SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_3284 FitnessBrowser__Putida:PP_3284 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
52% identity, 98% coverage: 3:255/257 of query aligns to 4:258/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
R
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
D
 
E
V
 
K
Q
 
K
A
 
G
P
 
K
E
 
N
H
 
S
G
 
S
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
D
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
F
V
 
Q
G
 
D
I
 
C
L
 
Y
N
x
S
D
 
G
P
 
K
R
 
F
V
x
L
A
 
S
H
 
H
W
 
W
Q
 
D
S
 
H
I
 
I
A
 
T
A
 
R
F
 
I
A
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
K
I
 
I
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
E
 
E
L
 
T
T
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
A
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
R
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
K
A
 
L
F
|
F
T
 
Y
L
 
S
L
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
A
F
|
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
F
 
F
Q
 
K

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
52% identity, 98% coverage: 3:255/257 of query aligns to 2:256/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
R
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
D
 
E
V
 
K
Q
 
K
A
 
G
P
 
K
E
 
N
H
 
S
G
 
S
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
D
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
F
V
 
Q
G
 
D
I
 
C
L
 
Y
N
x
S
D
 
G
P
 
K
R
 
F
V
x
L
A
 
S
H
 
H
W
|
W
Q
 
D
S
 
H
I
 
I
A
 
T
A
 
R
F
 
I
A
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
K
I
 
I
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
E
 
E
L
 
T
T
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
A
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
R
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
F
T
 
Y
L
 
S
L
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
A
F
 
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
F
 
F
Q
 
K

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
52% identity, 98% coverage: 3:255/257 of query aligns to 34:288/290 of P14604

query
sites
P14604
R
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
D
 
E
V
 
K
Q
 
K
A
 
G
P
 
K
E
 
N
H
 
S
G
 
S
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
E
 
E
M
 
M
A
 
Q
D
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
F
V
 
Q
G
 
D
I
 
C
L
 
Y
N
 
S
D
 
G
P
 
K
R
 
F
V
 
L
A
 
S
H
 
H
W
 
W
Q
 
D
S
 
H
I
 
I
A
 
T
A
 
R
F
 
I
A
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
K
I
 
I
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
E
 
E
L
 
T
T
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
A
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
R
 
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
F
T
 
Y
L
 
S
L
 
T
A
 
F
G
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
A
F
 
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
F
 
F
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
52% identity, 98% coverage: 3:255/257 of query aligns to 4:256/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
R
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
D
 
E
V
 
K
Q
 
K
A
 
G
P
 
K
E
 
N
H
 
S
G
 
S
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
D
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
F
V
 
Q
G
 
D
I
 
C
L
 
Y
N
x
S
D
 
G
P
 
-
R
 
-
V
x
L
A
 
S
H
 
H
W
 
W
Q
 
D
S
 
H
I
 
I
A
 
T
A
 
R
F
 
I
A
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
K
I
 
I
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
E
 
E
L
 
T
T
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
A
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
R
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
F
T
 
Y
L
 
S
L
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
A
F
 
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
F
 
F
Q
 
K

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
52% identity, 98% coverage: 3:255/257 of query aligns to 3:252/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
R
 
Q
Y
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
T
D
 
E
V
 
K
Q
 
K
A
 
G
P
 
K
E
 
N
H
 
S
G
 
S
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
x
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
D
 
N
R
 
R
D
 
T
L
 
F
V
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
Q
P
 
D
R
 
C
V
 
Y
A
x
S
H
 
H
W
 
W
Q
 
D
S
 
H
I
 
I
A
 
T
A
 
R
F
 
I
A
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
 
L
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
K
I
 
I
T
 
F
Q
 
P
P
 
V
E
 
E
L
 
T
T
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
N
K
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
A
 
I
V
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
N
R
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
F
T
 
Y
L
 
S
L
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
R
 
R
D
 
R
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
S
A
 
A
F
 
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
F
 
F
Q
 
K

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
52% identity, 95% coverage: 12:255/257 of query aligns to 15:258/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
H
 
N
G
 
T
V
 
V
Q
 
G
L
 
L
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
D
E
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
N
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
I
A
 
F
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
P
H
 
A
V
 
V
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
R
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
S
L
 
F
V
 
Q
G
 
D
I
 
C
L
 
Y
N
x
S
D
 
S
P
 
K
R
 
F
V
x
L
A
 
K
H
 
H
W
 
W
Q
 
D
S
 
H
I
 
L
A
 
T
A
 
Q
F
 
V
A
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
 
I
G
 
G
I
x
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
M
 
M
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
R
I
 
I
T
 
S
A
 
A
L
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
K
I
 
I
T
 
C
Q
 
P
P
 
V
E
 
E
L
 
T
T
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
C
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
S
K
 
N
A
 
S
P
 
K
L
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
N
K
 
A
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
M
D
 
T
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
G
L
 
S
R
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
F
T
 
Y
L
 
S
L
 
T
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
D
R
 
R
D
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
F
 
F
Q
 
K

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
47% identity, 95% coverage: 14:257/257 of query aligns to 13:256/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
V
 
V
Q
 
G
L
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
A
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
A
Q
 
T
A
 
E
A
 
L
G
 
D
N
 
D
D
 
D
E
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
D
 
D
R
 
L
D
 
T
L
 
F
V
 
A
G
 
D
I
 
A
L
 
F
N
x
T
D
 
A
P
 
D
R
 
F
V
x
F
A
 
A
H
 
T
W
 
W
Q
 
G
S
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
D
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
M
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
M
T
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
A
E
 
D
L
 
D
T
 
L
V
 
L
E
 
T
R
 
E
A
 
A
M
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
K
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
N
K
 
R
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
R
x
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
H
 
R
A
 
L
F
 
F
T
 
H
L
 
S
L
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
R
x
Q
D
 
S
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
A
 
P
R
 
Q
F
 
F
Q
 
T
G
 
H
R
 
R

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
47% identity, 94% coverage: 14:254/257 of query aligns to 14:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
V
 
V
Q
 
G
L
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
x
Q
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
A
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
A
Q
 
T
A
 
E
A
 
L
G
 
D
N
 
D
D
 
D
E
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
x
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
D
 
D
R
 
L
D
 
T
L
 
F
V
 
A
G
 
D
I
 
A
L
 
F
N
x
T
D
 
A
P
 
D
R
 
F
V
x
F
A
 
A
H
 
T
W
 
W
Q
 
G
S
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
D
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
x
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
M
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
M
T
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
A
E
 
D
L
 
D
T
 
L
V
 
L
E
 
T
R
 
E
A
 
A
M
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
K
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
N
K
 
R
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
R
x
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
H
 
R
A
 
L
F
 
F
T
 
H
L
 
S
L
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
Q
D
 
S
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
A
 
P
R
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
47% identity, 94% coverage: 14:254/257 of query aligns to 14:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
V
 
V
Q
 
G
L
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
A
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
A
Q
 
T
A
 
E
A
 
L
G
 
D
N
 
D
D
 
D
E
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
R
x
K
E
 
E
M
|
M
A
 
A
D
 
D
R
 
L
D
 
T
L
 
F
V
 
A
G
 
D
I
 
A
L
 
F
N
x
T
D
 
A
P
 
D
R
 
F
V
x
F
A
 
A
H
 
T
W
 
W
Q
 
G
S
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
D
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
|
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
M
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
M
T
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
A
E
 
D
L
 
D
T
 
L
V
 
L
E
 
T
R
 
E
A
 
A
M
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
K
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
N
K
 
R
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
R
x
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
H
 
R
A
 
L
F
 
F
T
 
H
L
 
S
L
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
Q
D
 
S
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
Q
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
A
 
P
R
 
Q
F
 
F

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
46% identity, 94% coverage: 14:254/257 of query aligns to 13:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
V
 
V
Q
 
G
L
 
I
I
 
I
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
A
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
A
 
S
A
 
A
L
 
A
Q
 
T
A
 
E
A
 
L
G
 
D
N
 
D
D
 
D
E
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
R
 
K
E
 
E
M
|
M
A
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
F
V
 
A
G
 
D
I
 
A
L
 
F
N
x
T
D
 
A
P
 
D
R
 
F
V
x
F
A
 
A
H
 
T
W
 
W
Q
 
G
S
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
F
 
V
A
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
M
C
 
M
A
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
D
D
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
D
M
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
T
I
 
M
T
 
D
A
 
A
L
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
A
E
 
D
L
 
D
T
 
L
V
 
L
E
 
T
R
 
E
A
 
A
M
 
R
Q
 
A
V
 
T
A
 
A
R
 
T
S
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
Q
K
 
M
A
 
S
P
 
A
L
 
S
A
 
A
V
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
N
K
 
R
A
 
A
G
 
F
D
 
E
T
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
S
S
 
E
G
 
G
L
 
L
R
x
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
H
 
R
A
 
L
F
|
F
T
 
H
L
 
S
L
 
A
A
x
F
G
 
A
T
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
Q
D
 
S
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
A
A
 
A
F
|
F
Q
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
A
 
P
R
 
Q
F
 
F

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
42% identity, 96% coverage: 11:257/257 of query aligns to 11:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
E
 
E
H
 
G
G
 
N
V
 
L
Q
 
F
L
 
W
I
 
I
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
D
A
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
S
A
 
Q
A
 
A
G
 
E
N
 
S
D
 
D
E
 
P
H
 
E
V
 
I
R
 
R
A
 
V
T
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
K
A
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
R
 
T
E
 
Q
M
x
F
A
 
N
D
 
Q
R
 
L
D
 
T
L
 
P
V
 
A
G
 
E
I
 
A
L
 
W
N
 
K
D
 
F
P
x
S
R
 
K
V
 
K
A
 
G
H
x
R
-
 
E
-
 
I
W
 
M
Q
 
D
S
 
K
I
 
I
A
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
S
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
L
C
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
|
I
I
 
Y
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
K
P
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
M
 
M
V
 
M
L
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
x
R
I
 
I
T
 
P
A
 
G
L
 
K
R
 
D
A
 
A
Q
 
E
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
N
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
L
E
 
A
L
 
N
T
 
L
V
 
E
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
M
 
R
Q
 
K
V
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
K
K
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
I
A
 
S
V
 
L
R
 
A
L
 
L
A
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
V
L
 
V
L
 
N
K
 
R
A
 
G
G
 
L
D
 
D
T
 
S
D
 
P
L
 
L
A
 
L
S
 
S
G
 
G
L
 
L
R
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
S
H
 
V
A
 
G
F
 
W
T
 
G
L
 
V
L
 
V
A
x
F
G
 
S
T
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
K
D
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
S
A
 
A
F
|
F
Q
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
E
A
 
P
R
 
T
F
 
F
Q
 
K
G
 
G
R
 
K

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:257/257 of query aligns to 4:261/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
M
 
M
P
 
P
R
 
E
Y
 
F
-
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
A
Q
 
R
A
 
G
P
 
P
E
 
-
H
 
-
G
 
-
V
 
I
Q
 
E
L
 
I
I
 
W
T
 
T
L
 
I
Q
 
D
R
 
G
P
 
E
E
x
S
A
x
R
L
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
I
C
 
S
T
 
R
E
 
A
L
 
M
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
L
L
 
V
Q
 
T
A
 
R
A
 
V
G
 
S
N
 
S
D
 
S
E
 
R
H
 
D
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
-
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
L
R
x
K
E
 
E
-
x
R
-
 
A
-
 
T
M
 
M
A
 
A
D
 
E
R
 
D
D
 
E
L
 
V
V
 
R
G
 
A
I
 
F
L
|
L
N
 
D
D
 
G
P
 
L
R
|
R
V
 
R
A
 
T
H
 
-
W
 
F
Q
 
R
S
 
A
I
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
S
A
 
D
K
 
C
P
 
V
L
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
T
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
L
C
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
L
V
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
P
D
 
A
A
 
A
R
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
x
T
E
|
E
I
 
V
N
 
K
L
|
L
G
 
G
I
|
I
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
A
R
 
R
A
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
P
P
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
K
Q
 
D
M
 
L
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
A
E
 
R
A
x
R
I
 
I
T
 
N
A
 
A
L
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
F
Q
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
S
 
N
E
 
R
I
 
L
T
 
A
Q
 
P
P
 
E
E
 
G
L
 
H
T
 
L
V
 
L
E
 
A
R
 
V
A
 
A
M
 
Y
Q
 
G
V
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
S
I
 
V
A
 
V
A
 
E
K
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
A
V
 
V
R
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
H
A
 
A
L
 
I
L
 
D
K
 
E
A
 
G
G
 
T
D
 
G
T
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
D
S
 
D
G
 
A
L
 
L
R
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
L
H
 
R
A
 
K
F
 
Y
T
 
E
L
 
E
L
 
I
A
x
L
G
 
K
T
 
T
A
 
E
D
 
D
R
 
R
D
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
F
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
A
 
P
R
 
V
F
 
Y
Q
 
K
G
 
G
R
 
R

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 11:257/257 of query aligns to 10:257/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
E
 
Q
H
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
T
T
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
A
 
G
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
R
H
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
L
V
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
R
 
T
E
 
E
M
x
F
A
 
G
D
 
D
R
 
R
-
 
K
-
 
P
D
 
D
L
x
Y
V
 
E
G
 
A
I
 
H
L
|
L
N
 
R
D
 
R
-
 
Y
P
x
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
H
 
-
W
 
-
Q
 
E
S
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
G
F
 
L
A
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
L
 
L
A
 
A
M
 
L
C
 
W
A
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
T
 
V
D
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
N
 
R
L
 
I
G
 
G
I
x
L
I
 
V
P
|
P
G
x
D
A
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
L
 
P
R
 
R
A
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
P
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
Q
Q
 
E
M
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
E
 
P
A
 
R
I
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
L
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
H
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
A
E
 
E
L
 
K
T
 
L
V
 
M
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
K
 
G
A
 
P
P
 
T
L
 
R
A
 
A
V
 
Y
R
 
A
L
 
L
A
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
E
A
 
T
G
 
Y
D
 
R
T
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
A
L
 
L
R
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
A
H
 
V
A
 
L
F
 
Q
T
 
G
L
 
Q
L
 
A
A
x
G
G
 
Q
T
 
T
A
 
Q
D
 
D
R
 
H
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
F
Q
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
P
A
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R

Q4WF54 Mevalonyl-coenzyme A hydratase sidH; Siderophore biosynthesis protein H; EC 4.2.1.- from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata) (see paper)
33% identity, 97% coverage: 7:255/257 of query aligns to 14:266/270 of Q4WF54

query
sites
Q4WF54
V
 
V
Q
 
S
A
 
F
P
 
P
E
 
T
H
 
P
G
 
H
V
 
I
Q
 
L
L
 
L
I
 
L
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
R
N
 
N
A
 
C
L
 
I
C
 
S
T
 
L
E
 
A
L
 
T
L
 
S
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
Q
A
 
R
A
 
L
L
 
W
Q
 
T
A
 
W
A
 
F
G
 
D
N
 
T
D
 
Q
E
 
P
H
 
A
V
 
L
R
 
Y
A
 
V
T
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
T
A
 
G
K
 
E
A
 
S
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
K
E
 
E
M
 
W
A
 
N
D
 
D
R
 
L
D
 
N
L
 
A
V
 
R
G
 
G
I
 
I
L
 
T
N
 
N
D
 
E
P
 
M
R
 
T
V
 
A
A
 
P
H
 
-
W
 
-
Q
 
-
S
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
G
F
 
L
-
 
P
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
G
A
 
S
K
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
F
E
 
E
L
 
M
A
 
V
M
 
A
C
 
N
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
S
T
 
E
D
 
N
A
 
A
R
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
V
N
 
Q
L
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
A
P
 
A
G
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
S
T
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
L
 
V
R
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
Q
L
 
R
A
 
A
M
 
A
Q
 
E
M
 
I
V
 
A
L
 
L
T
 
S
G
 
G
E
 
L
A
 
S
I
 
F
T
 
S
A
 
A
L
 
S
R
 
Q
A
 
L
Q
 
E
Q
 
R
A
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
N
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
E
P
 
H
E
 
D
L
 
Q
T
 
L
V
 
L
E
 
A
R
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
T
S
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
R
K
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
D
A
 
S
V
 
V
R
 
R
L
 
V
A
 
T
K
 
M
E
 
E
A
 
G
L
 
L
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
L
 
W
K
 
E
A
 
M
G
 
A
D
 
S
T
 
V
D
 
E
L
 
E
A
 
A
S
 
S
G
 
S
L
 
A
R
 
L
F
 
V
E
 
D
R
 
Q
H
 
W
A
 
Y
F
 
A
T
 
K
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
G
T
 
E
A
 
-
D
 
N
R
 
F
D
 
H
E
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
F
Q
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
P
R
 
Q
F
 
W
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
36% identity, 96% coverage: 11:257/257 of query aligns to 7:245/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
E
 
Q
H
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
T
T
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
Y
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
A
 
G
G
 
E
N
 
E
D
 
D
E
 
R
H
 
E
V
 
V
R
 
R
A
 
A
T
 
L
V
 
L
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
R
 
T
E
 
E
M
 
A
A
 
H
D
x
L
R
 
R
D
 
R
L
x
Y
V
x
N
G
 
R
I
 
V
L
 
V
N
 
-
D
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
H
 
-
W
 
-
Q
 
E
S
 
A
I
 
L
A
 
S
A
 
G
F
 
L
A
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
L
x
A
G
|
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
L
 
L
A
 
A
M
 
L
C
 
W
A
 
G
D
 
D
I
 
L
V
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
T
 
V
D
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
N
 
R
L
x
I
G
 
G
I
x
L
I
 
V
P
|
P
G
x
N
A
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
L
 
P
R
 
R
A
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
P
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
Q
Q
 
E
M
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
E
 
P
A
 
R
I
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
E
R
 
E
A
 
A
Q
 
L
Q
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
H
E
 
R
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
A
E
 
E
L
 
K
T
 
L
V
 
M
E
 
E
R
 
E
A
 
A
M
 
L
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
Q
K
 
G
A
 
P
P
 
T
L
 
R
A
 
A
V
 
Y
R
 
A
L
 
L
A
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
L
L
 
L
L
 
L
K
 
E
A
 
T
G
 
Y
D
 
R
T
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
A
L
 
L
R
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
A
H
 
V
A
 
L
F
 
Q
T
 
G
L
 
Q
L
 
A
A
x
G
G
 
Q
T
 
T
A
 
Q
D
 
D
R
 
H
D
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
F
|
F
Q
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
P
A
 
P
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R

Q13825 Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial; 3-MG-CoA hydratase; AU-specific RNA-binding enoyl-CoA hydratase; AU-binding protein/enoyl-CoA hydratase; Itaconyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.18; EC 4.2.1.56 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
34% identity, 99% coverage: 3:256/257 of query aligns to 78:338/339 of Q13825

query
sites
Q13825
R
 
R
Y
 
V
I
 
R
D
 
H
V
 
L
Q
 
E
A
 
E
P
 
E
E
 
N
H
 
R
G
 
G
V
 
I
Q
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
G
L
 
I
Q
 
N
R
 
R
P
 
A
E
 
Y
A
 
G
L
 
K
N
 
N
A
 
S
L
 
L
C
 
S
T
x
K
E
x
N
L
|
L
L
x
I
A
x
K
E
x
M
L
|
L
A
x
S
A
x
K
A
|
A
L
x
V
Q
x
D
A
|
A
A
x
L
G
x
K
N
 
S
D
 
D
E
 
K
H
 
K
V
 
V
R
 
R
A
 
T
T
 
I
V
 
I
I
 
I
T
 
R
G
 
S
S
 
E
A
 
V
K
 
P
A
 
G
-
 
I
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
K
E
 
E
M
 
R
A
 
A
-
 
K
-
 
M
D
 
S
R
 
S
D
 
S
L
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
P
L
 
F
N
 
V
D
 
S
P
 
K
R
 
I
V
 
R
A
 
A
H
 
V
W
 
I
Q
 
N
S
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
F
 
L
A
 
P
K
 
V
P
 
P
L
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
N
 
D
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
M
 
L
C
 
A
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
A
T
 
S
D
 
S
A
 
A
R
 
K
F
 
M
G
 
G
Q
 
L
P
 
V
E
 
E
I
 
T
N
 
K
L
 
L
G
 
A
I
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
P
R
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
M
P
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
K
Q
 
E
M
 
L
V
 
I
L
 
F
T
 
S
G
x
A
E
 
R
A
 
V
I
 
L
T
 
D
A
 
G
L
 
K
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
Q
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
S
E
 
H
I
 
V
T
 
L
Q
 
E
P
 
Q
-
 
N
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
E
 
D
L
 
A
T
 
A
V
 
Y
E
 
R
R
 
K
A
 
A
M
 
L
Q
 
D
V
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
E
I
 
F
A
 
L
A
 
P
K
 
Q
A
 
G
P
 
P
L
 
V
A
 
A
V
 
M
R
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
L
A
 
A
L
 
I
L
 
N
K
 
Q
A
 
G
G
 
M
D
 
E
T
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
V
S
 
T
G
 
G
L
 
L
R
 
A
F
 
I
E
 
E
R
 
E
H
 
A
A
 
C
F
 
Y
T
 
A
L
 
Q
L
 
T
A
 
I
G
 
P
T
 
T
A
 
K
D
 
D
R
 
R
D
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
L
A
 
A
F
 
F
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
P
A
 
P
R
 
R
F
 
Y
Q
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
31% identity, 94% coverage: 16:257/257 of query aligns to 20:266/266 of O53561

query
sites
O53561
L
 
I
I
 
V
T
 
T
L
 
M
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
T
E
 
E
L
 
M
L
 
M
A
 
R
E
 
I
L
 
M
A
 
V
A
 
Q
A
 
A
L
 
W
Q
 
D
A
 
R
A
 
V
G
 
D
N
 
N
D
 
D
E
 
P
H
 
D
V
 
I
R
 
R
A
 
C
T
 
C
V
 
I
I
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
G
K
 
G
A
 
Y
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
M
D
 
D
I
 
L
R
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
-
 
K
E
 
P
M
 
P
A
 
G
D
 
D
R
 
S
D
 
F
L
 
K
V
 
D
G
 
G
I
 
S
L
 
Y
N
 
G
D
 
P
P
 
S
R
 
R
V
 
I
A
 
D
H
 
A
W
 
L
Q
 
L
S
 
K
I
 
G
A
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
T
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
Y
 
P
A
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
T
E
 
E
L
 
I
A
 
L
M
 
Q
C
 
G
A
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
E
D
 
S
A
 
A
R
x
K
F
|
F
G
|
G
Q
x
I
P
x
S
E
|
E
I
x
A
N
x
K
L
 
W
G
 
S
I
 
L
I
 
Y
P
 
P
G
 
M
A
 
G
G
 
G
G
 
S
T
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
V
R
 
R
A
 
Q
V
 
I
G
 
P
K
 
Y
P
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
C
Q
 
D
M
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
H
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
K
Q
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
E
 
H
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
D
E
 
G
L
 
Q
T
 
A
V
 
L
E
 
T
R
 
K
A
 
A
M
 
L
Q
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
D
S
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
N
A
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
L
 
A
A
 
I
K
 
L
E
 
R
A
 
S
L
 
I
L
 
R
K
 
E
A
 
T
G
 
E
D
 
C
T
 
M
D
 
P
L
 
E
A
 
N
S
 
E
G
 
A
L
 
F
R
 
K
F
 
I
E
 
D
R
 
T
H
 
Q
A
 
I
F
 
G
T
 
I
L
 
K
L
 
V
A
 
F
G
 
L
T
 
S
A
 
D
D
 
D
R
 
A
D
 
K
E
 
E
G
 
G
I
 
P
R
 
R
A
 
A
F
 
F
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
A
 
P
R
 
N
F
 
F
Q
 
Q
G
 
N
R
 
R

3p85A Crystal structure enoyl-coa hydratase from mycobacterium avium (see paper)
38% identity, 84% coverage: 11:226/257 of query aligns to 8:210/224 of 3p85A

query
sites
3p85A
E
 
E
H
 
E
G
 
R
V
 
V
Q
 
R
L
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
A
E
 
A
L
 
L
L
 
R
A
 
D
E
 
R
L
 
F
A
 
F
A
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
E
N
 
T
D
|
D
E
 
D
H
x
D
V
 
V
R
 
D
A
 
V
T
 
V
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
A
 
D
K
 
P
A
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
x
L
D
 
D
I
 
L
R
 
K
E
 
E
M
x
L
A
x
P
D
 
D
R
 
I
D
 
S
L
 
-
V
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
R
V
 
-
A
 
-
H
 
-
W
 
W
Q
 
P
S
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
A
F
 
L
A
 
T
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
A
M
 
L
C
 
Y
A
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
E
D
 
N
A
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
Q
 
D
P
x
T
E
x
H
I
 
A
N
 
R
L
 
V
G
 
G
I
x
L
I
 
L
P
|
P
G
x
T
A
 
W
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
P
R
 
Q
A
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
I
P
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
R
Q
 
R
M
 
M
V
 
S
L
 
L
T
 
T
G
 
G
E
 
D
A
 
Y
I
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
D
A
 
A
Q
 
L
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
T
E
 
E
I
 
V
T
 
V
Q
 
P
P
 
H
E
 
D
L
 
Q
T
 
L
V
 
L
E
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
R
Q
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
A
S
 
S
I
 
I
A
 
V
A
 
G
K
 
N
A
 
N
P
 
Q
L
 
N
A
 
A
V
 
V
R
 
R
L
 
A
A
 
L
K
 
L
E
 
T
A
 
S
L
 
Y
L
 
H
K
 
R
A
 
I
G
 
D
D
 
D
T
 
A
D
 
Q
L
 
T
A
 
S
S
 
A
G
 
G
L
 
L
R
x
W
F
 
Q
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1ef9A The crystal structure of methylmalonyl coa decarboxylase complexed with 2s-carboxypropyl coa (see paper)
31% identity, 95% coverage: 14:257/257 of query aligns to 14:261/261 of 1ef9A

query
sites
1ef9A
V
 
V
Q
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
Q
 
N
R
 
Y
P
 
G
E
 
R
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
K
E
 
V
L
 
F
L
 
I
A
 
D
E
 
D
L
 
L
A
 
M
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
A
 
D
A
 
L
G
 
N
N
 
R
D
 
P
E
 
E
H
 
-
V
 
I
R
 
R
A
 
C
T
 
I
V
 
I
I
 
L
-
 
R
-
 
A
T
 
P
G
 
S
S
 
G
A
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
H
D
|
D
I
|
I
R
x
H
E
 
E
M
x
L
A
 
P
D
 
S
-
 
G
-
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
P
V
 
L
G
 
S
I
 
-
L
 
Y
N
x
D
D
 
D
P
 
P
R
 
L
V
x
R
A
 
Q
H
 
I
W
 
T
Q
 
R
S
 
M
I
 
I
A
 
Q
A
 
K
F
 
F
A
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
S
A
 
M
V
 
V
N
 
E
G
 
G
Y
 
S
A
 
V
L
x
W
G
 
G
G
|
G
G
 
A
C
 
F
E
|
E
L
 
M
A
 
I
M
 
M
C
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
S
D
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
F
G
 
S
Q
 
M
P
x
T
E
x
P
I
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
x
V
I
 
P
P
x
Y
G
x
N
A
 
L
G
 
V
G
 
G
T
 
I
Q
 
H
R
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
D
V
 
A
G
 
G
K
 
F
P
 
H
L
 
I
A
 
V
M
 
K
Q
 
E
M
 
L
V
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
A
E
 
S
A
 
P
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
Q
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
S
 
N
E
 
H
I
 
V
T
 
V
Q
 
E
P
 
V
E
 
E
L
 
E
T
 
L
V
 
E
E
 
D
R
 
F
A
 
T
M
 
L
Q
 
Q
V
 
M
A
 
A
R
 
H
S
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
K
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
A
L
 
V
A
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
R
K
 
V
A
 
L
G
 
G
D
 
E
T
 
A
D
 
H
L
 
T
A
 
M
S
 
N
G
 
S
L
 
D
R
 
E
F
 
F
E
|
E
R
 
R
-
 
I
-
 
Q
H
 
G
A
 
M
F
 
R
T
 
R
L
 
A
L
 
V
A
x
Y
G
 
D
T
 
S
A
 
E
D
 
D
R
 
Y
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
N
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
P
R
 
N
F
 
F
Q
 
V
G
 
G
R
 
H

P52045 Methylmalonyl-CoA decarboxylase; MMCD; Transcarboxylase; EC 4.1.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 14:257/257 of query aligns to 14:261/261 of P52045

query
sites
P52045
V
 
V
Q
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
E
L
 
F
Q
 
N
R
 
Y
P
 
G
E
 
R
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
K
E
 
V
L
 
F
L
 
I
A
 
D
E
 
D
L
 
L
A
 
M
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
A
 
D
A
 
L
G
 
N
N
 
R
D
 
P
E
 
E
H
 
-
V
 
I
R
 
R
A
 
C
T
 
I
V
 
I
I
 
L
-
 
R
-
 
A
T
 
P
G
 
S
S
 
G
A
 
S
K
 
K
A
 
V
F
 
F
A
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
H
D
 
D
I
 
I
R
 
H
E
 
E
M
 
L
A
 
P
D
 
S
-
 
G
-
 
G
R
 
R
D
 
D
L
 
P
V
 
L
G
 
S
I
 
-
L
 
Y
N
 
D
D
 
D
P
 
P
R
 
L
V
 
R
A
 
Q
H
 
I
W
 
T
Q
 
R
S
 
M
I
 
I
A
 
Q
A
 
K
F
 
F
A
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
S
A
 
M
V
 
V
N
 
E
G
 
G
Y
 
S
A
 
V
L
 
W
G
 
G
G
|
G
G
 
A
C
 
F
E
 
E
L
 
M
A
 
I
M
 
M
C
 
S
A
 
S
D
 
D
I
 
L
V
 
I
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
S
D
 
T
A
 
S
R
 
T
F
 
F
G
 
S
Q
 
M
P
x
T
E
 
P
I
 
V
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
V
I
 
P
P
 
Y
G
 
N
A
 
L
G
 
V
G
 
G
T
 
I
Q
 
H
R
 
N
L
 
L
L
 
T
R
 
R
A
 
D
V
 
A
G
 
G
K
 
F
P
 
H
L
 
I
A
 
V
M
 
K
Q
 
E
M
 
L
V
 
I
L
 
F
T
 
T
G
 
A
E
 
S
A
 
P
I
 
I
T
 
T
A
 
A
L
 
Q
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
Q
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
I
V
 
L
S
 
N
E
 
H
I
 
V
T
 
V
Q
 
E
P
 
V
E
 
E
L
 
E
T
 
L
V
 
E
E
 
D
R
 
F
A
 
T
M
 
L
Q
 
Q
V
 
M
A
 
A
R
 
H
S
 
H
I
 
I
A
 
S
A
 
E
K
 
K
A
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
I
R
 
A
L
 
V
A
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
E
L
 
L
L
 
R
K
 
V
A
 
L
G
 
G
D
 
E
T
 
A
D
 
H
L
 
T
A
 
M
S
 
N
G
 
S
L
 
D
R
 
E
F
 
F
E
 
E
R
 
R
-
 
I
-
 
Q
H
 
G
A
 
M
F
 
R
T
 
R
L
 
A
L
 
V
A
 
Y
G
 
D
T
 
S
A
 
E
D
 
D
R
 
Y
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
I
 
M
R
 
N
A
 
A
F
 
F
Q
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
K
A
 
P
R
 
N
F
 
F
Q
 
V
G
 
G
R
 
H

Query Sequence

>PP_3284 FitnessBrowser__Putida:PP_3284
MPRYIDVQAPEHGVQLITLQRPEALNALCTELLAELAAALQAAGNDEHVRATVITGSAKA
FAAGADIREMADRDLVGILNDPRVAHWQSIAAFAKPLIAAVNGYALGGGCELAMCADIVI
ASTDARFGQPEINLGIIPGAGGTQRLLRAVGKPLAMQMVLTGEAITALRAQQAGLVSEIT
QPELTVERAMQVARSIAAKAPLAVRLAKEALLKAGDTDLASGLRFERHAFTLLAGTADRD
EGIRAFQEKRQARFQGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory