SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing N515DRAFT_4257 N515DRAFT_4257 UDP-glucuronate 4-epimerase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5u4qA 1.5 angstrom resolution crystal structure of NAD-dependent epimerase from klebsiella pneumoniae in complex with NAD.
57% identity, 96% coverage: 1:334/348 of query aligns to 2:319/321 of 5u4qA

query
sites
5u4qA
M
 
M
K
 
K
V
 
F
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
F
H
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
N
R
 
E
G
 
G
D
 
H
E
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
I
D
|
D
N
|
N
L
 
M
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
L
Q
 
-
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
Y
 
F
T
 
H
H
 
F
V
 
Q
H
 
Q
A
 
L
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
E
A
 
G
V
 
M
E
 
A
K
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
T
H
 
E
K
 
Q
P
 
F
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
-
V
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
N
P
 
P
H
 
Y
V
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
D
S
 
A
N
 
N
V
 
L
T
 
M
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
H
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
C
 
C
R
 
R
Q
 
H
H
 
T
G
 
K
V
 
V
Q
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
V
F
 
Y
A
|
A
S
 
S
T
 
S
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
L
N
 
N
R
 
R
D
 
K
L
 
M
P
 
P
F
 
F
S
 
S
E
 
T
H
 
E
R
 
D
P
 
S
A
 
V
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
V
T
 
S
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
K
 
K
A
 
A
N
 
N
E
 
E
Q
 
L
M
 
M
A
 
A
H
 
H
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
R
F
|
F
F
|
F
T
|
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
K
F
 
F
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
K
P
 
S
I
 
I
R
 
D
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
E
 
Y
G
 
G
R
 
K
H
 
M
K
 
K
R
 
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
V
E
 
E
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
I
P
 
P
G
 
Q
K
 
A
D
 
N
P
 
A
A
 
D
W
 
W
D
 
T
A
 
V
T
 
E
Q
 
S
P
 
G
D
 
S
P
 
P
S
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
S
V
 
-
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
N
E
 
S
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
M
R
 
D
Y
 
Y
I
 
I
E
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
Y
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
M
K
 
E
A
 
A
T
 
Q
M
 
K
E
 
N
L
 
M
L
 
M
P
 
P
L
 
I
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
T
E
 
S
A
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
Q
S
 
P
L
 
L
V
 
Y
A
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
P
 
P
K
 
Q
V
 
T
S
 
S
V
 
V
E
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
K
A
 
N
F
 
F
V
 
V
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
K
T
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y

5u4qB 1.5 angstrom resolution crystal structure of NAD-dependent epimerase from klebsiella pneumoniae in complex with NAD.
56% identity, 96% coverage: 1:334/348 of query aligns to 2:303/304 of 5u4qB

query
sites
5u4qB
M
 
M
K
 
K
V
 
F
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
F
H
 
H
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
N
R
 
E
G
 
G
D
 
H
E
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
I
D
|
D
N
|
N
L
 
M
N
|
N
D
 
D
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
D
V
 
V
G
 
S
L
 
L
K
|
K
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
L
Q
 
-
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
A
Y
 
F
T
 
H
H
 
F
V
 
Q
H
 
Q
A
 
L
D
|
D
L
|
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
A
 
E
A
 
G
V
 
M
E
 
A
K
 
K
L
 
L
F
 
F
A
 
A
T
 
T
H
 
E
K
 
Q
P
 
F
E
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
-
A
 
-
A
 
L
T
 
E
N
 
N
P
 
P
H
 
Y
V
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
D
S
 
A
N
 
N
V
 
L
T
 
M
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
H
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
E
G
 
G
C
 
C
R
 
R
Q
 
H
H
 
T
G
 
K
V
 
V
Q
 
K
H
 
H
L
 
L
V
 
V
F
 
Y
A
|
A
S
 
S
T
 
S
S
 
S
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
L
N
 
N
R
 
R
D
 
K
L
 
M
P
 
P
F
 
F
S
 
S
E
 
T
H
 
E
R
 
D
P
 
S
A
 
V
E
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
V
T
 
S
L
 
L
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
K
 
K
A
 
A
N
 
N
E
 
E
Q
 
L
M
 
M
A
 
A
H
 
H
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
R
F
|
F
F
 
F
T
 
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
W
G
 
G
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
 
A
L
 
L
F
 
F
L
 
K
F
 
F
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
E
G
 
G
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
V
E
 
E
G
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
V
V
 
I
P
 
P
G
 
Q
K
 
A
D
 
N
P
 
A
A
 
D
W
 
W
D
 
T
A
 
V
T
 
E
Q
 
S
P
 
G
D
 
S
P
 
P
S
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
S
V
 
-
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
N
E
 
S
Q
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
M
R
 
D
Y
 
Y
I
 
I
E
 
T
V
 
A
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
Y
 
A
L
 
L
G
 
G
R
 
M
K
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
T
E
 
S
A
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
Q
S
 
P
L
 
L
V
 
Y
A
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
P
 
P
K
 
Q
V
 
T
S
 
S
V
 
V
E
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
K
A
 
N
F
 
F
V
 
V
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y
R
 
K
T
 
D
Y
 
Y
Y
 
Y

6zllA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-galacturonic acid and NAD (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:338/348 of query aligns to 1:318/321 of 6zllA

query
sites
6zllA
M
 
M
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
C
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
E
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
I
D
|
D
N
x
H
L
x
F
N
x
I
D
 
G
Y
 
P
Y
 
T
D
 
P
V
 
A
G
 
T
L
 
L
K
|
K
Q
 
T
A
 
G
R
 
N
L
 
I
A
 
Q
R
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
N
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
Q
H
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
D
|
D
L
x
I
A
 
L
D
 
N
R
 
-
A
 
T
A
 
D
V
 
L
E
 
S
K
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
-
T
 
-
H
 
Q
K
 
D
P
 
I
E
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
Y
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
I
A
x
P
G
 
G
V
|
V
R
|
R
Y
 
T
A
 
S
-
 
W
A
 
G
T
 
K
N
 
D
P
 
F
H
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
S
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
M
G
 
V
F
 
T
L
 
Q
H
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
K
Q
 
H
H
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
T
|
T
S
|
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
E
N
 
K
R
 
S
D
 
G
L
 
A
P
 
V
F
 
S
S
 
E
E
 
D
H
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
I
E
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
L
A
 
S
N
 
G
E
 
E
Q
 
H
M
 
L
A
 
C
H
 
H
S
 
V
Y
 
Y
A
 
H
H
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
I
T
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
T
|
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
|
A
L
 
F
F
 
H
L
x
R
F
 
L
T
 
I
Q
 
K
A
 
Q
I
 
M
L
 
L
A
 
E
G
 
D
E
 
K
P
 
P
I
 
L
R
x
T
V
 
I
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
T
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
C
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
K
P
 
K
S
 
N
T
 
I
S
 
I
G
 
G
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
V
Y
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
G
E
 
K
Q
 
E
P
 
Q
V
 
A
E
 
S
L
x
I
L
 
L
R
 
D
Y
 
I
I
 
I
E
 
S
V
 
M
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
Y
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
K
E
 
N
L
 
F
L
 
L
P
 
K
L
 
S
Q
 
V
A
 
P
G
 
G
D
x
E
V
 
P
P
 
K
E
 
Q
T
 
T
E
 
W
A
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
S
S
 
K
L
 
A
V
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
R
 
S
P
 
P
K
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
E
V
 
Y
D
 
D
W
 
Y
Y
 
I
R
 
K
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
Y
A
 
K
A
 
G
A
 
D
A
 
A

6zldA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
32% identity, 96% coverage: 1:334/348 of query aligns to 1:314/314 of 6zldA

query
sites
6zldA
M
 
M
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
C
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
E
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
I
D
|
D
N
x
H
L
x
F
N
x
I
D
 
G
Y
 
P
Y
 
T
D
 
P
V
 
A
G
 
T
L
 
L
K
|
K
Q
 
T
A
 
G
R
 
N
L
 
I
A
 
Q
R
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
N
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
Q
H
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
D
|
D
L
x
I
A
 
L
D
 
N
R
 
-
A
 
T
A
 
D
V
 
L
E
 
S
K
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
-
T
 
-
H
 
Q
K
 
D
P
 
I
E
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
Y
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
I
A
x
P
G
 
G
V
 
V
R
|
R
Y
 
T
A
 
S
-
 
W
A
 
G
T
 
K
N
 
D
P
 
F
H
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
S
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
M
G
 
V
F
 
T
L
 
Q
H
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
K
Q
 
H
H
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
T
|
T
S
|
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
E
N
 
K
R
 
S
D
 
G
L
 
A
P
 
V
F
 
S
S
 
E
E
 
D
H
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
I
E
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
L
A
 
S
N
 
G
E
 
E
Q
 
H
M
 
L
A
 
C
H
 
H
S
 
V
Y
 
Y
A
 
H
H
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
I
T
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
T
|
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
|
A
L
 
F
F
 
H
L
x
R
F
 
L
T
 
I
Q
 
K
A
 
Q
I
 
M
L
 
L
A
 
E
G
 
D
E
 
K
P
 
P
I
 
L
R
x
T
V
 
I
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
T
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
C
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
K
P
 
K
S
 
N
T
 
I
S
 
I
G
 
G
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
V
Y
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
G
E
 
K
Q
 
E
P
 
Q
V
 
A
E
 
S
L
x
I
L
 
L
R
 
D
Y
 
I
I
 
I
E
 
S
V
 
M
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
Y
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
K
E
 
N
L
 
F
L
 
L
P
 
K
L
 
S
Q
 
V
A
 
P
G
 
G
D
x
E
V
 
P
P
 
K
E
 
Q
T
 
T
E
 
W
A
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
S
S
 
K
L
 
A
V
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
R
 
S
P
 
P
K
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
E
V
 
Y
D
 
D
W
 
Y
Y
 
I
R
 
K
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
Y

6zl6A Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp and NAD (see paper)
32% identity, 96% coverage: 1:334/348 of query aligns to 1:314/314 of 6zl6A

query
sites
6zl6A
M
 
M
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
C
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
E
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
I
D
|
D
N
x
H
L
x
F
N
x
I
D
 
G
Y
 
P
Y
 
T
D
 
P
V
 
A
G
 
T
L
 
L
K
|
K
Q
 
T
A
 
G
R
 
N
L
 
I
A
 
Q
R
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
N
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
Q
H
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
D
|
D
L
x
I
A
 
L
D
 
N
R
 
-
A
 
T
A
 
D
V
 
L
E
 
S
K
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
-
T
 
-
H
 
Q
K
 
D
P
 
I
E
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
Y
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
I
A
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
R
Y
 
T
A
 
S
-
 
W
A
 
G
T
 
K
N
 
D
P
 
F
H
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
S
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
M
G
 
V
F
 
T
L
 
Q
H
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
K
Q
 
H
H
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
T
|
T
S
|
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
E
N
 
K
R
 
S
D
 
G
L
 
A
P
 
V
F
 
S
S
 
E
E
 
D
H
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
I
E
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
L
A
 
S
N
 
G
E
 
E
Q
 
H
M
 
L
A
 
C
H
 
H
S
 
V
Y
 
Y
A
 
H
H
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
I
T
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
T
|
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
|
A
L
 
F
F
 
H
L
x
R
F
 
L
T
 
I
Q
 
K
A
 
Q
I
 
M
L
 
L
A
 
E
G
 
D
E
 
K
P
 
P
I
 
L
R
x
T
V
 
I
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
T
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
C
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
K
P
 
K
S
 
N
T
 
I
S
 
I
G
 
G
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
V
Y
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
G
E
 
K
Q
 
E
P
 
Q
V
 
A
E
 
S
L
x
I
L
 
L
R
 
D
Y
 
I
I
 
I
E
 
S
V
 
M
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
Y
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
K
E
 
N
L
 
F
L
 
L
P
 
K
L
 
S
Q
 
V
A
 
P
G
 
G
D
x
E
V
 
P
P
 
K
E
 
Q
T
 
T
E
 
W
A
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
S
S
 
K
L
 
A
V
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
R
 
S
P
 
P
K
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
E
V
 
Y
D
 
D
W
 
Y
Y
 
I
R
 
K
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
Y

6zljA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase y149f mutant from bacillus cereus in complex with udp-4-deoxy-4-fluoro-glucuronic acid and NAD (see paper)
32% identity, 96% coverage: 1:334/348 of query aligns to 1:314/314 of 6zljA

query
sites
6zljA
M
 
M
K
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
C
R
 
Q
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
E
 
H
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
I
D
|
D
N
x
H
L
x
F
N
x
I
D
 
G
Y
 
P
Y
 
T
D
 
P
V
 
A
G
 
T
L
 
L
K
|
K
Q
 
T
A
 
G
R
 
N
L
 
I
A
 
Q
R
 
S
V
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
N
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
Q
H
 
F
V
 
I
H
 
R
A
 
E
D
|
D
L
x
I
A
 
L
D
 
N
R
 
-
A
 
T
A
 
D
V
 
L
E
 
S
K
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
-
T
 
-
H
 
Q
K
 
D
P
 
I
E
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
Y
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
I
A
x
P
G
 
G
V
 
V
R
|
R
Y
 
T
A
 
S
-
 
W
A
 
G
T
 
K
N
 
D
P
 
F
H
 
Q
V
 
P
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
S
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
M
G
 
V
F
 
T
L
 
Q
H
 
Q
I
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
K
Q
 
H
H
 
I
G
 
K
V
 
L
Q
 
D
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
T
|
T
S
|
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
E
N
 
K
R
 
S
D
 
G
L
 
A
P
 
V
F
 
S
S
 
E
E
 
D
H
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
I
E
 
-
H
 
-
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
x
F
A
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
L
A
 
S
N
 
G
E
 
E
Q
 
H
M
 
L
A
 
C
H
 
H
S
 
V
Y
 
Y
A
 
H
H
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
V
 
I
P
 
P
A
 
I
T
 
V
G
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
T
|
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
|
A
L
 
F
F
 
H
L
x
R
F
 
L
T
 
I
Q
 
K
A
 
Q
I
 
M
L
 
L
A
 
E
G
 
D
E
 
K
P
 
P
I
 
L
R
x
T
V
 
I
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
T
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
D
I
 
C
V
 
I
E
 
R
G
 
G
V
 
T
V
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
E
T
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
K
P
 
K
S
 
N
T
 
I
S
 
I
G
 
G
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
V
Y
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
G
E
 
K
Q
 
E
P
 
Q
V
 
A
E
 
S
L
x
I
L
 
L
R
 
D
Y
 
I
I
 
I
E
 
S
V
 
M
L
 
L
E
 
E
Q
 
K
Y
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
K
E
 
N
L
 
F
L
 
L
P
 
K
L
 
S
Q
 
V
A
 
P
G
 
G
D
x
E
V
 
P
P
 
K
E
 
Q
T
 
T
E
 
W
A
 
A
D
 
D
V
 
I
S
 
S
S
 
K
L
 
A
V
 
S
A
 
T
A
 
L
V
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
R
 
S
P
 
P
K
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
E
V
 
Y
D
 
D
W
 
Y
Y
 
I
R
 
K
T
 
Q
Y
 
L
Y
 
Y

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:331/348 of query aligns to 1:305/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
M
 
M
K
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
V
R
 
D
K
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
E
R
 
N
G
 
G
D
 
Y
E
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
V
L
 
V
D
|
D
N
|
N
L
 
L
N
x
S
D
x
S
Y
x
G
Y
 
K
D
 
V
V
 
E
G
 
N
L
 
L
K
 
N
Q
 
R
A
 
N
R
 
A
L
 
L
A
 
F
R
 
Y
V
 
E
Q
 
Q
A
x
S
Y
 
-
P
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
H
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
L
x
I
A
 
E
D
 
D
R
 
E
A
 
E
A
 
M
V
 
M
E
 
E
K
 
R
L
 
I
F
 
F
A
 
S
T
 
L
H
 
H
K
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
Y
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
 
A
G
 
S
V
 
V
R
 
A
Y
 
I
A
 
S
A
 
V
T
 
R
N
 
E
P
 
P
H
 
A
V
 
R
Y
 
D
V
 
A
S
 
K
S
x
T
N
 
N
V
 
I
T
 
I
G
 
G
F
 
S
L
 
L
H
 
V
I
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
K
C
 
S
R
 
I
Q
 
K
H
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
H
 
K
L
 
F
V
 
I
F
 
F
A
x
S
S
|
S
T
|
T
-
 
G
S
x
G
S
x
A
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
E
N
 
N
R
 
V
D
 
K
L
 
V
P
 
F
F
 
P
S
 
T
E
 
P
H
 
E
R
 
T
P
 
E
A
 
I
E
 
P
H
 
H
P
 
P
L
 
I
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
G
A
 
I
T
 
A
K
|
K
K
 
Y
A
 
S
N
 
T
E
 
E
Q
 
M
M
 
Y
A
 
L
H
 
E
S
 
F
Y
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
E
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
P
 
K
A
 
Y
T
 
T
G
 
V
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
A
T
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
-
x
Y
-
 
G
-
 
E
D
 
A
M
x
G
A
x
V
L
 
V
F
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
T
Q
 
E
A
 
R
I
 
M
L
 
L
A
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
E
I
 
V
R
x
H
V
 
I
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
E
H
x
Y
K
 
V
R
|
R
S
 
D
F
 
Y
T
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
V
V
 
V
E
 
R
G
 
A
V
 
N
V
 
L
R
 
L
A
 
A
L
 
M
D
 
E
T
 
K
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
G
P
 
D
Y
 
N
R
 
E
L
 
V
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
R
P
 
G
V
 
T
E
 
T
L
x
V
L
 
N
R
 
Q
Y
 
L
I
 
F
E
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
Y
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
Y
K
 
D
A
 
K
T
 
E
M
 
P
E
 
V
L
 
Y
L
 
K
P
 
P
L
 
P
Q
x
R
A
 
K
G
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
E
 
K
T
 
S
E
 
I
A
 
L
D
 
D
V
 
Y
S
 
T
S
 
K
L
 
A
V
 
K
A
 
E
A
 
K
V
 
L
G
 
G
Y
 
W
R
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
K
A
 
L
F
 
T
V
 
V
D
 
E
W
 
Y
Y
 
F
R
 
R

Q7BJX9 UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase; UDP-GalNAc 4-epimerase; EC 5.1.3.7 from Plesiomonas shigelloides (Aeromonas shigelloides) (see 2 papers)
30% identity, 94% coverage: 4:330/348 of query aligns to 23:339/345 of Q7BJX9

query
sites
Q7BJX9
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
T
x
V
A
|
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
V
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
E
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
x
F
N
x
S
D
x
T
Y
x
G
Y
 
H
D
 
Q
V
 
Y
G
 
N
L
 
L
K
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
-
 
T
L
 
L
A
 
V
R
 
S
V
 
T
Q
 
E
A
 
Q
Y
 
W
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
C
H
 
F
V
 
I
H
 
E
A
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
R
D
 
D
R
 
L
A
 
T
A
 
T
V
 
C
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
F
 
M
A
 
K
T
 
-
H
 
-
K
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
H
V
 
V
V
 
L
N
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
Q
 
L
A
 
G
G
 
S
V
 
V
R
 
P
Y
 
R
A
 
S
A
 
I
T
 
V
N
 
D
P
 
P
H
 
I
V
 
T
Y
 
T
V
 
N
S
 
A
S
x
T
N
 
N
V
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
C
 
A
R
 
K
Q
 
N
H
 
A
G
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
H
 
S
L
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
T
x
S
S
|
S
S
|
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
D
N
 
H
R
 
P
D
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
K
S
 
V
E
 
E
H
 
E
R
 
N
P
 
I
A
 
G
E
 
-
H
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
Y
A
 
V
N
 
N
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
A
H
 
Q
S
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
F
P
 
K
A
 
T
T
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
T
x
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
 
N
M
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
x
V
L
x
I
F
x
P
L
x
K
F
 
W
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
D
I
 
V
R
x
Y
V
x
I
F
x
N
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
T
K
x
S
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
C
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
N
I
 
V
V
 
I
E
 
Q
-
 
M
G
 
N
V
 
I
V
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
K
V
 
D
P
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
N
A
 
I
W
 
Y
D
 
N
A
 
V
T
 
A
Q
 
V
P
 
G
D
 
D
P
x
R
S
 
T
T
 
T
S
 
L
G
 
N
V
 
E
A
 
L
P
 
S
Y
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
N
 
D
I
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
E
V
 
L
E
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
H
Y
 
H
I
 
I
E
 
D
V
 
-
L
 
-
E
 
-
Q
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
L
T
 
S
M
 
I
E
 
K
L
 
Y
L
 
R
P
 
E
L
 
F
Q
x
R
A
x
S
G
|
G
D
|
D
V
 
V
P
x
R
E
x
H
T
x
S
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
T
S
 
K
L
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
L
V
 
L
G
 
K
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
K
 
N
V
 
I
S
 
K
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
L
F
 
S
V
 
M
D
 
P
W
 
W
Y
 
Y

3ruhA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
30% identity, 94% coverage: 4:330/348 of query aligns to 20:331/336 of 3ruhA

query
sites
3ruhA
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
V
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
E
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
 
F
N
x
S
D
x
T
Y
x
G
Y
 
H
D
 
Q
V
 
Y
G
 
N
L
 
L
K
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
-
 
T
L
 
L
A
 
V
R
 
S
V
 
T
Q
 
E
A
 
Q
Y
 
W
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
C
H
 
F
V
 
I
H
 
E
A
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
R
D
 
D
R
 
L
A
 
T
A
 
T
V
 
C
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
F
 
M
A
 
K
T
 
-
H
 
-
K
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
H
V
 
V
V
 
L
N
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
Q
 
L
A
x
G
G
x
S
V
 
V
R
 
P
Y
 
R
A
 
S
A
 
I
T
 
V
N
 
D
P
 
P
H
 
I
V
 
T
Y
 
T
V
 
N
S
 
A
S
x
T
N
 
N
V
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
C
 
A
R
 
K
Q
 
N
H
 
A
G
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
H
 
S
L
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
T
x
S
S
|
S
S
|
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
D
N
 
H
R
 
P
D
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
K
S
 
V
E
 
E
H
 
E
R
 
N
P
 
I
A
 
G
E
 
-
H
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
Y
A
 
V
N
 
N
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
A
H
 
Q
S
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
F
P
 
K
A
 
T
T
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
T
x
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
x
N
M
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
x
A
-
x
V
L
 
I
F
 
P
L
x
K
F
x
W
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
D
I
 
V
R
x
Y
V
x
I
F
x
N
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
T
K
 
S
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
C
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
N
I
 
V
V
 
I
E
 
Q
-
 
M
G
 
N
V
 
I
V
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
K
V
 
D
P
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
N
A
 
I
W
 
Y
D
 
N
A
 
V
T
 
A
Q
 
V
P
 
G
D
 
D
P
 
R
S
 
T
T
 
T
S
x
L
G
 
N
V
 
E
A
 
L
P
 
S
Y
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
N
 
D
I
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
E
V
 
L
E
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
H
Y
 
H
I
 
I
E
 
K
V
 
Y
L
 
R
E
 
E
Q
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
F
Q
x
R
A
 
S
G
 
G
D
|
D
V
|
V
P
 
R
E
 
H
T
x
S
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
T
S
 
K
L
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
L
V
 
L
G
 
K
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
K
 
N
V
 
I
S
 
K
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
L
F
 
S
V
 
M
D
 
P
W
 
W
Y
 
Y

3rufA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
30% identity, 94% coverage: 4:330/348 of query aligns to 20:331/336 of 3rufA

query
sites
3rufA
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
V
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
E
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
 
F
N
x
S
D
x
T
Y
x
G
Y
 
H
D
 
Q
V
 
Y
G
 
N
L
 
L
K
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
-
 
T
L
 
L
A
 
V
R
 
S
V
 
T
Q
 
E
A
 
Q
Y
 
W
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
C
H
 
F
V
 
I
H
 
E
A
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
R
D
 
D
R
 
L
A
 
T
A
 
T
V
 
C
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
F
 
M
A
 
K
T
 
-
H
 
-
K
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
H
V
 
V
V
 
L
N
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
Q
 
L
A
 
G
G
 
S
V
 
V
R
 
P
Y
 
R
A
 
S
A
 
I
T
 
V
N
 
D
P
 
P
H
 
I
V
 
T
Y
 
T
V
 
N
S
 
A
S
x
T
N
 
N
V
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
C
 
A
R
 
K
Q
 
N
H
 
A
G
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
H
 
S
L
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
 
A
T
x
S
S
|
S
S
|
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
D
N
 
H
R
 
P
D
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
K
S
 
V
E
 
E
H
 
E
R
 
N
P
 
I
A
 
G
E
 
-
H
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
Y
A
 
V
N
 
N
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
A
H
 
Q
S
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
F
P
 
K
A
 
T
T
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
T
x
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
x
N
M
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
x
A
-
x
V
L
 
I
F
 
P
L
x
K
F
x
W
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
D
I
 
V
R
x
Y
V
x
I
F
x
N
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
T
K
 
S
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
C
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
N
I
 
V
V
 
I
E
 
Q
-
 
M
G
 
N
V
 
I
V
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
K
V
 
D
P
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
N
A
 
I
W
 
Y
D
 
N
A
 
V
T
 
A
Q
 
V
P
 
G
D
 
D
P
 
R
S
 
T
T
 
T
S
x
L
G
 
N
V
 
E
A
 
L
P
 
S
Y
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
N
 
D
I
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
E
V
 
L
E
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
H
Y
 
H
I
 
I
E
 
K
V
 
Y
L
 
R
E
 
E
Q
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
F
Q
x
R
A
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
E
 
H
T
 
S
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
T
S
 
K
L
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
L
V
 
L
G
 
K
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
K
 
N
V
 
I
S
 
K
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
L
F
 
S
V
 
M
D
 
P
W
 
W
Y
 
Y

3lu1A Crystal structure analysis of wbgu: a udp-galnac 4-epimerase (see paper)
30% identity, 94% coverage: 4:330/348 of query aligns to 20:331/336 of 3lu1A

query
sites
3lu1A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
V
 
L
A
 
L
R
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
E
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
 
F
N
x
S
D
x
T
Y
x
G
Y
 
H
D
 
Q
V
 
Y
G
 
N
L
 
L
K
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
-
 
T
L
 
L
A
 
V
R
 
S
V
 
T
Q
 
E
A
 
Q
Y
 
W
P
 
S
G
 
R
Y
 
F
T
 
C
H
 
F
V
 
I
H
 
E
A
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
R
D
 
D
R
 
L
A
 
T
A
 
T
V
 
C
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
F
 
M
A
 
K
T
 
-
H
 
-
K
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
H
V
 
V
V
 
L
N
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
Q
 
L
A
 
G
G
x
S
V
 
V
R
 
P
Y
 
R
A
 
S
A
 
I
T
 
V
N
 
D
P
 
P
H
 
I
V
 
T
Y
 
T
V
 
N
S
 
A
S
 
T
N
 
N
V
 
I
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
L
H
 
N
I
 
I
L
 
L
E
 
H
G
 
A
C
 
A
R
 
K
Q
 
N
H
 
A
G
 
Q
V
 
V
Q
|
Q
H
 
S
L
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
T
x
S
S
|
S
S
|
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
D
N
 
H
R
 
P
D
 
A
L
 
L
P
 
P
F
 
K
S
 
V
E
 
E
H
 
E
R
 
N
P
 
I
A
 
G
E
 
-
H
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
Y
A
 
V
N
 
N
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
A
H
 
Q
S
 
V
Y
 
Y
A
 
A
H
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
F
P
x
K
A
 
T
T
 
I
G
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
T
x
N
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
x
N
M
 
G
A
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
x
V
L
 
I
F
 
P
L
 
K
F
x
W
T
 
T
Q
 
A
A
 
A
I
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
D
P
 
D
I
 
V
R
x
Y
V
x
I
F
x
N
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
E
H
 
T
K
 
S
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
C
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
D
 
N
I
 
V
V
 
I
E
 
Q
-
 
M
G
 
N
V
 
I
V
 
L
R
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
A
T
 
K
V
 
D
P
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
P
 
N
A
 
I
W
 
Y
D
 
N
A
 
V
T
 
A
Q
 
V
P
 
G
D
 
D
P
 
R
S
 
T
T
 
T
S
x
L
G
 
N
V
 
E
A
 
L
P
 
S
Y
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
N
 
D
I
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
E
V
 
L
E
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
H
Y
 
H
I
 
I
E
 
K
V
 
Y
L
 
R
E
 
E
Q
 
-
Y
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
T
 
-
M
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
F
Q
x
R
A
 
S
G
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
E
 
H
T
 
S
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
T
S
 
K
L
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
L
V
 
L
G
 
K
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
K
 
N
V
 
I
S
 
K
V
 
I
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
R
A
 
L
F
 
S
V
 
M
D
 
P
W
 
W
Y
 
Y

2p5uA Crystal structure of thermus thermophilus hb8 udp-glucose 4-epimerase complex with NAD
32% identity, 95% coverage: 1:331/348 of query aligns to 1:308/311 of 2p5uA

query
sites
2p5uA
M
 
M
K
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
I
A
 
V
R
 
E
K
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
G
D
 
L
E
 
E
V
 
V
I
 
A
G
 
V
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
|
L
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
|
A
R
x
T
L
x
G
A
 
K
R
 
R
V
 
E
Q
 
N
A
 
V
Y
 
P
P
 
K
G
 
G
Y
 
V
T
 
P
H
 
F
V
 
F
H
 
R
A
 
V
D
|
D
L
|
L
A
 
R
D
 
D
R
 
K
A
 
E
A
 
G
V
 
V
E
 
E
K
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
R
T
 
E
H
 
F
K
 
R
P
 
P
E
 
T
R
 
H
V
 
V
V
 
S
N
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
|
A
G
 
S
V
 
V
R
 
K
Y
 
V
A
 
S
A
 
V
T
 
E
N
 
D
P
 
P
H
 
V
V
 
L
Y
 
D
V
 
F
S
 
E
S
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
L
G
 
G
F
 
G
L
 
L
H
 
N
I
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
R
Q
 
Q
H
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
H
 
K
L
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
|
S
T
|
T
-
 
G
S
x
G
S
x
A
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
E
N
 
V
R
 
P
D
 
E
L
 
G
P
 
E
F
 
R
S
 
A
E
 
E
H
 
E
R
 
T
P
 
W
A
 
P
E
 
P
H
 
R
P
 
P
L
 
K
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
K
 
A
A
 
A
N
 
F
E
 
E
Q
 
H
M
 
Y
A
 
L
H
 
S
S
 
V
Y
 
Y
A
 
G
H
 
Q
L
 
S
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
P
 
K
A
 
W
T
 
V
G
 
S
L
 
L
R
 
R
F
 
Y
F
 
G
T
 
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
x
H
-
 
G
-
 
E
-
 
A
M
x
G
A
 
V
L
 
V
F
 
A
L
 
I
F
 
F
T
 
A
Q
 
E
A
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
G
E
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
T
V
 
L
F
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
P
-
 
G
N
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
-
H
 
C
K
 
V
R
 
R
S
 
D
F
 
Y
T
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
A
E
 
E
G
 
A
V
 
H
V
 
A
R
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
F
T
 
S
V
 
L
P
 
E
G
 
G
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
I
Y
 
Y
N
 
N
I
 
V
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
E
P
 
G
V
 
H
E
 
T
L
 
T
L
 
R
R
 
E
Y
 
V
I
 
L
E
 
M
V
 
A
L
 
V
E
 
A
Q
 
E
Y
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
K
K
 
A
A
 
P
T
 
E
M
 
V
E
 
Q
L
 
P
L
 
A
P
 
P
L
 
P
Q
 
R
A
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
E
E
 
R
T
 
S
E
 
V
A
 
L
D
 
S
V
 
P
S
 
L
S
 
K
L
 
L
V
 
M
A
 
A
A
 
H
V
 
-
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
G
V
 
F
E
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
R
A
 
L
F
 
T
V
 
V
D
 
D
W
 
H
Y
 
F
R
 
R

8du1A Crystal structure of NAD bound dtdp-glucose 4,6-dehydratase from elizabethkingia anophelis
28% identity, 95% coverage: 2:330/348 of query aligns to 5:337/361 of 8du1A

query
sites
8du1A
K
 
N
V
 
I
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
V
R
 
R
K
 
E
L
 
F
L
 
V
A
 
I
R
 
K
G
 
N
D
 
P
E
 
E
V
 
I
-
 
T
-
 
I
I
 
I
G
 
N
L
 
L
D
|
D
N
x
A
L
|
L
N
x
T
D
 
-
Y
 
-
Y
 
Y
D
 
A
V
x
G
G
 
N
L
 
L
K
 
E
Q
 
N
A
 
-
R
 
-
L
 
L
A
 
K
R
 
D
V
 
I
Q
 
E
A
 
N
Y
 
F
P
 
P
G
 
N
Y
 
Y
T
 
V
H
 
F
V
 
E
H
 
K
A
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
T
D
 
K
R
 
P
A
 
E
A
 
E
V
 
L
E
 
R
K
 
K
L
 
V
F
 
F
A
 
E
T
 
K
H
 
Y
K
 
N
P
 
P
E
 
D
R
 
A
V
 
V
V
 
V
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
E
A
 
S
G
 
H
V
 
V
R
 
D
Y
 
R
A
 
S
A
 
I
T
 
T
N
 
D
P
 
P
H
 
N
V
 
A
Y
 
F
V
 
I
S
 
N
S
x
T
N
 
N
V
 
V
T
 
I
G
 
G
F
 
T
L
 
A
H
 
N
I
 
L
L
 
L
E
 
N
G
 
L
C
 
C
R
 
R
Q
 
E
-
 
F
-
 
W
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
T
H
 
H
G
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
R
V
 
T
Q
 
N
H
 
L
L
 
F
V
 
Y
F
 
H
A
 
V
S
|
S
T
|
T
S
 
D
S
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
S
N
 
L
R
 
G
D
 
E
L
 
T
P
 
G
F
 
F
S
 
F
E
 
L
H
 
E
R
 
T
P
 
T
A
 
A
E
 
Y
H
 
D
P
 
P
L
 
Q
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
T
 
S
K
|
K
K
 
A
A
 
A
N
 
S
E
 
D
Q
 
H
M
 
L
A
 
V
H
 
R
S
 
A
Y
 
Y
A
 
G
H
 
N
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
M
P
 
P
A
 
F
T
 
I
G
 
V
L
 
S
R
 
N
F
x
C
F
 
S
T
 
N
V
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
N
G
 
H
R
 
F
P
 
P
D
 
E
M
 
K
A
 
L
L
 
I
F
 
P
L
 
L
F
 
C
T
 
I
Q
 
S
A
 
N
I
 
I
L
 
L
A
 
N
G
 
E
E
 
K
P
 
P
I
 
L
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
K
H
 
Y
K
 
T
R
 
R
S
 
D
F
 
W
T
 
L
Y
 
Y
I
 
V
D
 
I
D
 
D
I
 
H
V
 
A
E
 
R
G
 
A
V
 
I
V
 
H
R
 
Q
A
 
I
L
 
F
D
 
N
T
 
E
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
A
T
 
K
S
 
T
G
 
G
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
-
 
G
-
 
F
N
 
N
E
 
E
-
 
W
Q
 
Q
P
 
N
V
 
I
E
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
K
-
 
E
Y
 
L
I
 
I
E
 
K
V
 
Q
L
 
L
E
 
D
Q
 
A
Y
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
K
-
 
P
K
 
E
A
 
G
T
 
H
M
 
S
E
 
E
L
 
K
L
 
L
P
 
I
L
 
T
Q
 
F
A
 
V
G
 
K
D
 
D
V
 
R
P
 
P
E
 
G
T
 
H
E
 
D
A
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
I
D
 
D
V
 
A
S
 
T
S
 
K
L
 
L
V
 
N
A
 
K
A
 
D
V
 
L
G
 
G
Y
 
W
R
 
K
P
 
P
K
 
S
V
 
V
S
 
T
V
 
F
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
K
F
 
T
V
 
I
D
 
D
W
 
W
Y
 
Y

3aw9A Structure of udp-galactose 4-epimerase mutant
30% identity, 93% coverage: 1:323/348 of query aligns to 1:293/304 of 3aw9A

query
sites
3aw9A
M
 
M
K
 
R
V
 
I
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
D
K
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
E
R
 
L
G
 
G
D
 
Y
E
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
V
L
 
V
D
|
D
N
x
I
L
 
V
N
 
Q
D
 
-
Y
 
-
Y
 
R
D
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
G
Y
 
S
T
 
A
H
 
E
V
 
L
H
 
H
A
 
V
-
x
R
D
|
D
L
|
L
A
 
K
D
 
D
R
 
Y
A
 
S
A
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
W
F
 
G
A
 
A
T
 
G
H
 
I
K
 
K
P
 
G
E
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
x
F
A
|
A
A
|
A
Q
 
N
A
x
P
G
 
E
V
|
V
R
 
R
Y
 
-
A
 
-
A
 
T
T
 
T
N
 
E
P
 
P
H
 
I
V
 
V
Y
 
H
V
 
F
S
 
N
S
x
E
N
 
N
V
 
V
T
 
V
G
 
A
F
 
T
L
 
F
H
 
N
I
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
W
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
H
 
T
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
H
 
T
L
 
V
V
 
V
F
 
F
A
|
A
S
|
S
T
x
S
S
|
S
S
x
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
D
N
 
A
R
 
D
D
 
V
L
 
I
P
 
P
F
 
T
S
 
P
E
 
E
H
 
E
R
 
E
P
 
P
A
 
Y
E
 
K
H
 
-
P
 
P
L
 
I
T
 
S
L
 
V
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
T
 
A
K
|
K
K
 
A
A
 
A
N
 
G
E
 
E
Q
 
V
M
 
M
A
 
C
H
 
A
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
H
 
R
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
R
A
 
C
T
 
L
G
 
A
L
 
V
R
 
R
F
x
Y
F
 
A
T
x
N
V
|
V
Y
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
x
L
R
 
R
P
x
H
D
x
G
M
x
V
A
 
I
L
 
Y
F
x
D
L
 
F
F
 
I
T
 
M
Q
 
K
A
 
L
I
 
R
L
 
R
A
 
N
G
 
P
E
 
N
P
 
V
I
 
L
R
 
E
V
 
V
F
x
L
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
R
R
x
K
S
 
S
F
x
Y
T
 
L
Y
 
Y
I
 
V
D
 
R
D
 
D
I
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
A
V
 
T
V
 
L
R
 
A
A
 
A
L
 
W
D
 
K
T
 
K
V
 
F
P
 
E
G
 
E
K
 
M
D
 
D
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
R
 
L
L
 
A
Y
 
L
N
 
N
I
 
V
G
 
G
N
 
N
E
 
V
Q
 
D
P
 
A
V
 
V
E
 
R
L
x
V
L
 
L
R
 
D
Y
 
I
I
 
A
E
 
Q
V
 
I
L
 
V
E
 
A
Q
 
E
Y
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
L
K
 
R
A
 
P
T
 
E
M
 
I
E
 
R
L
 
L
L
 
V
P
 
P
L
 
S
Q
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
x
W
A
 
P
G
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
K
E
 
Y
T
 
M
E
 
T
A
 
L
D
 
A
V
 
V
S
 
T
S
 
K
L
 
L
V
 
M
A
 
K
A
 
L
V
 
T
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
P
 
P
K
 
T
V
 
M
S
 
T
V
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
A
I
 
V

7ystA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chain b from mycobacterium tuberculosis
29% identity, 95% coverage: 1:331/348 of query aligns to 1:309/312 of 7ystA

query
sites
7ystA
M
 
M
K
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
V
 
L
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
H
E
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
F
D
 
A
V
x
T
G
|
G
L
 
-
K
 
R
Q
 
A
A
 
T
R
 
N
L
 
L
A
 
E
R
 
H
V
 
L
Q
 
A
A
 
D
Y
 
N
P
 
S
G
 
A
Y
 
H
T
 
V
H
 
F
V
 
V
H
 
E
A
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
V
D
 
-
R
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
L
E
 
H
K
 
A
L
 
I
F
 
L
A
 
E
T
 
Q
H
 
H
K
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
V
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
x
I
G
 
D
V
 
V
R
|
R
Y
 
R
A
 
S
A
 
V
T
 
A
N
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
 
F
Y
 
D
V
 
A
S
 
A
S
x
V
N
 
N
V
 
V
T
 
I
G
 
G
F
 
T
L
 
V
H
 
R
I
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
H
 
T
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
H
 
K
L
 
I
V
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
T
x
S
S
 
G
-
x
G
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
N
 
P
R
 
P
D
 
E
L
 
Y
P
 
P
F
 
T
S
 
P
E
 
E
H
 
T
R
 
A
P
 
P
A
 
T
E
 
D
H
 
-
P
 
P
L
 
A
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
G
K
|
K
K
 
V
A
 
A
N
 
G
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
L
H
 
N
S
 
T
Y
 
F
A
 
R
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
P
 
D
A
 
C
T
 
S
G
 
H
L
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
T
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
 
H
M
 
G
-
 
E
-
x
A
-
x
G
A
x
V
L
 
V
F
 
A
L
 
I
F
|
F
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
 
K
P
 
P
I
 
T
R
|
R
V
|
V
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
T
D
 
N
T
 
T
V
x
R
P
 
D
G
 
Y
K
 
V
D
 
F
P
 
V
A
 
D
W
 
D
D
 
V
A
 
V
T
 
D
Q
 
A
P
 
F
D
 
V
P
 
R
S
 
V
T
 
S
S
 
A
G
 
D
V
 
V
A
 
G
P
 
G
Y
 
G
R
 
L
L
 
R
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
K
P
 
E
V
 
T
E
 
S
L
x
D
L
 
R
R
 
Q
Y
 
L
I
 
H
E
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
A
Q
 
A
Y
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
G
K
 
P
A
 
D
T
 
D
M
 
P
E
 
E
L
 
F
L
 
H
P
 
P
L
 
P
Q
x
R
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
K
E
 
R
T
 
S
E
 
C
A
 
L
D
 
D
V
 
I
S
 
G
S
 
L
L
 
A
V
 
E
A
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
V
 
I
S
 
E
V
 
L
E
 
A
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
R
A
 
R
F
 
T
V
 
V
D
 
E
W
 
Y
Y
 
F
R
 
R

7ysmA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) co-crystallized with udp-n-acetylglucosamine from mycobacterium tuberculosis
29% identity, 95% coverage: 1:331/348 of query aligns to 1:309/311 of 7ysmA

query
sites
7ysmA
M
 
M
K
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
V
 
L
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
H
E
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
F
D
 
A
V
x
T
G
|
G
L
 
-
K
 
R
Q
 
A
A
 
T
R
 
N
L
 
L
A
 
E
R
 
H
V
 
L
Q
 
A
A
 
D
Y
 
N
P
 
S
G
 
A
Y
 
H
T
 
V
H
 
F
V
 
V
H
 
E
A
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
V
D
 
-
R
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
L
E
 
H
K
 
A
L
 
I
F
 
L
A
 
E
T
 
Q
H
 
H
K
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
V
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
x
I
G
 
D
V
 
V
R
|
R
Y
 
R
A
 
S
A
 
V
T
 
A
N
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
 
F
Y
 
D
V
 
A
S
 
A
S
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
I
G
 
G
F
 
T
L
 
V
H
 
R
I
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
H
 
T
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
H
 
K
L
 
I
V
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
T
x
S
S
 
G
-
x
G
S
|
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
N
 
P
R
 
P
D
 
E
L
 
Y
P
 
P
F
 
T
S
 
P
E
 
E
H
 
T
R
 
A
P
 
P
A
 
T
E
 
D
H
 
-
P
 
P
L
 
A
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
G
K
|
K
K
 
V
A
 
A
N
 
G
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
L
H
 
N
S
 
T
Y
 
F
A
 
R
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
P
 
D
A
 
C
T
 
S
G
 
H
L
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
T
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
 
H
M
 
G
-
 
E
-
 
A
-
x
G
A
x
V
L
 
V
F
 
A
L
 
I
F
|
F
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
 
K
P
 
P
I
 
T
R
|
R
V
|
V
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
T
D
x
N
T
 
T
V
x
R
P
 
D
G
 
Y
K
 
V
D
 
F
P
 
V
A
 
D
W
 
D
D
 
V
A
 
V
T
 
D
Q
 
A
P
 
F
D
 
V
P
 
R
S
 
V
T
 
S
S
 
A
G
 
D
V
 
V
A
 
G
P
 
G
Y
 
G
R
 
L
L
 
R
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
K
P
 
E
V
 
T
E
 
S
L
x
D
L
 
R
R
 
Q
Y
 
L
I
 
H
E
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
A
Q
 
A
Y
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
G
K
 
P
A
 
D
T
 
D
M
 
P
E
 
E
L
 
F
L
 
H
P
 
P
L
 
P
Q
x
R
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
K
E
 
R
T
 
S
E
 
C
A
 
L
D
 
D
V
 
I
S
 
G
S
 
L
L
 
A
V
 
E
A
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
V
 
I
S
 
E
V
 
L
E
 
A
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
R
A
 
R
F
 
T
V
 
V
D
 
E
W
 
Y
Y
 
F
R
 
R

7ys9A Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chaina from mycobacterium tuberculosis
29% identity, 95% coverage: 1:331/348 of query aligns to 1:309/310 of 7ys9A

query
sites
7ys9A
M
 
M
K
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
V
 
L
A
 
V
R
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
H
E
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
D
|
D
N
|
N
L
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
F
D
x
A
V
x
T
G
|
G
L
 
-
K
 
R
Q
 
A
A
 
T
R
 
N
L
 
L
A
 
E
R
 
H
V
 
L
Q
 
A
A
 
D
Y
 
N
P
 
S
G
 
A
Y
 
H
T
 
V
H
 
F
V
 
V
H
 
E
A
 
A
D
|
D
L
x
I
A
 
V
D
 
-
R
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
L
E
 
H
K
 
A
L
 
I
F
 
L
A
 
E
T
 
Q
H
 
H
K
 
R
P
 
P
E
 
E
R
 
V
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
A
x
I
G
 
D
V
 
V
R
|
R
Y
 
R
A
 
S
A
 
V
T
 
A
N
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
 
F
Y
 
D
V
 
A
S
 
A
S
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
I
G
 
G
F
 
T
L
 
V
H
 
R
I
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
H
 
T
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
H
 
K
L
 
I
V
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
T
x
S
S
 
G
-
x
G
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
T
N
 
P
R
 
P
D
 
E
L
 
Y
P
 
P
F
 
T
S
 
P
E
 
E
H
 
T
R
 
A
P
 
P
A
 
T
E
 
D
H
 
-
P
 
P
L
 
A
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
G
K
|
K
K
 
V
A
 
A
N
 
G
E
 
E
Q
 
I
M
 
Y
A
 
L
H
 
N
S
 
T
Y
 
F
A
 
R
H
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
P
 
D
A
 
C
T
 
S
G
 
H
L
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
T
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
R
G
 
Q
R
 
D
P
 
P
D
 
H
M
 
G
-
 
E
-
x
A
-
x
G
A
x
V
L
 
V
F
 
A
L
 
I
F
|
F
T
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
E
 
K
P
 
P
I
 
T
R
|
R
V
 
V
F
|
F
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
-
H
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
I
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
T
D
x
N
T
 
T
V
x
R
P
 
D
G
 
Y
K
 
V
D
 
F
P
 
V
A
 
D
W
 
D
D
 
V
A
 
V
T
 
D
Q
 
A
P
 
F
D
 
V
P
 
R
S
 
V
T
 
S
S
 
A
G
 
D
V
 
V
A
 
G
P
 
G
Y
 
G
R
 
L
L
 
R
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
K
P
 
E
V
 
T
E
 
S
L
x
D
L
 
R
R
 
Q
Y
 
L
I
 
H
E
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
A
Q
 
A
Y
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
G
K
 
P
A
 
D
T
 
D
M
 
P
E
 
E
L
 
F
L
 
H
P
 
P
L
 
P
Q
x
R
A
 
L
G
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
K
E
 
R
T
 
S
E
 
C
A
 
L
D
 
D
V
 
I
S
 
G
S
 
L
L
 
A
V
 
E
A
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
Y
 
W
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
V
 
I
S
 
E
V
 
L
E
 
A
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
R
A
 
R
F
 
T
V
 
V
D
 
E
W
 
Y
Y
 
F
R
 
R

6kv9A Moee5 in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:331/348 of query aligns to 3:296/299 of 6kv9A

query
sites
6kv9A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
N
R
 
S
G
 
G
D
 
R
E
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
V
D
|
D
N
x
R
L
 
-
N
x
R
D
 
P
Y
 
L
Y
 
P
D
 
D
V
 
T
G
 
G
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
G
 
S
Y
 
L
T
 
R
H
 
E
V
 
I
H
 
R
A
 
G
D
|
D
L
|
L
A
 
N
D
 
S
R
 
L
A
 
N
A
 
L
V
 
V
E
 
D
K
 
C
L
 
L
F
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
K
K
 
N
P
 
I
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
L
A
x
P
G
 
G
V
 
V
R
|
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
W
T
 
T
N
 
Q
P
 
F
H
 
P
V
 
E
Y
 
Y
V
 
L
S
 
R
S
x
C
N
 
N
V
 
V
T
 
L
G
 
A
F
 
T
L
 
Q
H
 
R
I
 
L
L
 
M
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
V
Q
 
Q
H
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
A
|
A
S
|
S
T
x
S
S
|
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
G
N
 
A
R
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
M
F
 
S
S
 
E
E
 
D
H
 
D
R
 
L
P
 
P
A
 
-
E
 
-
H
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
E
Q
 
R
M
 
L
A
 
A
H
 
L
S
 
A
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
L
 
R
Y
 
G
G
 
D
-
 
A
-
 
E
V
 
L
P
 
S
A
 
V
T
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
R
F
|
F
F
 
F
T
|
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
G
G
 
Q
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
x
F
L
 
I
F
 
S
L
x
R
F
 
L
T
 
I
Q
 
R
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
V
R
x
E
V
x
I
F
x
Y
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
L
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
H
I
 
V
D
 
S
D
 
D
I
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
M
W
 
L
D
 
T
A
 
A
T
 
S
Q
 
V
P
 
R
D
 
D
P
 
R
S
 
G
T
 
S
S
 
A
G
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
V
Y
 
L
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
S
P
 
A
V
 
V
E
 
S
L
x
V
L
 
N
R
 
E
Y
 
V
I
 
V
E
 
S
V
 
M
L
 
T
E
 
A
Q
 
E
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
L
K
 
R
A
 
P
T
 
C
M
 
T
E
 
A
L
 
Y
L
 
G
P
 
S
L
 
A
Q
 
R
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
E
 
S
T
 
T
E
 
T
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
R
S
 
Q
L
 
A
V
 
Q
A
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
R
 
T
P
 
A
K
 
R
V
 
T
S
 
G
V
 
L
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
T
F
 
Q
V
 
I
D
 
E
W
 
W
Y
 
T
R
 
R

6kvcA Moee5 in complex with udp-glucose and NAD (see paper)
31% identity, 95% coverage: 3:331/348 of query aligns to 3:295/299 of 6kvcA

query
sites
6kvcA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
T
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
L
A
 
V
R
 
T
K
 
E
L
 
L
L
 
R
A
 
N
R
 
S
G
 
G
D
 
R
E
 
N
V
 
V
I
 
V
G
 
A
L
 
V
D
|
D
N
x
R
L
 
-
N
 
-
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
R
|
R
V
 
P
Q
 
L
A
 
P
Y
 
T
P
 
G
G
 
S
Y
 
L
T
 
R
H
 
E
V
 
I
H
 
R
A
 
G
D
|
D
L
|
L
A
 
N
D
 
S
R
 
L
A
 
N
A
 
L
V
 
V
E
 
D
K
 
C
L
 
L
F
 
-
A
 
-
T
 
-
H
 
K
K
 
N
P
 
I
E
 
S
R
 
T
V
 
V
V
 
F
N
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
L
A
x
P
G
 
G
V
 
V
R
|
R
Y
 
P
A
 
S
A
 
W
T
 
T
N
 
Q
P
 
F
H
 
P
V
 
E
Y
 
Y
V
 
L
S
 
R
S
 
C
N
 
N
V
 
V
T
 
L
G
 
A
F
 
T
L
 
Q
H
 
R
I
 
L
L
 
M
E
 
E
G
 
A
C
 
C
R
 
V
Q
 
Q
H
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
E
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
V
A
|
A
S
 
S
T
x
S
S
|
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
G
N
 
A
R
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
M
F
 
S
S
 
E
E
 
D
H
 
D
R
 
L
P
 
P
A
 
-
E
 
-
H
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
G
A
 
V
T
 
T
K
|
K
K
 
L
A
 
A
N
 
A
E
 
E
Q
 
R
M
 
L
A
 
A
H
 
L
S
 
A
Y
 
F
A
 
A
H
 
A
L
 
R
Y
 
G
G
 
D
-
 
A
-
 
E
V
 
L
P
 
S
A
 
V
T
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
R
F
|
F
F
 
F
T
|
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
G
G
 
Q
R
|
R
P
 
P
D
 
D
M
|
M
A
x
F
L
 
I
F
 
S
L
x
R
F
 
L
T
 
I
Q
 
R
A
 
A
I
 
T
L
 
L
A
 
R
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
V
R
x
E
V
x
I
F
x
Y
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
T
H
x
Q
K
 
L
R
|
R
S
 
D
F
 
F
T
 
T
Y
 
H
I
 
V
D
 
S
D
 
D
I
 
-
V
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
M
W
 
L
D
 
T
A
 
A
T
 
S
Q
 
V
P
 
R
D
 
D
P
 
R
S
 
G
T
 
S
S
 
A
G
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
V
Y
 
L
N
 
N
I
 
I
G
 
G
N
 
T
E
 
G
Q
 
S
P
 
A
V
 
V
E
 
S
L
 
V
L
 
N
R
 
E
Y
 
V
I
 
V
E
 
S
V
 
M
L
 
T
E
 
A
Q
 
E
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
L
K
 
R
A
 
P
T
 
C
M
 
T
E
 
A
L
 
Y
L
 
G
P
 
S
L
 
A
Q
 
R
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
E
 
S
T
 
T
E
 
T
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
R
S
 
Q
L
 
A
V
 
Q
A
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
G
Y
 
F
R
 
T
P
 
A
K
 
R
V
 
T
S
 
G
V
 
L
E
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
T
F
 
Q
V
 
I
D
 
E
W
 
W
Y
 
T
R
 
R

1r6dA Crystal structure of desiv double mutant (dtdp-glucose 4,6- dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and dau bound (see paper)
29% identity, 95% coverage: 1:331/348 of query aligns to 1:312/322 of 1r6dA

query
sites
1r6dA
M
 
M
K
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
V
 
F
A
 
V
R
 
R
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
G
G
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
G
 
V
L
 
L
D
|
D
N
x
S
L
|
L
N
x
T
D
 
-
Y
 
-
Y
 
-
D
 
-
V
 
Y
G
x
A
L
x
G
K
 
N
Q
 
R
A
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
P
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
Y
 
D
P
 
P
G
 
R
Y
 
L
T
 
R
H
 
F
V
 
V
H
 
H
A
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
R
D
 
D
R
 
A
A
 
G
A
 
L
V
 
L
E
 
A
K
 
R
L
 
E
F
 
L
A
 
-
T
 
-
H
 
R
K
 
G
P
 
V
E
 
D
R
 
A
V
 
I
V
 
V
N
 
H
L
x
F
A
|
A
A
|
A
Q
 
E
A
x
S
G
x
H
V
 
V
R
 
D
Y
 
R
A
 
S
A
 
I
T
 
A
N
 
G
P
 
A
H
 
S
V
 
V
Y
 
F
V
 
T
S
 
E
S
x
T
N
 
N
V
 
V
T
 
Q
G
 
G
F
 
T
L
 
Q
H
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
Q
G
 
C
C
 
A
R
 
V
Q
 
D
H
 
A
G
 
G
V
 
V
Q
 
G
H
 
R
L
 
V
V
 
V
F
 
H
A
x
V
S
|
S
T
|
T
S
x
N
S
x
Q
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
A
 
S
N
 
I
R
 
D
D
 
S
L
 
G
P
 
S
F
 
W
S
 
T
E
 
E
H
 
S
R
 
S
P
 
P
A
 
L
E
 
E
H
 
-
P
 
P
L
 
N
T
 
S
L
 
P
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
T
 
S
K
|
K
K
 
A
A
 
G
N
 
S
E
 
D
Q
 
L
M
 
V
A
 
A
H
 
R
S
 
A
Y
 
Y
A
 
H
H
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
V
 
L
P
 
D
A
 
V
T
 
R
G
 
I
L
 
T
R
 
R
F
 
C
F
 
C
T
x
N
V
x
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
W
 
Y
G
 
Q
R
 
H
P
 
P
D
 
E
M
x
K
A
x
L
L
 
I
F
 
P
L
 
L
F
 
F
T
 
V
Q
 
T
A
 
N
I
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
T
I
 
L
R
x
P
V
 
L
F
x
Y
N
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
A
H
 
N
K
 
V
R
|
R
S
 
E
F
 
W
T
 
V
Y
 
H
I
 
T
D
 
D
D
 
D
I
 
H
V
 
C
E
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
A
R
 
L
A
 
V
L
 
L
D
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
Q
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
-
S
 
A
G
 
G
V
 
G
A
 
R
P
 
A
Y
 
G
R
 
E
L
 
I
Y
 
Y
N
 
H
I
 
I
G
 
G
N
 
G
E
 
G
Q
 
L
P
 
E
V
 
L
E
 
T
L
x
N
L
 
R
R
 
E
Y
 
L
I
 
T
E
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
L
Q
 
D
Y
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
A
K
 
D
-
 
W
A
 
S
T
 
S
M
 
V
E
 
R
L
 
K
L
 
V
P
 
A
L
 
D
Q
x
R
A
 
K
G
 
G
D
x
H
V
 
D
P
 
L
E
 
R
T
x
Y
E
 
S
A
 
L
D
 
D
V
 
G
S
 
G
S
 
K
L
 
I
V
 
E
A
 
R
A
 
E
V
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
V
 
F
E
 
A
E
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
R
F
 
T
V
 
V
D
 
R
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R

Query Sequence

>N515DRAFT_4257 N515DRAFT_4257 UDP-glucuronate 4-epimerase
MKVLVTGTAGFIGSHVARKLLARGDEVIGLDNLNDYYDVGLKQARLARVQAYPGYTHVHA
DLADRAAVEKLFATHKPERVVNLAAQAGVRYAATNPHVYVSSNVTGFLHILEGCRQHGVQ
HLVFASTSSVYGANRDLPFSEHRPAEHPLTLYAATKKANEQMAHSYAHLYGVPATGLRFF
TVYGPWGRPDMALFLFTQAILAGEPIRVFNEGRHKRSFTYIDDIVEGVVRALDTVPGKDP
AWDATQPDPSTSGVAPYRLYNIGNEQPVELLRYIEVLEQYLGRKATMELLPLQAGDVPET
EADVSSLVAAVGYRPKVSVEEGIAAFVDWYRTYYAAAAPAAAVAGVAS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory