SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2810 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2810 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7aqrF Cryo-em structure of arabidopsis thaliana complex-i (peripheral arm) (see paper)
52% identity, 83% coverage: 50:413/436 of query aligns to 49:415/434 of 7aqrF

query
sites
7aqrF
L
 
I
I
 
V
E
 
N
E
 
E
I
 
M
K
 
K
K
 
K
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
|
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
G
 
V
N
 
S
M
 
D
Q
 
G
K
 
R
-
 
P
-
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
 
E
S
 
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
I
A
 
A
C
 
G
Y
 
V
C
 
G
T
 
M
G
 
R
S
 
A
T
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
Y
H
 
V
H
 
N
E
 
E
P
 
R
Y
 
L
E
 
-
H
 
N
F
 
L
E
 
E
E
 
K
A
 
A
L
 
R
K
 
R
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
E
I
 
V
Y
 
Y
G
 
I
A
 
H
L
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
|
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
N
F
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
x
T
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
P
D
 
E
W
 
W
F
 
F
L
 
S
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
K
K
 
N
N
 
N
G
 
A
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
C
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
K
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
I
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
R
-
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
R
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
A
A
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
N
Q
 
I
L
 
C
K
 
E
G
 
D
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
A
L
 
V
K
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
K
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
D
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
S
Q
 
Y
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
T
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
W
R
 
M
V
 
I
L
 
M
D
 
E
R
 
R
I
 
M
V
 
K
E
 
V
G
 
G
K
 
N
G
 
A
T
 
K
M
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
I
 
V
A
 
T
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F

7arcF Cryo-em structure of polytomella complex-i (peripheral arm) (see paper)
51% identity, 86% coverage: 50:423/436 of query aligns to 50:426/430 of 7arcF

query
sites
7arcF
L
 
I
I
 
I
E
 
D
E
 
Q
I
 
I
K
 
K
K
 
K
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
A
T
 
S
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
P
 
P
K
 
K
G
 
V
N
 
S
M
 
D
Q
 
G
K
 
R
-
 
P
-
 
S
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
G
D
|
D
E
|
E
S
|
S
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
H
N
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
V
A
 
A
C
 
G
Y
 
T
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
R
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
V
H
 
N
E
 
E
P
 
-
Y
 
R
E
 
K
H
 
A
F
 
V
E
 
E
E
 
R
A
 
A
L
 
V
K
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
L
Y
 
F
G
 
V
A
 
H
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
G
F
 
M
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
x
T
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
P
D
 
E
W
 
W
F
 
F
L
 
S
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
K
K
 
N
N
 
N
G
 
A
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
A
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
R
G
 
P
G
 
V
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
I
T
 
P
F
 
L
D
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
R
-
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
R
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
A
A
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
V
P
 
P
V
 
L
L
 
L
K
 
P
A
 
K
E
 
K
Q
 
M
L
 
C
K
 
D
G
 
D
L
 
V
P
 
I
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
T
L
 
A
K
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
N
D
 
K
T
 
D
V
 
T
C
 
D
T
 
V
V
 
I
R
 
D
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
S
Q
 
Y
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
T
G
 
G
W
 
W
M
 
L
H
 
Y
R
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
S
R
 
R
I
 
M
V
 
R
E
 
K
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
R
M
 
L
E
 
E
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
T
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
S
E
 
E
F
 
M
E
 
E
Y
 
D
Y
 
R
I
 
I
V
 
K
N
 
N

8eswV1 NADH dehydrogenase (Ubiquinone) 24 kDa subunit, isoform A (see paper)
46% identity, 95% coverage: 3:418/436 of query aligns to 12:427/439 of 8eswV1

query
sites
8eswV1
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
L
P
 
A
Q
 
D
E
 
E
H
 
D
Q
 
R
V
 
I
V
 
-
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
A
T
 
L
Q
 
K
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
V
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
A
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
V
E
 
N
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
L
 
M
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
G
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
|
E
S
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
I
A
 
A
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
x
Y
H
x
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
M
E
x
Q
E
 
L
A
 
A
L
 
I
K
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
|
D
I
 
V
Y
 
F
G
 
M
A
 
H
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
|
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
 
T
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
V
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
T
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
R
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
I
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
R
-
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
N
Q
 
V
L
 
C
K
 
D
G
 
D
L
 
V
P
 
I
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
G
L
 
L
R
 
I
D
 
A
L
 
A
K
 
Q
T
 
T
G
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
K
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
V
V
 
I
R
 
K
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
I
Q
 
S
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
H
 
N
R
 
K
V
 
I
L
 
M
D
 
T
R
 
R
I
 
F
V
 
V
E
 
K
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
Q
M
 
P
E
 
A
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
|
I
C
|
C
A
|
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
I
E
 
E

8b9zF Drosophila melanogaster complex i in the active state (dm1) (see paper)
46% identity, 95% coverage: 3:418/436 of query aligns to 14:429/441 of 8b9zF

query
sites
8b9zF
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
L
P
 
A
Q
 
D
E
 
E
H
 
D
Q
 
R
V
 
I
V
 
-
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
A
T
 
L
Q
 
K
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
V
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
A
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
V
E
 
N
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
L
 
M
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
G
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
 
E
S
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
I
A
 
A
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
M
E
 
Q
E
 
L
A
 
A
L
 
I
K
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
G
 
M
A
 
H
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
 
E
E
|
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
 
T
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
V
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
T
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
R
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
I
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
R
-
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
N
Q
 
V
L
 
C
K
 
D
G
 
D
L
 
V
P
 
I
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
G
L
 
L
R
 
I
D
 
A
L
 
A
K
 
Q
T
 
T
G
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
K
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
V
V
 
I
R
 
K
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
I
Q
 
S
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
H
 
N
R
 
K
V
 
I
L
 
M
D
 
T
R
 
R
I
 
F
V
 
V
E
 
K
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
Q
M
 
P
E
 
A
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
|
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
I
E
 
E

7b0nF 3.7-angstrom structure of Yarrowia lipolytica complex I with an R121M mutation in NUCM. (see paper)
45% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 7:421/460 of 7b0nF

query
sites
7b0nF
Q
 
K
E
 
D
H
 
Q
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
Q
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
D
D
 
N
K
 
Y
P
 
G
W
 
W
A
 
D
M
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
A
T
 
R
Q
 
K
V
 
Q
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
L
E
 
K
K
 
-
P
 
-
D
 
G
P
 
D
N
 
T
A
 
W
L
 
I
I
 
I
E
 
D
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
K
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
W
P
 
E
K
 
K
G
 
N
N
 
E
M
 
G
Q
 
P
K
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
|
E
S
x
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
L
A
 
A
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
A
H
 
V
F
 
L
E
 
Q
E
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
Y
G
 
I
A
 
H
L
 
R
G
 
G
A
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
V
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
T
 
T
A
 
S
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
A
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
G
F
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
P
S
 
S
T
 
T
I
 
V
N
 
T
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
D
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
C
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
N
V
 
V
Q
 
N
K
 
E
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
I
T
 
P
F
 
L
D
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
K
-
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
K
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
C
S
 
S
M
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
K
 
P
A
 
K
E
 
N
Q
 
I
L
 
C
K
 
E
G
 
D
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
D
L
 
V
K
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
N
D
 
K
T
 
Q
V
 
Q
C
 
D
T
 
V
V
 
I
R
 
R
F
 
A
T
 
I
R
 
Q
R
 
R
I
 
F
S
 
A
Q
 
A
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
 
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
T
G
 
T
W
 
W
M
 
L
H
 
L
R
 
K
V
 
A
L
 
M
D
 
D
R
 
R
I
 
F
V
 
R
E
 
T
G
 
G
K
 
Q
G
 
A
T
 
K
M
 
E
E
 
R
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
L
K
 
Y
A
 
E
I
 
L
A
 
T
G
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
F
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
N
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
M
E
 
E

7o6yB Cryo-em structure of respiratory complex i under turnover (see paper)
45% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 6:420/457 of 7o6yB

query
sites
7o6yB
Q
 
K
E
 
D
H
 
Q
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
Q
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
D
D
 
N
K
 
Y
P
 
G
W
 
W
A
 
D
M
 
L
D
 
A
S
 
S
Y
 
A
T
 
R
Q
 
K
V
 
Q
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
L
E
 
K
K
 
-
P
 
-
D
 
G
P
 
D
N
 
T
A
 
W
L
 
I
I
 
I
E
 
D
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
K
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
|
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
P
 
P
T
 
S
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
G
-
 
W
P
 
E
K
 
K
G
 
N
N
 
E
M
 
G
Q
 
P
K
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
|
E
S
 
G
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
R
F
 
K
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
L
A
 
A
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
A
H
 
V
F
 
L
E
 
Q
E
 
T
A
 
A
L
 
I
K
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
D
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
Y
G
 
I
A
 
H
L
 
R
G
 
G
A
 
M
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
V
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
|
E
T
 
T
A
 
S
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
A
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
|
F
P
 
P
A
 
A
N
 
G
F
 
V
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
K
 
R
P
 
P
S
 
S
T
 
T
I
 
V
N
x
T
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
D
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
C
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
N
V
 
V
Q
 
N
K
 
E
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
I
T
 
P
F
 
L
D
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
K
-
 
H
A
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
K
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
G
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
C
S
 
S
M
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
K
 
P
A
 
K
E
 
N
Q
 
I
L
 
C
K
 
E
G
 
D
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
K
D
 
D
L
 
V
K
 
Q
T
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
N
D
 
K
T
 
Q
V
 
Q
C
 
D
T
 
V
V
 
I
R
 
R
F
 
A
T
 
I
R
 
Q
R
 
R
I
 
F
S
 
A
Q
 
A
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
T
G
 
T
W
 
W
M
 
L
H
 
L
R
 
K
V
 
A
L
 
M
D
 
D
R
 
R
I
 
F
V
 
R
E
 
T
G
 
G
K
 
Q
G
 
A
T
 
K
M
 
E
E
 
R
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
M
L
 
L
K
 
Y
A
 
E
I
 
L
A
 
T
G
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
N
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
M
E
 
E

P49821 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial; NDUFV1; Complex I-51kD; CI-51kD; NADH dehydrogenase flavoprotein 1; NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit; EC 7.1.1.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
47% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 36:447/464 of P49821

query
sites
P49821
Q
 
K
E
 
D
H
 
E
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
S
T
 
L
Q
 
S
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
I
 
I
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
S
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
 
N
S
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
V
A
 
G
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
L
E
 
Q
E
 
V
A
 
A
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
G
 
V
A
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
 
A
N
 
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
T
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
G
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
H
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
V
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
K
-
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
T
P
 
P
V
 
L
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
S
Q
 
V
L
 
C
K
 
E
G
 
T
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
V
D
 
Q
L
 
A
K
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
R
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
I
V
 
V
R
 
K
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
I
Q
 
E
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
H
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
M
D
 
A
R
 
R
I
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
R
M
 
P
E
 
A
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
F
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
L
E
 
E

P25708 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial; NDUFV1; Complex I-51kD; CI-51kD; NADH dehydrogenase flavoprotein 1; NADH-ubiquinone oxidoreductase 51 kDa subunit; EC 7.1.1.2 from Bos taurus (Bovine) (see paper)
46% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 36:447/464 of P25708

query
sites
P25708
Q
 
K
E
 
D
H
 
E
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
A
T
 
Q
Q
 
S
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
I
 
V
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
S
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
 
N
S
 
A
D
 
D
E
 
E
S
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
V
A
 
G
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
L
E
 
Q
E
 
V
A
 
A
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
G
 
V
A
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
 
C
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
 
A
N
 
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
A
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
N
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
V
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
K
-
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
T
P
 
P
V
 
L
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
S
Q
 
V
L
 
C
K
 
E
G
 
T
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
I
D
 
Q
L
 
A
K
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
R
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
I
V
 
V
R
 
K
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
I
Q
 
E
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
 
G
Q
 
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
H
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
M
D
 
A
R
 
R
I
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
R
M
 
P
E
 
A
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
I
 
I
C
|
C
A
 
A
F
 
L
G
 
G
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
L
E
 
E

6zk91 Peripheral domain of open complex i during turnover (see paper)
46% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 8:419/430 of 6zk91

query
sites
6zk91
Q
 
K
E
 
D
H
 
E
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
A
T
 
Q
Q
 
S
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
I
 
V
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
 
R
G
|
G
G
|
G
A
|
A
G
 
G
F
|
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
S
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
|
E
S
 
G
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
V
A
 
G
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
L
E
 
Q
E
 
V
A
 
A
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
G
 
V
A
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
|
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
|
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
|
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
x
A
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
A
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
N
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
V
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
K
-
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
T
P
 
P
V
 
L
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
S
Q
 
V
L
 
C
K
 
E
G
 
T
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
I
D
 
Q
L
 
A
K
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
R
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
I
V
 
V
R
 
K
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
I
Q
 
E
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
 
S
C
|
C
G
|
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
H
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
M
D
 
A
R
 
R
I
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
R
M
 
P
E
 
A
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
 
I
C
|
C
A
|
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
L
E
 
E

5lnk1 Entire ovine respiratory complex i (see paper)
46% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 10:421/432 of 5lnk1

query
sites
5lnk1
Q
 
K
E
 
D
H
 
E
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
A
T
 
Q
Q
 
S
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
I
 
V
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
|
G
R
|
R
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
S
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
|
E
S
x
G
E
 
E
P
|
P
G
|
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
V
A
 
G
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
 
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
L
E
 
Q
E
 
V
A
 
A
L
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
 
F
G
 
V
A
 
V
L
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
I
 
I
C
 
C
G
|
G
E
|
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
|
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
x
V
N
x
A
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
|
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
A
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
N
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
V
T
 
P
F
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
I
E
 
E
M
 
K
-
 
H
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
R
 
T
P
 
G
G
 
G
-
 
W
R
 
D
K
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
A
A
 
V
I
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
S
S
 
S
M
 
T
P
 
P
V
 
L
L
 
I
K
 
P
A
 
K
E
 
S
Q
 
V
L
 
C
K
 
E
G
 
T
L
 
V
P
 
L
F
 
M
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
L
R
 
I
D
 
Q
L
 
A
K
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
M
D
 
D
D
 
R
T
 
S
V
 
T
C
 
D
T
 
I
V
 
V
R
 
K
F
 
A
T
 
I
R
 
A
R
 
R
I
 
L
S
 
I
Q
 
E
F
 
F
F
 
Y
H
 
K
K
 
H
E
 
E
S
|
S
C
|
C
G
 
G
Q
|
Q
C
|
C
T
 
T
P
 
P
C
|
C
R
 
R
E
 
E
G
 
G
T
 
V
G
 
D
W
 
W
M
 
M
H
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
M
D
 
A
R
 
R
I
 
F
V
 
V
E
 
R
G
 
G
K
 
D
G
 
A
T
 
R
M
 
P
E
 
A
D
 
E
L
 
I
H
 
D
R
 
S
L
 
L
K
 
W
A
 
E
I
 
I
A
 
S
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
|
T
I
|
I
C
|
C
A
 
A
F
x
L
G
 
G
E
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
L
L
 
I
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
W
 
R
D
 
P
E
 
E
F
 
L
E
 
E

7dgq8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial (see paper)
46% identity, 94% coverage: 8:418/436 of query aligns to 5:416/427 of 7dgq8

query
sites
7dgq8
Q
 
K
E
 
D
H
 
E
Q
 
D
V
 
R
V
 
I
Y
 
F
T
 
T
T
 
N
L
 
L
H
 
Y
F
 
G
D
 
R
K
 
H
P
 
D
W
 
W
A
 
R
M
 
L
D
 
K
S
 
G
Y
 
A
T
 
Q
Q
 
S
V
 
R
G
 
G
G
 
D
Y
 
W
E
 
Y
A
 
K
W
 
T
K
 
K
K
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
L
E
 
K
K
 
G
P
 
P
D
 
D
P
 
-
N
 
-
A
 
W
L
 
I
I
 
L
E
 
G
E
 
E
I
 
V
K
 
K
K
 
T
S
 
S
N
 
G
L
 
L
R
 
R
G
 
G
R
 
R
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
|
K
W
 
W
S
 
S
F
 
F
M
 
M
-
 
N
-
 
K
P
 
P
K
 
S
G
 
D
N
 
G
M
 
R
Q
 
P
K
 
K
Y
 
Y
I
 
L
L
 
V
C
 
V
N
|
N
S
 
A
D
|
D
E
|
E
S
x
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
C
 
C
K
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
R
F
 
H
N
 
D
P
 
P
H
 
H
A
 
K
V
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
C
A
 
L
I
 
V
A
 
G
C
 
G
Y
 
R
C
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
A
T
x
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
N
 
I
Y
 
Y
L
 
I
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
H
x
Y
H
 
N
E
 
E
P
 
A
Y
 
-
E
 
S
H
 
N
F
 
L
E
x
Q
E
 
V
A
 
A
L
 
I
K
x
R
E
 
E
A
 
A
Y
|
Y
A
x
E
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
I
 
A
Q
 
C
G
 
G
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
D
 
D
V
 
F
D
 
D
I
 
V
Y
x
F
G
 
V
A
 
V
L
x
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
C
|
C
G
|
G
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
K
 
K
K
 
Q
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
F
 
L
K
 
K
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
P
A
 
A
N
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
F
G
 
G
K
 
C
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
V
N
x
A
N
|
N
T
 
V
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
A
 
A
S
 
V
V
 
S
P
 
P
A
 
T
I
 
I
L
 
C
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
G
D
 
A
W
 
W
F
 
F
L
 
A
A
 
S
Q
 
F
S
 
G
K
 
R
T
 
E
K
 
R
N
 
N
G
 
S
G
 
G
P
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
F
S
 
N
V
 
I
S
 
S
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
N
K
 
N
G
 
P
G
 
C
N
 
T
F
 
V
E
 
E
V
 
E
P
 
E
L
 
M
G
 
S
T
 
V
T
 
P
F
 
L
D
 
K