SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_3260 FitnessBrowser__Dyella79:N515DRAFT_3260 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

5uxnA Type ii dah7ps from pseudomonas aeruginosa with tyr bound (see paper)
48% identity, 93% coverage: 13:453/472 of query aligns to 1:441/445 of 5uxnA

query
sites
5uxnA
S
 
S
W
 
W
T
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
S
W
 
W
R
 
R
L
 
A
R
 
K
E
 
P
A
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
E
Y
 
Y
D
 
P
D
|
D
R
 
A
A
 
A
Q
x
H
L
 
L
E
 
A
N
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
Q
R
 
T
I
 
L
G
 
A
K
 
G
L
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
F
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
A
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
Q
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
Q
 
T
E
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
S
F
 
F
G
 
A
D
 
E
C
 
F
D
 
S
A
 
A
D
 
A
T
 
K
I
 
I
V
 
R
N
 
D
R
 
T
L
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
M
G
 
T
H
 
F
G
 
A
L
 
A
K
 
G
Q
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
G
R
|
R
F
 
M
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
|
R
S
|
S
S
 
S
D
 
G
R
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
Q
G
 
N
G
 
G
E
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
G
A
 
I
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
R
R
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
M
 
L
F
 
L
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
H
F
 
Q
S
 
S
A
 
T
L
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
N
F
 
L
T
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
F
F
 
A
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
x
A
D
 
D
L
|
L
R
 
H
H
 
Q
P
 
V
E
 
H
Y
 
R
W
 
W
Q
 
N
L
 
L
D
 
D
W
 
F
I
 
I
D
 
A
Q
 
N
S
 
S
P
 
A
R
 
L
A
 
A
I
 
E
E
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
Q
E
 
L
V
 
A
E
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
D
N
 
E
S
 
T
W
 
L
R
 
A
F
 
F
L
 
M
H
 
R
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
L
Q
 
D
V
 
S
G
 
A
T
 
P
E
x
Q
R
 
L
V
 
R
S
x
E
A
x
T
G
 
S
F
 
F
Y
 
F
T
 
T
S
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
N
F
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
D
P
 
S
H
 
L
R
 
T
R
 
G
G
 
E
W
 
W
F
 
Y
N
 
D
L
 
C
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
M
P
 
L
W
 
W
I
 
I
G
|
G
M
 
D
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
V
E
 
E
Y
 
M
F
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
Q
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
I
A
 
G
M
 
V
K
|
K
V
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
M
R
 
D
P
 
S
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
H
 
D
E
 
N
E
 
D
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
N
L
 
L
I
 
I
T
 
V
R
|
R
M
 
M
G
 
G
C
 
A
K
 
D
H
 
K
I
 
V
A
 
G
E
 
D
A
 
H
L
 
L
P
 
P
P
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
R
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
R
H
 
Q
V
 
V
L
 
L
W
 
W
V
 
S
V
 
S
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
I
T
 
K
T
 
A
P
 
S
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
K
|
K
T
 
T
R
 
R
H
 
D
F
 
F
D
 
A
N
 
R
I
 
V
R
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
V
E
 
R
A
 
Q
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
Q
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
S
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
I
E
|
E
M
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
S
R
 
R
S
 
P
L
 
I
Q
 
T
E
 
E
Q
 
D
D
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
D
A
 
R
Y
 
Y
K
 
H
T
 
T
T
 
H
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
A
E
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
I
T
 
A
K
 
E
V
 
T
A
 
L
R
 
K

5uxmA Type ii dah7ps from pseudomonas aeruginosa with trp bound (see paper)
48% identity, 93% coverage: 13:453/472 of query aligns to 1:441/445 of 5uxmA

query
sites
5uxmA
S
 
S
W
 
W
T
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
S
W
 
W
R
 
R
L
 
A
R
 
K
E
 
P
A
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
E
Y
 
Y
D
 
P
D
|
D
R
 
A
A
 
A
Q
x
H
L
 
L
E
 
A
N
 
R
V
 
V
A
 
E
R
 
Q
R
 
T
I
 
L
G
 
A
K
 
G
L
 
Y
P
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
F
S
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
A
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
Q
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
Q
 
T
E
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
S
F
 
F
G
 
A
D
 
E
C
 
F
D
 
S
A
 
A
D
 
A
T
 
K
I
 
I
V
 
R
N
 
D
R
 
T
L
 
F
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
x
V
I
 
V
L
 
M
G
 
T
H
 
F
G
 
A
L
 
A
K
 
G
Q
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
x
K
V
 
V
G
 
G
R
|
R
F
 
M
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
|
R
S
|
S
S
 
S
D
 
G
R
 
D
E
 
E
T
 
T
V
 
Q
G
 
N
G
 
G
E
 
V
T
 
T
L
 
L
P
 
P
S
 
A
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
G
A
 
I
A
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
E
A
 
K
A
 
S
R
 
R
R
 
V
P
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
M
 
L
F
 
L
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
H
F
 
Q
S
 
S
A
 
T
L
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
N
F
 
L
T
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
F
F
 
A
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
F
 
F
G
x
A
D
 
D
L
|
L
R
 
H
H
 
Q
P
 
V
E
 
H
Y
 
R
W
 
W
Q
 
N
L
 
L
D
 
D
W
 
F
I
 
I
D
 
A
Q
 
N
S
 
S
P
 
A
R
 
L
A
 
A
I
 
E
E
 
R
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
Q
E
 
L
V
 
A
E
 
D
E
 
R
I
 
I
A
 
D
N
 
E
S
 
T
W
 
L
R
 
A
F
 
F
L
 
M
H
 
R
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
L
Q
 
D
V
 
S
G
 
A
T
 
P
E
x
Q
R
 
L
V
 
R
S
x
E
A
 
T
G
 
S
F
 
F
Y
 
F
T
 
T
S
 
A
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
P
 
N
F
 
Y
E
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
D
P
 
S
H
 
L
R
 
T
R
 
G
G
 
E
W
 
W
F
 
Y
N
 
D
L
 
C
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
M
P
 
L
W
 
W
I
 
I
G
|
G
M
 
D
R
|
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
V
E
 
E
Y
 
M
F
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
V
Q
 
G
N
 
N
P
 
P
V
 
I
A
 
G
M
 
V
K
|
K
V
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
T
 
M
R
 
D
P
 
S
A
 
E
D
 
E
L
 
L
L
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
I
E
 
D
V
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
H
 
D
E
 
N
E
 
D
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
N
L
 
L
I
 
I
T
 
V
R
|
R
M
 
M
G
 
G
C
 
A
K
 
D
H
 
K
I
 
V
A
 
G
E
 
D
A
 
H
L
 
L
P
 
P
P
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
R
 
Q
R
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
R
H
 
Q
V
 
V
L
 
L
W
 
W
V
 
S
V
 
S
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
I
T
x
K
T
 
A
P
 
S
T
 
S
G
 
G
I
 
Y
K
|
K
T
 
T
R
 
R
H
 
D
F
 
F
D
 
A
N
 
R
I
 
V
R
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
V
E
 
R
A
 
Q
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
Q
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
S
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
I
E
|
E
M
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
S
R
 
R
S
 
P
L
 
I
Q
 
T
E
 
E
Q
 
D
D
 
G
L
 
L
S
 
S
R
 
D
A
 
R
Y
 
Y
K
 
H
T
 
T
T
 
H
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
A
E
 
D
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
I
T
 
A
K
 
E
V
 
T
A
 
L
R
 
K

5hudD Non-covalent complex of and dahp synthase and chorismate mutase from corynebacterium glutamicum with bound transition state analog (see paper)
43% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 27:456/457 of 5hudD

query
sites
5hudD
R
 
R
E
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
D
 
D
D
 
-
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
R
R
 
K
R
 
I
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
I
V
 
V
T
 
V
S
 
A
G
 
P
E
 
E
I
 
V
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
E
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
F
G
 
E
D
 
S
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
V
 
T
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
x
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
T
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
x
K
V
 
M
G
 
A
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
L
G
 
D
G
 
G
E
 
N
T
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
N
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
G
A
 
V
A
 
E
F
 
A
D
 
T
A
 
P
A
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
A
R
 
R
M
 
M
F
 
I
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
T
G
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
H
 
R
P
 
L
E
 
S
Y
 
E
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
A
Q
 
N
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
S
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
E
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
S
T
 
D
E
 
E
R
 
S
V
 
L
-
 
R
S
x
A
A
 
A
G
 
D
F
 
I
Y
 
Y
T
 
C
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
S
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
A
P
 
T
H
 
D
R
 
E
R
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
E
W
 
L
F
 
Y
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
Q
P
 
L
W
 
W
I
 
I
G
 
G
M
 
E
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
G
I
 
M
D
 
D
G
 
D
A
 
F
H
 
H
I
 
V
E
 
N
Y
 
F
F
 
A
R
 
S
G
 
M
L
 
I
Q
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
I
A
 
G
M
 
I
K
 
K
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
G
T
 
I
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
A
L
 
Y
I
 
A
E
 
D
V
 
K
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
N
E
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
V
T
 
A
R
 
R
M
 
M
G
 
G
C
 
H
K
 
D
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
S
A
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
G
L
 
V
L
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
E
R
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
H
H
 
K
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
S
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
F
T
 
T
T
 
A
P
 
S
T
 
N
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
K
I
 
V
R
 
I
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
I
E
|
E
M
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
E
S
 
D
L
 
I
Q
 
T
E
 
D
Q
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
P
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
S
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

5hucA Dahp synthase from corynebacterium glutamicum (see paper)
43% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 19:448/449 of 5hucA

query
sites
5hucA
R
 
R
E
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
D
 
D
D
 
-
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
R
R
 
K
R
 
I
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
I
V
 
V
T
 
V
S
 
A
G
 
P
E
 
E
I
 
V
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
V
Q
 
A
E
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
F
G
 
E
D
 
S
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
A
R
 
N
L
 
V
K
 
K
V
 
T
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
x
A
L
x
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
T
P
 
P
V
 
V
I
 
I
R
x
K
V
 
M
G
 
A
R
|
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
L
G
 
D
G
 
G
E
 
N
T
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
N
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
N
 
N
A
 
G
A
 
V
A
 
E
F
 
A
D
 
T
A
 
P
A
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
A
R
 
R
M
 
M
F
 
I
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
T
G
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
H
 
R
P
 
L
E
 
S
Y
 
E
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
A
Q
 
N
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
S
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
E
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
S
T
 
D
E
 
E
R
x
S
V
 
L
-
 
R
S
 
A
A
 
A
G
 
D
F
 
I
Y
 
Y
T
 
C
S
 
S
H
 
H
E
|
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
V
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
S
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
A
P
 
T
H
 
D
R
 
E
R
 
E
G
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
E
W
 
L
F
 
Y
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
Q
P
 
L
W
|
W
I
 
I
G
|
G
M
x
E
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
G
I
 
M
D
 
D
G
 
D
A
 
F
H
 
H
I
 
V
E
 
N
Y
 
F
F
 
A
R
 
S
G
 
M
L
 
I
Q
 
S
N
 
N
P
 
P
V
 
I
A
 
G
M
 
I
K
|
K
V
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
G
T
 
I
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
A
L
 
Y
I
 
A
E
 
D
V
 
K
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
N
E
 
F
E
 
E
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
I
I
 
V
T
 
A
R
|
R
M
 
M
G
 
G
C
 
H
K
 
D
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
S
A
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
G
L
 
V
L
 
I
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
R
 
E
R
 
A
A
 
S
G
 
G
R
 
H
H
 
K
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
S
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
F
T
 
T
T
 
A
P
 
S
T
 
N
G
 
G
I
 
Y
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
K
I
 
V
R
 
I
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
I
E
|
E
M
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
E
S
 
D
L
 
I
Q
 
T
E
 
D
Q
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
P
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
S
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

5e40A 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from mycobacterium tuberculosis with d-tyrosine bound in the phenylalanine binding site (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 32:461/462 of 5e40A

query
sites
5e40A
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
x
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
|
F
G
 
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
V
Q
x
R
A
 
A
Y
|
Y
A
|
A
F
x
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
L
G
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
H
H
 
L
P
 
V
E
 
H
Y
 
D
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
R
Q
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
R
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
A
T
 
D
E
 
R
R
 
N
V
 
L
-
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
E
F
 
I
Y
 
Y
T
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
S
P
 
D
H
 
G
R
 
D
R
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
W
 
L
F
 
F
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
T
P
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
M
 
E
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
A
R
 
Q
G
 
V
L
 
I
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
G
M
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
N
T
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
L
L
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
N
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
C
 
N
K
 
H
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
H
H
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
E
T
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
F
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
V
E
|
E
M
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

5e2lA 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with d-phenylalanine (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 32:461/462 of 5e2lA

query
sites
5e2lA
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
|
F
G
 
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
V
Q
x
R
A
 
A
Y
 
Y
A
|
A
F
x
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
L
G
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
H
H
 
L
P
 
V
E
 
H
Y
 
D
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
R
Q
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
R
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
A
T
 
D
E
 
R
R
 
N
V
 
L
-
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
E
F
 
I
Y
 
Y
T
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
S
P
 
D
H
 
G
R
 
D
R
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
W
 
L
F
 
F
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
T
P
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
M
 
E
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
A
R
 
Q
G
 
V
L
 
I
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
G
M
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
N
T
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
L
L
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
N
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
C
 
N
K
 
H
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
H
H
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
E
T
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
F
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
V
E
|
E
M
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

O53512 Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase AroG; 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase; DAHP synthase; Phospho-2-keto-3-deoxyheptonate aldolase; EC 2.5.1.54 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 32:461/462 of O53512

query
sites
O53512
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
F
G
 
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
R
|
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
V
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
L
G
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
H
H
 
L
P
 
V
E
 
H
Y
 
D
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
R
Q
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
R
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
A
T
 
D
E
 
R
R
 
N
V
 
L
-
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
E
F
 
I
Y
 
Y
T
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
S
P
 
D
H
 
G
R
 
D
R
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
W
 
L
F
 
F
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
T
P
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
M
x
E
R
|
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
A
R
 
Q
G
 
V
L
 
I
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
G
M
 
V
K
|
K
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
N
T
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
L
L
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
N
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
R
|
R
M
 
M
G
 
G
C
 
N
K
 
H
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
H
H
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
E
T
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
F
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
V
E
|
E
M
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

3pfpA Structure of 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with an active site inhibitor (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 34:463/464 of 3pfpA

query
sites
3pfpA
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
F
G
 
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
R
|
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
|
K
P
|
P
R
|
R
S
|
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
V
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
L
G
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
H
H
 
L
P
 
V
E
 
H
Y
 
D
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
R
Q
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
R
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
A
T
 
D
E
 
R
R
 
N
V
 
L
-
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
E
F
 
I
Y
 
Y
T
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
S
P
 
D
H
 
G
R
 
D
R
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
W
 
L
F
 
F
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
T
P
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
M
x
E
R
|
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
A
R
 
Q
G
 
V
L
 
I
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
G
M
 
V
K
|
K
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
N
T
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
L
L
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
N
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
R
|
R
M
 
M
G
 
G
C
 
N
K
 
H
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
H
H
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
E
T
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
F
K
|
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
V
E
|
E
M
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
T
 
A
V
x
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

3nv8B The structure of 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase in complex with phosphoenol pyruvate and manganese (thesit-free) (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 34:463/464 of 3nv8B

query
sites
3nv8B
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
 
F
G
 
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
V
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
 
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
L
G
 
A
D
 
S
L
 
L
R
 
H
H
 
L
P
 
V
E
 
H
Y
 
D
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
R
Q
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
R
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
A
T
 
D
E
 
R
R
 
N
V
 
L
-
 
Q
S
 
T
A
 
A
G
 
E
F
 
I
Y
 
Y
T
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
S
P
 
D
H
 
G
R
 
D
R
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
W
 
L
F
 
F
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
T
P
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
M
x
E
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
A
R
 
Q
G
 
V
L
 
I
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
G
M
 
V
K
|
K
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
N
T
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
L
L
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
N
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
R
|
R
M
 
M
G
 
G
C
 
N
K
 
H
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
H
H
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
E
T
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
F
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
V
E
|
E
M
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

5e5gA 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase with d-tryptophan bound in the tryptophan and phenylalanine binding sites (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 28:457/458 of 5e5gA

query
sites
5e5gA
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
|
F
G
 
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
x
K
V
 
V
G
 
A
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D
 
D
P
 
P
E
 
S
R
 
R
M
 
L
F
 
V
Q
x
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
F
x
N
S
 
A
A
 
S
L
 
A
T
 
A
L
 
M
N
 
N
F
 
L
T
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
F
 
T
E
 
S
G
 
S
G
 
G
F
 
L
G
x
A
D
 
S
L
 
L
R
 
H
H
 
L
P
 
V
E
 
H
Y
 
D
W
 
W
Q
 
N
L
 
R
D
 
E
W
 
F
I
 
V
D
 
R
Q
 
T
S
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
G
I
 
A
E
 
R
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
E
 
L
V
 
A
E
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
D
N
 
R
S
 
G
W
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
M
H
 
S
T
 
A
L
 
C
G
 
G
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
G
 
A
T
 
D
E
 
R
R
x
N
V
 
L
-
 
Q
S
x
T
A
 
A
G
 
E
F
 
I
Y
 
Y
T
 
A
S
 
S
H
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
V
L
 
L
P
 
D
F
 
Y
E
 
E
E
 
R
A
 
A
V
 
M
T
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
S
P
 
D
H
 
G
R
 
D
R
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
Q
W
 
L
F
 
F
N
 
D
L
 
L
S
 
S
T
 
A
H
 
H
L
 
T
P
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
M
 
E
R
 
R
T
 
T
S
 
R
D
 
Q
I
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
I
E
 
A
Y
 
F
F
 
A
R
 
Q
G
 
V
L
 
I
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
V
 
V
A
 
G
M
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
N
T
 
M
R
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
L
L
 
A
L
 
V
R
 
E
L
 
Y
I
 
V
E
 
E
V
 
R
L
 
L
N
 
D
P
 
P
H
 
H
E
 
N
E
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
R
M
 
L
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
R
 
R
M
 
M
G
 
G
C
 
N
K
 
H
H
 
K
I
 
V
A
 
R
E
 
D
A
 
L
L
 
L
P
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
V
A
 
E
A
 
K
V
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
T
G
 
G
R
 
H
H
 
Q
V
 
V
L
 
I
W
 
W
V
 
Q
V
 
C
D
 
D
P
 
P
M
 
M
H
|
H
G
 
G
N
 
N
T
 
T
E
 
H
T
 
E
T
 
S
P
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
F
K
 
K
T
 
T
R
 
R
H
 
H
F
 
F
D
 
D
N
 
R
I
 
I
R
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
A
 
F
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
H
 
H
G
 
R
A
 
A
E
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
H
L
 
P
G
 
G
G
 
G
V
 
I
H
 
H
L
 
V
E
|
E
M
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
N
V
 
V
T
 
T
E
 
E
C
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
S
 
D
L
 
I
Q
 
S
E
 
E
Q
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
A
R
 
G
A
 
R
Y
 
Y
K
 
E
T
 
T
T
 
A
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
N
 
N
Y
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
S
M
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
L
I
 
V
T
 
A
K
 
E
V
 
M
A
 
L
R
 
R

2ypoA 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase with phenylalanine bound in only one site (see paper)
42% identity, 92% coverage: 22:453/472 of query aligns to 28:457/458 of 2ypoA

query
sites
2ypoA
R
 
K
E
 
P
A
 
A
Q
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
C
 
T
Y
 
W
-
 
P
-
 
A
D
 
D
D
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
E
 
R
N
 
T
V
 
V
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
L
G
 
E
K
 
S
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
T
T
 
V
S
 
P
G
 
S
E
 
E
I
 
I
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
K
 
Q
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
V
Q
 
A
E
 
K
G
 
G
R
 
E
R
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
G
 
G
G
 
G
D
 
D
C
|
C
A
 
A
E
 
E
S
 
T
F
|
F
G
x
M
D
 
D
C
 
N
D
 
T
A
 
E
D
 
P
T
 
H
I
 
I
V
 
R
N
 
G
R
 
N
L
 
V
K
 
R
V
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
M
 
M
S
 
A
L
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
T
H
 
Y
G
 
G
L
 
A
K
 
S
Q
 
M
P
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
R
 
R
F
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
K
 
K
P
 
P
R
 
R
S
 
S
S
 
A
D
 
D
R
 
I
E
 
D
T
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
P
 
R
S
 
S
F
 
Y
R
 
R
G
 
G
D
 
D
I
 
M
V
 
I
N
 
N
A
 
G
A
 
F
A
 
A
F
 
P
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
P
 
H
D