SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_0420 FitnessBrowser__Putida:PP_0420 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00903 Aminodeoxychorismate synthase component 2; ADC synthase; ADCS; 4-amino-4-deoxychorismate synthase component 2; Aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase component; EC 2.6.1.85 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
65% identity, 97% coverage: 1:192/197 of query aligns to 1:187/187 of P00903

query
sites
P00903
M
 
M
L
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
W
N
 
N
V
 
L
V
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
G
 
C
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
K
 
L
V
 
V
I
 
K
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
A
M
 
L
T
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
D
I
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
K
P
 
P
E
 
Q
R
 
K
I
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
P
C
 
C
T
 
T
P
 
P
S
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
D
A
 
V
I
 
I
L
 
R
H
 
H
F
 
Y
A
 
A
G
 
G
K
 
R
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
|
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
A
I
 
M
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
A
Q
 
K
V
 
V
M
 
M
H
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
I
Y
 
T
H
 
H
R
 
N
D
 
G
L
 
E
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
R
S
 
G
L
 
L
N
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
V
 
V
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
V
K
 
E
R
 
P
E
 
D
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
A
C
 
C
L
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
A
W
 
W
T
 
S
S
 
-
H
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
E
V
 
T
D
 
R
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
I
R
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
Q
L
 
W
N
 
D
I
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
S
I
 
I
L
 
L
T
 
S
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
H
 
H
E
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
K
 
H
Q
 
R

Q42565 Anthranilate synthase beta subunit 1, chloroplastic; Anthranilate synthase component 2-1; Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase component 2-1; Protein TRYPTOPHAN BIOSYNTHESIS 4; Protein WEAK ETHYLENE INSENSITIVE 7; EC 4.1.3.27 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
50% identity, 96% coverage: 2:191/197 of query aligns to 75:265/276 of Q42565

query
sites
Q42565
L
 
I
L
 
I
M
 
V
I
 
I
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
L
V
 
C
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
C
E
 
H
V
 
F
K
 
E
V
 
V
I
 
Y
R
 
R
N
 
N
D
 
D
E
 
E
M
 
L
T
 
T
I
 
V
A
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
K
A
 
K
L
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
R
R
 
G
I
 
V
V
 
L
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
Q
E
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
I
S
 
S
I
 
L
E
 
Q
A
 
T
I
 
V
L
 
L
H
 
E
F
 
L
A
 
G
G
 
P
K
 
L
L
 
V
P
 
P
I
 
L
L
 
F
G
|
G
V
 
V
C
 
C
L
 
M
G
 
G
H
 
L
Q
 
Q
S
 
C
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
S
R
 
P
-
 
F
Q
 
G
V
 
V
M
 
M
H
 
H
G
|
G
K
 
K
T
 
S
S
 
S
P
 
M
V
 
V
Y
 
H
H
 
Y
R
 
D
D
 
E
L
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
E
G
 
G
V
 
L
F
 
F
A
 
S
S
 
G
L
 
L
N
 
S
N
 
N
P
 
P
L
 
F
T
 
I
V
 
V
T
 
G
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
I
K
 
E
R
 
K
E
 
D
T
 
T
L
 
F
P
 
P
-
 
S
D
 
D
C
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
A
W
 
W
T
 
T
S
 
E
H
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
L
V
 
V
D
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
M
G
 
A
L
 
A
R
 
R
H
 
H
-
 
R
K
 
K
T
 
Y
L
 
K
N
 
H
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
I
 
I
L
 
I
T
 
T
E
 
T
Q
 
E
G
 
G
H
 
K
E
 
T
L
 
I
F
 
V
A
 
R
N
 
N
F
 
F
L
 
I
K
 
K

8hx8A Crystal structure of 4-amino-4-deoxychorismate synthase from streptomyces venezuelae co-crystallized with chorismate (see paper)
47% identity, 95% coverage: 3:189/197 of query aligns to 7:187/673 of 8hx8A

query
sites
8hx8A
L
 
L
M
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
H
N
 
N
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
A
G
 
T
A
 
G
E
 
Q
V
 
P
K
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
V
N
 
P
D
 
N
E
 
D
M
 
A
T
 
D
I
 
W
A
 
S
Q
 
R
I
 
L
E
 
P
A
 
V
L
 
E
N
 
D
P
 
F
E
 
D
R
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
S
P
 
P
S
 
D
-
 
R
-
 
E
-
 
R
E
 
D
A
 
F
G
 
G
V
 
I
S
 
S
I
 
R
E
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
T
H
 
D
F
 
-
A
 
-
G
 
S
K
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
G
I
 
I
G
 
A
Q
 
Q
A
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
T
V
 
V
V
 
G
R
 
L
A
 
A
R
 
P
Q
 
E
V
 
P
M
 
M
H
 
H
G
 
G
K
 
R
T
 
V
S
 
S
P
 
E
V
 
V
Y
 
R
H
 
H
R
 
T
D
 
G
L
 
E
G
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
R
S
 
G
L
 
L
N
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
F
T
 
T
V
 
A
T
 
V
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
A
V
 
A
K
 
T
R
 
-
E
 
-
T
 
D
L
 
L
P
 
P
D
 
D
C
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
P
T
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
S
 
D
H
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
V
V
 
V
D
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
M
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
E
L
 
K
N
 
P
I
 
L
E
 
W
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
I
|
I
L
 
G
T
x
S
E
 
D
Q
 
F
G
 
G
H
 
R
E
 
E
L
 
I
F
 
M
A
 
A
N
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P00900 Anthranilate synthase component 2; AS; ASII; Anthranilate synthase, GATase component; Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase component; EC 4.1.3.27 from Serratia marcescens (see 3 papers)
43% identity, 97% coverage: 2:193/197 of query aligns to 4:186/193 of P00900

query
sites
P00900
L
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
D
 
D
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
Y
 
Q
L
 
L
G
 
R
E
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
H
E
 
Q
V
 
V
K
 
V
V
 
I
I
 
Y
R
 
R
N
 
N
D
 
Q
-
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
E
M
 
V
T
 
I
I
 
I
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
E
 
Q
A
 
H
L
 
M
N
 
E
P
 
Q
E
 
P
R
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
M
I
 
P
E
 
E
A
 
L
I
 
L
L
 
Q
H
 
R
F
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
A
I
 
I
G
 
V
Q
 
E
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
V
 
G
R
 
Q
A
 
A
R
 
G
Q
 
E
V
 
I
M
 
L
H
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
A
S
 
S
P
 
A
V
 
I
Y
 
A
H
 
H
R
 
D
D
 
G
L
 
E
G
 
G
V
 
M
F
 
F
A
 
A
S
 
G
L
 
M
N
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
P
V
 
V
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
-
K
 
-
R
 
G
E
 
S
T
 
N
L
 
I
P
 
P
D
 
A
C
 
D
L
 
L
E
 
T
V
 
V
T
 
N
A
 
A
W
 
R
T
 
S
S
 
G
H
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
E
E
 
M
I
 
V
M
 
M
G
 
A
L
 
V
R
 
R
H
 
D
K
 
D
T
 
R
L
 
R
N
 
R
I
 
V
E
 
C
G
 
G
V
 
F
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
T
Q
 
H
G
 
G
H
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
N
 
R
F
 
L
L
 
L
K
 
E
Q
 
Q
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1i7qB Anthranilate synthase from s. Marcescens (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:193/197 of query aligns to 3:185/192 of 1i7qB

query
sites
1i7qB
L
 
I
L
 
L
M
 
L
I
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
D
 
D
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
V
 
L
V
 
V
Q
 
D
Y
 
Q
L
 
L
G
 
R
E
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
H
E
 
Q
V
 
V
K
 
V
V
 
I
I
 
Y
R
 
R
N
 
N
D
 
Q
-
 
I
-
 
G
-
 
A
E
 
E
M
 
V
T
 
I
I
 
I
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
E
 
Q
A
 
H
L
 
M
N
 
E
P
 
Q
E
 
P
R
 
V
I
 
L
V
 
M
V
 
L
S
 
S
P
|
P
G
|
G
P
 
P
C
x
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
C
S
 
M
I
 
P
E
 
E
A
 
L
I
 
L
L
 
Q
H
 
R
F
 
L
A
 
R
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
|
L
G
 
G
H
 
H
Q
|
Q
S
 
A
I
 
I
G
 
V
Q
 
E
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
V
 
G
R
 
Q
A
 
A
R
 
G
Q
 
E
V
 
I
M
 
L
H
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
A
S
 
S
P
 
A
V
 
I
Y
 
A
H
 
H
R
 
D
D
 
G
L
 
E
G
 
G
V
 
M
F
 
F
A
 
A
S
 
G
L
 
M
N
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
P
V
 
V
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
H
|
H
S
|
S
L
|
L
V
 
V
V
 
-
K
 
-
R
 
G
E
 
S
T
 
N
L
 
I
P
 
P
D
 
A
C
 
D
L
 
L
E
 
T
V
 
V
T
 
N
A
 
A
W
 
R
T
 
F
S
 
G
H
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
E
E
 
M
I
 
V
M
 
M
G
 
A
L
 
V
R
 
R
H
 
D
K
 
D
T
 
R
L
 
R
N
 
R
I
 
V
E
 
C
G
 
G
V
 
F
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
S
I
 
I
L
 
L
T
 
T
E
 
T
Q
 
H
G
 
G
H
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
N
 
R
F
 
L
L
 
L
K
 
E
Q
 
Q
T
 
T

8hx9A Crystal structure of 4-amino-4-deoxychorismate synthase from streptomyces venezuelae with chorismate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 3:189/197 of query aligns to 6:144/632 of 8hx9A

query
sites
8hx9A
L
 
L
M
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
N
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
F
 
F
T
 
T
Y
 
H
N
 
N
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
A
G
 
T
A
 
G
E
 
Q
V
 
P
K
 
P
V
 
V
I
 
V
R
 
V
N
 
P
D
 
N
E
 
D
M
 
A
T
 
D
I
 
W
A
 
S
Q
 
R
I
 
L
E
 
P
A
 
V
L
 
E
N
 
D
P
 
F
E
 
D
R
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
R
P
 
A
C
 
I
T
 
T
P
 
D
S
 
S
E
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
H
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
L
G
 
-
H
 
-
Q
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
M
 
M
H
 
H
G
 
G
K
 
R
T
 
V
S
 
S
P
 
E
V
 
V
Y
 
R
H
 
H
R
 
T
D
 
G
L
 
E
G
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
R
S
 
G
L
 
L
N
 
P
N
 
S
P
 
P
L
 
F
T
 
T
V
 
A
T
 
V
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
S
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
C
 
E
L
 
L
E
 
E
V
 
P
T
 
L
A
 
A
W
 
W
T
 
S
S
 
D
H
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
V
V
 
V
D
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
M
G
 
G
L
 
L
R
 
R
H
 
H
K
 
R
T
 
E
L
 
K
N
 
P
I
 
L
E
 
W
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
I
 
I
L
 
G
T
x
S
E
x
D
Q
 
F
G
 
G
H
 
R
E
 
E
L
 
I
F
 
M
A
 
A
N
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

7yc6A Crystal structure of d110p mutant of gatase subunit of methanocaldococcus jannaschii gmp synthetase
34% identity, 98% coverage: 1:194/197 of query aligns to 1:179/183 of 7yc6A

query
sites
7yc6A
M
 
M
L
 
I
L
 
V
M
 
I
I
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
G
D
 
G
S
 
Q
F
 
Y
T
 
V
Y
 
H
N
 
R
V
 
I
V
 
H
Q
 
R
Y
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
Y
L
 
I
G
 
G
A
 
V
E
 
S
V
 
S
K
 
K
V
 
I
I
 
V
R
 
P
N
 
N
D
 
T
E
 
-
M
 
T
T
 
P
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
I
 
I
E
 
E
A
 
S
L
 
N
N
 
K
P
 
E
E
 
V
R
 
K
-
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
 
G
P
 
P
C
 
-
T
 
D
P
 
I
S
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
K
V
 
N
S
 
C
I
 
I
E
 
D
A
 
I
I
 
A
L
 
L
H
 
N
F
 
-
A
 
-
G
 
A
K
 
K
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
I
G
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
G
R
 
R
A
 
A
-
 
A
-
 
L
R
 
T
Q
 
K
V
 
V
M
 
Y
H
 
V
G
x
D
K
 
K
T
 
E
S
 
N
P
 
P
V
 
L
Y
 
F
H
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
P
R
 
R
D
 
E
L
 
F
G
 
N
V
 
A
F
 
W
A
 
A
S
 
S
L
 
-
N
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
H
 
H
S
 
K
L
 
D
V
x
E
V
 
V
K
 
K
R
 
K
E
 
-
T
 
-
L
 
V
P
 
P
D
 
E
C
 
G
L
 
F
E
 
E
V
 
I
T
 
L
A
 
A
W
 
-
T
 
-
S
 
-
H
|
H
A
 
S
D
 
D
G
 
-
S
 
-
V
 
I
D
x
C
E
 
Q
I
 
V
M
 
E
G
 
A
L
 
M
R
 
K
H
 
H
K
 
K
T
 
T
L
 
K
N
 
P
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
A
L
 
H
T
 
T
E
 
E
Q
 
Y
G
 
G
H
 
N
E
 
E
L
 
I
F
 
L
A
 
K
N
 
N
F
 
F
L
 
C
K
 
K
Q
 
V
T
 
C
G
 
G

Q9LVW7 Carbamoyl phosphate synthase small chain, chloroplastic; Carbamoyl phosphate synthetase glutamine chain; Protein VENOSA 6; EC 6.3.5.5 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 83% coverage: 14:176/197 of query aligns to 254:405/430 of Q9LVW7

query
sites
Q9LVW7
N
 
N
V
 
I
V
 
L
Q
 
R
Y
 
R
L
 
L
G
 
S
E
 
S
L
 
Y
G
 
G
A
 
C
E
 
Q
V
 
I
K
 
T
V
 
V
I
 
V
R
 
P
N
 
S
D
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
T
I
 
F
A
 
P
Q
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
K
-
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
D
R
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
F
S
 
S
P
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
D
P
 
P
S
 
S
E
 
A
A
 
V
G
 
P
V
 
Y
S
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
T
I
 
V
L
 
K
H
 
E
F
 
L
A
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
C
 
C
L
 
M
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
K
V
 
T
V
 
F
R
 
K
A
 
M
R
 
K
Q
 
F
V
 
G
M
 
H
H
 
H
G
 
G
K
 
G
T
 
N
S
 
H
P
 
P
V
 
V
Y
 
R
H
 
N
R
 
N
D
 
R
L
 
T
G
 
G
-
 
Q
V
 
V
F
 
E
A
 
I
S
 
S
L
 
A
N
 
Q
N
 
N
P
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
H
 
H
S
 
N
L
 
Y
V
 
A
V
 
V
K
 
D
R
 
P
E
 
A
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
G
C
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
T
 
T
A
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
-
H
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
L
S
 
N
V
 
D
D
 
G
E
 
S
I
 
C
M
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
S
H
 
F
K
 
P
T
 
E
L
 
M
N
 
N
I
 
V
E
 
M
G
 
S
V
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
A

Sites not aligning to the query:

2ywcA Crystal structure of gmp synthetase from thermus thermophilus in complex with xmp
27% identity, 100% coverage: 1:197/197 of query aligns to 1:188/475 of 2ywcA

query
sites
2ywcA
M
 
M
L
 
V
L
 
L
M
 
V
I
 
L
D
 
D
N
 
F
Y
 
G
D
 
S
S
 
Q
F
 
Y
T
 
T
Y
 
R
N
 
L
V
 
I
V
 
A
Q
 
R
Y
 
R
L
 
L
G
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
R
A
 
A
E
 
F
V
 
S
K
 
L
V
 
I
I
 
L
R
 
P
N
 
G
D
 
D
E
 
-
M
 
A
T
 
P
I
 
L
A
 
E
Q
 
E
I
 
V
E
 
L
A
 
K
L
 
H
N
 
R
P
 
P
E
 
Q
R
 
A
I
 
L
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
|
G
P
 
P
C
x
R
T
 
S
P
 
V
S
 
F
E
 
D
A
 
P
G
 
D
V
 
A
S
 
P
I
 
R
E
 
P
A
 
D
I
 
P
L
 
R
H
 
L
F
 
F
A
 
S
G
 
S
K
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
Q
A
 
E
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
R
V
 
V
V
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
G
Q
 
R
V
 
A
M
 
E
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
A
S
 
L
P
 
L
V
 
T
Y
 
R
H
 
H
R
 
E
D
 
G
L
 
-
G
 
P
V
 
L
F
 
F
A
 
R
S
 
G
L
 
L
N
 
E
N
 
G
P
 
E
L
 
V
T
 
Q
V
 
V
T
 
W
R
 
M
Y
 
S
H
 
H
S
 
Q
L
 
D
V
 
A
V
 
V
K
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
A
P
 
P
D
 
P
C
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
P
A
 
G
W
 
W
T
 
R
S
 
V
H
 
V
A
 
A
D
 
E
G
 
T
S
 
E
V
 
E
D
 
N
E
 
P
I
 
V
M
 
A
G
 
A
L
 
I
R
 
A
H
 
S
K
 
P
T
 
D
L
 
G
N
 
R
I
 
A
E
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
V
I
 
A
L
 
H
T
 
T
E
 
P
Q
 
K
G
 
G
H
 
M
E
 
Q
L
 
I
F
 
L
A
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
L
K
 
E
Q
 
L
T
 
A
G
 
G
G
 
V
R
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ce8B Carbamoyl phosphate synthetase from escherichis coli with complexed with the allosteric ligand imp (see paper)
30% identity, 85% coverage: 9:176/197 of query aligns to 187:355/379 of 1ce8B

query
sites
1ce8B
D
 
D
S
 
E
F
 
L
T
 
P
Y
 
F
N
 
H
V
 
V
V
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
E
 
D
L
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
R
K
 
N
V
 
I
I
 
L
R
 
R
-
 
M
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
R
N
 
G
D
 
C
E
 
R
M
 
L
T
 
T
I
 
I
-
 
V
-
 
P
A
 
A
Q
 
Q
I
 
T
E
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
L
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
D
R
 
G
I
 
I
V
 
F
V
 
L
S
 
S
P
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
D
P
 
P
S
 
A
E
 
P
A
 
C
G
 
D
V
 
Y
S
 
A
I
 
I
E
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
H
 
K
F
 
F
-
 
L
A
 
E
G
 
T
K
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
K
V
 
T
V
 
V
R
 
K
A
 
M
R
 
K
Q
 
F
V
 
G
M
 
H
H
 
H
G
 
G
K
 
G
T
 
N
S
 
H
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
H
 
D
R
 
V
D
 
E
L
 
K
G
 
N
V
 
V
F
 
V
A
 
-
S
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
M
T
 
I
V
 
T
T
 
A
R
 
Q
Y
 
N
H
 
H
S
 
G
L
 
F
V
 
A
V
 
V
K
 
D
R
 
E
E
 
A
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
A
C
 
N
L
 
L
E
 
R
V
 
V
T
 
T
A
 
-
W
 
H
T
 
K
S
 
S
H
 
L
A
 
F
D
 
D
G
 
G
S
 
T
V
 
L
D
 
Q
E
 
G
I
 
I
M
 
H
G
 
R
L
 
T
R
 
D
H
 
K
K
 
P
T
 
A
L
 
F
N
 
S
I
 
F
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
A

Sites not aligning to the query:

P0A6F1 Carbamoyl phosphate synthase small chain; Carbamoyl phosphate synthetase glutamine chain; EC 6.3.5.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 9:176/197 of query aligns to 188:356/382 of P0A6F1

query
sites
P0A6F1
D
 
D
S
 
E
F
 
L
T
 
P
Y
 
F
N
 
H
V
 
V
V
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
E
 
D
L
 
F
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
R
K
 
N
V
 
I
I
 
L
R
 
R
-
 
M
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
R
N
 
G
D
 
C
E
 
R
M
 
L
T
 
T
I
 
I
-
 
V
-
 
P
A
 
A
Q
 
Q
I
 
T
E
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
L
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
D
R
 
G
I
 
I
V
 
F
V
 
L
S
 
S
P
 
N
G
|
G
P
 
P
C
x
G
T
 
D
P
 
P
S
 
A
E
 
P
A
 
C
G
 
D
V
 
Y
S
 
A
I
 
I
E
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
H
 
K
F
 
F
-
 
L
A
 
E
G
 
T
K
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
 
C
L
|
L
G
 
G
H
 
H
Q
|
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
K
V
 
T
V
 
V
R
 
K
A
 
M
R
 
K
Q
 
F
V
 
G
M
 
H
H
 
H
G
 
G
K
 
G
T
 
N
S
 
H
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
H
 
D
R
 
V
D
 
E
L
 
K
G
 
N
V
 
V
F
 
V
A
 
-
S
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
M
T
 
I
V
 
T
T
 
A
R
 
Q
Y
x
N
H
 
H
S
x
G
L
x
F
V
 
A
V
 
V
K
 
D
R
 
E
E
 
A
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
A
C
 
N
L
 
L
E
 
R
V
 
V
T
 
T
A
 
-
W
 
H
T
 
K
S
 
S
H
 
L
A
 
F
D
 
D
G
 
G
S
 
T
V
 
L
D
 
Q
E
 
G
I
 
I
M
 
H
G
 
R
L
 
T
R
 
D
H
 
K
K
 
P
T
 
A
L
 
F
N
 
S
I
 
F
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3uowA Crystal structure of pf10_0123, a gmp synthetase from plasmodium falciparum
28% identity, 78% coverage: 36:189/197 of query aligns to 37:214/517 of 3uowA

query
sites
3uowA
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
K
A
 
D
L
 
M
N
 
N
P
 
I
E
 
K
R
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
|
G
P
 
P
C
 
Y
T
 
S
P
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
H
V
 
L
S
 
K
I
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
L
 
E
H
 
Y
F
 
F
-
 
L
A
 
E
G
 
K
K
 
K
L
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
S
 
E
I
 
I
G
 
A
Q
 
V
A
 
Q
F
 
M
G
 
N
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
K
R
 
K
A
 
S
R
 
K
Q
 
T
V
 
S
M
 
E
H
 
Y
G
 
G
K
 
C
T
 
T
S
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
D
L
 
V
G
 
N
V
 
I
F
 
L
A
 
R
S
 
N
L
 
D
N
 
N
-
 
I
N
 
N
P
 
N
L
 
I
T
 
T
V
 
Y
T
 
C
R
 
R
Y
 
N
H
 
F
S
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
M
-
 
D
L
 
L
V
 
Y
V
 
S
K
 
N
R
 
Y
E
 
K
T
 
L
L
 
M
P
 
N
D
 
C
C
 
C
L
 
L
E
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
V
W
 
W
T
 
M
S
 
N
H
 
H
A
 
N
D
 
D
G
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
Y
-
 
L
-
 
V
S
 
S
V
 
S
D
 
S
E
 
E
-
 
N
-
 
C
-
 
L
I
 
I
M
 
C
G
 
S
L
 
I
R
 
Y
H
 
N
K
 
K
T
 
E
L
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
V
I
 
Y
L
 
E
T
 
S
E
 
L
Q
 
D
G
 
G
H
 
E
E
 
L
L
 
M
F
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5tw7F Crystal structure of a gmp synthase (glutamine-hydrolyzing) from neisseria gonorrhoeae
29% identity, 80% coverage: 33:190/197 of query aligns to 36:188/490 of 5tw7F

query
sites
5tw7F
E
 
D
M
 
M
T
 
P
I
 
L
A
 
D
Q
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
K
R
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
|
G
P
 
P
C
 
N
T
 
S
P
 
V
S
 
Y
E
 
E
A
 
S
G
 
D
V
 
Y
S
 
Q
I
 
A
E
 
D
A
 
T
I
 
G
L
 
I
H
 
F
F
 
D
A
 
L
G
 
G
K
 
-
L
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
S
 
F
I
 
M
G
 
A
Q
 
H
A
 
H
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
R
 
P
A
 
G
R
 
N
Q
 
Q
V
 
R
M
 
E
H
 
F
G
 
G
K
 
-
T
 
Y
S
 
A
P
 
Q
V
 
V
Y
 
K
H
 
T
R
 
I
D
 
D
L
 
S
G
 
G
V
 
L
F
 
T
A
 
R
S
 
G
L
 
I
N
 
Q
N
 
D
-
 
D
-
 
A
P
 
P
L
 
N
T
 
T
V
 
L
T
 
D
R
 
V
Y
 
W
H
 
M
S
 
S
L
 
H
V
 
G
V
 
D
K
 
K
R
 
V
E
 
S
T
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
C
 
G
L
 
F
E
 
A
V
 
V
T
 
I
A
 
G
W
 
D
T
 
T
S
 
P
H
 
S
A
 
C
D
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
P
I
 
I
M
 
A
G
 
M
L
 
M
R
 
E
H
 
N
K
 
T
T
 
E
L
 
K
N
 
Q
I
 
F
E
 
Y
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
V
I
 
T
L
 
H
T
 
T
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
H
 
R
E
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
N
N
 
R
F
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1gpmA Escherichia coli gmp synthetase complexed with amp and pyrophosphate (see paper)
25% identity, 97% coverage: 2:192/197 of query aligns to 8:198/501 of 1gpmA

query
sites
1gpmA
L
 
I
L
 
L
M
 
I
I
 
L
D
 
D
N
 
F
Y
 
G
D
 
S
S
 
Q
F
 
Y
T
 
T
Y
 
Q
N
 
L
V
 
V
V
 
A
Q
 
R
Y
 
R
L
 
V
G
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
V
E
 
Y
V
 
C
K
 
E
V
 
L
I
 
W
R
 
A
N
 
W
D
 
D
E
 
-
M
 
V
T
 
T
I
 
E
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
E
 
R
A
 
D
L
 
F
N
 
N
P
 
P
E
 
S
R
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
|
G
P
 
P
C
 
E
T
 
S
P
 
T
S
 
T
E
 
E
A
 
E
G
 
N
V
 
S
S
 
P
I
 
R
E
 
A
A
 
P
I
 
Q
L
 
Y
H
 
V
F
 
F
A
 
E
G
 
A
K
 
G
L
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
V
C
|
C
L
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
S
 
T
I
 
M
G
 
A
Q
 
M
A
 
Q
F
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
H
V
 
V
V
 
E
R
 
A
A
 
S
R
 
N
Q
 
E
V
 
R
M
 
E
H
 
F
G
 
G
K
 
Y
T
 
A
S
 
Q
P
 
V
V
 
E
Y
 
V
H
 
V
R
 
N
D
 
D
L
 
S
G
 
A
V
 
L
F
 
V
A
 
R
S
 
G
L
 
I
N
 
E
N
 
D
P
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
A
T
 
D
R
 
G
Y
 
K
H
 
P
S
 
L
L
 
L
V
 
D
V
 
V
-
 
W
-
 
M
-
 
S
-
 
H
-
 
G
-
 
D
K
 
K
R
 
V
E
 
T
T
 
A
L
 
I
P
 
P
D
 
S
C
 
D
L
 
F
E
 
I
V
 
T
T
 
V
A
 
A
W
 
S
T
 
T
S
 
E
H
 
S
A
 
C
D
 
P
G
 
F
S
 
A
V
 
I
D
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
M
R
 
A
H
 
N
K
 
E
T
 
E
L
 
K
N
 
R
I
 
F
E
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
V
I
 
T
L
 
H
T
 
T
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G
H
 
M
E
 
R
L
 
M
F
 
L
A
 
E
N
 
R
F
 
F
L
 
V
K
 
R
Q
 
D

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
27% identity, 93% coverage: 11:193/197 of query aligns to 185:356/2225 of P08955

query
sites
P08955
F
 
L
T
 
K
Y
 
Y
N
 
N
V
 
Q
V
 
I
Q
 
R
Y
 
C
L
 
L
G
 
C
E
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
K
 
T
V
 
V
I
 
V
-
 
P
R
 
W
N
 
N
D
 
H
E
 
E
M
 
L
T
 
D
I
 
S
A
 
Q
Q
 
K
I
 
Y
E
 
D
A
 
G
L
 
L
N
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
F
V
 
L
S
 
S
P
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
D
P
 
P
-
 
A
S
 
S
E
 
Y
A
 
P
G
 
G
V
 
V
-
 
V
-
 
A
S
 
T
I
 
L
E
 
N
A
 
R
I
 
V
L
 
L
H
 
S
F
 
E
A
 
P
G
 
N
K
 
P
L
 
R
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
 
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
A
D
 
K
V
 
T
V
 
Y
R
 
K
A
 
M
R
 
R
Q
 
Y
V
 
G
M
 
N
H
 
R
G
 
G
K
 
H
T
 
N
S
 
Q
P
 
P
V
 
C
Y
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
L
F
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
T
N
 
G
N
 
R
P
 
C
L
 
F
T
 
L
V
 
T
T
 
S
R
 
Q
Y
 
N
H
 
H
S
 
G
L
 
F
V
 
A
V
 
V
K
 
D
R
 
A
E
 
D
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
-
C
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
A
A
 
G
W
 
W
T
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
F
S
 
T
H
 
N
A
 
A
D
 
N
G
 
D
S
 
C
V
 
S
D
 
N
E
 
E
I
 
-
M
 
-
G
 
G
L
 
I
R
 
V
H
 
H
K
 
D
T
 
S
L
 
L
N
 
P
I
 
F
E
 
F
G
 
S
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
H
I
 
R
L
 
A
T
 
G
E
 
P
Q
 
S
G
 
D
H
 
M
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
F
N
 
D
F
 
V
L
 
F
K
 
L
Q
 
E
T
 
T

Sites not aligning to the query:

1c3oB Crystal structure of the carbamoyl phosphate synthetase: small subunit mutant c269s with bound glutamine (see paper)
29% identity, 85% coverage: 9:176/197 of query aligns to 187:355/379 of 1c3oB

query
sites
1c3oB
D
 
D
S
 
E
F
 
L
T
 
P
Y
 
F
N
 
H
V
 
V
V
 
V
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
-
G
 
-
E
 
D
L
 
F
G
 
G
A
 
A
E
x
K
V
 
R
K
 
N
V
 
I
I
 
L
R
 
R
-
 
M
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
R
N
 
G
D
 
C
E
 
R
M
 
L
T
 
T
I
 
I
-
 
V
-
 
P
A
 
A
Q
 
Q
I
 
T
E
 
S
A
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
L
 
M
N
 
N
P
 
P
E
 
D
R
 
G
I
 
I
V
 
F
V
 
L
S
 
S
P
x
N
G
|
G
P
 
P
C
x
G
T
 
D
P
 
P
S
 
A
E
 
P
A
 
C
G
 
D
V
 
Y
S
 
A
I
 
I
E
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
Q
H
 
K
F
 
F
-
 
L
A
 
E
G
 
T
K
 
D
L
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
x
S
L
|
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
S
G
 
G
G
 
A
D
 
K
V
 
T
V
 
V
R
 
K
A
 
M
R
 
K
Q
 
F
V
 
G
M
 
H
H
 
H
G
 
G
K
 
G
T
 
N
S
 
H
P
 
P
V
 
V
Y
 
K
H
 
D
R
 
V
D
 
E
L
 
K
G
 
N
V
 
V
F
 
V
A
 
-
S
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
M
T
 
I
V
 
T
T
 
A
R
 
Q
Y
x
N
H
|
H
S
x
G
L
x
F
V
 
A
V
 
V
K
 
D
R
 
E
E
 
A
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
A
C
 
N
L
 
L
E
 
R
V
 
V
T
 
T
A
 
-
W
 
H
T
 
K
S
 
S
H
 
L
A
 
F
D
 
D
G
 
G
S
 
T
V
 
L
D
 
Q
E
 
G
I
 
I
M
 
H
G
 
R
L
 
T
R
 
D
H
 
K
K
 
P
T
 
A
L
 
F
N
 
S
I
 
F
E
 
Q
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
A

Sites not aligning to the query:

Q8IJR9 GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]; PfGMPS; Glutamine amidotransferase; Guanosine monophosphate synthetase; EC 6.3.5.2 from Plasmodium falciparum (isolate 3D7) (see 3 papers)
27% identity, 78% coverage: 36:189/197 of query aligns to 42:224/555 of Q8IJR9

query
sites
Q8IJR9
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
K
A
 
D
L
 
M
N
 
N
P
 
I
E
 
K
R
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
 
G
P
 
P
C
 
Y
T
 
S
P
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
H
V
 
L
S
 
K
I
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
L
 
E
H
 
Y
F
 
F
-
 
L
A
 
E
G
 
K
K
 
K
L
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
|
C
L
 
Y
G
 
G
H
 
M
Q
|
Q
S
 
E
I
 
I
G
 
A
Q
 
V
A
 
Q
F
 
M
G
 
N
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
K
R
 
K
A
 
S
R
 
K
Q
 
T
V
 
S
M
 
E
H
 
Y
G
 
G
K
x
C
T
 
T
S
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
D
L
 
V
G
 
N
V
 
I
F
 
L
A
 
R
S
 
N
L
 
D
N
 
N
-
 
I
N
 
N
P
 
N
L
 
I
T
 
T
V
 
Y
T
 
C
R
 
R
-
 
N
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
S
-
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
M
-
 
D
-
 
L
Y
 
Y
H
 
S
S
 
N
L
 
Y
V
 
K
V
 
L
K
 
M
R
 
N
E
 
E
T
 
T
L
 
C
P
 
-
D
 
-
C
 
C
L
 
L
E
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
x
K
-
 
S
-
 
D
-
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
V
W
|
W
T
 
M
S
x
N
H
 
H
A
 
N
D
|
D
G
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
Y
-
 
L
-
 
V
S
 
S
V
 
S
D
 
S
E
 
E
-
 
N
-
 
C
-
 
L
I
 
I
M
 
C
G
 
S
L
 
I
R
 
Y
H
 
N
K
 
K
T
 
E
L
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
 
E
S
 
V
I
x
Y
L
x
E
T
 
S
E
 
L
Q
 
D
G
 
G
H
 
E
E
 
L
L
 
M
F
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

4wioA Crystal structure of the c89a gmp synthetase inactive mutant from plasmodium falciparum in complex with glutamine (see paper)
27% identity, 78% coverage: 36:189/197 of query aligns to 36:213/525 of 4wioA

query
sites
4wioA
I
 
L
A
 
K
Q
 
D
I
 
I
E
 
K
A
 
D
L
 
M
N
 
N
P
 
I
E
 
K
R
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
P
 
G
G
|
G
P
 
P
C
 
Y
T
 
S
P
 
V
S
 
T
E
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
H
V
 
L
S
 
K
I
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
F
L
 
E
H
 
Y
F
 
F
-
 
L
A
 
E
G
 
K
K
 
K
L
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
x
A
L
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
|
Q
S
 
E
I
 
I
G
 
A
Q
 
V
A
 
Q
F
 
M
G
 
N
G
 
G
D
 
E
V
 
V
V
 
K
R
 
K
A
 
S
R
 
K
Q
 
T
V
 
S
M
 
E
H
 
Y
G
 
G
K
 
C
T
 
T
S
 
-
P
 
-
V
 
-
Y
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
D
L
 
V
G
 
N
V
 
I
F
 
L
A
 
R
S
 
N
L
 
D
N
 
N
-
 
I
N
 
N
P
 
N
L
 
I
T
 
T
V
 
Y
T
 
C
R
 
R
Y
 
N
H
 
F
S
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
M
-
 
D
L
 
L
V
 
Y
V
 
S
K
 
N
R
 
Y
E
 
K
T
 
L
L
 
M
P
 
N
D
 
E
C
 
C
L
 
L
E
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
I
V
 
T
T
 
T
A
 
V
W
 
W
T
 
M
S
x
N
H
|
H
A
x
N
D
|
D
G
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
F
-
 
Y
-
 
L
-
 
V
S
 
S
V
 
S
D
 
S
E
 
E
-
 
N
-
 
C
-
 
L
I
 
I
M
 
C
G
 
S
L
 
I
R
 
Y
H
 
N
K
 
K
T
 
E
L
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
Y
H
|
H
P
 
P
E
|
E
S
 
V
I
 
Y
L
 
E
T
 
S
E
 
L
Q
 
D
G
 
G
H
 
E
E
 
L
L
 
M
F
 
F
A
 
Y
N
 
N
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
25% identity, 93% coverage: 11:193/197 of query aligns to 185:356/2225 of P27708

query
sites
P27708
F
 
L
T
 
K
Y
 
Y
N
 
N
V
 
Q
V
 
I
Q
 
R
Y
 
C
L
 
L
G
 
C
E
 
Q
L
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
K
 
T
V
 
V
I
 
V
R
 
P
N
 
W
D
 
D
E
 
H
M
 
A
T
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
I
 
L
E
 
D
A
 
S
L
 
Q
N
 
E
P
 
Y
E
 
E
R
 
G
I
 
L
V
 
F
V
 
L
S
 
S
P
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
D
P
 
P
S
 
A
E
 
S
A
 
Y
G
 
P
V
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
S
S
 
T
I
 
L
E
 
S
A
 
R
I
 
V
L
 
L
H
 
S
F
 
E
A
 
P
G
 
N
K
 
P
L
 
R
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
 
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
L
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
A
D
 
K
V
 
T
V
 
Y
R
 
K
A
 
M
R
 
R
Q
 
Y
V
 
G
M
 
N
H
 
R
G
 
G
K
 
H
T
 
N
S
 
Q
P
 
P
V
 
C
Y
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
L
F
 
L
A
 
V
S
 
G
L
 
S
N
 
G
N
 
R
P
 
C
L
 
F
T
 
L
V
 
T
T
 
S
R
 
Q
Y
 
N
H
 
H
S
 
G
L
 
F
V
 
A
V
 
V
K
 
E
R
 
T
E
 
D
T
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
A
C
 
D
L
 
W
E
 
-
V
 
A
T
 
P
A
 
L
W
 
F
T
 
T
S
 
N
H
 
A
A
 
N
D
 
D
G
 
G
S
 
S
V
 
N
D
 
E
E
 
-
I
 
-
M
 
-
G
 
G
L
 
I
R
 
V
H
 
H
K
 
N
T
 
S
L
 
L
N
 
P
I
 
F
E
 
F
G
 
S
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
H
I
 
Q
L
 
A
T
 
G
E
 
P
Q
 
S
G
 
D
H
 
M
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
F
N
 
D
F
 
I
L
 
F
K
 
L
Q
 
E
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
27% identity, 79% coverage: 37:191/197 of query aligns to 225:372/2224 of P05990

query
sites
P05990
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
E
 
E
A
 
D
L
 
E
N
 
Q
P
 
F
E
 
D
R
 
A
I
 
L
V
 
F
V
 
L
S
 
S
P
 
N
G
 
G
P
 
P
C
 
G
T
 
N
P
 
P
S
 
E
E
 
S
A
 
C
G
 
D
V
 
Q
S
 
I
I
 
V
E
 
Q
A
 
Q
I
 
V
L
 
R
H
 
K
F
 
V
-
 
I
-
 
E
A
 
E
G
 
G
K
 
Q
L
 
K
P
 
P
I
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
 
C
L
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
S
 
L
I
 
L
G
 
A
Q
 
K
A
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
C
D
 
S
V
 
T
V
 
Y
R
 
K
A
 
M
R
 
K
Q
 
Y
V
 
G
M
 
N
H
 
R
G
 
G
K
 
H
T
 
N
S
 
L
P
 
P
V
 
C
Y
 
L
H
 
H
R
 
R
D
 
A
L
 
T
G
 
G
V
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
N
 
-
N
 
R
P
 
C
L
 
L
T
 
M
V
 
T
T
 
S
R
 
Q
Y
 
N
H
 
H
S
 
G
L
 
Y
V
 
A
V
 
V
K
 
D
R
 
L
E
 
E
T
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
C
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
G
W
 
W
T
 
S
S
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
V
H
 
N
A
 
A
D
 
N
G
 
D
S
 
G
V
 
T
D
 
N
E
 
E
I
 
-
M
 
-
G
 
G
L
 
I
R
 
V
H
 
H
K
 
A
T
 
S
L
 
K
N
 
P
I
 
Y
E
 
F
G
 
S
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
H
I
 
H
L
 
A
T
 
G
E
 
P
Q
 
Q
G
 
D
H
 
T
E
 
E
-
 
F
L
 
L
F
 
F
A
 
D
N
 
V
F
 
F
L
 
M
K
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_0420 FitnessBrowser__Putida:PP_0420
MLLMIDNYDSFTYNVVQYLGELGAEVKVIRNDEMTIAQIEALNPERIVVSPGPCTPSEAG
VSIEAILHFAGKLPILGVCLGHQSIGQAFGGDVVRARQVMHGKTSPVYHRDLGVFASLNN
PLTVTRYHSLVVKRETLPDCLEVTAWTSHADGSVDEIMGLRHKTLNIEGVQFHPESILTE
QGHELFANFLKQTGGRR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory