SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_3136 FitnessBrowser__Putida:PP_3136 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
35% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 102:239/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
G
R
 
H
W
 
W
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
W
R
 
N
K
 
K
L
 
G
C
 
R
S
 
R
L
 
A
I
 
L
Y
 
A
K
 
I
V
 
F
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
I
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
-
x
G
L
 
T
K
 
G
N
 
K
V
 
T
D
 
S
E
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
33% identity, 82% coverage: 19:160/174 of query aligns to 98:230/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
L
V
 
A
L
 
C
L
 
Q
V
 
A
Y
 
H
R
 
R
F
 
V
G
 
A
R
 
H
-
 
L
-
 
L
W
 
W
R
 
R
Y
 
Q
T
 
S
L
 
R
R
 
R
P
 
P
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
-
K
 
-
L
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
 
A
L
 
L
F
 
H
K
 
S
F
 
R
V
 
I
Q
 
A
I
 
N
I
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
N
 
G
F
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
x
L
N
 
H
G
 
H
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
x
G
K
 
T
N
 
G
V
 
G
D
 
D
E
 
R
P
 
H
I
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
G
V
 
V
D
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
E
N
 
G
V
 
A
I
x
K
I
 
V
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
R
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
|
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
35% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 105:242/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
G
R
 
H
W
 
W
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
W
R
 
N
K
 
K
L
 
G
C
 
R
S
 
R
L
 
A
I
 
L
Y
 
A
K
 
I
V
 
F
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
I
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
x
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
-
x
G
L
x
T
K
 
G
N
 
K
V
 
T
D
 
S
E
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
|
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
I
x
K
I
|
I
G
|
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
|
L
V
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
36% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 109:246/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
G
R
 
H
W
 
W
R
 
L
Y
 
W
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
A
L
 
Q
L
 
D
R
 
R
K
 
K
L
 
A
C
 
L
S
 
A
L
 
-
I
 
I
Y
 
Y
K
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
I
 
A
T
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
C
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
 
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
|
G
-
x
G
L
 
T
K
 
G
N
 
K
V
 
T
D
 
S
E
 
G
P
 
D
I
x
R
A
 
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
D
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
A
N
 
H
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
35% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 106:243/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
G
R
 
H
W
 
W
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
W
R
 
N
K
 
K
L
 
G
C
 
R
S
 
R
L
 
A
I
 
L
Y
 
A
K
 
I
V
 
F
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
I
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
L
D
 
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
x
L
N
x
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
G
L
 
T
K
 
G
N
 
K
V
 
T
D
 
S
E
 
G
P
 
D
I
 
R
A
 
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
|
G
T
x
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
S
 
T
L
x
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
32% identity, 82% coverage: 19:160/174 of query aligns to 105:240/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
L
V
 
A
L
 
C
L
 
Q
V
 
A
Y
 
H
R
 
R
F
 
V
G
 
A
R
 
H
-
 
L
-
 
L
W
 
W
R
 
R
Y
 
Q
T
 
S
L
 
R
R
 
R
P
 
P
A
 
L
L
 
A
L
 
L
R
 
-
K
 
-
L
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
 
A
L
 
L
F
 
H
K
 
S
F
 
R
V
 
I
Q
 
A
I
 
N
I
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
K
N
 
G
F
 
I
V
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
H
G
 
H
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
-
x
G
L
 
T
K
 
G
N
 
K
V
 
V
D
 
G
E
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
G
V
 
V
D
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
E
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
R
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
34% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 106:243/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
A
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
G
R
 
H
W
 
W
R
 
L
Y
 
W
T
 
N
L
 
Q
R
 
G
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
K
 
R
L
 
A
C
 
L
S
 
A
L
 
I
I
 
F
Y
 
-
K
 
-
V
 
-
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
I
 
T
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
 
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
-
x
G
L
 
T
K
 
G
N
 
K
V
 
S
D
 
G
E
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
R
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
S
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
33% identity, 70% coverage: 50:171/174 of query aligns to 152:268/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
K
 
R
V
 
E
L
 
L
F
 
M
K
 
E
F
 
N
V
 
I
Q
 
H
I
 
S
I
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
G
V
 
T
V
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
N
N
 
H
F
 
F
V
 
F
I
 
I
D
|
D
H
|
H
F
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
I
G
 
G
D
 
N
D
 
W
C
 
C
R
 
R
I
 
V
R
 
Y
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
x
A
K
 
M
N
 
S
V
 
F
D
 
K
-
 
G
E
 
N
P
 
K
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
T
F
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
F
V
 
V
D
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
T
V
 
Q
D
 
N
V
 
I
P
 
D
D
 
Q
N
 
D
S
 
Q
L
 
I
A
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
V
I
 
F
K
 
I
A
 
S
R
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
S
A
 
Q
V
 
I
A
 
T

Sites not aligning to the query:

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
34% identity, 77% coverage: 20:153/174 of query aligns to 131:266/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
G
 
G
F
 
F
W
 
Q
V
 
A
L
 
V
L
 
I
V
 
V
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
A
R
 
-
W
 
-
R
 
-
Y
 
H
T
 
V
L
 
L
R
 
Y
P
 
E
A
 
C
L
 
G
L
 
E
R
 
R
K
 
Y
L
 
Y
C
 
C
S
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
K
 
R
V
 
E
L
 
M
F
 
M
K
 
E
F
 
S
V
 
V
Q
 
H
I
 
S
I
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
G
V
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
K
R
 
G
N
 
H
F
 
F
V
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
F
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
I
F
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
W
C
 
C
R
 
R
I
 
I
R
 
Y
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
x
A
K
 
M
N
x
H
V
 
F
D
 
Q
E
 
E
P
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
K
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
T
F
 
V
G
 
G
N
 
D
N
 
Y
V
 
V
D
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
S
N
 
H
V
 
V
I
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
D
V
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
D
 
S
N
 
N
S
 
Q

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
34% identity, 77% coverage: 20:153/174 of query aligns to 129:264/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
G
 
G
F
 
F
W
 
Q
V
 
A
L
 
V
L
 
I
V
 
V
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
A
R
 
-
W
 
-
R
 
-
Y
 
H
T
 
V
L
 
L
R
 
Y
P
 
E
A
 
C
L
 
G
L
 
E
R
 
R
K
 
Y
L
 
Y
C
 
C
S
 
-
L
 
-
I
 
-
Y
 
-
K
 
R
V
 
E
L
 
M
F
 
M
K
 
E
F
 
S
V
 
V
Q
 
H
I
 
S
I
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
G
V
 
A
V
 
S
I
 
I
G
 
K
R
 
G
N
 
H
F
 
F
V
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
F
 
G
G
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
I
F
 
I
G
 
G
D
 
E
D
 
W
C
 
C
R
 
R
I
 
I
R
 
Y
N
 
Q
G
 
S
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
A
K
 
M
N
x
H
V
 
F
D
 
Q
E
 
E
P
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
K
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
T
F
 
V
G
 
G
N
 
D
N
 
Y
V
 
V
D
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
S
N
 
H
V
 
V
I
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
W
V
 
I
L
 
D
V
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
D
 
S
N
 
N
S
 
Q

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
32% identity, 87% coverage: 19:169/174 of query aligns to 102:246/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
V
 
S
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
T
R
 
H
W
 
Y
R
 
L
Y
 
W
T
 
N
L
 
Q
R
 
N
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
K
 
K
L
 
S
C
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
 
Y
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
I
Q
 
S
I
 
V
I
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
H
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
F
D
|
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
S
R
 
V
F
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
T
N
 
G
V
 
K
D
 
E
E
 
S
-
 
G
P
 
D
I
 
R
A
 
H
P
 
P
V
 
K
F
 
V
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
K
N
 
Y
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
S
 
A
L
 
T
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I
K
 
V
A
 
S
R
 
Q
H
 
D
P
 
K
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
32% identity, 84% coverage: 19:165/174 of query aligns to 107:247/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
V
 
A
Y
 
H
R
 
R
F
 
I
G
 
N
R
 
H
W
 
R
R
 
L
Y
 
Y
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
D
K
 
G
L
 
R
C
 
K
S
 
T
L
 
L
I
 
A
Y
 
Y
K
 
F
V
 
L
L
 
Q
F
 
N
K
 
R
F
 
M
V
 
S
Q
 
E
I
 
V
I
 
F
T
 
-
G
 
G
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
Y
N
 
G
F
 
L
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
F
V
 
V
V
 
A
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
I
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
x
G
K
 
S
N
 
G
V
 
K
D
 
E
E
 
G
-
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
S
S
 
I
L
 
T
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
K
I
 
P
K
 
V
A
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
33% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 102:232/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
V
 
S
Y
 
Y
R
 
R
F
 
I
G
 
T
R
 
H
W
 
Y
R
 
L
Y
 
W
T
 
N
L
 
Q
R
 
N
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
R
K
 
K
L
 
S
C
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
V
 
Y
L
 
L
F
 
Q
K
 
N
F
 
Q
V
 
I
Q
 
S
I
 
V
I
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
H
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
F
D
 
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
S
R
 
V
F
 
I
G
 
E
D
 
N
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
x
L
N
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
x
G
K
x
T
N
 
H
V
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
K
F
 
V
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
x
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
|
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
K
N
 
Y
V
 
A
I
x
K
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
|
V
V
 
V
L
|
L
V
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
D
 
E
N
 
Y
S
 
A
L
x
T
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
|
V
P
|
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
31% identity, 82% coverage: 19:160/174 of query aligns to 105:240/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
V
 
A
Y
 
H
R
 
R
F
 
I
G
 
N
R
 
H
W
 
R
R
 
L
Y
 
Y
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
L
R
 
D
K
 
G
L
 
R
C
 
K
S
 
T
L
 
L
I
 
A
Y
 
Y
K
 
F
V
 
L
L
 
Q
F
 
N
K
 
R
F
 
M
V
 
S
Q
 
E
I
 
V
I
 
F
T
 
-
G
 
G
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
Y
N
 
G
F
 
L
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
F
V
 
V
V
 
A
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
L
G
 
G
D
 
N
D
 
N
C
 
I
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
G
K
 
S
N
 
G
V
 
K
D
 
E
E
 
G
-
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
S
S
 
I
L
 
T
A
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
30% identity, 84% coverage: 19:165/174 of query aligns to 102:242/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
Q
 
K
G
 
G
F
 
Y
W
 
H
V
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
G
Y
 
Y
R
 
R
F
 
V
G
 
A
R
 
N
W
 
W
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
W
R
 
R
K
 
Q
L
 
G
C
 
R
S
 
K
L
 
A
I
 
L
Y
 
A
K
 
T
V
x
Y
L
 
F
F
 
Q
K
 
N
F
x
Q
V
 
I
Q
 
S
I
 
V
I
 
A
T
 
C
G
 
Q
I
 
V
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
R
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
G
F
 
I
V
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
I
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
E
D
 
D
D
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
Q
G
 
D
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
L
x
G
K
 
T
N
 
G
V
 
K
D
 
E
-
 
C
E
 
G
P
 
D
I
x
R
A
x
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
E
N
 
G
V
 
V
D
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
E
N
 
G
V
 
A
I
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
S
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
P
N
 
H
S
 
T
L
 
T
A
 
V
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I
K
 
V
A
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
30% identity, 83% coverage: 19:162/174 of query aligns to 106:243/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
W
 
H
V
 
A
L
 
I
L
 
Q
V
 
T
Y
 
H
R
 
R
F
 
L
G
 
A
R
 
H
W
 
W
R
 
L
Y
 
Y
T
 
K
L
 
-
R
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
Q
K
 
G
L
 
R
C
 
K
S
 
D
L
 
F
I
 
A
Y
 
Y
K
 
Y
V
 
L
L
 
Q
F
 
S
K
 
R
F
 
S
V
 
S
Q
 
S
I
 
I
I
 
F
T
 
Q
G
 
-
I
 
T
E
 
D
L
 
I
P
 
H
C
 
P
E
 
A
V
 
A
V
 
R
I
 
L
G
 
G
R
 
S
N
 
G
F
 
L
V
 
F
I
 
L
D
 
D
H
|
H
F
 
A
G
 
T
G
 
G
I
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
G
G
 
E
Y
 
T
A
 
A
R
 
V
F
 
V
G
 
E
D
 
D
D
 
N
C
 
V
R
 
S
I
 
I
R
 
L
N
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
-
 
G
L
 
T
K
 
G
N
 
K
V
 
S
D
 
S
E
 
G
P
 
D
I
 
R
A
 
H
P
 
P
V
 
K
F
 
I
G
 
R
N
 
Q
N
 
G
V
 
V
D
 
L
I
 
I
G
|
G
T
x
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
N
I
 
I
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
N
 
Q
N
 
C
V
 
S
I
 
K
I
 
I
G
x
A
A
|
A
N
 
G
A
x
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
K
D
 
S
V
 
V
P
 
P
D
 
H
N
 
N
S
 
V
L
x
T
A
 
V
V
x
A
G
|
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
I
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 78% coverage: 25:159/174 of query aligns to 32:178/203 of P07464

query
sites
P07464
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
G
 
N
R
 
H
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
S
R
 
H
P
 
P
A
 
S
L
 
E
L
 
V
R
 
E
K
 
K
L
 
R
C
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
-
K
 
K
V
 
E
L
 
M
F
 
F
K
 
A
F
 
T
V
 
V
Q
 
G
I
 
E
I
 
N
T
 
A
G
 
W
I
 
V
E
 
E
L
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
x
S
-
 
Y
-
 
G
C
 
S
E
 
N
V
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
Y
I
 
A
D
x
N
H
 
-
F
 
F
G
 
N
G
 
L
I
 
T
V
 
I
V
 
V
S
 
D
G
x
D
Y
 
Y
A
 
T
-
 
V
R
 
T
F
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
R
 
L
I
 
I
R
 
A
N
 
P
G
 
N
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
S
L
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
N
V
 
G
D
 
E
E
 
M
P
 
Y
I
 
S
A
 
F
P
 
P
V
 
I
-
 
T
F
 
I
G
 
G
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
 
W
I
 
I
G
 
G
T
x
S
G
 
H
A
 
V
K
 
V
V
 
I
L
 
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
L
x
T
V
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
31% identity, 78% coverage: 25:159/174 of query aligns to 31:177/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
G
 
N
R
 
H
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
S
R
 
H
P
 
P
A
 
S
L
 
E
L
 
V
R
 
E
K
 
K
L
 
R
C
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
-
K
 
K
V
 
E
L
 
M
F
 
F
K
 
A
F
 
T
V
 
V
Q
 
G
I
 
E
I
 
N
T
 
A
G
 
W
I
 
V
E
 
E
L
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
x
S
-
 
Y
-
 
G
C
 
S
E
 
N
V
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
x
Y
I
 
A
D
x
N
H
 
-
F
 
F
G
 
N
G
 
L
I
 
T
V
 
I
V
|
V
S
 
D
G
x
D
Y
 
Y
A
 
T
-
 
V
R
 
T
F
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
R
 
L
I
 
I
R
x
A
N
 
P
G
 
N
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
x
S
L
 
V
-
x
T
-
 
G
-
 
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
N
V
 
G
D
 
E
E
x
M
P
 
Y
I
 
S
A
 
F
P
 
P
V
 
I
-
 
T
F
 
I
G
 
G
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
x
W
I
 
I
G
|
G
T
x
S
G
 
H
A
 
V
K
 
V
V
 
I
L
x
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
T
V
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
|
P

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
31% identity, 78% coverage: 25:159/174 of query aligns to 31:177/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
G
 
N
R
 
H
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
S
R
 
H
P
 
P
A
 
S
L
 
E
L
 
V
R
 
E
K
 
K
L
 
R
C
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
-
K
 
K
V
 
E
L
 
M
F
 
F
K
 
A
F
 
T
V
 
V
Q
 
G
I
 
E
I
 
N
T
 
A
G
x
W
I
 
V
E
 
E
L
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
x
S
-
 
Y
-
 
G
C
 
S
E
 
N
V
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
x
Y
I
 
A
D
x
N
H
 
-
F
 
F
G
 
N
G
 
L
I
 
T
V
 
I
V
|
V
S
 
D
G
x
D
Y
 
Y
A
 
T
-
 
V
R
 
T
F
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
R
x
L
I
 
I
R
 
A
N
 
P
G
 
N
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
S
L
 
V
-
 
T
-
 
G
-
x
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
N
V
 
G
D
 
E
E
x
M
P
 
Y
I
 
S
A
 
F
P
 
P
V
 
I
-
 
T
F
 
I
G
 
G
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
x
W
I
 
I
G
|
G
T
x
S
G
 
H
A
 
V
K
 
V
V
 
I
L
 
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
T
V
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
A
G
 
G
V
 
V
P
|
P

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
31% identity, 78% coverage: 25:159/174 of query aligns to 31:177/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
L
 
L
V
 
M
Y
 
Y
R
 
E
F
 
F
G
 
N
R
 
H
W
 
-
R
 
-
Y
 
-
T
 
-
L
 
S
R
 
H
P
 
P
A
 
S
L
 
E
L
 
V
R
 
E
K
 
K
L
 
R
C
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
Y
 
-
K
 
K
V
 
E
L
 
M
F
 
F
K
 
A
F
 
T
V
 
V
Q
 
G
I
 
E
I
 
N
T
 
A
G
 
W
I
 
V
E
 
E
L
 
P
P
 
P
-
 
V
-
 
Y
-
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
G
C
 
S
E
 
N
V
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
F
 
F
V
 
Y
I
 
A
D
x
N
H
 
-
F
 
F
G
 
N
G
 
L
I
 
T
V
 
I
V
 
V
S
 
D
G
 
D
Y
 
Y
A
 
T
-
 
V
R
 
T
F
 
I
G
 
G
D
 
D
D
 
N
C
 
V
R
 
L
I
|
I
R
x
A
N
x
P
G
 
N
V
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
S
L
 
V
-
x
T
-
 
G
-
x
H
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
H
-
 
E
-
 
L
-
 
R
K
 
K
N
 
N
V
 
G
D
 
E
E
 
M
P
 
Y
I
 
S
A
 
F
P
 
P
V
 
I
-
 
T
F
 
I
G
 
G
N
 
N
N
 
N
V
 
V
D
 
W
I
 
I
G
|
G
T
x
S
G
 
H
A
 
V
K
 
V
V
 
I
L
x
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
N
 
D
N
 
N
V
 
S
I
 
V
I
 
I
G
|
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
L
 
T
V
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
N
 
N
S
 
V
L
 
V
A
 
A
V
x
A
G
 
G
V
 
V
P
|
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_3136 FitnessBrowser__Putida:PP_3136
MFDNIRADLRAHGGDWGAQGFWVLLVYRFGRWRYTLRPALLRKLCSLIYKVLFKFVQIIT
GIELPCEVVIGRNFVIDHFGGIVVSGYARFGDDCRIRNGVVVGLKNVDEPIAPVFGNNVD
IGTGAKVLGSIRIGNNVIIGANAVVLVDVPDNSLAVGVPAIIKARHPAAVASVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory