SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_0762 PP_0762 Glycerate dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
33% identity, 86% coverage: 41:315/321 of query aligns to 37:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
E
Q
 
K
V
 
L
A
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
V
Q
 
K
G
 
D
A
 
V
V
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
S
 
T
N
x
M
-
x
L
K
 
S
V
 
E
M
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
A
 
E
T
 
V
L
 
F
A
 
E
A
 
N
N
 
A
P
 
P
Q
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
V
L
 
A
V
 
N
A
x
Y
A
|
A
T
x
V
G
|
G
T
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
R
 
T
A
 
R
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
C
 
T
N
 
N
C
 
T
Q
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
T
 
T
P
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
H
T
 
A
L
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
A
T
 
R
R
 
H
L
 
V
C
 
V
D
 
K
Y
 
G
N
 
D
Q
 
K
A
 
F
V
 
V
A
 
R
D
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
A
 
K
-
 
R
K
 
K
A
 
G
S
 
I
Q
 
A
F
 
W
C
 
H
L
 
P
L
 
K
D
 
W
F
 
F
P
 
L
I
 
G
V
 
Y
E
 
E
L
 
L
E
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
V
G
 
G
H
x
F
G
|
G
E
x
R
L
x
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
I
L
 
L
-
 
Y
-
 
Y
S
|
S
G
x
R
Q
 
T
I
 
R
P
 
K
G
 
S
R
 
Q
P
 
A
E
 
E
R
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
G
A
 
A
D
 
E
R
 
Y
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
L
P
 
K
Q
 
E
V
 
S
D
 
D
A
 
F
L
 
V
T
 
I
L
 
L
H
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
E
 
K
H
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
M
 
M
L
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
L
 
M
K
 
K
P
 
P
N
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
D
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
V
 
Y
N
 
N
G
 
E
N
 
E
P
 
L
L
 
F
L
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
S
I
 
L
P
 
D
R
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
I
A
x
G
W
 
S
G
 
A
A
 
T
V
 
F
E
 
E
S
 
A
R
 
R
Q
 
E
R
 
A
I
 
M
V
 
A
G
 
E
Q
 
L
L
 
V
S
 
A
E
 
R
N
 
N
A
 
L
Q
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
E

P87228 Putative D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
31% identity, 89% coverage: 22:306/321 of query aligns to 69:362/466 of P87228

query
sites
P87228
L
 
L
S
 
S
P
 
N
L
 
L
K
 
K
Q
 
D
Q
 
E
F
 
G
D
 
Y
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
L
 
F
F
 
L
A
 
K
A
 
T
T
 
S
R
 
M
P
x
S
E
 
E
Q
 
D
-
 
D
V
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
I
Q
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
H
A
 
A
V
 
I
-
 
G
V
 
I
S
 
R
N
 
S
K
 
K
V
 
T
M
 
R
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
E
A
 
A
N
 
A
P
 
D
Q
 
S
L
 
L
K
 
I
L
 
V
I
 
I
L
 
G
V
 
C
A
 
F
A
 
C
T
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
D
A
 
F
A
 
A
R
 
A
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
F
N
 
N
C
 
S
Q
 
P
G
 
Y
Y
 
A
G
 
N
T
 
S
P
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
T
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
Y
L
 
I
L
 
I
A
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
R
R
 
Q
L
 
V
C
 
G
D
 
D
Y
 
R
N
 
S
Q
 
L
A
 
E
V
 
L
A
 
H
D
 
R
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
A
 
N
K
 
K
A
 
V
S
 
S
Q
 
S
F
 
G
C
 
C
L
 
W
L
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
E
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
L
 
I
G
 
G
G
 
S
A
 
Q
V
 
L
A
 
S
R
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
M
G
 
G
M
 
L
R
 
H
V
 
V
L
 
V
S
 
Y
G
 
Y
Q
 
D
I
 
I
P
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
M
-
 
P
-
 
L
G
 
G
R
 
S
P
 
A
E
 
K
R
 
Q
A
 
L
D
 
S
R
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
L
L
 
L
P
 
H
Q
 
R
V
 
A
D
 
D
A
 
F
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
A
N
x
S
E
 
P
H
 
E
T
 
T
R
 
K
H
 
N
M
 
M
L
 
I
G
 
S
A
 
S
R
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
L
 
A
L
 
M
K
 
K
P
 
E
N
 
G
A
 
S
L
 
Y
V
 
L
V
 
I
N
 
N
T
 
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
S
R
 
K
G
 
S
G
 
G
H
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
P
V
 
S
E
 
E
P
 
P
P
 
A
V
 
G
N
 
N
G
 
G
N
 
K
P
 
D
L
 
K
L
 
F
E
 
V
P
 
D
G
 
S
I
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
W
-
 
T
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
H
-
 
C
P
 
K
R
 
N
L
 
I
I
 
I
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
H
S
 
I
A
 
G
W
 
G
G
 
S
A
 
T
V
 
E
E
 
E
S
 
A
R
 
Q
Q
 
Y
R
 
N
I
 
I
V
 
G
G
 
I
Q
 
E
L
 
V
S
 
S
E
 
E

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
32% identity, 82% coverage: 53:314/321 of query aligns to 46:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
V
 
I
V
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
K
V
 
P
M
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
R
A
 
R
T
 
V
L
 
I
A
 
E
A
 
S
N
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
V
I
 
I
L
 
A
V
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
L
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
E
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
E
V
 
V
C
 
V
N
 
N
C
 
A
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
S
P
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
F
A
 
S
L
 
V
A
 
A
T
 
R
R
 
K
L
 
I
C
 
A
D
 
F
Y
 
A
N
 
D
Q
 
R
A
 
K
V
 
M
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
K
A
 
K
S
 
E
Q
 
A
F
 
M
C
 
G
L
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
x
F
G
|
G
E
x
R
L
x
I
G
 
G
G
 
Y
A
 
Q
V
 
V
A
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
N
V
 
I
L
 
L
S
 
L
G
x
Y
Q
x
D
I
x
P
P
 
Y
G
 
P
R
 
N
P
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
K
R
 
E
L
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
V
P
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
L
L
 
L
P
 
K
Q
 
E
V
 
S
D
 
D
A
 
V
L
 
V
T
 
T
L
 
I
H
 
H
C
x
V
P
|
P
L
 
L
N
 
V
E
 
E
H
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
K
L
 
L
L
 
M
K
 
K
P
 
K
N
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
L
V
 
P
N
 
K
G
 
D
N
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
E
 
K
P
 
-
G
 
-
I
 
F
P
 
D
R
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
I
A
x
G
W
 
A
G
 
S
A
 
T
V
 
V
E
 
E
S
 
A
R
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
A
V
 
G
G
 
V
Q
 
E
L
 
V
S
 
A
E
 
E
N
 
K
A
 
V
Q
 
V
A
 
K
F
 
I
F
 
L
A
 
K
G
 
G

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 89% coverage: 30:315/321 of query aligns to 21:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
D
 
D
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
L
 
V
F
 
R
A
 
W
A
 
V
T
 
D
R
 
G
P
 
P
E
 
D
Q
 
R
V
 
-
A
 
-
E
 
D
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
G
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
T
M
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
I
 
V
L
 
A
V
x
R
A
 
A
A
 
G
T
x
V
G
 
G
T
 
L
N
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
N
C
 
A
Q
 
P
G
 
T
Y
 
S
G
x
N
T
 
I
P
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
S
T
 
R
R
 
Q
L
 
I
C
 
P
D
 
A
Y
 
A
N
 
D
Q
 
A
A
 
S
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
R
A
 
S
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
C
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
F
P
 
S
I
 
G
V
 
T
E
 
E
L
 
I
E
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
L
G
 
G
E
 
R
L
 
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
R
A
 
I
E
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
R
 
Y
V
 
V
L
 
V
S
 
A
G
 
Y
Q
 
D
I
 
P
P
 
Y
G
 
V
R
 
S
P
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
D
 
E
R
 
L
L
 
L
P
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
A
Q
 
R
V
 
A
D
 
D
A
 
F
L
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
E
 
P
H
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
M
 
L
L
 
I
G
 
D
A
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
L
 
T
K
 
K
P
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
V
 
T
N
 
D
G
 
-
N
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
E
 
E
P
 
-
G
 
-
I
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
L
A
 
G
W
x
A
G
 
S
A
 
T
V
 
A
E
 
E
S
 
A
R
x
Q
Q
 
D
R
 
R
I
 
A
V
 
G
G
 
T
Q
 
D
L
 
V
S
 
A
E
 
E
N
 
S
A
 
V
Q
 
R
A
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
E

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 89% coverage: 30:315/321 of query aligns to 20:304/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
D
 
D
Q
 
Q
F
 
V
E
 
E
L
 
V
F
 
R
A
 
W
A
 
V
T
 
D
R
 
G
P
 
P
E
 
D
Q
 
R
V
 
-
A
 
-
E
 
D
R
 
K
L
 
L
Q
 
L
G
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
T
M
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
A
P
 
P
Q
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
I
 
V
L
 
A
V
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
L
N
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
N
C
 
A
Q
 
P
G
 
T
Y
 
S
G
x
N
T
 
I
P
 
H
S
 
S
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
T
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
S
T
 
R
R
 
Q
L
 
I
C
 
P
D
 
A
Y
 
A
N
 
D
Q
 
A
A
 
S
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
A
 
K
K
 
R
A
 
S
S
 
S
Q
 
-
F
 
-
C
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
F
P
 
S
I
 
G
V
 
T
E
 
E
L
 
I
E
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
L
G
 
G
E
 
R
L
 
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
L
 
R
A
 
I
E
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
R
 
Y
V
 
V
L
 
V
S
 
A
G
 
Y
Q
 
D
I
 
P
P
 
Y
G
 
V
R
 
S
P
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
D
 
E
R
 
L
L
 
L
P
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
A
Q
 
R
V
 
A
D
 
D
A
 
F
L
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
E
 
P
H
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
M
 
L
L
 
I
G
 
D
A
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
K
L
 
T
K
 
K
P
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
V
 
T
N
 
D
G
 
-
N
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
E
 
E
P
 
-
G
 
-
I
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
L
A
 
G
W
 
A
G
 
S
A
 
T
V
 
A
E
 
E
S
 
A
R
 
Q
Q
 
D
R
 
R
I
 
A
V
 
G
G
 
T
Q
 
D
L
 
V
S
 
A
E
 
E
N
 
S
A
 
V
Q
 
R
A
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

6p2iA Acyclic imino acid reductase (bsp5) in complex with NADPH and d-arg (see paper)
30% identity, 92% coverage: 27:320/321 of query aligns to 21:306/307 of 6p2iA

query
sites
6p2iA
Q
 
N
Q
 
E
F
 
Y
D
 
G
Q
 
D
F
 
F
E
 
E
L
 
V
F
 
F
A
 
Y
A
 
D
T
 
F
-
 
P
R
 
N
P
 
E
E
 
E
Q
 
E
V
 
A
A
 
I
E
 
N
R
 
R
L
 
L
Q
 
S
G
 
S
A
 
T
V
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
S
 
V
N
x
E
K
 
W
V
 
T
M
 
S
L
 
I
D
 
T
A
 
K
A
 
E
T
 
M
L
 
I
A
 
E
A
 
K
N
 
I
P
 
S
Q
 
R
L
 
L
K
 
K
L
 
Y
I
 
L
L
 
I
V
 
T
A
 
I
A
x
T
T
|
T
G
x
S
T
 
Y
N
 
D
N
 
Y
V
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
N
A
 
S
A
 
L
R
 
K
A
 
D
Q
 
N
G
 
E
I
 
I
T
 
M
V
 
V
C
 
S
N
 
N
C
 
C
Q
 
P
G
 
Q
Y
|
Y
G
x
S
T
 
K
P
 
Q
S
 
A
V
|
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
T
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
A
L
 
V
A
 
N
T
 
R
R
 
K
L
 
I
C
 
L
D
 
Q
Y
 
-
N
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
A
D
 
D
G
 
E
Q
 
T
W
 
C
A
 
R
K
 
K
A
 
G
S
 
L
Q
 
S
F
 
H
C
 
I
L
 
Y
L
 
P
D
 
P
F
 
F
P
 
L
I
 
C
V
 
S
E
 
E
L
 
I
E
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
|
G
H
x
I
G
|
G
E
x
Q
L
x
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
A
F
 
F
G
 
Q
M
 
M
R
 
K
V
 
V
L
 
I
S
 
G
G
 
L
Q
x
N
I
x
K
P
x
S
G
 
K
R
|
R
P
 
N
E
 
V
R
 
K
A
 
G
-
 
I
D
 
Q
R
 
Q
L
 
V
P
 
D
L
 
I
D
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
M
P
 
K
Q
 
K
V
 
S
D
 
D
A
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
I
P
|
P
L
 
R
N
 
N
E
 
A
H
 
D
T
|
T
R
 
E
H
 
I
M
 
I
L
 
L
G
 
T
A
 
E
R
 
K
E
 
L
L
 
L
A
 
S
L
 
L
L
 
M
K
 
K
P
 
P
N
 
D
A
 
A
L
 
V
V
 
L
V
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
C
R
 
R
G
 
G
G
 
N
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
Y
D
 
S
A
 
V
L
 
L
R
 
K
G
 
Q
G
 
N
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
L
D
 
D
V
 
D
L
 
L
S
 
T
V
 
Y
E
 
-
P
 
-
P
 
-
V
 
Y
N
 
K
G
 
D
N
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
I
E
 
-
P
 
-
G
 
G
I
 
L
P
 
N
R
 
N
L
 
V
I
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
G
S
 
S
A
 
A
W
|
W
G
 
Y
A
 
S
V
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
R
Q
 
E
R
 
K
I
 
N
V
 
M
G
 
Y
Q
 
E
L
 
L
S
 
I
E
 
E
N
 
N
A
 
I
Q
 
E
A
 
S
F
 
Y
F
 
L
A
 
A
G
 
Q
Q
 
K
P
 
P
R
 
V
R
 
N
V
 
V
V
 
I

1hl3A Ctbp/bars in ternary complex with NAD(h) and pidlskk peptide (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 48:304/331 of 1hl3A

query
sites
1hl3A
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
T
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
H
 
L
G
|
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
Y
S
x
D
G
 
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
 
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

1hkuA Ctbp/bars: a dual-function protein involved in transcription corepression and golgi membrane fission (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 48:304/331 of 1hkuA

query
sites
1hkuA
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
x
S
G
 
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
T
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
|
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
S
x
D
G
x
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
 
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

4lceA Ctbp1 in complex with substrate mtob (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 47:303/327 of 4lceA

query
sites
4lceA
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
x
R
A
 
I
A
x
G
T
x
S
G
|
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
A
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
|
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
S
x
D
G
x
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
 
G
L
 
L
N
|
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

4u6sA Ctbp1 in complex with substrate phenylpyruvate (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 48:304/328 of 4u6sA

query
sites
4u6sA
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
x
Y
N
x
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
x
I
A
x
G
T
x
S
G
|
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
A
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
|
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
S
x
D
G
x
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
x
M
R
 
R
Q
 
E

4u6qA Ctbp1 bound to inhibitor 2-(hydroxyimino)-3-phenylpropanoic acid (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 48:304/328 of 4u6qA

query
sites
4u6qA
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
x
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
x
I
A
x
G
T
x
S
G
|
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
A
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
 
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
S
x
D
G
x
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
x
M
R
 
R
Q
 
E

6cdfA Human ctbp1 (28-378) (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 49:305/333 of 6cdfA

query
sites
6cdfA
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
 
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
A
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
 
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
S
x
D
G
x
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
 
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

6v89A Human ctbp1 (28-375) in complex with amp (see paper)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 48:304/332 of 6v89A

query
sites
6v89A
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
 
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
A
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
|
G
E
x
R
L
 
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
x
Y
S
x
D
G
x
P
Q
x
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
 
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
 
H
S
 
A
A
 
A
W
 
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

8atiA Human ctbp2(31-364) in complex with rai2 peptide(315-322)
34% identity, 80% coverage: 52:307/321 of query aligns to 47:320/330 of 8atiA

query
sites
8atiA
A
 
A
V
 
M
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
V
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
x
S
G
 
G
T
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
I
Q
 
P
G
 
S
Y
 
A
G
 
A
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
N
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
I
G
|
G
H
 
F
G
|
G
E
x
R
L
x
T
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
F
G
 
Y
Q
x
D
I
 
-
P
|
P
G
x
Y
R
 
L
P
 
Q
E
 
D
R
 
G
A
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
L
 
Y
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
Q
 
Q
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
N
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
 
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
I
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
A
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
T
A
|
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
A
I
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
S
 
P
E
 
E
N
 
S

Sites not aligning to the query:

4lcjA Ctbp2 in complex with substrate mtob (see paper)
34% identity, 80% coverage: 52:307/321 of query aligns to 47:320/330 of 4lcjA

query
sites
4lcjA
A
 
A
V
 
M
V
 
M
S
x
Y
N
x
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
V
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
x
I
A
x
G
T
x
S
G
|
G
T
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
I
Q
 
P
G
 
S
Y
 
A
G
x
A
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
N
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
x
I
G
|
G
H
 
F
G
|
G
E
x
R
L
x
T
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
F
G
 
Y
Q
x
D
I
 
-
P
 
P
G
x
Y
R
 
L
P
 
Q
E
 
D
R
 
G
A
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
L
 
Y
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
Q
 
Q
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
N
L
 
L
N
|
N
E
 
E
H
 
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
I
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
A
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
T
A
 
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
A
I
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
S
 
P
E
 
E
N
 
S

P56545 C-terminal-binding protein 2; CtBP2 from Homo sapiens (Human)
33% identity, 84% coverage: 52:320/321 of query aligns to 79:371/445 of P56545

query
sites
P56545
A
 
A
V
 
M
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
V
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
Y
N
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
E
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
I
Q
 
P
G
 
S
Y
 
A
G
 
A
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
I
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
N
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
Y
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
x
I
G
|
G
H
x
F
G
|
G
E
x
R
L
x
T
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
V
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
S
V
 
V
L
 
I
S
 
F
G
 
Y
Q
x
D
I
 
-
P
 
P
G
 
Y
R
 
L
P
 
Q
E
 
D
R
 
G
A
 
I
D
 
E
R
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
L
 
Y
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
Y
Q
 
Q
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
x
N
L
|
L
N
|
N
E
|
E
H
|
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
I
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
x
A
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
A
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
x
T
A
|
A
W
|
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
M
-
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
E
S
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
A
I
 
I
V
 
T
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
S
 
P
E
 
E
-
 
S
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
C
-
 
V
N
 
N
A
 
K
Q
 
E
A
 
F
F
 
F
F
 
V
A
 
T
G
 
S
Q
 
A
P
 
P
R
 
W
R
 
S
V
 
V
V
 
I

Q9Z2F5 C-terminal-binding protein 1; CtBP1; 50 kDa BFA-dependent ADP-ribosylation substrate; BARS-50; C-terminal-binding protein 3; CtBP3; EC 1.1.1.- from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
36% identity, 77% coverage: 52:298/321 of query aligns to 62:318/430 of Q9Z2F5

query
sites
Q9Z2F5
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
x
S
G
 
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
 
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
 
N
L
 
L
A
 
Y
T
 
R
R
 
R
L
 
T
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
 
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
 
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
x
I
G
|
G
H
x
L
G
|
G
E
x
R
L
x
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
Y
S
x
D
G
 
P
Q
 
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
x
G
L
|
L
N
|
N
E
|
E
H
|
H
T
x
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
 
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
 
H
S
 
A
A
 
A
W
 
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 81% coverage: 41:300/321 of query aligns to 41:300/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
E
 
E
Q
 
Q
V
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
S
L
 
I
Q
 
R
G
 
D
A
 
A
V
 
H
A
 
F
V
 
I
-
 
G
V
 
L
S
 
R
N
 
S
K
 
R
V
 
T
M
 
H
L
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
N
A
 
A
N
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
K
 
V
L
 
A
I
 
I
L
 
G
V
 
A
A
 
F
A
 
A
T
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
Q
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
A
 
K
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
P
V
 
V
C
 
F
N
 
N
C
 
A
Q
 
P
G
 
F
Y
 
S
G
x
N
T
 
T
P
 
R
S
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
T
 
V
L
 
I
A
 
G
L
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
L
A
 
L
T
 
R
R
 
G
L
 
V
C
 
P
D
 
E
Y
 
A
N
 
N
Q
 
A
A
 
K
V
 
A
A
 
H
D
 
R
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
A
 
N
K
 
K
A
 
L
S
 
A
Q
 
A
F
 
G
C
 
S
L
 
F
L
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
E
L
 
A
E
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
 
G
H
 
Y
G
|
G
E
x
H
L
x
I
G
 
G
G
 
T
A
 
Q
V
 
L
A
 
G
R
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
Y
V
 
V
L
 
Y
S
 
F
G
x
Y
Q
x
D
I
|
I
P
 
E
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
N
R
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
L
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
Q
-
 
H
-
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
N
Q
 
M
V
 
S
D
 
D
A
 
V
L
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
N
 
N
E
 
P
H
x
S
T
 
T
R
 
K
H
 
N
M
 
M
L
 
M
G
 
G
A
 
A
R
 
K
E
 
E
L
 
I
A
 
S
L
 
L
L
 
M
K
 
K
P
 
P
N
 
G
A
 
S
L
 
L
V
 
L
V
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
I
Q
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
A
G
 
S
G
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
I
D
|
D
V
 
V
L
 
F
S
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
A
V
 
T
N
 
N
G
 
S
N
 
D
P
 
P
L
 
F
L
 
T
E
 
S
P
 
P
-
 
L
-
 
A
G
 
E
I
 
F
P
 
D
R
 
N
L
 
V
I
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
I
A
x
G
W
 
G
G
 
S
A
 
T
V
 
Q
E
 
E
S
 
A
R
 
Q
Q
 
E
R
 
N
I
 
I

Q13363 C-terminal-binding protein 1; CtBP1; EC 1.1.1.- from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
33% identity, 86% coverage: 24:298/321 of query aligns to 43:329/440 of Q13363

query
sites
Q13363
P
 
P
L
 
I
K
 
L
Q
 
K
Q
 
D
F
 
V
D
 
A
Q
 
T
F
 
V
E
x
A
L
 
F
F
 
C
A
 
D
A
 
A
T
 
Q
R
 
S
P
 
T
E
 
Q
Q
 
E
V
 
I
A
 
H
E
 
E
R
 
K
L
x
V
-
 
L
-
 
N
Q
 
E
G
 
A
A
 
V
V
 
G
A
 
A
V
 
L
V
 
M
S
 
Y
N
 
H
K
 
T
V
 
I
M
 
T
L
 
L
D
 
T
A
 
R
A
 
E
T
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
K
N
 
F
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
V
V
 
R
A
 
I
A
 
G
T
 
S
G
 
G
T
 
F
N
 
D
N
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
D
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
C
 
V
Q
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
 
S
T
 
V
P
 
E
S
 
E
V
 
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
T
 
T
L
 
L
A
x
C
L
 
H
L
 
I
L
 
L
A
x
N
L
 
L
A
 
Y
T
x
R
R
|
R
L
 
A
C
 
T
D
 
W
Y
 
L
N
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
x
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
T
W
 
R
A
 
V
K
 
Q
A
 
S
-
 
V
S
 
E
Q
 
Q
F
 
I
C
x
R
L
 
E
L
 
V
D
 
A
F
 
S
P
 
G
I
 
A
V
 
A
E
x
R
L
 
I
E
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
I
G
|
G
H
 
L
G
|
G
E
 
R
L
 
V
G
|
G
G
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
Y
S
x
D
G
 
P
Q
 
Y
I
 
L
P
 
S
G
 
D
R
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
L
R
 
G
L
 
L
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
S
P
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
F
Q
 
H
V
 
S
D
 
D
A
 
C
L
 
V
T
 
T
L
 
L
H
 
H
C
 
C
P
 
G
L
 
L
N
 
N
E
 
E
H
 
H
T
 
N
R
 
H
H
 
H
M
 
L
L
 
I
G
 
N
A
 
D
R
 
F
E
 
T
L
 
V
A
 
K
L
 
Q
L
 
M
K
 
R
P
 
Q
N
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
L
V
 
V
N
 
N
T
 
T
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
E
G
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
H
S
 
E
V
 
S
E
|
E
P
 
P
-
 
F
P
 
S
V
 
F
N
 
S
G
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
E
 
D
P
 
A
G
 
-
I
 
-
P
 
P
R
 
N
L
 
L
I
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
S
 
A
A
 
A
W
 
W
-
 
Y
-
 
S
-
 
E
-
 
Q
G
 
A
A
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
M
R
 
R
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
35% identity, 72% coverage: 38:269/321 of query aligns to 33:263/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
T
 
S
R
 
K
P
 
E
E
 
E
Q
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
Q
Q
 
D
G
 
C
A
 
E
V
 
G
A
 
L
V
 
I
V
 
V
S
 
R
N
 
S
K
 
A
V
 
T
M
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
D
T
 
V
L
 
I
A
 
N
A
 
A
N
 
A
P
 
E
Q
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
I
 
V
L
 
G
V
 
R
A
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
V
N
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
L
V
 
V
C
 
M
N
 
N
C
 
T
Q
 
P
G
 
N
Y
 
G
G
 
N
T
 
S
P
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
T
 
T
L
 
C
A
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
A
 
C
L
 
L
A
 
A
T
 
R
R
 
Q
L
 
I
C
 
P
D
 
Q
Y
 
A
N
 
T
Q
 
A
A
 
S
V
 
M
A
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
W
A
 
E
K
 
R
A
 
K
S
 
K
Q
 
-
F
 
-
C
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
F
P
 
M
I
 
G
V
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
H
 
L
G
 
G
E
 
R
L
 
I
G
 
G
G
 
R
A
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
T
L
 
R
A
 
M
E
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
L
 
I
S
 
G
G
x
Y
Q
x
D
I
x
P
P
 
I
G
 
I
R
 
S
P
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
G
-
 
V
D
 
Q
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
|
L
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
W
P
 
P
Q
 
L
V
 
C
D
 
D
A
 
F
L
 
I
T
 
T
L
 
V
H
|
H
C
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
E
 
P
H
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
M
x
L
L
 
L
G
 
N
A
 
D
R
 
N
E
 
T
L
 
F
A
 
A
L
 
Q
L
 
C
K
 
K
P
 
K
N
 
G
A
 
V
L
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
D
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
S
G
 
G
H
 
Q
L
 
C
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
S
 
T
V
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P

Query Sequence

>PP_0762 PP_0762 Glycerate dehydrogenase
MPSPRRAVFLDHQSLDLGDLDLSPLKQQFDQFELFAATRPEQVAERLQGAVAVVSNKVML
DAATLAANPQLKLILVAATGTNNVDLAAARAQGITVCNCQGYGTPSVAQHTLALLLALAT
RLCDYNQAVADGQWAKASQFCLLDFPIVELEGKTLGLLGHGELGGAVARLAEAFGMRVLS
GQIPGRPERADRLPLDELLPQVDALTLHCPLNEHTRHMLGARELALLKPNALVVNTARGG
LIDEQALADALRGGHLGGAATDVLSVEPPVNGNPLLEPGIPRLIITPHSAWGAVESRQRI
VGQLSENAQAFFAGQPRRVVS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory