SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2463 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2463 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q58761 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
28% identity, 98% coverage: 4:290/293 of query aligns to 2:284/284 of Q58761

query
sites
Q58761
V
 
I
V
 
V
Y
 
V
A
 
S
M
 
G
P
 
S
G
 
Q
N
 
S
Q
 
Q
E
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
F
A
 
K
L
 
V
A
 
A
H
 
K
R
 
L
R
 
L
R
 
N
M
 
T
A
 
K
R
 
L
L
 
T
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
H
 
K
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
|
D
G
x
N
E
|
E
G
 
I
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
V
 
I
E
 
V
E
 
D
P
 
E
P
 
I
V
 
N
G
 
D
A
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
N
T
 
T
L
 
Q
D
 
K
R
 
N
P
 
Q
D
 
N
E
 
D
K
 
A
T
 
I
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
I
M
 
L
A
 
L
A
 
C
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
E
G
 
G
A
 
V
G
 
K
S
 
K
V
 
I
G
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
K
R
 
K
F
 
F
R
 
N
P
 
P
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
S
S
 
I
G
 
R
I
 
A
F
 
L
G
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
E
 
N
H
 
I
F
 
V
D
 
D
W
 
K
Q
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
D
 
N
P
 
P
H
 
H
L
 
E
H
 
T
R
 
H
L
 
I
R
 
K
S
 
D
L
 
F
T
 
F
E
 
T
A
 
I
G
 
P
M
 
F
P
 
I
Q
 
Y
G
 
G
R
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
W
 
Y
L
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
L
E
 
N
L
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
D
E
 
K
E
 
G
S
 
A
A
 
L
P
 
E
W
 
F
V
 
A
E
 
K
S
 
T
V
 
A
A
 
S
A
 
K
L
 
I
M
 
L
S
 
N
A
 
A
P
 
E
A
 
Y
V
 
D
V
 
Y
A
 
L
T
 
E
K
 
K
R
 
T
R
 
R
F
 
L
G
 
S
D
 
P
R
 
T
K
 
E
V
 
I
Q
 
Q
V
 
I
Q
 
A
L
 
-
P
 
P
D
 
K
L
 
T
S
 
L
N
 
D
W
 
A
P
 
K
G
 
D
H
 
R
N
 
D
P
 
V
V
 
F
L
 
I
L
 
V
D
|
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
x
G
T
|
T
L
 
M
L
 
A
K
 
T
S
 
A
I
 
V
E
 
K
G
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
K
P
 
I
W
 
I
C
 
A
V
 
A
A
 
C
V
 
V
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
I
D
 
G
N
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
V
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
G
T
 
T
N
 
D
S
 
T
V
 
Y
P
 
L
G
 
S
E
 
E
T
 
V
A
 
S
R
 
K
I
 
V
D
 
S
L
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
A
 
V
A
 
D
A
 
L
L
 
L

1u9zA Crystal structure of phosphoribosyl diphosphate synthase complexed with amp and ribose 5-phosphate (see paper)
26% identity, 98% coverage: 4:290/293 of query aligns to 2:274/274 of 1u9zA

query
sites
1u9zA
V
 
I
V
 
V
Y
 
V
A
 
S
M
 
G
P
 
S
G
 
Q
N
 
S
Q
 
Q
E
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
F
A
 
K
L
 
V
A
 
A
H
 
K
R
 
L
R
 
L
R
 
N
M
 
T
A
 
K
R
 
L
L
 
T
A
 
R
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
H
 
K
R
 
R
F
|
F
P
 
P
D
|
D
G
 
N
E
|
E
G
 
I
L
 
Y
V
 
V
R
 
R
V
 
I
E
 
V
E
 
D
P
 
E
P
 
I
V
 
N
G
 
D
A
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
I
V
 
I
C
 
N
T
 
T
L
 
Q
D
 
K
R
 
N
P
 
Q
D
 
N
E
 
D
K
 
A
T
 
I
L
 
V
P
 
E
L
 
T
L
 
I
M
 
L
A
 
L
A
 
C
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
D
L
 
E
G
 
G
A
 
V
G
 
K
S
 
K
V
 
I
G
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
A
 
K
R
 
K
F
|
F
R
 
N
P
 
P
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
S
S
 
I
G
 
R
I
 
A
F
 
L
G
 
A
R
 
K
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
E
 
N
H
 
I
F
 
V
D
 
D
W
 
K
Q
 
L
V
 
I
T
 
T
I
 
I
D
 
N
P
 
P
H
|
H
L
 
E
H
 
T
R
 
H
L
 
I
R
 
K
S
 
D
L
 
F
T
 
F
E
 
T
A
 
I
G
 
P
M
 
F
P
 
I
Q
 
Y
G
 
G
R
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
K
L
 
L
A
 
A
G
 
E
W
 
Y
L
 
V
R
 
K
E
 
D
R
 
K
V
 
L
E
 
N
L
 
D
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
L
G
 
A
P
 
P
D
|
D
E
 
K
E
 
G
S
 
A
A
 
L
P
 
E
W
 
F
V
 
A
E
 
K
S
 
T
V
 
A
A
 
S
A
 
K
L
 
I
M
 
L
S
 
N
A
 
A
P
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
R
 
-
R
 
E
F
 
Y
G
 
D
D
 
Y
R
 
L
K
 
E
V
 
I
Q
 
A
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
K
L
 
T
S
 
L
N
 
D
W
 
A
P
 
K
G
 
D
H
 
R
N
 
D
P
 
V
V
 
F
L
 
I
L
 
V
D
|
D
D
 
D
I
 
I
I
|
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
 
G
T
|
T
L
 
M
L
 
A
K
 
T
S
 
A
I
 
V
E
 
K
G
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
Q
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
K
P
 
I
W
 
I
C
 
A
V
 
A
A
 
C
V
 
V
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
I
D
 
G
N
 
D
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
V
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
G
T
 
T
N
 
D
S
 
T
V
 
Y
P
 
L
G
 
S
E
 
E
T
 
V
A
 
S
R
 
K
I
 
V
D
 
S
L
 
V
S
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
A
 
V
A
 
D
A
 
L
L
 
L

Q97Z86 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
31% identity, 90% coverage: 27:290/293 of query aligns to 25:291/291 of Q97Z86

query
sites
Q97Z86
L
 
V
A
 
K
L
 
V
E
 
E
L
 
N
H
 
K
R
 
I
F
 
F
P
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
S
L
 
Y
V
 
I
R
 
R
V
 
V
E
 
P
E
 
S
P
 
S
P
 
I
V
 
R
G
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
L
I
 
L
V
 
V
C
 
Q
T
 
T
L
 
T
D
 
D
R
 
Y
P
 
P
D
 
Q
E
 
D
K
 
K
T
 
H
L
 
L
-
 
I
P
 
E
L
 
L
L
 
F
M
 
L
A
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
T
L
 
I
R
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
S
 
K
V
 
L
G
 
T
L
 
A
V
 
I
A
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
F
R
 
K
P
 
D
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
S
S
 
I
G
 
K
I
 
T
F
 
I
G
 
L
R
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
E
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
N
W
 
T
Q
 
L
V
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
E
P
 
P
H
 
H
L
 
K
H
 
P
R
 
E
L
 
E
R
 
L
S
 
S
L
 
Y
T
 
F
E
 
K
A
 
G
G
 
E
M
 
L
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
K
A
 
I
I
 
V
S
 
H
A
 
P
A
 
Y
P
 
H
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
G
 
R
W
 
K
L
 
I
R
 
K
E
 
E
R
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
D
P
 
P
L
 
F
L
 
I
I
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
D
E
 
R
E
 
G
S
 
A
A
 
L
P
 
D
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
E
M
 
I
S
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
V
 
S
V
 
Y
A
 
I
T
 
E
K
 
K
R
 
E
R
 
R
-
 
D
-
 
R
-
 
T
F
 
T
G
 
G
D
 
E
R
 
V
K
 
R
V
 
I
Q
 
K
V
 
-
Q
 
E
L
 
A
P
 
P
D
 
N
L
 
I
S
 
-
N
 
N
W
 
L
P
 
K
G
 
G
H
 
K
N
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
x
G
T
|
T
L
 
I
L
 
V
K
 
Q
S
 
A
I
 
T
E
 
R
G
 
L
L
 
A
R
 
Y
A
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
S
P
 
V
W
 
T
C
 
A
V
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
L
L
 
L
F
 
L
A
 
V
D
 
G
N
 
G
A
 
A
L
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
T
V
 
L
V
 
I
T
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
T
V
 
I
-
 
N
-
 
V
-
 
N
P
 
D
G
 
K
E
 
D
T
 
I
A
 
I
R
 
T
I
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
E
 
Q
L
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L

4twbA Sulfolobus solfataricus ribose-phosphate pyrophosphokinase (see paper)
31% identity, 88% coverage: 34:290/293 of query aligns to 32:278/278 of 4twbA

query
sites
4twbA
F
|
F
P
 
P
D
|
D
G
 
G
E
|
E
G
 
S
L
 
Y
V
 
I
R
 
R
V
 
V
E
 
P
E
 
S
P
 
S
P
 
I
V
 
R
G
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
L
I
 
L
V
 
V
C
 
Q
T
 
T
L
 
T
D
 
D
R
 
Y
P
 
P
D
 
Q
E
 
D
K
 
K
T
 
H
L
 
L
-
 
I
P
 
E
L
 
L
L
 
F
M
 
L
A
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
T
L
 
I
R
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
S
 
K
V
 
L
G
 
T
L
 
A
V
 
I
A
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
L
 
S
R
|
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
R
R
 
R
F
|
F
R
 
K
P
 
D
G
 
G
E
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
S
S
 
I
G
 
K
I
 
T
F
 
I
G
 
L
R
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
E
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
N
W
 
T
Q
 
L
V
 
V
T
 
V
I
 
V
D
 
E
P
 
P
H
|
H
L
 
K
H
 
P
R
 
E
L
 
E
R
 
L
S
 
S
L
 
Y
T
 
F
E
 
K
A
 
G
G
 
E
M
 
L
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
K
A
 
I
I
 
V
S
 
H
A
 
P
A
 
Y
P
 
H
A
 
Q
L
 
I
A
 
A
G
 
R
W
 
K
L
 
I
R
 
K
E
 
E
R
 
I
V
 
I
E
 
E
L
 
D
P
 
P
L
 
F
L
 
I
I
 
L
G
 
A
P
 
P
D
 
D
E
 
R
E
 
G
S
 
A
A
 
L
P
 
D
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
E
M
 
I
S
 
N
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
V
 
S
V
 
Y
A
 
I
T
 
E
K
 
K
R
 
E
R
 
R
F
 
N
G
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
I
N
 
N
W
 
L
P
 
K
G
 
G
H
 
K
N
 
D
P
 
V
V
 
V
L
 
I
L
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
S
S
 
T
G
 
G
H
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
V
K
 
Q
S
 
A
I
 
T
E
 
R
G
 
L
L
 
A
R
 
Y
A
 
S
L
 
L
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
S
P
 
V
W
 
T
C
 
A
V
 
A
A
 
A
V
 
I
H
 
H
G
 
L
L
 
L
F
 
L
A
 
V
D
 
G
N
 
G
A
 
A
L
 
K
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
T
V
 
L
V
 
I
T
 
G
T
 
T
N
 
N
S
 
T
V
 
I
-
 
N
-
 
V
-
 
N
P
 
D
G
 
K
E
 
D
T
 
I
A
 
I
R
 
T
I
 
I
D
 
D
L
 
V
S
 
S
E
 
Q
L
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
L

3mbiA Crystal structure of the phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase from thermoplasma volcanium in complex with adp-mg2+ and ribose 5- phosphate (see paper)
27% identity, 80% coverage: 25:259/293 of query aligns to 16:253/287 of 3mbiA

query
sites
3mbiA
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
L
H
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
R
R
 
R
F
|
F
P
 
P
D
|
D
G
 
G
E
|
E
G
 
L
L
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
Y
E
 
D
E
 
E
P
 
D
P
 
L
V
 
T
G
 
G
A
 
H
E
 
N
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
G
T
 
N
L
 
T
D
 
-
R
 
H
P
 
S
D
 
D
E
 
A
K
 
E
T
 
V
L
 
M
P
 
E
L
 
M
L
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
I
R
 
Q
E
 
D
L
 
Y
G
 
R
A
 
T
G
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
N
L
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
x
H
A
 
Q
R
 
R
F
x
Y
R
 
K
P
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
S
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
F
 
L
G
 
T
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
E
 
S
H
 
Y
F
 
S
D
 
N
W
 
S
Q
 
I
V
 
A
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
I
H
|
H
L
 
D
H
 
E
R
 
K
L
 
T
R
 
L
S
 
S
L
 
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
V
G
 
K
M
 
F
P
 
S
Q
 
D
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
N
P
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
R
W
 
Y
L
 
Y
R
 
K
E
 
-
R
 
N
V
 
V
E
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
Y
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
D
E
 
G
S
 
G
A
 
L
P
 
A
W
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
K
M
 
L
S
 
G
A
 
K
P
 
K
A
 
H
V
 
F
V
 
F
A
 
I
T
 
E
K
|
K
R
 
K
R
|
R
F
 
I
G
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
T
V
 
V
Q
 
E
V
 
M
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
N
L
 
V
S
 
-
N
 
D
W
 
V
P
 
N
G
 
G
H
 
K
N
 
K
P
 
L
V
 
L
L
 
I
L
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
A
K
 
K
S
 
S
I
 
S
E
 
G
G
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
S
A
 
K
P
 
I
W
 
Y
C
 
V
V
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
S
L
 
E
E
 
N
R
 
K
L
 
I

Q97CA5 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Thermoplasma volcanium (strain ATCC 51530 / DSM 4299 / JCM 9571 / NBRC 15438 / GSS1) (see paper)
27% identity, 80% coverage: 25:259/293 of query aligns to 14:251/286 of Q97CA5

query
sites
Q97CA5
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
L
H
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
D
|
D
G
|
G
E
|
E
G
 
L
L
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
Y
E
 
D
E
 
E
P
 
D
P
 
L
V
 
T
G
 
G
A
 
H
E
 
N
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
G
T
 
N
L
 
T
D
 
-
R
 
H
P
 
S
D
 
D
E
 
A
K
 
E
T
 
V
L
 
M
P
 
E
L
 
M
L
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
I
R
 
Q
E
 
D
L
 
Y
G
 
R
A
 
T
G
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
N
L
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
x
H
A
 
Q
R
 
R
F
 
Y
R
 
K
P
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
S
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
F
 
L
G
 
T
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
E
 
S
H
 
Y
F
 
S
D
 
N
W
 
S
Q
 
I
V
 
A
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
I
H
 
H
L
 
D
H
 
E
R
 
K
L
 
T
R
 
L
S
 
S
L
 
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
V
G
 
K
M
 
F
P
 
S
Q
 
D
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
N
P
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
R
W
 
Y
L
 
Y
R
 
K
E
 
-
R
 
N
V
 
V
E
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
Y
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
D
E
 
G
S
 
G
A
 
L
P
 
A
W
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
K
M
 
L
S
 
G
A
 
K
P
 
K
A
 
H
V
 
F
V
 
F
A
 
I
T
 
E
K
 
K
R
 
K
R
|
R
F
 
I
G
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
T
V
 
V
Q
 
E
V
 
M
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
N
L
 
V
S
 
-
N
 
D
W
 
V
P
 
N
G
 
G
H
 
K
N
 
K
P
 
L
V
 
L
L
 
I
L
 
V
D
|
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
x
G
T
|
T
L
 
I
L
 
A
K
 
K
S
 
S
I
 
S
E
 
G
G
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
S
A
 
K
P
 
I
W
 
Y
C
 
V
V
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
S
L
 
E
E
 
N
R
 
K
L
 
I

3mbiD Crystal structure of the phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase from thermoplasma volcanium in complex with adp-mg2+ and ribose 5- phosphate (see paper)
27% identity, 80% coverage: 25:259/293 of query aligns to 14:251/285 of 3mbiD

query
sites
3mbiD
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
L
H
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
R
R
 
R
F
|
F
P
 
P
D
|
D
G
 
G
E
|
E
G
 
L
L
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
Y
E
 
D
E
 
E
P
 
D
P
 
L
V
 
T
G
 
G
A
 
H
E
 
N
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
G
T
 
N
L
 
T
D
 
-
R
 
H
P
 
S
D
 
D
E
 
A
K
 
E
T
 
V
L
 
M
P
 
E
L
 
M
L
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
I
R
 
Q
E
 
D
L
 
Y
G
 
R
A
 
T
G
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
N
L
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
H
A
 
Q
R
 
R
F
x
Y
R
 
K
P
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
S
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
F
 
L
G
 
T
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
E
 
S
H
 
Y
F
 
S
D
 
N
W
 
S
Q
 
I
V
 
A
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
I
H
|
H
L
 
D
H
 
E
R
 
K
L
 
T
R
 
L
S
 
S
L
 
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
V
G
 
K
M
 
F
P
 
S
Q
 
D
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
N
P
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
R
W
 
Y
L
 
Y
R
 
K
E
 
-
R
 
N
V
 
V
E
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
Y
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
D
E
 
G
S
 
G
A
 
L
P
 
A
W
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
K
M
 
L
S
 
G
A
 
K
P
 
K
A
 
H
V
 
F
V
 
F
A
 
I
T
 
E
K
|
K
R
 
K
R
|
R
F
 
I
G
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
T
V
 
V
Q
 
E
V
 
M
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
N
L
 
V
S
 
-
N
 
D
W
 
V
P
 
N
G
 
G
H
 
K
N
 
K
P
 
L
V
 
L
L
 
I
L
 
V
D
|
D
D
|
D
I
|
I
I
 
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
A
K
 
K
S
 
S
I
 
S
E
 
G
G
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
S
A
 
K
P
 
I
W
 
Y
C
 
V
V
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
S
L
 
E
E
 
N
R
 
K
L
 
I

3lpnA Crystal structure of the phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase from thermoplasma volcanium in complex with an atp analog (ampcpp). (see paper)
27% identity, 80% coverage: 25:259/293 of query aligns to 14:251/284 of 3lpnA

query
sites
3lpnA
A
 
A
R
|
R
L
 
I
A
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
L
H
 
K
-
 
T
-
 
E
-
 
P
-
 
V
-
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
R
R
 
R
F
|
F
P
 
P
D
|
D
G
 
G
E
|
E
G
 
L
L
 
Y
V
 
L
R
 
R
V
 
Y
E
 
D
E
 
E
P
 
D
P
 
L
V
 
T
G
 
G
A
 
H
E
 
N
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
G
T
 
N
L
 
T
D
 
-
R
 
H
P
x
S
D
 
D
E
 
A
K
 
E
T
 
V
L
 
M
P
 
E
L
 
M
L
 
I
M
 
L
A
 
T
A
 
L
D
 
S
T
 
A
L
 
I
R
 
Q
E
 
D
L
 
Y
G
 
R
A
 
T
G
 
K
S
 
S
V
 
V
G
 
N
L
 
I
V
 
I
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
x
H
A
 
Q
R
 
R
F
x
Y
R
 
K
P
 
N
G
 
G
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
S
S
 
S
G
 
Q
I
 
I
F
 
L
G
 
T
R
 
E
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
E
 
S
H
 
Y
F
 
S
D
 
N
W
 
S
Q
 
I
V
 
A
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
I
H
|
H
L
x
D
H
 
E
R
 
K
L
 
T
R
 
L
S
 
S
L
 
Y
T
 
S
E
 
K
A
 
V
G
 
K
M
 
F
P
 
S
Q
 
D
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
N
P
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
R
W
 
Y
L
 
Y
R
 
K
E
 
-
R
 
N
V
 
V
E
 
D
L
 
V
P
 
D
L
 
Y
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
D
E
 
G
S
 
G
A
 
L
P
 
A
W
 
R
V
 
V
E
 
A
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
K
M
 
L
S
 
G
A
 
K
P
 
K
A
 
H
V
 
F
V
 
F
A
 
I
T
 
E
K
 
K
R
 
K
R
 
R
F
 
I
G
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
T
V
 
V
Q
 
E
V
 
M
Q
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
N
L
 
V
S
 
-
N
 
D
W
 
V
P
 
N
G
 
G
H
 
K
N
 
K
P
 
L
V
 
L
L
 
I
L
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
|
S
S
x
T
G
|
G
H
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
A
K
 
K
S
 
S
I
 
S
E
 
G
G
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
K
G
 
G
M
 
A
P
 
S
A
 
K
P
 
I
W
 
Y
C
 
V
V
 
S
A
 
A
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
L
F
 
F
A
 
V
D
 
N
N
 
G
A
 
S
L
 
E
E
 
N
R
 
K
L
 
I

Sites not aligning to the query:

4s2uA Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase from e. Coli
25% identity, 92% coverage: 5:274/293 of query aligns to 5:275/308 of 4s2uA

query
sites
4s2uA
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
M
 
G
P
 
N
G
 
A
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
N
R
 
R
R
 
L
R
 
Y
M
 
T
A
 
S
R
 
L
L
 
G
A
 
D
L
 
A
E
 
A
L
 
V
H
 
G
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
S
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
E
 
N
E
 
E
P
 
N
P
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
E
 
D
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
C
R
 
A
P
 
P
-
 
T
D
 
N
E
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
V
M
 
V
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
V
R
 
R
P
 
S
G
 
A
E
 
R
A
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
V
F
 
V
G
 
A
R
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
S
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
L
H
 
H
L
 
A
H
 
E
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
-
G
 
-
M
 
V
P
 
P
Q
 
V
G
 
D
R
 
N
A
 
V
I
 
F
S
 
G
A
 
S
A
 
P
P
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
M
L
 
L
R
 
Q
E
 
L
R
 
N
V
 
L
E
 
D
L
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
I
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
V
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
N
A
 
D
P
 
T
A
 
D
V
 
M
V
 
A
A
 
I
T
 
I
K
 
D
R
 
K
R
 
R
F
 
R
G
 
P
D
 
R
R
 
A
K
 
N
V
 
V
Q
 
S
V
 
Q
Q
 
V
L
 
M
P
 
H
D
 
I
L
 
I
S
 
G
N
 
D
W
 
V
P
 
A
G
 
G
H
 
R
N
 
D
P
 
C
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
M
I
 
I
S
x
D
S
 
T
G
 
G
H
 
G
T
|
T
L
 
L
L
 
C
K
 
K
S
 
A
I
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
R
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
R
P
 
V
W
 
F
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
A
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
R
V
 
N
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
C
N
 
D
S
 
T
V
 
I
P
 
P

P0A717 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
25% identity, 92% coverage: 5:274/293 of query aligns to 6:276/315 of P0A717

query
sites
P0A717
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
M
 
G
P
 
N
G
 
A
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
N
R
 
R
R
 
L
R
 
Y
M
 
T
A
 
S
R
 
L
L
 
G
A
 
D
L
 
A
E
 
A
L
 
V
H
 
G
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
S
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
E
 
N
E
 
E
P
 
N
P
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
E
 
D
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
C
R
 
A
P
 
P
-
 
T
D
 
N
E
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
V
M
 
V
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
V
R
 
R
P
 
S
G
 
A
E
 
R
A
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
V
F
 
V
G
 
A
R
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
S
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
V
D
|
D
P
 
L
H
 
H
L
 
A
H
 
E
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
-
G
 
-
M
 
V
P
 
P
Q
 
V
G
 
D
R
 
N
A
 
V
I
 
F
S
 
G
A
 
S
A
 
P
P
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
M
L
 
L
R
 
Q
E
 
L
R
 
N
V
 
L
E
 
D
L
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
I
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
V
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
N
A
 
D
P
 
T
A
 
D
V
 
M
V
 
A
A
 
I
T
 
I
K
 
D
R
 
K
R
 
R
F
 
R
G
 
P
D
 
R
R
 
A
K
 
N
V
 
V
Q
 
S
V
 
Q
Q
 
V
L
 
M
P
 
H
D
 
I
L
 
I
S
 
G
N
 
D
W
 
V
P
 
A
G
 
G
H
 
R
N
 
D
P
 
C
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
|
D
D
|
D
I
 
M
I
 
I
S
x
D
S
 
T
G
 
G
H
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
C
K
 
K
S
 
A
I
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
R
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
R
P
 
V
W
 
F
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
A
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
R
V
 
N
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
C
N
 
D
S
 
T
V
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6asvC E. Coli prpp synthetase (see paper)
25% identity, 92% coverage: 5:274/293 of query aligns to 4:274/311 of 6asvC

query
sites
6asvC
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
M
 
G
P
 
N
G
 
A
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
N
R
 
R
R
 
L
R
 
Y
M
 
T
A
 
S
R
 
L
L
 
G
A
 
D
L
 
A
E
 
A
L
 
V
H
 
G
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
S
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
E
 
N
E
 
E
P
 
N
P
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
E
 
D
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
C
R
 
A
P
 
P
-
 
T
D
 
N
E
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
V
M
 
V
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
R
R
 
R
F
 
V
R
 
R
P
 
S
G
 
A
E
 
R
A
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
V
F
 
V
G
 
A
R
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
S
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
L
H
 
H
L
 
A
H
 
E
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
-
G
 
-
M
 
V
P
 
P
Q
 
V
G
 
D
R
 
N
A
 
V
I
 
F
S
 
G
A
 
S
A
 
P
P
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
M
L
 
L
R
 
Q
E
 
L
R
 
N
V
 
L
E
 
D
L
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
|
D
E
 
I
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
V
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
N
A
 
D
P
 
T
A
 
D
V
 
M
V
 
A
A
 
I
T
 
I
K
 
D
R
 
K
R
 
R
F
 
R
G
 
P
D
 
R
R
 
A
K
 
N
V
 
V
Q
 
S
V
 
Q
Q
 
V
L
 
M
P
 
H
D
 
I
L
 
I
S
 
G
N
 
D
W
 
V
P
 
A
G
 
G
H
 
R
N
 
D
P
 
C
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
|
D
D
|
D
I
 
M
I
 
I
S
x
D
S
x
T
G
|
G
H
 
G
T
|
T
L
|
L
L
 
C
K
 
K
S
 
A
I
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
R
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
R
P
 
V
W
 
F
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
A
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
R
V
 
N
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
C
N
 
D
S
 
T
V
 
I
P
 
P

7xmvA E.Coli phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase type a(amp/adp) filament bound with adp, amp and r5p (see paper)
26% identity, 92% coverage: 5:274/293 of query aligns to 4:268/307 of 7xmvA

query
sites
7xmvA
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
M
 
G
P
 
N
G
 
A
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
N
R
 
R
R
 
L
R
 
Y
M
 
T
A
 
S
R
 
L
L
 
G
A
 
D
L
 
A
E
 
A
L
 
V
H
 
G
R
 
R
F
|
F
P
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
G
 
V
L
 
S
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
E
 
N
E
 
E
P
 
N
P
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
E
 
D
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
C
R
 
A
P
 
P
-
 
T
D
 
N
E
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
V
M
 
V
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
 
Q
D
 
D
A
x
R
R
 
R
F
x
V
R
|
R
P
 
S
G
 
A
E
 
R
A
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
V
F
 
V
G
 
A
R
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
S
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
L
H
|
H
L
 
A
H
x
E
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
-
G
 
-
M
 
V
P
 
P
Q
 
V
G
 
D
R
 
N
A
 
V
I
x
F
S
 
G
A
x
S
A
 
P
P
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
M
L
 
L
R
 
Q
E
 
L
R
 
N
V
 
L
E
 
D
L
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
I
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
x
V
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
x
A
V
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
N
A
 
D
P
 
T
A
 
D
V
 
M
V
 
A
A
 
I
T
 
I
K
 
D
R
 
K
R
 
R
F
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
Q
 
M
V
 
H
Q
 
I
L
 
I
P
 
G
D
 
D
L
 
V
S
 
A
N
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
R
N
 
D
P
 
C
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
|
D
D
|
D
I
x
M
I
 
I
S
x
D
S
x
T
G
 
G
H
x
G
T
|
T
L
 
L
L
 
C
K
 
K
S
 
A
I
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
R
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
R
P
 
V
W
 
F
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
A
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
R
V
 
N
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
C
N
 
D
S
 
T
V
 
I
P
 
P

7xmuA E.Coli phosphoribosylpyrophosphate (prpp) synthetase type a filament bound with adp, pi and r5p (see paper)
26% identity, 92% coverage: 5:274/293 of query aligns to 4:268/307 of 7xmuA

query
sites
7xmuA
V
 
L
Y
 
F
A
 
A
M
 
G
P
 
N
G
 
A
N
 
T
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
N
R
 
R
R
 
L
R
 
Y
M
 
T
A
 
S
R
 
L
L
 
G
A
 
D
L
 
A
E
 
A
L
 
V
H
 
G
R
 
R
F
|
F
P
 
S
D
|
D
G
 
G
E
|
E
G
 
V
L
 
S
V
 
V
R
 
Q
V
 
I
E
 
N
E
 
E
P
 
N
P
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
G
E
 
D
A
 
I
I
 
F
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
C
R
 
A
P
 
P
-
 
T
D
 
N
E
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
V
M
 
V
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
R
V
 
I
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
A
x
R
R
 
R
F
 
V
R
|
R
P
 
S
G
 
A
E
 
R
A
 
V
-
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
V
F
 
V
G
 
A
R
 
D
L
 
F
L
 
L
A
 
S
E
 
S
-
 
V
H
 
G
F
 
V
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
V
D
 
D
P
 
L
H
|
H
L
 
A
H
x
E
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
-
G
 
-
M
 
V
P
 
P
Q
 
V
G
 
D
R
 
N
A
 
V
I
x
F
S
 
G
A
x
S
A
 
P
P
 
I
A
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
D
W
 
M
L
 
L
R
 
Q
E
 
L
R
 
N
V
 
L
E
 
D
L
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
V
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
|
D
E
 
I
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
x
V
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
L
M
 
L
S
 
N
A
 
D
P
 
T
A
 
D
V
 
M
V
 
A
A
 
I
T
 
I
K
 
D
R
 
K
R
 
R
F
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
R
K
 
Q
V
 
V
Q
 
M
V
 
H
Q
 
I
L
 
I
P
 
G
D
 
D
L
 
V
S
 
A
N
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
R
N
 
D
P
 
C
V
 
V
L
 
L
L
 
V
D
|
D
D
 
D
I
x
M
I
 
I
S
x
D
S
x
T
G
 
G
H
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
C
K
 
K
S
 
A
I
 
A
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
R
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
R
P
 
V
W
 
F
C
 
A
V
 
Y
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
A
E
 
N
R
 
N
L
 
L
R
 
R
V
 
N
A
 
S
G
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
C
N
 
D
S
 
T
V
 
I
P
 
P

P14193 Ribose-phosphate pyrophosphokinase; RPPK; 5-phospho-D-ribosyl alpha-1-diphosphate synthase; Phosphoribosyl diphosphate synthase; Phosphoribosyl pyrophosphate synthase; P-Rib-PP synthase; PPRibP synthase; PRPP synthase; PRPPase; EC 2.7.6.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 4 papers)
24% identity, 92% coverage: 5:273/293 of query aligns to 12:279/317 of P14193

query
sites
P14193
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
L
P
 
N
G
 
S
N
 
N
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
I
R
 
V
R
 
G
M
 
V
A
 
Q
R
 
L
L
 
G
A
 
K
L
 
C
E
 
S
L
 
V
H
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
Q
V
 
I
R
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
E
P
 
S
P
 
I
V
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
D
A
 
C
I
 
Y
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
S
R
 
D
P
 
P
-
 
V
D
 
N
E
 
E
K
 
H
T
 
I
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
I
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
A
 
R
R
 
K
F
 
A
R
 
R
P
 
S
G
 
R
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
L
F
 
F
G
 
A
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
T
H
 
A
F
 
G
D
 
A
W
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
-
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
L
H
 
H
L
 
A
H
 
P
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
I
G
 
P
M
 
I
P
 
D
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
M
A
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
W
 
Y
L
 
F
R
 
E
-
 
G
E
 
K
R
 
N
V
 
L
E
 
E
L
 
D
P
 
I
L
 
V
L
 
I
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
H
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
T
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
K
V
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
R
M
 
L
S
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
I
V
 
A
V
 
I
A
 
I
T
 
D
K
|
K
R
 
R
R
|
R
F
 
P
G
x
R
D
 
P
R
x
N
K
 
V
V
 
A
Q
x
E
V
 
V
Q
 
-
L
 
M
P
 
N
D
 
I
L
 
V
S
 
G
N
 
N
W
 
I
P
 
E
G
 
G
H
 
K
N
 
T
P
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
x
D
S
x
T
G
x
A
H
x
G
T
|
T
L
 
I
L
 
T
K
 
L
S
 
A
I
 
A
E
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
E
L
 
N
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
E
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
C
A
 
C
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
S
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
N
V
 
N
A
 
S
G
 
T
V
 
I
A
 
K
G
 
E
V
 
L
V
 
V
T
 
V
T
 
T
N
 
N
S
 
S
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1dkuA Crystal structures of bacillus subtilis phosphoribosylpyrophosphate synthetase: molecular basis of allosteric inhibition and activation. (see paper)
23% identity, 94% coverage: 5:279/293 of query aligns to 4:268/295 of 1dkuA

query
sites
1dkuA
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
L
P
 
N
G
 
S
N
 
N
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
I
R
 
V
R
 
G
M
 
V
A
 
Q
R
 
L
L
 
G
A
 
K
L
 
C
E
 
S
L
 
V
H
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
Q
V
 
I
R
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
E
P
 
S
P
 
I
V
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
D
A
 
C
I
 
Y
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
S
R
 
D
P
 
P
-
 
V
D
 
N
E
 
E
K
 
H
T
 
I
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
I
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
 
Q
D
 
D
A
 
R
R
x
K
F
 
A
R
 
R
P
x
S
G
x
R
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
L
F
 
F
G
 
A
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
T
H
 
A
F
 
G
D
 
A
W
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
-
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
L
H
|
H
L
 
A
H
 
P
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
I
G
 
P
M
 
I
P
x
D
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
M
A
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
W
 
Y
L
 
F
R
 
E
-
 
G
E
 
K
R
 
N
V
 
L
E
 
E
L
 
D
P
 
I
L
 
V
L
 
I
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
H
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
T
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
K
V
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
R
M
 
L
S
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
I
V
 
A
V
 
I
A
 
I
T
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
M
P
 
N
D
 
I
L
 
V
S
 
G
N
 
N
W
 
I
P
 
E
G
 
G
H
 
K
N
 
T
P
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
D
S
 
T
G
 
A
H
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
T
K
 
L
S
 
A
I
 
A
E
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
E
L
 
N
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
E
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
C
A
 
C
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
S
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
N
V
 
N
A
 
S
G
 
T
V
 
I
A
 
K
G
 
E
V
 
L
V
 
V
T
 
V
T
 
T
N
 
N
S
 
S
V
 
I
P
 
K
G
 
L
E
 
K
T
 
I
A
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ibsA Phosphoribosyldiphosphate synthetase in complex with cadmium ions (see paper)
24% identity, 92% coverage: 5:273/293 of query aligns to 4:260/297 of 1ibsA

query
sites
1ibsA
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
L
P
 
N
G
 
S
N
 
N
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
I
R
 
V
R
 
G
M
 
V
A
 
Q
R
 
L
L
 
G
A
 
K
L
 
C
E
 
S
L
 
V
H
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
Q
V
 
I
R
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
E
P
 
S
P
 
I
V
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
D
A
 
C
I
 
Y
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
S
R
 
D
P
 
P
-
 
V
D
 
N
E
 
E
K
 
H
T
 
I
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
I
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
A
x
R
R
 
K
F
 
S
R
 
R
P
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
L
F
 
F
G
 
A
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
T
H
 
A
F
 
G
D
 
A
W
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
-
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
L
H
|
H
L
 
A
H
 
P
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
I
G
 
P
M
 
I
P
 
D
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
M
A
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
W
 
Y
L
 
F
R
 
E
-
 
G
E
 
K
R
 
N
V
 
L
E
 
E
L
 
D
P
 
I
L
 
V
L
 
I
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
H
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
T
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
K
V
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
R
M
 
L
S
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
I
V
 
A
V
 
I
A
 
I
T
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
M
P
 
N
D
 
I
L
 
V
S
 
G
N
 
N
W
 
I
P
 
E
G
 
G
H
 
K
N
 
T
P
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
x
D
S
x
T
G
x
A
H
 
G
T
|
T
L
 
I
L
 
T
K
 
L
S
 
A
I
 
A
E
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
E
L
 
N
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
E
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
C
A
 
C
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
S
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
N
V
 
N
A
 
S
G
 
T
V
 
I
A
 
K
G
 
E
V
 
L
V
 
V
T
 
V
T
 
T
N
 
N
S
 
S
V
 
I

1ibsB Phosphoribosyldiphosphate synthetase in complex with cadmium ions (see paper)
24% identity, 92% coverage: 5:273/293 of query aligns to 6:262/299 of 1ibsB

query
sites
1ibsB
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
L
P
 
N
G
 
S
N
 
N
Q
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
I
R
 
V
R
 
G
M
 
V
A
 
Q
R
 
L
L
 
G
A
 
K
L
 
C
E
 
S
L
 
V
H
 
T
R
 
R
F
 
F
P
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
V
L
 
Q
V
 
I
R
 
N
V
 
I
E
 
E
E
 
E
P
 
S
P
 
I
V
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
D
A
 
C
I
 
Y
I
 
I
V
 
I
C
 
Q
T
 
S
L
 
T
D
 
S
R
 
D
P
 
P
-
 
V
D
 
N
E
 
E
K
 
H
T
 
I
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
I
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
R
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
K
S
 
T
V
 
I
G
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
A
x
R
R
 
K
F
 
S
R
 
R
P
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
P
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
K
I
 
L
F
 
F
G
 
A
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
T
H
 
A
F
 
G
D
 
A
W
 
T
Q
 
R
V
 
V
T
 
I
-
 
A
I
 
L
D
 
D
P
 
L
H
 
H
L
 
A
H
 
P
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
I
G
 
P
M
 
I
P
 
D
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
M
A
 
G
A
 
V
P
 
P
A
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
W
 
Y
L
 
F
R
 
E
-
 
G
E
 
K
R
 
N
V
 
L
E
 
E
L
 
D
P
 
I
L
 
V
L
 
I
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
H
E
 
G
S
 
G
A
 
V
P
 
T
W
 
R
V
 
A
E
 
R
S
 
K
V
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
R
M
 
L
S
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
I
V
 
A
V
 
I
A
 
I
T
 
D
K
 
K
R
 
R
R
 
-
F
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
-
L
 
M
P
 
N
D
 
I
L
 
V
S
 
G
N
 
N
W
 
I
P
 
E
G
 
G
H
 
K
N
 
T
P
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
I
S
 
D
S
 
T
G
 
A
H
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
T
K
 
L
S
 
A
I
 
A
E
 
N
G
 
A
L
 
L
R
 
V
A
 
E
L
 
N
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
E
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
C
A
 
C
V
 
T
H
 
H
G
 
P
L
 
V
F
 
L
A
 
S
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
I
R
 
N
V
 
N
A
 
S
G
 
T
V
 
I
A
 
K
G
 
E
V
 
L
V
 
V
T
 
V
T
 
T
N
 
N
S
 
S
V
 
I

2hcrA Crystal structure of human phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1 in complex with amp(atp), cadmium and sulfate ion (see paper)
24% identity, 98% coverage: 5:290/293 of query aligns to 4:292/305 of 2hcrA

query
sites
2hcrA
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
G
P
 
S
G
 
S
N
 
H
Q
 
Q
E
 
D
L
 
L
A
 
S
D
 
Q
A
 
K
L
 
I
A
 
A
H
 
D
R
 
R
R
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
V
-
 
T
H
 
K
R
 
K
F
 
F
P
 
S
D
 
N
G
 
Q
E
 
E
G
 
T
L
 
C
V
 
V
R
 
E
V
 
I
E
 
G
E
 
E
P
 
S
P
 
V
V
 
R
G
 
G
A
 
E
E
 
D
A
 
V
I
 
Y
I
 
I
V
 
V
C
 
Q
T
 
S
-
 
G
L
 
C
D
 
G
R
 
E
P
 
I
D
 
N
E
 
D
K
 
N
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
I
A
 
M
A
 
I
D
 
N
T
 
A
L
 
C
R
 
K
E
 
I
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
S
S
 
R
V
 
V
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
C
L
 
F
A
 
P
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
|
Q
D
 
D
A
x
K
R
 
K
F
 
D
R
 
K
P
 
S
G
 
R
E
 
A
A
 
P
V
 
I
S
 
S
S
 
A
G
 
K
I
 
L
F
 
V
G
 
A
R
 
N
L
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
G
A
 
A
E
 
D
H
 
H
F
 
I
D
 
-
W
 
-
Q
 
-
V
 
I
T
 
T
I
 
M
D
 
D
P
 
L
H
|
H
L
 
A
H
 
S
R
 
Q
L
 
I
R
 
Q
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
D
A
 
I
G
 
P
M
 
V
P
 
D
Q
 
N
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
Y
A
 
A
A
 
E
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
L
G
 
K
W
 
W
L
 
I
R
 
R
E
 
E
R
 
N
V
 
I
E
 
S
-
 
E
-
 
W
-
 
R
L
 
N
P
 
C
L
 
T
L
 
I
I
 
V
G
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
A
E
 
G
S
 
G
A
 
A
P
 
K
W
 
R
V
 
V
E
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
A
 
D
L
 
R
M
 
L
S
 
N
A
 
V
P
 
D
A
 
F
V
 
A
V
 
L
A
 
I
T
 
H
K
 
K
R
 
E
R
 
R
F
 
-
G
 
-
D
 
D
R
 
R
K
 
M
V
 
V
Q
 
L
V
 
V
Q
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
G
N
 
D
W
 
V
P
 
K
G
 
D
H
 
R
N
 
V
P
 
A
V
 
I
L
 
L
L
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
M
I
 
A
S
 
D
S
 
T
G
 
C
H
 
G
T
 
T
L
 
I
L
 
C
K
 
H
S
 
A
I
 
A
E
 
D
G
 
K
L
 
L
R
 
L
A
 
S
L
 
A
G
 
G
M
 
A
P
 
T
A
 
R
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
I
A
 
L
V
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
I
F
 
F
A
 
S
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
I
E
 
S
R
 
R
L
 
I
R
 
N
V
 
N
A
 
A
G
 
C
V
 
F
A
 
E
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
V
T
 
T
N
 
N
S
 
T
V
 
I
P
 
P
G
 
Q
E
 
E
T
 
D
A
 
K
R
 
M
-
 
K
-
 
H
-
 
C
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
Q
-
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
S
 
S
E
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I

7pn0A Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase ii from thermus thermophilus at r32 space group
24% identity, 92% coverage: 4:274/293 of query aligns to 4:274/312 of 7pn0A

query
sites
7pn0A
V
 
L
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
G
P
 
Q
G
 
S
N
 
N
Q
 
R
E
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
E
R
 
A
R
 
L
R
 
G
M
 
L
A
 
P
R
 
L
L
 
G
A
 
K
L
 
S
E
 
T
L
 
T
H
 
L
R
 
R
F
 
F
P
 
A
D
 
N
G
 
D
E
 
N
G
 
L
L
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
Y
E
 
E
E
 
E
P
 
S
P
 
L
V
 
R
G
 
E
A
 
G
E
 
D
A
 
V
I
 
F
I
 
I
V
 
V
C
 
Q
T
 
S
L
 
F
D
 
V
R
 
P
P
 
P
-
 
V
D
 
Q
E
 
D
K
 
H
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
R
V
 
V
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
S
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
x
S
D
 
D
A
 
K
R
 
K
F
 
D
R
 
A
P
 
P
G
 
R
E
 
I
A
 
S
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
R
I
 
L
F
 
I
G
 
A
R
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
T
H
 
A
-
 
G
F
 
A
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
M
D
 
T
P
 
L
H
|
H
L
 
S
H
 
P
R
 
Q
L
 
V
R
 
H
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
K
A
 
I
G
 
P
M
 
V
P
 
D
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
E
P
 
P
A
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
N
W
 
Y
L
 
F
R
 
A
E
 
T
R
 
R
V
 
V
E
 
D
L
 
L
-
 
E
-
 
N
P
 
A
L
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
D
E
 
A
E
 
G
S
 
D
A
 
L
P
 
K
W
 
R
V
 
A
E
 
S
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
R
M
 
L
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
V
 
A
V
 
F
A
 
I
T
 
D
K
 
K
R
 
E
R
 
R
F
 
V
G
 
S
D
 
D
R
 
T
K
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
Q
 
R
L
 
M
P
 
L
D
 
-
L
 
V
S
 
G
N
 
E
W
 
V
P
 
E
G
 
G
H
 
K
N
 
T
P
 
A
V
 
L
L
 
I
L
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
E
I
 
I
S
 
S
S
 
T
G
 
A
H
 
G
T
 
S
L
 
L
L
 
V
K
 
E
S
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
M
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
E
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
A
 
V
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
I
R
 
A
V
 
K
A
 
S
G
 
P
V
 
V
A
 
K
G
 
E
V
 
V
V
 
A
T
 
A
T
 
T
N
 
D
S
 
T
V
 
C
P
 
P

5t3oA Crystal structure of the phosphorybosylpyrophosphate synthetase ii from thermus thermophilus (see paper)
24% identity, 92% coverage: 4:274/293 of query aligns to 3:273/307 of 5t3oA

query
sites
5t3oA
V
 
L
V
 
I
Y
 
F
A
 
S
M
 
G
P
 
Q
G
 
S
N
 
N
Q
 
R
E
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
E
R
 
A
R
 
L
R
 
G
M
 
L
A
 
P
R
 
L
L
 
G
A
 
K
L
 
S
E
 
T
L
 
T
H
 
L
R
 
R
F
 
F
P
 
A
D
 
N
G
 
D
E
 
N
G
 
L
L
 
F
V
 
V
R
 
R
V
 
Y
E
 
E
E
 
E
P
x
S
P
 
L
V
x
R
G
 
E
A
 
G
E
 
D
A
 
V
I
 
F
I
 
I
V
 
V
C
 
Q
T
 
S
L
 
F
D
 
V
R
 
P
P
 
P
-
 
V
D
 
Q
E
 
D
K
 
H
T
 
L
L
 
M
P
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
M
A
 
M
A
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
A
R
 
K
E
 
G
L
 
A
G
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
R
V
 
V
G
 
T
L
 
A
V
 
V
A
 
I
P
 
P
Y
 
Y
L
 
F
A
 
S
Y
 
Y
L
 
A
R
|
R
Q
x
S
D
 
D
A
 
K
R
 
K
F
x
D
R
 
A
P
 
P
G
 
R
E
 
I
A
 
S
V
 
I
S
 
T
S
 
A
G
 
R
I
 
L
F
 
I
G
 
A
R
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
T
H
 
A
-
 
G
F
 
A
D
 
D
W
 
R
Q
 
V
V
 
L
T
 
T
I
 
M
D
 
T
P
 
L
H
|
H
L
 
S
H
 
P
R
 
Q
L
 
V
R
 
H
S
 
G
L
 
F
T
 
F
E
 
K
A
 
I
G
 
P
M
 
V
P
 
D
Q
 
H
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
E
P
 
P
A
 
V
L
 
I
A
 
A
G
 
N
W
 
Y
L
 
F
R
 
A
E
 
T
R
 
R
V
 
V
E
 
D
L
 
L
-
 
E
-
 
N
P
 
A
L
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
D
E
 
A
E
 
G
S
 
D
A
 
L
P
 
K
W
 
R
V
 
A
E
 
S
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
R
M
 
L
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
V
 
A
V
 
F
A
 
I
T
 
D
K
 
K
R
 
E
R
|
R
F
 
V
G
 
S
D
 
D
R
 
T
K
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
Q
 
R
L
 
M
P
 
L
D
 
-
L
 
V
S
 
G
N
 
E
W
 
V
P
 
E
G
 
G
H
 
K
N
 
T
P
 
A
V
 
L
L
 
I
L
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
E
I
 
I
S
 
S
S
 
T
G
 
A
H
 
G
T
 
S
L
 
L
L
 
V
K
 
E
S
 
A
I
 
V
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
M
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
M
 
A
P
 
K
A
 
E
P
 
V
W
 
Y
C
 
A
V
 
A
A
 
A
V
 
T
H
 
H
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
A
 
V
D
 
G
N
 
P
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
R
L
 
I
R
 
A
V
 
K
A
 
S
G
 
P
V
 
V
A
 
K
G
 
E
V
 
V
V
 
A
T
 
A
T
 
T
N
 
D
S
 
T
V
 
C
P
 
P

Query Sequence

>N515DRAFT_2463 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2463
MRHVVYAMPGNQELADALAHRRRMARLALELHRFPDGEGLVRVEEPPVGAEAIIVCTLDR
PDEKTLPLLMAADTLRELGAGSVGLVAPYLAYLRQDARFRPGEAVSSGIFGRLLAEHFDW
QVTIDPHLHRLRSLTEAGMPQGRAISAAPALAGWLRERVELPLLIGPDEESAPWVESVAA
LMSAPAVVATKRRFGDRKVQVQLPDLSNWPGHNPVLLDDIISSGHTLLKSIEGLRALGMP
APWCVAVHGLFADNALERLRVAGVAGVVTTNSVPGETARIDLSELLAAALPEH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory