SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_1852 FitnessBrowser__Putida:PP_1852 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5wuwA Serratia marcescens short-chain dehydrogenase/reductase f98l/f202l mutant (see paper)
72% identity, 98% coverage: 7:249/249 of query aligns to 3:245/245 of 5wuwA

query
sites
5wuwA
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
V
Q
 
Q
G
|
G
G
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
T
Y
|
Y
V
x
A
S
x
A
S
 
S
A
 
A
G
 
D
P
 
R
A
 
A
E
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
S
E
 
A
I
 
V
T
 
T
E
 
T
N
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
K
A
 
A
D
|
D
S
|
S
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
L
 
Q
A
 
A
V
 
V
D
 
R
D
 
Q
T
 
A
E
 
V
K
 
S
A
 
H
L
 
F
G
 
G
R
 
N
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
L
A
 
G
P
 
G
V
 
T
T
 
E
E
 
E
F
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
D
F
 
L
D
 
D
H
 
R
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
S
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
H
M
 
M
G
 
N
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
H
I
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
V
P
 
P
F
 
F
A
 
G
G
 
G
G
 
A
A
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
A
M
 
M
S
 
S
K
|
K
S
 
S
A
 
A
L
|
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
G
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
S
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
|
G
P
|
P
V
|
V
D
 
D
T
 
T
D
 
E
M
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
D
S
 
A
G
 
G
E
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
D
S
 
Q
L
 
L
I
 
K
P
 
Q
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
E
 
K
P
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
G
F
 
F
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
S
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A

6j7uA Crystal structure of blue fluorescent protein from metagenomic library in complex with NADPH (see paper)
57% identity, 98% coverage: 6:249/249 of query aligns to 2:247/247 of 6j7uA

query
sites
6j7uA
T
 
N
L
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
I
A
 
A
F
 
F
T
 
T
Y
|
Y
V
|
V
S
|
S
-
 
A
-
 
S
S
|
S
A
 
K
G
 
N
P
 
V
A
 
A
E
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
V
R
 
Q
E
 
E
I
 
L
T
 
E
E
 
A
N
 
K
G
 
G
G
 
R
K
 
R
A
 
A
L
 
R
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
D
|
D
S
|
S
A
 
A
D
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Q
V
 
V
Q
 
R
L
 
Q
A
 
A
V
 
V
D
 
E
D
 
Q
T
 
A
E
 
I
K
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
L
 
F
A
 
L
V
 
A
A
 
G
P
 
P
V
 
L
T
 
G
E
 
E
F
 
V
D
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
D
F
 
Y
D
 
E
H
 
R
M
 
T
L
 
M
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
V
R
 
R
S
 
A
V
 
P
F
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
R
 
A
Y
 
S
M
 
M
G
 
P
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
G
|
G
S
|
S
T
 
C
N
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
A
P
 
G
F
 
R
A
 
A
G
 
G
G
 
V
A
 
T
P
 
L
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
|
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
N
 
V
V
 
V
Q
 
H
P
|
P
G
 
G
P
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
N
|
N
P
 
P
A
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
R
A
 
S
E
 
G
S
 
E
L
 
L
I
 
V
P
 
A
L
 
V
M
 
L
A
 
S
I
 
L
G
 
P
R
 
H
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
P
 
V
E
 
R
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
G
F
 
M
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
D
A
 
G
G
 
R
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A

5u2wA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP
55% identity, 96% coverage: 7:246/249 of query aligns to 4:243/246 of 5u2wA

query
sites
5u2wA
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
A
 
A
F
 
I
T
 
T
Y
|
Y
V
x
E
S
x
K
S
|
S
A
 
A
G
 
E
P
 
R
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
A
E
 
G
I
 
I
T
 
E
E
 
A
N
 
L
G
 
G
G
 
R
K
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
A
|
A
D
|
D
S
|
S
A
 
A
D
 
D
A
 
P
A
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
L
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
R
T
 
V
E
 
A
K
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
L
 
F
A
 
R
V
 
A
A
 
G
P
 
S
V
 
L
T
 
D
E
 
D
F
 
L
D
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
D
F
 
I
D
 
D
H
 
A
M
 
T
L
 
L
A
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
V
R
 
R
S
 
A
V
 
V
F
 
I
V
 
V
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
H
M
 
L
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
S
I
x
T
G
 
G
S
|
S
T
 
C
N
 
L
A
 
A
E
 
T
R
 
R
M
 
V
P
 
P
F
 
D
A
 
A
G
 
G
G
x
M
A
 
S
P
 
L
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
|
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
W
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
I
V
 
V
Q
 
H
P
|
P
G
|
G
P
 
S
V
x
T
D
 
D
T
|
T
D
 
D
M
|
M
N
|
N
P
 
P
A
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
A
F
 
H
A
 
A
E
 
D
S
 
A
L
 
Q
I
 
R
P
 
S
L
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
Q
R
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
E
 
K
P
 
A
E
 
D
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
A
F
 
L
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
E
A
 
G
G
 
R
Y
 
S
I
 
I
T
 
N
G
 
G
A
 
T
S
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P39333 Cyclic-di-GMP-binding biofilm dispersal mediator protein from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
52% identity, 98% coverage: 7:249/249 of query aligns to 4:237/237 of P39333

query
sites
P39333
L
 
F
E
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
Q
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
V
R
 
T
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
A
 
R
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
V
 
A
S
 
G
S
 
S
A
 
K
G
 
D
P
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
|
E
I
 
T
T
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
F
A
 
T
D
 
D
S
 
S
A
 
A
D
 
D
A
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
I
D
 
D
T
 
V
E
 
V
K
 
R
A
 
K
L
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
G
A
 
V
V
 
F
A
 
G
P
 
E
V
 
A
T
 
L
E
 
E
F
 
L
D
 
N
L
 
A
A
 
D
D
 
D
F
 
I
D
 
D
H
 
R
M
 
L
L
 
F
A
 
K
V
 
I
N
 
N
V
 
I
R
 
H
S
 
A
V
 
P
F
 
Y
V
 
H
A
 
A
S
 
S
Q
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Q
M
 
M
G
 
P
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
N
 
N
A
 
G
E
 
D
R
 
R
M
 
M
P
 
P
F
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
M
A
 
A
P
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
L
 
M
T
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
F
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
N
 
V
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
D
M
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
P
F
 
M
A
 
R
E
 
D
S
 
M
L
 
L
I
 
H
P
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
K
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
F
 
M
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
H
T
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A

5z2lK Crystal structure of bdca in complex with NADPH (see paper)
52% identity, 98% coverage: 7:249/249 of query aligns to 3:236/244 of 5z2lK

query
sites
5z2lK
L
 
F
E
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
Q
 
L
G
 
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
V
R
 
T
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
A
 
R
F
 
F
T
 
T
Y
|
Y
V
x
A
S
x
G
S
|
S
A
 
K
G
 
D
P
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
I
 
T
T
 
-
E
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
G
A
 
A
L
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
F
A
x
T
D
|
D
S
|
S
A
 
A
D
 
D
A
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
I
D
 
D
T
 
V
E
 
V
K
 
R
A
 
K
L
 
S
G
 
G
R
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
V
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
L
 
G
A
 
V
V
 
F
A
 
G
P
 
E
V
 
A
T
 
L
E
 
E
F
 
L
D
 
N
L
 
A
A
 
D
D
 
D
F
 
I
D
 
D
H
 
R
M
 
L
L
 
F
A
 
K
V
 
I
N
 
N
V
 
I
R
 
H
S
 
A
V
 
P
F
 
Y
V
 
H
A
 
A
S
 
S
Q
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Q
M
 
M
G
 
P
Q
 
E
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
L
N
 
I
I
|
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
N
 
N
A
 
G
E
 
D
R
 
R
M
 
M
P
 
P
F
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
M
A
 
A
P
 
A
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
|
K
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
G
 
G
L
 
M
T
 
A
R
 
R
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
F
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
N
 
N
N
 
V
V
 
V
Q
 
Q
P
|
P
G
 
G
P
 
P
V
x
I
D
 
D
T
|
T
D
 
D
M
x
A
N
|
N
P
 
P
A
 
A
S
 
N
G
 
G
E
 
P
F
 
M
A
 
R
E
 
D
S
 
M
L
 
L
I
 
H
P
 
S
L
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
K
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
F
 
M
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
G
 
G
P
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
M
L
 
H
T
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
F
 
F
A
 
G
A
 
A

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 98% coverage: 5:247/249 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
I
 
I
V
 
A
R
 
I
R
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
V
 
I
A
 
F
F
 
F
T
x
N
Y
|
Y
V
x
N
S
x
G
S
|
S
A
 
P
G
 
E
P
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
E
N
 
H
G
 
G
G
 
V
K
 
E
A
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
M
R
 
K
A
 
A
D
x
N
S
x
V
A
 
A
D
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
D
V
 
V
Q
 
D
L
 
A
A
 
F
V
 
F
D
 
K
D
 
Q
T
 
A
E
 
I
K
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
L
 
T
A
 
R
V
 
D
A
 
N
P
 
L
V
 
L
T
 
M
E
 
R
F
 
M
D
 
K
L
 
E
A
 
D
D
 
E
F
 
W
D
 
D
H
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
V
 
L
R
 
K
S
 
G
V
 
T
F
 
F
V
 
L
A
 
C
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
R
Y
 
T
M
 
M
-
 
M
-
 
K
G
 
Q
Q
 
R
G
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
A
S
|
S
T
 
V
N
 
-
A
 
V
E
 
G
R
 
L
M
 
I
P
 
G
F
 
N
A
 
A
G
 
G
G
x
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
M
 
A
S
 
S
K
|
K
S
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
G
 
T
M
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
V
x
I
D
 
T
T
|
T
D
 
D
M
 
M
N
 
T
P
 
D
A
 
K
S
 
L
G
 
D
E
 
E
-
 
K
F
 
T
A
 
K
E
 
E
S
 
A
L
 
M
I
 
L
P
 
A
L
 
Q
M
 
I
A
 
P
I
 
L
G
 
G
R
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
F
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
D
E
 
A
A
 
S
G
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
T
L
 
L
T
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
40% identity, 99% coverage: 1:247/249 of query aligns to 6:252/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
M
 
M
S
 
S
K
 
K
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
V
 
A
R
 
K
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
F
 
V
T
 
N
Y
 
Y
V
x
A
S
|
S
S
|
S
A
 
K
G
 
A
P
 
G
A
 
A
E
 
D
E
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
S
E
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
E
N
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
V
R
 
G
A
x
G
D
|
D
S
x
V
A
 
S
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
D
V
 
A
Q
 
Q
L
 
R
A
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
T
T
 
A
E
 
I
K
 
E
A
 
T
L
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
V
 
V
L
x
Y
A
 
E
V
 
F
A
 
A
P
 
P
V
 
I
T
 
E
E
 
A
F
 
I
D
 
T
L
 
E
A
 
E
D
 
H
F
 
Y
D
 
R
H
 
R
M
 
Q
L
 
F
A
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
V
R
 
F
S
 
G
V
 
V
F
 
L
V
 
L
A
 
T
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
K
Y
 
H
M
 
L
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
G
 
S
S
|
S
T
 
V
N
 
V
A
 
T
E
 
S
R
 
I
M
 
T
P
 
P
F
 
P
A
 
A
G
 
-
G
 
S
A
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
S
M
 
G
S
 
T
K
|
K
S
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
D
G
 
A
L
 
I
T
 
T
R
 
G
G
 
V
M
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
K
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
I
Q
 
N
P
|
P
G
|
G
P
x
M
V
x
I
D
 
V
T
|
T
D
 
E
M
x
G
N
x
T
P
 
H
A
 
S
S
 
A
G
 
G
-
x
I
-
 
I
-
 
G
-
 
S
E
 
D
F
 
L
A
 
E
E
 
A
S
 
Q
L
 
V
I
 
L
P
 
G
L
 
Q
M
 
T
A
 
P
I
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
N
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
S
F
 
V
V
 
A
A
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
W
I
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
E
S
 
H
L
 
L
T
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
L

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 1:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
S
 
S
K
 
Q
Q
 
F
L
 
M
T
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
R
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
G
T
 
T
Y
 
A
V
x
T
S
 
S
S
 
E
A
 
S
G
 
G
P
 
-
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
L
 
I
A
 
S
R
 
D
E
 
Y
I
 
L
T
 
G
E
 
D
N
 
N
G
 
G
G
 
-
K
 
K
A
 
G
L
 
M
A
 
A
L
 
L
R
x
N
A
x
V
D
 
T
S
 
N
A
 
P
D
 
E
A
 
S
-
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
I
D
 
T
D
 
D
T
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
L
 
T
A
 
R
V
 
D
A
 
N
P
 
L
V
 
L
T
 
M
E
 
R
F
 
M
D
 
K
L
 
E
A
 
E
D
 
E
F
 
W
D
 
S
H
 
D
M
 
I
L
 
M
A
 
E
V
 
T
N
|
N
V
 
L
R
 
T
S
 
S
V
 
I
F
 
F
V
 
R
A
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
R
Y
 
G
M
 
M
-
 
M
-
 
K
G
 
K
Q
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
V
G
|
G
S
|
S
T
 
V
N
 
-
A
 
V
E
 
G
R
 
T
M
 
M
P
 
G
F
 
N
A
 
A
G
 
G
G
x
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
T
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
 
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
M
 
M
N
 
N
P
 
D
A
 
E
S
 
Q
G
 
R
E
 
T
F
 
A
A
 
T
E
 
L
S
 
A
L
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
M
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
F
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
S
 
T
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

7nm8AAA Antimycin pathway standalone ketoreductase, AntM (see paper)
41% identity, 96% coverage: 8:246/249 of query aligns to 5:247/251 of 7nm8AAA

query
sites
7nm8AAA
E
 
Q
G
 
G
K
 
R
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
V
T
x
H
Y
|
Y
V
x
G
S
x
H
S
 
D
A
 
H
G
 
A
P
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
R
L
 
T
A
 
V
R
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
E
E
 
T
N
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
P
L
 
V
R
 
H
A
 
A
D
 
E
-
x
L
-
 
G
-
 
V
S
 
E
A
 
G
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
Q
 
W
L
 
A
A
 
A
V
 
F
D
 
D
D
 
E
T
 
A
E
 
L
K
 
S
A
 
G
L
 
T
G
 
G
R
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
L
 
T
A
 
L
V
 
P
A
 
R
P
 
P
V
 
I
T
 
A
E
 
A
F
 
V
D
 
T
L
 
E
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
D
 
D
H
 
R
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
P
F
 
F
V
 
F
A
 
I
S
 
V
Q
 
Q
A
 
R
A
 
S
A
 
L
R
 
E
Y
 
R
M
 
L
G
 
R
Q
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
S
I
 
I
G
 
-
S
 
S
T
x
S
N
 
A
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
M
 
T
P
 
A
F
 
Y
A
 
P
G
 
A
G
 
I
A
 
V
P
 
A
Y
|
Y
A
 
S
M
 
M
S
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
D
G
 
V
L
 
L
T
 
T
R
 
P
G
 
A
M
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
T
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
|
G
P
 
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
D
 
E
M
 
I
-
 
L
-
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
E
F
 
I
A
 
R
E
 
K
S
 
A
L
 
L
I
 
S
P
 
S
L
 
A
M
 
S
A
 
V
I
 
F
G
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
E
 
A
P
 
P
E
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
D
F
 
V
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
L
 
V
A
 
A
G
 
S
P
 
D
E
 
E
A
 
A
G
 
R
Y
 
W
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
W
L
 
I
T
 
D
V
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
42% identity, 99% coverage: 2:247/249 of query aligns to 1:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
S
 
S
K
 
Q
Q
 
F
L
 
M
T
 
N
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
I
V
 
A
R
 
E
R
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
I
F
 
G
T
 
T
Y
 
A
V
x
T
S
 
S
S
 
E
A
 
S
G
 
G
P
 
-
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
L
 
I
A
 
S
R
 
D
E
 
Y
I
 
L
T
 
G
E
 
D
N
 
N
G
 
G
G
 
-
K
 
K
A
 
G
L
 
M
A
 
A
L
 
L
R
x
N
A
x
V
D
 
T
S
 
N
A
 
P
D
 
E
A
 
S
-
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
I
D
 
T
D
 
D
T
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
L
 
T
A
 
R
V
 
D
A
 
N
P
 
L
V
 
L
T
 
M
E
 
R
F
 
M
D
 
K
L
 
E
A
 
E
D
 
E
F
 
W
D
 
S
H
 
D
M
 
I
L
 
M
A
 
E
V
 
T
N
 
N
V
 
L
R
 
T
S
 
S
V
 
I
F
 
F
V
 
R
A
 
L
S
 
S
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
L
R
 
R
Y
 
G
M
 
M
-
 
M
-
 
K
G
 
K
Q
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
x
V
G
 
G
S
|
S
T
 
V
N
 
-
A
 
V
E
 
G
R
 
T
M
 
M
P
 
G
F
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
V
G
 
A
P
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
T
V
 
V
Q
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
x
I
D
 
E
T
|
T
D
 
D
M
|
M
N
 
T
P
 
K
A
 
A
-
 
L
S
 
N
G
 
D
E
 
E
F
 
Q
A
 
R
E
 
T
S
 
A
L
 
T
I
 
L
P
 
A
L
 
Q
M
 
V
A
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
E
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
F
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
S
 
T
L
 
L
T
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain ATCC 27184 / PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 4:244/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
E
 
T
G
 
A
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
 
G
G
x
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
L
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
M
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
V
T
 
N
Y
 
Y
V
 
A
S
 
Q
S
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
A
A
 
A
E
 
D
E
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
I
E
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
V
R
 
Q
A
 
A
D
 
N
S
 
V
A
 
A
D
 
N
A
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
V
Q
 
D
L
 
Q
A
 
L
V
 
I
D
 
K
D
 
T
T
 
T
E
 
L
K
 
D
A
 
K
L
 
F
G
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
T
A
 
R
V
 
D
A
 
T
P
 
L
V
 
L
T
 
L
E
 
R
F
 
M
D
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
D
F
 
W
D
 
Q
H
 
A
M
 
V
L
 
I
A
 
D
V
 
L
N
 
N
V
 
L
R
 
T
S
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
L
A
 
C
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
A
 
V
A
 
S
R
 
K
Y
 
L
M
 
M
-
 
L
-
 
K
G
 
Q
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
G
 
T
S
 
S
T
 
V
N
 
-
A
 
A
E
 
G
R
 
M
M
 
M
P
 
G
F
 
N
A
x
P
G
 
G
G
 
Q
A
 
A
P
 
N
Y
 
Y
A
 
S
M
 
A
S
 
A
K
|
K
S
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
G
 
T
M
 
V
A
 
A
R
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
P
x
F
V
 
I
D
 
A
T
 
T
D
 
D
M
 
M
N
 
T
P
 
E
A
 
N
S
 
L
G
x
N
E
 
-
F
 
-
A
 
A
E
 
E
S
 
P
L
 
I
I
 
L
P
 
Q
L
 
F
M
 
I
A
 
P
I
 
L
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
F
 
T
V
 
I
A
 
R
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
T
G
 
D
P
 
P
E
 
A
A
 
A
G
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
T
L
 
F
T
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

8w0oA Gdh-105 crystal structure
35% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 5:250/259 of 8w0oA

query
sites
8w0oA
L
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
A
V
 
I
Q
 
T
G
|
G
G
 
A
S
 
A
R
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
M
V
 
A
R
 
I
R
 
R
L
 
F
A
 
G
R
 
K
E
 
E
G
 
Q
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
I
T
 
N
Y
 
Y
V
x
Y
S
 
S
S
 
N
A
 
K
G
x
Q
P
 
D
A
 
P
E
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
V
T
 
I
E
 
K
N
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
V
R
 
Q
A
 
G
D
|
D
S
x
V
A
 
T
D
 
K
A
 
E
A
 
E
A
 
D
V
 
V
Q
 
K
L
 
N
A
 
I
V
 
V
D
 
Q
D
 
T
T
 
A
E
 
I
K
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
L
 
E
A
 
N
V
 
P
A
 
V
P
 
P
V
 
S
T
 
H
E
 
E
F
 
M
D
 
P
L
 
L
A
 
K
D
 
D
F
 
W
D
 
D
H
 
K
M
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
T
N
 
N
V
 
L
R
 
T
S
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
S
 
S
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
Y
 
Y
M
 
F
G
 
V
Q
 
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
x
M
G
 
S
S
 
S
T
 
V
N
 
H
A
 
-
E
 
E
R
 
V
M
 
I
P
 
P
F
 
W
A
 
P
G
 
L
G
 
F
A
 
V
P
 
H
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
K
G
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
K
G
 
T
M
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
G
P
|
P
G
|
G
P
 
A
V
x
I
D
 
N
T
|
T
D
 
T
M
 
I
N
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
D
P
 
P
A
 
K
S
 
Q
G
 
K
E
 
A
F
 
D
A
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
M
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
Y
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
F
 
V
V
 
A
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
S
 
T
L
 
L
T
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
36% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 5:250/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
Q
 
T
G
 
G
G
 
S
S
 
S
R
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
K
A
 
S
I
 
M
V
 
A
R
 
I
R
 
R
L
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
V
T
 
N
Y
 
Y
V
x
R
S
 
S
S
 
K
A
 
E
G
 
D
P
 
E
A
 
A
E
 
N
E
 
S
L
 
V
A
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
E
 
K
N
 
V
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
G
D
|
D
S
x
V
A
 
T
D
 
V
A
 
E
A
 
S
A
 
D
V
 
V
Q
 
I
L
 
N
A
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
S
T
 
A
E
 
I
K
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
L
 
A
A
 
N
V
 
P
A
 
V
P
 
S
V
 
S
T
 
H
E
 
E
F
 
M
D
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
D
F
 
W
D
 
N
H
 
K
M
 
V
L
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
R
 
T
S
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
S
 
S
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
Y
 
Y
M
 
F
G
 
V
Q
 
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
x
M
G
 
S
S
|
S
T
 
V
N
 
H
A
 
-
E
 
E
R
 
K
M
 
I
P
 
P
F
 
W
A
 
P
G
 
L
G
 
F
A
 
V
P
 
H
Y
|
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
|
K
S
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
K
G
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
G
 
T
M
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
G
P
|
P
G
|
G
P
 
A
V
x
I
D
 
N
T
|
T
D
 
P
M
 
I
N
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
D
P
 
P
A
 
E
S
 
Q
G
 
R
E
 
A
F
 
D
A
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
M
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
G
R
 
Y
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
F
 
V
V
 
A
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
S
 
T
L
 
L
T
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
36% identity, 97% coverage: 7:247/249 of query aligns to 5:250/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
x
V
V
x
I
Q
x
T
G
|
G
G
x
S
S
|
S
R
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
A
x
K
A
x
S
I
x
M
V
x
A
R
x
I
R
|
R
L
x
F
A
|
A
R
x
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
Q
x
K
V
|
V
A
x
V
F
 
V
T
 
N
Y
 
Y
V
 
R
S
 
S
S
 
K
A
 
E
G
 
D
P
 
E
A
 
A
E
 
N
E
 
S
L
 
V
A
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
E
 
K
N
 
V
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
G
D
 
D
S
 
V
A
 
T
D
 
V
A
 
E
A
 
S
A
 
D
V
 
V
Q
 
I
L
 
N
A
 
L
V
 
V
D
 
Q
D
 
S
T
 
A
E
 
I
K
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
x
E
A
 
N
V
 
P
A
 
V
P
 
S
V
 
S
T
 
H
E
 
E
F
 
M
D
 
S
L
 
L
A
 
S
D
|
D
F
 
W
D
 
N
H
 
K
M
x
V
L
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
R
 
T
S
 
G
V
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
S
 
S
Q
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
I
R
 
K
Y
 
Y
M
 
F
G
 
V
Q
x
E
G
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
K
G
 
G
R
 
T
I
 
V
I
 
I
N
 
N
I
 
M
G
 
S
S
 
S
T
 
V
N
 
H
A
 
-
E
 
E
R
 
K
M
 
I
P
 
P
F
 
W
A
 
P
G
 
L
G
 
F
A
 
V
P
 
H
Y
 
Y
A
 
A
M
 
A
S
 
S
K
 
K
S
 
G
A
 
G
L
 
M
V
 
K
G
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
G
 
T
M
 
L
A
 
A
R
 
L
D
 
E
L
 
Y
G
 
A
P
 
P
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
|
V
N
 
N
N
 
N
V
 
I
Q
 
G
P
 
P
G
 
G
P
 
A
V
 
I
D
 
N
T
 
T
D
x
P
M
 
I
N
 
N
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
D
P
 
P
A
 
E
S
 
Q
G
 
R
E
 
A
F
 
D
A
 
V
E
|
E
S
 
S
L
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
M
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
G
R
x
Y
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
F
 
V
V
 
A
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
S
 
T
L
 
L
T
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

Sites not aligning to the query:

3iccA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase from bacillus anthracis at 1.87 a resolution (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:246/249 of query aligns to 5:252/255 of 3iccA

query
sites
3iccA
L
 
L
E
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
|
G
G
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
N
E
 
D
G
 
G
A
 
A
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
I
T
x
H
Y
|
Y
V
x
G
S
 
N
S
 
R
A
 
K
G
 
E
P
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
E
L
 
T
A
 
V
R
 
Y
E
 
E
I
 
I
T
 
Q
E
 
S
N
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
S
A
 
A
L
 
F
A
 
S
L
 
I
R
 
G
A
 
A
D
 
N
S
x
L
A
x
E
D
 
S
A
 
L
A
 
H
A
 
G
V
 
V
Q
 
E
L
 
A
A
 
L
V
 
Y
D
 
S
D
 
S
T
 
L
E
 
D
K
 
N
A
 
E
L
 
L
-
 
Q
-
 
N
-
 
R
-
 
T
-
 
G
-
 
S
G
 
T
R
 
K
L
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
L
 
G
A
 
P
V
 
G
A
 
A
P
 
F
V
 
I
T
 
E
E
 
E
F
 
T
D
 
T
L
 
E
A
 
Q
D
 
F
F
 
F
D
 
D
H
 
R
M
 
M
L
 
V
A
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
A
R
 
K
S
 
A
V
 
P
F
 
F
V
 
F
A
 
I
S
 
I
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
L
R
 
S
Y
 
R
M
 
L
G
 
R
Q
 
D
G
 
N
G
 
S
R
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
G
 
S
S
|
S
T
 
A
N
 
-
A
 
A
E
 
T
R
 
R
M
 
I
P
 
S
F
 
L
A
 
P
G
 
D
G
x
F
A
 
I
P
 
A
Y
|
Y
A
 
S
M
 
M
S
 
T
K
|
K
S
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
N
G
 
T
L
 
M
T
 
T
R
 
F
G
 
T
M
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
G
 
G
P
 
A
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
A
V
 
I
Q
 
L
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
 
V
D
 
K
T
 
T
D
 
D
M
|
M
N
|
N
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
D
P
 
P
A
 
M
S
 
M
G
 
K
E
 
Q
F
 
Y
A
 
A
E
 
T
S
 
T
L
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
I
M
 
S
A
 
A
I
 
F
G
 
N
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
E
 
E
P
 
V
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
D
F
 
T
V
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
S
G
 
R
Y
 
W
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
L
L
 
I
T
 
D
V
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
40% identity, 96% coverage: 10:247/249 of query aligns to 3:253/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
|
L
V
|
V
Q
x
T
G
|
G
G
x
A
S
x
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
K
A
|
A
I
|
I
V
x
A
R
x
L
R
|
R
L
|
L
A
x
V
R
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
Q
x
A
V
|
V
A
|
A
F
x
I
T
x
A
Y
x
D
V
 
Y
S
 
N
S
 
D
A
 
A
G
 
-
P
 
T
A
 
A
E
 
K
E
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
S
E
 
E
I
 
I
T
 
N
E
 
Q
N
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
V
R
 
K
A
 
V
D
|
D
S
 
V
A
 
S
D
 
D
A
 
R
A
 
D
A
 
Q
V
 
V
Q
 
F
L
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
E
D
 
Q
T
 
A
E
 
R
K
 
K
A
 
T
L
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
A
A
 
P
V
 
S
A
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
E
E
 
S
F
 
I
D
 
T
L
 
P
A
 
E
D
 
I
F
 
V
D
 
D
H
 
K
M
 
V
L
 
Y
A
 
N
V
 
I
N
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
G
V
 
V
F
 
I
V
 
W
A
 
G
S
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
F
R
 
K
Y
 
K
M
 
E
G
 
G
Q
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
-
G
 
A
S
 
C
T
 
S
N
 
Q
A
 
A
E
 
G
R
 
H
M
 
V
P
 
G
F
 
N
A
 
P
G
 
E
G
 
L
A
 
A
P
 
V
Y
 
Y
A
 
S
M
 
S
S
 
S
K
|
K
S
 
F
A
 
A
L
 
V
V
 
R
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
Q
G
 
T
M
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
D
L
 
L
G
 
A
P
 
P
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
G
V
 
Y
Q
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
I
V
 
V
D
 
K
T
 
T
D
 
P
M
 
M
-
 
W
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
N
 
S
P
 
E
A
 
A
S
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
A
E
 
E
F
 
F
A
 
A
E
 
K
S
 
R
L
 
I
I
 
-
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
S
E
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
A
F
 
C
V
 
V
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
S
P
 
P
E
 
D
A
 
S
G
 
D
Y
 
Y
I
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
38% identity, 96% coverage: 10:247/249 of query aligns to 5:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
G
 
G
G
 
A
S
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
I
V
 
A
R
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
V
T
 
N
Y
 
Y
V
 
A
S
 
G
S
 
S
A
 
K
G
 
E
P
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
E
 
A
N
 
K
G
 
G
G
 
V
K
 
D
A
 
S
L
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
A
 
A
D
 
N
S
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
A
 
E
V
 
V
Q
 
K
L
 
A
A
 
M
V
 
I
D
 
K
D
 
E
T
 
V
E
 
V
K
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
T
A
 
R
V
 
D
A
 
N
P
 
L
V
 
L
T
 
M
E
 
R
F
 
M
D
 
K
L
 
E
A
 
Q
D
 
E
F
 
W
D
 
D
H
 
D
M
 
V
L
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
V
 
L
R
 
K
S
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
N
A
 
C
S
 
I
Q
 
Q