SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_4066 FitnessBrowser__Putida:PP_4066 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
31% identity, 96% coverage: 3:262/271 of query aligns to 2:257/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
D
 
E
F
 
F
S
 
E
T
 
T
L
 
I
E
 
E
V
 
T
I
 
K
R
 
K
D
 
E
P
 
G
R
 
N
G
 
L
F
 
F
A
 
-
T
 
W
L
 
I
W
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
D
K
|
K
N
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
Q
 
K
M
 
L
I
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
L
I
 
D
V
 
R
A
 
A
I
 
V
D
 
S
Q
 
Q
L
 
A
A
 
E
E
 
S
D
 
D
A
 
P
S
 
E
L
 
I
R
 
R
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
R
 
K
G
 
G
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
A
 
T
W
 
-
M
 
-
Q
 
-
Q
 
Q
S
x
F
A
 
N
Q
 
Q
L
 
L
D
 
T
F
 
P
N
 
A
T
 
E
N
 
A
L
 
W
D
 
K
D
 
F
A
x
S
H
 
K
E
 
K
L
 
G
G
x
R
E
 
E
L
 
I
M
 
M
Y
 
D
A
 
K
L
 
I
H
 
E
R
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
L
G
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
L
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
I
A
 
R
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
C
 
G
L
 
L
S
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
N
I
 
L
G
 
G
L
x
I
A
 
Y
P
|
P
A
x
G
V
 
Y
-
 
G
I
 
G
S
 
T
P
 
Q
F
 
R
V
 
L
V
 
T
K
 
R
A
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
G
A
 
R
A
 
A
R
 
L
R
 
E
Y
 
M
A
 
M
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
D
R
|
R
F
 
I
T
 
P
G
 
G
V
 
K
R
 
D
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
R
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
N
L
 
L
D
 
E
D
 
Q
H
 
E
V
 
T
E
 
R
A
 
K
W
 
L
V
 
A
S
 
E
N
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
K
N
 
K
S
 
S
P
 
P
Q
 
I
A
 
S
L
 
L
R
 
A
A
 
L
T
 
I
K
 
K
D
 
E
L
 
V
L
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
V
D
 
N
D
 
R
G
 
G
E
 
L
L
 
D
S
 
S
P
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
S
R
 
G
Y
 
L
C
x
A
E
 
L
N
 
E
T
 
S
I
 
V
-
 
G
-
 
W
A
 
G
R
 
V
I
 
V
R
x
F
V
 
S
S
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
K
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
R
 
E
P
 
P
A
 
T
W
 
F
Q
 
K

6p5uE Structure of an enoyl-coa hydratase/aldolase isolated from a lignin- degrading consortium (see paper)
34% identity, 83% coverage: 1:226/271 of query aligns to 2:231/246 of 6p5uE

query
sites
6p5uE
M
 
L
S
 
N
D
 
G
F
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
V
E
 
K
V
 
V
I
 
Q
R
 
F
D
 
D
P
 
-
R
 
E
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
W
L
 
V
W
 
S
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
|
D
K
|
K
N
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
M
 
L
I
 
N
R
 
R
E
 
E
L
 
M
I
 
L
V
 
Q
A
 
V
I
 
L
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
F
D
 
D
A
 
D
S
 
R
L
 
C
R
 
G
F
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
E
G
 
G
R
 
D
H
 
S
F
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
|
L
A
 
K
W
 
-
M
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
E
F
x
Y
N
 
F
T
 
R
N
 
E
L
 
T
D
|
D
D
 
N
A
 
A
H
 
P
E
 
A
L
 
L
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
-
x
R
-
 
A
-
 
A
G
 
G
E
x
A
L
 
W
M
 
Q
Y
 
W
A
 
R
L
 
K
H
 
L
R
 
R
L
 
F
K
 
Y
A
 
A
-
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
F
G
x
T
L
 
P
I
 
L
S
 
I
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
T
L
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
I
x
W
G
 
G
L
x
I
A
 
I
P
|
P
A
|
A
-
 
G
V
 
N
I
 
V
S
 
T
P
 
K
F
 
A
V
 
V
V
 
S
K
 
Q
A
 
V
I
 
C
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
A
 
I
L
 
M
T
 
S
A
 
G
E
 
E
R
 
P
F
 
F
T
 
G
G
 
G
V
 
Q
R
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
E
V
 
S
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
A
L
 
L
D
 
R
D
 
E
H
 
R
V
 
T
E
 
R
A
 
E
W
 
L
V
 
A
S
 
K
N
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
G
N
 
K
S
 
N
P
 
P
Q
 
T
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
T
 
A
K
 
K
D
 
H
L
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
R
V
 
V
D
 
E
-
 
P
-
 
M
D
 
D
G
 
W
E
 
D
L
 
L
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Q8GYN9 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal; DHNS; Enoyl-CoA hydratase/isomerase D; ECHID; Naphthoate synthase; EC 4.1.3.36 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
28% identity, 93% coverage: 15:267/271 of query aligns to 86:336/337 of Q8GYN9

query
sites
Q8GYN9
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
E
K
 
R
N
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
Q
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
M
V
 
R
A
 
A
I
 
F
D
 
N
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
S
L
 
V
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
K
G
 
G
-
 
T
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
S
G
 
G
A
 
G
D
 
D
L
 
Q
A
 
A
W
 
L
M
 
R
Q
 
T
Q
 
Q
S
 
D
A
 
G
Q
 
Y
L
 
A
D
 
D
F
 
P
N
 
N
T
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
D
A
 
V
H
 
G
E
 
R
L
 
L
G
 
N
-
 
V
-
 
L
E
 
D
L
 
L
M
 
Q
Y
 
V
A
 
Q
L
 
I
H
 
R
R
 
R
L
 
L
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
H
G
 
I
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
V
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
 
T
E
 
G
V
 
P
R
 
K
I
 
V
G
 
G
-
 
S
L
 
F
A
 
D
P
 
A
A
 
G
V
 
Y
I
 
G
S
 
S
P
 
S
F
 
I
V
 
M
V
 
S
K
 
R
A
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
P
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
M
A
 
W
L
 
F
T
 
M
A
 
T
E
 
R
R
 
F
F
 
Y
T
 
T
G
 
A
V
 
S
R
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
I
A
 
N
E
 
T
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
E
E
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
K
H
 
E
V
 
T
E
 
V
A
 
K
W
 
W
V
 
C
S
 
R
N
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
R
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
R
A
 
V
T
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
-
S
 
-
P
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
R
 
G
Y
 
L
C
 
G
E
 
G
N
 
D
T
 
A
I
 
T
A
 
L
R
 
L
I
 
F
R
 
Y
V
 
G
S
 
T
A
 
E
E
 
E
G
 
A
Q
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
R
R
 
T
A
 
A
F
 
Y
L
 
M
E
 
H
K
 
R
R
 
R
R
 
P
P
 
P
A
 
D
W
 
F
Q
 
S
T
 
K
V
 
F
D
 
H
K
 
R
K
 
R

Sites not aligning to the query:

6l3pA Crystal strcuture of feruloyl-coa hydratase lyase(fchl) complexed with coa
33% identity, 74% coverage: 15:215/271 of query aligns to 17:215/244 of 6l3pA

query
sites
6l3pA
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
W
L
 
V
W
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
E
K
|
K
N
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
M
 
L
I
 
N
R
 
R
E
 
E
L
 
M
I
 
V
V
 
D
A
 
V
I
 
L
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
A
S
 
D
L
 
A
R
 
G
F
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
E
H
 
S
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
|
L
A
 
K
W
 
E
M
x
Y
Q
 
F
Q
 
R
S
 
E
A
 
E
Q
 
I
L
 
L
D
 
Q
F
 
E
N
 
K
T
 
I
N
 
R
L
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
H
x
R
E
 
E
L
 
A
G
 
S
E
x
Q
L
 
W
M
 
Q
Y
 
W
A
 
K
L
 
L
H
 
L
R
 
R
L
 
L
K
 
Y
A
 
A
-
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
 
W
A
 
C
F
 
F
G
|
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
C
A
 
A
E
 
N
D
 
E
A
 
A
Q
 
T
L
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
I
 
W
G
 
G
L
x
I
A
 
P
P
|
P
A
x
G
-
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
F
 
A
V
 
M
V
 
A
K
 
D
A
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
A
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
T
 
D
G
 
G
V
 
R
R
 
K
A
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
D
V
 
S
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
E
L
 
L
D
 
R
D
 
E
H
 
T
V
 
T
E
 
R
A
 
E
W
 
L
V
 
A
S
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
S
 
N
P
 
P
Q
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
A
K
 
K
D
 
N

Sites not aligning to the query:

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
27% identity, 98% coverage: 4:269/271 of query aligns to 22:285/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
F
 
Y
S
 
T
T
 
D
L
 
I
E
 
R
V
 
Y
I
 
E
R
 
K
D
 
S
P
 
T
R
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
V
N
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
L
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
Y
D
 
D
A
 
D
S
 
N
L
 
V
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
E
G
 
G
-
 
D
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
G
D
 
D
L
 
-
A
 
-
W
 
-
M
 
-
Q
 
-
Q
 
Q
S
 
K
A
 
V
Q
 
R
L
 
G
D
 
D
F
 
Y
N
 
G
T
 
G
N
 
Y
L
 
Q
D
 
D
D
 
D
A
 
S
-
 
G
-
 
V
H
 
H
E
 
H
L
 
L
G
 
N
E
 
V
L
 
L
M
 
D
Y
 
F
A
 
Q
-
 
R
-
 
Q
L
 
I
H
 
R
R
 
T
L
 
C
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
F
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
H
G
 
V
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
x
Q
S
x
T
E
x
G
V
 
P
R
 
K
I
 
V
G
 
G
-
 
S
L
 
F
A
 
D
P
 
G
A
 
G
V
 
W
I
 
G
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
A
K
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
I
A
 
W
L
 
F
T
 
L
A
 
C
E
 
R
R
 
Q
F
 
Y
T
 
D
G
 
A
V
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
T
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
K
H
 
E
V
 
T
E
 
V
A
 
R
W
 
W
V
 
C
S
 
R
N
 
E
L
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
T
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
A
V
 
D
D
 
C
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
-
S
 
-
P
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
R
 
E
Y
 
L
C
 
A
E
 
G
N
 
N
T
 
A
I
 
T
A
 
M
R
 
L
I
 
F
R
 
Y
V
 
M
S
 
T
A
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
R
R
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
A
 
D
W
 
F
Q
 
S
T
 
K
V
 
F
D
 
-
K
 
K
K
 
R
E
 
N
P
 
P

2vssB Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
32% identity, 74% coverage: 15:214/271 of query aligns to 15:217/247 of 2vssB

query
sites
2vssB
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
F
L
 
V
W
 
I
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
x
E
K
|
K
N
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
M
 
L
I
 
N
R
 
R
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
D
A
 
V
I
 
L
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
P
S
 
A
L
 
A
R
 
G
F
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
E
H
 
A
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
 
L
A
 
K
W
 
-
M
 
-
Q
 
E
Q
x
Y
S
 
F
A
 
R
Q
 
E
L
 
V
D
|
D
F
 
A
N
 
G
T
 
P
N
 
E
L
 
I
D
 
L
D
 
Q
A
 
E
H
 
K
-
 
I
-
 
R
-
x
R
E
 
E
L
 
A
G
 
S
E
x
Q
L
 
W
M
 
Q
Y
 
W
A
 
K
L
 
L
H
 
L
R
 
R
L
 
M
K
 
Y
A
 
A
-
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
C
A
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
T
L
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
I
 
W
G
 
G
L
x
I
A
 
P
P
|
P
A
x
G
-
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
F
 
A
V
 
M
V
 
A
K
 
D
A
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
A
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
T
 
G
G
 
G
V
 
Q
R
 
K
A
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
E
V
 
S
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
R
D
 
E
H
 
V
V
 
T
E
 
I
A
 
E
W
 
L
V
 
A
S
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
S
 
N
P
 
P
Q
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2vssD Wild-type hydroxycinnamoyl-coa hydratase lyase in complex with acetyl- coa and vanillin (see paper)
32% identity, 74% coverage: 15:214/271 of query aligns to 16:218/246 of 2vssD

query
sites
2vssD
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
F
L
 
V
W
 
I
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
x
E
K
|
K
N
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
M
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
M
 
L
I
 
N
R
 
R
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
D
A
 
V
I
 
L
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
P
S
 
A
L
 
A
R
 
G
F
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
E
H
 
A
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
|
D
L
|
L
A
 
K
W
 
-
M
 
-
Q
 
E
Q
x
Y
S
x
F
A
 
R
Q
 
E
L
 
V
D
|
D
F
 
A
N
 
G
T
 
P
N
 
E
L
 
I
D
 
L
D
 
Q
A
 
E
H
 
K
-
 
I
-
 
R
-
x
R
E
 
E
L
 
A
G
 
S
E
x
Q
L
 
W
M
x
Q
Y
 
W
A
 
K
L
 
L
H
 
L
R
 
R
L
 
M
K
 
Y
A
 
A
-
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
x
W
A
 
C
F
|
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
C
A
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
T
L
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
I
 
W
G
 
G
L
x
I
A
 
P
P
|
P
A
x
G
-
x
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
F
 
A
V
 
M
V
 
A
K
 
D
A
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
A
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
T
 
G
G
 
G
V
 
Q
R
 
K
A
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
E
V
 
S
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
R
D
 
E
H
 
V
V
 
T
E
 
I
A
 
E
W
 
L
V
 
A
S
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
S
 
N
P
 
P
Q
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

O69762 Hydroxycinnamoyl-CoA hydratase-lyase; HCHL; P-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase; Trans-feruloyl-CoA hydratase/vanillin synthase; EC 4.1.2.61 from Pseudomonas fluorescens (see 2 papers)
32% identity, 74% coverage: 15:214/271 of query aligns to 18:220/276 of O69762

query
sites
O69762
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
F
L
 
V
W
 
I
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
E
K
|
K
N
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
M
N
 
S
A
 
P
Q
 
T
M
 
L
I
 
N
R
 
R
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
D
A
 
V
I
 
L
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
A
 
E
E
 
Q
D
 
D
A
 
P
S
 
A
L
 
A
R
 
G
F
 
V
V
 
L
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
R
 
E
H
 
A
F
 
W
S
 
T
A
|
A
G
 
G
A
x
M
D
 
D
L
|
L
A
 
K
W
 
-
M
 
-
Q
 
E
Q
x
Y
S
 
F
A
 
R
Q
 
E
L
 
V
D
 
D
F
 
A
N
 
G
T
 
P
N
 
E
L
 
I
D
 
L
D
 
Q
A
 
E
H
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
R
E
 
E
L
 
A
G
 
S
E
 
Q
L
 
W
M
 
Q
Y
 
W
A
 
K
L
 
L
H
 
L
R
 
R
L
 
M
K
 
Y
A
 
A
-
 
K
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
A
 
W
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
F
G
x
S
L
 
P
I
 
L
S
 
V
C
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
C
A
 
A
E
 
D
D
 
E
A
 
A
Q
 
T
L
 
F
C
 
G
L
 
L
S
|
S
E
|
E
V
 
I
R
 
N
I
x
W
G
 
G
L
 
I
A
 
P
P
 
P
A
x
G
-
 
N
V
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
K
F
 
A
V
 
M
V
 
A
K
 
D
A
 
T
I
 
V
G
 
G
E
 
H
R
 
R
A
 
Q
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
Y
 
Y
A
 
I
L
 
M
T
 
T
A
 
G
E
 
K
R
 
T
F
 
F
T
 
G
G
 
G
V
 
Q
R
 
K
A
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
E
V
 
S
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
Q
L
 
L
D
 
R
D
 
E
H
 
V
V
 
T
E
 
I
A
 
E
W
 
L
V
 
A
S
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
S
 
N
P
 
P
Q
 
V
A
 
V
L
 
L
R
 
R
A
 
A
T
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4i42A E.Coli. 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase (ecmenb) in complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
27% identity, 98% coverage: 4:269/271 of query aligns to 22:285/285 of 4i42A

query
sites
4i42A
F
 
F
S
 
E
T
 
D
L
 
I
E
 
R
V
 
Y
I
 
E
R
 
K
D
 
S
P
 
T
R
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
x
V
N
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
L
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
Y
D
 
D
A
 
D
S
 
N
L
 
I
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
-
 
D
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
L
 
-
A
 
-
W
 
-
M
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
S
x
K
A
 
V
Q
x
R
L
 
G
D
 
D
F
 
Y
N
 
G
T
 
G
N
x
Y
L
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
S
-
 
G
-
 
V
H
 
H
E
x
H
L
 
L
G
 
N
E
x
V
L
|
L
M
 
D
Y
 
F
A
 
Q
-
 
R
-
 
Q
L
 
I
H
 
R
R
 
T
L
 
C
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
S
F
 
I
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
H
G
x
V
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
T
E
x
G
V
 
P
R
 
K
I
 
V
G
 
G
-
x
S
L
 
F
A
x
D
P
x
G
A
 
G
V
 
W
I
 
G
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
A
K
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
I
A
 
W
L
 
F
T
 
L
A
 
C
E
 
R
R
 
Q
F
 
Y
T
 
D
G
 
A
V
 
K
R
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
T
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
K
H
 
E
V
 
T
E
 
V
A
 
R
W
 
W
V
 
C
S
 
R
N
 
E
L
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
T
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
A
V
 
D
D
 
C
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
-
S
 
-
P
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
R
 
E
Y
 
L
C
x
A
E
 
G
N
 
N
T
 
A
I
x
T
A
 
M
R
 
L
I
 
F
R
x
Y
V
 
M
S
 
T
A
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
R
R
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
A
 
D
W
 
F
Q
 
S
T
 
K
V
 
F
D
 
-
K
 
K
K
 
R
E
 
N
P
 
P

P0ABU0 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
27% identity, 98% coverage: 4:269/271 of query aligns to 22:285/285 of P0ABU0

query
sites
P0ABU0
F
 
F
S
 
E
T
 
D
L
 
I
E
 
R
V
 
Y
I
 
E
R
 
K
D
 
S
P
 
T
R
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
V
N
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
L
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
Y
D
 
D
A
 
D
S
 
N
L
 
I
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
-
 
D
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
L
 
-
A
 
-
W
 
-
M
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
S
x
K
A
 
V
Q
x
R
L
 
G
D
 
D
F
 
Y
N
 
G
T
 
G
N
x
Y
L
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
S
-
 
G
-
 
V
H
 
H
E
 
H
L
 
L
G
 
N
E
 
V
L
 
L
M
 
D
Y
 
F
A
 
Q
-
 
R
-
 
Q
L
 
I
H
 
R
R
 
T
L
 
C
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
x
S
F
x
I
G
|
G
G
|
G
A
 
G
L
 
H
G
 
V
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
x
Q
S
x
T
E
x
G
V
 
P
R
 
K
I
 
V
G
 
G
-
x
S
L
 
F
A
 
D
P
 
G
A
 
G
V
 
W
I
 
G
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
A
K
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
I
A
x
W
L
 
F
T
 
L
A
 
C
E
 
R
R
 
Q
F
 
Y
T
 
D
G
 
A
V
 
K
R
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
T
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
K
H
 
E
V
 
T
E
 
V
A
 
R
W
 
W
V
 
C
S
 
R
N
 
E
L
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
T
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
A
V
 
D
D
 
C
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
-
S
 
-
P
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
R
 
E
Y
 
L
C
 
A
E
 
G
N
 
N
T
 
A
I
 
T
A
 
M
R
 
L
I
 
F
R
x
Y
V
 
M
S
 
T
A
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
x
R
R
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
A
 
D
W
 
F
Q
 
S
T
 
K
V
 
F
D
 
-
K
 
K
K
 
R
E
 
N
P
 
P

3t88A Crystal structure of escherichia coli menb in complex with substrate analogue, osb-ncoa (see paper)
27% identity, 98% coverage: 4:269/271 of query aligns to 18:281/281 of 3t88A

query
sites
3t88A
F
 
F
S
 
E
T
 
D
L
 
I
E
 
R
V
 
Y
I
 
E
R
 
K
D
 
S
P
 
T
R
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
x
Q
K
x
V
N
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
L
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
Y
D
 
D
A
 
D
S
 
N
L
 
I
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
-
 
D
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
L
 
-
A
 
-
W
 
-
M
 
-
Q
 
-
Q
|
Q
S
x
K
A
 
V
Q
x
R
L
 
G
D
 
D
F
 
Y
N
 
G
T
 
G
N
x
Y
L
 
K
D
 
D
D
 
D
A
 
S
-
 
G
-
 
V
H
 
H
E
x
H
L
 
L
G
 
N
E
x
V
L
|
L
M
 
D
Y
 
F
A
 
Q
-
 
R
-
 
Q
L
 
I
H
 
R
R
 
T
L
 
C
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
S
F
 
I
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
H
G
x
V
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
T
E
x
G
V
 
P
R
 
K
I
x
V
G
 
G
-
x
S
L
x
F
A
x
D
P
x
G
A
 
G
V
 
W
I
 
G
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
A
K
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
I
A
 
W
L
 
F
T
 
L
A
 
C
E
 
R
R
 
Q
F
 
Y
T
 
D
G
 
A
V
 
K
R
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
T
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
K
H
 
E
V
 
T
E
 
V
A
 
R
W
 
W
V
 
C
S
 
R
N
 
E
L
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
T
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
A
V
 
D
D
 
C
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
-
S
 
-
P
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
R
 
E
Y
 
L
C
x
A
E
 
G
N
 
N
T
 
A
I
x
T
A
 
M
R
 
L
I
 
F
R
x
Y
V
 
M
S
 
T
A
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
R
R
 
N
A
 
A
F
|
F
L
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
A
 
D
W
 
F
Q
 
S
T
 
K
V
 
F
D
 
-
K
 
K
K
 
R
E
 
N
P
 
P

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
29% identity, 95% coverage: 4:261/271 of query aligns to 2:253/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
F
 
Y
S
 
E
T
 
T
L
 
I
E
 
L
V
 
V
I
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
-
F
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
W
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
A
N
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
E
 
E
L
 
V
I
 
T
V
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
D
E
 
D
D
 
D
A
 
P
S
 
D
L
 
I
R
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
W
 
E
M
|
M
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
T
F
 
F
N
 
A
T
 
D
N
 
A
L
 
F
D
 
-
D
 
-
A
x
T
H
 
A
E
 
D
L
 
F
G
x
F
E
 
A
L
 
T
M
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
H
 
A
R
 
A
L
 
V
K
 
R
A
 
T
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
A
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
T
A
 
A
Q
 
K
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
P
|
P
A
x
G
V
 
M
-
 
G
I
 
G
S
 
S
P
 
Q
F
 
R
V
 
L
V
 
T
K
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
M
R
 
D
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
R
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
S
E
 
R
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
D
 
T
H
 
E
V
 
A
E
 
R
A
 
A
W
 
T
V
 
A
S
 
T
N
 
T
L
 
I
L
 
S
Q
 
Q
N
 
M
S
 
S
P
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
T
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
N
E
 
R
V
 
A
D
 
F
D
 
E
G
 
S
E
 
S
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
G
L
 
L
-
x
L
-
 
Y
-
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
L
C
 
F
E
 
H
N
 
S
T
 
A
I
x
F
A
 
A
R
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
T
A
 
E
E
 
D
G
x
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
A
 
Q
W
 
F

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
29% identity, 95% coverage: 4:261/271 of query aligns to 3:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
F
 
Y
S
 
E
T
 
T
L
 
I
E
 
L
V
 
V
I
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
-
F
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
W
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
x
Q
K
x
A
N
x
L
N
 
N
A
|
A
F
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
E
 
E
L
 
V
I
 
T
V
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
D
E
 
D
D
 
D
A
 
P
S
 
D
L
 
I
R
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
L
x
I
A
x
K
W
 
E
M
|
M
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
T
F
 
F
N
 
A
T
 
D
N
 
A
L
 
F
D
 
-
D
 
-
A
x
T
H
 
A
E
 
D
L
 
F
G
x
F
E
 
A
L
 
T
M
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
H
 
A
R
 
A
L
 
V
K
 
R
A
 
T
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
|
G
G
|
G
A
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
A
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
T
A
 
A
Q
 
K
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
P
|
P
A
x
G
V
x
M
-
 
G
I
 
G
S
 
S
P
 
Q
F
 
R
V
 
L
V
 
T
K
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
M
R
 
D
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
R
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
S
E
 
R
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
D
 
T
H
 
E
V
 
A
E
 
R
A
 
A
W
 
T
V
 
A
S
 
T
N
 
T
L
 
I
L
 
S
Q
 
Q
N
 
M
S
 
S
P
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
T
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
N
E
 
R
V
 
A
D
 
F
D
 
E
G
 
S
E
 
S
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
G
L
 
L
-
x
L
-
 
Y
-
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
L
C
 
F
E
 
H
N
 
S
T
 
A
I
x
F
A
 
A
R
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
A
 
Q
W
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 95% coverage: 4:261/271 of query aligns to 3:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
F
 
Y
S
 
E
T
 
T
L
 
I
E
 
L
V
 
V
I
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
-
F
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
W
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
A
N
x
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
E
 
E
L
 
V
I
 
T
V
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
D
E
 
D
D
 
D
A
 
P
S
 
D
L
 
I
R
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
L
x
I
A
x
K
W
 
E
M
|
M
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
T
F
 
F
N
 
A
T
 
D
N
 
A
L
 
F
D
 
-
D
 
-
A
x
T
H
 
A
E
 
D
L
 
F
G
x
F
E
 
A
L
 
T
M
 
W
Y
 
G
A
 
K
L
 
L
H
 
A
R
 
A
L
 
V
K
 
R
A
 
T
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
x
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
A
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
T
A
 
A
Q
 
K
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
I
x
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
P
|
P
A
x
G
V
 
M
-
 
G
I
 
G
S
 
S
P
 
Q
F
 
R
V
 
L
V
 
T
K
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
M
R
 
D
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
R
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
S
E
 
R
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
D
 
T
H
 
E
V
 
A
E
 
R
A
 
A
W
 
T
V
 
A
S
 
T
N
 
T
L
 
I
L
 
S
Q
 
Q
N
 
M
S
 
S
P
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
T
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
N
E
 
R
V
 
A
D
 
F
D
 
E
G
 
S
E
 
S
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
G
L
 
L
-
x
L
-
 
Y
-
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
L
C
 
F
E
 
H
N
 
S
T
 
A
I
x
F
A
 
A
R
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
A
 
Q
W
 
F

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
29% identity, 95% coverage: 4:261/271 of query aligns to 2:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
F
 
Y
S
 
E
T
 
T
L
 
I
E
 
L
V
 
V
I
 
E
R
 
R
D
 
D
P
 
Q
R
 
R
G
 
-
F
 
V
A
 
G
T
 
I
L
 
I
W
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
A
N
 
L
N
 
N
A
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
E
 
E
L
 
V
I
 
T
V
 
S
A
 
A
I
 
A
D
 
T
Q
 
E
L
 
L
A
 
D
E
 
D
D
 
D
A
 
P
S
 
D
L
 
I
R
 
G
F
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
L
 
I
A
 
K
W
 
E
M
|
M
Q
 
F
Q
 
A
S
 
D
A
 
A
-
 
F
Q
x
T
L
 
A
D
 
D
F
 
F
N
x
F
T
 
A
N
 
T
L
 
W
D
 
G
D
 
K
A
 
-
H
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
L
H
 
A
R
 
A
L
 
V
K
 
R
A
 
T
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
I
 
A
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
A
 
L
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
T
A
 
A
Q
 
K
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
P
E
|
E
V
 
I
R
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
A
 
L
P
|
P
A
x
G
V
 
M
-
 
G
I
 
G
S
 
S
P
 
Q
F
 
R
V
 
L
V
 
T
K
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
K
R
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
M
R
 
D
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
T
 
T
A
 
G
E
 
R
R
 
T
F
 
M
T
 
D
G
 
A
V
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
R
L
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
S
E
 
R
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
L
D
 
T
H
 
E
V
 
A
E
 
R
A
 
A
W
 
T
V
 
A
S
 
T
N
 
T
L
 
I
L
 
S
Q
 
Q
N
 
M
S
 
S
P
 
A
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
R
A
 
M
T
 
A
K
 
K
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
N
E
 
R
V
 
A
D
 
F
D
 
E
G
 
S
E
 
S
L
 
L
S
 
S
P
 
E
A
 
G
L
 
L
-
x
L
-
 
Y
-
 
E
R
 
R
R
 
R
Y
 
L
C
x
F
E
 
H
N
 
S
T
 
A
I
x
F
A
 
A
R
 
-
I
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
T
A
 
E
E
 
D
G
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
R
 
A
P
 
P
A
 
Q
W
 
F

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
26% identity, 98% coverage: 4:269/271 of query aligns to 18:266/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
F
 
Y
S
 
T
T
 
D
L
 
I
E
 
R
V
 
Y
I
 
E
R
 
K
D
 
S
P
 
T
R
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
V
N
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
L
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
Y
D
 
D
A
 
D
S
 
N
L
 
V
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
E
G
 
G
-
 
D
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
G
A
x
G
D
 
D
L
 
-
A
 
-
W
 
-
M
 
Q
Q
 
H
Q
x
H
S
 
L
A
 
N
Q
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
N
 
Q
T
 
R
N
 
Q
L
 
I
D
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
R
R
 
T
L
 
C
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
F
 
I
G
|
G
G
|
G
A
 
G
L
 
H
G
x
V
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
E
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
x
Q
S
 
T
E
x
G
V
 
P
R
 
K
I
 
V
G
 
G
-
x
S
L
 
F
A
x
D
P
x
G
A
 
G
V
 
W
I
 
G
S
 
A
P
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
A
K
 
R
A
 
I
I
 
V
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
A
 
K
A
 
A
R
 
R
R
 
E
Y
 
I
A
x
W
L
 
F
T
 
L
A
 
C
E
 
R
R
 
Q
F
 
Y
T
 
D
G
 
A
V
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
L
E
 
D
L
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
N
E
 
T
V
 
V
Y
 
V
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
D
L
 
L
D
 
E
D
 
K
H
 
E
V
 
T
E
 
V
A
 
R
W
 
W
V
 
C
S
 
R
N
 
E
L
 
M
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
M
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
C
T
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
N
E
 
A
V
 
D
D
 
C
D
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
-
S
 
-
P
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
Q
R
 
E
Y
 
L
C
x
A
E
 
G
N
 
N
T
 
A
I
 
T
A
 
M
R
 
L
I
 
F
R
x
Y
V
 
M
S
 
T
A
 
E
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
R
R
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
R
 
Q
P
 
P
A
 
D
W
 
F
Q
 
S
T
 
K
V
 
F
D
 
-
K
 
K
K
 
R
E
 
N
P
 
P

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
26% identity, 98% coverage: 4:269/271 of query aligns to 19:267/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
F
 
F
S
 
E
T
 
D
L
 
I
E
 
R
V
 
Y
I
 
E
R
 
K
D
 
S
P
 
T
R
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
T
L
 
I
S
 
N
R
 
R
E
 
P
D
 
Q
K
 
V
N
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
N
 
R
A
 
P
Q
 
L
M
 
T
I
 
V
R
 
K
E
 
E
L
 
M
I
 
I
V
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
A
A
 
R
E
 
Y
D
 
D
A
 
D
S
 
N
L
 
I
R
 
G
F
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
R
 
A
G
 
G
-
 
D
R
 
K
H
 
A
F
 
F
S
 
C
A
 
S
G
 
G
A
x
G
D
 
D
L
 
-
A
 
-
W
 
-
M
 
Q
Q
 
K
Q
 
H
S
 
L
A
 
N
Q
 
V
L
|
L
D
 
D
F
 
F
N
 
Q
T
 
R
N
 
Q
L
 
I
D
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
M
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
R
R
 
T
L
 
C
K
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
A
 
S
F
 
I
G
|
G
G
|
G
A
 
G
L
 
H
G
x
V
L
 
L
I
 
H
S
 
M
C
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
A
A
 
A
E
 
D
D
 
N
A
 
A
Q
 
I
L
 
F
C
 
G
L
 
Q
S
x
T
E
x