SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_3633 FitnessBrowser__Putida:PP_3633 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

2i3gA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (rv1652) from mycobacterium tuberculosis in complex with NADP+. (see paper)
30% identity, 77% coverage: 73:313/313 of query aligns to 96:339/347 of 2i3gA

query
sites
2i3gA
N
 
S
P
 
P
Q
 
E
V
 
T
R
 
L
V
 
I
I
 
I
D
 
D
A
x
C
S
 
G
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
T
P
 
D
G
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
S
W
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
P
E
 
G
Q
 
A
Q
 
R
A
 
-
E
 
D
R
 
Q
I
 
L
A
 
R
Q
 
G
S
 
T
T
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
I
-
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
V
N
 
T
I
 
V
H
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
|
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
A
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
T
R
 
-
H
 
-
E
 
D
Q
 
L
P
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
V
A
 
I
P
 
G
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
L
 
A
Y
 
Y
G
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
G
A
 
V
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
R
H
 
D
A
 
V
G
 
S
L
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
V
F
 
L
M
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
L
L
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
Q
 
R
L
 
T
R
 
R
L
 
S
L
 
P
P
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
C
 
A
L
 
Y
E
 
E
Q
 
K
H
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
G
 
A
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
Y
V
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
E
H
 
G
Q
 
Q
C
 
L
G
 
P
A
 
R
A
 
T
A
 
G
N
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
A
L
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
A
 
V
N
 
D
P
 
E
E
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
L
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
|
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7npjB Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 6-phenoxy-3-pyridinamine
30% identity, 77% coverage: 73:313/313 of query aligns to 93:336/344 of 7npjB

query
sites
7npjB
N
 
S
P
 
P
Q
 
E
V
 
T
R
 
L
V
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
C
S
 
G
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
T
P
 
D
G
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
S
W
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
P
E
 
G
Q
 
A
Q
 
R
A
 
-
E
 
D
R
 
Q
I
 
L
A
 
R
Q
 
G
S
 
T
T
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
I
-
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
V
N
 
T
I
 
V
H
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
A
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
T
R
 
-
H
 
-
E
 
D
Q
 
L
P
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
V
A
 
I
P
 
G
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
L
 
A
Y
 
Y
G
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
G
A
 
V
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
R
H
 
D
A
 
V
G
 
S
L
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
V
F
 
L
M
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
L
L
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
Q
 
R
L
 
T
R
 
R
L
 
S
L
 
P
P
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
C
 
A
L
 
Y
E
 
E
Q
 
K
H
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
G
 
A
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
Y
V
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
E
H
 
G
Q
 
Q
C
 
L
G
 
P
A
 
R
A
 
T
A
 
G
N
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
A
L
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
A
 
V
N
 
D
P
 
E
E
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
L
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7nphC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with 5-methoxy-1,3-benzoxazole-2-carboxylic acid
30% identity, 77% coverage: 73:313/313 of query aligns to 93:336/344 of 7nphC

query
sites
7nphC
N
 
S
P
 
P
Q
 
E
V
 
T
R
 
L
V
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
C
S
 
G
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
T
P
 
D
G
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
S
W
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
P
E
 
G
Q
 
A
Q
 
R
A
 
-
E
 
D
R
 
Q
I
 
L
A
 
R
Q
 
G
S
 
T
T
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
I
-
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
V
N
 
T
I
 
V
H
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
 
G
G
 
A
G
|
G
R
|
R
A
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
T
R
 
-
H
 
-
E
 
D
Q
 
L
P
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
V
A
 
I
P
 
G
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
L
 
A
Y
 
Y
G
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
G
A
 
V
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
R
H
 
D
A
 
V
G
 
S
L
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
V
F
 
L
M
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
L
L
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
Q
 
R
L
 
T
R
 
R
L
 
S
L
 
P
P
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
C
 
A
L
 
Y
E
 
E
Q
 
K
H
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
G
 
A
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
Y
V
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
E
H
 
G
Q
 
Q
C
 
L
G
 
P
A
 
R
A
 
T
A
 
G
N
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
A
L
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
A
 
V
N
 
D
P
 
E
E
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
L
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7notA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP+) and 5-methoxy-3- indoleacetic acid
30% identity, 77% coverage: 73:313/313 of query aligns to 93:336/344 of 7notA

query
sites
7notA
N
 
S
P
 
P
Q
 
E
V
 
T
R
 
L
V
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
C
S
 
G
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
T
P
 
D
G
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
S
W
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
P
E
 
G
Q
 
A
Q
 
R
A
 
-
E
 
D
R
 
Q
I
 
L
A
 
R
Q
 
G
S
 
T
T
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
I
-
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
V
N
 
T
I
 
V
H
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
T
R
 
-
H
 
-
E
 
D
Q
 
L
P
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
V
A
 
I
P
 
G
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
L
 
A
Y
|
Y
G
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
G
A
 
V
H
|
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
R
H
 
D
A
 
V
G
 
S
L
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
V
F
x
L
M
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
L
L
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
Q
 
R
L
 
T
R
 
R
L
 
S
L
 
P
P
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
C
 
A
L
 
Y
E
 
E
Q
 
K
H
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
G
 
A
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
Y
V
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
E
H
 
G
Q
 
Q
C
 
L
G
 
P
A
 
R
A
 
T
A
 
G
N
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
A
L
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
A
 
V
N
 
D
P
 
E
E
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
L
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
D
G
 
G

7nnrA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis argc in complex with xanthene-9-carboxylic acid
30% identity, 77% coverage: 73:313/313 of query aligns to 93:336/344 of 7nnrA

query
sites
7nnrA
N
 
S
P
 
P
Q
 
E
V
 
T
R
 
L
V
 
I
I
 
I
D
 
D
A
 
C
S
 
G
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
T
P
 
D
G
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
Y
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
S
W
 
W
V
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
P
E
 
G
Q
 
A
Q
 
R
A
 
-
E
 
D
R
 
Q
I
 
L
A
 
R
Q
 
G
S
 
T
T
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
A
N
 
V
P
 
P
G
 
G
C
 
C
Y
|
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
L
H
 
F
P
 
P
L
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
I
-
 
E
P
 
P
A
 
A
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
L
 
V
N
 
T
I
 
V
H
 
V
A
 
A
V
 
V
S
|
S
G
 
G
Y
 
T
S
 
S
G
|
G
G
x
A
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
T
E
 
T
R
 
-
H
 
-
E
 
D
Q
 
L
P
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
E
K
 
V
A
 
I
P
 
G
A
 
S
L
 
A
Q
 
R
L
 
A
Y
|
Y
G
 
N
L
 
I
E
 
A
L
 
G
A
 
V
H
|
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
P
E
 
E
I
 
I
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
G
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
R
H
 
D
A
 
V
G
 
S
L
 
V
S
 
S
A
 
F
R
 
T
P
 
P
M
 
V
F
x
L
M
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
L
L
 
A
S
 
T
I
 
C
P
 
T
L
 
A
Q
 
R
L
 
T
R
 
R
L
 
S
L
 
P
P
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
L
 
L
Q
 
R
A
 
A
C
 
A
L
 
Y
E
 
E
Q
 
K
H
 
A
Y
 
Y
Q
 
H
G
 
A
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
Y
V
 
L
M
 
M
P
 
P
L
 
E
H
 
G
Q
 
Q
C
 
L
G
 
P
A
 
R
A
 
T
A
 
G
N
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
N
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
D
 
A
L
 
A
R
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
A
A
 
V
N
 
D
P
 
E
E
 
D
H
 
A
G
 
Q
Q
 
T
V
 
F
L
 
V
L
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
L
 
M
D
 
N
L
 
L
M
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2ozpA Crystal structure of n-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase (ttha1904) from thermus thermophilus
24% identity, 94% coverage: 19:313/313 of query aligns to 45:334/342 of 2ozpA

query
sites
2ozpA
I
 
V
H
 
H
A
 
P
R
 
N
L
 
L
Q
x
R
G
 
G
R
 
R
S
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
F
L
 
V
T
 
P
L
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
C
 
P
E
 
E
A
 
K
I
 
L
N
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
L
L
 
V
L
 
L
C
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
H
D
 
G
A
 
V
-
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
P
I
 
V
H
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
K
P
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
G
G
 
R
W
 
F
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
Y
A
 
R
E
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
K
Q
 
G
S
 
A
T
 
D
R
 
W
V
 
I
S
 
A
N
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
C
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
L
L
 
G
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
P
 
K
A
 
P
D
 
T
Y
 
-
P
 
P
L
 
I
N
 
F
I
 
V
H
 
T
A
 
L
V
 
L
S
 
I
G
 
S
Y
 
T
S
 
S
G
 
A
G
 
G
G
 
G
R
x
A
A
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
P
R
 
A
H
 
S
E
 
H
Q
 
H
P
 
P
G
 
-
A
 
-
A
 
E
K
 
R
A
 
A
P
 
G
A
 
S
L
 
I
Q
 
R
L
 
V
Y
 
Y
G
 
K
L
 
-
E
 
P
L
 
T
A
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
A
E
 
E
I
 
V
Q
 
V
Q
 
E
H
 
N
A
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
P
A
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
E
F
 
V
M
 
H
P
 
L
G
 
T
Y
 
A
G
 
I
A
 
A
Y
 
T
R
 
D
Q
 
R
G
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
I
S
 
L
I
 
M
P
 
T
L
 
A
Q
 
Q
L
 
C
R
 
F
L
 
V
L
 
Q
P
 
D
G
 
G
Q
 
W
V
 
S
S
 
E
A
 
R
E
 
D
H
 
V
L
 
W
Q
 
Q
A
 
A
C
 
Y
L
 
R
E
 
E
Q
 
A
H
 
-
Y
 
Y
Q
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
R
V
 
L
M
 
V
P
 
K
L
 
-
H
 
Q
Q
 
K
C
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
H
A
 
R
N
 
Y
L
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
F
L
 
V
N
 
Q
G
 
G
S
 
T
N
 
N
D
 
Y
L
 
A
R
 
D
L
 
I
A
 
G
L
 
F
Y
 
E
A
 
L
N
 
E
P
 
E
E
 
D
H
 
T
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
V
L
 
V
T
 
M
A
 
T
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
H
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
D
 
N
L
 
V
M
 
R
L
 
M
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

O50146 [LysW]-L-2-aminoadipate 6-phosphate reductase; EC 1.2.1.103 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
24% identity, 94% coverage: 19:313/313 of query aligns to 47:336/344 of O50146

query
sites
O50146
I
 
V
H
 
H
A
 
P
R
 
N
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
S
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
F
L
 
I
T
 
P
L
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
C
 
P
E
 
E
A
 
K
I
 
L
N
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
L
L
 
V
L
 
L
C
 
A
L
|
L
P
 
P
D
 
H
D
 
G
A
 
V
-
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
P
I
 
I
H
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
L
I
 
I
D
 
D
A
 
L
S
 
S
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
|
R
T
 
L
T
 
K
P
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
G
G
 
C
W
 
F
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
Y
A
 
R
E
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
K
Q
 
G
S
 
A
T
 
D
R
 
W
V
 
I
S
 
A
N
 
G
P
 
A
G
 
G
C
|
C
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
L
L
 
G
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
P
 
K
A
 
P
D
 
T
Y
 
-
P
 
P
L
 
I
N
 
F
I
 
V
H
 
T
A
 
L
V
 
L
S
 
I
G
 
S
Y
 
T
S
|
S
G
 
A
G
 
A
G
 
G
R
x
A
A
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
P
R
 
A
H
 
S
E
 
H
Q
 
H
P
 
P
G
 
-
A
 
-
A
 
E
K
x
R
A
 
A
P
 
G
A
 
S
L
 
I
Q
 
R
L
 
V
Y
 
Y
G
 
K
L
 
-
E
 
P
L
 
T
A
 
G
H
 
H
K
 
R
H
|
H
V
 
T
P
 
A
E
 
E
I
 
V
Q
 
V
Q
 
E
H
 
N
A
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
P
A
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
E
F
 
V
M
 
H
P
 
L
G
 
T
Y
 
A
G
 
I
A
 
A
Y
 
T
R
 
D
Q
 
R
G
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
I
S
 
L
I
 
M
P
 
T
L
 
A
Q
 
Q
L
 
C
R
 
F
L
 
V
L
 
Q
P
 
D
G
 
G
Q
 
W
V
 
S
S
 
E
A
 
R
E
 
D
H
 
V
L
 
W
Q
 
Q
A
 
A
C
 
Y
L
x
R
E
 
E
Q
 
A
H
 
-
Y
 
Y
Q
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
R
V
 
L
M
 
V
P
x
K
L
 
-
H
 
Q
Q
 
K
C
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
H
A
x
R
N
 
Y
L
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
F
L
 
V
N
 
Q
G
 
G
S
 
T
N
 
N
D
 
Y
L
 
A
R
 
D
L
 
I
A
 
G
L
 
F
Y
 
E
A
 
L
N
 
E
P
 
E
E
 
D
H
 
T
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
V
L
 
V
T
 
M
A
 
T
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
|
N
L
 
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
T
S
 
A
G
 
G
A
 
H
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
D
 
N
L
 
V
M
 
R
L
 
M
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5einA Crystal structure of c148a mutant of lysy from thermus thermophilus in complex with NADP+ and lysw-gamma-aminoadipic acid (see paper)
24% identity, 94% coverage: 19:313/313 of query aligns to 47:336/344 of 5einA

query
sites
5einA
I
 
V
H
 
H
A
 
P
R
 
N
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
S
 
T
D
 
N
L
 
L
R
 
K
L
 
F
L
 
I
T
 
P
L
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
R
 
-
C
 
P
E
 
E
A
 
K
I
 
L
N
 
E
S
 
P
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
L
L
 
V
L
 
L
C
x
A
L
|
L
P
|
P
D
 
H
D
 
G
A
 
V
-
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
-
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
S
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
P
I
 
I
H
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
L
I
 
I
D
 
D
A
x
L
S
|
S
S
 
A
A
 
D
H
 
F
R
 
R
T
 
L
T
 
K
P
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
R
-
 
Y
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
G
G
 
C
W
 
F
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
D
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
Y
A
 
R
E
 
E
R
 
A
I
 
L
A
 
K
Q
 
G
S
 
A
T
 
D
R
 
W
V
 
I
S
 
A
N
 
G
P
 
A
G
 
G
C
 
A
Y
 
N
P
 
A
T
 
T
G
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
L
L
 
G
L
 
L
H
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
L
P
 
K
A
 
P
D
 
T
Y
 
-
P
 
P
L
 
I
N
 
F
I
 
V
H
 
T
A
 
L
V
 
L
S
 
I
G
 
S
Y
 
T
S
 
S
G
x
A
G
 
A
G
|
G
R
x
A
A
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
P
R
 
A
H
 
S
E
 
H
Q
 
H
P
 
P
G
 
-
A
 
-
A
 
E
K
 
R
A
 
A
P
 
G
A
 
S
L
 
I
Q
 
R
L
 
V
Y
 
Y
G
 
K
L
 
-
E
 
P
L
 
T
A
 
G
H
 
H
K
 
R
H
 
H
V
 
T
P
 
A
E
 
E
I
 
V
Q
 
V
Q
 
E
H
 
N
A
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
P
A
 
G
R
 
R
P
 
P
M
 
E
F
 
V
M
 
H
P
 
L
G
 
T
Y
 
A
G
 
I
A
 
A
Y
 
T
R
 
D
Q
 
R
G
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
I
S
 
L
I
 
M
P
 
T
L
 
A
Q
 
Q
L
 
C
R
 
F
L
 
V
L
 
Q
P
 
D
G
 
G
Q
 
W
V
 
S
S
 
E
A
 
R
E
 
D
H
 
V
L
 
W
Q
 
Q
A
 
A
C
 
Y
L
 
R
E
 
E
Q
 
A
H
 
-
Y
 
Y
Q
 
A
G
 
G
A
 
E
R
 
P
H
 
F
V
 
I
Q
 
R
V
 
L
M
 
V
P
 
K
L
 
-
H
 
Q
Q
 
K
C
 
K
G
 
G
A
 
V
A
 
H
A
 
R
N
 
Y
L
 
P
D
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
F
L
 
V
N
 
Q
G
 
G
S
 
T
N
 
N
D
 
Y
L
 
A
R
 
D
L
 
I
A
 
G
L
 
F
Y
 
E
A
 
L
N
 
E
P
 
E
E
 
D
H
 
T
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
L
 
V
L
 
V
T
 
M
A
 
T
V
 
A
F
 
I
D
 
D
N
 
N
L
|
L
G
 
V
K
 
K
G
 
G
A
x
T
S
 
A
G
 
G
A
 
H
A
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
L
 
L
D
 
N
L
 
V
M
 
R
L
 
M
G
 
G
A
 
W
L
 
P
Q
 
E
A
 
T
H
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_3633 FitnessBrowser__Putida:PP_3633
MHTPVVFIDGDQGTTGLQIHARLQGRSDLRLLTLPEAERKDPQRRCEAINSADIALLCLP
DDAAREAVAAIHNPQVRVIDASSAHRTTPGWVYGLPELDEQQAERIAQSTRVSNPGCYPT
GAIALLHPLVKAGLLPADYPLNIHAVSGYSGGGRAAVERHEQPGAAKAPALQLYGLELAH
KHVPEIQQHAGLSARPMFMPGYGAYRQGIALSIPLQLRLLPGQVSAEHLQACLEQHYQGA
RHVQVMPLHQCGAAANLDPEALNGSNDLRLALYANPEHGQVLLTAVFDNLGKGASGAAVQ
NLDLMLGALQAHG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory