SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1803 FitnessBrowser__Putida:PP_1803 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
26% identity, 97% coverage: 5:317/323 of query aligns to 2:304/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
T
 
N
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
V
C
 
V
R
 
D
Q
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
E
L
 
N
G
 
G
S
 
Y
F
 
G
A
 
V
I
 
I
R
 
V
A
 
V
A
x
D
S
x
N
R
 
L
D
x
S
L
x
S
G
|
G
G
 
K
A
 
V
S
 
E
V
 
N
A
 
L
G
 
N
I
 
R
Q
 
N
A
 
A
V
 
L
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
-
 
Q
T
x
S
V
x
I
A
 
E
D
 
D
L
 
-
S
 
E
A
 
E
T
 
M
T
 
M
D
 
E
W
 
R
A
 
I
R
 
F
A
 
S
L
 
L
S
 
H
G
 
R
V
 
P
D
 
E
L
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
Q
V
 
A
H
 
S
V
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
S
M
 
V
K
 
R
E
 
E
T
 
P
A
 
A
S
 
R
D
 
D
S
 
A
L
 
-
A
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
K
V
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
I
G
 
G
T
 
S
L
 
L
N
 
V
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
K
A
 
S
A
 
I
A
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
R
 
K
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
F
I
x
S
S
|
S
S
x
T
I
 
G
-
x
G
K
x
A
V
 
I
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
N
S
 
V
Q
 
K
P
 
V
G
 
-
Q
 
F
P
 
P
L
 
T
R
 
P
A
 
E
D
 
T
D
 
E
S
 
I
P
 
P
A
 
H
P
 
P
Q
 
I
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
S
 
A
K
|
K
H
 
Y
E
 
S
A
 
T
E
 
E
Q
 
M
G
 
Y
L
 
L
R
 
E
Q
 
F
L
 
F
A
 
A
A
 
R
A
 
E
T
 
Y
G
 
G
M
 
L
E
 
K
V
 
Y
V
 
T
V
 
V
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
 
A
L
x
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
x
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
A
G
|
G
V
|
V
K
 
V
A
 
A
N
 
I
F
 
F
-
 
T
H
 
E
S
 
R
M
 
M
M
 
L
R
 
R
W
 
G
L
 
E
Q
 
E
R
 
V
G
x
H
V
 
I
P
 
-
L
 
-
P
 
-
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
E
N
x
Y
R
 
V
R
|
R
S
 
D
L
 
Y
V
 
V
S
 
Y
L
 
V
A
 
D
N
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
L
 
A
V
 
N
V
 
L
T
 
L
C
 
A
I
 
M
D
 
E
H
 
-
P
 
-
R
 
K
A
 
G
A
 
D
N
 
N
Q
 
E
T
 
V
F
 
F
L
 
N
A
 
I
S
 
G
D
 
T
G
 
G
D
 
R
D
 
G
V
 
T
S
 
T
L
x
V
T
 
N
Q
 
Q
L
 
L
L
 
F
R
 
K
A
 
L
L
 
L
G
 
K
L
 
E
A
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
Y
P
 
D
A
 
K
R
 
E
L
 
P
L
 
V
P
 
Y
V
 
K
P
 
P
-
 
P
-
x
R
A
 
K
G
 
G
L
x
D
L
 
V
R
 
R
G
 
K
A
 
S
V
 
I
L
 
L
L
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
D
I
 
Y
E
 
T
K
 
K
N
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Y
 
E
P
 
P
P
 
K
C
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
N
 
K
M
 
L
T
 
T
A
 
V
R
 
E
S
 
Y
F
 
F

Q9FX01 3beta-hydroxysteroid-dehydrogenase/decarboxylase isoform 1; At3BETAHSD/D1; 4alpha-carboxysterol-C3-dehydrogenase/C4-decarboxylase isoform 1-1; Reticulon-like protein B24; AtRTNLB24; Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase 1, decarboxylating; EC 1.1.1.418 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 98% coverage: 3:317/323 of query aligns to 9:358/439 of Q9FX01

query
sites
Q9FX01
R
 
E
R
 
R
T
 
W
I
 
C
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
S
 
R
G
 
G
F
 
F
V
 
A
G
 
A
G
 
R
A
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
E
Q
 
M
L
 
L
A
 
V
T
 
R
L
 
Y
G
 
Q
S
 
M
F
 
F
A
 
H
I
 
V
R
 
R
A
 
I
A
 
A
-
x
D
-
 
L
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
H
-
 
E
-
 
E
S
 
T
R
 
G
D
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
A
S
 
I
V
 
R
A
 
S
G
 
G
I
 
R
Q
 
V
A
 
Q
V
 
Y
T
 
V
V
 
S
A
 
A
D
|
D
L
 
L
S
 
R
A
 
N
T
 
K
T
 
T
D
 
Q
W
 
V
A
 
V
R
 
K
A
 
G
L
 
F
S
 
Q
G
 
G
V
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
 
M
A
 
A
A
 
A
R
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
-
M
 
-
K
 
P
E
 
D
T
 
S
A
 
S
S
 
I
D
 
N
S
 
N
L
 
H
A
 
Q
E
 
L
F
 
Q
R
 
Y
R
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
Q
G
 
G
T
 
T
L
 
T
N
 
N
L
 
V
A
 
I
R
 
D
Q
 
A
A
 
C
A
 
I
A
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
K
R
 
R
F
 
L
I
 
I
F
 
Y
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
P
K
x
S
V
 
V
N
 
V
G
 
F
E
 
D
S
 
G
S
 
V
Q
 
H
P
 
-
G
 
-
Q
 
G
P
 
T
L
 
L
R
 
N
A
 
A
D
 
D
D
 
E
S
 
S
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
H
Q
 
N
D
 
D
A
 
S
Y
|
Y
G
 
S
V
 
A
S
 
T
K
|
K
H
 
A
E
 
E
A
 
G
E
 
E
Q
 
A
G
 
L
L
 
I
R
 
L
Q
 
K
L
 
A
A
 
N
A
 
G
A
 
R
T
 
S
G
 
G
M
 
L
E
 
L
V
 
T
V
 
C
V
 
C
I
 
I
R
 
R
P
 
P
V
 
S
L
 
S
V
 
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
D
K
 
K
A
 
L
N
 
M
F
 
V
H
 
P
S
 
S
M
 
L
M
 
V
R
 
T
W
 
A
L
 
A
Q
 
R
R
 
A
G
 
G
-
 
K
V
 
S
P
 
K
L
 
F
P
 
I
F
 
I
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
S
N
 
N
R
 
F
R
 
Y
S
 
D
L
 
F
V
 
T
S
 
Y
L
 
V
A
 
E
N
 
N
L
 
V
V
 
V
D
 
H
L
 
A
V
 
H
V
 
V
T
 
-
C
 
C
I
 
A
D
 
E
H
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
C
P
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
Q
T
 
A
F
 
Y
L
 
F
A
 
I
S
 
T
D
 
N
G
 
M
D
 
E
D
 
P
V
 
I
S
 
K
L
 
F
T
 
W
Q
 
E
L
 
F
L
 
M
R
 
S
A
 
Q
L
 
L
-
 
L
-
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
G
L
 
Y
G
 
E
R
 
R
P
 
P
A
 
S
R
 
-
L
 
-
L
 
I
P
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
A
G
 
S
L
 
L
L
 
M
R
 
M
G
 
P
A
 
I
V
 
A
L
 
Y
L
 
L
I
 
V
G
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Y
R
 
K
L
 
L
F
 
L
G
 
G
T
 
P
L
 
Y
-
 
G
-
 
M
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
S
-
x
R
-
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
C
-
 
N
-
x
R
Q
 
T
V
 
F
D
 
D
I
 
S
E
 
S
K
 
K
N
 
A
R
 
K
Q
 
D
L
 
R
L
 
L
G
 
G
W
 
Y
Y
 
S
P
 
P
P
 
V
C
 
V
T
 
P
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
N
 
K
M
 
R
T
 
T
A
 
I
R
 
D
S
 
S
F
 
F

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
30% identity, 78% coverage: 6:256/323 of query aligns to 4:262/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
A
 
L
T
 
A
L
 
K
G
 
G
S
 
-
F
 
Y
A
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
L
S
x
D
R
 
-
D
|
D
L
 
L
G
x
S
G
x
T
A
x
G
S
 
K
V
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
E
A
 
-
V
 
L
T
 
L
V
 
V
A
 
G
D
|
D
L
x
A
S
 
A
A
 
D
T
 
A
T
 
A
D
 
L
W
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
V
H
 
A
V
 
S
M
x
V
K
 
Q
E
 
A
T
 
S
A
 
V
S
 
E
D
 
D
S
 
P
L
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
-
R
 
H
R
 
Q
V
x
S
N
 
N
V
 
F
D
 
I
G
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
R
L
 
L
A
 
C
R
 
E
Q
 
A
A
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
V
I
 
V
F
 
F
I
x
A
S
 
S
S
x
A
I
x
A
K
x
A
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
N
S
 
N
S
 
G
Q
 
E
P
 
-
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
A
A
 
E
D
 
D
D
 
T
S
 
P
P
 
K
A
 
S
P
 
P
Q
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
x
F
G
 
A
V
 
A
S
 
D
K
|
K
H
 
L
E
 
A
A
 
S
E
 
E
Q
 
Y
G
 
Y
L
 
L
R
 
D
Q
 
F
L
 
Y
A
 
R
A
 
R
A
 
Q
T
 
H
G
 
G
M
 
L
E
 
E
V
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
F
V
x
F
L
x
N
V
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
Y
-
 
S
G
|
G
V
|
V
K
 
I
A
 
S
N
 
I
F
|
F
H
 
S
S
 
E
M
 
R
M
 
A
R
 
K
W
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
R
P
 
P
L
 
I
P
x
T
-
x
L
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
G
N
 
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
Y
L
 
V
A
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
K
L
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
Q
C
 
G
I
 
L
D
 
E
H
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
P
A
 
A
N
 
A
Q
 
D
T
 
A
F
 
T
L
 
N
A
 
V
S
 
G
D
 
L
G
 
G
D
 
G
D
 
V
V
 
T
S
 
T
L
|
L
T
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
Q
L
 
Q
A
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
30% identity, 78% coverage: 6:256/323 of query aligns to 3:261/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
L
C
 
V
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
A
 
L
T
 
A
L
 
K
G
 
G
S
 
-
F
 
Y
A
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
L
S
x
D
R
 
-
D
|
D
L
 
L
G
x
S
G
x
T
A
x
G
S
 
K
V
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
L
Q
 
E
A
 
-
V
 
L
T
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
D
L
x
A
S
 
A
A
 
D
T
 
A
T
 
A
D
 
L
W
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
L
 
V
S
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
-
V
 
V
H
 
A
V
 
S
M
x
V
K
 
Q
E
 
A
T
 
S
A
 
V
S
 
E
D
 
D
S
 
P
L
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
-
R
 
H
R
 
Q
V
x
S
N
 
N
V
 
F
D
 
I
G
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
R
L
 
L
A
 
C
R
 
E
Q
 
A
A
 
M
A
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
R
F
 
V
I
 
V
F
 
F
I
 
A
S
 
S
S
x
A
I
x
A
K
x
A
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
N
S
 
N
S
 
G
Q
 
E
P
 
-
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
I
R
 
A
A
 
E
D
 
D
D
 
T
S
 
P
P
 
K
A
 
S
P
 
P
Q
 
L
D
 
T
A
 
P
Y
x
F
G
 
A
V
 
A
S
 
D
K
|
K
H
 
L
E
 
A
A
 
S
E
 
E
Q
 
Y
G
 
Y
L
 
L
R
 
D
Q
 
F
L
 
Y
A
 
R
A
 
R
A
 
Q
T
 
H
G
 
G
M
 
L
E
 
E
V
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
F
V
x
F
L
x
N
V
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
-
 
R
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
Y
-
 
S
G
|
G
V
|
V
K
 
I
A
 
S
N
 
I
F
|
F
H
 
S
S
 
E
M
 
R
M
 
A
R
 
K
W
 
A
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
R
P
 
P
L
 
I
P
x
T
-
 
L
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
G
N
 
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
V
S
 
Y
L
 
V
A
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
K
L
 
I
V
 
L
V
 
V
T
 
Q
C
 
G
I
 
L
D
 
E
H
 
S
P
 
P
R
 
A
A
 
P
A
 
A
N
 
A
Q
 
D
T
 
A
F
 
T
L
 
N
A
 
V
S
 
G
D
 
L
G
 
G
D
 
G
D
 
V
V
 
T
S
 
T
L
|
L
T
 
N
Q
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
G
A
 
A
L
 
L
G
 
Q
L
 
Q
A
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4id9A Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
36% identity, 51% coverage: 6:171/323 of query aligns to 2:158/321 of 4id9A

query
sites
4id9A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
G
|
G
F
x
R
V
|
V
G
 
G
G
 
R
A
 
A
L
 
V
C
 
V
R
 
A
Q
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
R
S
 
G
F
 
F
A
x
D
I
x
L
R
|
R
A
 
P
A
 
S
S
 
G
R
 
-
D
 
-
L
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
E
S
 
E
V
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
T
x
S
V
x
L
A
 
E
D
 
D
L
 
G
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
T
 
S
D
 
D
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
I
S
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
A
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
x
L
A
 
G
A
|
A
R
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
F
M
 
M
K
 
S
E
 
W
T
 
A
A
 
P
S
 
A
D
 
D
S
 
R
L
 
D
A
 
R
E
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
-
V
|
V
N
 
N
V
 
V
D
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
R
N
 
R
L
 
L
A
 
L
R
 
D
Q
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
V
F
 
F
I
 
A
S
 
S
S
|
S
I
 
G
K
 
E
V
 
V
N
 
Y
G
 
P
E
 
E
S
 
N
S
 
R
Q
 
P
P
 
E
G
 
F
Q
 
L
P
 
P
L
 
V
R
 
T
A
 
E
D
 
D
D
 
H
S
 
P
P
 
L
A
 
C
P
 
P
Q
 
N
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
S
 
T
K
|
K
H
 
L
E
 
L
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
G
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
F
L
 
H
A
 
Q
A
 
R
A
 
S
T
 
G
G
 
A
M
 
M
E
 
E
V
 
T
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4id9B Crystal structure of a short-chain dehydrogenase/reductase superfamily protein from agrobacterium tumefaciens (target efi-506441) with bound NAD, monoclinic form 1
36% identity, 51% coverage: 6:171/323 of query aligns to 3:159/328 of 4id9B

query
sites
4id9B
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
G
|
G
F
x
R
V
|
V
G
 
G
G
 
R
A
 
A
L
 
V
C
 
V
R
 
A
Q
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
T
L
 
Q
G
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
R
S
 
G
F
 
F
A
x
D
I
x
L
R
 
R
A
 
P
A
 
S
S
 
G
R
 
-
D
 
-
L
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
E
S
 
E
V
 
V
A
 
V
G
 
G
I
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
T
x
S
V
x
L
A
 
E
D
 
D
L
 
G
S
 
Q
A
 
A
T
 
L
T
 
S
D
 
D
W
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
A
L
 
I
S
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
A
V
 
V
V
 
L
H
 
H
A
x
L
A
 
G
A
|
A
R
 
-
V
 
-
H
 
-
V
 
F
M
 
M
K
 
S
E
 
W
T
 
A
A
 
P
S
 
A
D
 
D
S
 
R
L
 
D
A
 
R
E
 
M
F
 
F
R
 
A
R
 
-
V
|
V
N
 
N
V
 
V
D
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
R
N
 
R
L
 
L
A
 
L
R
 
D
Q
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
F
I
 
V
F
 
F
I
 
A
S
 
S
S
|
S
I
 
G
K
 
E
V
 
V
N
 
Y
G
 
P
E
 
E
S
 
N
S
 
R
Q
 
P
P
 
E
G
 
F
Q
 
L
P
 
P
L
 
V
R
 
T
A
 
E
D
 
D
D
 
H
S
 
P
P
 
L
A
 
C
P
 
P
Q
 
N
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
L
S
 
T
K
|
K
H
 
L
E
 
L
A
 
G
E
 
E
Q
 
E
G
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
F
L
 
H
A
 
Q
A
 
R
A
 
S
T
 
G
G
 
A
M
 
M
E
 
E
V
 
T
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6zldA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
25% identity, 65% coverage: 6:215/323 of query aligns to 3:222/314 of 6zldA

query
sites
6zldA
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
L
C
 
C
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
A
 
L
T
 
K
L
 
N
G
 
S
S
 
A
F
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
V
A
 
G
A
 
I
S
x
D
R
x
H
D
x
F
L
x
I
G
 
G
G
 
P
A
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
L
S
x
K
V
 
T
A
 
G
G
 
N
I
 
I
Q
 
Q
A
 
S
V
 
L
T
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
Q
-
 
F
V
 
I
A
 
R
D
 
E
L
x
D
S
x
I
A
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
I
V
x
P
H
 
G
V
 
V
M
x
R
K
 
T
E
 
S
T
 
W
A
 
G
S
 
K
D
 
D
S
 
-
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
V
 
N
N
 
N
V
 
I
D
 
M
G
 
V
T
 
T
L
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
R
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
I
|
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
K
S
 
S
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
G
P
 
A
L
 
V
R
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
Q
 
L
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
T
K
|
K
H
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
G
 
L
L
 
C
R
 
H
Q
 
V
L
 
Y
A
 
H
A
 
K
A
 
N
T
 
F
G
 
H
M
 
I
E
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
x
F
L
x
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
-
x
A
F
 
F
H
 
H
S
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
K
W
 
Q
L
 
M
Q
 
L
R
 
E
G
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
P
x
T
-
 
I
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
T
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
S
 
Y
L
 
I
A
 
D
N
 
D
L
 
C
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6zl6A Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp and NAD (see paper)
25% identity, 65% coverage: 6:215/323 of query aligns to 3:222/314 of 6zl6A

query
sites
6zl6A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
L
C
 
C
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
A
 
L
T
 
K
L
 
N
G
 
S
S
 
A
F
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
V
A
 
G
A
 
I
S
x
D
R
x
H
D
x
F
L
x
I
G
 
G
G
 
P
A
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
L
S
x
K
V
 
T
A
 
G
G
 
N
I
 
I
Q
 
Q
A
 
S
V
 
L
T
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
Q
-
 
F
V
 
I
A
 
R
D
 
E
L
x
D
S
x
I
A
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
I
V
 
P
H
 
G
V
 
V
M
 
R
K
 
T
E
 
S
T
 
W
A
 
G
S
 
K
D
 
D
S
 
-
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
V
 
N
N
 
N
V
 
I
D
 
M
G
 
V
T
 
T
L
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
R
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
I
|
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
K
S
 
S
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
G
P
 
A
L
 
V
R
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
Q
 
L
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
T
K
|
K
H
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
G
 
L
L
 
C
R
 
H
Q
 
V
L
 
Y
A
 
H
A
 
K
A
 
N
T
 
F
G
 
H
M
 
I
E
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
-
x
A
F
 
F
H
 
H
S
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
K
W
 
Q
L
 
M
Q
 
L
R
 
E
G
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
P
x
T
-
 
I
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
T
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
S
 
Y
L
 
I
A
 
D
N
 
D
L
 
C
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6zllA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-galacturonic acid and NAD (see paper)
25% identity, 65% coverage: 6:215/323 of query aligns to 3:222/321 of 6zllA

query
sites
6zllA
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
L
C
 
C
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
A
 
L
T
 
K
L
 
N
G
 
S
S
 
A
F
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
V
A
 
G
A
 
I
S
x
D
R
x
H
D
x
F
L
x
I
G
 
G
G
 
P
A
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
L
S
x
K
V
 
T
A
 
G
G
 
N
I
 
I
Q
 
Q
A
 
S
V
 
L
T
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
Q
-
 
F
V
 
I
A
 
R
D
 
E
L
x
D
S
x
I
A
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
I
V
x
P
H
 
G
V
|
V
M
x
R
K
 
T
E
 
S
T
 
W
A
 
G
S
 
K
D
 
D
S
 
-
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
V
 
N
N
 
N
V
 
I
D
 
M
G
 
V
T
 
T
L
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
R
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
I
|
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
K
S
 
S
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
G
P
 
A
L
 
V
R
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
Q
 
L
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
S
 
T
K
|
K
H
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
G
 
L
L
 
C
R
 
H
Q
 
V
L
 
Y
A
 
H
A
 
K
A
 
N
T
 
F
G
 
H
M
 
I
E
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
 
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
-
x
A
F
 
F
H
 
H
S
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
K
W
 
Q
L
 
M
Q
 
L
R
 
E
G
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
P
x
T
-
 
I
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
T
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
S
 
Y
L
 
I
A
 
D
N
 
D
L
 
C
V
 
I

Sites not aligning to the query:

8fenA Panicum vigratum dihydroflavonol 4-reductase complexed with NADP and dhq (see paper)
29% identity, 75% coverage: 6:247/323 of query aligns to 7:267/326 of 8fenA

query
sites
8fenA
I
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
W
L
 
L
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
A
 
L
T
 
R
L
 
A
G
 
G
S
 
-
F
 
Y
A
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
T
S
 
V
R
|
R
D
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
x
K
-
 
T
-
 
K
-
 
P
-
 
L
L
 
L
G
 
D
G
 
L
A
 
P
S
 
G
V
 
A
A
 
A
G
 
E
I
 
R
Q
 
L
A
 
S
V
 
I
T
 
W
V
 
K
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
T
A
 
E
T
 
E
T
 
G
D
 
S
W
 
F
A
 
D
R
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
K
G
 
G
V
 
C
D
 
T
L
 
G
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
x
V
A
|
A
A
x
T
R
 
P
V
 
-
H
 
-
V
 
-
M
 
M
K
 
D
E
 
F
T
 
E
A
 
S
S
 
K
D
 
D
S
 
P
L
 
E
A
 
N
E
 
E
F
 
V
R
 
I
R
 
K
V
 
P
N
 
T
V
 
V
D
 
E
G
 
G
T
 
V
L
 
L
N
 
S
L
 
I
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
V
I
 
V
F
 
F
I
x
T
S
|
S
S
x
T
I
x
A
-
x
G
K
 
A
V
 
V
N
|
N
G
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
R
Q
 
Q
P
 
-
G
 
-
Q
 
K
P
 
P
L
 
V
R
 
Y
A
 
D
D
 
E
D
 
N
S
 
N
P
 
W
A
 
S
P
 
D
Q
 
V
D
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
W
A
 
M
Y
|
Y
G
 
F
V
 
V
S
 
S
K
|
K
H
 
T
E
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
G
 
A
L
 
A
R
 
I
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
H
G
 
G
M
 
M
E
 
D
V
 
L
V
 
I
V
 
S
I
 
V
R
 
I
P
|
P
V
x
P
L
|
L
V
|
V
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
F
V
 
I
K
 
S
A
 
A
N
 
G
F
 
-
H
 
-
S
 
-
M
 
M
M
 
P
R
 
P
W
x
S
L
 
L
Q
 
L
R
 
T
G
 
A
V
 
L
P
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
E
P
 
P
F
 
H
G
 
Y
A
 
S
V
 
I
C
 
L
N
 
K
R
 
Q
R
 
V
S
x
Q
L
 
F
V
 
V
S
 
H
L
 
L
A
 
D
N
 
D
L
 
L
V
 
C
D
 
D
L
 
A
V
 
E
V
 
I
T
 
F
C
 
L
I
 
F
D
 
E
H
 
H
P
 
P
R
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
R
T
 
Y
F
 
V
L
 
C
A
 
S
S
 
S
D
 
H
G
 
A
D
 
T
D
 
T
V
 
I
S
 
H
-
 
G
L
 
L
T
 
A
Q
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
R

8femA Panicum vigratum dihydroflavonol 4-reductase complexed with NADP (see paper)
29% identity, 75% coverage: 6:247/323 of query aligns to 7:267/327 of 8femA

query
sites
8femA
I
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
G
 
S
A
 
W
L
 
L
C
 
V
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
A
 
L
T
 
R
L
 
A
G
 
G
S
 
-
F
 
Y
A
 
A
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
T
S
 
V
R
|
R
D
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
V
-
 
G
-
x
K
-
 
T
-
 
K
-
 
P
-
 
L
L
 
L
G
 
D
G
 
L
A
 
P
S
 
G
V
 
A
A
 
A
G
 
E
I
 
R
Q
 
L
A
 
S
V
 
I
T
 
W
V
 
K
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
T
A
 
E
T
 
E
T
 
G
D
 
S
W
 
F
A
 
D
R
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
K
G
 
G
V
 
C
D
 
T
L
 
G
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
x
V
A
|
A
A
x
T
R
 
P
V
 
-
H
 
-
V
 
-
M
 
M
K
 
D
E
 
F
T
 
E
A
 
S
S
 
K
D
 
D
S
 
P
L
 
E
A
 
N
E
 
E
F
 
V
R
 
I
R
 
K
V
 
P
N
 
T
V
 
V
D
 
E
G
 
G
T
 
V
L
 
L
N
 
S
L
 
I
A
 
M
R
 
R
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
F
 
V
I
 
V
F
 
F
I
x
T
S
|
S
S
x
T
I
 
A
-
 
G
K
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
V
E
 
E
S
 
E
S
 
R
Q
 
Q
P
 
-
G
 
-
Q
 
K
P
 
P
L
 
V
R
 
Y
A
 
D
D
 
E
D
 
N
S
 
N
P
 
W
A
 
S
P
 
D
Q
 
V
D
 
D
-
 
F
-
 
C
-
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
W
A
 
M
Y
|
Y
G
 
F
V
 
V
S
 
S
K
|
K
H
 
T
E
 
L
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
G
 
A
L
 
A
R
 
I
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
H
G
 
G
M
 
M
E
 
D
V
 
L
V
 
I
V
 
S
I
 
V
R
 
I
P
|
P
V
x
P
L
 
L
V
|
V
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
F
V
 
I
K
 
S
A
 
A
N
 
G
F
 
-
H
 
-
S
 
-
M
 
M
M
 
P
R
 
P
W
x
S
L
 
L
Q
 
L
R
 
T
G
 
A
V
 
L
P
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
E
P
 
P
F
 
H
G
 
Y
A
 
S
V
 
I
C
 
L
N
 
K
R
 
Q
R
 
V
S
 
Q
L
 
F
V
 
V
S
 
H
L
 
L
A
 
D
N
 
D
L
 
L
V
 
C
D
 
D
L
 
A
V
 
E
V
 
I
T
 
F
C
 
L
I
 
F
D
 
E
H
 
H
P
 
P
R
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
R
T
 
Y
F
 
V
L
 
C
A
 
S
S
 
S
D
 
H
G
 
A
D
 
T
D
 
T
V
 
I
S
 
H
-
 
G
L
 
L
T
 
A
Q
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
R

6zljA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase y149f mutant from bacillus cereus in complex with udp-4-deoxy-4-fluoro-glucuronic acid and NAD (see paper)
25% identity, 65% coverage: 6:215/323 of query aligns to 3:222/314 of 6zljA

query
sites
6zljA
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
L
C
 
C
R
 
Q
Q
 
A
L
 
L
A
 
L
T
 
K
L
 
N
G
 
S
S
 
A
F
 
Y
A
 
H
I
 
V
R
 
V
A
 
G
A
 
I
S
x
D
R
x
H
D
x
F
L
x
I
G
 
G
G
 
P
A
 
T
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
L
S
x
K
V
 
T
A
 
G
G
 
N
I
 
I
Q
 
Q
A
 
S
V
 
L
T
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
Q
-
 
F
V
 
I
A
 
R
D
 
E
L
x
D
S
x
I
A
 
L
T
 
N
T
 
T
D
 
D
W
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
Q
G
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
V
V
 
Y
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
I
V
x
P
H
 
G
V
 
V
M
x
R
K
 
T
E
 
S
T
 
W
A
 
G
S
 
K
D
 
D
S
 
-
L
 
F
A
 
Q
E
 
P
F
 
Y
R
 
V
R
 
T
V
 
N
N
 
N
V
 
I
D
 
M
G
 
V
T
 
T
L
 
Q
N
 
Q
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
H
A
 
I
G
 
K
V
 
L
R
 
D
R
 
K
F
 
F
I
 
I
F
 
H
I
|
I
S
 
S
S
x
T
I
x
S
K
x
S
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
E
S
 
K
S
 
S
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
G
P
 
A
L
 
V
R
 
S
A
 
E
D
 
D
D
 
L
S
 
L
P
 
P
A
 
I
P
 
P
Q
 
L
D
 
S
A
 
P
Y
x
F
G
 
G
V
 
V
S
 
T
K
|
K
H
 
L
E
 
S
A
 
G
E
 
E
Q
 
H
G
 
L
L
 
C
R
 
H
Q
 
V
L
 
Y
A
 
H
A
 
K
A
 
N
T
 
F
G
 
H
M
 
I
E
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
I
 
L
R
 
R
P
x
Y
V
x
F
L
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
R
V
 
Q
K
x
R
A
 
P
N
 
D
-
x
M
-
x
A
F
 
F
H
 
H
S
x
R
M
 
L
M
 
I
R
 
K
W
 
Q
L
 
M
Q
 
L
R
 
E
G
 
D
V
 
K
P
 
P
L
 
L
P
x
T
-
 
I
F
|
F
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
T
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
F
V
 
T
S
 
Y
L
 
I
A
 
D
N
 
D
L
 
C
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6bwlA X-ray structure of pal from bacillus thuringiensis (see paper)
26% identity, 94% coverage: 6:310/323 of query aligns to 3:302/313 of 6bwlA

query
sites
6bwlA
I
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
R
A
 
W
L
 
V
C
 
V
R
 
K
Q
 
R
L
 
L
A
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
V
-
 
W
T
 
I
L
 
L
G
x
D
S
x
N
F
x
L
A
 
A
I
x
N
R
x
S
A
 
T
A
 
T
S
 
A
R
 
N
D
 
I
L
 
T
G
 
E
G
 
F
A
 
A
S
 
H
V
 
D
A
 
L
G
 
N
I
 
L
Q
 
K
A
 
Q
V
 
C
T
 
I
V
 
Q
A
 
G
D
|
D
L
x
I
S
 
K
A
 
D
T
 
K
T
 
K
D
 
L
W
 
V
A
 
A
R
 
Q
A
 
L
L
 
F
-
 
E
-
 
N
S
 
N
G
 
S
V
 
F
D
 
D
L
 
L
V
 
C
V
 
Y
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
S
V
x
I
H
 
N
V
 
V
M
 
-
K
 
Q
E
 
D
T
 
S
A
 
I
S
 
D
D
 
D
S
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
T
F
 
F
R
 
E
R
 
N
V
 
D
N
 
T
V
 
I
D
 
-
G
 
G
T
 
T
L
 
F
N
 
N
L
 
L
A
 
L
R
 
E
Q
 
Q
A
 
C
A
 
L
A
 
N
A
 
Y
G
 
D
V
 
V
R
 
K
R
 
-
F
 
M
I
 
V
F
 
F
I
x
M
S
 
S
S
x
T
I
x
C
K
x
M
V
 
V
N
 
Y
G
 
D
E
 
K
S
 
A
S
 
T
Q
 
N
P
 
I
G
 
-
Q
 
Q
P
 
G
L
 
I
R
 
S
A
 
E
D
 
L
D
 
D
S
 
P
P
 
I
A
 
K
P
 
P
Q
 
A
D
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
G
S
 
S
K
|
K
H
 
I
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
N
G
 
M
L
 
V
R
 
L
Q
 
S
L
 
Y
A
 
Y
A
 
Y
A
 
A
T
 
Y
G
 
K
M
 
L
E
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
R
 
R
P
 
P
V
 
F
L
x
N
V
x
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
G
G
|
G
V
|
V
K
 
V
A
 
A
N
 
I
F
 
F
H
 
-
S
 
-
M
 
-
M
 
I
R
 
N
W
 
N
L
 
K
Q
 
L
R
 
D
G
 
N
V
 
V
P
 
P
L
 
L
P
x
N
-
x
I
F
x
Y
G
 
G
A
 
D
V
 
G
C
 
K
N
x
Q
R
 
T
R
|
R
S
 
D
L
 
L
V
 
L
S
 
Y
L
 
V
A
 
E
N
 
D
L
 
C
V
 
A
D
 
D
L
 
F
V
 
V
V
 
V
T
 
A
C
 
A
I
 
G
D
 
Y
H
 
S
P
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
N
N
 
G
Q
 
H
T
 
I
F
 
I
L
 
N
A
 
A
S
 
G
D
 
T
G
 
G
D
 
Q
D
 
D
V
 
I
S
 
S
L
x
I
T
 
N
Q
 
K
L
 
L
L
 
A
R
 
E
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
A
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
N
P
 
K
A
 
V
R
 
S
L
 
I
L
 
Q
P
 
H
V
 
V
P
 
T
A
 
H
G
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
I
G
 
H
R
 
P
R
 
Q
D
 
S
L
x
E
A
 
I
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
F
 
L
G
 
-
T
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
C
D
 
N
I
 
Y
E
 
E
K
 
K
N
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
N
W
 
W
Y
 
E
P
 
P
P
 
K
C
 
V
T
 
S
L
 
L
E
 
E
Q
 
D
G
 
G
L
 
V

6x3bB Structure of rmd from pseudomonas aeruginosa complexed with NADPH
32% identity, 55% coverage: 6:184/323 of query aligns to 4:169/297 of 6x3bB

query
sites
6x3bB
I
 
L
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
L
S
|
S
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
G
 
K
A
 
H
L
 
L
C
 
Q
R
 
A
Q
 
Y
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
T
 
T
L
 
P
G
 
W
S
 
A
F
 
L
A
 
L
I
 
P
R
 
V
A
 
P
A
 
H
S
 
R
R
 
Y
D
|
D
L
|
L
G
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
L
Q
 
E
A
 
P
V
 
D
T
 
S
V
 
L
A
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
W
A
 
P
R
 
E
A
 
L
L
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
P
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
I
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
x
G
R
 
Q
V
x
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
-
K
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
F
S
 
R
D
 
D
S
 
P
L
 
-
A
 
A
E
 
R
F
 
T
R
 
L
R
 
Q
V
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
F
R
 
S
-
 
G
R
 
T
F
 
F
I
 
L
F
 
Y
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
x
G
K
x
D
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
Q
S
 
V
S
 
A
Q
 
E
P
 
A
G
 
A
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
R
 
H
A
 
E
D
 
E
D
 
L
S
 
I
P
 
P
A
 
H
P
 
P
Q
 
R
D
 
N
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
|
K
H
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
L
L
 
C
R
 
L
Q
 
Q
L
 
W
A
 
G
A
 
I
A
 
T
T
 
E
G
 
G
M
 
W
E
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
V
I
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
F
L
 
N
V
x
H
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
x
Q
K
 
K
A
 
D
N
 
S
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6x3bA Structure of rmd from pseudomonas aeruginosa complexed with NADPH
32% identity, 55% coverage: 6:184/323 of query aligns to 8:173/300 of 6x3bA

query
sites
6x3bA
I
 
L
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
L
S
|
S
G
|
G
F
|
F
V
|
V
G
 
G
G
 
K
A
 
H
L
 
L
C
 
Q
R
 
A
Q
 
Y
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
H
T
 
T
L
 
P
G
 
W
S
 
A
F
 
L
A
 
L
I
 
P
R
 
V
A
 
P
A
 
H
S
 
R
R
 
Y
D
|
D
L
|
L
G
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
I
 
L
Q
 
E
A
 
P
V
 
D
T
 
S
V
 
L
A
 
G
D
 
D
L
 
L
S
 
-
A
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
W
 
W
A
 
P
R
 
E
A
 
L
L
 
-
S
 
-
G
 
-
V
 
P
D
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
I
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
x
G
R
 
Q
V
x
T
H
 
Y
V
 
V
M
 
-
K
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
F
S
 
R
D
 
D
S
 
P
L
 
-
A
 
A
E
 
R
F
 
T
R
 
L
R
 
Q
V
 
I
N
 
N
V
 
L
D
 
L
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
L
A
 
L
R
 
Q
Q
 
A
A
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
F
R
 
S
-
 
G
R
 
T
F
 
F
I
 
L
F
 
Y
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
x
G
K
x
D
V
 
V
N
 
Y
G
 
G
E
 
Q
S
 
V
S
 
A
Q
 
E
P
 
A
G
 
A
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
R
 
H
A
 
E
D
 
E
D
 
L
S
 
I
P
 
P
A
 
H
P
 
P
Q
 
R
D
 
N
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
V
S
 
S
K
|
K
H
 
L
E
 
A
A
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
L
L
 
C
R
 
L
Q
 
Q
L
 
W
A
 
G
A
 
I
A
 
T
T
 
E
G
 
G
M
 
W
E
 
R
V
 
V
V
 
L
V
 
V
I
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
F
L
 
N
V
x
H
Y
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
x
Q
K
 
K
A
 
D
N
 
S
F
 
F

6dntA Udp-n-acetylglucosamine 4-epimerase from methanobrevibacter ruminantium m1 in complex with udp-n-acetylmuramic acid (see paper)
26% identity, 55% coverage: 1:178/323 of query aligns to 1:177/310 of 6dntA

query
sites
6dntA
M
 
M
E
 
K
R
 
D
R
 
K
T
 
N
I
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
L
G
|
G
F
|
F
V
x
I
G
 
G
G
 
S
A
 
H
L
 
I
C
 
V
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
A
 
I
T
 
D
L
 
D
G
 
N
S
 
K
F
 
V
A
 
T
I
 
I
-
 
I
-
x
D
R
x
N
A
x
L
A
x
S
S
|
S
R
x
G
D
 
K
L
 
M
G
 
E
G
 
N
A
 
L
S
 
N
V
 
N
A
 
P
G
 
N
I
 
H
Q
 
E
A
 
N
V
 
L
T
 
T
V
 
I
-
 
I
-
 
K
A
 
E
D
|
D
L
|
L
S
 
-
A
 
M
T
 
D
T
 
A
D
 
D
W
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
I
L
 
L
S
 
K
G
 
D
V
 
K
D
 
D
L
 
Y
V
 
V
V
 
F
H
 
H
A
x
L
A
|
A
A
|
A
R
 
L
V
x
A
H
 
S
V
 
V
M
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
S
 
P
D
 
G
S
 
S
L
 
V
A
 
A
E
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
R
F
 
Y
R
 
N
R
 
Q
V
 
N
N
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
K
L
 
L
A
 
F
R
 
I
Q
 
A
A
 
C
A
 
K
A
 
N
A
 
N
G
 
N
V
 
I
R
 
K
R
 
K
F
 
V