SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_3180 FitnessBrowser__Putida:PP_3180 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

4gncA Human smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 16:296/298 of 4gncA

query
sites
4gncA
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
V
S
 
S
G
 
N
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
|
I
S
 
P
G
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
V
N
 
C
G
 
R
L
 
W
T
 
D
P
 
S
D
 
F
G
 
T
E
 
K
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
T
S
 
M
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
G
L
 
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
W
P
 
K
T
 
E
R
 
Q
K
 
S
V
 
A
S
 
V
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
T
S
 
V
V
 
D
H
 
N
P
 
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
|
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
|
M
D
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
H
D
 
V
Q
 
K
V
 
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
 
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
 
I
V
 
F
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
S
I
 
V
Y
 
D
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
 
R
L
 
S
F
 
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
L
P
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
|
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
 
P
R
 
V
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
|
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
x
N
M
x
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
M
T
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
G
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
G
|
G
V
x
I
A
|
A
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q15493 Regucalcin; RC; Gluconolactonase; GNL; Senescence marker protein 30; SMP-30; EC 3.1.1.17 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 17:297/299 of Q15493

query
sites
Q15493
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
V
S
 
S
G
 
N
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
P
G
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
V
N
 
C
G
 
R
L
 
W
T
 
D
P
 
S
D
 
F
G
 
T
E
 
K
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
T
S
 
M
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
G
L
 
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
W
P
 
K
T
 
E
R
 
Q
K
 
S
V
 
A
S
 
V
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
T
S
 
V
V
 
D
H
 
N
P
 
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
 
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
H
D
 
V
Q
 
K
V
 
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
 
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
 
I
V
 
F
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
S
I
 
V
Y
 
D
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
 
R
L
 
S
F
 
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
L
P
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
 
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
 
P
R
 
V
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
 
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
 
N
M
 
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
M
T
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
G
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
F
 
Y

3g4hA Crystal structure of human senescence marker protein-30 (zinc bound) (see paper)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 15:295/297 of 3g4hA

query
sites
3g4hA
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
V
S
 
S
G
 
N
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
P
G
 
A
G
 
K
R
 
K
I
 
V
N
 
C
G
 
R
L
 
W
T
 
D
P
 
S
D
 
F
G
 
T
E
 
K
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
T
S
 
M
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
Q
R
 
S
G
 
G
N
 
G
L
 
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
W
P
 
K
T
 
E
R
 
Q
K
 
S
V
 
A
S
 
V
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
T
S
 
V
V
 
D
H
 
N
P
 
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
H
D
 
V
Q
 
K
V
 
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
 
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
 
I
V
 
F
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
S
I
 
V
Y
 
D
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
 
R
L
 
S
F
 
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
L
P
 
E
A
 
K
E
 
E
L
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
 
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
 
P
R
 
V
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
 
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
 
N
M
 
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
M
T
 
D
P
 
P
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
G
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
F
 
Y

4gnaA Mouse smp30/gnl-xylitol complex (see paper)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 15:295/297 of 4gnaA

query
sites
4gnaA
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
A
S
 
S
G
 
Q
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
P
G
 
S
G
 
K
R
 
I
I
 
I
N
 
C
G
 
R
L
 
W
T
 
D
P
 
T
D
 
V
G
 
S
E
 
N
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
A
S
 
V
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
Q
R
 
L
G
 
G
N
 
G
L
 
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
W
P
 
E
T
 
N
R
 
Q
K
 
S
V
 
V
S
 
F
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
M
S
 
V
V
 
D
H
 
E
P
 
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
A
E
 
E
-
x
E
-
 
T
-
 
A
-
x
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
S
D
 
V
Q
 
K
V
 
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
 
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
 
I
V
 
F
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
T
I
 
V
Y
 
D
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
 
R
L
 
I
F
 
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
M
P
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
|
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
 
P
R
 
E
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
 
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
 
D
M
 
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
N
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
T
P
 
G
-
 
L
E
 
G
T
 
V
G
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
F
 
Y

4gn9A Mouse smp30/gnl-glucose complex (see paper)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 15:295/297 of 4gn9A

query
sites
4gn9A
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
x
E
E
 
E
R
 
A
S
 
S
G
 
Q
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
P
G
 
S
G
 
K
R
 
I
I
 
I
N
 
C
G
x
R
L
 
W
T
 
D
P
 
T
D
 
V
G
 
S
E
 
N
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
A
S
 
V
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
Q
R
 
L
G
|
G
N
x
G
L
x
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
x
N
V
x
W
P
x
E
T
 
N
R
 
Q
K
 
S
V
 
V
S
 
F
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
M
S
x
V
V
x
D
H
x
E
P
x
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
A
E
 
E
-
x
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
x
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
S
D
 
V
Q
 
K
V
x
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
x
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
 
I
V
 
F
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
|
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
T
I
 
V
Y
 
D
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
 
R
L
 
I
F
 
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
M
P
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
E
G
 
Q
R
x
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
|
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
 
P
R
 
E
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
 
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
 
D
M
 
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
N
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
T
P
 
G
-
 
L
E
 
G
T
 
V
G
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
F
 
Y

4gn8A Mouse smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 15:295/297 of 4gn8A

query
sites
4gn8A
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
A
S
 
S
G
 
Q
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
P
G
 
S
G
 
K
R
 
I
I
 
I
N
 
C
G
 
R
L
 
W
T
 
D
P
 
T
D
 
V
G
 
S
E
 
N
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
A
S
 
V
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
x
Q
R
 
L
G
 
G
N
 
G
L
 
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
W
P
 
E
T
 
N
R
 
Q
K
 
S
V
 
V
S
 
F
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
M
S
 
V
V
 
D
H
 
E
P
 
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
|
P
Q
x
A
G
|
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
A
E
 
E
-
x
E
-
 
T
-
 
A
-
x
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
S
D
 
V
Q
 
K
V
 
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
 
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
x
I
V
 
F
Y
|
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
T
I
 
V
Y
 
D
R
x
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
x
D
L
 
L
I
x
Q
E
x
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
x
R
L
 
I
F
x
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
M
P
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
|
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
x
P
R
 
E
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
 
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
 
D
M
 
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
N
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
T
P
 
G
-
 
L
E
 
G
T
 
V
G
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
H
x
Y
S
|
S
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

4gn7A Mouse smp30/gnl (see paper)
30% identity, 79% coverage: 72:344/346 of query aligns to 15:295/297 of 4gn7A

query
sites
4gn7A
G
 
G
E
|
E
S
 
S
L
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
A
S
 
S
G
 
Q
V
 
S
L
 
L
Y
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
P
G
 
S
G
 
K
R
 
I
I
 
I
N
 
C
G
 
R
L
 
W
T
 
D
P
 
T
D
 
V
G
 
S
E
 
N
V
 
Q
D
 
V
C
 
Q
L
 
R
Y
 
V
E
 
A
S
 
V
A
 
D
A
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
A
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
R
D
 
Q
R
 
L
G
 
G
N
 
G
L
 
Y
I
 
V
F
 
A
T
 
T
E
 
I
D
 
G
A
 
T
S
 
K
V
 
F
A
 
C
I
 
A
F
 
L
D
 
N
V
 
W
P
 
E
T
 
N
R
 
Q
K
 
S
V
 
V
S
 
F
Q
 
V
H
 
L
S
 
A
A
 
M
S
 
V
V
 
D
H
 
E
P
 
D
R
 
K
S
 
K
T
 
N
Y
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
V
 
F
T
 
A
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
A
E
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
A
 
V
L
 
L
S
 
E
D
 
R
N
 
H
T
 
Q
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
S
F
 
L
D
 
F
W
 
P
Q
 
D
L
 
H
S
 
S
D
 
V
Q
 
K
V
 
K
I
 
Y
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
M
 
V
G
 
D
L
 
I
P
 
S
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
H
 
L
D
 
D
G
 
H
H
 
K
T
 
I
V
 
F
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
L
A
 
S
R
 
Y
A
 
T
I
 
V
Y
 
D
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
Y
-
 
D
L
 
L
I
 
Q
E
 
T
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
G
 
S
A
 
N
V
 
R
T
 
R
L
 
I
F
 
V
A
 
Y
E
 
K
T
 
M
P
 
E
A
 
K
E
 
D
L
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
 
C
L
 
I
D
 
D
R
 
A
E
 
E
G
 
G
G
 
K
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
C
Y
 
Y
H
 
N
G
 
G
S
 
G
C
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
R
Y
 
L
D
 
D
-
 
P
R
 
E
H
 
T
G
 
G
Y
 
K
L
 
R
T
 
L
D
 
Q
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
C
 
K
P
 
T
T
 
T
S
 
S
C
 
C
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
G
 
D
M
 
Y
N
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
Y
 
D
D
 
G
M
 
L
T
 
N
P
 
A
E
 
E
D
 
G
L
 
L
H
 
L
H
 
R
Y
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
A
G
 
G
D
 
N
L
 
I
Y
 
F
A
 
K
I
 
I
R
 
T
P
 
G
-
 
L
E
 
G
T
 
V
G
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
H
 
Y
S
 
S
F
 
Y

7pldA Caulobacter crescentus xylonolactonase with (r)-4-hydroxy-2- pyrrolidone (see paper)
29% identity, 82% coverage: 64:345/346 of query aligns to 6:285/287 of 7pldA

query
sites
7pldA
V
 
V
A
 
W
N
 
D
T
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
T
L
 
L
G
 
G
E
|
E
S
 
G
L
 
P
V
 
I
W
 
W
D
 
-
E
 
-
R
 
H
S
 
G
G
 
D
V
 
T
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
K
G
 
Q
G
 
R
R
 
K
I
 
I
N
 
H
G
 
N
L
 
Y
T
 
H
P
 
P
D
 
A
G
 
T
E
 
G
V
 
E
D
 
R
C
 
F
L
 
S
Y
 
F
E
 
D
S
 
A
A
 
P
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
G
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
P
L
 
I
T
 
V
D
 
G
R
 
A
G
 
T
N
 
G
L
 
F
I
 
V
F
 
V
T
 
G
E
 
L
D
 
K
A
 
T
S
 
G
V
 
I
A
 
H
I
 
R
F
 
F
D
 
H
V
 
-
P
 
P
T
 
A
R
 
T
K
 
G
V
 
F
S
 
S
Q
 
L
H
 
L
S
 
L
A
 
E
S
 
V
V
 
E
H
 
D
P
 
A
R
 
A
S
 
L
T
 
N
Y
 
N
R
 
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
A
 
T
C
 
V
D
 
D
P
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
V
 
W
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
H
E
 
D
A
 
G
L
x
E
S
 
E
D
 
N
N
 
N
T
 
S
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
F
 
M
D
 
D
W
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
T
D
 
G
Q
 
V
V
 
A
I
 
R
H
 
M
D
 
D
-
 
R
D
 
D
M
 
I
G
 
C
L
 
I
P
 
T
T
x
N
G
 
G
L
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
H
 
P
D
 
D
G
 
G
H
 
K
T
 
T
V
 
F
Y
 
Y
F
 
H
V
 
T
D
 
D
S
x
T
A
x
L
A
 
E
R
 
K
A
 
T
I
 
I
Y
 
Y
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
L
L
 
A
I
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
N
V
 
K
T
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
V
E
 
Q
T
 
-
P
 
-
A
 
F
E
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
S
A
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
S
E
 
E
G
 
G
G
 
Y
L
 
L
W
 
W
V
 
T
C
 
A
Q
 
L
Y
x
W
H
 
G
G
 
G
S
 
F
C
 
G
L
 
A
L
 
V
R
 
R
Y
 
F
D
 
S
R
 
P
H
 
Q
G
 
G
Y
 
D
L
 
A
T
 
V
D
 
T
Q
 
R
V
 
I
L
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
A
P
 
P
C
 
N
P
 
V
T
 
T
S
 
K
C
 
P
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
D
M
 
L
N
 
K
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
S
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
Y
x
K
D
 
G
M
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
D
 
T
L
 
L
H
 
A
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
G
L
 
V
Y
 
F
A
 
A
I
 
V
R
 
P
P
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
R
 
Q
H
 
H
S
 
E
F
 
V
K
 
R

Q9A9Z1 D-xylonolactone lactonase; Xylono-1,5-lactonase; EC 3.1.1.110 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
29% identity, 82% coverage: 64:345/346 of query aligns to 8:287/289 of Q9A9Z1

query
sites
Q9A9Z1
V
 
V
A
 
W
N
 
D
T
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
T
L
 
L
G
 
G
E
|
E
S
 
G
L
 
P
V
 
I
W
 
W
D
 
-
E
 
-
R
 
H
S
 
G
G
 
D
V
 
T
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
K
G
 
Q
G
 
R
R
 
K
I
 
I
N
 
H
G
 
N
L
 
Y
T
 
H
P
 
P
D
 
A
G
 
T
E
 
G
V
 
E
D
 
R
C
 
F
L
 
S
Y
 
F
E
 
D
S
 
A
A
 
P
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
G
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
P
L
 
I
T
 
V
D
 
G
R
 
A
G
 
T
N
 
G
L
 
F
I
 
V
F
 
V
T
 
G
E
 
L
D
 
K
A
 
T
S
 
G
V
 
I
A
 
H
I
 
R
F
 
F
D
 
H
V
 
-
P
 
P
T
 
A
R
 
T
K
 
G
V
 
F
S
 
S
Q
 
L
H
 
L
S
 
L
A
 
E
S
 
V
V
 
E
H
 
D
P
 
A
R
 
A
S
 
L
T
 
N
Y
 
N
R
 
R
F
 
P
N
 
N
D
 
D
G
 
A
A
 
T
C
 
V
D
 
D
P
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
V
 
W
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
 
M
D
 
H
E
 
D
A
 
G
L
 
E
S
 
E
D
 
N
N
 
N
T
 
S
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
F
 
M
D
 
D
W
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
T
D
 
G
Q
 
V
V
 
A
I
 
R
H
 
M
D
 
D
-
 
R
D
 
D
M
 
I
G
 
C
L
 
I
P
 
T
T
x
N
G
 
G
L
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
H
 
P
D
 
D
G
 
G
H
 
K
T
 
T
V
 
F
Y
 
Y
F
 
H
V
 
T
D
 
D
S
 
T
A
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
T
I
 
I
Y
 
Y
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
L
L
 
A
I
 
E
E
 
D
G
 
G
R
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
N
V
 
K
T
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
V
E
 
Q
T
 
-
P
 
-
A
 
F
E
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
S
A
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
S
E
 
E
G
 
G
G
 
Y
L
 
L
W
 
W
V
 
T
C
 
A
Q
 
L
Y
 
W
H
 
G
G
 
G
S
 
F
C
 
G
L
 
A
L
 
V
R
 
R
Y
 
F
D
 
S
R
 
P
H
 
Q
G
 
G
Y
 
D
L
 
A
T
 
V
D
 
T
Q
 
R
V
 
I
L
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
A
P
 
P
C
 
N
P
 
V
T
 
T
S
 
K
C
 
P
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
D
M
 
L
N
 
K
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
S
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
D
 
G
M
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
D
 
T
L
 
L
H
 
A
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
G
L
 
V
Y
 
F
A
 
A
I
 
V
R
 
P
P
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
R
 
Q
H
 
H
S
 
E
F
 
V
K
 
R

7plbB Caulobacter crescentus xylonolactonase with d-xylose (see paper)
29% identity, 82% coverage: 64:345/346 of query aligns to 8:287/289 of 7plbB

query
sites
7plbB
V
 
V
A
 
W
N
 
D
T
 
L
R
 
K
A
 
A
D
 
T
L
|
L
G
 
G
E
|
E
S
 
G
L
 
P
V
 
I
W
 
W
D
 
-
E
 
-
R
x
H
S
 
G
G
 
D
V
 
T
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
K
G
 
Q
G
 
R
R
 
K
I
 
I
N
 
H
G
 
N
L
 
Y
T
 
H
P
 
P
D
 
A
G
 
T
E
 
G
V
 
E
D
 
R
C
 
F
L
 
S
Y
 
F
E
 
D
S
 
A
A
 
P
A
 
D
R
 
Q
I
 
V
G
 
T
A
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
P
L
 
I
T
 
V
D
 
G
R
x
A
G
x
T
N
x
G
L
x
F
I
 
V
F
 
V
T
 
G
E
 
L
D
 
K
A
 
T
S
 
G
V
 
I
A
 
H
I
 
R
F
 
F
D
x
H
V
 
-
P
|
P
T
 
A
R
 
T
K
 
G
V
 
F
S
 
S
Q
 
L
H
 
L
S
 
L
A
x
E
S
x
V
V
x
E
H
x
D
P
 
A
R
 
A
S
 
L
T
 
N
Y
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
A
 
T
C
 
V
D
 
D
P
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
L
V
 
W
T
 
F
G
 
G
L
 
T
M
|
M
D
 
H
E
 
D
A
 
G
L
x
E
S
 
E
D
 
N
N
 
N
T
 
S
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
|
R
F
 
M
D
|
D
W
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
x
T
D
 
G
Q
 
V
V
 
A
I
 
R
H
 
M
D
 
D
-
 
R
D
 
D
M
 
I
G
 
C
L
 
I
P
 
T
T
x
N
G
 
G
L
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
H
 
P
D
 
D
G
 
G
H
 
K
T
 
T
V
 
F
Y
 
Y
F
 
H
V
 
T
D
 
D
S
 
T
A
 
L
A
 
E
R
 
K
A
 
T
I
 
I
Y
 
Y
R
 
A
A
 
F
E
 
D
Y
 
L
L
 
A
I
 
E
E
x
D
G
 
G
R
 
L
L
 
L
G
 
S
A
 
N
V
 
K
T
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
V
E
 
Q
T
 
-
P
 
-
A
 
F
E
 
A
L
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
S
A
 
V
L
 
V
D
 
D
R
 
S
E
 
E
G
 
G
G
 
Y
L
 
L
W
 
W
V
 
T
C
 
A
Q
 
L
Y
x
W
H
 
G
G
 
G
S
 
F
C
 
G
L
 
A
L
 
V
R
 
R
Y
 
F
D
 
S
R
 
P
H
 
Q
G
 
G
Y
 
D
L
 
A
T
 
V
D
 
T
Q
 
R
V
 
I
L
 
E
M
 
L
P
 
P
V
 
A
P
 
P
C
 
N
P
 
V
T
 
T
S
 
K
C
 
P
C
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
D
M
 
L
N
 
K
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
S
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
D
 
G
M
 
L
T
 
S
P
 
D
E
 
E
D
 
T
L
 
L
H
 
A
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
G
L
 
V
Y
 
F
A
 
A
I
 
V
R
 
P
P
 
V
E
 
D
T
 
V
G
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
R
 
Q
H
 
H
S
 
E
F
 
V
K
 
R

5gx1A Luciferin-regenerating enzyme collected with serial synchrotron rotational crystallography with accumulated dose of 1.1 mgy (1st measurement) (see paper)
29% identity, 70% coverage: 71:311/346 of query aligns to 15:271/307 of 5gx1A

query
sites
5gx1A
L
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
G
L
 
P
V
 
H
W
 
W
D
 
D
E
 
H
R
 
E
S
 
T
G
 
Q
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
V
G
 
E
G
 
K
R
 
T
I
 
F
N
 
H
G
 
K
L
 
Y
T
 
V
P
 
P
-
 
S
-
 
Q
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
F
-
x
C
-
 
K
-
 
V
D
 
D
G
 
K
E
 
L
V
 
V
D
 
S
C
 
F
L
 
I
Y
 
I
E
 
P
S
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
S
I
 
P
G
 
G
A
 
R
L
 
F
A
 
V
L
 
V
T
 
S
-
 
L
D
 
E
R
 
R
G
 
E
N
 
I
L
 
A
I
 
I
F
x
L
T
 
T
E
x
W
D
 
D
A
 
G
S
 
V
V
 
S
A
 
A
I
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
A
P
 
P
T
 
T
R
 
S
K
 
I
V
 
E
S
 
A
Q
 
I
H
 
V
S
 
N
A
 
V
S
 
E
V
 
P
H
 
H
P
 
I
R
 
K
S
 
N
T
 
N
Y
 
-
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
A
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
V
 
W
T
 
T
G
 
G
L
 
T
M
 
M
-
 
A
-
 
I
D
 
D
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
P
D
 
I
N
 
G
-
 
P
-
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
H
F
 
L
D
 
G
W
 
A
Q
 
D
L
 
K
S
 
K
D
 
V
Q
 
K
V
 
M
I
 
H
H
 
E
D
 
S
D
 
N
M
 
I
G
 
A
L
 
I
P
 
A
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
H
 
N
D
 
D
G
 
L
H
 
K
T
 
K
V
 
M
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
R
I
 
V
Y
 
-
R
 
-
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
D
I
 
Y
E
 
D
G
 
A
R
 
S
L
 
T
G
 
L
A
 
S
V
 
I
T
 
S
-
 
N
-
 
Q
-
 
R
-
 
P
L
 
L
F
 
F
A
 
T
E
 
F
T
 
E
P
 
K
A
 
H
E
 
E
L
 
V
-
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
D
R
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
N
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
V
Y
 
F
H
 
Q
G
 
G
S
 
Q
C
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
K
Y
 
I
D
 
S
R
 
T
H
 
Q
G
 
Q
-
 
P
-
 
E
Y
 
V
L
 
L
T
 
L
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
I
P
 
P
V
 
D
P
 
P
C
 
Q
P
 
V
T
 
T
S
 
S
C
 
V
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
N
M
 
L
N
 
D
T
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
S
A
 
A

5d9bA Luciferin-regenerating enzyme solved by siras using xfel (refined against native data) (see paper)
29% identity, 70% coverage: 71:311/346 of query aligns to 15:271/307 of 5d9bA

query
sites
5d9bA
L
 
V
G
 
G
E
|
E
S
 
G
L
 
P
V
 
H
W
 
W
D
 
D
E
 
H
R
 
E
S
 
T
G
 
Q
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
V
G
 
E
G
 
K
R
 
T
I
 
F
N
 
H
G
 
K
L
 
Y
T
 
V
P
 
P
-
 
S
-
 
Q
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
F
-
 
C
-
 
K
-
 
V
D
 
D
G
 
K
E
 
L
V
 
V
D
 
S
C
 
F
L
 
I
Y
 
I
E
 
P
S
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
S
I
 
P
G
 
G
A
 
R
L
 
F
A
 
V
L
 
V
T
 
S
-
 
L
D
 
E
R
 
R
G
 
E
N
 
I
L
 
A
I
 
I
F
 
L
T
 
T
E
 
W
D
 
D
A
 
G
S
 
V
V
 
S
A
 
A
I
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
A
P
 
P
T
 
T
R
 
S
K
 
I
V
 
E
S
 
A
Q
 
I
H
 
V
S
 
N
A
 
V
S
 
E
V
 
P
H
 
H
P
 
I
R
 
K
S
 
N
T
 
N
Y
 
-
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
C
 
A
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
V
 
W
T
 
T
G
 
G
L
 
T
M
 
M
-
 
A
-
 
I
D
 
D
E
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
P
D
 
I
N
 
G
-
 
P
-
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
L
 
L
F
 
Y
R
 
H
F
 
L
D
 
G
W
 
A
Q
 
D
L
 
K
S
 
K
D
 
V
Q
 
K
V
 
M
I
 
H
H
 
E
D
 
S
D
 
N
M
 
I
G
 
A
L
 
I
P
 
A
T
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
H
 
N
D
 
D
G
 
L
H
 
K
T
 
K
V
 
M
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
I
D
 
D
S
 
S
A
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
R
I
 
V
Y
 
-
R
 
-
A
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
D
I
 
Y
E
 
D
G
 
A
R
 
S
L
 
T
G
 
L
A
 
S
V
 
I
T
 
S
-
 
N
-
 
Q
-
 
R
-
 
P
L
 
L
F
 
F
A
 
T
E
 
F
T
 
E
P
 
K
A
 
H
E
 
E
L
 
V
-
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
D
R
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
N
L
 
L
W
 
W
V
 
V
C
 
A
Q
 
V
Y
 
F
H
 
Q
G
 
G
S
 
Q
C
 
R
L
 
I
L
 
I
R
 
K
Y
 
I
D
 
S
R
 
T
H
 
Q
G
 
Q
-
 
P
-
 
E
Y
 
V
L
 
L
T
 
L
D
 
D
Q
 
T
V
 
V
L
 
K
M
 
I
P
 
P
V
 
D
P
 
P
C
 
Q
P
 
V
T
 
T
S
 
S
C
 
V
C
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
N
M
 
L
N
 
D
T
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
S
 
T
T
 
S
A
 
A

Query Sequence

>PP_3180 FitnessBrowser__Putida:PP_3180
MPVTHLAGALCHPTDCTLRASNSQHIATRFNEHSSVSHTRDLDRVQVAERWSRIKECNYV
PVKVANTRADLGESLVWDERSGVLYFVDISGGRINGLTPDGEVDCLYESAARIGALALTD
RGNLIFTEDASVAIFDVPTRKVSQHSASVHPRSTYRFNDGACDPQGRFVTGLMDEALSDN
TGALFRFDWQLSDQVIHDDMGLPTGLAWSHDGHTVYFVDSAARAIYRAEYLIEGRLGAVT
LFAETPAELGRPDGLALDREGGLWVCQYHGSCLLRYDRHGYLTDQVLMPVPCPTSCCFGG
PGMNTLYISTARYDMTPEDLHHYPDAGDLYAIRPETGGVARHSFKE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory