SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2399 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2399 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
48% identity, 99% coverage: 2:247/248 of query aligns to 3:248/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
K
 
R
L
 
L
K
 
L
N
 
N
K
 
K
V
 
T
A
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
R
F
 
F
R
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
G
S
x
R
N
x
R
A
 
R
E
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
A
E
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
R
E
 
N
V
 
V
L
 
T
L
 
A
V
 
V
S
 
K
A
|
A
D
|
D
L
x
V
R
 
T
K
 
K
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
E
 
D
H
 
R
A
 
L
V
 
Y
E
 
A
Q
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
Q
F
 
R
G
 
G
R
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
F
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
A
 
A
S
 
I
T
 
E
V
 
Q
A
 
K
P
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
E
I
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Y
 
H
V
 
Y
E
 
D
E
 
R
N
 
T
V
 
F
A
 
D
L
x
V
N
 
N
F
 
V
A
 
R
G
 
G
V
 
L
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
T
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
L
P
 
R
K
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
L
T
 
T
T
 
S
S
|
S
F
 
V
L
 
A
N
 
G
T
 
V
V
 
L
G
 
G
K
 
L
P
 
Q
G
 
A
L
x
H
S
 
D
V
 
T
L
x
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
W
G
 
T
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
P
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
|
G
T
 
A
I
|
I
A
 
D
T
|
T
P
 
P
F
x
I
Y
 
I
S
 
E
K
 
N
I
 
Q
G
 
V
L
 
S
T
 
T
D
x
Q
A
 
E
Q
 
E
L
 
A
T
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
F
T
 
A
E
 
A
Q
 
A
V
 
T
G
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
V
G
 
G
D
 
R
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
D
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
48% identity, 99% coverage: 2:247/248 of query aligns to 3:248/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
K
 
R
L
 
L
K
 
L
N
 
N
K
 
K
V
 
T
A
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
T
 
T
A
 
A
K
 
K
L
 
R
F
 
F
R
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
Y
V
 
V
V
 
F
I
 
I
V
 
V
G
 
G
S
x
R
N
x
R
A
 
R
E
 
K
R
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
A
E
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
R
E
 
N
V
 
V
L
 
T
L
 
A
V
 
V
S
 
K
A
 
A
D
|
D
L
x
V
R
 
T
K
 
K
V
 
L
E
 
E
D
 
D
I
 
L
E
 
D
H
 
R
A
 
L
V
 
Y
E
 
A
Q
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
Q
F
 
R
G
 
G
R
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
F
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
A
 
A
S
 
V
T
 
E
V
 
Q
A
 
K
P
 
T
L
 
L
E
 
E
A
 
E
I
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Y
 
H
V
 
Y
E
 
D
E
 
R
N
 
T
V
 
F
A
 
D
L
x
V
N
 
N
F
 
V
A
 
R
G
 
G
V
 
L
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
T
 
A
A
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
L
P
 
R
K
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
L
T
|
T
T
 
S
S
|
S
F
 
V
L
 
A
N
 
G
T
 
V
V
 
L
G
 
G
K
 
L
P
 
Q
G
 
A
L
x
H
S
 
D
V
 
T
L
x
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
W
G
 
T
A
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
K
P
 
G
R
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
T
x
A
I
|
I
A
 
D
T
|
T
P
 
P
F
x
S
Y
x
L
S
 
E
K
 
N
I
 
N
G
 
V
L
 
S
T
 
T
D
 
Q
A
 
E
Q
 
E
L
 
A
T
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
R
A
 
A
A
 
K
L
 
A
T
 
A
E
 
A
Q
 
A
V
 
T
G
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
V
G
 
G
D
 
R
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
D
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
|
L
T
 
T
Q
 
Q

4esoB Crystal structure of a putative oxidoreductase protein from sinorhizobium meliloti 1021 in complex with NADP
40% identity, 99% coverage: 2:247/248 of query aligns to 2:246/251 of 4esoB

query
sites
4esoB
K
 
N
L
 
Y
K
 
Q
N
 
G
K
 
K
V
 
K
A
 
A
F
 
I
I
 
V
T
 
I
G
|
G
G
 
G
T
|
T
S
x
H
G
|
G
I
x
M
G
 
G
L
 
L
E
 
A
T
 
T
A
 
V
K
 
R
L
 
R
F
 
L
R
 
V
A
 
E
E
 
G
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
V
 
V
V
 
L
I
 
L
V
 
T
G
 
G
S
x
R
N
|
N
A
 
E
E
 
S
R
x
N
L
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
I
G
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
P
E
 
R
V
 
V
L
 
H
L
 
A
V
 
L
S
 
R
A
x
S
D
|
D
L
x
I
R
 
A
K
 
D
V
 
L
E
 
N
D
 
E
I
 
I
E
 
A
H
 
V
A
 
L
V
 
G
E
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
Q
A
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
L
V
 
L
F
 
H
A
 
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
V
S
 
S
T
 
E
V
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
F
E
 
D
A
 
Q
I
 
V
T
 
S
P
 
E
A
 
A
Y
 
S
V
 
Y
E
 
D
E
 
R
N
 
Q
V
 
F
A
 
A
L
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
K
G
 
G
V
 
A
L
 
F
F
 
F
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
K
 
R
T
 
L
A
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
R
K
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
F
T
|
T
T
 
S
S
|
S
F
 
V
L
 
A
N
 
D
T
 
E
V
 
G
G
 
G
K
 
H
P
 
P
G
 
G
L
x
M
S
 
S
V
 
V
L
x
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
V
S
 
S
L
 
F
V
 
A
R
 
S
T
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
L
P
 
P
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
T
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
P
 
P
F
x
T
Y
x
K
S
x
G
K
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
A
 
A
Q
 
E
L
 
R
T
 
A
E
 
E
V
 
F
A
 
K
A
 
T
A
 
L
L
 
G
T
 
D
E
 
N
Q
 
I
V
 
T
G
 
P
L
 
M
K
 
K
R
 
R
F
 
N
G
 
G
D
 
T
P
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
F
N
 
-
D
 
E
S
 
A
S
 
T
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
V
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
G
Q
 
Q

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
37% identity, 99% coverage: 2:246/248 of query aligns to 8:253/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
K
 
K
L
 
L
K
 
A
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
x
S
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
A
E
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
A
F
 
L
R
 
A
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
A
-
x
S
V
x
S
G
 
K
S
 
A
N
 
G
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
V
A
 
V
E
 
S
A
 
A
G
 
I
K
 
T
E
 
E
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
R
V
 
A
L
 
V
L
 
A
V
 
V
S
 
G
A
x
G
D
|
D
L
x
V
R
 
S
K
 
K
V
 
A
E
 
A
D
 
D
I
 
A
E
 
Q
H
 
R
A
 
I
V
 
V
E
 
D
Q
 
T
A
 
A
R
 
I
A
 
E
A
 
T
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
A
 
V
S
x
Y
T
 
E
V
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
E
A
 
E
Y
 
H
V
 
Y
E
 
R
E
 
R
N
 
Q
V
 
F
A
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
V
A
 
F
G
 
G
V
 
V
L
 
L
F
 
L
T
 
T
I
 
T
Q
 
Q
K
 
A
T
 
A
A
 
V
P
 
K
L
 
H
V
 
L
P
 
G
K
 
E
G
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
I
T
 
S
S
|
S
F
 
V
L
 
V
N
 
T
T
 
S
V
 
I
G
 
T
K
 
P
P
 
P
G
 
A
L
 
S
S
 
A
V
 
V
L
x
Y
A
 
S
A
 
G
T
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
A
 
V
R
 
D
S
 
A
L
 
I
V
 
T
R
 
G
T
 
V
L
 
L
G
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
R
 
R
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
S
 
N
P
|
P
G
|
G
T
x
M
I
|
I
A
 
V
T
|
T
P
 
E
F
x
G
Y
x
T
S
 
H
K
 
S
I
 
A
G
 
G
L
x
I
T
 
I
D
 
G
A
 
S
Q
 
D
L
 
L
T
 
E
E
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
Q
L
 
V
T
 
L
E
 
G
Q
 
Q
V
 
T
G
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
D
 
E
P
 
P
A
 
N
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
S
A
 
V
V
 
A
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
D
S
 
A
S
 
R
Y
 
W
T
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
E
E
 
H
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
N

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
36% identity, 97% coverage: 6:245/248 of query aligns to 3:253/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
T
x
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
x
K
E
x
A
T
x
I
A
|
A
K
x
L
L
x
R
F
x
L
R
x
V
A
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
Q
x
A
V
|
V
V
x
A
I
|
I
V
x
A
G
x
D
S
 
Y
N
 
N
-
 
D
-
 
A
-
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
S
A
 
E
G
 
I
K
 
N
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
R
V
 
A
L
 
M
L
 
A
V
 
V
S
 
K
A
 
V
D
|
D
L
 
V
R
 
S
K
 
D
V
 
R
E
 
D
D
 
Q
I
 
V
E
 
F
H
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
V
 
I
F
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
V
S
 
A
T
 
P
V
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Y
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
K
N
 
V
V
 
Y
A
 
N
L
 
I
N
 
N
F
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
T
 
A
A
 
V
P
 
E
L
 
A
V
 
F
P
 
K
K
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
T
 
C
S
 
S
F
 
Q
L
 
A
N
 
G
T
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
N
P
 
P
G
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
V
L
 
Y
A
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
T
 
T
L
 
A
G
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
Y
S
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
I
I
 
V
A
 
K
T
 
T
P
 
P
F
 
M
Y
 
W
S
 
A
K
 
E
I
 
I
G
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
D
A
 
R
Q
 
Q
L
 
V
T
 
S
E
 
E
V
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
F
T
 
A
E
 
K
Q
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
S
D
 
E
P
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
C
V
 
V
L
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 97% coverage: 6:245/248 of query aligns to 3:253/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
 
G
S
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
E
 
A
T
 
I
A
 
A
K
 
L
L
 
R
F
 
L
R
 
V
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
Q
 
A
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
A
G
x
D
S
x
Y
N
 
N
-
 
D
-
 
A
-
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
S
A
 
E
G
 
I
K
 
N
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
H
V
 
A
L
 
V
L
 
A
V
 
V
S
 
K
A
x
V
D
|
D
L
x
V
R
 
S
K
 
D
V
x
R
E
x
D
D
 
Q
I
 
V
E
x
F
H
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
K
A
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
V
 
I
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
V
S
 
A
T
 
P
V
 
S
A
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Y
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
K
N
 
V
V
 
Y
A
 
N
L
x
I
N
 
N
F
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
F
 
W
T
 
G
I
 
I
Q
 
Q
K
 
A
T
 
A
A
 
V
P
x
E
L
 
A
V
 
F
P
 
K
K
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
A
T
 
C
S
|
S
F
 
Q
L
 
A
N
 
G
T
 
H
V
 
V
G
 
G
K
 
N
P
 
P
G
 
E
L
 
L
S
 
A
V
 
V
L
x
Y
A
 
S
A
 
S
T
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
Q
T
 
T
L
 
A
G
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
V
 
Y
S
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
I
I
x
V
A
 
K
T
|
T
P
 
P
F
x
M
Y
 
W
S
 
A
K
 
E
I
 
I
G
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
D
A
 
R
Q
 
Q
L
x
V
T
 
S
E
 
E
V
 
A
A
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
F
T
 
A
E
 
K
Q
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
S
D
 
E
P
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
C
V
 
V
L
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
P
D
 
D
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:244/248 of query aligns to 2:237/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
M
 
M
K
 
E
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
L
V
 
T
A
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
S
A
 
A
K
 
R
L
 
L
F
 
M
R
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
 
G
S
x
R
N
x
D
A
 
A
E
 
Q
R
|
R
L
 
G
A
 
E
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
A
E
 
D
L
 
I
G
 
G
G
 
H
E
 
G
V
 
A
L
 
R
L
 
F
V
 
V
S
 
Q
A
 
A
D
|
D
L
|
L
R
 
G
K
 
D
V
 
L
E
 
D
D
 
S
I
 
V
E
 
A
H
 
D
A
 
L
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
P
A
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
I
S
x
Y
T
 
P
V
 
Q
A
 
A
P
 
S
L
 
T
E
 
F
A
 
D
I
 
Q
T
 
D
P
 
V
A
 
A
Y
 
G
V
 
F
E
 
Q
E
 
Q
N
 
L
V
 
F
A
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
V
A
 
R
G
 
G
V
 
T
L
 
Y
F
 
F
T
 
L
I
 
V
Q
 
A
K
 
A
T
 
A
A
 
A
P
 
K
-
 
G
L
 
M
V
 
V
P
 
A
K
 
R
G
 
G
-
 
H
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
N
T
x
I
T
 
T
S
x
T
F
 
L
L
 
A
N
 
A
T
 
H
V
 
K
G
 
G
K
 
F
P
 
P
G
 
G
L
x
T
S
 
S
V
 
V
L
x
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
A
 
L
R
 
E
S
 
S
L
 
L
V
 
T
R
 
R
T
 
T
L
 
W
G
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
F
A
 
G
P
 
A
R
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
 
G
T
x
P
I
x
T
A
 
R
T
|
T
P
 
P
F
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
L
x
T
T
|
T
D
 
L
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
T
 
G
E
 
D
V
 
F
A
 
I
A
 
D
A
 
D
L
 
V
T
 
A
E
 
A
Q
 
G
V
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
R
R
 
R
F
 
T
G
 
A
D
 
A
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
P
D
 
R
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
S
E
 
T
L
 
L
V
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:245/248 of query aligns to 4:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
V
F
 
F
R
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
A
G
x
D
S
x
F
N
 
N
A
 
-
E
 
E
R
 
A
L
 
A
A
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
N
G
 
P
E
 
G
V
 
V
L
 
V
L
 
F
V
 
I
S
 
R
A
x
V
D
|
D
L
x
V
R
 
S
K
 
D
V
 
R
E
 
E
D
 
S
I
 
V
E
 
H
H
 
R
A
 
L
V
 
V
E
 
E
Q
 
N
A
 
V
R
 
A
A
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
S
 
T
T
 
R
V
x
D
A
 
S
P
 
M
L
 
L
E
 
S
A
x
K
I
 
M
T
 
T
P
 
V
A
 
D
Y
 
Q
V
 
F
E
 
Q
E
 
Q
N
 
V
V
 
I
A
 
N
L
 
V
N
|
N
F
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
V
L
 
F
F
 
H
T
 
C
I
 
T
Q
 
Q
K
 
A
T
 
V
A
 
L
P
 
P
L
 
Y
V
 
M
P
 
A
K
 
E
-
 
Q
-
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
|
T
T
 
S
S
|
S
F
 
V
L
 
T
N
 
G
T
 
T
V
 
Y
G
 
G
K
x
N
P
x
V
G
 
G
L
x
Q
S
 
T
V
 
N
L
x
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
I
S
 
G
L
 
M
V
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
W
G
 
A
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
T
x
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
P
 
A
F
x
M
Y
 
V
S
 
A
K
 
E
I
 
V
G
 
P
L
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
T
 
E
E
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
E
A
x
K
L
 
M
T
 
K
E
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
D
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
H
D
 
E
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
E
 
V
L
 
L
V
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
38% identity, 99% coverage: 2:246/248 of query aligns to 7:251/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
K
 
R
L
 
L
K
 
A
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
x
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
T
 
T
A
 
G
K
 
R
L
 
R
F
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
G
G
x
D
S
x
I
N
 
D
A
 
P
E
 
T
R
 
T
L
 
G
A
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
E
G
 
G
E
 
-
V
 
-
L
 
L
L
 
F
V
 
V
S
 
P
A
x
V
D
|
D
L
x
V
R
 
S
K
 
E
V
 
Q
E
 
E
D
 
A
I
 
V
E
 
D
H
 
N
A
 
L
V
 
F
E
 
D
Q
 
T
A
 
A
R
 
A
A
 
S
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
F
 
F
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
S
 
S
T
 
P
V
 
-
A
 
-
P
 
P
L
 
E
E
 
D
A
 
D
I
 
L
T
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
W
V
 
-
E
 
Q
E
 
R
N
 
V
V
 
Q
A
 
D
L
 
I
N
 
N
F
 
L
A
 
K
G
 
S
V
 
V
L
 
Y
F
 
L
T
 
S
I
 
C
Q
 
R
K
 
A
T
 
A
-
 
L
A
 
R
P
 
H
L
 
M
V
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
|
T
T
 
A
S
|
S
F
 
F
L
 
V
N
 
A
T
 
V
V
 
M
G
 
G
K
 
S
P
 
A
G
 
T
L
 
S
S
x
Q
V
 
I
-
 
S
L
x
Y
A
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
L
S
 
A
L
 
M
V
 
S
R
 
R
T
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
C
P
|
P
G
 
G
T
x
P
I
x
V
A
 
N
T
 
T
P
 
P
F
 
L
Y
 
L
S
 
Q
K
 
E
I
 
L
G
 
F
L
 
A
T
 
K
D
 
D
A
 
P
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
E
 
E
V
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
R
L
 
R
T
 
L
E
 
V
Q
 
H
V
 
I
G
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
F
 
F
G
 
A
D
 
E
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
S
E
 
T
L
 
F
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
S

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:244/248 of query aligns to 6:248/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
K
 
S
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
R
V
 
S
A
 
A
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
x
S
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
E
 
G
T
 
I
A
 
A
K
 
E
L
 
T
F
 
F
R
 
A
A
 
N
E
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
T
G
|
G
S
x
R
N
|
N
A
 
Q
E
 
D
R
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
R
A
 
T
G
 
V
K
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
S
G
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
G
E
 
K
V
 
V
L
 
T
L
 
A
V
 
V
S
 
R
A
 
A
D
|
D
L
x
V
R
 
T
K
 
D
V
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
A
E
 
R
H
 
R
A
 
T
V
 
V
E
 
A
Q
 
E
A
 
T
R
 
V
A
 
S
A
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
V
F
 
C
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
I
S
x
F
T
 
P
V
 
S
A
 
G
P
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
D
I
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
D
Y
 
D
V
 
I
E
 
E
E
 
Q
N
 
V
V
 
L
A
 
G
L
 
V
N
 
N
F
 
F
A
 
K
G
 
G
V
 
T
L
 
V
F
 
Y
T
 
I
I
 
V
Q
 
Q
K
 
A
T
 
A
-
 
L
A
 
Q
P
 
A
L
 
L
V
 
T
P
 
A
K
 
S
G
 
G
-
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
V
T
|
T
T
 
S
S
|
S
F
 
I
L
x
T
N
 
G
T
 
P
V
 
I
-
 
T
G
 
G
K
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
x
W
S
 
S
V
 
H
L
x
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
L
S
 
G
L
 
F
V
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
A
G
 
A
A
 
M
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
L
P
|
P
G
|
G
T
x
N
I
|
I
A
 
M
T
|
T
P
 
E
F
x
G
Y
x
L
S
 
D
K
 
E
I
 
M
G
 
G
L
 
-
T
 
-
D
 
Q
A
 
D
Q
 
Y
L
 
L
T
 
D
E
 
Q
V
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
I
T
 
P
E
 
A
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
D
 
S
P
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
I
A
 
G
K
 
N
A
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
A
S
 
T
N
 
D
D
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3r3sA Structure of the ygha oxidoreductase from salmonella enterica
35% identity, 98% coverage: 2:244/248 of query aligns to 44:288/292 of 3r3sA

query
sites
3r3sA
K
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
R
V
 
K
A
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
x
D
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
E
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
I
L
 
A
F
 
Y
R
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
x
L
-
 
P
-
 
A
V
x
E
G
 
E
S
 
E
N
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
Q
L
 
V
A
 
K
E
 
A
A
 
L
G
 
I
K
 
E
E
 
E
L
 
C
G
 
G
G
 
R
E
 
K
V
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
L
S
 
P
A
 
G
D
|
D
L
|
L
R
 
S
K
 
D
V
 
E
E
 
S
D
 
F
I
 
A
E
 
R
H
 
S
A
 
L
V
 
V
E
 
H
Q
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
A
A
 
L
N
x
V
A
|
A
G
|
G
A
 
K
S
 
Q
T
 
T
V
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
E
L
 
I
E
 
K
A
 
D
I
 
L
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Y
 
Q
V
 
F
E
 
Q
E
 
Q
N
 
T
V
 
F
A
 
A
L
 
V
N
 
N
F
 
V
A
 
F
G
 
A
V
 
L
L
 
F
F
 
W
T
 
I
I
 
T
Q
 
Q
K
 
E
T
 
A
A
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
V
 
T
T
 
T
T
 
S
S
|
S
F
 
I
L
 
Q
N
 
A
T
 
Y
V
 
Q
G
 
P
K
 
S
P
 
P
G
 
H
L
|
L
S
 
L
V
 
D
L
x
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
L
S
 
N
L
 
Y
V
 
S
R
 
R
T
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
P
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
I
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
F
x
I
Y
 
W
S
x
T
K
 
A
I
x
L
G
x
Q
L
 
I
T
 
S
D
 
G
A
 
G
Q
 
Q
L
 
T
T
x
Q
E
 
D
V
 
K
A
 
I
A
 
P
A
 
Q
L
 
F
T
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
T
G
 
P
L
 
M
K
 
K
R
 
R
F
 
A
G
 
G
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
P
A
 
V
V
 
Y
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
Q
D
 
E
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
E
E
 
V
L
 
H
V
 
G
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:246/248 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
K
 
N
L
 
L
K
 
T
N
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
F
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
E
 
A
T
 
A
A
 
V
K
 
Q
L
 
A
F
 
F
R
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
A
G
x
D
-
x
I
S
 
D
N
 
E
A
 
A
E
 
Q
R
 
G
L
 
E
A
 
A
E
 
M
A
 
V
G
 
R
K
 
K
E
 
E
L
 
N
G
 
N
G
 
D
E
 
R
V
 
L
L
 
H
L
 
F
V
 
V
S
 
Q
A
x
T
D
 
D
L
x
I
R
 
T
K
 
D
V
 
E
E
 
A
D
 
A
I
 
C
E
 
Q
H
 
H
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
S
A
 
A
R
 
V
A
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
I
S
 
E
T
 
I
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
E
 
H
A
 
E
I
 
M
T
 
E
P
 
L
A
 
S
Y
 
D
V
 
W
E
 
N
E
 
K
N
 
V
V
 
L
A
 
Q
L
 
V
N
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
-
L
 
M
F
 
F
T
 
L
I
 
M
Q
 
S
K
 
K
T
 
H
A
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
H
P
 
M
L
 
L
V
 
A
P
 
A
K
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
|
T
T
 
C
S
|
S
F
 
V
L
 
G
N
 
G
T
 
L
V
 
V
G
 
A
K
 
W
P
 
P
G
 
D
L
 
I
S
 
P
V
 
A
L
x
Y
A
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
A
 
V
R
 
L
S
 
Q
L
 
L
V
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
G
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
R
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
I
I
|
I
A
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
L
Y
 
N
S
 
E
K
 
K
I
 
S
G
 
F
L
 
L
T
 
E
D
 
N
A
 
N
Q
 
E
-
 
G
-
 
T
L
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
K
A
 
K
A
 
E
L
 
K
T
 
A
E
 
K
Q
 
V
V
 
N
G
 
P
L
 
L
K
 
L
R
 
R
F
 
L
G
 
G
D
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
V
V
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
L
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
S
E
 
A
L
 
I
V
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:246/248 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
K
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
T
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
A
T
 
V
A
 
A
K
 
H
L
 
S
F
 
Y
R
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
V
V
 
S
G
x
D
S
x
I
N
 
N
A
 
E
E
 
D
R
 
H
L
 
G
A
 
N
E
 
K
A
 
A
G
 
V
K
 
E
E
 
D
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
A
L
 
S
L
 
F
V
 
V
S
 
K
A
|
A
D
|
D
L
x
T
R
 
S
K
 
N
V
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
E
 
E
H
 
A
A
 
L
V
 
V
E
 
K
Q
 
R
A
 
T
R
 
V
A
 
E
A
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
A
F
 
C
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
-
S
 
-
T
 
-
V
 
I
A
 
G
P
 
G
L
 
E
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
T
 
A
P
 
G
A
 
D
Y
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
S
V
 
W
E
 
R
E
 
K
N
 
V
V
 
L
A
 
S
L
 
I
N
 
N
F
 
L
A
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
F
 
Y
T
 
G
I
 
C
Q
 
K
K
 
Y
T
 
E
A
 
L
P
 
E
L
 
Q
V
 
M
P
 
E
K
 
K
-
 
N
-
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
N
T
x
M
T
 
A
S
|
S
F
 
I
L
 
H
N
 
G
T
 
I
V
 
V
G
 
A
K
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
S
S
 
S
V
 
A
L
x
Y
A
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
A
 
V
R
 
V
S
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
T
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
R
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
T
x
Y
I
|
I
A
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
-
Y
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
G
 
-
L
|
L
T
 
L
D
 
E
A
 
S
Q
 
L
L
 
T
T
 
K
E
 
E
V
 
M
A
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
L
T
 
I
E
 
S
Q
 
K
V
 
H
G
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
D
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
N
 
E
D
 
K
S
 
S
S
 
S
Y
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
E
 
Y
L
 
Y
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 99% coverage: 1:245/248 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
K
 
T
L
 
L
K
 
Q
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
E
 
D
T
 
I
A
 
A
K
 
I
L
 
N
F
 
L
R
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
V
 
F
I
 
F
V
x
N
G
x
Y
S
x
N
N
x
G
-
x
S
-
 
P
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
L
G
 
V
K
 
A
E
 
E
L
 
H
G
 
G
G
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
E
L
 
A
V
 
M
S
 
K
A
 
A
D
x
N
L
x
V
R
 
A
K
 
I
V
 
A
E
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
D
H
 
A
A
 
F
V
 
F
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
R
 
I
A
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
x
I
S
 
T
T
 
R
V
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
A
 
R
I
 
M
T
 
K
P
 
E
A
 
D
Y
 
E
V
 
W
E
 
D
E
 
D
N
 
V
V
 
I
A
 
N
L
x
I
N
 
N
F
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
T
L
 
F
F
 
L
T
 
C
I
 
T
Q
 
K
K
 
A
T
 
V
A
 
S
P
 
R
L
 
T
V
 
M
P
 
M
K
 
K
-
 
Q
-
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
M
T
 
A
S
|
S
F
 
V
L
 
V
N
 
G
T
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
N
P
 
A
G
 
G
L
x
Q
S
 
A
V
 
N
L
x
Y
A
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
A
 
V
R
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
T
G
 
A
A
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
R
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
P
 
D
F
 
M
Y
 
T
S
 
D
K
 
K
I
 
L
G
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
D
A
 
E
Q
 
K
L
 
T
T
 
K
E
 
E
V
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
M
T
 
L
E
 
A
Q
 
Q
V
 
I
G
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
A
F
 
Y
G
 
G
D
 
T
P
 
T
A
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
A
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
T
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

P0AG84 Uncharacterized oxidoreductase YghA; EC 1.-.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 2:244/248 of query aligns to 46:290/294 of P0AG84

query
sites
P0AG84
K
 
R
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
R
V
 
K
A
 
A
F
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
E
 
A
T
 
A
A
 
A
K
 
I
L
 
A
F
 
Y
R
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
P
-
 
V
-
 
E
G
 
E
S
 
E
N
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
D
L
 
V
A
 
K
E
 
K
A
 
I
G
 
I
K
 
E
E
 
E
L
 
C
G
 
G
G
 
R
E
 
K
V
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
L
S
 
P
A
 
G
D
 
D
L
 
L
R
 
S
K
 
D
V
 
E
E
 
K
D
 
F
I
 
A
E
 
R
H
 
S
A
 
L
V
 
V
E
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
K
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
M
F
 
A
A
 
L
N
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
K
S
 
Q
T
 
V
V
 
A
A
 
I
P
 
P
-
 
D
L
 
I
E
 
A
A
 
D
I
 
L
T
 
T
P
 
S
A
 
E
Y
 
Q
V
 
F
E
 
Q
E
 
K
N
 
T
V
 
F
A
 
A
L
 
I
N
 
N
F
 
V
A
 
F
G
 
A
V
 
L
L
 
F
F
 
W
T
 
L
I
 
T
Q
 
Q
K
 
E
T
 
A
A
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
G
G
 
A
S
 
S
I
 
I
I
 
I
V
 
T
T
 
T
T
 
S
S
 
S
F
 
I
L
 
Q
N
 
A
T
 
Y
V
 
Q
G
 
P
K
 
S
P
 
P
G
 
H
L
 
L
S
 
L
V
 
D
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
L
S
 
N
L
 
Y
V
 
S
R
 
R
T
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
P
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
I
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
F
 
I
Y
 
W
S
 
T
K
 
A
I
 
L
G
 
Q
L
 
I
T
 
S
D
 
G
A
 
G
Q
 
Q
L
 
T
T
 
Q
E
 
D
V
 
K
A
 
I
A
 
P
A
 
Q
L
 
F
T
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
V
 
T
G
 
P
L
 
M
K
 
K
R
 
R
F
 
A
G
 
G
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
E
 
E
V
 
L
A
 
A
K
 
P
A
 
V
V
 
Y
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
Q
D
 
E
S
 
S
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
A
V
 
E
E
 
V
L
 
H
V
 
G
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

A0A3Q8GL18 (+)-cis,trans-nepetalactol synthase NEPS1; Nepetalactol-related short-chain dehydrogenase; Nepetalactol dehydrogenase; Nepetalactol-related short-chain reductase 1; Nepetalactol-related SDR1; NmNEPS1; EC 5.5.1.34; EC 1.1.1.419 from Nepeta racemosa (Catmint) (Raceme catnip) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:245/248 of query aligns to 14:262/271 of A0A3Q8GL18

query
sites
A0A3Q8GL18
K
 
K
L
 
L
K
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
Q
E
 
T
T
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
V
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
E
 
H
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
A
S
 
D
-
 
I
N
 
Q
A
 
S
E
 
E
R
 
V
L
 
G
A
 
K
E
 
S
A
 
V
G
 
A
K
 
K
E
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
D
E
 
P
V
 
C
L
 
C
L
 
Y
V
 
V
S
 
Q
A
 
C
D
 
D
L
 
V
R
 
S
K
 
D
V
 
E
E
 
E
D
 
E
I
 
V
E
 
K
H
 
S
A
 
M
V
 
I
E
 
E
Q
 
W
A
 
T
R
 
A
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
M
V
 
M
F
 
F
A
 
S
N
 
N
A
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
M
-
 
S
-
 
K
-
 
S
A
 
A
S
 
Q
T
 
T
V
 
V
A
 
M
P
 
D
L
 
L
E
 
D
A
 
L
I
 
L
T
 
E
P
 
F
A
 
D
Y
 
K
V
 
V
E
 
M
E
 
R
N
 
V
V
x
N
A
 
A
L
 
R
N
 
G
F
 
M
A
 
A
G
 
A
V
 
C
L
 
L
F
 
K
T
 
H
I
 
A
Q
 
A
K
 
R
T
 
K
A
 
M
P
 
V
L
 
E
V
 
L
P
 
G
K
 
T
G
 
R
G
 
G
S
 
T
I
 
I
I
 
I
V
 
C
T
|
T
T
|
T
S
x
T
F
x
P
L
|
L
N
 
S
T
 
S
V
 
R
G
 
G
K
 
G
P
 
Q
G
 
S
L
 
M
S
 
T
V
 
D
L
x
Y
A
 
A
A
 
M
T
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
A
 
V
R
 
M
S
 
G
L
 
L
V
 
V
R
 
R
T
 
S
L
 
A
G
 
S
A
 
I
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
P
 
A
R
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
S
 
T
P
 
P
G
x
S
T
x
V
I
 
V
A
 
L
T
|
T
P
 
P
F
 
L
Y
 
A
S
 
Q
K
 
R
I
 
M
G
 
G
L
 
L
-
 
A
T
 
T
D
 
P
A
 
D
Q
 
D
L
 
F
T
 
H
E
 
T
V
 
H
A
 
F
A
 
G
A
 
N
L
 
F
T
 
T
E
 
S
Q
 
L
V
 
K
G
 
G
L
 
V
K
 
-
R
 
-
F
 
Y
G
 
L
D
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
V
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
V
L
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
D
S
 
A
S
 
A
Y
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
H
E
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
32% identity, 99% coverage: 3:248/248 of query aligns to 11:259/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
K
 
K
N
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
L
 
R
E
 
A
T
 
M
A
 
A
K
 
V
L
 
R
F
 
F
R
 
G
A
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
-
 
N
V
 
Y
G
x
Y
S
 
N
N
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
E
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
K
K
 
K
E
 
E
L
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
V
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
V
S
 
Q
A
 
G
D
|
D
L
x
V
R
 
T
K
 
K
V
 
E
E
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
V
H
 
N
A
 
L
V
 
V
E
 
Q
Q
 
T
A
 
A
R
 
I
A
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
M
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
V
S
x
E
T
 
N
V
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
S
E
 
H
A
 
E
I
 
L
T
 
S
P
 
L
A
 
D
Y
 
N
V
 
W
E
 
N
E
 
K
N
 
V
V
 
I
A
 
D
L
 
T
N
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
F
F
 
L
T
 
G
I
 
S
Q
 
R
K
 
E
T
 
A
A
 
I
P
 
K
L
 
Y
V
 
F
P
 
V
K
 
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
I
 
I
V
 
N
T
x
M
T
 
S
S
|
S
F
 
V
L
x
H
N
 
E
T
 
M
V
 
I
G
 
P
K
x
W
P
 
P
G
 
L
L
 
F
S
 
V
V
 
H
L
x
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
A
 
M
R
 
K
S
 
L
L
 
M
V
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
R
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
S
 
G
P
|
P
G
|
G
T
 
A
I
x
M
A
 
N
T
|
T
P
|
P
F
x
I
Y
x
N
S
 
A
K
 
E
I
x
K
G
 
F
L
 
A
T
 
D
D
 
P
A
 
V
Q
 
Q
L
 
R
T
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
E
A
 
S
A
 
M
L
 
I
T
 
P
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
M
K
 
G
R
 
Y
F
 
I
G
 
G
D
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
V
V
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
S
D
 
Q
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
I
E
 
T
L
 
L
V
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
T
 
T
Q
 
K
F
 
Y

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:246/248 of query aligns to 5:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
L
K
 
D
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
K
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
S
G
x
D
S
x
M
N
 
N
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
C
A
 
Q
E
 
E
A
 
T
G
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
G
 
F
E
 
D
V
 
A
L
 
L
L
 
S
V
 
A
S
 
P
A
 
C
D
|
D
L
x
V
R
 
T
K
 
D
V
 
E
E
 
D
D
 
A
I
 
Y
E
 
K
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
E
Q
 
L
A
 
T
R
 
Q
A
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
F
S
x
Q
T
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
E
I
 
F
T
 
P
P
 
T
A
 
A
Y
 
V
V
 
F
E
 
Q
E
 
K
N
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
V
N
 
M
F
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
F
F
 
I
T
 
G
I
 
I
Q
 
K
K
 
H
T
 
V
A
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
P
 
K
-
 
A
-
 
Q
K
 
K
G
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
M
T
x
A
S
|
S
F
 
I
L
x
N
N
 
G
T
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
F
P
 
A
G
 
G
L
x
K
S
 
A
V
 
G
L
x
Y
A
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
A
 
V
R
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
T
 
V
L
 
A
G
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
C
A
 
A
P
 
R
R
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
C
P
|
P
G
|
G
T
 
Y
I
x
V
A
 
D
T
|
T
P
 
P
F
x
L
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
Y
 
I
S
 
A
K
 
D
I
 
L
G
 
A
L
 
K
T
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
D
 
D
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
T
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
V
E
 
P
Q
 
Q
V
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
L
D
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
Y
V
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
S
D
 
K
S
 
A
S
 
G
Y
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:246/248 of query aligns to 4:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
K
 
D
N
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
T
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
K
 
K
L
 
K
F
 
F
R
 
A
A
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
S
G
x
D
S
x
M
N
 
N
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
C
A
 
Q
E
 
E
A
 
T
G
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
G
 
F
E
 
D
V
 
A
L
 
L
L
 
S
V
 
A
S
 
P
A
 
C
D
|
D
L
x
V
R
 
T
K
 
D
V
 
E
E
 
D
D
 
A
I
 
Y
E
 
K
H
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
E
Q
 
L
A
 
T
R
 
Q
A
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
F
S
x
Q
T
 
H
V
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
E
 
E
A
 
E
I
 
F
T
 
P
P
 
T
A
 
A
Y
 
V
V
 
F
E
 
Q
E
 
K
N
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
V
N
 
M
F
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
F
F
 
I
T
 
G
I
 
I
Q
 
K
K
 
H
T
 
V
A
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
M
P
 
K
-
 
A
-
 
Q
K
 
K
G
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
M
T
x
A
S
|
S
F
 
I
L
 
N
N
 
G
T
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
F
P
 
A
G
 
G
L
x
K
S
 
A
V
 
G
L
x
Y
A
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
A
 
V
R
 
I
S
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
T
 
V
L
 
A
G
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
C
A
 
A
P
 
R
R
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
S
 
C
P
 
P
G
 
G
T
x
Y
I
x
V
A
 
D
T
|
T
P
 
P
F
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
Y
 
I
S
 
A
K
 
D
I
 
L
G
 
A
L
 
K
T
 
T
-
 
R
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
L
D
 
D
A
 
S
Q
 
A
L
 
L
T
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
V
E
 
P
Q
 
Q
V
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
K
R
 
R
F
 
L
G
 
L
D
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
D
A
 
Y
V
 
A
L
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
S
D
 
K
S
 
A
S
 
G
Y
 
G
T
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T

7wbcA Hydroxysteroid dehydrogenase wild-type complexed with NAD+ and (4s)-2- 2-methyl-2,4-pentanediol
37% identity, 98% coverage: 1:244/248 of query aligns to 1:245/250 of 7wbcA

query
sites
7wbcA
M
 
M
K
 
K
L
 
L
K
 
R
N
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
F
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
T
 
A
S
 
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
E
 
A
T
 
V
A
 
T
K
 
R
L
 
V
F
 
F
R
 
V
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
F
V
 
V
G
x
D
S
x
V
N
 
D
A
 
D
E
 
D
R
 
R
L
 
G
A
 
R
E
 
A
A
 
L
G
 
E
K
 
S
E
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
A
L
 
K
L
 
F
V
 
L
S
 
Q
A
|
A
D
|
D
L
x
I
R
 
S
K
 
R
V
 
R
E
 
E
D
 
S
I
 
A
E
 
D
H
 
Q
A
 
I
V
 
R
E
 
D
Q
 
A
A
 
A
R
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
F
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
H
A
 
A
S
 
S
T
 
R
V
 
Q
A
 
A
P
 
L
L
 
L
E
 
V
A
 
E
I
 
H
T
 
T
P
 
P
A
 
E
Y
 
M
V
 
F
E
 
E
E
 
L
N
 
S
V
 
F
A
 
G
L
 
T
N
 
G
F
 
F
A
x
Y
G
x
P
V
 
T
L
 
V
F
x
H
T
 
L
I
 
M
Q
 
Q
K
 
A
T
 
C
A
 
Y
P
 
P
L
 
Q
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
G
 
A
-
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
V
 
N
T
x
F
T
 
G
S
|
S
F
 
G
L
 
S
N
 
A
T
 
L
V
 
D
G
 
G
K
 
M
P
 
P
G
 
T
L
 
Q
S
 
T
V
 
S
L
x
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
R
S
 
A
L
 
V
V
 
S
R
 
R
T
 
V
L
 
A
G
 
A
A
 
N
E
 
E
L
 
W
A
 
A
P
 
A
R
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
S
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
C
P
|
P
F
|
F
Y
x
A
S
 
A
K
x
T
I
 
E
G
|
G
L
x
V
T
 
Q
D
 
A
A
 
W
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
A
L
 
F
T
 
P
E
 
D
V
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
T
 
A
E
 
A
Q
 
K
V
 
V
G
 
P
L
 
L
K
 
Q
R
 
R
F
 
I
G
 
G
D
 
D
P
 
P
-
 
E
A
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
P
A
 
V
V
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
N
 
D
D
 
D
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
E
 
T
L
 
L
V
 
M
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>N515DRAFT_2399 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2399
MKLKNKVAFITGGTSGIGLETAKLFRAEGAQVVIVGSNAERLAEAGKELGGEVLLVSADL
RKVEDIEHAVEQARAAFGRIDIVFANAGASTVAPLEAITPAYVEENVALNFAGVLFTIQK
TAPLVPKGGSIIVTTSFLNTVGKPGLSVLAATKAAARSLVRTLGAELAPRGIRVNAVSPG
TIATPFYSKIGLTDAQLTEVAAALTEQVGLKRFGDPAEVAKAVLFLASNDSSYTTGVELV
VDGGLTQF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory