydroxy-2-oxo-heptane-1,7-dioate aldolase; 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase; HHED aldolase; 4-hydroxy-2-ketoheptane-1,7-dioate aldolase; HKHD aldolase; EC 4.1.2.52 from Escherichia coli (see 3 papers)
33% identity, 73% coverage: 5:180/242 of query aligns to 16:191/262 of Q47098

query
sites
Q47098
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
W
Q
 
L
S
 
G
V
 
L
P
 
S
S
 
S
P
 
S
L
 
Y
L
 
S
C
 
A
E
 
E
M
 
L
L
 
L
G
 
A
H
 
G
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
N
L
 
V
Q
 
Q
H
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
-
A
 
-
C
 
T
E
 
Q
L
 
L
G
 
Q
G
 
A
C
 
I
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
V
 
P
R
 
S
V
 
Q
P
 
P
E
 
V
V
 
V
-
x
R
-
 
P
-
 
S
-
 
W
-
 
N
D
 
D
E
 
P
K
 
V
L
 
Q
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
Q
T
 
N
V
 
A
E
 
D
Q
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
S
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
R
L
 
I
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
K
A
 
A
N
 
N
R
 
D
E
 
Q
I
 
M
H
 
C
V
 
V
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
T
E
 
R
A
 
E
G
 
A
V
 
M
R
 
K
A
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
 
F
E
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
Y
G
 
A
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
Q
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V

2vwtA Crystal structure of yfau, a metal ion dependent class ii aldolase from escherichia coli k12 - mg-pyruvate product complex (see paper)
31% identity, 98% coverage: 5:241/242 of query aligns to 20:256/256 of 2vwtA

query
sites
2vwtA
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
W
Q
 
L
S
 
S
V
 
S
P
 
T
S
 
T
P
 
A
L
 
Y
L
 
M
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
T
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
A
L
 
P
L
 
N
S
 
T
P
 
I
D
 
Q
Q
 
D
L
 
L
Q
 
Y
H
 
H
A
 
Q
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
C
 
V
E
 
A
L
 
P
G
 
Y
G
 
A
C
 
S
A
 
Q
P
 
P
W
 
V
V
 
I
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
E
V
 
G
D
 
S
E
 
K
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
|
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
D
T
 
T
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
R
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
S
G
 
V
G
 
A
R
 
R
V
 
A
T
 
A
G
 
R
F
 
W
G
 
G
K
 
R
T
 
-
A
 
-
L
 
I
P
 
E
D
 
N
Y
 
Y
I
 
M
E
 
A
Q
 
Q
A
 
V
N
 
N
R
 
D
E
 
S
I
 
L
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
T
G
 
A
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
x
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
 
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
P
P
 
D
Q
 
N
P
 
A
L
 
G
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
Q
 
I
D
 
E
-
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
R
-
 
R
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
-
F
x
L
C
 
A
P
 
V
N
 
A
P
 
P
R
 
D
N
 
M
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
C
R
 
L
Y
 
A
W
 
W
A
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
N
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
M
L
 
L
L
 
Y
L
 
S
A
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
D
D
 
Q
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
M
L
 
F
R
 
K
A
 
S

P76469 2-keto-3-deoxy-L-rhamnonate aldolase; KDR aldolase; 2-dehydro-3-deoxyrhamnonate aldolase; 2-keto-3-deoxy acid sugar aldolase; EC 4.1.2.53 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 98% coverage: 5:241/242 of query aligns to 20:256/267 of P76469

query
sites
P76469
I
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
W
Q
 
L
S
 
S
V
 
S
P
 
T
S
 
T
P
 
A
L
 
Y
L
 
M
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
T
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
|
H
V
 
A
L
 
P
L
 
N
S
 
T
P
 
I
D
 
Q
Q
 
D
L
 
L
Q
 
Y
H
 
H
A
 
Q
I
 
L
R
 
Q
A
 
A
C
 
V
E
 
A
L
 
P
G
 
Y
G
 
A
C
 
S
A
 
Q
P
 
P
W
 
V
V
 
I
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
E
V
 
G
D
 
S
E
 
K
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
D
T
 
T
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
A
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
R
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
S
G
 
V
G
 
A
R
 
R
V
 
A
T
 
A
G
 
R
F
 
W
G
 
G
K
 
R
T
 
-
A
 
-
L
 
I
P
 
E
D
 
N
Y
 
Y
I
 
M
E
 
A
Q
 
Q
A
 
V
N
 
N
R
 
D
E
 
S
I
 
L
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
T
G
 
A
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
E
G
 
G
I
 
I
S
 
D
L
 
G
V
 
V
M
 
F
E
 
I
G
 
G
A
 
P
L
 
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
P
P
 
D
Q
 
N
P
 
A
L
 
G
H
 
H
A
 
P
D
 
E
V
 
V
W
 
-
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
Q
 
I
D
 
E
-
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
R
-
 
R
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
F
P
 
-
F
 
L
C
 
A
P
 
V
N
 
A
P
 
P
R
 
D
N
 
M
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
C
R
 
L
Y
 
A
W
 
W
A
 
G
A
 
A
R
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
N
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
M
L
 
L
L
 
Y
L
 
S
A
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
D
D
 
Q
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
M
L
 
F
R
 
K
A
 
S

1izcA Crystal structure analysis of macrophomate synthase (see paper)
33% identity, 69% coverage: 5:171/242 of query aligns to 43:217/299 of 1izcA

query
sites
1izcA
I
 
M
G
 
G
L
 
V
L
 
A
Q
 
H
S
 
G
V
 
I
P
 
P
S
 
S
P
 
T
L
 
F
L
 
V
C
 
T
E
 
K
M
 
V
L
 
L
G
 
A
H
 
A
A
 
T
G
 
K
Y
 
P
D
 
D
F
 
F
V
 
V
L
 
W
L
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
E
H
|
H
V
 
G
L
 
M
L
 
F
S
 
N
P
 
R
D
 
L
Q
 
E
L
 
L
Q
 
H
H
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
H
A
 
A
C
 
A
E
 
Q
L
 
H
-
 
H
-
 
S
-
 
E
G
 
G
G
 
R
C
 
S
A
 
L
P
 
V
W
 
I
V
 
V
R
|
R
V
 
V
P
 
P
E
 
K
V
 
H
D
 
D
E
 
E
K
 
V
L
 
S
I
 
L
G
 
S
R
 
T
V
 
A
L
 
L
D
|
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
S
 
P
R
 
H
L
 
V
E
 
E
T
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
A
 
V
E
 
R
R
 
E
A
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
E
A
 
M
R
 
Y
F
 
Y
P
 
G
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
S
I
 
F
T
 
S
G
 
P
G
 
W
R
 
T
V
 
F
T
 
S
-
 
P
G
 
G
F
 
I
G
 
A
K
 
D
T
 
A
A
 
S
L
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
D
P
 
P
D
 
Y
Y
 
N
I
 
V
E
 
A
Q
 
T
A
 
S
N
 
N
R
 
N
E
 
H
I
 
V
H
 
C
V
 
I
V
 
I
P
 
P
M
x
Q
I
 
I
E
|
E
S
 
S
E
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
E
A
 
N
L
 
V
P
 
D
Q
 
A
I
 
I
L
 
A
A
 
A
V
 
M
P
 
P
G
 
E
I
 
I
S
 
H
L
 
G
V
 
L
M
 
M
E
 
F
G
|
G
A
x
P
L
x
G
D
|
D
L
 
Y
A
 
M
L
 
I
D
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
L

7ethA Crystal structure of abhpai-zn-pyruvate-propionaldehyde complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
28% identity, 95% coverage: 3:233/242 of query aligns to 14:244/251 of 7ethA

query
sites
7ethA
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
x
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
A
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K

7et9A Crystal structure of abhpai-zn-pyruvate complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
28% identity, 95% coverage: 3:233/242 of query aligns to 16:246/254 of 7et9A

query
sites
7et9A
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
A
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K

7etiA Crystal structure of abhpai-zn-pyruvate-4-hydroxybenzaldehyde complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
27% identity, 98% coverage: 3:240/242 of query aligns to 16:253/253 of 7etiA

query
sites
7etiA
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
x
G
G
 
A
G
x
A
R
x
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
x
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
R
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
R
 
K

7etfA Crystal structure of abhpai-mn-pyruvate-succinic semialdehyde complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
27% identity, 98% coverage: 3:240/242 of query aligns to 16:253/253 of 7etfA

query
sites
7etfA
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
x
G
G
x
A
G
x
A
R
x
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
x
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
R
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
R
 
K

7eteA Crystal structure of abhpai-mg-(4r)-kdgal complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
27% identity, 98% coverage: 3:240/242 of query aligns to 16:253/253 of 7eteA

query
sites
7eteA
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
x
G
G
 
A
G
x
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
x
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
R
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
R
 
K

7etdA Crystal structure of abhpai-zn-(4s)-kdglu complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
27% identity, 98% coverage: 3:240/242 of query aligns to 16:253/253 of 7etdA

query
sites
7etdA
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
A
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
x
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
x
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
R
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
R
 
K

7etcA Crystal structure of abhpai-zn-(4r)-kdgal complex, class ii aldolase, hpai from acinetobacter baumannii (see paper)
27% identity, 98% coverage: 3:240/242 of query aligns to 16:253/253 of 7etcA

query
sites
7etcA
R
 
Q
S
 
Q
I
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
W
Q
 
V
S
 
G
V
 
L
P
 
A
S
 
D
P
 
G
L
 
Y
L
 
C
C
 
A
E
 
E
M
 
I
L
 
A
G
 
A
H
 
N
A
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
F
 
W
V
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
L
 
G
E
 
E
H
 
H
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
A
P
 
P
D
 
N
Q
 
D
L
 
V
Q
 
R
H
 
S
A
 
I
I
 
L
R
 
A
A
 
Q
C
 
L
E
 
Q
L
 
S
G
 
I
G
 
A
C
 
A
A
 
Y
P
 
P
W
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
V
 
V
R
|
R
V
 
P
P
 
V
E
 
S
V
 
G
D
 
D
E
 
V
K
 
P
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
V
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
G
 
T
V
 
L
V
 
L
I
 
I
S
 
P
R
 
M
L
 
V
E
 
E
T
 
S
V
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
L
A
 
M
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
E
G
 
G
R
 
I
R
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
G
G
 
A
G
 
A
R
 
L
V
 
A
T
 
R
G
 
A
F
 
S
G
 
R
K
 
W
T
 
N
A
 
N
L
 
I
P
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
N
 
D
R
 
E
E
 
Q
I
 
I
H
 
C
V
 
L
V
 
L
P
 
V
M
 
Q
I
 
V
E
|
E
S
 
S
E
 
K
A
 
K
G
 
G
V
 
L
R
 
D
A
 
N
L
 
L
P
 
D
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
N
V
 
V
P
 
D
G
 
G
I
 
V
S
 
D
L
 
G
V
 
I
M
 
F
E
 
I
G
|
G
A
x
P
L
x
A
D
|
D
L
 
L
A
 
S
L
 
A
D
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
G
 
R
P
 
G
Q
 
N
P
 
P
L
 
G
H
 
H
A
 
E
D
 
F
V
 
V
W
 
Q
-
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
V
Q
 
Q
R
 
T
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
R
D
 
A
C
 
A
C
 
G
D
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
L
F
 
S
C
 
A
P
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
D
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
L
 
A
R
 
K
Y
 
Q
W
 
Y
A
 
L
A
 
E
R
 
L
E
 
G
V
 
T
R
 
E
W
 
F
M
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
E
 
V
D
 
D
R
 
T
G
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
K
A
 
S
L
 
M
R
 
K
D
 
Q
R
 
L
A
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
F
R
 
K

Query Sequence

>N515DRAFT_2292 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2292
MPRSIGLLQSVPSPLLCEMLGHAGYDFVLLDLEHVLLSPDQLQHAIRACELGGCAPWVRV
PEVDEKLIGRVLDAGARGVVISRLETVEQAERAVAAARFPPLGRRGITGGRVTGFGKTAL
PDYIEQANREIHVVPMIESEAGVRALPQILAVPGISLVMEGALDLALDLGLGPQPLHADV
WQRLQDIADCCDTAGIPFCPNPRNEQQLRYWAAREVRWMLAGEDRGLLLAALRDRAAALR
AS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory