SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1346 FitnessBrowser__Putida:PP_1346 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

Q04728 Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ, mitochondrial; Extracellular mutant protein 40; EC 2.3.1.35; EC 2.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 16:405/405 of query aligns to 31:441/441 of Q04728

query
sites
Q04728
G
 
G
F
 
F
E
 
E
L
 
V
G
 
G
I
 
Y
A
 
T
S
 
A
A
 
S
G
 
G
I
 
V
K
 
K
R
 
K
P
 
N
G
 
G
R
 
S
K
 
L
D
 
D
V
 
L
-
 
G
V
 
V
V
 
I
M
 
L
R
 
N
C
 
T
A
 
N
E
 
K
G
 
S
-
 
R
-
 
P
S
 
S
S
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
V
F
 
F
T
 
T
L
 
T
N
 
N
A
 
K
F
 
F
C
 
K
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
L
L
 
T
S
 
S
K
 
K
Q
 
K
R
 
V
V
 
L
Q
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
G
G
 
K
T
 
N
V
 
I
R
 
N
Y
 
A
L
 
I
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
S
G
 
G
N
 
C
A
 
A
N
 
N
A
 
S
G
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
D
P
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
K
A
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
V
T
 
M
C
 
I
A
 
D
K
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
D
L
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
-
P
 
Q
A
 
K
E
 
N
S
 
S
V
 
T
L
 
L
P
 
V
F
 
M
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
Q
P
 
R
L
 
L
P
 
Q
V
 
M
E
 
D
K
 
K
I
 
I
E
 
S
G
 
T
A
 
G
L
 
I
Q
 
N
A
 
K
A
 
I
L
 
F
D
 
G
N
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
G
L
 
S
S
 
D
E
 
F
N
 
N
N
 
S
W
 
W
A
 
L
E
 
N
A
 
V
A
 
A
T
 
K
G
 
S
I
 
I
M
 
C
T
 
T
T
 
T
D
 
D
T
 
T
L
 
F
P
 
P
K
 
K
G
 
L
A
 
V
S
 
T
R
 
S
Q
 
R
F
 
F
Q
 
K
H
 
L
-
 
P
D
 
S
G
 
G
V
 
T
T
 
E
V
 
Y
T
 
T
V
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
M
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
M
 
M
I
 
I
R
 
C
P
 
P
N
 
N
M
 
M
A
 
A
T
|
T
M
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
T
D
 
D
A
 
L
K
 
P
V
 
I
A
 
E
P
 
S
K
 
K
V
 
A
L
 
L
K
 
Q
D
 
K
L
 
M
M
 
L
L
 
T
D
 
F
G
 
A
A
 
T
N
 
T
K
 
R
S
 
S
F
 
F
N
 
N
R
 
C
I
 
I
T
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
M
S
 
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
C
 
T
C
 
I
M
 
C
L
 
M
I
 
L
A
 
A
T
 
N
G
 
G
K
 
A
A
 
I
D
 
D
L
 
T
P
 
K
E
 
E
V
 
I
T
 
N
E
 
E
A
 
D
S
 
S
G
 
K
A
 
D
L
 
-
F
 
F
E
 
E
A
 
Q
L
 
V
K
 
K
K
 
L
A
 
Q
V
 
V
F
 
T
E
 
E
V
 
F
C
 
A
M
 
Q
E
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
L
I
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
S
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
V
T
 
T
V
 
V
Q
 
N
V
 
V
N
 
K
G
 
N
G
 
A
G
 
L
N
 
H
H
 
F
Q
 
E
E
 
D
C
 
A
L
 
K
D
 
I
V
 
I
G
 
A
Y
 
E
A
 
S
V
 
I
A
 
S
H
 
N
S
 
S
P
 
M
L
 
L
I
 
V
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
G
S
 
Q
D
 
D
P
 
A
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
L
A
 
C
A
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
G
 
K
V
 
L
P
 
N
E
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
N
L
 
K
I
 
I
D
 
N
V
 
V
Y
 
S
L
 
F
-
 
I
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
P
D
 
R
S
 
E
V
 
L
C
 
K
I
 
L
A
 
V
S
 
A
K
 
N
G
 
G
G
 
V
R
 
P
S
 
Q
P
 
L
S
 
E
Y
 
I
T
 
D
E
 
E
A
 
T
Q
 
R
G
 
A
S
 
S
A
 
E
V
 
I
M
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
N
E
 
D
I
 
L
T
 
E
I
 
V
R
 
S
I
 
V
E
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
T
G
 
G
Q
 
D
C
 
Q
S
 
A
E
 
A
T
 
Q
I
 
F
W
 
W
T
 
T
T
 
C
D
 
D
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
K
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
G
E
 
D
Y
 
Y
R
 
R
T
 
S

Sites not aligning to the query:

Q07908 Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ; EC 2.3.1.35; EC 2.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 16:405/405 of query aligns to 23:410/410 of Q07908

query
sites
Q07908
G
 
G
F
 
F
E
 
Q
L
 
A
G
 
A
I
 
G
A
 
V
S
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
K
 
-
R
 
R
P
 
Y
G
 
S
R
 
K
K
 
N
D
 
D
V
 
L
V
 
G
V
 
V
M
 
I
R
 
L
C
 
C
A
 
D
E
 
V
G
 
P
S
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
V
F
 
Y
T
 
T
L
 
Q
N
 
S
A
 
H
F
 
F
C
 
Q
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
L
I
 
K
L
 
V
S
 
T
K
 
Q
Q
 
A
R
 
S
-
 
L
-
 
A
V
 
V
Q
 
E
G
 
Q
T
 
K
V
 
L
R
 
Q
Y
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
V
N
 
N
T
 
R
G
 
P
N
 
C
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
C
T
 
T
G
 
G
A
 
A
P
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
K
A
 
D
A
 
A
E
 
Y
R
 
E
T
 
M
C
 
R
A
 
E
K
 
L
L
 
C
A
 
A
E
 
K
L
 
Q
A
 
F
G
 
G
V
 
L
P
 
A
A
 
L
E
 
H
S
 
H
V
 
V
L
 
A
P
 
V
F
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
Y
L
 
L
P
 
P
V
 
M
E
 
E
K
 
K
I
 
I
E
 
R
G
 
A
A
 
G
L
 
I
Q
 
K
A
 
Q
A
 
L
L
 
V
D
 
P
N
 
G
L
 
V
S
 
T
E
 
M
N
 
A
N
 
D
W
 
A
A
 
E
E
 
A
A
 
F
A
 
Q
T
 
T
G
 
A
I
 
I
M
 
L
T
 
T
T
 
T
D
 
D
T
 
T
L
 
V
P
 
M
K
 
K
G
 
R
A
 
A
S
 
C
R
 
Y
Q
 
Q
F
 
T
Q
 
T
H
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
K
T
 
T
V
 
V
T
 
T
V
 
V
T
 
G
G
 
G
I
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
S
G
 
G
M
 
M
I
 
I
R
 
H
P
 
P
N
 
N
M
 
M
A
 
A
T
|
T
M
 
M
L
 
L
G
 
A
Y
 
F
I
 
I
A
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
A
K
 
N
V
 
V
A
 
S
P
 
S
K
 
P
V
 
V
L
 
L
K
 
H
D
 
A
L
 
A
M
 
L
L
 
R
D
 
S
G
 
I
A
 
T
N
 
D
K
 
V
S
 
S
F
 
F
N
 
N
R
 
Q
I
 
I
T
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
D
T
 
T
S
 
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
C
 
M
C
 
V
M
 
V
L
 
V
I
 
M
A
 
A
T
 
S
G
 
G
K
 
L
A
 
A
D
 
G
L
 
N
P
 
D
E
 
E
V
 
L
T
 
T
E
 
P
A
 
D
S
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
W
G
 
E
A
 
N
L
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
R
K
 
K
A
 
-
V
 
-
F
 
-
E
 
-
V
 
T
C
 
C
M
 
E
E
 
D
V
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
Q
I
 
I
V
 
A
R
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
T
K
 
K
F
 
L
V
 
I
T
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
N
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
K
N
 
T
H
 
D
Q
 
E
E
 
E
C
 
A
L
 
K
D
 
K
V
 
I
G
 
A
Y
 
K
A
 
Q
V
 
I
A
 
V
H
 
G
S
 
S
P
 
N
L
 
L
I
 
V
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
V
F
 
Y
A
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
A
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
S
G
 
D
V
 
A
P
 
-
E
 
E
L
 
V
D
 
N
V
 
P
S
 
D
L
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
V
Y
 
A
L
 
I
D
 
G
S
 
P
V
 
M
C
 
V
I
 
M
A
 
L
S
 
-
K
 
K
G
 
G
G
 
S
R
 
E
S
 
P
P
 
Q
S
 
P
Y
 
F
T
 
S
E
 
E
A
 
E
Q
 
E
G
 
A
S
 
A
A
 
A
V
 
Y
M
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
E
 
E
E
 
T
I
 
V
T
 
V
I
 
I
R
 
E
I
 
V
E
 
D
L
 
L
G
 
H
R
 
I
G
 
G
Q
 
D
C
 
G
S
 
V
E
 
G
T
 
V
I
 
A
W
 
W
T
 
G
T
 
C
D
 
D
L
 
L
S
 
T
H
 
Y
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
K
 
K
I
 
I
N
 
N
A
 
A
E
 
S
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T

P0DJQ5 Glutamate N-acetyltransferase 2; Ornithine acetyltransferase 2; Ornithine transacetylase 2; OATase 2; EC 2.3.1.35 from Streptomyces clavuligerus (see 2 papers)
34% identity, 96% coverage: 16:405/405 of query aligns to 11:393/393 of P0DJQ5

query
sites
P0DJQ5
G
 
G
F
 
F
E
 
V
L
 
V
G
 
H
I
 
T
A
 
A
S
 
P
A
 
V
G
 
G
I
 
L
K
 
A
R
 
D
P
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
D
D
 
D
V
 
F
V
 
T
V
 
V
M
 
L
R
 
A
C
 
S
A
 
T
E
 
A
G
 
P
S
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
T
 
T
L
 
R
N
 
S
A
 
R
F
 
F
C
 
A
A
 
G
A
 
P
P
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
S
 
C
K
 
R
Q
 
E
R
 
A
V
 
V
-
 
A
Q
 
D
G
 
G
T
 
Q
V
 
A
R
 
R
Y
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
V
N
 
L
T
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
N
 
N
A
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
E
G
 
G
L
 
E
A
 
E
A
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
E
T
 
V
C
 
R
A
 
E
K
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
R
L
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
G
S
 
E
V
 
M
L
 
L
P
 
I
F
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
R
P
 
Q
L
 
Y
P
 
P
V
 
M
E
 
E
K
 
S
I
 
I
E
 
R
G
 
E
A
 
H
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
A
 
L
L
 
E
D
 
W
N
 
P
L
 
A
S
 
G
E
 
E
N
 
G
N
 
G
W
 
F
A
 
D
E
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
R
G
 
A
I
 
I
M
 
M
T
|
T
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
R
P
 
P
K
 
K
G
 
E
A
 
V
S
 
R
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
Q
 
-
H
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
V
T
 
S
V
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
A
T
 
T
V
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
L
R
 
E
P
 
P
N
 
D
M
 
M
A
 
A
T
|
T
M
 
L
L
 
L
G
 
T
Y
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
A
K
 
R
V
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
A
V
 
E
L
 
Q
K
 
D
D
 
R
L
 
L
M
 
F
L
 
R
D
 
R
G
 
V
A
 
M
N
 
D
K
 
R
S
 
T
F
 
F
N
 
N
R
 
A
I
 
V
T
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
T
D
 
D
T
 
T
S
 
S
T
 
T
N
 
S
D
 
D
C
 
T
C
 
A
M
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
A
T
 
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
D
 
-
L
 
-
P
 
G
E
 
E
V
 
V
T
 
D
E
 
-
A
 
-
S
 
A
G
 
G
A
 
E
L
 
F
F
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
H
K
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
L
E
 
A
V
 
L
C
 
V
M
 
K
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
A
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
G
E
|
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
K
 
K
F
 
L
V
 
I
T
 
E
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
R
N
 
D
H
 
D
Q
 
A
E
 
Q
C
 
A
L
 
K
D
 
R
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
A
 
T
V
 
V
A
 
V
H
 
N
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
V
F
 
H
A
 
G
S
 
C
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
V
L
 
A
A
 
M
A
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
K
-
 
C
A
 
S
G
 
D
V
 
D
P
 
T
E
 
D
L
 
I
D
 
D
V
 
Q
S
 
E
L
 
R
I
 
V
D
 
T
V
 
I
Y
 
R
L
 
F
D
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
E
I
 
V
A
 
Y
S
 
P
K
 
P
G
 
K
G
 
A
R
 
R
S
 
G
P
 
D
S
 
Q
Y
 
A
T
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
L
G
 
R
S
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
A
A
 
E
Q
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
G
E
 
D
E
 
E
I
 
V
T
 
V
I
 
I
R
 
G
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
A
R
 
I
G
 
A
Q
 
D
C
 
G
S
 
A
E
 
F
T
 
T
I
 
V
W
 
Y
T
 
G
T
 
C
D
 
D
L
 
L
S
 
T
H
 
E
E
 
G
Y
 
Y
V
 
V
K
 
R
I
 
L
N
|
N
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
R
 
T
T
|
T

2yepB Structure of an n-terminal nucleophile (ntn) hydrolase, oat2, in complex with glutamate (see paper)
34% identity, 54% coverage: 189:405/405 of query aligns to 1:213/213 of 2yepB

query
sites
2yepB
T
|
T
M
 
L
L
 
L
G
 
T
Y
 
F
I
 
F
A
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
A
K
 
R
V
 
L
A
 
D
P
 
P
K
 
A
V
 
E
L
 
Q
K
 
D
D
 
R
L
 
L
M
 
F
L
 
R
D
 
R
G
 
V
A
 
M
N
 
D
K
 
R
S
 
T
F
 
F
N
 
N
R
 
A
I
 
V
T
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
T
D
 
D
T
 
T
S
 
S
T
 
T
N
 
S
D
 
D
C
 
T
C
 
A
M
 
V
L
 
L
I
 
F
A
 
A
T
 
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
D
 
-
L
 
-
P
 
G
E
 
E
V
 
V
T
 
D
E
 
-
A
 
-
S
 
A
G
 
G
A
 
E
L
 
F
F
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
H
K
 
T
A
 
A
V
 
A
F
 
L
E
 
A
V
 
L
C
 
V
M
 
K
E
 
D
V
 
I
A
 
A
Q
 
S
A
 
-
I
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
T
 
A
K
 
K
F
 
L
V
 
I
T
 
E
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
R
N
 
D
H
 
D
Q
 
A
E
 
Q
C
 
A
L
 
K
D
 
R
V
 
V
G
 
G
Y
 
K
A
 
T
V
 
V
A
 
V
H
 
N
S
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
V
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
V
F
 
H
A
 
G
S
 
C
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
V
L
 
A
A
 
M
A
 
A
V
 
I
G
 
G
R
 
K
-
 
C
A
 
S
G
 
D
V
 
D
P
 
T
E
 
D
L
 
I
D
 
D
V
 
Q
S
 
E
L
 
R
I
 
V
D
 
T
V
 
I
Y
 
R
L
 
F
D
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
E
I
 
V
A
 
Y
S
 
P
K
 
P
G
 
K
G
 
A
R
 
R
S
 
G
P
 
D
S
 
Q
Y
 
A
T
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
L
G
 
R
S
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
A
A
 
E
Q
 
H
-
 
L
-
 
R
-
 
G
E
 
D
E
 
E
I
 
V
T
 
V
I
 
I
R
 
G
I
 
I
E
 
D
L
 
L
G
 
A
R
 
I
G
 
A
Q
 
D
C
 
G
S
 
A
E
 
F
T
 
T
I
 
V
W
 
Y
T
 
G
T
 
C
D
 
D
L
 
L
S
 
T
H
 
E
E
 
G
Y
 
Y
V
 
V
K
 
R
I
 
L
N
 
N
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
R
 
T
T
|
T

3it6B The crystal structure of ornithine acetyltransferase complexed with ornithine from mycobacterium tuberculosis (rv1653) at 2.4 a (see paper)
37% identity, 54% coverage: 189:405/405 of query aligns to 1:205/205 of 3it6B

query
sites
3it6B
T
|
T
M
 
M
L
 
L
G
 
C
Y
 
V
I
 
L
A
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
A
K
 
A
V
 
A
A
 
E
P
 
P
K
 
A
V
 
A
L
 
L
K
 
E
D
 
R
L
 
A
M
 
L
L
 
R
D
 
R
G
 
A
A
 
A
N
 
A
K
 
A
S
 
T
F
 
F
N
 
D
R
 
R
I
 
L
T
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
D
 
S
T
 
C
S
 
S
T
 
T
N
 
N
D
 
D
C
 
T
C
 
V
M
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
S
T
 
S
G
 
G
K
 
A
A
 
S
D
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
P
V
 
A
T
 
Q
E
 
A
A
 
D
S
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
L
K
 
D
K
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
L
E
 
R
V
 
V
C
 
C
M
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
C
Q
 
A
A
 
Q
I
 
L
V
 
Q
R
 
A
D
 
D
G
 
A
E
|
E
G
 
G
A
 
V
T
 
T
K
 
K
F
 
R
V
 
V
T
 
T
V
 
V
Q
 
T
V
 
V
N
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
A
N
 
T
H
 
E
Q
 
D
E
 
D
C
 
A
L
 
L
D
 
V
V
 
A
G
 
A
Y
 
R
A
 
Q
V
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
D
P
 
S
L
 
L
I
 
V
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
G
S
 
S
D
 
D
P
 
P
N
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
G
R
 
M
A
 
A
G
 
P
V
 
I
P
 
-
E
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
P
S
 
D
L
 
R
I
 
I
D
 
S
V
 
V
Y
 
S
L
 
F
D
 
N
S
 
G
V
 
A
C
 
A
I
 
V
A
 
C
S
 
V
K
 
H
G
 
G
G
 
V
R
 
G
S
 
A
P
 
P
S
 
G
Y
 
A
T
 
R
E
 
E
A
 
V
Q
 
D
G
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
L
A
 
S
Q
 
D
E
 
A
E
 
D
I
 
I
T
 
D
I
 
I
R
 
T
I
 
V
E
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
V
G
 
G
Q
 
D
C
 
G
S
 
Q
E
 
A
T
 
R
I
 
I
W
 
R
T
 
T
T
 
T
D
 
D
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
 
A
Y
 
Y
V
 
V
K
 
E
I
 
E
N
|
N
A
 
S
E
 
A
Y
 
Y
R
 
S
T
x
S

2yepA Structure of an n-terminal nucleophile (ntn) hydrolase, oat2, in complex with glutamate (see paper)
34% identity, 43% coverage: 16:188/405 of query aligns to 4:173/173 of 2yepA

query
sites
2yepA
G
 
G
F
 
F
E
 
V
L
 
V
G
 
H
I
 
T
A
 
A
S
 
P
A
 
V
G
 
G
I
 
L
K
 
A
R
 
D
P
 
D
G
 
G
R
 
R
K
 
D
D
 
D
V
 
F
V
 
T
V
 
V
M
 
L
R
 
A
C
 
S
A
 
T
E
 
A
G
 
P
S
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
T
 
T
L
 
R
N
 
S
A
 
R
F
 
F
C
 
A
A
 
G
A
 
P
P
 
S
V
 
V
I
 
V
L
 
L
S
 
C
K
 
R
Q
 
E
R
 
A
V
 
V
-
 
A
Q
 
D
G
 
G
T
 
Q
V
 
A
R
 
R
Y
 
G
L
 
V
L
 
V
T
 
V
N
 
L
T
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
N
 
N
A
 
V
G
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
E
G
 
G
L
 
E
A
 
E
A
 
N
A
 
A
E
 
R
R
 
E
T
 
V
C
 
R
A
 
E
K
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
R
L
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
A
 
E
E
 
G
S
 
E
V
 
M
L
 
L
P
 
I
F
 
A
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
R
P
 
Q
L
 
Y
P
 
P
V
 
M
E
 
E
K
 
S
I
 
I
E
 
R
G
 
E
A
 
H
L
 
L
Q
 
K
A
 
T
A
 
L
L
 
E
D
 
W
N
 
P
L
 
A
S
 
G
E
 
E
N
 
G
N
 
G
W
 
F
A
 
D
E
 
R
A
 
A
A
 
A
T
 
R
G
 
A
I
 
I
M
 
M
T
|
T
T
|
T
D
|
D
T
 
T
L
 
R
P
 
P
K
 
K
G
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
E
F
 
V
Q
 
R
H
 
V
D
 
S
G
 
V
V
 
G
T
 
G
V
 
A
T
 
T
V
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
A
K
 
K
G
|
G
A
x
V
G
|
G
M
 
M
I
 
L
R
 
E
P
 
P
N
 
D
M
 
M
A
 
A

3it6A The crystal structure of ornithine acetyltransferase complexed with ornithine from mycobacterium tuberculosis (rv1653) at 2.4 a (see paper)
36% identity, 43% coverage: 16:188/405 of query aligns to 15:193/193 of 3it6A

query
sites
3it6A
G
 
G
F
 
F
E
 
R
L
 
A
G
 
A
I
 
G
A
 
V
S
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
K
R
 
A
P
 
S
G
 
G
R
 
A
K
 
L
D
 
D
V
 
L
-
 
A
V
 
L
V
 
V
M
 
F
R
 
N
C
 
E
A
 
G
E
 
P
G
 
D
S
 
Y
S
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
T
 
T
L
 
R
N
 
N
A
 
Q
F
 
V
C
 
K
A
 
A
A
 
A
P
 
P
V
 
V
I
 
L
L
 
W
S
 
T
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
V
V
 
L
Q
 
T
-
 
T
G
 
G
T
 
R
V
 
L
R
 
R
Y
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
L
N
 
N
T
 
S
G
 
G
N
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
C
T
 
T
G
 
G
A
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
D
A
 
T
E
 
H
R
 
A
T
 
T
C
 
A
A
 
E
K
 
A
L
 
V
A
 
A
E
 
A
-
 
A
L
 
L
A
 
S
G
 
D
V
 
W
P
 
G
A
 
T
E
 
E
S
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
E
V
 
V
L
 
A
P
 
V
F
 
C
S
 
S
T
 
T
G
 
G
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
D
P
 
R
L
 
L
P
 
P
V
 
M
E
 
D
K
 
K
I
 
L
E
 
L
G
 
A
A
 
G
L
 
V
Q
 
A
A
 
H
A
 
V
L
 
V
D
 
H
N
 
E
L
 
M
S
 
H
E
 
G
N
 
G
-
 
L
-
 
V
N
 
G
W
 
G
A
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
H
G
 
A
I
 
I
M
 
M
T
|
T
T
 
T
D
 
D
T
 
N
L
 
V
P
 
P
K
 
K
G
 
Q
A
 
V
S
 
A
R
 
L
Q
 
H
F
 
-
Q
 
H
H
 
H
D
 
D
G
 
-
V
 
-
T
 
N
V
 
W
T
 
T
V
 
V
T
 
G
G
 
G
I
 
M
S
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
M
|
M
I
 
L
R
 
A
P
 
P
N
 
S
M
 
L
A
 
A

Query Sequence

>PP_1346 FitnessBrowser__Putida:PP_1346
MAVGLGPLPTLHPVPGFELGIASAGIKRPGRKDVVVMRCAEGSSVAGVFTLNAFCAAPVI
LSKQRVQGTVRYLLTNTGNANAGTGAPGLAAAERTCAKLAELAGVPAESVLPFSTGVIGE
PLPVEKIEGALQAALDNLSENNWAEAATGIMTTDTLPKGASRQFQHDGVTVTVTGISKGA
GMIRPNMATMLGYIATDAKVAPKVLKDLMLDGANKSFNRITIDGDTSTNDCCMLIATGKA
DLPEVTEASGALFEALKKAVFEVCMEVAQAIVRDGEGATKFVTVQVNGGGNHQECLDVGY
AVAHSPLIKTALFASDPNWGRILAAVGRAGVPELDVSLIDVYLDSVCIASKGGRSPSYTE
AQGSAVMAQEEITIRIELGRGQCSETIWTTDLSHEYVKINAEYRT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory