SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_4059 FitnessBrowser__Putida:PP_4059 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5x7uA Trehalose synthase from thermobaculum terrenum (see paper)
63% identity, 50% coverage: 13:565/1106 of query aligns to 1:545/546 of 5x7uA

query
sites
5x7uA
D
 
D
P
 
P
L
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
A
 
A
V
 
I
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
G
I
 
V
K
 
R
S
 
C
F
 
F
F
 
F
D
|
D
S
 
S
N
|
N
N
 
N
D
|
D
G
 
G
I
x
S
G
 
G
D
|
D
F
 
I
A
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
A
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
E
E
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
T
T
 
A
L
 
I
W
 
W
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
A
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
K
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
S
E
 
D
Y
 
Y
K
 
R
A
 
S
V
 
L
H
 
H
P
 
P
D
 
D
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
I
A
 
E
D
 
D
A
 
F
R
 
K
R
 
V
F
 
F
I
 
L
A
 
D
E
 
E
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
V
I
 
I
T
 
T
E
|
E
L
 
L
V
 
V
I
 
L
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
Q
W
 
W
F
 
F
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
R
 
R
H
 
-
A
 
S
K
 
N
R
 
P
G
 
N
S
 
S
K
 
P
A
 
Y
R
 
R
E
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
D
Q
 
D
K
 
K
Y
 
Y
D
 
K
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
I
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
R
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
W
D
 
D
P
 
Q
V
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
L
 
Q
K
 
Q
A
 
E
V
 
I
I
 
L
G
 
D
V
 
I
M
 
V
R
 
G
F
 
Y
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
Y
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
K
I
 
L
R
 
R
A
 
K
E
 
F
I
 
V
D
 
D
A
 
D
N
 
N
Y
 
W
P
 
P
D
 
N
R
 
R
M
 
M
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
-
G
 
-
D
 
N
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
Y
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
I
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
M
Y
 
Y
M
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
D
R
 
R
F
 
H
P
 
P
I
 
I
T
 
T
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
E
N
 
T
C
 
C
Q
 
Q
W
 
W
A
 
A
I
 
L
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
|
H
D
|
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
M
W
 
Y
N
 
H
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
D
 
D
R
 
P
R
 
R
A
 
M
R
 
R
I
 
L
N
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
N
D
 
S
R
 
E
R
 
R
R
|
R
I
 
I
E
 
Q
L
 
L
L
 
M
T
 
H
S
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
F
S
 
T
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
T
P
 
P
T
 
I
L
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
S
P
 
G
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
A
 
A
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
R
 
A
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
I
M
 
R
D
 
D
P
 
P
L
 
V
Y
 
F
G
 
T
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
E
H
 
Q
D
 
V
P
 
P
H
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
W
T
 
M
R
 
K
R
 
R
M
 
T
L
 
I
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
K
 
K
Q
 
K
Q
 
Y
K
 
P
A
 
V
F
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
L
 
I
R
 
R
T
 
F
L
 
L
T
 
Q
P
 
P
S
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
Q
D
 
D
A
 
T
D
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
T
I
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
A
A
 
C
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
C
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
D
L
 
L
S
 
S
Q
 
D
Y
 
F
A
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
Y
P
 
P
V
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
S
 
T
A
 
V
F
 
F
P
 
P
P
 
Q
I
 
I
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
F
P
 
G
P
 
P
Y
x
H
A
 
V
F
 
F
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
L
 
E
L
 
L
A
 
K
S
 
P
R
 
Q
D
 
E
R
 
Q
M
 
L
P
 
P

A0R6E0 Trehalose synthase/amylase TreS; Maltose alpha-D-glucosyltransferase; MTase; EC 3.2.1.1; EC 5.4.99.16 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see 2 papers)
61% identity, 50% coverage: 13:566/1106 of query aligns to 32:590/593 of A0R6E0

query
sites
A0R6E0
D
 
D
P
 
T
L
 
N
W
 
W
Y
 
F
K
 
K
D
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
L
I
 
V
K
 
R
S
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
S
 
S
N
 
N
N
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
E
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
T
 
C
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
D
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
R
E
 
D
Y
 
F
K
 
Y
A
 
K
V
 
V
H
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
V
R
 
T
F
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
T
E
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
E
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
E
A
 
S
R
 
R
H
 
H
A
 
N
K
 
P
R
 
D
G
 
G
S
 
P
K
 
Y
A
 
G
R
 
-
E
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
S
Q
 
D
K
 
R
Y
 
Y
D
 
P
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
V
 
M
I
 
L
G
 
D
V
 
V
M
 
L
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
 
R
L
 
L
D
|
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
F
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
C
R
 
R
A
 
K
E
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
D
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
A
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
P
D
 
D
-
 
T
-
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
T
C
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
 
H
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
M
W
 
Y
N
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
D
 
D
R
 
P
R
 
R
A
 
M
R
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
I
I
 
I
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
S
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
T
P
 
P
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
N
M
 
Q
D
 
D
P
 
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
T
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
L
H
 
D
D
 
S
P
 
S
H
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
W
T
 
T
R
 
R
R
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
S
Q
 
R
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
G
S
 
S
N
 
N
R
 
P
R
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Y
 
V
T
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
D
 
D
A
 
G
D
 
G
G
 
A
N
 
K
T
 
T
E
 
D
V
 
A
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
N
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
P
Q
 
Q
A
 
P
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
N
L
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
D
 
G
K
 
Y
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
T
G
 
G
G
 
Y
S
 
V
A
 
E
F
 
F
P
 
P
P
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
G
Y
 
H
A
 
G
F
 
F
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
S
 
E
R
 
P
D
 
D
R
 
P
M
 
E
P
 
P
S
 
G

5jy7B Complex of mycobacterium smegmatis trehalose synthase with maltokinase (see paper)
62% identity, 50% coverage: 13:562/1106 of query aligns to 16:570/571 of 5jy7B

query
sites
5jy7B
D
 
D
P
 
T
L
 
N
W
 
W
Y
 
F
K
 
K
D
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
L
I
 
V
K
 
R
S
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
 
D
S
 
S
N
 
N
N
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
E
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
T
 
C
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
D
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
R
E
 
D
Y
 
F
K
 
Y
A
 
K
V
 
V
H
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
V
R
 
T
F
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
T
E
x
D
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
E
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
E
A
 
S
R
 
R
H
 
H
A
 
N
K
 
P
R
 
D
G
 
G
S
 
P
K
 
Y
A
 
G
R
 
-
E
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
S
Q
 
D
K
 
R
Y
 
Y
D
 
P
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
V
 
M
I
 
L
G
 
D
V
 
V
M
 
L
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
F
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
C
R
 
R
A
 
K
E
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
D
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
A
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
P
D
 
D
-
 
T
-
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
T
C
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
|
H
D
|
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
M
W
 
Y
N
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
D
 
D
R
 
P
R
 
R
A
 
M
R
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
I
I
 
I
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
S
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
T
P
 
P
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
N
M
 
Q
D
 
D
P
 
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
T
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
L
H
 
D
D
 
S
P
 
S
H
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
W
T
 
T
R
 
R
R
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
S
Q
 
R
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
G
S
 
S
N
 
N
R
 
P
R
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Y
 
V
T
 
T
-
 
R
-
 
Q
-
 
Q
-
 
G
D
 
D
A
 
G
D
 
G
G
 
A
N
 
K
T
 
T
E
 
D
V
 
A
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
N
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
P
Q
 
Q
A
 
P
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
N
L
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
D
 
G
K
 
Y
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
T
G
 
G
G
 
Y
S
 
V
A
 
E
F
 
F
P
 
P
P
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
G
Y
 
H
A
 
G
F
 
F
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
S
 
E
R
 
P
D
 
D

3zoaA The structure of trehalose synthase (tres) of mycobacterium smegmatis in complex with acarbose (see paper)
62% identity, 50% coverage: 13:562/1106 of query aligns to 3:548/548 of 3zoaA

query
sites
3zoaA
D
 
D
P
 
T
L
 
N
W
 
W
Y
 
F
K
 
K
D
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
L
I
 
V
K
 
R
S
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
|
D
S
 
S
N
|
N
N
 
A
D
|
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
D
|
D
F
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
E
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
T
 
C
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
D
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
R
E
 
D
Y
 
F
K
 
Y
A
 
K
V
 
V
H
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
V
R
 
T
F
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
T
E
x
D
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
E
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
E
A
 
S
R
 
R
H
 
H
A
 
N
K
 
P
R
 
D
G
 
G
S
 
P
K
 
Y
A
 
G
R
 
-
E
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
S
Q
 
D
K
 
R
Y
 
Y
D
 
P
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
V
 
M
I
 
L
G
 
D
V
 
V
M
 
L
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
F
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
C
R
 
R
A
 
K
E
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
D
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
A
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
P
D
 
D
-
 
T
-
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
T
C
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
|
H
D
|
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
M
W
 
Y
N
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
D
 
D
R
 
P
R
 
R
A
 
M
R
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
I
I
 
I
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
S
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
T
P
 
P
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
N
M
 
Q
D
 
D
P
 
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
T
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
L
H
 
D
D
 
S
P
 
S
H
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
|
W
T
 
T
R
 
R
R
x
N
M
|
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
S
Q
 
R
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
G
S
 
S
N
 
N
R
 
P
R
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Y
 
V
T
 
T
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
T
E
 
D
V
 
A
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
N
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
P
Q
 
Q
A
 
P
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
N
L
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
D
 
G
K
 
Y
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
|
E
M
|
M
L
x
T
G
 
G
G
x
Y
S
 
V
A
 
E
F
 
F
P
 
P
P
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
G
Y
 
H
A
 
G
F
|
F
Y
|
Y
W
|
W
F
 
F
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
S
 
E
R
 
P
D
 
D

3zo9A The structure of trehalose synthase (tres) of mycobacterium smegmatis (see paper)
62% identity, 50% coverage: 13:562/1106 of query aligns to 4:549/549 of 3zo9A

query
sites
3zo9A
D
 
D
P
 
T
L
 
N
W
 
W
Y
 
F
K
 
K
D
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
L
I
 
V
K
 
R
S
 
A
F
 
F
F
 
Y
D
|
D
S
 
S
N
|
N
N
 
A
D
|
D
G
 
G
I
|
I
G
 
G
D
|
D
F
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
A
 
K
E
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
T
 
C
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
D
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
R
E
 
D
Y
 
F
K
 
Y
A
 
K
V
 
V
H
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
V
R
 
T
F
 
L
I
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
T
E
x
D
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
D
Q
 
Q
H
 
H
P
 
E
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
E
A
 
S
R
 
R
H
 
H
A
 
N
K
 
P
R
 
D
G
 
G
S
 
P
K
 
Y
A
 
G
R
 
-
E
 
D
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
S
Q
 
D
K
 
R
Y
 
Y
D
 
P
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
V
 
M
I
 
L
G
 
D
V
 
V
M
 
L
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
L
D
|
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
F
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
C
R
 
R
A
 
K
E
 
A
I
 
I
D
 
D
A
 
D
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
A
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
A
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
P
D
 
D
-
 
T
-
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
T
C
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
|
H
D
|
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
M
W
 
Y
N
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
D
 
D
R
 
P
R
 
R
A
 
M
R
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
I
I
 
I
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
S
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
T
P
 
P
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
N
M
 
Q
D
 
D
P
 
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
H
T
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
L
H
 
D
D
 
S
P
 
S
H
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
W
T
 
T
R
 
R
R
 
N
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
S
Q
 
R
Q
 
H
K
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
F
R
 
R
T
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
G
S
 
S
N
 
N
R
 
P
R
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
E
Y
 
V
T
 
T
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
T
 
T
E
 
D
V
 
A
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
N
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
P
Q
 
Q
A
 
P
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
N
L
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
A
D
 
G
K
 
Y
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
T
G
 
G
G
 
Y
S
 
V
A
 
E
F
 
F
P
 
P
P
 
S
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
G
Y
 
H
A
 
G
F
 
F
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
L
 
Q
L
 
L
A
 
R
S
 
E
R
 
P
D
 
D

4lxfA Crystal structure of m. Tuberculosis tres (see paper)
58% identity, 50% coverage: 8:560/1106 of query aligns to 24:570/570 of 4lxfA

query
sites
4lxfA
A
 
A
A
 
A
F
 
L
I
 
P
D
 
A
D
 
D
P
 
P
L
 
T
W
 
W
Y
 
F
K
 
K
D
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
L
I
 
V
K
 
R
S
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
A
N
 
S
N
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
S
G
 
G
D
 
D
F
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
D
K
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
A
 
Q
E
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
D
T
 
C
L
 
I
W
 
W
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
D
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
R
E
 
D
Y
 
F
K
 
Y
A
 
K
V
 
V
H
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
V
R
 
A
F
 
L
I
 
V
A
 
D
E
 
A
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
T
E
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
E
Q
 
S
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
E
A
 
S
R
 
R
H
 
R
A
 
D
K
 
P
R
 
D
G
 
G
S
 
P
K
 
Y
A
 
G
R
 
-
E
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
S
Q
 
E
K
 
R
Y
 
Y
D
 
T
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
S
W
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
D
V
 
V
M
 
I
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
F
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
K
E
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
D
N
 
E
Y
 
F
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
G
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
E
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
P
D
 
N
-
 
T
-
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
M
C
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
 
H
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
L
 
M
W
 
Y
N
 
A
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
D
 
D
R
 
P
R
 
R
A
 
M
R
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
V
I
 
I
Y
 
W
L
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
T
A
 
A
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
S
M
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
R
H
 
D
D
 
T
P
 
S
H
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
F
T
 
T
R
 
R
R
 
T
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
R
Q
 
R
Q
 
H
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
F
R
 
Q
T
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
G
S
 
S
N
 
N
R
 
P
R
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
E
 
Q
Y
 
V
T
 
A
D
 
G
A
 
D
D
 
D
G
 
G
N
 
D
T
 
T
E
 
-
V
 
-
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
N
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
P
Q
 
Q
A
 
P
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
D
L
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
T
D
 
N
K
 
Y
V
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
H
S
 
V
A
 
E
F
 
F
P
 
P
P
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
G
Y
 
H
A
 
G
F
 
F
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
L
 
Q
L
 
L
A
 
T
S
 
T

4lxfB Crystal structure of m. Tuberculosis tres (see paper)
55% identity, 50% coverage: 8:560/1106 of query aligns to 24:546/546 of 4lxfB

query
sites
4lxfB
A
 
A
A
 
A
F
 
L
I
 
P
D
 
A
D
 
D
P
 
P
L
 
T
W
 
W
Y
 
F
K
 
K
D
 
H
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
V
H
 
L
I
 
V
K
 
R
S
 
A
F
 
F
F
 
F
D
 
D
S
 
A
N
 
S
N
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
S
G
 
G
D
 
D
F
 
L
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
D
K
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
A
 
Q
E
 
W
L
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
D
T
 
C
L
 
I
W
 
W
L
 
L
L
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
P
 
D
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
G
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
A
 
R
E
 
D
Y
 
F
K
 
Y
A
 
K
V
 
V
H
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
M
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
V
R
 
A
F
 
L
I
 
V
A
 
D
E
 
A
A
 
A
H
 
H
K
 
R
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
I
 
I
T
 
T
E
 
D
L
 
L
V
 
V
I
 
M
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
E
Q
 
S
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
E
A
 
S
R
 
R
H
 
R
A
 
D
K
 
P
R
 
D
G
 
G
S
 
P
K
 
Y
A
 
G
R
 
-
E
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
T
D
 
S
Q
 
E
K
 
R
Y
 
Y
D
 
T
G
 
D
T
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
V
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
S
W
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
S
H
 
H
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
V
 
V
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
V
 
M
I
 
I
G
 
D
V
 
V
M
 
I
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
F
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
A
V
 
F
L
 
L
K
 
K
A
 
R
I
 
V
R
 
R
A
 
K
E
 
V
I
 
V
D
 
D
A
 
D
N
 
E
Y
 
F
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
G
D
 
D
T
 
V
R
 
V
P
 
E
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
D
G
 
P
D
 
N
-
 
T
-
 
G
G
 
G
D
 
D
E
 
E
C
 
C
H
 
H
M
 
M
A
 
A
F
 
F
H
 
H
F
 
F
P
 
P
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
M
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
R
E
 
E
D
 
S
R
 
R
F
 
F
P
 
P
I
 
I
T
 
S
D
 
E
I
 
I
L
 
I
R
 
A
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
P
I
 
I
P
 
P
A
 
D
N
 
M
C
 
A
Q
 
Q
W
 
W
A
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
 
H
D
 
D
E
 
E
L
 
L
T
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
W
 
-
N
 
-
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
D
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
N
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
N
R
 
Q
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
T
S
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
 
S
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
V
I
 
I
Y
 
W
L
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
I
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
R
N
 
N
G
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
T
A
 
A
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
P
 
P
I
 
S
M
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
A
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
S
 
R
H
 
D
D
 
T
P
 
S
H
 
T
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
N
W
 
F
T
 
T
R
 
R
R
 
T
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
K
 
R
Q
 
R
Q
 
H
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
F
R
 
Q
T
 
E
L
 
L
T
 
G
P
 
G
S
 
S
N
 
N
R
 
P
R
 
S
I
 
V
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
E
 
Q
Y
 
V
T
 
A
D
 
G
A
 
D
D
 
D
G
 
G
N
 
D
T
 
T
E
 
-
V
 
-
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
V
A
 
N
N
 
N
V
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
F
A
 
P
Q
 
Q
A
 
P
A
 
I
E
 
E
L
 
L
E
 
D
L
 
L
S
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
A
 
T
D
 
N
K
 
Y
V
 
T
P
 
P
V
 
V
E
 
E
M
 
L
L
 
T
G
 
G
G
 
H
S
 
V
A
 
E
F
 
F
P
 
P
P
 
R
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
P
 
P
F
 
Y
L
 
L
L
 
L
T
 
T
L
 
L
P
 
P
P
 
G
Y
 
H
A
 
G
F
 
F
Y
 
Y
W
 
W
F
 
F
L
 
Q
L
 
L
A
 
T
S
 
T

5gtwA The n253r mutant structures of trehalose synthase from deinococcus radiodurans display two different active-site conformations
54% identity, 49% coverage: 14:560/1106 of query aligns to 1:548/548 of 5gtwA

query
sites
5gtwA
P
 
P
L
 
E
W
 
W
Y
 
Y
K
 
K
D
 
S
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
H
 
S
I
 
V
K
 
R
S
 
T
F
 
F
F
 
Q
D
|
D
S
 
G
N
|
N
N
 
G
D
|
D
G
 
G
I
x
K
G
 
G
D
|
D
F
 
F
A
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
S
K
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
T
 
C
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
H
P
 
P
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
S
 
T
M
 
L
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
K
R
 
V
F
 
F
I
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
K
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
W
V
 
V
I
 
I
T
 
G
E
x
D
L
 
L
V
 
V
I
 
T
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
S
Q
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
R
A
 
G
K
 
P
R
 
T
-
 
L
-
 
P
-
 
D
G
 
G
S
 
S
-
 
P
-
 
N
K
 
E
A
 
Y
R
 
H
E
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
D
D
 
E
D
 
G
Q
 
K
K
 
E
Y
 
Y
D
 
A
G
 
D
T
 
T
R
 
R
I
 
I
I
 
I
F
 
F
L
 
T
D
 
D
T
 
T
E
 
E
K
 
V
S
 
S
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
L
D
 
D
P
 
E
V
 
Q
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
H
 
H
R
 
R
F
 
F
Y
 
F
S
 
A
H
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
L
 
V
K
 
E
A
 
E
V
 
L
I
 
H
G
 
G
V
 
A
M
 
A
R
 
R
F
 
F
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
V
D
|
D
A
 
A
I
 
V
P
 
P
Y
|
Y
L
|
L
I
 
I
E
|
E
R
 
R
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
S
N
 
C
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
E
 
E
T
 
T
H
 
H
D
 
E
V
 
I
L
 
L
K
 
K
A
 
G
I
 
F
R
 
R
A
 
A
E
 
M
I
 
V
D
 
D
A
 
R
N
 
E
Y
 
Y
P
 
P
D
 
G
R
 
R
M
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
|
E
A
 
A
N
 
R
Q
 
Q
W
 
W
P
 
P
E
 
E
D
 
E
T
 
V
R
 
V
P
 
E
Y
 
Y
F
 
F
G
 
G
E
 
T
G
 
E
D
 
A
G
 
E
D
 
P
E
 
E
C
 
F
H
 
H
M
 
M
A
 
C
F
 
F
H
 
N
F
 
F
P
 
P
L
 
V
M
 
M
P
 
P
R
 
R
M
 
L
Y
 
Y
M
 
M
A
 
S
L
 
L
A
 
K
M
 
R
E
 
E
D
 
D
R
 
T
F
 
S
P
 
S
I
 
I
T
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
M
R
 
G
Q
 
R
T
 
L
P
 
P
E
 
K
I
 
I
P
 
P
A
 
S
N
 
F
C
 
G
Q
 
Q
W
 
W
A
 
C
I
 
I
F
 
F
L
 
L
R
 
R
N
 
N
H
|
H
D
|
D
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
E
 
E
M
 
M
V
 
V
T
 
T
D
 
D
R
 
D
E
 
E
R
 
R
D
 
A
Y
 
F
L
 
M
W
 
Y
N
 
A
Y
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
P
D
 
D
R
 
A
R
 
R
A
 
M
R
 
K
I
 
I
N
 
N
L
 
V
G
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
D
R
 
N
D
 
D
R
 
R
R
 
R
R
 
R
I
 
I
E
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
N
S
 
T
L
 
V
L
 
L
L
 
L
S
 
A
M
 
L
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
P
T
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
D
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
D
 
D
N
 
D
I
 
L
Y
 
G
L
 
L
G
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
W
 
W
S
 
N
P
 
A
D
 
G
R
 
T
N
 
S
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
T
A
 
A
D
 
Q
P
 
P
Q
 
S
R
 
D
L
 
C
V
 
F
L
 
F
P
 
P
P
 
P
I
 
I
M
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
F
Q
 
G
T
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
V
E
 
Q
A
 
S
Q
 
Q
S
 
L
H
 
Q
D
 
D
P
 
P
H
 
S
S
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
K
W
 
W
T
 
T
R
 
A
R
 
R
M
 
Q
L
 
L
A
 
E
V
 
L
R
 
R
K
 
R
Q
 
A
Q
 
H
K
 
P
A
 
A
F
 
F
G
 
A
R
 
H
G
 
G
S
 
D
L
 
L
R
 
T
T
 
F
L
 
I
T
 
E
P
 
T
S
 
G
N
 
N
R
 
P
R
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
I
 
T
R
 
R
E
 
Q
Y
 
Y
T
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
D
G
 
G
N
 
-
T
 
-
E
 
E
V
 
T
I
 
L
L
 
L
C
 
I
V
 
V
A
 
S
N
 
N
V
 
F
S
 
A
R
 
G
A
 
N
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
S
 
A
Q
 
P
Y
 
F
A
 
V
D
 
G
K
 
R
V
 
A
P
 
P
V
 
V
E
 
T
M
 
L
L
 
S
G
 
G
G
 
A
S
 
S
A
 
P
F
 
L
P
 
P
P
 
V
I
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
N
G
 
G
Q
 
Q
L
 
Y
P
 
P
F
 
V
L
 
V
L
 
M
T
 
G
L
 
-
P
 
-
P
 
K
Y
 
Y
A
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
W
 
W
F
 
L
L
 
R
L
 
L
A
 
N
S
 
S

5ykbD The n253f mutant structure of trehalose synthase from deinococcus radiodurans reveals an open active-site conformation (see paper)
53% identity, 49% coverage: 14:558/1106 of query aligns to 1:522/523 of 5ykbD

query
sites
5ykbD
P
 
P
L
 
E
W
 
W
Y
 
Y
K
 
K
D
 
S
A
 
A
V
 
V
I
 
F
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
L
H
 
S
I
 
V
K
 
R
S
 
T
F
 
F
F
 
Q
D
|
D
S
 
G
N
|
N
N
 
G
D
|
D
G
 
G
I
x
K
G
 
G
D
|
D
F
 
F
A
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
T
S
 
S
K
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
I
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
T
 
C
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
L
P
 
P
F
 
W
Y
 
F
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
L
R
 
R
D
 
D
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
K
 
R
A
 
G
V
 
I
H
 
H
P
 
P
D
 
D
Y
 
L
G
 
G
S
 
T
M
 
L
A
 
D
D
 
D
A
 
F
R
 
K
R
 
V
F
 
F
I
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
A
H
 
H
K
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
W
V
 
V
I
 
I
T
 
G
E
x
D
L
 
L
V
 
V
I
 
T
N
|
N
H
 
H
T
 
T
S
 
S
D
 
S
Q
 
D
H
 
H
P
 
P
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
R
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
R
A
 
G
K
 
P
R
 
T
G
 
L
S
 
N
K
 
E
A
 
Y
R
 
H
E
 
D
F
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
W
 
W
S
 
S
D
 
-
D
 
-
D
 
-
Q
 
-
K
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
I
 
-
I
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
N
 
N
W
 
W
T
 
T
W
 
L
D
 
D
P
 
E
V
 
Q
A
 
A
G