SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_3206 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_3206 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7nbgDDD structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:309/310 of 7nbgDDD

query
sites
7nbgDDD
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
L
W
 
N
F
 
A
V
 
V
A
 
R
T
 
S
A
 
L
L
 
V
N
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
G
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
x
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
x
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
|
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

Sites not aligning to the query:

3l6bA X-ray crystal structure of human serine racemase in complex with malonate a potent inhibitor (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 24:310/322 of 3l6bA

query
sites
3l6bA
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
L
W
 
N
F
 
A
V
 
V
A
 
R
T
 
S
A
 
L
L
 
V
N
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
|
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
x
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
x
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
|
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

6zspAAA serine racemase bound to atp and malonate. (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:307/320 of 6zspAAA

query
sites
6zspAAA
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
x
S
A
x
S
A
x
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
x
K
I
x
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
-
E
 
-
W
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
|
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
x
H
G
 
G
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
x
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
N
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
 
V
A
 
K
V
x
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
x
E
H
x
R
L
 
M
G
x
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
 
G
K
 
G
N
|
N
I
 
V

7nbfAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z126932614, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:314/323 of 7nbfAAA

query
sites
7nbfAAA
T
|
T
P
|
P
L
 
V
R
x
L
R
x
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
x
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
T
 
V
E
 
R
W
 
S
F
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
-
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
x
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbdAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z235449082, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:314/323 of 7nbdAAA

query
sites
7nbdAAA
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
T
 
V
E
 
R
W
 
S
F
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
-
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
x
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
x
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
x
L
V
 
I
E
|
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
x
V

Sites not aligning to the query:

7nbcCCC structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:314/323 of 7nbcCCC

query
sites
7nbcCCC
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
T
 
V
E
 
R
W
 
S
F
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
-
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
x
T
A
x
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
x
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
|
V
E
x
H
D
x
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

7nbcAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:314/323 of 7nbcAAA

query
sites
7nbcAAA
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
T
 
V
E
 
R
W
 
S
F
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
-
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
x
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

Sites not aligning to the query:

P04968 L-threonine dehydratase biosynthetic IlvA; Threonine deaminase; EC 4.3.1.19 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 90% coverage: 24:307/316 of query aligns to 32:320/514 of P04968

query
sites
P04968
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
A
 
M
A
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
S
D
 
S
A
 
R
L
 
L
G
 
D
C
 
N
R
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
V
K
 
K
D
 
R
E
 
E
T
 
D
D
 
R
N
 
Q
P
 
P
I
 
V
G
 
H
S
 
S
F
 
F
K
|
K
G
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
Y
W
 
A
F
 
M
V
 
M
A
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
T
A
 
E
L
 
E
N
 
Q
S
 
K
G
 
A
E
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
S
A
 
A
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
F
A
 
S
A
 
S
T
 
A
R
 
R
R
 
L
G
 
G
-
 
V
H
 
K
A
 
A
C
 
L
T
 
I
V
 
V
F
 
M
A
 
P
A
 
T
Q
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
D
P
 
-
A
 
I
K
 
K
L
 
V
E
 
D
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
F
G
 
G
A
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
H
 
Q
R
 
G
L
 
F
R
 
T
F
 
W
V
 
V
E
 
P
D
 
P
G
 
F
A
 
D
E
 
H
P
 
P
A
 
M
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
A
 
D
A
 
A
P
 
H
-
 
L
E
 
D
V
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
|
L
L
 
A
E
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
A
S
 
V
V
 
L
L
 
I
R
 
K
A
 
Q
R
 
L
A
 
M
P
 
P
S
 
Q
V
 
I
E
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
E
A
 
A
A
 
E
G
 
D
A
 
S
P
 
A
S
 
C
M
 
L
K
 
K
L
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
H
A
 
P
I
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
P
H
 
R
A
 
V
D
 
G
T
 
L
I
 
F
A
 
A
D
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
K
V
 
R
P
 
I
I
 
G
A
 
D
S
 
E
R
 
T
L
 
F
P
 
R
Q
 
L
L
 
C
R
 
Q
R
 
E
C
 
Y
C
 
L
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
T
V
 
V
S
 
D
E
 
S
A
 
D
Q
 
A
L
 
I
L
 
C
D
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
K
L
 
D
I
 
L
Q
 
F
R
 
E
H
 
D
L
 
V
G
 
R
M
 
A
V
 
V
V
 
A
E
 
E
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
L
G
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
K
A
 
K
E
 
Y
P
 
I
A
 
A
R
 
L
H
 
H
A
 
N
-
 
I
-
 
R
G
 
G
R
 
E
L
 
R
V
 
L
A
 
A
T
 
H
V
 
I
L
 
L
C
x
S
G
 
G
K
 
A
N
 
N
I
 
V
H
 
N

7nbgAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:314/322 of 7nbgAAA

query
sites
7nbgAAA
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
T
 
V
E
 
R
W
 
S
F
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
-
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
|
G
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
x
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
|
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
x
I
R
 
Q
A
 
A
L
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
x
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

7nbhAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z26781964, XChem fragment screen (see paper)
30% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 23:314/320 of 7nbhAAA

query
sites
7nbhAAA
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
L
L
 
T
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
A
T
 
V
E
 
R
W
 
S
F
 
L
V
 
V
A
 
P
T
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
-
 
R
S
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
 
N
F
 
H
G
|
G
Q
|
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
D
A
 
C
K
|
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
x
I
R
 
Q
A
 
A
L
x
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
M
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
V
A
 
P
-
 
L
P
 
V
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
N
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
M
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
A
 
L
I
 
M
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
Y
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
|
D
G
|
G
I
 
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
C
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
|
P
A
 
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
 
G
K
 
G
N
|
N
I
x
V

Sites not aligning to the query:

1tdjA Threonine deaminase (biosynthetic) from e. Coli (see paper)
31% identity, 90% coverage: 24:307/316 of query aligns to 28:316/494 of 1tdjA

query
sites
1tdjA
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
Q
R
 
K
A
 
M
A
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
S
D
 
S
A
 
R
L
 
L
G
 
D
C
 
N
R
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
V
K
 
K
D
 
R
E
 
E
T
 
D
D
 
R
N
 
Q
P
 
P
I
 
V
G
 
H
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
Y
W
 
A
F
 
M
V
 
M
A
 
A
-
 
G
-
 
L
T
 
T
A
 
E
L
 
E
N
 
Q
S
 
K
G
 
A
E
 
H
A
 
G
I
 
V
V
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
S
A
|
A
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
F
A
 
S
A
 
S
T
 
A
R
 
R
R
 
L
G
 
G
-
 
V
H
 
K
A
 
A
C
 
L
T
 
I
V
 
V
F
 
M
A
 
P
A
 
T
Q
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
D
P
 
-
A
 
I
K
 
K
L
 
V
E
 
D
A
 
A
M
 
V
R
 
R
A
 
G
L
 
F
G
 
G
A
 
G
E
 
E
V
 
V
R
 
L
L
 
L
A
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
N
F
 
F
D
 
D
A
 
E
A
 
A
K
 
K
S
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
I
Q
 
E
Y
 
L
A
 
S
E
 
Q
E
 
Q
H
 
Q
R
 
G
L
 
F
R
 
T
F
 
W
V
 
V
E
 
P
D
 
P
G
 
F
A
 
D
E
 
H
P
 
P
A
 
M
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
A
 
D
A
 
A
P
 
H
-
 
L
E
 
D
V
 
R
V
 
V
L
 
F
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
 
L
L
 
A
E
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
A
S
 
V
V
 
L
L
 
I
R
 
K
A
 
Q
R
 
L
A
 
M
P
 
P
S
 
Q
V
 
I
E
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
V
x
E
A
 
A
A
 
E
G
 
D
A
x
S
P
 
A
S
x
C
M
 
L
K
 
K
L
 
A
S
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
G
 
G
R
 
H
A
 
P
I
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
P
H
 
R
A
 
V
D
 
G
T
 
L
I
 
F
A
 
A
D
 
E
G
|
G
I
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
K
V
 
R
P
 
I
I
 
G
A
 
D
S
 
E
R
 
T
L
 
F
P
 
R
Q
 
L
L
 
C
R
 
Q
R
 
E
C
 
Y
C
 
L
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
T
V
 
V
S
 
D
E
 
S
A
 
D
Q
 
A
L
 
I
L
 
C
D
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
K
L
 
D
I
 
L
Q
 
F
R
 
E
H
 
D
L
 
V
G
 
R
M
 
A
V
 
V
V
 
A
E
|
E
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
L
G
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
K
A
 
K
E
 
Y
P
 
I
A
 
A
R
 
L
H
 
H
A
 
N
-
 
I
-
 
R
G
 
G
R
 
E
L
 
R
V
 
L
A
 
A
T
 
H
V
 
I
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
A
N
 
N
I
 
V
H
 
N

Q7XSN8 Serine racemase; D-serine dehydratase; D-serine ammonia-lyase; L-serine dehydratase; L-serine ammonia-lyase; EC 5.1.1.18; EC 4.3.1.18; EC 4.3.1.17 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
29% identity, 95% coverage: 6:306/316 of query aligns to 20:327/339 of Q7XSN8

query
sites
Q7XSN8
D
 
D
L
 
I
D
 
H
G
 
S
V
 
I
L
 
R
A
 
E
A
 
A
S
 
Q
P
 
A
Q
 
R
I
 
I
D
 
A
P
 
P
V
 
Y
F
 
V
L
 
H
H
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
S
A
 
S
A
 
T
A
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
I
L
 
V
G
 
G
C
 
K
R
 
Q
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
C
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
A
G
 
G
S
 
A
F
 
F
K
 
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
S
W
 
N
F
 
S
V
 
I
A
 
-
T
 
F
A
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
D
G
 
D
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
I
A
 
P
Q
 
R
T
 
N
A
 
A
N
 
P
P
 
A
A
 
C
K
 
K
L
 
V
E
 
D
A
 
N
M
 
V
R
 
K
A
 
R
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
H
V
 
I
R
 
I
L
 
W
A
 
S
G
 
D
V
 
V
D
 
S
F
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
S
A
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
G
L
 
A
R
 
I
F
 
L
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
F
A
 
N
E
 
N
P
 
K
A
 
N
I
 
T
A
 
I
Q
 
S
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
-
P
 
P
E
 
E
V
 
I
-
 
D
-
 
T
V
 
I
L
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
 
S
N
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
I
E
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
A
S
 
L
V
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
I
A
 
N
P
 
P
S
 
S
V
 
I
E
 
R
I
 
I
V
 
L
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
K
G
 
G
A
 
A
P
 
D
S
x
D
M
 
S
K
 
A
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
I
I
 
I
E
 
T
T
 
L
A
 
P
H
 
S
A
 
T
D
 
N
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
A
P
 
F
I
 
L
A
 
G
S
 
D
-
 
L
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
V
L
 
V
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
D
E
 
D
A
 
N
Q
 
A
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
K
L
 
M
I
 
C
Q
 
Y
R
 
E
H
 
M
L
 
L
G
 
K
M
 
V
V
 
A
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
I
G
 
G
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
P
 
S
A
 
A
R
 
W
H
 
H
A
 
E
G
 
S
R
 
S
L
 
K
V
 
I
A
 
G
T
 
I
V
 
I
L
 
V
C
 
S
G
 
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

5cvcA Structure of maize serine racemase (see paper)
27% identity, 95% coverage: 6:306/316 of query aligns to 4:311/329 of 5cvcA

query
sites
5cvcA
D
 
D
L
 
I
D
 
D
G
 
S
V
 
I
L
 
R
A
 
E
A
 
A
S
 
Q
P
 
A
Q
 
R
I
 
I
D
 
A
P
 
P
V
 
Y
F
 
V
L
 
H
H
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
M
R
 
S
A
 
S
A
 
T
A
 
S
L
 
I
D
 
D
D
 
A
A
 
M
L
 
V
G
 
G
C
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
C
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
A
G
 
G
S
 
A
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
S
T
 
N
E
 
S
W
 
I
F
 
F
V
 
A
A
 
L
T
 
D
A
 
D
L
 
E
N
 
Q
S
 
V
G
 
S
E
 
K
A
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
A
G
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
R
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
H
V
 
I
F
 
V
A
 
I
A
 
P
Q
 
R
T
 
N
A
 
A
N
 
P
P
 
A
A
 
S
K
 
K
L
 
V
E
 
E
A
 
N
M
 
V
R
 
K
A
 
C
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
H
V
 
I
R
 
I
L
 
W
A
 
S
G
 
D
V
 
A
D
 
S
F
 
I
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
Y
A
 
V
A
 
S
R
 
K
Q
 
R
Y
 
V
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
G
L
 
A
R
 
V
F
 
L
V
 
I
E
 
H
D
 
P
G
 
I
A
 
N
E
 
S
P
 
K
A
 
Y
I
 
T
A
 
I
Q
 
S
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
-
E
 
E
A
 
Q
A
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
I
-
 
D
-
 
T
V
 
I
L
 
I
V
 
V
P
 
P
L
 
I
G
x
S
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
 
L
L
 
I
E
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
A
S
 
L
V
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
I
A
 
N
P
 
P
S
 
S
V
 
I
E
 
R
I
 
I
V
 
L
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
K
G
 
G
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
S
K
 
A
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
K
A
 
I
I
 
I
E
 
T
T
 
L
A
 
P
H
 
S
A
 
T
D
 
N
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
L
A
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
A
P
 
F
I
 
L
A
 
G
S
 
D
-
 
L
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
V
L
 
V
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
V
V
 
I
A
 
V
V
 
V
S
 
D
E
 
D
A
 
T
Q
 
A
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
K
L
 
M
I
 
C
Q
 
Y
R
 
E
H
 
I
L
 
L
G
 
K
M
 
V
V
 
A
V
 
V
E
|
E
P
 
P
A
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
I
G
 
G
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
A
L
 
L
A
 
S
E
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
Q
-
 
S
P
 
S
A
 
A
R
 
W
H
 
H
A
 
E
G
 
S
R
 
S
L
 
K
V
 
I
A
 
G
T
 
I
V
 
I
L
x
V
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

1ve5A Crystal structure of t.Th. Hb8 threonine deaminase
36% identity, 95% coverage: 6:305/316 of query aligns to 2:303/308 of 1ve5A

query
sites
1ve5A
D
 
S
L
 
L
D
 
Q
G
 
D
V
 
L
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
F
P
 
R
Q
 
R
I
 
I
D
 
A
P
 
P
V
 
Y
F
 
T
L
 
H
H
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
R
A
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
G
A
 
L
L
 
L
G
 
G
C
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
L
K
 
K
D
 
A
E
 
E
T
 
H
D
 
L
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
-
W
 
L
F
x
S
V
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
E
S
 
N
G
 
P
E
 
K
A
 
G
I
 
L
V
 
L
S
 
A
A
 
V
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
V
A
 
A
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
Q
R
 
V
R
 
L
G
 
G
H
 
V
A
 
K
C
 
A
T
 
L
V
 
V
F
 
V
A
 
M
A
 
P
Q
 
E
T
 
-
A
 
-
N
 
D
P
 
P
A
 
Y
K
 
K
L
 
K
E
 
A
A
 
C
M
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
R
 
V
L
 
D
A
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
T
F
 
A
D
 
K
A
 
N
A
 
R
K
 
E
S
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
Y
 
L
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
H
 
T
R
 
G
L
 
Y
R
 
A
F
 
L
V
 
I
E
 
H
D
 
P
G
 
F
A
 
D
E
 
D
P
 
P
A
 
L
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
A
 
G
-
 
R
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
F
P
 
P
E
 
G
V
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
A
P
 
P
L
 
V
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
 
L
L
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
A
S
 
T
V
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
S
P
 
P
S
 
T
V
 
T
E
 
L
I
 
V
V
 
L
A
 
G
V
 
V
V
x
E
A
 
P
A
 
E
G
 
A
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
A
K
 
K
L
 
R
S
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
I
I
 
L
E
 
R
-
 
L
T
 
E
A
 
A
H
 
P
A
 
P
D
 
R
T
 
T
I
 
R
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
 
V
A
 
R
V
 
T
R
 
L
V
 
S
P
 
L
I
 
G
A
 
E
S
 
R
R
 
T
L
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
E
C
 
R
C
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
S
E
 
E
A
 
E
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
E
A
 
A
M
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
L
Q
 
F
R
 
T
H
 
R
L
 
T
G
 
K
M
 
Q
V
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
A
x
T
G
 
G
A
 
A
A
 
L
G
 
P
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
-
E
 
-
P
 
-
A
 
-
R
 
E
H
 
H
A
 
G
G
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
V
 
L
A
 
A
T
 
L
V
 
L
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N

A4F2N8 L-threo-3-hydroxyaspartate ammonia-lyase; L-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase; L-THA DH; EC 4.3.1.16 from Pseudomonas sp. (see paper)
28% identity, 97% coverage: 1:306/316 of query aligns to 1:308/319 of A4F2N8

query
sites
A4F2N8
M
 
M
T
 
Q
L
 
L
S
 
S
L
 
S
D
 
Y
L
 
H
D
 
D
G
 
-
V
 
V
L
 
I
A
 
K
A
 
A
S
 
A
P
 
E
Q
 
R
I
 
L
D
 
E
P
 
G
V
 
F
F
 
A
L
 
N
H
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
F
R
 
T
A
 
S
A
 
R
A
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
A
A
 
E
L
 
T
G
 
G
C
 
A
R
 
Q
L
 
V
L
 
F
G
 
I
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
N
D
 
L
N
 
Q
P
 
R
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
G
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
-
W
 
F
F
 
N
V
 
A
A
 
L
T
 
S
A
 
R
L
 
F
N
 
D
S
 
E
G
 
A
E
 
Q
-
 
R
-
 
K
-
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
F
S
 
S
A
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
A
T
 
R
R
 
L
R
 
L
G
 
Q
H
 
M
A
 
P
C
 
A
T
 
T
V
 
I
F
 
V
A
 
M
A
 
P
Q
 
T
T
 
D
A
 
A
N
 
P
P
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
V
E
 
A
A
 
A
M
 
T
R
 
R
A
 
E
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
V
R
 
V
L
 
F
A
 
Y
G
 
D
V
 
R
D
 
I
F
 
T
D
 
E
A
 
D
A
 
R
K
 
E
S
 
Q
A
 
I
A
 
G
R
 
R
Q
 
T
Y
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
H
 
H
R
 
G
L
 
M
R
 
T
F
 
L
V
 
I
E
 
P
D
 
S
G
 
Y
A
 
D
E
 
H
P
 
P
A
 
D
I
 
V
A
 
L
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
F
A
 
T
A
 
G
P
 
P
-
 
L
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
F
V
 
V
P
 
G
L
 
L
G
 
G
N
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
M
L
 
L
E
 
S
G
 
G
I
 
T
G
 
A
S
 
L
V
 
A
L
 
T
R
 
R
A
 
A
R
 
L
A
 
S
P
 
P
S
 
D
V
 
C
E
 
L
I
 
L
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
V
 
E
A
 
P
A
 
E
G
 
A
A
 
G
P
 
N
S
 
D
M
 
G
K
 
Q
L
 
R
S
 
S
L
 
F
E
 
Q
A
 
T
G
 
G
R
 
S
A
 
I
I
 
V
E
 
H
T
 
I
A
 
D
H
 
T
A
 
P
D
 
A
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
A
A
 
Q
V
 
T
R
 
Q
V
 
H
P
 
L
I
 
G
A
 
N
S
 
H
R
 
T
L
 
F
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
E
C
 
N
C
 
V
D
 
N
R
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
S
E
 
D
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
L
 
V
D
 
E
A
 
S
M
 
M
R
 
R
L
 
F
I
 
F
Q
 
M
R
 
Q
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
M
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
C
A
 
L
G
 
G
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
N
E
 
L
P
 
K
A
 
Q
R
 
Q
H
 
F
A
 
R
G
 
G
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
A
 
G
T
 
I
V
 
I
L
 
V
C
 
T
G
 
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

3hmkA Crystal structure of serine racemase (see paper)
27% identity, 91% coverage: 18:306/316 of query aligns to 19:315/321 of 3hmkA

query
sites
3hmkA
D
 
D
P
 
S
V
 
V
F
 
H
L
 
L
H
 
-
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
I
L
 
A
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
-
E
 
-
W
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
 
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
N
A
 
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
S
G
 
E
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
Q
 
R
Y
 
I
A
 
I
E
 
Q
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
L
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
V
N
 
D
G
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
x
G
-
x
G
-
x
G
A
x
G
L
x
M
L
 
V
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
T
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
x
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
|
A
P
 
D
S
x
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
E
A
 
L
I
 
T
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
H
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
x
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
V
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
Y
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
E
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
x
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
I
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
|
L
C
x
S
G
|
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

Q9QZX7 Serine racemase; D-serine ammonia-lyase; D-serine dehydratase; L-serine ammonia-lyase; L-serine dehydratase; EC 5.1.1.18; EC 4.3.1.18; EC 4.3.1.17 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
27% identity, 90% coverage: 24:306/316 of query aligns to 26:317/339 of Q9QZX7

query
sites
Q9QZX7
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
I
L
 
L
D
 
N
D
 
Q
A
 
I
L
 
A
G
 
G
C
 
R
R
 
N
L
 
L
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
L
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
G
 
I
R
 
R
G
 
G
T
 
-
E
 
-
W
 
-
F
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
L
N
 
N
S
 
A
-
 
I
-
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
K
G
 
P
E
 
K
A
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
T
A
 
H
S
 
S
A
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
H
G
 
G
Q
 
Q
G
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
L
R
 
E
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
Y
V
 
I
F
 
V
A
 
V
A
 
P
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
N
 
P
P
 
N
A
x
C
K
 
K
L
 
K
E
 
L
A
 
A
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
R
 
V
L
 
Y
A
 
C
G
 
D
V
 
P
D
 
S
F
 
D
D
 
E
A
 
S
A
 
R
K
 
E
S
 
K
A
 
V
A
 
T
R
 
Q
Q
 
R
Y
 
I
A
 
M
E
 
Q
E
 
E
H
 
T
R
 
E
L
 
G
R
 
I
F
 
L
V
 
V
E
 
H
D
 
P
G
 
N
A
 
Q
E
 
E
P
 
P
A
 
A
I
 
V
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
A
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
V
P
 
P
L
 
L
G
 
V
N
 
D
G
 
A
-
 
L
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
G
A
 
G
L
 
M
L
 
V
E
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
A
S
 
I
V
 
T
L
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
V
E
 
K
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
V
 
A
V
 
E
A
 
P
A
 
S
G
 
N
A
 
A
P
 
D
S
 
D
M
 
C
K
 
Y
L
 
Q
S
 
S
L
 
K
E
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
E
A
 
L
I
 
T
E
 
P
T
 
N
A
 
L
H
 
H
-
 
P
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
K
V
 
S
R
 
S
V
 
I
P
 
G
I
 
L
A
 
-
S
 
N
R
 
T
L
 
W
P
 
P
Q
 
I
L
 
I
R
 
R
R
 
D
C
 
L
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
V
V
 
F
A
 
T
V
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
L
 
I
L
 
K
D
 
Y
A
 
A
M
 
T
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
Q
 
W
R
 
G
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
A
A
 
G
A
 
V
G
 
A
V
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
P
 
H
A
 
F
R
 
Q
H
 
T
A
 
V
G
 
S
-
 
P
-
 
E
-
 
V
R
 
K
L
 
N
V
 
V
A
 
C
T
 
I
V
 
V
L
 
L
C
 
S
G
 
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

O59791 Serine racemase; D-serine ammonia-lyase; D-serine dehydratase; L-serine ammonia-lyase; L-serine dehydratase; EC 4.3.1.17; EC 4.3.1.18; EC 5.1.1.18 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
25% identity, 95% coverage: 7:306/316 of query aligns to 10:312/323 of O59791

query
sites
O59791
L
 
Y
D
 
D
G
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
E
Q
 
R
I
 
I
D
 
K
P
 
K
V
 
F
F
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
T
L
 
V
D
 
N
D
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
V
C
 
A
R
 
E
L
 
V
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
N
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
M
G
 
G
S
 
A
F
 
F
K
 
K
G
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
-
W
 
L
F
 
N
V
 
A
A
 
L
T
 
S
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
S
 
E
G
 
A
E
 
Q
-
 
R
-
 
K
-
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
L
S
 
T
A
 
F
S
 
S
A
x
S
G
 
G
N
 
N
F
 
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
K
R
 
I
R
 
L
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
K
V
 
I
F
 
I
A
 
M
A
 
P
Q
 
L
T
 
D
A
 
A
N
 
P
P
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
E
 
A
A
 
A
M
 
T
R
 
K
A
 
G
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
V
 
V
R
 
I
L
 
M
A
 
Y
G
 
D
V
 
R
D
 
Y
F
 
K
D
 
D
A
 
D
A
 
R
K
 
E
S
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
Y
 
I
A
 
S
E
 
E
E
 
R
H
 
E
R
 
G
L
 
L
R
 
T
F
 
I
V
 
I
E
 
P
D
 
P
G
 
Y
A
 
D
E
 
H
P
 
P
A
 
H
I
 
V
A
 
L
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
G
P
 
P
-
 
L
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
F
V
 
V
P
 
C
L
 
L
G
 
G
N
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
S
G
 
G
I
 
S
G
 
A
S
 
L
V
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
H
R
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
N
V
 
C
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
V
 
E
A
 
P
A
 
E
G
 
A
A
 
G
P
 
N
S
 
D
M
 
G
K
 
Q
L
 
Q
S
 
S
L
 
F
E
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
S
A
 
I
I
 
V
E
 
H
T
 
I
A
 
D
H
 
T
A
 
P
D
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
A
A
 
Q
V
 
T
R
 
Q
V
 
H
P
 
L
I
 
G
A
 
N
S
 
Y
R
 
T
L
 
F
P
 
S
Q
 
I
L
 
I
R
 
K
R
 
E
C
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
S
E
 
D
A
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
C
M
 
L
R
 
K
L
 
F
I
 
Y
Q
 
A
R
 
A
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
I
V
 
V
V
 
V
E
 
E
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
C
A
 
L
G
 
S
V
 
F
A
 
A
G
 
A
I
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
M
P
 
K
A
 
E
R
 
K
H
 
L
A
 
K
G
 
N
R
 
K
L
 
R
V
 
I
A
 
G
T
 
I
V
 
I
L
 
I
C
 
S
G
 
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

2zr8A Crystal structure of modified serine racemase complexed with serine (see paper)
25% identity, 95% coverage: 7:306/316 of query aligns to 6:308/319 of 2zr8A

query
sites
2zr8A
L
 
Y
D
 
D
G
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
E
Q
 
R
I
 
I
D
 
K
P
 
K
V
 
F
F
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
T
L
 
V
D
 
N
D
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
V
C
 
A
R
 
E
L
 
V
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
N
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
M
G
 
G
S
 
A
F
|
F
K
|
K
G
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
-
W
 
L
F
 
N
V
 
A
A
 
L
T
 
S
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
S
 
E
G
 
A
E
 
Q
-
 
R
-
 
K
-
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
L
S
 
T
A
 
F
S
|
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
x
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
K
R
 
I
R
 
L
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
K
V
 
I
F
 
I
A
 
M
A
 
P
Q
 
L
T
 
D
A
 
A
N
 
P
P
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
E
 
A
A
 
A
M
 
T
R
 
K
A
 
G
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
V
 
V
R
 
I
L
 
M
A
 
Y
G
 
D
V
 
R
D
 
Y
F
 
K
D
 
D
A
 
D
A
x
R
K
 
E
S
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
Y
 
I
A
 
S
E
 
E
E
 
R
H
 
E
R
 
G
L
 
L
R
 
T
F
 
I
V
 
I
E
 
P
D
x
P
G
 
Y
A
 
D
E
 
H
P
 
P
A
 
H
I
 
V
A
 
L
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
G
P
 
P
-
 
L
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
F
V
 
V
P
 
C
L
 
L
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
 
L
L
 
L
E
 
S
G
 
G
I
 
S
G
 
A
S
 
L
V
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
H
R
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
N
V
 
C
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
V
x
E
A
 
P
A
 
E
G
 
A
A
x
G
P
 
N
S
x
D
M
 
G
K
 
Q
L
 
Q
S
 
S
L
 
F
E
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
S
A
 
I
I
 
V
E
 
H
T
 
I
A
 
D
H
 
T
A
 
P
D
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
|
D
G
|
G
I
x
A
A
x
Q
V
x
T
R
 
Q
V
 
H
P
 
L
I
 
G
A
 
N
S
 
Y
R
 
T
L
 
F
P
 
S
Q
 
I
L
 
I
R
 
K
R
 
E
C
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
S
E
 
D
A
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
C
M
 
L
R
 
K
L
 
F
I
 
Y
Q
 
A
R
 
A
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
I
V
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
A
x
T
G
 
G
A
 
C
A
 
L
G
 
S
V
 
F
A
 
A
G
 
A
I
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
M
P
 
K
A
 
E
R
 
K
H
 
L
A
 
K
G
 
N
R
 
K
L
 
R
V
 
I
A
 
G
T
 
I
V
 
I
L
x
I
C
x
S
G
 
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

2zpuA Crystal structure of modified serine racemase from s.Pombe. (see paper)
25% identity, 95% coverage: 7:306/316 of query aligns to 6:308/319 of 2zpuA

query
sites
2zpuA
L
 
Y
D
 
D
G
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
S
P
 
E
Q
 
R
I
 
I
D
 
K
P
 
K
V
 
F
F
 
A
L
 
N
H
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
L
R
 
T
A
 
S
A
 
S
A
 
T
L
 
V
D
 
N
D
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
V
C
 
A
R
 
E
L
 
V
L
 
F
G
 
F
K
 
K
D
 
C
E
 
E
T
 
N
D
 
F
N
 
Q
P
 
K
I
 
M
G
 
G
S
 
A
F
|
F
K
|
K
G
 
F
R
 
R
G
 
G
T
 
A
E
 
-
W
 
L
F
 
N
V
 
A
A
 
L
T
 
S
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
S
 
E
G
 
A
E
 
Q
-
 
R
-
 
K
-
 
A
A
 
G
I
 
V
V
 
L
S
 
T
A
 
F
S
|
S
A
x
S
G
 
G
N
|
N
F
x
H
G
 
A
Q
 
Q
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
S
A
 
A
T
 
K
R
 
I
R
 
L
G
 
G
H
 
I
A
 
P
C
 
A
T
 
K
V
 
I
F
 
I
A
 
M
A
 
P
Q
 
L
T
 
D
A
 
A
N
 
P
P
 
E
A
 
A
K
 
K
L
 
V
E
 
A
A
 
A
M
 
T
R
 
K
A
 
G
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
V
 
V
R
 
I
L
 
M
A
 
Y
G
 
D
V
 
R
D
 
Y
F
 
K
D
 
D
A
 
D
A
 
R
K
 
E
S
 
K
A
 
M
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
Y
 
I
A
 
S
E
 
E
E
 
R
H
 
E
R
 
G
L
 
L
R
 
T
F
 
I
V
 
I
E
 
P
D
x
P
G
 
Y
A
 
D
E
 
H
P
 
P
A
 
H
I
 
V
A
 
L
Q
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
G
T
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
G
P
 
P
-
 
L
E
 
D
V
 
A
V
 
L
L
 
F
V
 
V
P
 
C
L
 
L
G
|
G
N
x
G
G
|
G
A
x
G
L
 
L
L
 
L
E
 
S
G
 
G
I
 
S
G
 
A
S
 
L
V
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
H
R
 
F
A
 
A
P
 
P
S
 
N
V
 
C
E
 
E
I
 
V
V
 
Y
A
 
G
V
 
V
V
x
E
A
 
P
A
 
E
G
 
A
A
x
G
P
 
N
S
x
D
M
 
G
K
 
Q
L
 
Q
S
 
S
L
 
F
E
 
R
A
 
K
G
 
G
R
 
S
A
 
I
I
 
V
E
 
H
T
 
I
A
 
D
H
 
T
A
 
P
D
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
D
 
D
G
|
G
I
 
A
A
 
Q
V
 
T
R
 
Q
V
 
H
P
 
L
I
 
G
A
 
N
S
 
Y
R
 
T
L
 
F
P
 
S
Q
 
I
L
 
I
R
 
K
R
 
E
C
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
D
I
 
I
V
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
S
E
 
D
A
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
C
M
 
L
R
 
K
L
 
F
I
 
Y
Q
 
A
R
 
A
H
 
R
L
 
M
G
 
K
M
 
I
V
 
V
V
 
V
E
|
E
P
 
P
A
x
T
G
 
G
A
 
C
A
 
L
G
 
S
V
 
F
A
 
A
G
 
A
I
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
M
P
 
K
A
 
E
R
 
K
H
 
L
A
 
K
G
 
N
R
 
K
L
 
R
V
 
I
A
 
G
T
 
I
V
 
I
L
x
I
C
x
S
G
 
G
K
 
G
N
 
N
I
 
V

Query Sequence

>N515DRAFT_3206 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_3206
MTLSLDLDGVLAASPQIDPVFLHTPLRRAAALDDALGCRLLGKDETDNPIGSFKGRGTEW
FVATALNSGEAIVSASAGNFGQGLARAATRRGHACTVFAAQTANPAKLEAMRALGAEVRL
AGVDFDAAKSAARQYAEEHRLRFVEDGAEPAIAQGAATIALELLAEAAPEVVLVPLGNGA
LLEGIGSVLRARAPSVEIVAVVAAGAPSMKLSLEAGRAIETAHADTIADGIAVRVPIASR
LPQLRRCCDRIVAVSEAQLLDAMRLIQRHLGMVVEPAGAAGVAGILAEPARHAGRLVATV
LCGKNIHPSLRDRLIP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory