SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_3926 PP_3926 short-chain dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9BTZ2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NRDR; humNRDR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; SCAD-SRL; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; Short-chain dehydrogenase/reductase family member 4; EC 1.1.1.184 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
37% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 30:273/278 of Q9BTZ2

query
sites
Q9BTZ2
L
 
L
D
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
 
A
A
 
S
S
 
T
R
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
R
 
R
K
 
K
L
 
Q
D
 
Q
G
 
N
C
 
V
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
A
A
 
V
D
 
A
A
 
T
I
 
L
I
 
Q
A
 
G
A
 
E
G
 
G
G
 
L
K
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
T
A
 
V
C
 
C
H
 
H
I
 
V
G
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
A
R
 
V
E
 
K
Q
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
V
N
 
N
P
 
P
Q
 
F
F
 
F
C
 
G
N
 
S
V
 
I
L
 
M
D
 
D
T
 
V
D
 
T
P
 
E
G
 
E
A
 
V
F
 
W
Q
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
L
D
 
D
V
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
Y
 
P
F
 
A
F
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
V
K
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
E
 
K
N
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
S
I
 
I
N
 
A
G
 
A
V
 
F
S
 
S
P
 
P
G
x
S
L
 
P
F
 
G
Q
x
F
G
 
S
I
 
P
Y
 
Y
S
 
N
V
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
x
T
F
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
L
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
I
D
 
K
T
 
T
K
 
S
F
 
F
A
 
S
S
 
R
A
 
M
L
 
L
V
 
W
K
 
M
N
 
D
E
 
K
A
 
E
I
 
K
L
 
E
N
 
E
A
 
S
A
 
M
L
 
K
Q
 
E
Q
 
T
I
 
L
P
 
R
L
 
I
K
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
V
N
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

3o4rA Crystal structure of human dehydrogenase/reductase (sdr family) member 4 (dhrs4)
37% identity, 96% coverage: 9:252/255 of query aligns to 6:249/254 of 3o4rA

query
sites
3o4rA
L
 
L
D
 
A
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
x
A
A
 
S
S
x
T
R
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
S
S
|
S
R
|
R
K
|
K
L
 
Q
D
 
Q
G
x
N
C
 
V
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
A
A
 
V
D
 
A
A
 
T
I
 
L
I
 
Q
A
 
G
A
 
E
G
 
G
G
 
L
K
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
T
A
 
V
C
 
C
H
|
H
I
x
V
G
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
T
I
 
A
R
 
V
E
 
K
Q
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
A
|
A
T
 
V
N
 
N
P
 
P
Q
 
F
F
 
F
C
 
G
N
 
S
V
 
I
L
 
M
D
 
D
T
 
V
D
 
T
P
 
E
G
 
E
A
 
V
F
 
W
Q
 
D
K
 
K
T
 
T
V
 
L
D
 
D
V
 
I
N
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
Y
 
P
F
 
A
F
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
V
K
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
E
 
K
N
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
V
N
 
I
V
 
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
N
 
A
G
 
A
V
 
F
S
 
S
P
 
P
G
 
S
L
 
P
F
 
G
Q
x
F
G
 
S
I
 
P
Y
|
Y
S
 
N
V
 
V
T
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
x
I
D
 
K
T
|
T
K
 
S
F
|
F
A
x
S
S
 
R
A
 
M
L
 
L
V
 
W
K
 
M
N
 
D
E
x
K
A
 
E
I
 
K
L
 
E
N
 
E
A
 
S
A
 
M
L
 
K
Q
 
E
Q
 
T
I
 
L
P
 
R
L
 
I
K
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
V
N
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

2zatA Crystal structure of a mammalian reductase (see paper)
37% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 3:249/251 of 2zatA

query
sites
2zatA
L
 
L
D
 
E
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
x
A
A
 
S
S
x
T
R
x
D
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
R
L
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
S
S
|
S
R
|
R
K
|
K
L
 
Q
D
 
E
G
x
N
C
 
V
Q
 
D
Q
 
R
V
 
T
A
 
V
D
 
A
A
 
T
I
 
L
I
 
Q
A
 
G
A
 
E
G
 
G
G
 
L
K
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
T
A
 
V
C
 
C
H
|
H
I
 
V
G
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
M
I
 
A
R
 
V
E
 
N
Q
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
|
N
A
 
A
A
|
A
T
 
V
N
 
N
P
 
P
Q
 
F
F
 
F
C
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
A
D
 
T
P
 
E
G
 
E
A
 
V
F
 
W
Q
 
D
K
 
K
T
 
I
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
Y
 
T
F
 
V
F
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
V
K
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
E
 
K
N
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
N
 
I
V
|
V
A
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
G
G
 
A
V
 
Y
S
 
H
P
 
P
G
 
F
L
 
P
F
 
N
Q
x
L
G
 
G
I
 
P
Y
|
Y
S
 
N
V
 
V
T
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
N
F
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
L
T
x
I
D
 
K
T
|
T
K
 
N
F
|
F
A
x
S
S
 
Q
A
 
V
L
 
L
V
 
W
K
 
M
N
 
D
E
x
K
A
 
A
I
 
R
L
 
K
N
 
E
A
 
Y
A
 
M
L
 
K
Q
 
E
Q
 
S
I
 
L
P
 
R
L
 
I
K
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
N
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
V
N
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
T
L
 
A
S
 
S

Q8WNV7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4; NADPH-dependent carbonyl reductase; CR; PHCR; NADPH-dependent retinol dehydrogenase/reductase; NDRD; Peroxisomal carbonyl reductase; PerCR; Peroxisomal short-chain alcohol dehydrogenase; PSCD; Short chain dehydrogenase/reductase family 25C member 2; Protein SDR25C2; EC 1.1.1.184; EC 1.1.1.300 from Sus scrofa (Pig) (see 2 papers)
37% identity, 97% coverage: 9:255/255 of query aligns to 31:277/279 of Q8WNV7

query
sites
Q8WNV7
L
 
L
D
 
E
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
x
L
V
|
V
S
x
T
G
x
A
A
x
S
S
x
T
R
x
D
G
|
G
I
|
I
G
|
G
E
x
L
A
|
A
I
|
I
A
|
A
H
x
R
L
x
R
L
|
L
A
|
A
Q
|
Q
Q
x
D
G
|
G
A
|
A
H
|
H
V
|
V
I
x
V
V
 
V
S
 
S
S
 
S
R
 
R
K
 
K
L
 
Q
D
 
E
G
 
N
C
 
V
Q
 
D
Q
 
R
V
 
T
A
 
V
D
 
A
A
 
T
I
 
L
I
 
Q
A
 
G
A
 
E
G
 
G
G
 
L
K
 
S
A
 
V
T
 
T
A
 
G
V
 
T
A
 
V
C
 
C
H
 
H
I
 
V
G
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
I
 
R
Q
 
E
Q
 
R
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
M
I
 
A
R
 
V
E
 
N
Q
 
L
F
 
H
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
T
 
V
N
 
N
P
 
P
Q
 
F
F
 
F
C
 
G
N
 
N
V
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
A
D
 
T
P
 
E
G
 
E
A
 
V
F
 
W
Q
 
D
K
 
K
T
 
I
V
 
L
D
 
H
V
 
V
N
 
N
I
 
V
R
 
K
G
 
A
Y
 
T
F
 
V
F
 
L
M
 
M
S
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
V
K
 
P
L
 
E
M
 
M
R
 
E
E
 
K
N
 
R
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
V
I
 
L
N
 
I
V
 
V
A
 
S
S
 
S
I
 
V
N
 
G
G
 
A
V
 
Y
S
 
H
P
 
P
G
x
F
L
 
P
F
 
N
Q
x
L
G
 
G
I
 
P
Y
|
Y
S
 
N
V
 
V
T
 
S
K
|
K
A
 
T
A
 
A
V
 
L
I
 
L
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
x
N
F
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
L
L
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
I
D
 
K
T
 
T
K
 
N
F
 
F
A
 
S
S
 
Q
A
 
V
L
 
L
V
 
W
K
 
M
N
 
D
E
 
K
A
 
A
I
 
R
L
 
K
N
 
E
A
 
Y
A
 
M
L
 
K
Q
 
E
Q
 
S
I
 
L
P
 
R
L
 
I
K
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
N
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
I
V
 
V
L
 
S
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
D
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
V
N
 
V
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
T
L
 
A
S
|
S

Sites not aligning to the query:

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
35% identity, 97% coverage: 6:253/255 of query aligns to 1:249/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
L
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
D
 
R
G
 
G
K
 
R
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
x
L
G
 
G
E
 
F
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
H
 
S
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
A
S
|
S
R
|
R
K
 
N
L
 
L
D
 
E
G
 
E
C
 
A
Q
 
S
Q
 
E
V
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
K
I
 
L
I
 
T
A
 
E
A
 
K
G
 
Y
G
 
G
K
 
V
A
 
E
T
 
T
-
 
M
A
 
A
V
 
F
A
 
R
C
|
C
H
x
D
I
x
V
G
 
S
E
 
N
L
 
Y
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
Q
 
K
Q
 
K
V
 
L
F
 
L
A
 
E
G
 
A
I
 
V
R
 
K
E
 
E
Q
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
V
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
A
x
G
T
x
I
N
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
H
P
 
P
Q
 
A
F
 
E
C
 
E
N
 
F
V
 
P
L
 
L
D
 
D
T
 
E
D
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
F
Q
 
R
K
 
Q
T
 
V
V
 
I
D
 
E
V
|
V
N
 
N
I
 
L
R
 
F
G
 
G
Y
 
T
F
 
Y
F
 
Y
M
 
V
S
 
C
V
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
F
K
 
S
L
 
L
M
 
L
R
 
R
E
 
E
N
 
S
G
 
D
G
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
S
|
S
I
 
L
N
 
T
G
 
-
V
 
V
S
 
E
P
 
E
G
 
V
L
 
T
F
 
M
Q
 
P
G
 
N
I
|
I
-
 
S
-
 
A
Y
|
Y
S
 
A
V
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
I
 
A
N
 
S
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
A
F
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
C
 
W
A
 
G
P
 
R
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
W
T
x
Y
D
 
R
T
|
T
K
 
K
F
x
M
A
x
T
S
 
E
A
 
A
L
 
V
V
 
F
K
 
S
N
 
D
E
 
P
A
 
E
I
 
K
L
 
L
N
 
D
A
 
Y
A
 
M
L
 
L
Q
 
K
Q
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
G
D
 
V
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
V
V
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
S
 
A
S
 
K
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
I
L
 
I
N
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 12:254/255 of query aligns to 6:252/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
K
 
K
I
 
T
A
 
V
F
 
I
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
L
 
E
L
 
C
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
S
 
G
S
 
H
R
x
S
K
 
G
L
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
G
 
G
C
 
A
Q
 
L
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
T
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
C
 
A
H
x
D
I
x
A
G
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
I
 
G
Q
 
E
Q
 
K
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
A
R
 
V
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
T
x
I
N
 
C
P
 
P
Q
 
-
F
|
F
C
 
H
N
 
S
V
 
F
L
 
L
D
 
D
T
 
M
D
 
P
P
 
R
G
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
D
 
G
V
 
T
N
 
N
I
 
L
R
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
F
 
F
M
 
T
S
 
V
V
 
Q
E
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
R
L
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
-
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
V
|
V
A
x
S
S
|
S
I
 
I
N
x
S
G
 
A
V
 
L
S
 
V
P
 
G
G
 
G
L
 
A
F
 
M
Q
|
Q
G
 
T
I
 
H
Y
|
Y
S
 
T
V
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
N
 
S
M
 
L
T
 
M
K
 
Q
V
 
S
F
 
C
A
 
A
K
 
I
E
 
A
C
 
L
A
 
G
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
L
 
T
T
x
I
D
 
A
T
|
T
K
 
D
F
x
I
-
x
N
-
 
K
-
 
E
-
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
E
K
 
K
N
 
R
E
 
E
A
 
R
I
 
M
L
 
T
N
 
S
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
Q
 
R
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
K
 
D
E
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
|
D
A
x
M
S
 
A
S
x
R
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
F

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 12:254/255 of query aligns to 6:252/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
K
 
K
I
 
T
A
 
V
F
 
I
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
L
 
E
L
 
C
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
S
 
G
S
 
H
R
 
S
K
 
G
L
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
G
 
G
C
 
A
Q
 
L
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
T
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
C
 
A
H
x
D
I
x
A
G
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
I
 
G
Q
 
E
Q
 
K
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
A
R
 
V
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
T
x
I
N
 
C
P
 
P
Q
 
-
F
 
F
C
 
H
N
 
S
V
 
F
L
 
L
D
 
D
T
 
M
D
 
P
P
 
R
G
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
D
 
G
V
x
T
N
 
N
I
 
L
R
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
F
 
F
M
 
T
S
 
V
V
 
Q
E
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
R
L
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
-
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
V
|
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
N
 
S
G
 
A
V
 
L
S
 
V
P
 
G
G
 
G
L
 
A
F
 
M
Q
 
Q
G
 
T
I
 
H
Y
|
Y
S
 
T
V
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
N
 
S
M
 
L
T
 
M
K
 
Q
V
 
S
F
 
C
A
 
A
K
 
I
E
 
A
C
 
L
A
 
G
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
L
 
T
T
x
I
D
 
A
T
|
T
K
 
D
F
x
I
-
 
N
-
 
K
-
 
E
-
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
E
K
 
K
N
 
R
E
 
E
A
 
R
I
 
M
L
 
T
N
 
S
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
Q
 
R
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
K
 
D
E
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
A
S
 
R
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
F

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 12:254/255 of query aligns to 6:243/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
K
 
K
I
 
T
A
 
V
F
 
I
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
A
A
 
A
H
 
R
L
 
E
L
 
C
A
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
I
 
V
V
 
I
S
 
G
S
x
H
R
x
S
K
 
G
L
 
S
D
 
D
-
 
E
-
x
G
-
 
R
-
 
A
G
 
G
C
 
A
Q
 
L
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
K
 
T
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
C
 
A
H
x
D
I
x
A
G
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
I
 
G
Q
 
E
Q
 
K
V
 
L
F
 
V
A
 
A
G
 
A
I
 
A
R
 
V
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
T
x
I
N
 
C
P
 
P
Q
 
-
F
 
F
C
 
H
N
 
S
V
 
F
L
 
L
D
 
D
T
 
M
D
 
P
P
 
R
G
 
E
A
 
L
F
 
Y
Q
 
L
K
 
K
T
 
T
V
 
V
D
 
G
V
x
T
N
 
N
I
 
L
R
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
Y
F
 
F
M
 
T
S
 
V
V
 
Q
E
 
A
A
 
A
G
 
A
K
 
R
L
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
-
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
V
 
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
N
 
S
G
 
A
V
 
L
S
 
V
P
 
G
G
 
G
L
 
A
F
 
M
Q
 
Q
G
 
T
I
 
H
Y
|
Y
S
 
T
V
 
P
T
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
N
 
S
M
 
L
T
 
M
K
 
Q
V
 
S
F
 
C
A
 
A
K
 
I
E
 
A
C
 
L
A
 
G
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
T
T
x
I
D
 
-
T
 
-
K
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
E
K
 
K
N
 
R
E
 
E
A
 
R
I
 
M
L
 
T
N
 
S
A
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
Q
 
R
I
 
V
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
K
 
D
E
 
D
M
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
A
S
 
R
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
L
L
 
F

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 1:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
T
 
S
H
 
Q
L
 
F
F
 
M
D
 
N
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
T
S
 
A
R
x
T
K
 
S
L
 
E
D
 
S
G
 
G
C
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
D
K
 
N
A
 
G
T
 
K
A
 
G
V
 
M
A
 
A
C
 
L
H
x
N
I
x
V
G
 
T
E
 
N
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
I
 
I
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
K
G
 
A
I
 
I
R
 
T
E
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
T
x
I
N
 
T
P
 
R
Q
 
D
F
 
N
C
 
L
N
 
-
V
 
L
L
 
M
D
 
R
T
 
M
D
 
K
P
 
E
G
 
E
A
 
E
F
 
W
Q
 
S
K
 
D
T
 
I
V
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
I
 
L
R
 
T
G
 
S
Y
 
I
F
 
F
F
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
L
K
 
R
L
 
G
M
 
M
R
 
M
E
 
K
N
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
|
V
A
 
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
V
 
T
S
 
M
P
 
G
G
 
N
L
 
A
F
 
G
Q
 
Q
G
 
A
I
 
N
Y
|
Y
S
 
A
V
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
S
F
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
C
 
V
A
 
A
P
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
T
x
I
D
 
E
T
|
T
K
 
D
F
x
M
A
 
T
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
-
K
 
-
N
 
N
E
 
D
A
 
E
I
 
Q
L
 
R
N
 
T
A
 
A
A
 
T
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
R
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 1:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
T
 
S
H
 
Q
L
 
F
F
 
M
D
 
N
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
G
S
 
T
S
 
A
R
x
T
K
 
S
L
 
E
D
 
S
G
 
G
C
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
V
 
I
A
 
S
D
 
D
A
 
Y
I
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
G
 
D
K
 
N
A
 
G
T
 
K
A
 
G
V
 
M
A
 
A
C
 
L
H
x
N
I
x
V
G
 
T
E
 
N
L
 
P
E
 
E
Q
 
S
I
 
I
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
F
 
L
A
 
K
G
 
A
I
 
I
R
 
T
E
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
T
 
I
N
 
T
P
 
R
Q
 
D
F
 
N
C
 
L
N
 
-
V
 
L
L
 
M
D
 
R
T
 
M
D
 
K
P
 
E
G
 
E
A
 
E
F
 
W
Q
 
S
K
 
D
T
 
I
V
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
I
 
L
R
 
T
G
 
S
Y
 
I
F
 
F
F
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
L
K
 
R
L
 
G
M
 
M
R
 
M
E
 
K
N
 
K
G
 
R
G
 
Q
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
x
G
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
V
 
T
S
 
M
P
 
G
G
 
N
L
 
A
F
 
G
Q
|
Q
G
 
A
I
 
N
Y
|
Y
S
 
A
V
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
S
F
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
C
 
V
A
 
A
P
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
L
 
V
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
T
 
I
D
 
E
T
|
T
K
 
D
F
 
M
A
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
-
N
 
N
E
 
D
A
 
E
I
 
Q
L
 
R
N
 
T
A
 
A
A
 
T
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
D
P
 
P
K
 
R
E
 
E
M
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
A
 
E
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:254/255 of query aligns to 1:246/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
T
 
S
H
 
N
L
 
A
F
 
M
D
 
K
L
 
L
D
 
A
G
 
S
K
 
K
I
 
T
A
 
A
F
 
I
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
F
A
 
G
I
 
I
A
 
A
H
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
I
S
 
A
S
x
D
R
|
R
K
 
D
L
 
A
D
 
H
G
 
G
C
 
-
Q
 
E
Q
 
A
V
 
A
A
 
A
D
 
A
A
 
S
I
 
L
I
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
T
 
L
A
 
F
V
 
I
A
 
S
C
|
C
H
 
N
I
|
I
G
 
A
E
 
E
L
 
K
E
 
T
Q
 
Q
I
 
V
Q
 
E
Q
 
A
V
 
L
F
 
F
A
 
S
G
 
Q
I
 
A
R
 
E
E
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
T
x
I
N
 
N
-
 
R
-
 
D
P
 
A
Q
 
M
F
 
L
C
 
H
N
 
K
V
 
L
L
 
T
D
 
E
T
 
A
D
 
D
P
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
W
Q
 
D
K
 
T
T
 
V
V
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
I
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
T
F
 
F
F
 
L
M
 
C
S
 
M
V
 
Q
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
K
 
I
L
 
R
M
 
M
R
 
R
E
 
E
N
 
R
G
 
G
G
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
N
 
S
G
 
W
V
 
L
S
 
G
P
 
-
G
 
N
L
 
V
F
 
G
Q
 
Q
G
 
T
I
 
N
Y
|
Y
S
 
S
V
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
V
 
T
F
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
K
F
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
L
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
F
T
x
I
D
 
D
T
|
T
K
 
D
F
 
M
A
x
T
S
 
R
A
 
G
L
 
V
V
 
P
K
 
E
N
 
N
E
 
-
A
 
-
I
 
V
L
 
W
N
 
Q
A
 
I
A
 
M
L
 
V
Q
 
S
Q
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
Y
V
 
A
A
 
G
D
 
E
P
 
A
K
 
K
E
 
D
M
 
V
A
 
G
G
 
E
A
 
C
V
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
S
 
A
S
 
R
Y
 
Y
T
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
E
T
 
V
L
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
V

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
35% identity, 96% coverage: 9:253/255 of query aligns to 3:245/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
D
 
D
G
 
N
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
H
 
H
L
 
S
L
 
Y
A
 
A
Q
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
S
 
S
S
x
D
R
x
I
K
 
N
L
 
E
D
 
D
G
 
H
C
 
G
Q
 
N
Q
 
K
V
 
A
A
 
V
D
 
E
A
 
D
I
 
I
I
 
K
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
S
A
 
F
V
 
V
A
 
K
C
x
A
H
x
D
I
x
T
G
 
S
E
 
N
L
 
P
E
 
E
Q
 
E
I
 
V
Q
 
E
Q
 
A
V
 
L
F
 
V
A
 
K
G
 
R
I
 
T
R
 
V
E
 
E
Q
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
T
 
I
N
 
G
P
 
G
Q
 
E
F
 
Q
C
 
A
N
 
L
V
 
A
L
 
G
D
 
D
T
 
Y
D
 
G
P
 
L
G
 
D
A
 
S
F
 
W
Q
 
R
K
 
K
T
 
V
V
 
L
D
 
S
V
 
I
N
 
N
I
 
L
R
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
F
F
 
Y
M
 
G
S
 
C
V
 
K
E
 
Y
A
 
E
G
 
L
K
 
E
L
 
Q
M
 
M
R
 
E
E
 
K
N
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
I
 
I
N
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
V
P
 
A
G
 
A
L
 
P
F
 
L
Q
 
S
G
 
S
I
 
A
Y
|
Y
S
 
T
V
 
S
T
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
N
F
 
I
A
 
G
K
 
A
E
 
E
C
 
Y
A
 
G
P
 
Q
F
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
G
P
|
P
G
x
A
L
x
Y
T
x
I
D
 
E
T
 
T
K
 
P
F
x
L
A
 
L
S
 
E
A
 
S
L
 
L
V
 
T
K
 
K
N
 
E
E
 
-
A
 
-
I
 
M
L
 
K
N
 
E
A
 
A
A
 
L
L
 
I
Q
 
S
Q
 
K
I
 
H
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
S
 
S
S
 
S
Y
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
G
T
 
Y
L
 
Y
N
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 3:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
V
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
I
L
 
N
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
I
I
 
F
V
 
F
S
x
N
S
x
Y
R
x
N
-
x
G
K
x
S
L
 
P
D
 
E
G
 
A
C
 
A
Q
 
E
Q
 
E
V
 
T
A
 
A
D
 
K
A
 
L
I
 
V
I
 
A
A
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
K
 
E
A
 
V
T
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
K
C
 
A
H
x
N
I
x
V
G
 
A
E
 
I
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
I
 
V
Q
 
D
Q
 
A
V
 
F
F
 
F
A
 
K
G
 
Q
I
 
A
R
 
I
E
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
-
x
I
T
 
T
N
 
R
P
 
D
Q
 
N
F
 
L
C
 
L
N
 
M
V
 
R
L
 
M
D
 
K
T
 
E
D
 
D
P
 
E
G
 
-
A
 
-
F
 
W
Q
 
D
K
 
D
T
 
V
V
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
I
 
L
R
 
K
G
 
G
Y
 
T
F
 
F
F
 
L
M
 
C
S
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
S
K
 
R
L
 
T
M
 
M
R
 
M
E
 
K
N
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
N
 
V
G
 
G
V
 
L
S
 
I
P
 
G
G
 
N
L
 
A
F
 
G
Q
|
Q
G
 
A
I
 
N
Y
|
Y
S
 
V
V
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
V
 
T
F
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
T
x
I
D
 
T
T
|
T
K
 
D
F
 
M
A
 
T
S
 
D
A
 
K
L
 
L
V
 
-
K
 
-
N
 
D
E
 
E
A
 
K
I
 
T
L
 
K
N
 
E
A
 
A
A
 
M
L
 
L
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
A
V
 
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
K
 
E
E
 
D
M
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
S
S
 
K
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
N
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
V

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
37% identity, 98% coverage: 7:255/255 of query aligns to 3:248/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
F
 
F
D
 
S
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
T
A
 
A
F
 
V
V
 
V
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
 
H
L
 
G
L
 
Y
A
 
A
Q
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
S
 
W
S
 
G
R
|
R
K
 
T
L
 
-
D
 
D
G
 
G
C
 
V
Q
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
S
A
 
A
T
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
C
 
A
H
x
D
I
x
L
G
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
A
Q
 
N
I
 
V
Q
 
A
Q
 
E
V
 
E
F
 
L
A
 
A
G
 
A
I
 
T
R
 
R
E
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
T
x
I
N
 
I
P
 
A
Q
 
R
F
 
-
C
 
A
N
 
P
V
 
A
L
 
E
D
 
E
T
 
V
D
 
S
P
 
L
G
 
G
A
 
R
F
 
W
Q
 
R
K
 
E
T
 
V
V
 
L
D
 
T
V
 
V
N
 
N
I
 
L
R
 
D
G
 
A
Y
 
A
F
 
W
F
 
V
M
 
L
S
 
S
V
 
R
E
 
S
A
 
F
G
 
G
K
 
T
L
 
A
M
 
M
R
 
L
E
 
A
N
 
H
G
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
V
N
 
T
V
x
I
A
|
A
S
|
S
I
 
M
N
 
L
G
 
S
V
 
F
S
 
Q
P
 
G
G
 
G
L
 
R
F
 
N
Q
x
V
G
 
A
I
 
A
Y
|
Y
S
 
A
V
 
A
T
 
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
K
 
S
E
 
E
C
 
W
A
 
A
P
 
G
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
G
C
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
Y
T
x
V
D
 
V
T
|
T
K
 
A
F
x
N
A
x
T
S
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
R
K
 
A
N
 
D
E
 
D
A
 
E
I
 
R
L
 
A
N
 
A
A
 
E
A
 
I
L
 
T
Q
 
A
Q
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
V
 
W
A
 
A
D
 
T
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
M
A
 
V
G
 
G
A
 
P
V
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
A
S
 
S
Y
 
Y
T
 
V
T
 
H
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
L
N
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
W
L
 
L
S
 
A

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 9:254/255 of query aligns to 4:245/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
D
 
T
G
 
A
K
 
Q
I
 
V
A
 
A
F
 
L
V
 
V
S
 
T
G
 
G
A
|
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
K
A
 
A
I
 
T
A
 
A
H
 
L
L
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
Q
 
T
G
 
G
A
 
M
H
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
V
S
 
N
-
 
Y
S
 
A
R
 
Q
K
 
S
L
 
S
D
 
T
G
 
A
C
 
A
Q
 
D
Q
 
A
V
 
V
A
 
V
D
 
A
A
 
E
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
Q
C
 
A
H
 
N
I
 
V
G
 
A
E
 
N
L
 
A
E
 
D
Q
 
E
I
 
V
Q
 
D
Q
 
Q
V
 
L
F
 
I
A
 
K
G
 
T
I
 
T
R
 
L
E
 
D
Q
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
T
 
I
N
 
T
P
 
R
Q
 
D
F
 
T
C
 
L
N
 
-
V
 
L
L
 
L
D
 
R
T
 
M
D
 
K
P
 
L
G
 
E
A
 
D
F
 
W
Q
 
Q
K
 
A
T
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
I
 
L
R
 
T
G
 
G
Y
 
V
F
 
F
F
 
L
M
 
C
S
 
T
V
 
K
E
 
A
A
 
V
G
 
S
K
 
K
L
 
L
M
 
M
R
 
L
E
 
K
N
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
T
S
 
S
I
 
V
N
 
A
G
 
G
V
 
M
-
 
M
-
 
G
S
 
N
P
|
P
G
 
G
L
 
-
F
 
-
Q
 
Q
G
 
A
I
 
N
Y
 
Y
S
 
S
V
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
V
 
T
F
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
S
F
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
G
L
x
F
T
 
-
D
 
-
T
 
-
K
 
-
F
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
D
L
 
M
V
 
T
K
 
E
N
 
N
E
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
L
N
|
N
A
 
A
A
 
E
-
 
P
-
 
I
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
V
 
Y
A
 
G
D
 
Q
P
 
P
K
 
E
E
 
E
M
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
I
L
 
R
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
-
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
A
Y
 
Y
T
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
M
L
 
V

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
32% identity, 98% coverage: 5:254/255 of query aligns to 1:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
H
 
H
L
 
M
F
 
S
D
 
R
L
 
L
D
 
Q
G
 
D
K
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
I
V
 
I
S
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
E
 
L
A
 
E
I
 
A
A
 
A
H
 
R
L
 
V
L
 
F
A
 
M
Q
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
I
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
-
R
 
-
K
 
-
L
 
-
D
|
D
G
x
F
C
 
N
Q
 
E
Q
 
A
V
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
E
I
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
N
G
 
P
K
 
G
A
 
V
T
 
V
A
 
F
V
 
I
A
 
R
C
x
V
H
x
D
I
x
V
G
 
S
E
 
D
L
 
R
E
 
E
Q
 
S
I
 
V
Q
 
H
Q
 
R
V
 
L
F
 
V
A
 
E
G
 
N
I
 
V
R
 
A
E
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
-
x
I
T
 
T
N
 
R
P
x
D
Q
 
S
F
 
M
C
 
L
N
 
S
V
x
K
L
 
M
D
 
T
T
 
V
D
 
D
P
 
Q
G
 
-
A
 
-
F
 
F
Q
 
Q
K
 
Q
T
 
V
V
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
I
 
L
R
 
T
G
 
G
Y
 
V
F
 
F
F
 
H
M
 
C
S
 
T
V
 
Q
E
 
A
A
 
V
G
 
L
K
 
P
L
 
Y
M
 
M
R
 
A
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
I
 
V
N
 
T
G
 
G
V
 
T
S
 
Y
P
 
G
G
x
N
L
x
V
F
 
G
Q
|
Q
G
 
T
I
 
N
Y
|
Y
S
 
A
V
 
A
T
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
V
 
T
F
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
C
 
L
A
 
A
P
 
R
F
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
T
|
T
D
 
E
T
|
T
K
 
A
F
x
M
A
 
V
S
 
A
A
 
E
L
 
V
V
 
-
K
 
-
N
 
P
E
 
E
A
 
K
I
 
V
L
 
I
N
 
E
A
x
K
A
 
M
L
 
K
Q
 
A
Q
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
V
 
L
A
 
G
D
 
K
P
 
P
K
 
E
E
 
D
M
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
A
 
E
S
 
S
S
 
D
Y
 
Y
T
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
T
 
V
L
 
L
N
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
I
L
 
M