SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1785 FitnessBrowser__Putida:PP_1785 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P27830 dTDP-glucose 4,6-dehydratase 2; EC 4.2.1.46 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
63% identity, 96% coverage: 2:354/366 of query aligns to 4:347/355 of P27830

query
sites
P27830
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
L
V
 
V
L
 
R
Q
 
Y
W
 
I
C
 
I
A
 
N
H
 
E
N
 
T
E
 
S
E
 
D
P
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
V
L
 
V
D
|
D
A
x
K
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
M
N
 
S
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
L
 
V
E
 
A
G
 
Q
N
 
S
P
 
E
Q
 
R
H
 
F
R
 
A
F
 
F
V
 
E
Q
 
K
G
 
V
N
x
D
I
|
I
C
 
C
D
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
E
L
 
L
T
 
A
K
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
H
 
H
R
 
Q
P
 
P
R
 
D
A
 
C
V
 
V
V
 
M
H
 
H
F
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
D
G
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
M
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
W
 
W
N
 
N
S
 
A
L
 
L
E
 
T
G
 
E
A
 
D
E
 
K
K
 
K
E
 
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
F
 
F
L
 
H
H
 
H
V
 
I
S
 
S
T
 
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
L
G
 
H
P
 
S
N
 
T
D
 
D
P
 
D
A
 
F
F
 
F
T
 
T
E
 
E
T
 
T
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
N
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
A
Y
 
W
F
 
L
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
L
T
 
I
T
 
T
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
 
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
H
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
M
I
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
H
 
H
C
 
A
S
 
R
G
 
A
I
 
L
R
 
Y
R
 
C
V
 
V
L
 
A
E
 
T
A
 
T
G
 
G
A
 
K
F
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
H
N
 
N
E
 
E
K
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
C
S
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
N
Q
 
K
K
 
P
T
 
H
G
 
G
E
 
-
P
 
-
V
 
V
E
 
A
Q
 
H
Y
 
Y
A
 
R
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
T
Y
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
S
K
 
K
I
 
I
E
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
L
P
 
P
A
 
Q
E
 
E
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
G
 
G
I
 
M
R
 
R
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
E
K
 
S
W
 
W
V
 
W
K
 
K
G
 
Q
V
 
V
M
 
Q
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
R
 
Q

1kewA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from salmonella enterica serovar typhimurium with thymidine diphosphate bound (see paper)
59% identity, 98% coverage: 2:361/366 of query aligns to 3:357/361 of 1kewA

query
sites
1kewA
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
V
V
 
V
L
 
R
Q
 
H
W
 
I
C
 
I
A
 
K
H
 
N
N
 
T
E
 
Q
E
 
D
P
 
T
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
I
D
|
D
A
x
K
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
G
|
G
N
 
N
L
 
L
A
 
E
N
 
S
L
 
L
Q
 
S
P
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
E
N
 
S
P
 
N
Q
 
R
H
 
Y
R
 
N
F
 
F
V
 
E
Q
 
H
G
 
A
N
x
D
I
|
I
C
 
C
D
 
D
A
 
S
A
 
A
L
 
E
L
 
I
T
 
T
K
 
R
L
 
I
F
 
F
A
 
E
E
 
Q
H
 
Y
R
 
Q
P
 
P
R
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
M
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
K
H
 
Y
W
 
W
N
 
S
S
 
A
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
D
E
 
K
K
 
K
E
 
N
A
 
N
F
 
F
R
 
R
F
 
F
L
 
H
H
 
H
V
x
I
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
L
G
 
P
P
 
H
N
 
P
D
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
x
L
P
 
P
A
x
L
F
|
F
T
 
T
E
 
E
T
|
T
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
N
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
A
Y
 
W
F
 
R
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
T
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
H
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
|
K
L
|
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
P
L
 
L
P
|
P
V
 
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
K
G
 
G
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
H
 
H
C
 
A
S
 
R
G
 
A
I
 
L
R
 
H
R
 
M
V
 
V
L
 
V
E
 
T
A
 
E
G
 
G
A
 
K
F
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
H
N
 
N
E
 
E
K
 
K
A
 
K
N
|
N
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
F
T
 
T
L
 
I
C
 
C
S
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
A
S
 
T
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
Q
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
T
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
K
 
N
G
 
N
V
 
V
M
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
S
W
 
W
V
 
I
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
N
Y
|
Y

1keuA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from salmonella enterica serovar typhimurium with dtdp-d-glucose bound (see paper)
59% identity, 98% coverage: 2:361/366 of query aligns to 3:357/361 of 1keuA

query
sites
1keuA
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
V
V
 
V
L
 
R
Q
 
H
W
 
I
C
 
I
A
 
K
H
 
N
N
 
T
E
 
Q
E
 
D
P
 
T
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
I
D
|
D
A
x
K
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
|
G
N
 
N
L
 
L
A
 
E
N
 
S
L
 
L
Q
 
S
P
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
E
N
 
S
P
 
N
Q
 
R
H
 
Y
R
 
N
F
 
F
V
 
E
Q
 
H
G
 
A
N
x
D
I
 
I
C
 
C
D
 
D
A
 
S
A
 
A
L
 
E
L
 
I
T
 
T
K
 
R
L
 
I
F
 
F
A
 
E
E
 
Q
H
 
Y
R
 
Q
P
 
P
R
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
M
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
K
H
 
Y
W
 
W
N
 
S
S
 
A
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
D
E
 
K
K
 
K
E
 
N
A
 
N
F
 
F
R
 
R
F
 
F
L
 
H
H
 
H
V
 
I
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
L
G
 
P
P
 
H
N
 
P
D
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
x
L
P
 
P
A
x
L
F
|
F
T
 
T
E
 
E
T
|
T
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
N
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
A
Y
 
W
F
 
R
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
T
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
H
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
|
K
L
|
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
P
L
 
L
P
|
P
V
 
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
K
G
 
G
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
H
 
H
C
 
A
S
 
R
G
 
A
I
 
L
R
 
H
R
 
M
V
 
V
L
 
V
E
 
T
A
 
E
G
 
G
A
 
K
F
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
H
N
 
N
E
 
E
K
 
K
A
 
K
N
|
N
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
F
T
 
T
L
 
I
C
 
C
S
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
A
S
 
T
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
Q
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
P
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
T
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
K
 
N
G
 
N
V
 
V
M
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
S
W
 
W
V
 
I
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
N
Y
|
Y

P26391 dTDP-glucose 4,6-dehydratase; EC 4.2.1.46 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
59% identity, 98% coverage: 2:361/366 of query aligns to 3:357/361 of P26391

query
sites
P26391
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
V
V
 
V
L
 
R
Q
 
H
W
 
I
C
 
I
A
 
K
H
 
N
N
 
T
E
 
Q
E
 
D
P
 
T
V
 
V
L
 
V
N
 
N
L
 
I
D
|
D
A
x
K
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
A
 
E
N
 
S
L
 
L
Q
 
S
P
 
D
L
 
I
E
 
S
G
 
E
N
 
S
P
 
N
Q
 
R
H
 
Y
R
 
N
F
 
F
V
 
E
Q
 
H
G
 
A
N
x
D
I
|
I
C
 
C
D
 
D
A
 
S
A
 
A
L
 
E
L
 
I
T
 
T
K
 
R
L
 
I
F
 
F
A
 
E
E
 
Q
H
 
Y
R
 
Q
P
 
P
R
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
|
E
S
|
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
M
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
K
H
 
Y
W
 
W
N
 
S
S
 
A
L
 
L
E
 
G
G
 
E
A
 
D
E
 
K
K
 
K
E
 
N
A
 
N
F
 
F
R
 
R
F
 
F
L
 
H
H
 
H
V
 
I
S
 
S
T
|
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
L
G
 
P
P
 
H
N
 
P
D
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
V
-
 
T
-
 
L
P
 
P
A
 
L
F
 
F
T
 
T
E
 
E
T
 
T
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
N
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
A
Y
 
W
F
 
R
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
T
N
 
N
C
 
C
S
 
S
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
H
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
|
K
L
|
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
V
I
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
P
L
 
L
P
|
P
V
x
I
Y
|
Y
G
 
G
D
 
K
G
 
G
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
I
R
|
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
H
 
H
C
 
A
S
 
R
G
 
A
I
 
L
R
 
H
R
 
M
V
 
V
L
 
V
E
 
T
A
 
E
G
 
G
A
 
K
F
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
H
N
 
N
E
 
E
K
 
K
A
 
K
N
|
N
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
F
T
 
T
L
 
I
C
 
C
S
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
M
 
I
A
 
V
P
 
P
A
 
K
A
 
A
S
 
T
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
L
 
Q
I
 
I
A
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
|
D
R
|
R
P
|
P
G
|
G
H
|
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
L
E
 
E
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
T
K
 
Q
W
 
W
V
 
V
K
 
N
G
 
N
V
 
V
M
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
S
W
 
W
V
 
I
A
 
E
Q
 
Q
Q
 
N
Y
|
Y

1bxkB Dtdp-glucose 4,6-dehydratase from e. Coli
61% identity, 96% coverage: 2:354/366 of query aligns to 4:341/344 of 1bxkB

query
sites
1bxkB
I
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
A
F
 
L
V
 
V
L
 
R
Q
 
Y
W
 
I
C
 
I
A
 
N
H
 
E
N
 
T
E
 
S
E
 
D
P
 
A
V
 
V
L
 
V
N
 
V
L
 
V
D
|
D
A
x
K
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
G
|
G
N
 
N
L
 
L
A
 
M
N
 
S
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
L
 
V
E
 
A
G
 
Q
N
 
S
P
 
E
Q
 
R
H
 
F
R
 
A
F
 
F
V
 
E
Q
 
K
G
 
V
N
x
D
I
|
I
C
 
C
D
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
E
L
 
L
T
 
A
K
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
T
E
 
E
H
 
H
R
 
Q
P
 
P
R
 
D
A
 
C
V
 
V
V
 
M
H
 
H
F
x
L
A
 
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
D
G
 
G
P
 
P
E
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
M
 
V
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
W
 
W
N
 
N
S
 
A
L
 
L
E
 
T
G
 
E
A
 
D
E
 
K
K
 
K
E
x
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
F
 
F
L
 
H
H
 
H
V
x
I
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
L
G
 
H
P
 
S
N
 
T
D
 
D
P
 
D
A
 
F
F
 
F
T
 
T
E
 
E
T
 
T
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
N
 
S
S
|
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
A
Y
 
W
F
 
L
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
P
V
 
T
L
 
L
T
 
I
T
 
T
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
H
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
M
I
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
H
 
H
C
 
A
S
 
R
G
 
A
I
 
L
R
 
Y
R
 
C
V
 
V
L
 
A
E
 
T
A
 
T
G
 
G
A
 
K
F
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
H
N
 
N
E
 
E
K
 
R
A
 
K
N
 
N
I
 
L
D
 
D
I
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
T
L
 
I
C
 
C
S
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
N
Q
 
K
K
 
P
T
 
H
G
 
G
E
 
-
P
 
-
V
 
V
E
 
A
Q
 
H
Y
 
Y
A
 
R
E
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
T
Y
 
F
V
 
V
T
 
A
D
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
H
 
-
D
 
-
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
S
K
 
K
I
 
I
E
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
C
K
 
V
P
 
P
A
 
Q
E
 
E
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
G
 
G
I
 
M
R
 
R
K
 
K
T
 
T
V
 
V
A
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
N
 
N
Q
 
E
K
 
S
W
 
W
V
 
W
K
 
K
G
 
Q
V
 
V
M
 
Q
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Y
 
Y
R
 
Q

8du1A Crystal structure of NAD bound dtdp-glucose 4,6-dehydratase from elizabethkingia anophelis
53% identity, 98% coverage: 2:361/366 of query aligns to 6:360/361 of 8du1A

query
sites
8du1A
I
 
I
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
V
V
 
V
L
 
R
Q
 
E
W
 
F
C
 
V
A
 
I
H
 
K
N
 
N
E
 
P
E
 
E
-
 
I
P
 
T
V
 
I
L
 
I
N
 
N
L
 
L
D
|
D
A
|
A
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
|
G
N
 
N
L
 
L
A
 
E
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
P
 
D
L
 
I
E
 
E
G
 
N
N
 
F
P
 
P
Q
 
N
H
 
Y
R
 
V
F
 
F
V
 
E
Q
 
K
G
 
A
N
x
D
I
|
I
C
 
T
D
 
K
A
 
P
A
 
E
L
 
E
L
 
L
T
 
R
K
 
K
L
 
V
F
 
F
A
 
E
E
 
K
H
 
Y
R
 
N
P
 
P
R
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
D
P
 
P
E
 
N
A
 
A
F
 
F
V
 
I
E
 
N
T
|
T
N
 
N
V
 
V
M
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
A
R
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
E
H
 
F
W
 
W
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
T
N
 
H
S
 
G
L
 
R
E
 
F
G
 
P
A
 
N
E
 
E
K
 
P
E
 
R
A
 
T
F
 
N
R
 
L
F
 
F
L
 
Y
H
 
H
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
 
D
E
 
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
L
 
L
G
 
G
P
 
E
N
 
T
D
 
G
P
 
-
A
 
F
F
 
F
T
 
L
E
 
E
T
 
T
T
 
T
P
 
A
Y
 
Y
A
 
D
P
 
P
N
 
Q
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
H
L
 
L
V
 
V
R
 
R
S
 
A
Y
 
Y
F
 
G
H
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
P
 
P
V
 
F
L
 
I
T
 
V
T
 
S
N
 
N
C
|
C
S
 
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
N
H
 
H
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
C
I
 
I
V
 
S
N
 
N
A
 
I
L
 
L
A
 
N
G
 
E
K
 
K
A
 
P
L
 
L
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
T
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
I
D
 
D
H
 
H
C
 
A
S
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
H
R
 
Q
V
 
I
L
 
F
E
 
N
A
 
E
G
 
A
A
 
K
F
 
T
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
F
N
 
N
E
 
E
K
 
W
A
 
Q
N
 
N
I
 
I
D
 
D
I
 
L
V
 
V
R
 
K
T
 
E
L
 
L
C
 
I
S
 
K
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
E
 
-
M
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
A
K
 
K
T
 
L
G
 
G
E
 
K
P
 
P
V
 
E
E
 
G
Q
 
H
Y
 
S
A
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
T
Y
 
F
V
 
V
T
 
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
K
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
A
R
 
T
K
 
K
I
 
L
E
 
N
R
 
K
E
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
K
 
K
P
 
P
A
 
S
E
 
V
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
A
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
D
N
 
N
Q
 
K
K
 
E
W
 
W
V
 
L
K
 
E
G
 
N
V
 
V
M
 
T
D
 
S
G
 
G
S
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
D
 
K
W
 
Y
V
 
Y
A
 
E
Q
 
N
Q
 
Q
Y
 
Y

6bi4C 2.9 angstrom resolution crystal structure of dtdp-glucose 4,6- dehydratase (rfbb) from bacillus anthracis str. Ames in complex with NAD. (see paper)
47% identity, 94% coverage: 2:346/366 of query aligns to 4:308/311 of 6bi4C

query
sites
6bi4C
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
-
 
H
L
 
Y
Q
 
M
W
 
L
C
 
Q
A
 
S
H
 
Y
N
 
E
E
 
T
E
 
Y
P
 
K
V
 
I
L
 
I
N
 
N
L
 
F
D
|
D
A
|
A
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
x
S
G
|
G
N
 
N
L
 
L
A
 
N
N
 
N
L
 
V
Q
 
K
P
 
S
L
 
I
E
 
Q
G
 
D
N
 
H
P
 
P
Q
 
N
H
 
Y
R
 
Y
F
 
F
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
N
x
E
I
|
I
C
x
Q
D
x
N
A
x
G
A
x
E
L
 
L
L
 
L
T
 
E
K
 
H
L
 
V
F
 
I
A
 
K
E
 
E
H
 
R
R
 
D
P
 
V
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
V
 
V
H
 
N
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
I
V
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
P
F
 
F
V
 
Y
E
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
V
M
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
V
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
V
R
 
K
A
 
K
H
 
Y
W
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
P
A
 
H
F
 
I
R
 
K
F
 
L
L
 
V
H
 
Q
V
|
V
S
 
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
L
 
L
G
 
G
P
 
K
N
 
T
D
 
G
P
 
-
A
 
R
F
 
F
T
 
T
E
 
E
T
 
E
T
 
T
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A
D
 
D
H
 
M
L
 
I
V
 
A
R
 
L
S
 
A
Y
 
Y
F
 
Y
H
 
K
T
 
T
Y
 
Y
G
 
Q
M
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
I
T
 
V
T
 
T
N
 
R
C
|
C
S
|
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
Q
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
M
I
 
V
V
 
T
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
Q
 
N
I
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
E
 
T
D
 
D
H
 
H
C
 
C
S
 
S
G
 
A
I
 
I
R
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
L
E
 
H
A
 
K
G
 
G
A
 
R
F
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
N
N
 
N
E
 
E
K
 
K
A
 
T
N
 
N
I
 
V
D
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
Q
L
 
I
C
 
I
S
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
G
E
 
-
M
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
K
T
 
T
G
 
K
E
 
K
P
 
D
V
 
I
E
 
E
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
A
R
 
E
K
 
K
I
 
M
E
 
K
R
 
N
E
 
E
L
 
F
G
 
D
W
 
W
K
 
E
P
 
P
A
 
K
E
 
Y
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
K
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
L
 
E
A
 
K
N
 
N
Q
 
E
K
 
E
W
 
W
V
 
W
K
 
K

6bi4B 2.9 angstrom resolution crystal structure of dtdp-glucose 4,6- dehydratase (rfbb) from bacillus anthracis str. Ames in complex with NAD. (see paper)
47% identity, 94% coverage: 2:346/366 of query aligns to 4:307/310 of 6bi4B

query
sites
6bi4B
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
-
 
H
L
 
Y
Q
 
M
W
 
L
C
 
Q
A
 
S
H
 
Y
N
 
E
E
 
T
E
 
Y
P
 
K
V
 
I
L
 
I
N
 
N
L
 
F
D
|
D
A
|
A
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
x
S
G
|
G
N
 
N
L
 
L
A
 
N
N
 
N
L
 
V
Q
 
K
P
 
S
L
 
I
E
 
Q
G
 
D
N
 
H
P
 
P
Q
 
N
H
 
Y
R
 
Y
F
 
F
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
N
x
E
I
 
I
C
x
Q
D
x
N
A
 
G
A
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
E
K
 
H
L
 
V
F
 
I
A
 
K
E
 
E
H
 
R
R
 
D
P
 
V
R
 
Q
A
 
V
V
 
I
V
 
V
H
 
N
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
I
V
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
P
F
 
F
V
 
Y
E
 
D
T
|
T
N
 
N
V
 
V
M
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
V
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
V
R
 
K
A
 
K
H
 
Y
W
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
P
A
 
H
F
 
I
R
 
K
F
 
L
L
 
V
H
 
Q
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
L
 
L
G
 
G
P
 
K
N
 
T
D
 
G
P
 
-
A
 
R
F
 
F
T
 
T
E
 
E
T
 
E
T
 
T
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
S
 
A
D
 
D
H
 
M
L
 
I
V
 
A
R
 
L
S
 
A
Y
 
Y
F
 
Y
H
 
K
T
 
T
Y
 
Y
G
 
Q
M
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
I
T
 
V
T
 
T
N
 
R
C
|
C
S
 
S
N
 
N
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
Q
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
M
I
 
V
V
 
T
N
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
Q
 
N
I
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
H
V
 
V
E
 
T
D
 
D
H
 
H
C
 
C
S
 
S
G
 
A
I
 
I
R
 
D
R
 
V
V
 
V
L
 
L
E
 
H
A
 
K
G
 
G
A
 
R
F
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
N
N
 
N
E
 
E
K
 
K
A
 
T
N
 
N
I
 
V
D
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
E
T
 
Q
L
 
I
C
 
I
S
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
G
E
 
-
M
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
K
T
 
T
G
 
K
E
 
K
P
 
D
V
 
I
E
 
E
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
-
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
A
R
 
E
K
 
K
I
 
M
E
 
K
R
 
N
E
 
E
L
 
F
G
 
D
W
 
W
K
 
E
P
 
P
A
 
K
E
 
Y
T
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
K
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
Q
W
 
W
Y
 
Y
L
 
E
A
 
K
N
 
N
Q
 
E
K
 
E
W
 
W
V
 
W
K
 
K

2hunA Crystal structure of hypothetical protein ph0414 from pyrococcus horikoshii ot3
46% identity, 95% coverage: 2:350/366 of query aligns to 4:318/329 of 2hunA

query
sites
2hunA
I
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
M
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
I
L
 
R
Q
 
Y
W
 
I
C
 
L
-
 
E
A
 
K
H
 
H
N
 
P
E
 
D
E
 
W
P
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
I
D
|
D
A
x
K
L
 
L
T
 
G
Y
 
Y
A
 
G
G
x
S
N
 
N
L
 
P
A
 
A
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
P
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
D
N
 
D
P
 
P
Q
 
R
H
 
Y
R
 
T
F
 
F
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
N
x
D
I
x
V
C
 
A
D
 
D
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
K
K
 
E
L
 
L
F
 
V
A
 
-
E
 
-
H
 
R
R
 
K
P
 
V
R
 
D
A
 
G
V
 
V
V
 
V
H
 
H
F
x
L
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
 
S
H
 
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
S
G
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
I
F
 
F
V
 
L
E
 
H
T
x
S
N
 
N
V
 
V
M
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
S
A
 
I
R
 
R
A
 
R
H
 
-
W
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
E
K
 
N
E
 
P
A
 
E
F
 
V
R
 
R
F
 
F
L
 
V
H
 
H
V
 
V
S
 
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
I
G
 
L
P
 
K
N
 
G
D
 
-
P
 
-
A
 
S
F
 
F
T
 
T
E
 
E
T
 
N
T
 
D
P
 
R
Y
 
L
A
 
M
P
 
P
N
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
M
L
 
L
V
 
V
R
 
L
S
 
G
Y
 
W
F
 
T
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
N
M
 
L
P
 
N
V
 
A
L
 
S
T
 
I
T
 
T
N
 
R
C
|
C
S
x
T
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
Q
F
 
F
P
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
K
M
 
T
I
 
I
V
 
I
N
 
R
A
 
A
L
 
S
A
 
L
G
 
G
K
 
L
A
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
Q
 
-
Q
 
T
I
 
V
R
 
R
D
 
D
W
 
W
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
H
 
H
C
 
V
S
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
E
R
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
E
F
 
S
G
 
R
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
G
 
S
G
 
A
W
 
G
N
 
E
E
 
E
K
 
K
A
 
T
N
 
N
I
 
L
D
 
E
I
 
V
V
 
V
R
 
K
T
 
I
L
 
I
C
 
L
S
 
R
L
 
L
L
 
M
D
 
G
E
 
K
M
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
G
E
 
E
P
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
E
Y
 
L
V
 
V
T
 
E
D
 
D
R
 
R
P
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
S
R
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
T
R
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
K
W
 
W
K
 
R
P
 
P
A
 
K
E
 
Y
T
 
T
F
 
F
E
 
D
T
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
K
K
 
K
T
 
T
V
 
I
A
 
D
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
A
 
K
N
 
N
Q
 
E
K
 
W
W
 
W
V
 
W
K
 
K
G
 
P
V
 
L
M
 
V
D
 
D

1r66A Crystal structure of desiv (dtdp-glucose 4,6-dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and tyd bound (see paper)
47% identity, 94% coverage: 2:344/366 of query aligns to 3:317/322 of 1r66A

query
sites
1r66A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
F
V
 
V
L
 
R
Q
 
Q
W
 
L
C
 
L
A
 
A
H
 
G
N
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
E
 
A
E
 
D
P
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
S
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
 
A
G
|
G
N
 
N
L
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
A
N
 
D
P
 
P
Q
 
R
H
 
L
R
 
R
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
G
 
G
N
x
D
I
|
I
C
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
K
 
R
L
 
E
F
 
L
A
 
-
E
 
-
H
 
R
R
 
G
P
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
V
H
 
H
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
|
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
S
A
 
V
F
 
F
V
 
T
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
V
M
 
Q
G
 
G
T
 
T
F
 
Q
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
C
A
 
A
R
 
-
A
 
-
H
 
-
W
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
V
E
 
D
K
 
A
E
 
G
A
 
V
F
 
G
R
 
R
F
 
V
L
 
V
H
 
H
V
|
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
L
 
I
G
 
-
P
 
-
N
 
D
D
 
S
P
 
G
A
 
S
F
 
W
T
 
T
E
 
E
T
 
S
T
 
S
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
P
 
P
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
L
L
 
V
V
 
A
R
 
R
S
 
A
Y
 
Y
F
 
H
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
D
V
 
V
L
 
R
T
 
I
T
 
T
N
 
R
C
 
C
S
 
C
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
Q
F
 
H
P
 
P
E
 
E
K
|
K
L
|
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
F
I
 
V
V
 
T
N
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
G
A
 
T
L
 
L
P
|
P
V
 
L
Y
|
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
Q
 
N
I
 
V
R
|
R
D
 
E
W
 
W
L
 
V
Y
 
H
V
 
T
E
 
D
D
 
D
H
 
H
C
 
C
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
A
R
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
R
F
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
N
 
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
G
N
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
T
N
|
N
I
 
R
D
 
E
I
 
L
V
 
T
R
 
G
T
 
I
L
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
S
M
 
L
A
 
G
P
 
A
A
 
D
A
 
W
S
 
S
R
 
S
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
V
A
 
R
Y
 
K
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
K
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
K
 
R
P
 
P
A
 
Q
E
 
V
T
 
S
F
 
F
E
 
A
T
 
D
G
 
G
I
 
L
R
 
A
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
R
W
 
W
Y
 
Y
L
 
R
A
 
E
N
 
N
Q
 
R
K
 
G
W
 
W

1r6dA Crystal structure of desiv double mutant (dtdp-glucose 4,6- dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and dau bound (see paper)
46% identity, 94% coverage: 2:344/366 of query aligns to 3:317/322 of 1r6dA

query
sites
1r6dA
I
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
H
F
 
F
V
 
V
L
 
R
Q
 
Q
W
 
L
C
 
L
A
 
A
H
 
G
N
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
E
 
A
E
 
D
P
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
S
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
G
|
G
N
 
N
L
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
A
N
 
D
P
 
P
Q
 
R
H
 
L
R
 
R
F
 
F
V
 
V
Q
 
H
G
 
G
N
x
D
I
|
I
C
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
L
T
 
A
K
 
R
L
 
E
F
 
L
A
 
-
E
 
-
H
 
R
R
 
G
P
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
V
H
 
H
F
|
F
A
|
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
|
H
V
 
V
D
 
D
R
 
R
S
 
S
I
 
I
T
 
A
G
 
G
P
 
A
E
 
S
A
 
V
F
 
F
V
 
T
E
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
V
M
 
Q
G
 
G
T
 
T
F
 
Q
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
A
 
C
A
 
A
R
 
-
A
 
-
H
 
-
W
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
V
E
 
D
K
 
A
E
 
G
A
 
V
F
 
G
R
 
R
F
 
V
L
 
V
H
 
H
V
|
V
S
|
S
T
|
T
D
x
N
E
x
Q
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
L
 
I
G
 
-
P
 
-
N
 
D
D
 
S
P
 
G
A
 
S
F
 
W
T
 
T
E
 
E
T
 
S
T
 
S
P
 
P
Y
 
L
A
 
E
P
 
P
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
S
 
S
D
 
D
H
 
L
L
 
V
V
 
A
R
 
R
S
 
A
Y
 
Y
F
 
H
H
 
R
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
M
 
L
P
 
D
V
 
V
L
 
R
T
 
I
T
 
T
N
 
R
C
 
C
S
 
C
N
|
N
N
|
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
Y
H
 
Q
F
 
H
P
 
P
E
 
E
K
|
K
L
|
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
F
I
 
V
V
 
T
N
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
G
A
 
T
L
 
L
P
|
P
V
 
L
Y
|
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
Q
 
A
Q
 
N
I
 
V
R
|
R
D
 
E
W
 
W
L
 
V
Y
 
H
V
 
T
E
 
D
D
 
D
H
 
H
C
 
C
S
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
A
R
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
G
G
 
G
A
 
R
F
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
I
Y
 
Y
N
 
H
I
 
I
G
 
G
G
 
G
W
 
G
N
 
L
E
 
E
K
 
L
A
 
T
N
|
N
I
 
R
D
 
E
I
 
L
V
 
T
R
 
G
T
 
I
L
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
S
M
 
L
A
 
G
P
 
A
A
 
D
A
 
W
S
 
S
R
 
S
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
V
A
 
R
Y
 
K
V
 
V
T
 
A
D
 
D
R
|
R
P
 
K
G
 
G
H
|
H
D
 
D
R
 
L
R
 
R
Y
|
Y
A
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
G
R
 
G
K
 
K
I
 
I
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
K
 
R
P
 
P
A
 
Q
E
 
V
T
 
S
F
 
F
E
 
A
T
 
D
G
 
G
I
 
L
R
 
A
K
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
R
W
 
W
Y
 
Y
L
 
R
A
 
E
N
 
N
Q
 
R
K
 
G
W
 
W

1ketA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from streptococcus suis with thymidine diphosphate bound (see paper)
45% identity, 94% coverage: 2:346/366 of query aligns to 5:328/346 of 1ketA

query
sites
1ketA
I
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
V
-
 
H
L
 
Y
Q
 
V
W
 
Y
C
 
N
A
 
N
H
 
H
N
 
P
E
 
D
E
 
V
P
 
H
V
 
V
L
 
T
N
 
V
L
 
L
D
|
D
A
x
K
L
|
L
T
|
T
Y
 
Y
A
|
A
G
|
G
N
 
N
L
 
K
A
 
A
N
 
N
L
 
L
Q
 
E
P
 
A
L
 
I
E
 
L
G
 
G
N
 
D
P
 
-
Q
 
R
H
 
V
R
 
E
F
 
L
V
 
V
Q
 
V
G
 
G
N
x
D
I
|
I
C
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
V
T
 
D
K
 
K
L
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
-
H
 
-
R
 
K
P
 
A
R
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
V
H
 
H
F
x
Y
A
 
A
A
|
A
E
 
E
S
|
S
H
 
H
V
 
N
D
 
D
R
 
N
S
 
S
I
 
L
T
 
N
G
 
D
P
 
P
E
 
S
A
 
P
F
 
F
V
 
I
E
 
H
T
|
T
N
 
N
V
 
F
M
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
Y
R
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
-
H
 
-
W
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
K
E
 
Y
A
 
D
F
 
I
R
 
R
F
 
F
L
 
H
H
 
H
V
 
V
S
|
S
T
|
T
D
|
D
E
|
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
E
G
 
G
P
 
P
N
 
G
D
 
E
P
 
K
A
 
-
F
 
F
T
 
T
E
 
A
T
 
E
T
 
T
P
 
N
Y
 
Y
A
 
N
P
 
P
N
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
S
 
S
D
 
D
H
 
L
L
 
I
V
 
V
R
 
K
S
 
A
Y
 
W
F
 
V
H
 
R
T
 
S
Y
 
F
G
 
G