SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1259 FitnessBrowser__Putida:PP_1259 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5oqtA Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue (see paper)
30% identity, 80% coverage: 6:435/537 of query aligns to 22:447/456 of 5oqtA

query
sites
5oqtA
K
 
R
K
 
K
Q
x
E
L
 
L
S
x
G
L
x
A
L
x
F
D
|
D
L
 
L
T
 
T
F
x
M
I
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
|
A
I
|
I
-
 
I
-
x
G
-
x
T
-
x
G
-
 
I
F
 
F
G
 
V
S
 
L
G
 
T
W
 
G
L
 
V
F
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
H
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
L
I
 
V
L
 
L
S
 
S
W
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
F
 
L
A
 
A
V
 
C
L
 
V
L
 
F
L
 
A
G
 
A
I
 
L
V
 
C
Y
 
Y
C
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
A
A
 
S
A
 
T
L
 
V
P
 
P
R
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
S
V
 
A
V
 
Y
R
 
T
Y
 
Y
P
 
S
V
 
Y
Y
 
A
S
 
T
H
 
F
G
 
G
P
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
L
G
 
G
F
 
W
I
 
D
T
 
L
L
 
I
I
 
L
A
 
E
F
 
Y
S
 
G
S
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
V
A
 
A
S
 
S
R
 
S
Q
 
A
Y
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
W
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
F
 
F
P
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
L
S
 
T
S
 
S
-
 
A
-
 
Y
D
 
D
P
 
P
-
 
A
-
 
K
-
 
G
T
 
T
V
 
F
L
 
I
G
 
D
W
 
L
L
 
P
V
 
A
Q
 
I
F
 
I
A
 
I
L
 
V
L
 
L
G
 
F
L
 
I
F
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
L
N
 
N
Y
 
L
R
 
G
S
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
S
F
 
-
A
|
A
K
x
R
A
 
F
N
 
N
N
x
A
L
x
V
V
 
I
S
 
V
V
x
A
F
x
I
K
 
K
F
x
V
I
x
A
V
 
V
P
 
V
L
 
L
L
|
L
V
 
F
I
 
L
G
x
A
V
|
V
L
 
G
F
 
V
T
x
W
F
x
Y
F
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
F
 
W
E
 
-
V
 
-
Q
 
T
G
 
P
F
 
F
A
 
M
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
T
S
 
G
A
 
A
G
 
A
G
 
T
I
 
V
I
 
F
F
|
F
A
|
A
Y
 
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
F
T
 
D
P
 
A
I
 
V
I
 
S
S
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
T
 
D
I
 
M
P
 
P
I
 
I
A
 
G
L
 
I
I
 
I
L
 
V
S
 
S
V
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
C
T
 
T
A
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
I
L
 
A
L
 
V
Q
 
S
L
 
L
A
 
V
F
 
L
L
 
T
G
 
G
S
 
I
V
 
V
P
 
P
T
 
Y
E
 
E
M
 
Q
L
 
L
A
 
-
N
 
N
G
 
V
W
 
K
A
 
N
S
 
P
V
 
V
T
 
A
K
 
F
E
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
Y
P
 
I
Y
x
H
R
x
Q
D
 
D
I
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
W
|
W
L
x
V
A
 
A
Y
 
G
L
x
F
V
 
I
V
 
S
A
 
L
D
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
A
S
 
G
P
 
I
S
 
T
G
 
T
C
x
V
G
 
L
N
 
L
I
 
V
Y
 
M
M
 
M
N
 
Y
A
 
G
T
 
Q
P
 
T
R
 
R
V
 
L
I
 
F
Y
 
Y
G
 
A
W
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
L
F
 
L
F
 
P
K
 
K
Y
 
V
F
 
F
T
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
P
E
 
T
S
 
R
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
R
 
Y
P
 
V
A
 
N
L
 
T
W
 
W
L
 
L
T
 
T
-
 
G
F
 
A
G
 
A
L
 
V
S
 
A
V
 
V
F
 
F
W
 
A
-
 
G
T
 
I
L
 
I
P
 
P
F
 
L
P
 
N
S
 
K
W
 
L
E
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
N
V
 
I
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
G
L
 
T
V
 
L
L
 
F
S
 
A
Y
 
F
A
 
I
V
 
T
A
 
V
P
 
S
V
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
K
N
 
T
A
 
Q
P
 
P
H
 
D
M
 
L
P
 
K
R
 
R
P
 
A
F
 
F
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
F
M
 
V
T
 
P
V
 
V
L
 
V
G
 
P
P
 
I
L
 
L
S
 
A
F
 
V
I
 
L
I
 
F
A
 
C
A
 
G
L
 
Y
I
 
L
V
 
V
Y
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
M
-
 
T
W
 
W
S
 
I
G
 
G
W
 
F
N
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
I
L
 
G
Q
 
L
I
 
V
V
 
I
M
 
Y
F
 
F
V
 
I

6f34A Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue bound to arginine. (see paper)
30% identity, 80% coverage: 6:435/537 of query aligns to 24:449/458 of 6f34A

query
sites
6f34A
K
 
R
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
x
G
L
x
A
L
x
F
D
|
D
L
 
L
T
 
T
F
x
M
I
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
A
|
A
I
|
I
-
 
I
-
x
G
-
x
T
-
x
G
-
 
I
F
 
F
G
 
V
S
 
L
G
 
T
W
 
G
L
 
V
F
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
H
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
L
I
 
V
L
 
L
S
 
S
W
 
F
F
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
F
 
L
A
 
A
V
 
C
L
 
V
L
 
F
L
 
A
G
 
A
I
 
L
V
 
C
Y
 
Y
C
 
A
E
 
E
L
 
F
G
 
A
A
 
S
A
 
T
L
 
V
P
 
P
R
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
S
V
 
A
V
 
Y
R
 
T
Y
 
Y
P
 
S
V
 
Y
Y
 
A
S
 
T
H
 
F
G
 
G
P
 
E
L
 
L
L
 
I
G
 
A
Y
 
W
L
 
I
M
 
L
G
 
G
F
 
W
I
 
D
T
 
L
L
 
I
I
 
L
A
x
E
F
x
Y
S
 
G
S
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
V
A
|
A
S
 
S
R
 
S
Q
 
A
Y
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
W
 
W
-
 
S
-
 
G
-
 
Y
F
 
F
P
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
P
K
 
K
A
 
A
G
 
L
S
 
T
S
 
S
-
 
A
-
 
Y
D
 
D
P
 
P
-
 
A
-
 
K
-
 
G
T
 
T
V
 
F
L
 
I
G
 
D
W
 
L
L
 
P
V
 
A
Q
 
I
F
 
I
A
 
I
L
 
V
L
 
L
G
 
F
L
 
I
F
 
T
F
 
F
F
 
L
L
 
L
N
 
N
Y
 
L
R
 
G
S
 
A
V
 
K
K
 
K
T
 
S
F
 
-
A
|
A
K
x
R
A
 
F
N
 
N
N
x
A
L
x
V
V
 
I
S
 
V
V
x
A
F
x
I
K
 
K
F
 
V
I
x
A
V
 
V
P
 
V
L
|
L
L
|
L
V
 
F
I
 
L
G
x
A
V
|
V
L
 
G
F
 
V
T
x
W
F
x
Y
F
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
N
F
 
W
E
 
-
V
 
-
Q
 
T
G
 
P
F
 
F
A
 
M
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
L
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
-
M
 
-
A
 
A
V
 
T
S
 
G
A
 
A
G
 
A
G
 
T
I
 
V
I
 
F
F
|
F
A
|
A
Y
 
Y
L
x
I
G
 
G
L
 
F
T
 
D
P
 
A
I
 
V
I
 
S
S
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
R
 
R
T
 
D
I
 
M
P
 
P
I
 
I
A
 
G
L
 
I
I
 
I
L
 
V
S
 
S
V
 
L
L
 
L
L
 
V
S
 
C
T
 
T
A
 
L
I
 
L
Y
 
Y
A
 
I
L
 
A
L
 
V
Q
 
S
L
 
L
A
 
V
F
 
L
L
 
T
G
 
G
S
 
I
V
 
V
P
 
P
T
 
Y
E
 
E
M
 
Q
L
 
L
A
 
-
N
 
N
G
 
V
W
 
K
A
 
N
S
 
P
V
 
V
T
 
A
K
 
F
E
 
A
L
 
L
A
 
N
L
 
Y
P
 
I
Y
x
H
R
x
Q
D
 
D
I
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
W
|
W
L
x
V
A
 
A
Y
 
G
L
x
F
V
 
I
V
 
S
A
 
L
D
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
A
S
 
G
P
 
I
S
 
T
G
 
T
C
x
V
G
 
L
N
 
L
I
 
V
Y
x
S
M
 
M
N
 
Y
A
 
G
T
 
Q
P
 
T
R
 
R
V
 
L
I
 
F
Y
 
Y
G
 
A
W
 
I
A
 
S
Q
 
R
T
 
D
G
 
G
T
 
L
F
 
L
F
 
P
K
 
K
Y
 
V
F
 
F
T
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
P
E
 
T
S
 
R
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
R
 
Y
P
 
V
A
 
N
L
 
T
W
 
W
L
 
L
T
 
T
-
 
G
F
 
A
G
 
A
L
 
V
S
 
A
V
 
V
F
 
F
-
 
A
W
 
G
T
 
I
L
 
I
P
 
P
F
 
L
P
 
N
S
 
K
W
 
L
E
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
T
N
 
N
V
 
I
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
G
L
 
T
V
 
L
L
 
F
S
 
A
Y
 
F
A
 
I
V
 
T
A
 
V
P
 
S
V
 
I
S
 
G
V
 
V
A
 
L
A
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
K
N
 
T
A
 
Q
P
 
P
H
 
D
M
 
L
P
 
K
R
 
R
P
 
A
F
 
F
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
F
M
 
V
T
 
P
V
 
V
L
 
V
G
 
P
P
 
I
L
 
L
S
 
A
F
 
V
I
 
L
I
 
F
A
 
C
A
 
G
L
 
Y
I
 
L
V
 
V
Y
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
M
-
 
T
W
 
W
S
 
I
G
 
G
W
 
F
N
 
-
T
 
-
V
 
V
S
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
I
L
 
G
Q
 
L
I
 
V
V
 
I
M
 
Y
F
 
F
V
 
I

P30825 High affinity cationic amino acid transporter 1; CAT-1; CAT1; Ecotropic retroviral leukemia receptor homolog; Ecotropic retrovirus receptor homolog; Solute carrier family 7 member 1; System Y+ basic amino acid transporter from Homo sapiens (Human) (see paper)
25% identity, 73% coverage: 4:393/537 of query aligns to 27:438/629 of P30825

query
sites
P30825
K
 
R
F
 
L
K
 
S
K
 
R
Q
 
C
L
 
L
S
 
N
L
 
T
L
 
F
D
 
D
L
 
L
T
 
V
F
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
V
G
 
G
A
 
S
I
 
T
F
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
-
 
V
W
 
Y
L
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
G
S
 
A
H
 
V
V
 
A
S
 
R
A
 
E
I
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
G
 
I
I
 
V
L
 
I
S
 
S
W
 
F
F
 
L
L
 
I
G
 
A
G
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
V
L
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
C
Y
 
Y
C
 
G
E
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
R
L
 
V
P
 
P
R
 
K
A
 
T
G
 
G
G
 
S
V
 
A
V
 
Y
R
 
L
Y
 
Y
P
 
S
V
 
Y
Y
 
V
S
 
T
H
 
V
G
 
G
P
 
E
L
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
F
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
W
-
 
N
-
 
L
-
 
I
L
 
L
G
 
S
Y
 
Y
L
 
I
M
 
I
G
 
G
F
 
T
I
 
S
T
 
S
L
 
V
I
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
S
-
 
A
A
 
T
F
 
F
S
 
D
S
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
G
I
 
R
E
 
P
V
 
I
V
 
G
A
 
E
-
 
F
S
 
S
R
 
R
Q
 
T
Y
 
H
A
 
M
A
 
T
A
 
L
W
 
N
F
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
V
T
 
L
K
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
A
S
 
E
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
I
L
 
F
G
 
A
W
 
V
L
 
I
V
 
I
Q
 
I
F
 
L
A
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
F
 
T
F
 
L
L
 
G
N
 
V
Y
 
K
R
 
E
S
 
S
V
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
N
K
 
K
T
 
I
F
 
F
A
 
T
K
 
C
A
 
I
N
 
N
N
 
V
L
 
L
V
 
V
S
 
L
V
 
G
F
 
F
K
 
I
F
 
M
I
 
V
V
 
S
P
 
G
L
 
F
L
 
V
V
 
K
I
 
G
G
 
S
V
 
V
L
 
K
F
 
N
T
 
W
F
 
Q
F
 
L
K
 
T
P
 
E
E
 
E
N
 
D
F
 
F
E
 
G
-
x
N
-
 
T
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
C
-
 
L
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
G
V
 
V
Q
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
M
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
-
M
 
-
A
 
L
V
 
S
S
 
G
A
 
A
G
 
A
G
 
T
I
 
C
I
 
F
F
 
Y
A
 
A
Y
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
D
P
 
C
I
 
I
I
 
A
S
 
T
V
 
T
A
 
G
S
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
K
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
R
 
K
T
 
A
I
 
I
P
 
P
I
 
V
A
 
G
L
 
I
I
 
V
L
 
A
S
 
S
V
 
L
L
 
L
L
 
I
S
 
C
T
 
F
A
 
I
I
 
A
Y
 
Y
A
 
F
L
 
G
L
 
V
Q
 
S
L
 
A
A
 
A
F
 
L
L
 
T
G
 
L
S
 
M
V
 
M
P
 
P
T
 
Y
E
 
F
M
 
C
L
 
L
A
 
D
N
 
N
G
 
N
W
 
S
A
 
P
S
 
L
V
 
P
T
 
D
K
 
A
E
 
F
L
 
K
A
 
H
L
 
V
P
 
G
Y
 
W
R
 
E
D
 
G
I
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
L
 
V
G
 
A
V
 
V
G
 
G
W
 
S
L
 
L
A
 
C
Y
 
A
L
 
L
V
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
S
 
S
P
 
A
S
 
S
G
 
L
C
 
L
G
 
G
N
 
S
I
 
M
Y
 
F
M
 
-
N
 
-
A
 
P
T
 
M
P
 
P
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
G
 
A
W
 
M
A
 
A
Q
 
E
T
 
D
G
 
G
T
 
L
F
 
L
F
 
F
K
 
K
Y
 
F
F
 
L
T
 
A
R
 
N
I
 
V
D
 
N
A
 
D
E
 
R
S
 
T
G
 
K
I
 
T
P
 
P
R
 
I
P
 
I
A
 
A
L
 
T
W
 
L
L
 
A
T
 
S
F
 
G
G
 
A
L
 
V
S
 
A
V
 
A
F
 
V
W
 
M
T
 
A
L
 
F
P
 
L
F
 
F
P
 
-
S
 
D
W
 
L
E
 
K
A
 
D
L
 
L
I
 
V
N
 
D
V
 
L
V
 
M
S
 
S
A
 
I
A
 
G
L
 
T
V
 
L
L
 
L
S
 
A
Y
 
Y
A
 
S
V
 
L
A
 
V
P
 
A
V
 
A
S
 
C
V
 
V
A
 
L
A
 
V
L
 
L
R
 
R
R
 
Y
N
 
Q
A
 
-
P
 
P
H
 
E
M
 
Q
P
 
P
R
 
N

6f2wA Bacterial asc transporter crystal structure in open to in conformation (see paper)
25% identity, 77% coverage: 7:418/537 of query aligns to 2:401/433 of 6f2wA

query
sites
6f2wA
K
 
K
Q
 
E
L
 
V
S
 
S
L
 
G
L
 
I
D
 
T
L
 
A
T
 
L
F
 
T
I
 
V
G
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
T
I
x
V
F
 
I
G
|
G
S
x
A
G
|
G
W
 
I
L
 
F
F
 
F
A
 
K
A
 
P
S
 
T
H
 
A
V
 
V
S
 
Y
A
 
G
I
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
A
A
 
P
G
 
G
I
 
L
-
 
G
-
 
L
L
 
L
S
 
A
W
 
W
F
 
F
L
 
V
G
 
A
G
 
G
F
 
I
A
 
I
V
 
T
L
 
I
L
 
A
L
 
G
G
 
G
I
 
L
V
 
T
Y
 
V
C
 
A
E
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
T
A
 
I
L
 
Y
P
 
P
R
 
Q
A
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
M
V
 
M
R
 
I
Y
 
Y
P
 
L
V
 
E
Y
 
K
S
 
V
H
 
Y
G
 
G
P
 
R
L
 
W
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
M
 
V
G
 
G
F
 
W
I
 
A
T
 
Q
L
 
M
I
 
V
A
 
I
F
 
Y
-
 
Y
-
 
P
S
 
A
S
 
N
L
 
I
I
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
F
S
 
A
R
 
T
Q
 
Q
Y
 
F
A
 
V
A
 
N
A
 
L
W
 
F
F
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
A
S
 
L
S
 
S
D
 
D
P
 
S
T
 
T
V
 
I
L
 
-
G
 
-
W
 
-
L
 
-
V
 
V
Q
 
P
F
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
G
 
T
L
 
S
F
 
I
F
 
F
F
 
L
L
 
M
-
 
G
-
 
V
N
 
N
Y
 
F
R
 
L
S
 
G
V
 
T
K
 
K
T
 
Y
F
 
S
A
 
G
K
 
W
A
 
I
N
 
Q
N
 
T
L
 
L
V
 
A
S
 
T
V
 
I
F
 
L
K
 
K
F
 
L
I
 
I
V
 
-
P
 
P
L
 
L
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
-
V
 
I
L
 
V
F
 
A
T
 
G
F
 
L
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
E
 
G
N
 
G
F
 
G
E
 
V
V
 
I
Q
 
R
G
 
-
F
 
L
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
S
L
 
V
S
 
E
G
 
T
V
 
H
E
 
P
M
 
V
A
 
L
V
 
T
S
 
S
A
 
F
G
 
G
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
I
G
 
A
I
 
T
I
 
L
F
|
F
A
|
A
Y
 
Y
L
x
D
G
 
G
L
 
W
T
 
I
P
 
N
I
 
V
I
 
G
S
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
G
E
 
E
V
 
M
K
 
K
N
 
N
P
 
P
Q
 
G
R
 
K
T
 
M
I
 
L
P
 
P
I
 
K
A
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
G
S
 
G
V
 
L
L
 
S
L
 
I
S
 
V
T
 
M
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
L
L
 
L
L
 
T
Q
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
G
 
F
S
 
V
V
 
L
P
 
D
T
 
S
E
 
S
M
 
Q
L
 
L
A
 
A
N
 
G
G
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
T
A
 
D
L
 
T
P
 
P
Y
 
A
R
 
A
D
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
S
A
 
H
L
 
L
G
 
F
V
 
E
G
 
G
W
 
I
L
 
G
A
 
S
Y
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
T
A
 
I
D
 
G
A
 
I
V
 
L
I
 
I
S
 
S
P
 
V
S
 
F
G
 
G
C
 
G
G
 
I
N
 
N
I
 
G
Y
|
Y
M
 
I
N
 
I
A
 
S
T
 
G
P
 
L
R
 
R
V
 
V
I
 
P
Y
 
Y
G
 
A
W
 
L
A
 
A
Q
 
T
T
 
Q
G
 
K
T
 
M
-
 
L
-
 
P
F
 
F
F
 
S
K
 
D
Y
 
W
F
 
F
T
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
N
A
 
P
E
 
K
S
 
T
G
 
N
I
 
L
P
 
P
R
 
I
P
 
N
A
 
G
L
 
G
W
 
L
L
 
V
T
 
M
F
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
A
V
 
I
F
 
V
W
 
M
T
 
I
L
 
L
P
 
T
F
 
-
P
 
G
S
 
Q
W
 
F
E
 
N
A
 
Q
L
 
L
I
 
T
N
 
D
V
 
L
V
 
I
S
 
V
A
 
F
A
 
V
L
 
I
V
 
W
L
 
F
S
 
F
Y
 
I
A
 
T
V
 
L
A
 
T
P
 
F
V
 
I
S
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
I
L
 
L
R
 
R
R
 
K
N
 
T
A
 
Q
P
 
P
H
 
D
M
 
I
P
 
E
R
 
R
P
 
P
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
K
 
P
G
 
F
M
 
Y
T
 
P
V
 
V
L
 
I
G
 
-
P
 
P
L
 
L
S
 
I
F
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
G
A
 
G
L
 
L
I
 
Y
V
 
I
Y
 
I
W
 
F
S
 
N

P82251 b(0,+)-type amino acid transporter 1; b(0,+)AT1; Glycoprotein-associated amino acid transporter b0,+AT1; Solute carrier family 7 member 9 from Homo sapiens (Human) (see 11 papers)
25% identity, 74% coverage: 2:397/537 of query aligns to 23:409/487 of P82251

query
sites
P82251
S
 
T
G
 
T
K
 
S
F
 
L
K
 
Q
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
S
L
 
G
T
 
I
F
 
S
I
 
I
G
 
I
L
x
V
G
 
G
A
 
T
I
|
I
F
x
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
W
 
I
L
 
F
F
 
V
A
x
S
A
x
P
S
 
K
H
 
S
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
N
S
 
T
A
 
E
I
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
C
G
 
L
I
 
I
L
 
I
S
 
-
W
 
W
F
x
A
L
 
A
G
 
C
G
 
G
F
 
V
A
 
L
V
 
A
L
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
A
I
 
L
V
 
C
Y
 
F
C
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
A
 
M
L
 
I
P
 
T
R
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
V
 
Y
R
 
P
Y
|
Y
P
 
L
V
 
M
Y
 
E
S
 
A
H
 
Y
G
|
G
P
 
P
L
 
I
L
 
P
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
M
 
F
G
 
S
F
x
W
I
 
A
T
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
V
F
x
I
S
 
K
-
 
P
S
x
T
L
 
S
I
 
F
A
 
A
I
 
I
E
 
I
V
 
C
V
 
L
A
 
S
S
 
F
R
 
S
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
A
 
C
A
 
A
W
 
P
F
 
F
P
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
Y
A
x
V
G
 
G
S
x
C
S
 
K
D
 
P
P
 
P
T
 
Q
V
 
I
L
 
V
G
 
V
W
 
K
L
 
C
V
 
L
Q
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
I
G
 
L
L
 
F
F
 
I
F
 
S
F
 
T
L
 
V
N
 
N
Y
 
S
R
 
L
S
 
S
V
|
V
K
 
R
T
 
L
F
 
G
A
 
S
K
 
Y
A
 
V
N
 
Q
N
 
N
L
 
I
V
 
F
S
 
T
V
x
A
F
 
A
K
 
K
F
 
L
-
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
S
-
x
G
-
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
L
T
 
A
F
 
Q
F
 
G
K
 
N
P
 
T
E
 
K
N
 
N
F
 
F
E
 
D
V
 
N
Q
 
S
G
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
F
S
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
M
 
L
A
 
S
V
 
V
S
 
G
A
 
A
G
 
I
G
 
S
I
x
L
I
x
A
F
 
F
-
 
Y
-
x
N
-
 
G
-
 
L
-
x
W
A
 
A
Y
 
Y
L
x
D
G
 
G
L
x
W
T
 
N
P
x
Q
I
 
L
I
 
N
S
 
Y
V
 
I
A
 
T
S
 
E
E
 
E
V
 
L
K
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Y
R
 
R
T
 
N
I
 
L
P
 
P
I
 
L
A
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
I
S
x
G
V
 
I
L
x
P
L
 
L
S
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
C
Y
 
Y
A
 
I
L
 
L
L
 
M
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
G
 
T
S
 
V
V
 
M
P
 
T
-
 
A
T
 
T
E
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
N
x
S
G
 
Q
W
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
T
 
T
K
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
F
R
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
-
L
 
Y
G
 
P
V
 
A
G
 
S
W
 
W
L
 
I
A
 
V
Y
 
P
L
 
L
V
 
F
V
 
V
A
 
A
D
 
F
A
 
S
V
 
T
I
 
I
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
C
 
A
G
 
A
N
 
N
I
 
G
Y
 
T
M
x
C
N
 
F
A
 
T
T
x
A
P
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
I
Y
 
Y
G
x
V
W
x
A
A
 
G
Q
x
R
T
 
E
G
 
G
T
 
H
F
 
M
F
 
L
K
 
K
Y
 
V
F
 
L
T
 
S
R
 
Y
I
 
I
D
 
S
A
 
V
E
 
R
S
 
R
G
 
L
I
 
T
P
 
P
R
 
A
P
 
P
A
|
A
L
 
I
W
 
I
L
 
F
T
 
Y
F
 
G
G
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
T
F
 
I
W
 
Y
T
 
I
L
 
I
P
 
P
F
 
-
P
 
G
S
 
D
W
 
I
E
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
Y
V
 
F
S
|
S
A
 
F
A
 
A
L
x
A
V
x
W
L
 
L
S
 
F
Y
|
Y
A
 
G
V
 
L
A
 
T
P
 
I
V
 
L
S
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
V
L
 
M
R
 
R
R
 
F
N
 
T
A
 
R
P
x
K
H
 
E
M
 
L
P
 
E
R
 
R
P
 
P
F
 
I
R
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P25737 Lysine-specific permease LysP; Lysine transporter LysP; Trigger transporter LysP from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
27% identity, 63% coverage: 6:345/537 of query aligns to 14:352/489 of P25737

query
sites
P25737
K
 
R
K
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
A
L
 
R
D
 
H
L
 
L
T
 
T
F
 
M
I
 
I
G
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
S
F
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
W
 
L
L
 
F
F
 
V
A
 
A
A
 
S
S
 
G
H
 
A
V
 
T
S
 
I
A
 
S
I
 
Q
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
G
-
 
A
I
 
L
L
 
L
S
 
S
W
 
Y
F
 
M
L
 
L
G
 
I
G
 
G
F
 
L
A
 
M
V
 
V
L
 
Y
L
 
F
L
 
L
G
 
M
I
 
T
V
 
S
Y
 
L
C
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
Y
L
 
M
P
 
P
R
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
S
V
 
F
V
 
A
R
 
T
Y
 
Y
P
 
G
V
 
Q
Y
 
N
S
 
Y
H
 
V
G
 
E
P
 
E
L
 
G
L
 
F
G
 
G
Y
 
F
L
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
W
I
 
N
T
x
Y
L
 
W
I
 
Y
A
 
N
F
x
W
S
 
A
S
 
V
L
 
T
I
 
I
A
 
A
I
 
V
E
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
Q
Q
 
L
Y
 
V
A
 
M
A
 
S
A
 
W
W
 
W
F
 
F
P
 
P
G
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
D
D
 
T
P
 
P
T
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
G
W
 
W
L
 
I
V
 
W
Q
 
S
F
 
A
A
 
L
L
 
F
L
 
L
G
 
G
L
 
V
F
 
I
F
 
F
F
 
L
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
R
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
R
T
 
G
F
 
F
A
 
G
K
 
E
A
 
A
N
 
E
N
 
Y
L
 
W
V
 
F
S
 
S
V
 
L
F
 
I
K
|
K
F
 
V
-
 
T
-
 
T
I
 
V
V
 
I
P
 
V
L
 
F
L
 
I
V
 
I
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
-
 
M
-
 
I
-
 
I
-
 
G
-
 
I
F
 
F
T
 
K
F
 
G
F
 
A
K
 
Q
P
 
P
E
 
A
N
 
G
F
 
W
E
 
S
-
 
N
-
 
W
V
 
T
Q
 
I
G
 
G
F
 
E
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
A
L
 
G
S
 
G
G
 
F
V
 
A
E
 
A
M
 
M
A
 
I
V
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
M
G
 
I
I
 
V
I
 
G
F
|
F
A
 
S
Y
 
F
L
 
Q
G
 
G
L
 
T
T
x
E
P
 
L
I
 
I
I
 
G
S
 
I
V
 
A
A
 
A
S
 
G
E
|
E
V
 
S
K
 
E
N
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
 
K
T
 
N
I
 
I
P
 
P
I
 
R
A
 
A
L
 
V
-
 
R
-
 
Q
I
 
V
L
 
F
S
 
W
V
 
R
L
 
I
L
 
L
S
 
L
T
 
F
A
 
Y
I
 
V
Y
 
F
A
 
A
L
 
I
L
 
L
Q
 
I
L
 
I
A
 
S
F
 
L
L
 
I
G
 
-
S
 
-
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
-
 
T
-
 
D
-
 
P
E
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
R
N
 
N
G
x
D
W
 
V
A
 
K
S
x
D
V
 
I
T
 
S
-
 
V
K
 
S
E
 
P
L
 
F
A
 
T
L
 
L
P
 
V
Y
 
F
R
 
Q
D
 
H
I
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
-
L
 
L
G
 
S
V
 
A
G
 
A
W
 
A
L
 
V
A
 
M
Y
 
N
L
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
L
D
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
L
S
 
S
P
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
S
Y
 
G
M
 
M
N
 
Y
A
 
A
T
 
S
P
 
T
R
 
R
V
 
M
I
 
L
Y
 
Y
G
 
T
W
 
L
A
 
A
Q
 
C
T
 
D
G
 
G
T
 
K
F
 
A
F
 
P
K
 
R
Y
 
I
F
 
F
T
 
A
R
 
K
I
 
L
D
 
-
A
 
S
E
 
R
S
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
P
R
 
R
P
 
N
A
 
A
L
 
L
W
 
Y
L
 
A
T
 
T

Sites not aligning to the query:

6li9B Heteromeric amino acid transporter b0,+at-rbat complex bound with arginine (see paper)
25% identity, 71% coverage: 17:397/537 of query aligns to 9:380/458 of 6li9B

query
sites
6li9B
I
 
I
G
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
T
I
|
I
F
 
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
W
 
I
L
 
F
F
 
V
A
 
S
A
 
P
S
 
K
H
 
S
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
N
S
 
T
A
 
E
I
 
A
A
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
C
G
 
L
I
 
I
L
 
I
S
 
-
W
 
W
F
 
A
L
 
A
G
 
C
G
 
G
F
 
V
A
 
L
V
 
A
L
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
A
I
 
L
V
 
C
Y
 
F
C
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
A
 
M
L
 
I
P
 
T
R
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
V
 
Y
R
 
P
Y
 
Y
P
 
L
V
 
M
Y
 
E
S
 
A
H
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
P
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
M
 
F
G
 
S
F
 
W
I
 
A
T
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
V
F
 
I
S
 
K
-
 
P
S
 
T
L
 
S
I
 
F
A
 
A
I
 
I
E
 
I
V
 
C
V
 
L
A
 
S
S
 
F
R
 
S
Q
 
E
Y
 
Y
A
 
V
A
 
C
A
 
A
W
 
P
F
 
F
P
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
Y
A
 
V
G
 
G
S
 
C
S
 
K
D
 
P
P
 
P
T
 
Q
V
 
I
L
 
V
G
 
V
W
 
K
L
 
C
V
 
L
Q
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
A
L
 
I
G
 
L
L
 
F
F
 
I
F
 
S
F
 
T
L
 
V
N
 
N
Y
 
S
R
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
R
T
 
L
F
 
G
A
 
S
K
 
Y
A
 
V
N
 
Q
N
 
N
L
 
I
V
 
F
S
 
T
V
 
A
F
 
A
K
 
K
F
 
L
-
 
V
I
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
I
L
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
S
-
 
G
-
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
L
T
 
A
F
 
Q
F
 
G
K
 
N
P
 
T
E
 
K
N
 
N
F
 
F
E
 
D
V
 
N
Q
 
S
G
 
-
F
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
F
S
 
E
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
M
 
L
A
 
S
V
 
V
S
 
G
A
 
A
G
 
I
G
 
S
I
 
L
I
 
A
F
 
F
-
 
Y
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
x
W
A
|
A
Y
 
Y
L
x
D
G
 
G
L
 
W
T
 
N
P
 
Q
I
 
L
I
 
N
S
 
Y
V
 
I
A
 
T
S
 
E
E
 
E
V
 
L
K
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Y
R
 
R
T
 
N
I
 
L
P
 
P
I
 
L
A
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
I
S
 
G
V
 
I
L
 
P
L
 
L
S
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
C
Y
 
Y
A
 
I
L
 
L
L
 
M
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
G
 
T
S
 
V
V
 
M
P
 
T
-
 
A
T
 
T
E
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
N
 
S
G
 
Q
W
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
T
 
T
K
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
F
R
 
G
D
 
D
I
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
-
L
 
Y
G
 
P
V
 
A
G
 
S
W
 
W
L
 
I
A
 
V
Y
 
P
L
 
L
V
 
F
V
 
V
A
 
A
D
 
F
A
 
S
V
 
T
I
 
I
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
C
 
A
G
 
A
N
 
N
I
 
G
Y
 
T
M
 
C
N
 
F
A
 
T
T
 
A
P
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
I
Y
 
Y
G
 
V
W
 
A
A
 
G
Q
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
H
F
 
M
F
 
L
K
 
K
Y
 
V
F
 
L
T
 
S
R
 
Y
I
 
I
D
 
S
A
 
V
E
 
R
S
 
R
G
 
L
I
 
T
P
 
P
R
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
W
 
I
L
 
F
T
 
Y
F
 
G
G
 
I
L
 
I
S
 
A
V
 
T
F
 
I
W
 
Y
T
 
I
L
 
I
P
 
P
F
 
-
P
 
G
S
 
D
W
 
I
E
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
Y
V
 
F
S
 
S
A
 
F
A
 
A
L
 
A
V
 
W
L
 
L
S
 
F
Y
 
Y
A
 
G
V
 
L
A
 
T
P
 
I
V
 
L
S
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
V
L
 
M
R
 
R
R
 
F
N
 
T
A
 
R
P
 
K
H
 
E
M
 
L
P
 
E
R
 
R
P
 
P
F
 
I
R
 
K
V
 
V

7nf6B Ovine b0,+at-rbat heterodimer (see paper)
25% identity, 73% coverage: 8:397/537 of query aligns to 1:381/455 of 7nf6B

query
sites
7nf6B
Q
 
E
L
 
L
S
 
G
L
 
L
L
 
F
D
 
S
L
 
G
T
 
T
F
 
C
I
 
I
G
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
T
I
 
I
F
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
G
W
 
I
L
 
F
F
 
I
A
 
S
A
 
P
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
L
S
 
S
H
 
N
V
 
M
S
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
-
G
 
G
P
 
P
A
 
C
G
 
L
I
 
I
L
 
I
S
 
-
W
 
W
F
 
A
L
 
M
G
 
C
G
 
G
F
 
V
A
 
L
V
 
A
L
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
A
I
 
L
V
 
C
Y
 
F
C
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
T
A
 
M
L
 
I
P
 
T
R
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
E
V
 
Y
R
 
P
Y
 
Y
P
 
L
V
 
M
Y
 
E
S
 
A
H
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
P
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
M
 
F
G
 
S
F
 
W
I
 
S
T
 
S
L
 
L
I
 
F
A
 
V
F
 
I
S
 
K
-
 
P
S
 
S
L
 
S
I
 
F
A
 
A
I
 
I
E
 
I
V
 
C
V
 
L
A
 
S
S
 
F
R
 
S
Q
 
E
Y
 
Y
A
x
V
A
 
C
A
 
A
W
x
P
F
|
F
P
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
K
 
Y
A
 
S
G
 
G
S
 
C
S
 
S
D
 
P
P
 
P
T
 
Q
V
 
V
L
 
V
G
 
I
W
x
K
L
x
T
V
x
L
Q
 
A
F
x
A
A
 
A
L
 
A
L
 
I
G
 
L
L
|
L
F
 
I
F
 
S
F
 
T
L
 
V
N
 
N
Y
 
A
R
 
L
S
 
S
V
 
V
K
 
R
T
 
L
F
 
G
A
 
S
K
 
Y
A
 
V
N
 
Q
N
 
N
L
 
V
V
 
F
S
 
T
V
 
A
F
 
A
K
 
K
F
 
M
I
 
V
V
 
I
P
 
V
L
x
V
L
x
I
V
 
I
I
 
I
G
x
I
-
x
S
-
 
G
-
 
L
V
|
V
L
|
L
F
 
L
T
 
A
F
 
Q
F
 
G
K
 
N
P
 
T
E
 
R
N
 
N
F
 
F
E
 
E
V
 
-
Q
 
N
G
 
S
F
 
F
A
 
E
P
 
G
F
 
A
G
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
V
V
 
G
E
 
S
M
 
I
A
 
S
V
 
L
S
 
A
A
 
L
G
 
Y
G
 
N
I
 
G
I
 
L
F
 
W
A
 
A
Y
 
Y
L
 
D
G
 
G
L
 
W
T
 
N
P
 
Q
I
 
L
I
 
N
S
 
Y
V
 
I
A
 
T
S
 
E
E
 
E
V
 
L
K
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
F
R
 
R
T
 
N
I
 
L
P
 
P
I
 
L
A
 
A
L
 
I
I
 
I
L
 
I
S
 
G
V
 
I
L
 
P
L
 
L
S
 
V
T
 
T
A
 
G
I
 
C
Y
 
Y
A
 
I
L
 
L
L
 
M
Q
 
N
L
 
V
A
 
S
F
 
Y
L
 
F
G
 
T
S
 
V
V
 
M
P
 
T
-
 
A
T
 
T
E
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
N
 
-
G
 
-
W
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
S
K
 
Q
E
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
V
P
 
T
Y
 
F
R
 
G
D
 
D
I
 
R
A
x
V
L
 
L
A
 
-
L
 
Y
G
 
P
V
 
A
G
 
S
W
|
W
L
 
I
A
 
V
Y
 
P
L
 
L
V
 
F
V
 
V
A
 
A
D
x
F
A
 
S
V
 
T
I
 
I
S
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
G
C
 
A
G
 
A
N
 
N
I
 
G
Y
 
S
M
 
C
N
 
F
A
 
T
T
 
A
P
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
V
Y
 
F
G
 
V
W
 
A
A
 
G
Q
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
H
F
 
M
F
 
L
K
 
K
Y
 
V
F
 
L
T
 
S
R
 
Y
I
 
I
D
 
S
A
 
V
E
 
K
S
 
R
G
 
L
I
 
T
P
 
P
R
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
I
W
 
M
L
 
F
T
 
H
F
 
S
G
 
M
L
 
I
S
 
A
V
x
I
F
 
I
W
 
Y
T
 
I
L
x
I
P
 
P
F
 
-
P
 
G
S
 
D
W
 
I
E
 
N
A
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
Y
V
 
F
S
 
S
A
 
F
A
 
A
L
 
A
V
 
W
L
 
L
S
 
F
Y
 
Y
A
 
G
V
 
L
A
 
T
P
 
I
V
 
T
S
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
V
L
 
M
R
 
R
R
 
F
N
 
T
A
 
R
P
 
K
H
 
E
M
 
L
P
 
K
R
 
R
P
 
P
F
 
I
R
 
K
V
 
V

P46349 Gamma-aminobutyric acid permease; GABA permease; 4-aminobutyrate permease; Gamma-aminobutyrate permease; Proline transporter GabP from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
23% identity, 73% coverage: 6:398/537 of query aligns to 9:397/469 of P46349

query
sites
P46349
K
 
K
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
S
 
K
L
 
T
L
 
R
D
 
H
L
 
M
T
 
T
F
 
M
I
 
I
G
 
S
L
 
I
G
 
A
A
 
G
I
 
V
F
 
I
G
 
G
S
 
A
G
 
G
W
 
L
L
 
F
F
 
V
A
x
G
A
 
S
S
 
G
H
 
S
V
 
V
S
 
I
A
 
H
I
 
S
A
 
T
G
|
G
P
 
P
A
 
G
G
 
A
I
 
V
L
 
V
S
 
S
W
 
Y
F
 
A
L
 
L
G
 
A
G
 
G
F
 
L
A
 
L
V
 
V
L
 
I
L
 
F
L
 
I
G
 
M
I
 
R
V
 
M
Y
 
L
C
 
G
E
 
E
L
 
M
G
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
N
P
 
P
R
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
S
V
 
F
V
 
S
R
 
Q
Y
 
Y
P
 
A
V
 
H
Y
 
D
S
 
A
H
 
I
G
 
G
P
 
P
L
 
W
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
T
M
 
I
G
 
G
F
 
W
I
 
L
T
 
Y
L
 
W
I
 
F
A
 
F
F
 
W
S
 
V
S
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
I
 
I
E
 
E
V
 
A
V
 
I
A
 
A
S
 
G
R
 
A
Q
 
G
Y
 
I
A
 
I
A
 
Q
A
 
Y
W
 
W
F
 
F
P
 
H
G
 
D
L
 
I
T
 
P
K
 
L
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
W
 
W
L
 
L
V
 
T
Q
 
S
F
 
L
A
 
I
L
 
L
L
 
T
G
 
I
L
 
V
F
 
L
F
 
T
F
 
L
L
 
T
N
 
N
Y
 
V
R
 
Y
S
 
S
V
 
V
K
 
K
T
 
S
F
 
F
A
 
G
K
 
E
A
 
F
N
 
E
N
 
Y
L
 
W
V
 
F
S
 
S
V
 
L
F
 
I
K
 
K
F
 
V
-
 
V
-
 
T
I
 
I
V
 
I
P
 
A
L
 
F
L
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
G
V
 
F
L
 
A
F
 
F
T
 
I
F
 
F
-
 
G
F
 
F
K
 
A
P
 
P
E
 
G
N
 
S
F
 
E
E
 
P
V
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
K
Q
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
F
P
 
P
F
 
E
G
 
G
L
 
I
S
 
S
G
 
S
V
 
V
E
 
L
M
 
L
A
 
G
V
 
I
S
 
V
A
 
V
G
 
-
G
 
-
I
 
V
I
 
I
F
 
F
A
 
S
Y
 
F
L
 
M
G
 
G
L
 
T
T
 
E
P
 
I
I
 
V
I
 
A
S
 
I
V
 
A
A
 
A
S
 
G
E
 
E
V
 
T
K
 
S
N
 
N
P
 
P
Q
 
I
R
 
E
T
 
S
I
 
V
P
 
T
I
 
K
A
 
A
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
T
T
 
R
A
 
S
I
 
V
Y
 
V
A
 
W
L
 
R
L
 
I
Q
 
I
L
 
V
A
 
F
F
 
Y
L
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
I
P
 
A
T
 
I
E
 
V
M
 
V
L
 
A
A
 
L
N
 
L
G
 
P
W
 
W
A
 
N
S
 
S
V
 
-
T
 
A
K
 
N
E
 
I
L
 
L
A
 
E
L
 
S
P
 
P
Y
 
F
R
 
V
D
 
A
I
 
V
A
 
L
L
 
E
A
 
H
L
 
I
G
 
G
V
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
A
G
 
A
W
 
Q
L
 
I
A
 
M
Y
 
N
L
 
F
V
 
I
V
 
V
A
 
L
D
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
L
S
 
S
P
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
C
G
 
L
N
 
N
I
 
S
Y
x
G
M
 
L
N
 
Y
A
 
T
T
 
T
P
 
S
R
 
R
V
 
M
I
 
L
Y
 
Y
G
 
S
W
 
L
A
 
A
Q
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
E
F
 
A
F
 
P
K
 
R
Y
 
R
F
 
F
T
 
M
R
 
K
I
 
L
D
 
-
A
 
S
E
 
K
S
 
K
G
 
G
I
 
V
P
 
P
R
 
V
P
 
Q
A
 
A
L
 
I
-
 
V
-
 
A
-
x
G
-
 
T
-
 
F
W
x
F
L
 
S
T
 
Y
F
 
I
G
 
A
L
 
V
S
 
V
V
 
M
F
 
N
W
 
Y
T
 
F
L
 
S
P
 
P
F
 
D
P
 
T
S
 
V
W
 
F
E
 
L
A
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
S
S
 
G
A
 
A
A
 
I
L
 
A
V
 
L
L
 
L
S
 
V
Y
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
I
P
 
A
V
 
V
S
 
S
V
 
Q
A
 
L
A
 
K
L
 
M
R
 
R
R
 
K
N
 
K
A
 
L
P
 
E
H
 
K
M
 
T
-
 
N
P
 
P
R
 
E
P
 
A
F
 
L
R
 
K
V
 
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

P15993 Aromatic amino acid transport protein AroP; Aromatic amino acid:H(+) symporter AroP; General aromatic amino acid permease; General aromatic transport system from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
25% identity, 71% coverage: 4:386/537 of query aligns to 10:386/457 of P15993

query
sites
P15993
K
 
Q
F
 
L
K
 
K
K
 
R
Q
 
G
L
 
L
S
 
K
L
 
N
L
 
R
D
 
H
L
 
I
T
 
Q
F
 
L
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
G
I
 
A
F
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
W
 
L
L
 
F
F
 
L
A
 
G
A
 
S
S
 
A
H
 
S
V
 
V
S
 
I
A
 
Q
I
 
S
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
G
 
I
I
 
I
L
 
L
S
 
G
W
 
Y
F
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
I
V
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
I
G
 
M
I
 
R
V
 
Q
Y
 
L
C
 
G
E
 
E
L
 
M
G
 
V
A
 
V
A
 
E
L
 
E
P
 
P
R
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
S
V
 
F
V
 
S
R
 
H
Y
 
F
P
 
A
V
 
Y
Y
 
K
S
 
Y
H
 
W
G
 
G
P
 
S
L
 
F
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
A
M
 
S
G
 
G
F
 
W
I
 
N
T
 
Y
L
 
W
I
 
V
A
 
L
F
x
Y
S
 
V
S
 
L
L
 
V
I
 
A
A
 
M
I
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
T
A
 
A
S
 
V
R
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
A
 
I
A
 
Q
A
 
F
W
 
W
F
 
Y
P
 
P
G
 
E
L
 
I
T
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
T
V
 
W
L
 
V
G
 
S
W
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
F
F
 
F
A
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
N
L
 
A
F
 
-
F
 
-
F
 
-
L
 
I
N
 
N
Y
 
L
R
 
T
S
 
N
V
 
V
K
 
K
T
 
V
F
 
F
A
 
G
K
 
E
A
 
M
N
 
E
N
 
F
L
 
W
V
 
F
S
 
A
V
 
I
F
 
I
K
 
K
F
 
V
I
 
I
-
 
A
-
 
V
V
 
V
P
 
A
L
 
M
L
 
I
V
 
I
I
 
F
G
 
G
-
 
G
-
 
W
V
 
L
L
 
L
F
 
F
T
 
S
F
 
G
F
 
N
K
 
G
P
 
G
E
 
P
N
 
Q
F
 
A
E
 
T
V
 
V
Q
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
W
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
L
P
 
P
F
 
H
G
 
G
L
 
F
S
 
T
G
 
G
V
 
L
E
 
V
M
 
M
A
 
M
V
 
M
S
 
A
A
 
I
G
 
-
G
 
-
I
 
I
I
 
M
F
 
F
A
 
S
Y
 
F
L
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
E
P
 
L
I
 
V
I
 
G
S
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
A
E
 
E
V
 
A
K
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
E
R
 
Q
T
 
S
I
 
I
P
 
P
I
 
K
A
 
A
L
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
T
S
 
N
T
 
Q
A
 
V
I
 
I
Y
 
Y
A
 
R
L
 
I
L
 
L
Q
 
-
L
 
I
A
 
F
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
S
 
S
V
 
L
P
 
A
T
 
V
E
 
L
M
 
L
L
 
S
A
 
L
N
 
M
G
 
P
W
 
W
A
 
T
S
 
R
V
 
V
T
 
T
K
 
A
E
 
D
L
 
T
A
 
S
L
 
-
P
 
P
Y
 
F
R
 
V
D
 
L
I
 
I
A
 
F
L
 
H
A
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
D
G
 
T
W
 
F
L
 
V
A
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
L
Y
 
N
L
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
D
 
T
A
 
A
V
 
A
I
 
L
S
 
S
P
 
V
-
 
Y
S
 
N
G
 
S
C
 
C
G
 
-
N
 
-
I
 
V
Y
 
Y
M
 
C
N
 
N
A
 
S
T
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
M
I
 
L
Y
 
F
G
 
G
W
 
L
A
 
A
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
G
T
 
N
F
 
A
F
 
P
K
 
K
Y
 
A
F
 
L
T
 
A
R
 
S
I
 
V
D
 
D
A
 
-
E
 
K
S
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
P
R
 
V
P
 
N
A
 
T
L
 
I
W
 
L
L
 
V
T
 
S
F
 
A
G
 
L
L
 
V
S
 
T
V
 
A
F
 
L
W
 
C
T
 
V
L
 
L
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
P
 
P
F
 
E
P
 
S
S
 
A
W
 
F
E
 
G
A
 
L
L
 
L
I
 
M
N
 
A
V
 
L
V
 
V
S
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
N
Y
 
W
A
 
A
V
 
M
A
 
I
P
 
S
V
 
L
S
 
A
V
 
H
A
 
M
A
 
K
L
 
F
R
 
R
R
 
R

7cmiB The lat2-4f2hc complex in complex with leucine (see paper)
24% identity, 71% coverage: 17:398/537 of query aligns to 8:383/458 of 7cmiB

query
sites
7cmiB
I
 
I
G
 
I
L
 
V
G
 
G
A
 
N
I
|
I
F
 
I
G
|
G
S
|
S
G
|
G
W
 
I
L
 
F
F
 
V
A
 
S
A
 
P
S
 
K
H
 
G
V
 
V
S
 
L
A
 
E
I
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
S
A
 
V
G
 
G
I
 
L
-
 
A
-
 
L
L
 
I
S
 
V
W
 
W
F
 
I
L
 
V
G
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
I
V
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
G
G
 
A
I
 
L
V
 
C
Y
 
Y
C
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
T
L
 
I
P
 
P
R
 
K
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
D
V
 
Y
R
 
S
Y
 
Y
P
 
V
V
 
K
Y
 
D
S
 
I
H
 
F
G
 
G
P
 
G
L
 
L
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
L
 
L
M
 
R
G
 
L
F
 
W
I
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
L
A
 
V
F
 
I
-
 
Y
-
 
P
S
 
T
S
x
N
L
 
Q
I
 
A
A
 
V
I
 
I
E
 
A
V
 
L
V
 
T
A
 
F
S
 
S
R
 
N
Q
 
Y
Y
 
V
A
 
L
A
 
Q
A
 
P
W
 
L
F
 
F
P
 
P
G
 
T
L
 
C
T
 
F
K
 
P
A
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
G
D
 
L
P
 
R
T
 
L
V
 
L
L
 
A
G
 
A
W
 
I
L
 
C
V
 
L
Q
 
L
F
 
L
A
 
L
L
 
T
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
F
 
-
F
 
W
L
 
V
N
 
N
Y
 
C
R
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
R
T
 
W
F
 
A
A
 
T
K
 
R
A
 
V
N
 
Q
N
 
D
L
 
I
V
 
F
S
 
T
V
 
A
F
 
G
K
 
K
F
 
L
I
 
L
V
 
A
P
 
L
L
 
A
L
 
L
V
 
I
I
 
I
-
 
I
-
 
M
G
 
G
V
 
I
L
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
C
-
 
K
-
 
G
-
 
E
F
 
Y
T
 
F
F
 
W
F
 
L
K
 
E
P
 
P
E
 
K
N
 
N
F
 
-
E
 
A
V
 
F
Q
 
E
G
 
N
F
 
F
A
 
Q
P
 
E
F
 
P
G
 
D
L
 
I
S
 
G
G
 
L
V
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
A
 
Q
G
 
G
G
 
S
I
 
-
I
 
-
F
|
F
A
|
A
Y
 
Y
L
x
G
G
 
G
L
 
W
T
 
N
P
 
F
I
 
L
I
 
N
S
 
Y
V
 
V
A
 
T
S
 
E
E
 
E
V
 
L
K
 
V
N
 
D
P
 
P
Q
 
Y
R
 
K
T
 
N
I
 
L
P
 
P
I
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
F
L
 
I
S
 
S
V
 
I
L
 
P
L
 
L
S
 
V
T
 
T
A
 
F
I
 
V
Y
 
Y
A
 
V
L
 
F
L
 
A
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
Y
L
 
V
G
 
T
S
 
A
V
 
M
-
 
S
P
 
P
T
 
Q
E
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
S
G
 
N
W
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
V
T
 
T
K
 
F
E
 
G
L
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
-
Y
 
-
R
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
L
G
 
G
W
 
V
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
L
 
I
V
 
M
V
 
P
A
 
I
D
 
S
A
 
V
V
 
A
I
 
L
S
 
S
P
 
T
S
 
F
G
 
G
C
 
G
G
 
V
N
 
N
I
 
G
Y
 
S
M
 
L
N
 
F
A
 
T
T
 
S
P
 
S
R
 
R
V
 
L
I
 
F
Y
 
F
G
 
A
W
 
G
A
 
A
Q
 
R
T
 
E
G
 
G
T
 
H
F
 
L
F
 
P
K
 
S
Y
 
V
F
 
L
T
 
A
R
 
M
I
 
I
D
 
H
A
 
V
E
 
K
S
 
R
G
 
C
I
 
T
P
 
P
R
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
W
 
L
L
 
F
T
 
T
F
 
-
G
 
C
L
 
I
S
 
S
V
 
T
F
 
L
W
 
L
T
 
M
L
 
L
P
 
V
F
 
T
P
 
S
S
 
D
W
 
M
E
 
Y
A
 
T
L
 
L
I
 
I
N
 
N
V
 
Y
V
 
V
S
 
G
A
 
F
A
 
I
L
 
N
V
 
Y
L
 
L
S
 
F
Y
 
Y
A
 
G
V
 
V
A
 
T
P
 
V
V
 
A
S
 
G
V
 
Q
A
 
I
A
 
V
L
 
L