SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_2873 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_2873 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
51% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 2:244/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
E
E
 
A
I
 
V
C
 
S
R
 
I
Q
 
R
L
 
L
A
 
N
L
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
H
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
T
D
x
Y
L
x
S
P
 
P
A
 
N
R
x
N
-
 
T
-
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
W
Q
 
L
A
 
T
E
 
E
L
 
M
A
 
H
D
 
A
L
 
A
D
 
G
G
 
R
A
 
E
V
 
F
R
 
H
F
 
A
E
 
Y
P
 
P
V
|
V
D
|
D
V
|
V
S
 
A
D
 
D
F
 
H
A
 
D
S
 
S
C
 
C
S
 
Q
E
 
Q
L
 
C
I
 
I
A
 
E
R
 
K
V
 
I
E
 
V
A
 
R
A
 
D
H
 
V
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
R
K
 
K
M
 
L
D
 
D
P
 
K
Q
 
V
H
x
N
W
 
W
Q
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
R
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
M
C
 
T
R
 
K
H
 
P
V
 
V
V
 
C
E
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
V
A
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
T
 
K
G
 
G
Q
 
S
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
H
 
H
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
C
 
L
D
 
A
T
 
T
P
 
K
L
 
M
V
 
V
A
 
T
R
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
I
 
I
-
 
L
R
 
D
A
 
T
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
P
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
L
V
 
V
C
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
A
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
N
 
N
L
 
I
P
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
F
 
H
M
 
M

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
51% identity, 99% coverage: 3:246/247 of query aligns to 2:245/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
I
 
M
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
T
 
A
E
 
A
I
 
I
C
 
S
R
 
R
Q
 
R
L
 
L
A
 
H
L
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
-
Q
 
M
V
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
V
D
 
S
L
x
H
P
x
S
A
 
E
R
 
R
A
x
N
D
 
D
R
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
T
F
 
W
Q
 
L
A
 
M
E
 
H
L
 
E
A
 
R
D
 
D
L
 
A
D
 
G
G
 
R
A
 
D
V
 
F
R
 
K
F
 
A
E
 
Y
P
 
A
V
|
V
D
|
D
V
|
V
S
 
A
D
 
D
F
 
F
A
 
E
S
 
S
C
 
C
S
 
E
E
 
R
L
 
C
I
 
A
A
 
E
R
 
K
V
 
V
E
 
L
A
 
A
A
 
D
H
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
A
T
 
T
L
 
F
R
 
M
K
 
K
M
 
M
D
 
T
P
 
K
Q
 
G
H
x
D
W
 
W
Q
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
M
R
 
R
V
 
T
N
 
D
L
 
L
D
 
D
G
 
A
V
 
M
F
 
F
N
 
N
M
 
V
C
 
T
R
 
K
H
 
Q
V
 
F
V
 
I
E
 
A
G
 
G
M
 
M
S
 
V
A
 
E
R
 
R
G
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
T
 
R
G
 
G
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
H
 
H
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
K
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
 
G
Y
|
Y
C
x
L
D
 
A
T
|
T
P
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
E
R
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
E
 
D
I
 
V
-
 
L
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
I
 
I
L
 
L
E
 
P
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
R
P
 
P
A
 
D
D
 
E
I
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
L
V
 
I
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
C
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
D
L
 
L
P
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
H
M
 
M
S
 
S

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
49% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 3:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
I
 
M
G
|
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
T
 
T
E
 
S
I
 
I
C
 
C
R
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
H
L
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
F
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
G
D
x
C
L
x
G
P
 
P
A
 
N
R
 
S
A
 
P
D
x
R
R
 
R
V
 
V
A
 
K
A
 
W
F
 
L
Q
 
E
A
 
D
E
 
Q
L
 
K
A
 
A
D
 
-
L
 
L
D
 
G
G
 
F
A
 
D
V
 
F
R
 
Y
F
 
A
E
 
S
P
 
E
V
x
G
D
x
N
V
|
V
S
 
G
D
 
D
F
 
W
A
 
D
S
 
S
C
 
T
S
 
K
E
 
Q
L
 
A
I
 
F
A
 
D
R
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
A
A
 
E
H
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
V
T
 
V
L
 
F
R
 
R
K
 
K
M
 
M
D
 
T
P
 
R
Q
 
E
H
 
D
W
 
W
Q
 
Q
E
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
C
 
T
R
 
K
H
 
Q
V
 
V
V
 
I
E
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
V
A
 
E
R
 
R
G
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
H
 
H
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
C
x
I
D
 
G
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
V
A
 
K
R
 
A
V
 
I
P
 
R
A
 
P
E
 
D
I
 
V
R
 
L
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
L
 
V
E
 
A
D
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
A
 
D
D
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
S
A
 
I
V
 
V
C
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
D
L
 
F
P
 
S
V
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
F
 
H
M
 
M

P14697 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see 2 papers)
47% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 4:245/246 of P14697

query
sites
P14697
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
M
G
|
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
T
 
T
E
 
A
I
 
I
C
 
C
R
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
F
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
C
L
x
G
P
 
P
A
 
N
R
 
S
A
 
P
D
x
R
R
 
R
V
 
E
A
 
K
A
 
W
F
 
L
Q
 
E
A
x
Q
E
 
Q
L
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
K
A
 
A
V
 
L
R
 
G
F
 
F
E
 
D
P
 
F
V
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
x
G
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
D
F
 
W
A
 
D
S
 
S
C
 
T
S
 
K
E
 
T
L
 
A
I
 
F
A
 
D
R
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
S
A
 
E
H
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
D
|
D
T
 
V
T
 
V
L
 
F
R
 
R
K
|
K
M
 
M
D
 
T
P
 
R
Q
 
A
H
 
D
W
 
W
Q
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
C
 
T
R
 
K
H
 
Q
V
 
V
V
 
I
E
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
A
A
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
S
S
 
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
Q
|
Q
F
|
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
T
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
x
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
C
x
I
D
 
A
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
V
A
 
K
R
 
A
V
 
I
P
x
R
A
 
Q
E
 
D
I
 
V
R
 
L
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
L
 
V
E
 
A
D
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
I
V
 
C
C
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
A
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
D
L
 
F
P
 
S
V
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
F
 
H
M
 
M

3vzsB Crystal structure of phab from ralstonia eutropha in complex with acetoacetyl-coa and NADP (see paper)
47% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 7:248/249 of 3vzsB

query
sites
3vzsB
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
L
x
I
G
 
G
T
 
T
E
 
A
I
 
I
C
 
C
R
 
Q
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
K
A
 
D
G
 
G
R
 
F
Q
 
R
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
C
L
x
G
P
 
P
A
 
N
R
 
S
A
 
P
D
x
R
R
 
R
V
 
E
A
 
K
A
 
W
F
 
L
Q
 
E
A
 
Q
E
 
Q
L
 
K
A
 
A
D
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
L
R
 
G
F
 
F
E
 
D
P
 
F
V
 
I
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
x
G
D
x
N
V
|
V
S
 
A
D
 
D
F
 
W
A
 
D
S
 
S
C
 
T
S
 
K
E
 
T
L
 
A
I
 
F
A
 
D
R
 
K
V
 
V
E
 
K
A
 
S
A
 
E
H
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
|
T
R
 
R
D
|
D
T
 
V
T
 
V
L
 
F
R
 
R
K
 
K
M
 
M
D
 
T
P
 
R
Q
 
A
H
 
D
W
 
W
Q
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
N
 
N
M
 
V
C
 
T
R
 
K
H
 
Q
V
 
V
V
 
I
E
 
D
G
 
G
M
 
M
S
 
A
A
 
D
R
 
R
G
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Q
 
Q
T
 
K
G
 
G
Q
|
Q
F
|
F
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
H
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
T
K
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
Y
|
Y
C
x
I
D
 
A
T
 
T
P
 
D
L
x
M
V
|
V
A
 
K
R
 
A
V
 
I
P
x
R
A
 
Q
E
 
D
I
 
V
R
 
L
A
 
D
Q
 
K
I
 
I
L
 
V
E
 
A
D
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
I
V
 
C
C
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
A
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
D
L
 
F
P
 
S
V
 
L
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
F
 
H
M
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 8:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
T
 
L
E
 
E
I
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
F
A
 
M
L
 
K
A
 
E
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
F
P
 
N
A
 
E
R
 
A
A
 
A
D
 
G
R
 
K
V
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
E
L
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
A
D
 
N
G
 
P
A
 
G
V
 
V
R
 
V
F
 
F
E
 
I
P
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
D
F
 
R
A
 
E
S
 
S
C
 
V
S
 
H
E
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
E
R
 
N
V
 
V
E
 
A
A
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
|
D
T
 
S
T
 
M
L
 
L
R
 
S
K
|
K
M
 
M
D
 
T
P
 
V
Q
 
D
H
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
L
 
V
M
 
I
R
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
D
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
H
M
 
C
C
 
T
R
 
Q
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
P
G
 
Y
M
 
M
S
 
A
A
 
E
R
 
Q
G
 
G
F
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
Y
G
 
G
Q
x
N
F
x
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
M
G
 
T
M
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
R
 
K
E
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
x
F
C
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
V
 
V
A
 
A
R
 
E
V
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
K
I
 
V
R
 
I
A
 
E
Q
x
K
I
 
M
L
 
K
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
Y
C
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
G
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
A
 
H
N
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
I
F
 
M
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 6:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
T
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
D
x
T
R
 
S
V
 
E
A
 
S
A
 
G
F
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
-
L
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
D
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
N
-
 
G
R
 
K
F
 
G
E
 
L
P
 
M
V
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
F
 
P
A
 
A
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
E
R
 
N
V
 
V
E
 
R
A
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
D
H
 
E
W
 
W
Q
 
N
E
 
D
L
 
I
M
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
S
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
C
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
A
 
R
R
 
A
V
 
L
P
 
T
A
 
D
E
 
E
I
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
T
L
 
L
E
 
A
D
 
A
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
T
P
 
P
A
 
N
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
42% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 6:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
I
x
S
G
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
T
A
 
A
R
x
T
A
 
S
D
 
E
R
 
N
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
F
 
A
Q
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
D
 
G
L
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
-
V
 
-
R
 
K
F
 
G
E
 
L
P
 
M
V
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
F
 
P
A
 
A
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
E
R
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
E
H
 
E
W
 
W
Q
 
N
E
 
D
L
 
I
M
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
G
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
S
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
C
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
A
 
R
R
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
I
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
P
 
A
A
 
Q
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 5:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
T
A
 
A
R
x
T
A
 
S
D
 
E
R
 
N
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
F
 
A
Q
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
D
 
G
L
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
-
V
 
-
R
 
K
F
 
G
E
 
L
P
 
M
V
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
F
 
P
A
 
A
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
E
R
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
E
H
x
E
W
 
W
Q
 
N
E
 
D
L
 
I
M
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
S
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
C
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
A
 
R
R
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
I
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
P
 
A
A
 
Q
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
N
x
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 5:242/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
T
A
|
A
R
x
T
A
 
S
D
 
E
R
 
N
V
 
G
A
 
A
A
 
Q
F
 
A
Q
 
I
A
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
D
 
G
L
 
A
D
 
N
G
 
G
A
 
-
V
 
-
R
 
K
F
 
G
E
 
L
P
 
M
V
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
F
 
P
A
 
A
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
E
R
 
K
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
E
H
 
E
W
 
W
Q
 
N
E
 
D
L
 
I
M
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
G
 
A
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
G
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
x
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
S
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
C
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
A
 
R
R
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
I
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
P
 
A
A
 
Q
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
44% identity, 97% coverage: 3:242/247 of query aligns to 2:248/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
R
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
T
C
 
A
R
 
L
Q
 
E
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
Y
Q
 
H
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
W
D
|
D
L
|
L
P
 
A
A
 
E
R
 
E
A
 
A
D
 
G
R
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
A
F
 
L
Q
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
A
D
 
G
G
 
G
A
 
S
V
 
A
R
 
D
F
 
F
E
 
A
P
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
A
F
 
A
A
 
E
S
 
S
C
 
V
S
 
E
E
 
A
L
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
V
 
I
E
 
I
A
 
A
A
 
E
H
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
L
R
 
H
D
 
D
T
 
G
T
 
Q
L
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
R
 
K
K
 
K
M
 
M
D
 
A
P
 
E
Q
 
A
H
 
Q
W
 
F
Q
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
L
M
 
C
C
 
T
R
 
Q
H
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
P
G
 
H
M
 
M
S
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
L
 
A
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
L
T
 
Y
G
 
G
Q
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
M
G
 
T
M
 
K
A
 
V
L
 
W
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
L
A
 
G
R
 
R
K
 
Y
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
I
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
C
x
I
D
 
A
T
|
T
P
 
E
L
 
M
V
 
V
A
 
Q
R
 
Q
V
 
M
P
 
P
A
 
E
E
 
R
I
 
V
R
 
L
A
 
E
Q
 
A
I
 
M
L
 
V
E
 
A
D
 
R
I
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
S
 
D
P
 
P
A
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
Y
C
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
E
D
 
E
A
 
S
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
T
 
S
G
 
G
A
 
T
N
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 9:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
T
 
K
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
T
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
D
x
T
R
 
S
V
 
E
A
 
S
A
 
G
F
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
I
L
 
S
A
 
D
D
 
Y
L
 
L
D
 
G
G
 
D
A
 
N
V
 
G
R
 
K
F
 
G
E
 
M
P
 
A
V
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
N
F
 
P
A
 
E
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
A
L
 
V
I
 
L
A
 
K
R
 
A
V
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
E
Q
 
E
H
 
E
W
 
W
Q
 
S
E
 
D
L
 
I
M
 
M
R
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
V
S
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
C
x
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
L
x
M
V
 
T
A
 
K
R
 
A
V
 
L
P
 
N
A
 
D
E
 
E
I
 
Q
R
 
R
A
 
T
Q
 
A
I
 
T
L
 
L
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 6:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
I
 
S
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
V
L
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
T
D
 
A
L
 
T
P
 
S
A
 
E
R
 
N
A
 
G
D
 
A
R
 
K
V
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
N
L
 
I
A
 
S
D
 
D
L
 
Y
D
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
N
-
 
G
R
 
K
F
 
G
E
 
L
P
 
M
V
 
L
D
 
N
V
 
V
S
 
T
D
 
D
F
 
P
A
 
A
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
E
R
 
N
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
D
H
 
E
W
 
W
Q
 
N
E
 
D
L
 
I
M
 
I
R
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
R
G
 
A
M
|
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
S
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
C
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
A
 
R
R
 
A
V
 
L
P
 
S
A
 
D
E
 
D
I
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
G
P
 
A
A
 
Q
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
A
x
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
41% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 5:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
T
 
R
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
T
L
 
F
A
 
V
L
 
A
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
A
 
T
A
 
A
D
x
T
L
 
S
P
 
E
A
 
S
R
 
G
A
 
A
D
 
E
R
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
G
F
 
Y
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
L
D
 
G
G
 
A
A
 
N
V
 
G
R
 
K
F
 
G
E
 
F
P
 
M
V
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
K
D
 
D
F
 
A
A
 
Q
S
 
S
C
 
I
S
 
D
E
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
A
R
 
S
V
 
I
E
 
R
A
 
A
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
D
H
 
E
W
 
W
Q
 
E
E
 
D
L
 
I
M
 
L
R
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
V
 
V
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
M
E
 
C
G
 
A
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
L
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
S
M
 
K
A
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
V
V
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
C
 
I
D
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
V
 
T
A
 
R
R
 
A
V
 
L
P
 
T
A
 
D
E
 
D
I
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
G
I
 
I
L
 
L
E
 
S
D
 
S
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
N
R
 
R
L
 
P
G
 
G
S
 
D
P
 
A
A
 
K
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
40% identity, 99% coverage: 3:246/247 of query aligns to 13:254/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
T
 
Q
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
L
Q
 
E
L
 
L
A
 
G
L
 
R
A
 
L
G
 
G
R
 
A
Q
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
T
D
 
A
L
x
T
P
 
S
A
 
A
R
 
S
A
 
G
D
 
A
R
 
E
V
 
K
A
 
I
A
 
A
F
 
E
Q
 
T
A
 
L
E
 
K
L
 
A
A
 
N
D
 
G
L
 
V
D
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
G
R
 
L
F
 
V
E
 
-
P
 
-
V
x
L
D
|
D
V
|
V
S
 
S
D
 
S
F
 
D
A
 
E
S
 
S
C
 
V
S
 
A
E
 
A
L
 
T
I
 
L
A
 
E
R
 
H
V
 
I
E
 
Q
A
 
Q
A
 
H
H
 
L
G
 
G
R
 
Q
V
 
P
D
 
L
V
 
I
L
 
V
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
V
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
D
Q
 
D
H
 
E
W
 
W
Q
 
F
E
 
D
L
 
V
M
 
V
R
 
N
V
 
T
N
 
N
L
 
L
D
 
N
G
 
S
V
 
L
F
 
Y
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
T
A
 
K
R
 
A
G
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
G
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
A
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
H
 
E
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
G
R
 
S
K
 
R
G
 
A
V
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
A
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
C
x
I
D
 
D
T
|
T
P
 
D
L
x
M
V
x
T
A
 
R
R
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
A
I
 
Q
R
 
R
A
 
E
Q
 
A
I
 
L
L
 
L
E
 
G
D
 
Q
I
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
P
 
A
A
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
V
V
 
V
C
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
T
L
 
V
P
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M
S
 
S

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
42% identity, 98% coverage: 3:245/247 of query aligns to 9:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
I
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
T
 
K
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
E
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
T
D
 
-
L
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
D
x
T
R
 
S
V
 
E
A
 
S
A
 
G
F
 
A
Q
 
Q
A
 
A
E
 
I
L
 
S
A
 
D
D
 
Y
L
 
L
D
 
G
G
 
D
A
 
N
V
 
G
R
 
K
F
 
G
E
 
M
P
 
A
V
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
N
F
 
P
A
 
E
S
 
S
C
 
I
S
 
E
E
 
A
L
 
V
I
 
L
A
 
K
R
 
A
V
 
I
E
 
T
A
 
D
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
V
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
R
 
R
D
 
D
T
 
N
T
 
L
L
 
L
R
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
P
 
E
Q
 
E
H
 
E
W
 
W
Q
 
S
E
 
D
L
 
I
M
 
M
R
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
D
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
N
 
R
M
 
L
C
 
S
R
 
K
H
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
R
G
 
G
M
 
M
S
 
M
A
 
K
R
 
K
G
 
R
F
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
V
S
x
G
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
M
G
 
G
Q
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
T
M
 
K
A
 
S
L
 
M
A
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
S
K
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
C
 
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
L
 
M
V
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
P
 
N
A
 
D
E
 
E
I
 
Q
R
 
R
A
 
T
Q
 
A
I
 
T
L
 
L
E
 
A
D
 
Q
I
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
D
P
 
P
A
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
A
V
 
V
C
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
N
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
40% identity, 97% coverage: 3:242/247 of query aligns to 6:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
R
 
K
I
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
I
 
A
G
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
T
 
Q
E
 
A
I
 
I
C
 
A
R
 
L
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
L
 
E
A
 
E
G
 
G
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
G
D
|
D
L
|
L
P
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
G
E
 
D
L
 
L
A
 
T
D
 
Y
L
 
S
D
 
H
G
 
P
A
 
N
V
 
V
R
 
E
F
 
G
E
 
M
P
 
Y
V
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
D
 
D
F
 
V
A
 
T
S
 
G
C
 
V
S
 
E
E
 
K
L
 
F
I
 
Y
A
 
Q
R
 
S
V
 
V
E
 
I
A
 
D
A
 
K
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
A
x
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
T
 
T
R
 
K
D
 
D
T
 
A
T
 
M
L
 
T
R
 
R
K
 
K
M
 
M
D
 
T
P
 
E
Q
 
A
H
 
Q
W
 
W
Q
 
D
E
 
A
L
 
V
M
 
I
R
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
C
 
T
R
 
R
H
 
L
V
 
V
V
 
G
E
 
P
G
 
Q
M
 
M
S
 
Q
A
 
T
R
 
N
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
N
 
V
G
 
G
Q
 
V
T
 
F
G
 
G
Q
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A