SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_4490 FitnessBrowser__Putida:PP_4490 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2v27B Structure of the cold active phenylalanine hydroxylase from colwellia psychrerythraea 34h (see paper)
57% identity, 99% coverage: 4:262/262 of query aligns to 2:264/272 of 2v27B

query
sites
2v27B
T
 
T
Q
 
K
Y
 
Y
V
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
E
H
 
H
G
 
G
F
 
F
I
 
I
D
 
E
Y
 
W
P
 
S
Q
 
T
Q
 
E
E
 
E
H
 
N
A
 
L
V
 
I
W
 
W
N
 
Q
T
 
E
L
 
L
I
 
F
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
K
 
A
V
 
C
I
 
I
E
 
K
G
 
D
R
 
K
A
 
A
C
 
C
Q
 
D
E
 
E
Y
 
Y
L
 
H
D
 
E
G
 
G
I
 
L
D
 
A
Q
 
K
L
 
L
K
 
N
L
 
L
P
 
P
H
 
T
D
 
D
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
D
E
 
E
I
 
V
N
 
S
K
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
K
A
 
V
T
 
S
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
E
V
 
C
A
 
Y
R
 
P
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
I
P
 
G
F
 
F
Q
 
G
T
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
K
 
K
R
 
K
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
T
F
 
F
I
 
I
R
 
R
T
 
S
P
 
R
E
 
E
E
 
E
L
 
M
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
I
F
 
F
H
|
H
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
H
|
H
C
 
C
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
N
P
 
S
W
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
N
F
 
Y
T
 
T
H
 
E
T
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
N
A
 
A
T
 
T
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
I
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
L
E
 
D
T
 
T
A
 
P
Q
 
K
G
 
G
R
 
L
K
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
V
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
P
K
 
G
E
 
E
T
 
T
V
 
D
Y
 
Y
S
 
A
L
 
M
S
 
N
D
 
N
-
 
T
E
 
D
P
 
V
E
 
D
H
 
R
Q
 
K
A
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
I
I
 
L
E
 
D
A
 
V
M
 
L
R
 
R
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
M
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
M
L
 
L
P
 
T
N
 
K
M
 
V
K
 
S
R
 
D
L
 
L
F
 
D
D
 
E
L
 
I
A
 
R
H
 
K
-
 
F
-
 
E
-
 
V
E
 
D
D
 
D
I
 
I
M
 
M
G
 
E
M
 
L
V
 
V
H
 
A
K
 
Q
A
 
A
M
 
E
Q
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
L
H
 
H
A
 
E
P
 
A
K
 
K
F
 
F
P
 
P
P
 
V
K
 
K
V
 
K
A
 
A
A
 
S

4etlA Crystallographic structure of phenylalanine hydroxylase from chromobacterium violaceum f258a mutation (see paper)
50% identity, 84% coverage: 19:238/262 of query aligns to 30:251/277 of 4etlA

query
sites
4etlA
Y
 
Y
P
 
S
Q
 
A
Q
 
E
E
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
Y
T
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
C
K
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
C
Q
 
D
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
L
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
K
 
E
L
 
V
P
 
D
H
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
F
G
 
N
E
 
K
I
 
L
N
 
N
K
 
E
V
 
K
L
 
L
G
 
M
A
 
A
T
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
A
 
V
R
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
D
Q
 
D
T
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
H
L
 
L
A
 
A
S
 
N
K
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
T
T
 
W
F
 
W
I
 
L
R
 
R
T
 
E
P
 
P
E
 
H
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
F
H
|
H
E
 
D
I
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
I
N
 
N
P
 
P
W
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
H
 
E
T
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
K
A
 
A
T
 
K
K
 
A
E
 
L
Q
 
G
R
 
A
V
 
L
-
 
P
Y
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
Y
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
N
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
M
K
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
K
K
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
-
 
D
S
 
S
D
 
A
E
 
S
P
 
P
E
 
N
H
 
R
Q
 
V
A
 
G
F
 
F
D
 
D
P
 
L
I
 
M
E
 
R
A
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
P
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
L
 
I
P
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
A
A
 
T
H
 
A
E
 
P
D
 
D

3tcyA Crystallographic structure of phenylalanine hydroxylase from chromobacterium violaceum (cpah) bound to phenylalanine in a site distal to the active site (see paper)
50% identity, 84% coverage: 19:238/262 of query aligns to 30:251/277 of 3tcyA

query
sites
3tcyA
Y
 
Y
P
 
S
Q
 
A
Q
 
E
E
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
Y
T
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
C
K
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
C
Q
 
D
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
L
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
K
 
E
L
 
V
P
 
D
H
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
F
G
 
N
E
 
K
I
 
L
N
 
N
K
 
E
V
 
K
L
 
L
G
 
M
A
 
A
T
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
A
 
V
R
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
D
Q
 
D
T
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
H
L
 
L
A
 
A
S
 
N
K
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
T
T
 
W
F
 
W
I
 
L
R
 
R
T
 
E
P
 
P
E
 
H
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
F
H
|
H
E
 
D
I
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
I
N
 
N
P
 
P
W
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
H
 
E
T
x
A
Y
|
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
G
G
 
G
L
 
V
A
x
K
A
 
A
T
 
K
K
 
A
E
 
L
Q
 
G
R
 
A
V
 
L
-
 
P
Y
 
M
L
|
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
Y
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
N
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
M
K
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
K
K
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
-
 
D
S
 
S
D
 
A
E
 
S
P
 
P
E
 
N
H
 
R
Q
 
V
A
 
G
F
 
F
D
 
D
P
 
L
I
 
M
E
 
R
A
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
P
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
L
 
I
P
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
A
A
x
T
H
 
A
E
x
P
D
|
D

Sites not aligning to the query:

1ltvA Crystal structure of chromobacterium violaceum phenylalanine hydroxylase, structure with bound oxidized fe(iii) (see paper)
50% identity, 84% coverage: 19:238/262 of query aligns to 28:249/275 of 1ltvA

query
sites
1ltvA
Y
 
Y
P
 
S
Q
 
A
Q
 
E
E
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
Y
T
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
C
K
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
C
Q
 
D
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
L
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
K
 
E
L
 
V
P
 
D
H
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
F
G
 
N
E
 
K
I
 
L
N
 
N
K
 
E
V
 
K
L
 
L
G
 
M
A
 
A
T
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
A
 
V
R
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
F
 
D
Q
 
D
T
 
V
F
 
F
F
 
F
E
 
E
L
 
H
L
 
L
A
 
A
S
 
N
K
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
T
T
 
W
F
 
W
I
 
L
R
 
R
T
 
E
P
 
P
E
 
H
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
F
H
|
H
E
 
D
I
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
I
N
 
N
P
 
P
W
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
H
 
E
T
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
K
A
 
A
T
 
K
K
 
A
E
 
L
Q
 
G
R
 
A
V
 
L
-
 
P
Y
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
Y
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
N
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
M
K
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
K
K
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
-
 
D
S
 
S
D
 
A
E
 
S
P
 
P
E
 
N
H
 
R
Q
 
V
A
 
G
F
 
F
D
 
D
P
 
L
I
 
M
E
 
R
A
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
P
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
L
 
I
P
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D
L
 
A
A
 
T
H
 
A
E
 
P
D
 
D

1ltzA Crystal structure of chromobacterium violaceum phenylalanine hydroxylase, structure has bound iron (iii) and oxidized cofactor 7, 8-dihydrobiopterin (see paper)
50% identity, 82% coverage: 19:233/262 of query aligns to 30:246/274 of 1ltzA

query
sites
1ltzA
Y
 
Y
P
 
S
Q
 
A
Q
 
E
E
 
D
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
A
T
 
T
L
 
L
I
 
Y
T
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
C
K
 
K
V
 
L
I
 
L
E
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
C
 
C
Q
 
D
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
L
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
K
 
E
L
 
V
P
 
D
H
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Q
 
D
L
 
F
G
 
N
E
 
K
I
 
L
N
 
N
K
 
E
V
 
K
L
 
L
G
 
M
A
 
A
T
 
A
T
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
V
 
I
A
 
V
R
 
A
V
 
V
P
 
P
A
 
G
L
 
L
I
|
I
P
 
P
F
x
D
Q
 
D
T
 
V
F
|
F
F
 
F
E
 
E
L
 
H
L
 
L
A
 
A
S
 
N
K
 
R
R
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
T
T
 
W
F
 
W
I
 
L
R
 
R
T
 
E
P
 
P
E
 
H
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
V
F
 
F
H
|
H
E
 
D
I
 
L
F
 
F
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
I
N
 
N
P
 
P
W
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
T
 
L
H
 
E
T
 
A
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
L
 
G
G
 
G
L
 
V
A
 
K
A
 
A
T
 
K
K
 
A
E
 
L
Q
 
G
R
 
A
V
 
L
-
 
P
Y
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
L
Y
|
Y
W
 
W
M
 
Y
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
I
E
 
N
T
 
T
A
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
M
K
 
R
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
K
K
 
S
E
 
E
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
S
 
C
L
 
L
-
 
D
S
 
S
D
 
A
E
 
S
P
 
P
E
 
N
H
 
R
Q
 
V
A
 
G
F
 
F
D
 
D
P
 
L
I
 
M
E
 
R
A
 
I
M
 
M
R
 
N
T
 
T
P
 
R
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
K
V
 
T
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V
L
 
I
P
 
D
N
 
S
M
 
F
K
 
K
R
 
Q
L
 
L
F
 
F
D
 
D

P04177 Tyrosine 3-monooxygenase; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Rattus norvegicus (Rat) (see 7 papers)
37% identity, 84% coverage: 5:224/262 of query aligns to 213:434/498 of P04177

query
sites
P04177
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
A
 
H
R
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
I
A
 
P
H
 
H
G
 
-
F
 
-
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
V
R
 
T
Q
 
L
L
 
K
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
A
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
F
D
 
Q
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
S
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
P
 
S
F
 
A
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
x
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
x
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
 
I
V
 
E
Y
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
V
Y
 
Y
W
|
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
N
Q
 
G
G
 
E
R
 
L
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
Y
K
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
V
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
D
E
 
T
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
x
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2tohA Tyrosine hydroxylase catalytic and tetramerization domains from rat (see paper)
37% identity, 84% coverage: 5:224/262 of query aligns to 51:272/336 of 2tohA

query
sites
2tohA
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
A
 
H
R
 
G
E
 
E
P
 
P
D
 
I
A
 
P
H
 
H
G
 
-
F
 
-
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
V
R
 
T
Q
 
L
L
 
K
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
A
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
G
I
 
F
D
 
Q
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
S
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
R
R
 
P
V
|
V
P
 
A
A
 
G
L
|
L
I
x
L
P
 
S
F
 
A
Q
 
R
T
 
D
F
x
Y
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
|
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
 
I
V
 
E
Y
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
V
Y
|
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
N
Q
 
G
G
 
E
R
 
L
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
Y
K
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
V
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
D
E
 
T
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

P17289 Tyrosine 3-monooxygenase; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Bos taurus (Bovine) (see 2 papers)
36% identity, 84% coverage: 5:224/262 of query aligns to 206:427/491 of P17289

query
sites
P17289
Q
 
Q
Y
 
Y
V
 
K
A
 
Q
R
 
G
E
 
D
P
 
P
D
 
I
A
 
P
H
 
H
G
 
-
F
 
-
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
H
 
T
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
S
R
 
T
Q
 
L
L
 
R
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
P
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
A
I
 
F
D
 
E
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
R
R
 
P
V
 
A
P
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
P
 
S
F
 
A
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
E
I
 
C
F
 
C
H
 
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
V
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
 
I
V
 
E
Y
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
N
Q
 
G
G
 
E
R
 
V
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
Y
K
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
I
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
D
E
 
A
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P90986 Tyrosine 3-monooxygenase; Abnormal catecholamine distribution protein 2; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Caenorhabditis elegans (see 4 papers)
32% identity, 83% coverage: 12:228/262 of query aligns to 234:454/519 of P90986

query
sites
P90986
D
 
D
A
 
E
H
 
I
G
 
G
F
 
Y
I
 
V
D
 
D
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
H
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
A
L
 
V
I
 
Y
T
 
E
R
 
K
Q
 
L
L
 
G
K
 
D
V
 
L
I
 
H
E
 
L
G
 
S
R
 
H
A
 
T
C
 
C
Q
 
A
E
 
V
Y
 
Y
L
 
R
D
 
Q
G
 
N
I
 
L
D
 
K
Q
 
I
L
 
L
K
x
Q
-
x
E
-
x
E
-
x
K
-
x
V
L
|
L
P
x
T
H
x
A
D
|
D
R
|
R
I
|
I
P
|
P
Q
|
Q
L
x
I
G
x
R
E
x
D
I
x
V
N
|
N
K
|
K
V
x
F
L
|
L
G
x
Q
A
x
K
T
x
K
T
|
T
G
|
G
W
x
F
Q
x
E
V
x
L
A
x
R
R
x
P
V
x
C
P
x
S
A
x
G
L
|
L
I
x
L
P
x
S
F
x
A
Q
x
R
T
x
D
F
|
F
F
x
L
E
x
A
L
x
S
L
|
L
A
|
A
S
x
F
K
x
R
R
x
V
F
|
F
P
x
Q
V
x
T
A
x
T
T
|
T
F
x
Y
I
x
L
R
|
R
T
x
H
P
x
H
E
x
K
E
x
S
L
x
P
D
x
H
Y
x
H
L
x
S
Q
x
P
E
|
E
P
|
P
D
|
D
I
x
L
F
x
I
H
|
H
E
|
E
I
x
L
F
x
L
G
|
G
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
x
M
L
x
F
T
x
S
N
x
D
P
|
P
W
x
L
F
x
L
A
|
A
E
x
Q
F
x
M
T
x
S
H
x
Q
T
x
D
Y
x
I
G
|
G
K
x
L
L
x
M
G
x
S
L
|
L
A
x
G
A
|
A
T
x
S
K
x
D
E
|
E
Q
x
H
R
x
I
V
x
E
Y
x
K
L
|
L
A
x
S
R
x
T
L
x
V
Y
|
Y
W
|
W
M
x
F
T
x
I
I
x
V
E
|
E
F
|
F
G
|
G
L
|
L
M
x
C
E
x
K
T
x
E
A
x
D
Q
x
G
G
x
K
R
x
L
K
|
K
I
x
A
Y
x
I
G
|
G
G
x
A
G
|
G
I
x
L
L
|
L
S
|
S
S
x
A
P
x
Y
K
x
G
E
|
E
T
x
L
V
x
M
Y
x
H
S
x
A
L
x
C
S
|
S
D
|
D
E
x
A
P
|
P
E
|
E
H
|
H
Q
x
K
A
x
D
F
|
F
D
|
D
P
|
P
I
x
A
E
x
V
A
x
T
M
x
A
R
x
V
T
x
Q
P
x
K
Y
|
Y
R
x
E
I
x
D
D
|
D
I
x
D
L
x
Y
Q
|
Q
P
|
P
V
x
L
Y
|
Y
F
|
F
V
|
V
L
x
A
P
x
D
N
x
S
M
x
I

Sites not aligning to the query:

2xsnA Crystal structure of human tyrosine hydroxylase catalytic domain
36% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 61:272/335 of 2xsnA

query
sites
2xsnA
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
T
R
 
T
Q
 
L
L
 
K
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
A
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
G
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
A
I
 
F
D
 
A
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
P
 
S
F
 
A
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
 
I
V
 
E
Y
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
N
Q
 
G
G
 
E
R
 
V
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
Y
K
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
I
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

6zvpD Atomic model of the em-based structure of the full-length tyrosine hydroxylase in complex with dopamine (residues 40-497) in which the regulatory domain (residues 40-165) has been included only with the backbone atoms (see paper)
36% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 183:394/458 of 6zvpD

query
sites
6zvpD
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
T
R
 
T
Q
 
L
L
 
K
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
A
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
G
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
A
I
 
F
D
 
A
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
P
 
S
F
 
A
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
 
I
V
 
E
Y
 
K
L
 
L
A
 
S
R
 
T
L
 
L
Y
|
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
N
Q
 
G
G
 
E
R
 
V
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
x
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
Y
K
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
I
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6zn2A Partial structure of tyrosine hydroxylase in complex with dopamine showing the catalytic domain and an alpha-helix from the regulatory domain involved in dopamine binding. (see paper)
36% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 60:271/335 of 6zn2A

query
sites
6zn2A
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
T
R
 
T
Q
 
L
L
 
K
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
A
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
G
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
A
I
 
F
D
 
A
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
P
 
S
F
x
A
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
 
I
V
x
E
Y
 
K
L
 
L
A
x
S
R
 
T
L
 
L
Y
|
Y
W
|
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
N
Q
 
G
G
 
E
R
 
V
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
Y
K
 
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
I
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
|
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

P07101 Tyrosine 3-monooxygenase; Tyrosine 3-hydroxylase; TH; EC 1.14.16.2 from Homo sapiens (Human) (see 32 papers)
36% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 253:464/528 of P07101

query
sites
P07101
I
 
V
D
 
E
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
A
Q
 
E
E
|
E
H
 
I
A
 
A
V
 
T
W
 
W
N
 
K
T
 
E
L
 
V
I
 
Y
T
 
T
R
 
T
Q
 
L
L
 
K
K
 
G
V
 
L
I
 
Y
E
 
A
G
x
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
G
E
 
E
Y
 
H
L
 
L
D
 
E
G
 
A
I
 
F
D
 
A
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
S
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
|
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
x
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
|
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
Q
V
 
L
A
x
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
P
 
S
F
 
A
Q
x
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
S
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
x
R
R
 
V
F
 
F
P
 
Q
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
A
E
 
S
E
 
S
L
 
P
D
 
M
Y
 
H
L
 
S
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
x
C
F
 
C
H
 
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
M
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
R
W
 
T
F
|
F
A
|
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
D
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
|
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
E
R
x
I
V
 
E
Y
 
K
L
 
L
A
 
S
R
x
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
x
Q
A
 
N
Q
x
G
G
 
E
R
 
V
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
Y
K
x
G
E
 
E
T
 
L
V
 
L
Y
 
H
S
 
C
L
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
P
E
 
E
H
 
I
Q
x
R
A
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
E
E
 
A
A
 
A
M
 
A
R
 
V
T
 
Q
P
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
I
 
D
D
 
Q
I
 
T
L
 
Y
Q
 
Q
P
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5jk5A Phenylalanine hydroxylase from dictyostelium - bh2 complex
34% identity, 82% coverage: 17:230/262 of query aligns to 151:368/400 of 5jk5A

query
sites
5jk5A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
V
L
 
V
I
 
Y
T
 
N
R
 
R
Q
 
L
L
 
K
K
 
E
V
 
L
I
 
F
E
 
P
G
 
T
R
 
N
A
 
A
C
 
C
Q
 
H
E
 
Q
Y
 
H
L
 
A
D
 
Y
G
 
I
I
 
F
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
Q
-
 
N
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
S
H
 
P
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
Q
E
 
D
I
 
I
N
 
S
K
 
N
V
 
F
L
 
L
G
 
Q
A
 
E
T
 
C
T
|
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
R
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
Q
A
x
G
L
|
L
I
x
L
P
 
S
F
 
A
Q
 
R
T
 
D
F
|
F
F
x
L
E
 
N
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
A
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
P
E
 
S
E
 
V
L
 
P
D
 
L
Y
 
Y
L
 
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
|
P
W
 
D
F
 
F
A
 
A
E
x
D
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
D
R
 
I
V
 
Q
Y
 
L
L
 
L
A
x
S
R
 
T
L
 
C
Y
|
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
E
A
 
G
Q
 
D
G
 
T
R
 
I
K
 
R
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
M
V
 
E
Y
 
H
S
 
F
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
P
 
A
E
 
K
H
 
K
Q
 
L
A
 
P
F
 
F
D
 
N
P
 
P
I
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
C
R
 
N
T
 
T
P
 
E
Y
 
Y
R
 
P
I
 
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
V
L
 
A
P
 
E
N
 
S
M
 
F
K
 
Q
R
 
K

Sites not aligning to the query:

5jk8A Phenylalanine hydroxylase from dictyostelium - bh2, norleucine complex
34% identity, 82% coverage: 17:230/262 of query aligns to 142:359/390 of 5jk8A

query
sites
5jk8A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
V
L
 
V
I
 
Y
T
 
N
R
 
R
Q
 
L
L
 
K
K
 
E
V
 
L
I
 
F
E
 
P
G
 
T
R
 
N
A
 
A
C
 
C
Q
 
H
E
 
Q
Y
 
H
L
 
A
D
 
Y
G
 
I
I
 
F
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
E
-
 
Q
-
 
N
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
S
H
 
P
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
Q
E
 
D
I
 
I
N
 
S
K
 
N
V
 
F
L
 
L
G
 
Q
A
 
E
T
 
C
T
|
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
R
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
Q
A
 
G
L
 
L
I
x
L
P
 
S
F
x
A
Q
 
R
T
 
D
F
|
F
F
 
L
E
 
N
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
x
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
A
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
I
R
 
R
T
 
H
P
 
P
E
 
S
E
 
V
L
 
P
D
 
L
Y
|
Y
L
x
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
C
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
P
 
P
W
 
D
F
 
F
A
 
A
E
x
D
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
D
R
 
I
V
 
Q
Y
 
L
L
 
L
A
x
S
R
 
T
L
 
C
Y
|
Y
W
 
W
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
E
A
 
G
Q
 
D
G
 
T
R
 
I
K
 
R
I
 
A
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
S
|
S
S
|
S
P
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
M
V
 
E
Y
 
H
S
 
F
L
 
L
S
 
T
D
 
D
E
 
K
P
 
A
E
 
K
H
 
K
Q
 
L
A
 
P
F
 
F
D
 
N
P
 
P
I
 
F
E
 
D
A
 
A
M
 
C
R
 
N
T
 
T
P
 
E
Y
 
Y
R
 
P
I
 
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
P
V
 
L
Y
 
Y
F
 
Y
V
 
V
L
 
A
P
 
E
N
 
S
M
 
F
K
 
Q
R
 
K

Sites not aligning to the query:

P70080 Tryptophan 5-hydroxylase 1; Tryptophan 5-monooxygenase 1; EC 1.14.16.4 from Gallus gallus (Chicken) (see paper)
33% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 165:376/445 of P70080

query
sites
P70080
I
 
I
D
 
E
Y
 
F
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
Y
T
 
R
R
 
E
Q
 
L
L
 
N
K
 
K
V
 
L
I
 
Y
E
 
P
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
G
 
N
I
 
L
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
T
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
x
Y
I
 
L
P
 
S
F
 
P
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
V
R
|
R
T
 
H
P
 
S
E
 
S
E
 
D
L
 
P
D
 
L
Y
 
Y
L
x
T
Q
 
P
E
 
E
P
 
P
D
 
D
I
 
T
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
E
P
 
P
W
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
A
R
 
V
V
 
Q
Y
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
E
Q
 
G
G
 
Q
R
 
L
K
 
R
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
V
 
K
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
G
E
 
S
P
 
A
E
 
K
H
 
V
Q
 
K
A
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
K
E
 
V
A
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
|
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

3e2tA The catalytic domain of chicken tryptophan hydroxylase 1 with bound tryptophan (see paper)
33% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 61:272/307 of 3e2tA

query
sites
3e2tA
I
 
I
D
 
E
Y
 
F
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
Y
T
 
R
R
 
E
Q
 
L
L
 
N
K
 
K
V
 
L
I
 
Y
E
 
P
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
G
 
N
I
 
L
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
T
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
R
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
T
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
 
Y
I
 
L
P
 
S
F
 
P
Q
 
R
T
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
V
R
|
R
T
 
H
P
 
S
E
 
S
E
 
D
L
 
P
D
 
L
Y
|
Y
L
x
T
Q
 
P
E
|
E
P
|
P
D
 
D
I
 
T
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
E
P
 
P
W
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
D
E
 
E
Q
 
A
R
 
V
V
 
Q
Y
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
|
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
E
Q
 
G
G
 
Q
R
 
L
K
 
R
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
|
S
S
 
S
P
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
V
 
K
Y
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
S
D
 
G
E
 
S
P
 
A
E
 
K
H
 
V
Q
 
K
A
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
K
E
 
V
A
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
|
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
E
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

8cjnA Crystal structure of human tryptophan hydroxylase 1 in complex with inhibitor km-06-070 (see paper)
32% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 61:272/291 of 8cjnA

query
sites
8cjnA
I
 
V
D
 
E
Y
 
F
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
F
T
 
Q
R
 
E
Q
 
L
L
 
N
K
 
K
V
 
L
I
 
Y
E
 
P
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
G
 
N
I
 
L
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
S
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
N
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
x
Y
I
x
L
P
 
S
F
x
P
Q
 
R
T
 
D
F
|
F
F
 
L
E
 
S
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
x
Y
I
 
V
R
 
R
T
 
H
P
 
S
E
 
S
E
 
D
L
 
P
D
 
F
Y
 
Y
L
 
T
Q
 
P
E
|
E
P
|
P
D
 
D
I
 
T
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
E
P
 
P
W
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
A
R
 
V
V
 
Q
Y
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
Q
 
G
G
 
Q
R
 
L
K
 
R
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
V
 
K
Y
 
H
S
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
G
E
 
H
P
 
A
E
 
K
H
 
V
Q
 
K
A
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
K
E
 
I
A
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
 
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

8cjkA Crystal structure of human tryptophan hydroxylase 1 in complex with inhibitor km-06-098 (see paper)
32% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 61:272/291 of 8cjkA

query
sites
8cjkA
I
 
V
D
 
E
Y
 
F
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
F
T
 
Q
R
 
E
Q
 
L
L
 
N
K
 
K
V
 
L
I
 
Y
E
 
P
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
G
 
N
I
 
L
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
S
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
N
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
x
Y
I
x
L
P
 
S
F
x
P
Q
 
R
T
 
D
F
|
F
F
 
L
E
 
S
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
V
R
 
R
T
 
H
P
 
S
E
 
S
E
 
D
L
 
P
D
 
F
Y
 
Y
L
 
T
Q
x
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
I
 
T
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
E
P
 
P
W
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
A
R
 
V
V
 
Q
Y
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
Q
 
G
G
 
Q
R
 
L
K
 
R
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
V
 
K
Y
 
H
S
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
G
E
 
H
P
 
A
E
 
K
H
 
V
Q
 
K
A
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
K
E
 
I
A
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
 
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8cjiA Crystal structure of human tryptophan hydroxylase 1 in complex with inhibitor km-07-052 (see paper)
32% identity, 79% coverage: 17:224/262 of query aligns to 61:272/290 of 8cjiA

query
sites
8cjiA
I
 
V
D
 
E
Y
 
F
P
 
T
Q
 
E
Q
 
E
E
 
E
H
 
I
A
 
K
V
 
T
W
 
W
N
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
F
T
 
Q
R
 
E
Q
 
L
L
 
N
K
 
K
V
 
L
I
 
Y
E
 
P
G
 
T
R
 
H
A
 
A
C
 
C
Q
 
R
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
D
 
K
G
 
N
I
 
L
D
 
P
Q
 
L
L
 
L
K
 
S
-
 
K
-
 
Y
-
 
C
-
 
G
L
 
Y
P
 
R
H
 
E
D
 
D
R
 
N
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
G
 
E
E
 
D
I
 
V
N
 
S
K
 
N
V
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
E
T
 
R
T
 
T
G
 
G
W
 
F
Q
 
S
V
 
I
A
 
R
R
 
P
V
 
V
P
 
A
A
 
G
L
x
Y
I
x
L
P
 
S
F
x
P
Q
 
R
T
 
D
F
|
F
F
 
L
E
 
S
L
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
F
K
 
R
R
 
V
F
 
F
P
 
H
V
 
C
A
 
T
T
 
Q
F
 
Y
I
 
V
R
 
R
T
 
H
P
 
S
E
 
S
E
 
D
L
 
P
D
 
F
Y
 
Y
L
 
T
Q
x
P
E
 
E
P
|
P
D
 
D
I
 
T
F
 
C
H
|
H
E
 
E
I
 
L
F
 
L
G
 
G
H
|
H
C
 
V
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
E
P
 
P
W
 
S
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
F
 
F
T
 
S
H
 
Q
T
 
E
Y
 
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
G
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
A
T
 
S
K
 
E
E
 
E
Q
 
A
R
 
V
V
 
Q
Y
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
T
L
 
C
Y
 
Y
W
 
F
M
 
F
T
 
T
I
 
V
E
|
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
M
 
C
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
Q
 
G
G
 
Q
R
 
L
K
 
R
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
G
 
A
G
 
G
I
 
L
L
 
L
S
 
S
S
 
S
P
 
I
K
 
S
E
 
E
T
 
L
V
 
K
Y
 
H
S
 
A
L
 
L
S
 
S
D
 
G
E
 
H
P
 
A
E
 
K
H
 
V
Q
 
K
A
 
P
F
 
F
D
 
D
P
 
P
I
 
K
E
 
I
A
 
T
M
 
C
R
 
K
T
 
Q
P
 
E
Y
 
C
R
 
L
I
 
I
D
 
T
I
 
T
L
 
F
Q
 
Q
P
 
D
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
V
 
V

Query Sequence

>PP_4490 FitnessBrowser__Putida:PP_4490
MKQTQYVAREPDAHGFIDYPQQEHAVWNTLITRQLKVIEGRACQEYLDGIDQLKLPHDRI
PQLGEINKVLGATTGWQVARVPALIPFQTFFELLASKRFPVATFIRTPEELDYLQEPDIF
HEIFGHCPLLTNPWFAEFTHTYGKLGLAATKEQRVYLARLYWMTIEFGLMETAQGRKIYG
GGILSSPKETVYSLSDEPEHQAFDPIEAMRTPYRIDILQPVYFVLPNMKRLFDLAHEDIM
GMVHKAMQLGLHAPKFPPKVAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory