SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_2689 FitnessBrowser__Putida:PP_2689 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

3k0tC Crystal structure of pspto -psp protein in complex with d-beta-glucose from pseudomonas syringae pv. Tomato str. Dc3000 (see paper)
39% identity, 81% coverage: 11:110/123 of query aligns to 11:111/124 of 3k0tC

query
sites
3k0tC
A
 
A
S
 
A
R
 
I
A
 
G
P
 
P
L
x
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
K
G
 
A
N
 
G
G
 
N
T
 
T
L
 
V
Y
 
Y
-
 
M
T
 
S
A
x
G
Q
 
Q
I
|
I
P
 
P
I
 
L
D
 
D
T
 
P
Q
 
S
G
 
T
Q
 
M
V
 
E
V
 
L
A
 
V
G
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
A
 
I
R
 
T
Q
 
Q
T
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
S
T
 
V
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
G
S
 
S
L
 
F
D
 
K
A
 
D
V
 
I
T
 
V
Q
 
K
V
 
L
L
 
N
I
 
I
Y
 
F
V
 
L
T
 
T
D
 
D
R
 
L
R
 
G
Y
 
H
L
x
F
A
 
A
T
 
K
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
M
A
 
G
E
 
S
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
S
A
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
N
 
A
R
|
R
A
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
P
R
|
R

Sites not aligning to the query:

2b33B Crystal structure of a putative endoribonuclease (tm0215) from thermotoga maritima msb8 at 2.30 a resolution
43% identity, 74% coverage: 20:110/123 of query aligns to 21:112/126 of 2b33B

query
sites
2b33B
V
 
V
V
 
V
G
 
G
N
 
N
G
 
M
T
 
M
L
 
F
Y
 
V
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
I
D
|
D
T
 
P
Q
x
E
-
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
Q
G
 
G
G
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
E
Q
 
K
A
 
T
R
 
E
Q
 
R
T
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
A
T
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
G
 
G
S
 
F
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
D
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
V
L
 
T
I
 
V
Y
 
F
V
 
T
T
 
T
D
 
S
R
 
M
R
 
D
Y
 
Y
L
 
F
A
 
Q
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
A
 
S
E
 
R
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
G
A
 
D
P
 
H
Y
 
R
P
 
P
N
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
F
V
 
V
V
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
L
 
L
A
 
P
R
 
R

7cd4A Crystal structure of the s103f mutant of bacillus subtilis (natto) yabj protein. (see paper)
35% identity, 92% coverage: 11:123/123 of query aligns to 11:123/124 of 7cd4A

query
sites
7cd4A
A
 
A
S
 
A
R
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
G
V
 
I
V
 
I
G
 
V
N
 
N
G
 
N
T
 
M
L
 
F
Y
 
Y
T
 
S
A
 
S
-
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
L
D
 
T
T
 
P
Q
 
S
G
 
G
Q
 
E
V
 
M
V
 
V
A
 
N
G
 
G
G
 
D
I
 
I
E
 
K
A
x
E
Q
 
Q
A
 
T
R
 
H
Q
 
Q
T
 
V
L
 
F
D
 
S
N
 
N
L
 
L
R
 
K
H
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
A
S
 
S
L
 
F
D
 
E
A
 
T
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
A
L
 
T
I
 
V
Y
 
F
V
 
I
T
 
A
D
 
D
R
 
M
R
 
E
Y
 
Q
L
 
F
A
 
A
T
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
E
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
D
A
 
T
P
 
H
Y
 
K
P
 
P
N
 
A
R
 
R
A
 
F
A
 
C
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
P
R
 
K
E
 
-
E
 
D
M
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
E
V
 
V
Y
 
I
A
 
A
C
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

5v4dA Crystal structure of the protein of unknown function of the conserved rid protein family yyfa from yersinia pestis
37% identity, 88% coverage: 14:121/123 of query aligns to 16:125/127 of 5v4dA

query
sites
5v4dA
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
C
G
 
F
N
 
N
G
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
-
 
A
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
I
D
 
N
T
 
P
Q
 
D
-
 
T
G
 
G
Q
 
D
V
 
L
V
 
V
A
 
E
G
 
N
G
 
D
I
 
I
E
 
E
A
 
K
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
L
 
L
D
 
K
N
 
N
L
 
I
R
 
D
H
 
A
T
 
V
L
 
L
E
 
L
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
S
 
T
S
 
T
L
 
K
D
 
D
A
 
K
V
 
I
T
 
V
Q
 
K
V
 
T
L
 
T
I
 
I
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
D
 
N
R
 
I
R
 
N
Y
 
N
L
 
S
A
 
S
T
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
x
D
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
x
D
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
K
A
 
G
P
 
T
-
 
I
Y
 
F
P
 
P
N
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
T
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
P
R
 
K
E
 
-
E
 
G
M
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
E
V
 
V
Y
 
I
A
 
A

Q7CP78 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Enamine/imine deaminase; EC 3.5.99.10 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
36% identity, 74% coverage: 21:111/123 of query aligns to 23:116/128 of Q7CP78

query
sites
Q7CP78
V
 
L
G
 
G
N
 
S
G
 
M
T
 
V
L
 
I
Y
 
T
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
D
T
 
P
Q
 
K
G
 
T
Q
 
G
V
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
E
G
 
D
I
 
V
E
 
S
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
V
R
 
K
H
 
A
T
 
I
L
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
L
S
 
K
L
 
V
D
 
G
A
 
D
V
 
I
T
 
V
Q
 
K
V
 
T
L
 
T
I
 
V
Y
 
F
V
 
V
T
 
K
D
 
D
R
 
L
R
 
N
Y
 
D
L
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
T
Y
 
Y
A
 
E
E
 
A
Y
 
F
F
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
H
Q
 
N
A
 
A
P
 
T
Y
 
F
P
 
P
N
 
A
R
|
R
A
 
S
A
 
C
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
P
R
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

3vczB 1.80 angstrom resolution crystal structure of a putative translation initiation inhibitor from vibrio vulnificus cmcp6
37% identity, 74% coverage: 21:111/123 of query aligns to 22:116/127 of 3vczB

query
sites
3vczB
V
 
L
G
 
G
N
 
N
G
 
M
T
 
V
L
 
L
Y
 
T
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
N
T
 
P
Q
 
A
G
 
T
Q
 
G
V
 
E
V
 
V
A
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
I
E
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
T
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
V
R
 
K
H
 
A
T
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
L
S
 
T
L
 
V
D
 
G
A
 
D
V
 
I
T
 
V
Q
 
K
V
 
M
L
 
T
I
 
V
Y
 
F
V
 
V
T
 
K
D
|
D
R
 
L
R
x
N
Y
 
D
L
 
F
A
 
G
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
A
 
G
E
 
N
Y
 
F
F
 
F
Q
 
D
-
 
E
-
 
H
-
 
N
-
 
V
A
 
A
P
 
H
Y
 
Y
P
 
P
N
 
A
R
 
R
A
 
S
A
 
C
V
 
V
V
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
P
R
 
K
E
 
D

P52759 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Liver perchloric acid-soluble protein; L-PSP; Reactive intermediate imine deaminase A homolog; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen homolog; rp14.5; EC 3.5.99.10 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
36% identity, 89% coverage: 1:110/123 of query aligns to 1:117/137 of P52759

query
sites
P52759
M
|
M
K
x
S
H
 
S
A
 
I
I
 
I
K
 
R
T
 
K
E
 
V
L
 
I
F
 
S
A
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
A
P
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
G
-
 
A
L
 
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
V
N
 
D
G
 
R
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
-
 
V
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
G
I
 
M
D
 
D
-
 
P
T
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
V
 
V
A
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
A
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
G
H
 
E
T
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
C
S
 
D
L
 
F
D
 
T
A
 
N
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
T
L
 
T
I
 
V
Y
 
L
V
 
L
T
 
A
D
 
D
R
 
I
R
 
N
Y
 
D
L
 
F
A
 
G
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
A
 
K
E
 
T
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
A
 
G
P
 
N
Y
 
L
P
 
P
N
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
P
R
 
K

P80601 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; 14.3 kDa perchloric acid soluble protein; Translation inhibitor L-PSP ribonuclease; UK114 antigen; EC 3.5.99.10; EC 3.1.-.- from Capra hircus (Goat) (see paper)
36% identity, 81% coverage: 11:110/123 of query aligns to 16:117/137 of P80601

query
sites
P80601
A
 
A
S
 
A
R
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
L
G
 
V
N
 
D
G
 
R
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
-
 
I
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
L
P
 
G
I
 
M
D
 
D
-
 
P
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
L
V
 
V
A
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
V
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
N
L
 
I
R
 
G
H
 
E
T
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
C
S
 
D
L
 
F
D
 
T
A
 
N
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
A
L
 
T
I
 
V
Y
 
L
V
 
L
T
 
A
D
 
D
R
 
I
R
 
N
Y
 
D
L
 
F
A
 
S
T
 
A
V
 
V
N
 
N
A
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
K
E
 
Q
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
P
 
S
Y
 
F
P
 
P
N
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
Y
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

2uynA Crystal structure of e. Coli tdcf with bound 2-ketobutyrate (see paper)
33% identity, 76% coverage: 21:114/123 of query aligns to 22:118/127 of 2uynA

query
sites
2uynA
V
 
L
G
 
G
N
 
S
G
 
M
T
 
V
L
 
F
Y
 
T
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
C
T
 
P
Q
 
Q
G
 
T
Q
 
G
V
 
E
V
 
I
A
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
T
 
S
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
V
R
 
K
H
 
A
T
 
I
L
 
V
E
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
L
S
 
S
L
 
V
D
 
G
A
 
D
V
 
I
T
 
I
Q
 
K
V
 
M
L
 
T
I
 
V
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
D
 
D
R
 
L
R
 
N
Y
 
D
L
x
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
A
 
K
E
 
Q
Y
 
F
F
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
H
Q
 
Q
A
 
A
P
 
T
Y
 
Y
P
 
P
N
 
T
R
|
R
A
x
S
A
x
C
V
 
V
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
P
R
 
K
E
 
D
E
 
V
M
 
K
L
 
L

2uykC Crystal structure of e. Coli tdcf with bound serine (see paper)
33% identity, 76% coverage: 21:114/123 of query aligns to 22:118/127 of 2uykC

query
sites
2uykC
V
 
L
G
 
G
N
 
S
G
 
M
T
 
V
L
 
F
Y
 
T
T
 
S
A
 
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
I
 
V
D
 
C
T
 
P
Q
 
Q
G
 
T
Q
 
G
V
 
E
V
 
I
A
 
P
G
 
A
G
 
D
I
 
V
E
 
Q
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
T
 
S
L
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
V
R
 
K
H
 
A
T
 
I
L
 
V
E
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
L
S
 
S
L
 
V
D
 
G
A
 
D
V
 
I
T
 
I
Q
 
K
V
 
M
L
 
T
I
 
V
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
D
 
D
R
 
L
R
 
N
Y
 
D
L
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
A
 
K
E
 
Q
Y
 
F
F
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
H
Q
 
Q
A
 
A
P
 
T
Y
 
Y
P
 
P
N
 
T
R
|
R
A
x
S
A
x
C
V
 
V
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
R
L
 
L
A
 
P
R
 
K
E
 
D
E
 
V
M
 
K
L
 
L

A0A1J1DL12 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; Allergen Der f 34; Enamine/imine deaminase; Allergen Der f 34.0101; EC 3.5.99.10 from Dermatophagoides farinae (American house dust mite) (see paper)
32% identity, 79% coverage: 14:110/123 of query aligns to 17:115/128 of A0A1J1DL12

query
sites
A0A1J1DL12
A
 
G
P
 
P
L
x
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
A
V
 
V
-
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
N
G
 
T
T
 
V
L
 
Y
Y
 
L
T
 
S
A
x
G
Q
 
Q
I
 
I
P
 
G
I
 
M
D
 
N
T
 
V
Q
 
R
-
 
T
G
 
N
Q
 
E
V
 
M
V
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
P
I
 
I
E
 
R
A
 
D
Q
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
L
 
F
D
 
T
N
|
N
L
 
M
R
 
K
H
 
A
T
 
V
L
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
A
S
 
K
L
 
M
D
 
S
A
 
D
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
V
L
 
N
I
 
I
Y
 
F
V
 
I
T
 
R
D
 
N
R
 
F
R
 
N
Y
 
D
L
 
F
A
 
P
T
 
A
V
 
I
N
|
N
A
 
D
V
 
V
Y
 
M
A
 
K
E
 
E
Y
 
F
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
P
 
P
Y
 
F
P
 
P
N
 
A
R
|
R
A
 
S
A
 
T
V
 
V
V
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
E
L
 
L
A
x
P
R
 
K

Sites not aligning to the query:

P0AFQ5 3-aminoacrylate deaminase RutC; 3-AA deaminase; EC 3.5.-.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 90% coverage: 11:121/123 of query aligns to 13:124/128 of P0AFQ5

query
sites
P0AFQ5
A
 
A
S
 
P
R
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
F
E
 
V
W
 
P
A
 
G
V
 
T
V
 
L
G
 
A
N
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
V
Y
 
Y
-
 
V
T
 
S
A
 
G
Q
 
T
I
 
L
P
 
A
I
 
F
D
 
D
T
 
Q
Q
 
H
G
 
N
Q
 
N
V
 
V
V
 
L
-
 
F
A
 
A
G
 
D
G
 
D
I
 
P
E
 
K
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Q
 
H
T
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
T
L
 
I
R
 
R
H
 
K
T
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
G
S
 
T
L
 
M
D
 
A
A
 
D
V
 
V
T
 
T
Q
 
F
V
 
N
L
 
S
I
 
I
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
D
 
D
R
 
W
R
 
K
Y
 
N
L
 
Y
A
 
A
T
 
A
V
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
Y
 
F
F
 
F
Q
 
P
A
 
G
P
 
D
Y
 
K
P
 
P
N
 
A
R
|
R
A
 
F
A
 
C
V
 
-
V
 
I
V
 
Q
A
 
C
G
 
G
L
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
P
E
 
D
M
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
I
V
 
A
V
 
T
Y
 
I
A
 
A

Q94JQ4 Reactive Intermediate Deaminase A, chloroplastic; 2-iminobutanoate/2-iminopropanoate deaminase; EC 3.5.99.10 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 87% coverage: 2:108/123 of query aligns to 64:173/187 of Q94JQ4

query
sites
Q94JQ4
K
 
K
H
 
E
A
 
V
I
 
V
K
 
S
T
 
T
E
 
E
L
 
K
F
 
A
-
 
P
A
 
A
S
 
A
R
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
Y
E
 
S
W
 
Q
A
 
A
V
 
I
V
 
K
G
 
A
N
 
N
G
 
N
T
 
L
L
 
V
Y
 
F
T
 
L
A
 
S
Q
 
G
I
 
V
P
 
L
-
 
G
-
 
L
I
 
I
D
 
P
T
 
E
Q
 
T
G
 
G
Q
 
K
V
 
F
V
 
V
A
 
S
G
 
E
G
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
D
Q
 
Q
A
 
T
R
 
E
Q
 
Q
T
 
V
L
 
L
D
 
K
N
 
N
L
 
M
R
 
G
H
 
E
T
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
A
S
 
D
L
 
Y
D
 
S
A
 
S
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
T
L
 
T
I
 
I
Y
 
M
V
 
L
T
 
A
D
 
D
R
 
L
R
 
A
Y
 
D
L
 
F
A
 
K
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
S
P
 
P
N
 
A
R
|
R
A
 
S
A
 
T
V
 
Y
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L

5hp8A Crystal structures of rida in complex with pyruvate (see paper)
37% identity, 62% coverage: 33:108/123 of query aligns to 19:94/108 of 5hp8A

query
sites
5hp8A
I
 
I
D
 
P
T
 
E
Q
 
T
G
 
G
Q
 
K
V
 
F
V
 
V
A
 
S
G
 
E
G
 
S
I
 
V
E
 
E
A
 
D
Q
 
Q
A
 
T
R
 
E
Q
 
Q
T
 
V
L
 
L
D
 
K
N
 
N
L
 
M
R
 
G
H
 
E
T
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
A
S
 
D
L
 
Y
D
 
S
A
 
S
V
 
V
T
 
V
Q
 
K
V
 
T
L
 
T
I
 
I
Y
 
M
V
 
L
T
 
A
D
 
D
R
 
L
R
 
A
Y
 
D
L
 
F
A
 
K
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
E
V
 
I
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
Y
 
Y
F
 
F
Q
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
S
P
 
P
N
 
A
R
|
R
A
 
S
A
x
T
V
 
Y
V
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
L

3i3fB Hypothetical protein from giardia lamblia gl50803_14299
34% identity, 78% coverage: 23:118/123 of query aligns to 23:121/128 of 3i3fB

query
sites
3i3fB
N
 
N
G
 
G
T
 
M
L
 
V
Y
 
Y
T
 
L
A
 
G
-
 
G
Q
 
S
I
 
V
P
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
K
Q
 
S
G
 
G
Q
 
-
V
 
T
V
 
L
A
 
H
G
 
K
G
 
G
I
 
L
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
L
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
I
R
 
R
H
 
K
T
 
C
L
 
L
E
 
E
A
 
Y
A
 
A
G
 
N
S
 
S
S
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
Y
V
 
I
T
 
V
Q
 
S
V
 
L
L
 
N
I
 
I
Y
 
F
V
 
L
T
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
L
D
 
S
R
 
D
R
 
S
Y
 
E
L
 
E
A
 
A
T
 
R
V
 
F
N
 
N
A
 
E
V
 
L
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
Y
 
V
F
 
F
Q
 
C
A
 
V
P
 
P
Y
 
A
P
 
T
N
 
R
R
 
P
A
 
C
A
x
R
V
x
C
V
x
C
V
 
V
A
 
R
G
 
A
L
 
Q
A
 
L
R
x
Q
E
 
E
E
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3i3fA Hypothetical protein from giardia lamblia gl50803_14299
34% identity, 78% coverage: 23:118/123 of query aligns to 26:124/131 of 3i3fA

query
sites
3i3fA
N
 
N
G
 
G
T
 
M
L
 
V
Y
 
Y
T
 
L
A
 
G
-
x
G
Q
 
S
I
 
V
P
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
K
Q
 
S
G
 
G
Q
 
-
V
 
T
V
 
L
A
 
H
G
 
K
G
 
G
I
 
L
E
 
E
A
 
E
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
L
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
I
R
 
R
H
 
K
T
 
C
L
 
L
E
 
E
A
 
Y
A
 
A
G
 
N
S
 
S
S
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
Y
V
 
I
T
 
V
Q
 
S
V
 
L
L
 
N
I
 
I
Y
 
F
V
 
L
T
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
L
D
 
S
R
 
D
R
 
S
Y
 
E
L
 
E
A
 
A
T
 
R
V
 
F
N
 
N
A
 
E
V
 
L
Y
 
Y
A
 
R
E
 
E
Y
 
V
F
 
F
Q
 
C
A
 
V
P
 
P
Y
 
A
P
 
T
N
 
R
R
 
P
A
 
C
A
x
R
V
x
C
V
x
C
V
 
V
A
 
R
G
 
A
L
 
Q
A
 
L
R
 
Q
E
 
E
E
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_2689 FitnessBrowser__Putida:PP_2689
MKHAIKTELFASRAPLEWAVVGNGTLYTAQIPIDTQGQVVAGGIEAQARQTLDNLRHTLE
AAGSSLDAVTQVLIYVTDRRYLATVNAVYAEYFQAPYPNRAAVVVAGLAREEMLVELVVY
ACL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory