SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_4715 FitnessBrowser__Putida:PP_4715 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
52% identity, 99% coverage: 1:249/251 of query aligns to 1:249/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
R
A
 
H
S
 
M
V
 
V
A
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
V
K
 
S
G
 
N
L
 
L
-
 
R
S
 
K
N
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
G
P
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
M
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
M
V
 
A
I
 
K
D
 
R
G
 
E
L
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
S
E
 
H
I
 
I
T
 
M
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
V
A
 
D
V
 
L
Q
 
N
P
 
L
E
 
-
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
P
 
A
E
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
I
G
 
G
C
 
A
K
 
Q
L
 
Y
V
 
I
L
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
I
 
Y
I
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
Q
 
K
A
 
E
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
S
 
D
S
 
A
I
 
V
I
 
L
E
 
K
A
 
T
F
 
Q
G
 
G
V
 
A
K
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
Q
V
 
V
Q
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
A
F
 
F
G
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
52% identity, 99% coverage: 1:249/251 of query aligns to 1:249/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
R
A
 
H
S
 
M
V
 
V
A
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
V
K
 
S
G
 
N
L
 
L
-
 
R
S
 
K
N
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
G
P
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
M
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
M
V
 
A
I
 
K
D
 
R
G
 
E
L
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
S
E
 
H
I
 
I
T
 
M
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
V
A
 
D
V
 
L
Q
 
N
P
 
L
E
 
-
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
P
 
A
E
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
I
G
 
G
C
 
A
K
 
Q
L
 
Y
V
 
I
L
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
I
 
Y
I
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
Q
 
K
A
 
E
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
E
E
 
A
E
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
S
 
D
S
 
A
I
 
V
I
 
L
E
 
K
A
 
T
F
 
Q
G
 
G
V
 
A
K
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
D
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
K
E
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
N
V
 
I
A
 
A
A
 
E
K
 
Q
V
 
V
Q
 
I
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
A
F
 
F
G
 
A
A
 
V
I
 
I
C
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
52% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
T
R
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
V
K
 
E
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
S
L
 
A
A
 
Q
L
 
L
P
 
D
S
 
P
G
 
N
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
I
F
 
Y
I
 
L
N
 
P
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
S
G
 
K
L
 
L
A
 
K
G
 
K
-
 
P
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
C
A
 
Y
V
 
T
Q
 
K
P
 
P
E
 
-
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
A
E
 
E
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
V
K
 
P
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
T
I
 
I
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
Y
A
 
A
Q
 
L
A
 
D
K
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
M
E
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
S
 
L
S
 
K
I
 
A
I
 
I
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
K
V
 
I
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
R
G
 
K
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
E
E
 
N
-
 
V
D
 
S
A
 
P
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
K
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
A
D
 
P
E
 
E
F
 
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
49% identity, 95% coverage: 1:238/251 of query aligns to 1:240/256 of P50921

query
sites
P50921
M
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
E
S
 
M
V
 
V
A
 
V
E
 
D
L
 
L
T
 
L
K
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
N
-
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
E
L
 
G
P
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
I
 
V
N
 
D
Q
 
L
V
 
A
I
 
E
D
 
R
G
 
T
L
 
L
-
 
T
-
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
S
E
 
A
I
 
I
T
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
T
A
 
D
V
 
L
Q
 
N
P
 
-
E
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
P
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
F
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
H
V
 
I
L
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
I
 
Y
I
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
F
L
 
V
N
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
F
A
 
L
Q
 
K
A
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
M
E
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
D
S
 
A
I
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
T
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
G
 
A
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
K
D
 
S
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
N
V
 
V
Q
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
A
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L
N
 
D

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
49% identity, 94% coverage: 2:238/251 of query aligns to 1:239/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
E
S
 
M
V
 
V
A
 
V
E
 
D
L
 
L
T
 
L
K
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
N
-
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
E
L
 
G
P
 
V
S
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
D
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
I
 
V
N
 
D
Q
 
L
V
 
A
I
 
E
D
 
R
G
 
T
L
 
L
-
 
T
-
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
S
E
 
A
I
 
I
T
 
I
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
T
A
 
D
V
 
L
Q
 
N
P
 
-
E
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
P
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
E
 
E
A
 
F
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
H
V
 
I
L
 
I
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
I
 
Y
I
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
F
L
 
V
N
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
F
A
 
L
Q
 
K
A
 
E
K
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
D
E
 
A
E
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
M
E
 
A
V
 
V
V
 
C
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
D
S
 
A
I
 
V
I
 
I
E
 
N
A
 
T
F
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
E
D
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
G
 
A
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
E
E
 
K
D
 
S
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
N
V
 
V
Q
 
V
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
A
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
Y
F
 
F
G
 
A
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
N
 
D

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:250/251 of query aligns to 2:250/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
R
 
K
P
 
K
M
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
T
T
 
T
R
 
L
A
 
A
S
 
E
V
 
A
A
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
G
K
 
A
G
 
A
L
 
V
S
 
A
N
 
K
L
 
G
A
 
V
L
 
T
P
 
D
S
 
D
G
 
R
V
 
V
E
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
P
 
P
A
 
Y
L
 
P
F
 
W
I
 
L
N
 
T
Q
 
A
V
 
V
I
 
G
D
 
E
G
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
G
K
 
S
E
 
P
I
 
V
T
 
A
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
S
 
V
A
 
S
V
 
S
Q
 
E
P
 
-
E
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
L
E
 
E
A
 
T
G
 
G
C
 
C
K
 
K
L
 
Y
V
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
E
E
 
T
V
 
F
L
 
I
N
 
N
R
 
H
K
 
K
F
 
V
A
 
H
A
 
T
A
 
A
Q
 
L
A
 
E
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
S
P
 
V
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
K
 
L
T
 
Q
L
 
E
E
 
R
V
 
V
V
 
F
G
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
V
S
 
Y
S
 
A
I
 
A
I
 
C
E
 
A
A
 
G
F
 
L
G
 
T
V
 
D
K
 
E
A
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
R
A
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
F
I
 
V
R
 
R
G
 
S
Q
 
K
L
 
L
A
 
R
A
 
L
E
 
L
D
 
Y
A
 
G
E
 
D
-
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
D
K
 
S
V
 
T
Q
 
P
L
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
T
A
 
V
E
 
G
L
 
L
F
 
M
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
A
D
 
D
E
 
S
F
 
F
G
 
L
A
 
A
I
 
I
C
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
G
 
G

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 8:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
R
A
 
D
S
 
D
V
 
N
A
 
D
E
 
K
L
 
L
T
 
L
K
 
K
G
 
L
L
 
L
S
 
S
N
 
E
L
 
A
A
 
H
L
 
F
P
 
D
S
 
D
G
 
N
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
L
V
 
I
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
S
L
 
V
F
 
F
I
 
L
N
 
H
Q
 
E
V
 
I
I
 
R
D
 
K
G
 
S
L
 
L
A
 
K
G
 
-
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
H
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
S
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
I
V
 
R
E
 
D
A
 
I
G
 
G
C
 
C
K
 
D
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
N
I
 
I
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
S
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
K
 
K
T
 
T
L
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
K
S
 
A
I
 
I
I
 
A
E
 
N
A
 
K
F
 
I
-
 
K
G
 
S
V
 
A
K
 
D
A
 
E
F
 
W
A
 
K
D
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
N
A
 
F
I
 
L
R
 
R
G
 
K
Q
 
W
L
 
F
A
 
K
A
 
T
E
 
N
D
 
A
A
 
P
E
 
N
-
 
G
V
 
V
A
 
D
A
 
E
K
 
K
V
 
I
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
Q
M
 
Q
P
 
H
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
T
A
 
E
I
 
I
C
 
C
R
 
K
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
48% identity, 94% coverage: 2:238/251 of query aligns to 402:639/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
R
 
K
P
 
L
M
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
H
G
 
K
T
 
T
R
 
I
A
 
S
S
 
E
V
 
A
A
 
K
E
 
K
L
 
F
T
 
V
K
 
S
G
 
L
L
 
L
S
 
V
N
 
N
-
 
E
L
 
L
A
 
H
L
 
D
P
 
V
S
 
K
G
 
E
V
 
F
E
 
E
V
 
I
A
 
V
V
 
V
F
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
F
L
 
T
F
 
A
I
 
L
N
 
S
Q
 
E
V
 
V
I
 
G
D
 
E
G
 
I
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
R
E
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
V
A
 
F
V
 
Y
Q
 
E
P
 
-
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
L
Q
 
M
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
A
 
I
G
 
G
C
 
V
K
 
E
L
 
Y
V
 
V
L
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
R
I
 
I
I
 
F
G
 
K
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
E
V
 
F
L
 
I
N
 
N
R
 
R
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
A
 
E
K
 
K
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
K
 
L
T
 
T
L
 
F
E
 
C
V
 
V
V
 
V
G
 
E
R
 
K
Q
 
Q
L
 
V
S
 
R
S
 
E
I
 
G
I
 
F
E
 
Y
A
 
G
F
 
L
G
 
D
V
 
K
K
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
K
D
 
R
A
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
K
Q
 
L
L
 
L
A
 
S
-
 
E
A
 
M
E
 
Y
D
 
D
A
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
G
K
 
S
V
 
I
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
F
A
 
L
E
 
G
L
 
L
F
 
I
G
 
V
M
 
Q
P
 
K
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K

Sites not aligning to the query:

P00942 Triosephosphate isomerase; TIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
45% identity, 94% coverage: 2:237/251 of query aligns to 3:236/248 of P00942

query
sites
P00942
R
 
R
R
 
T
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
I
T
 
V
K
 
E
G
 
R
L
 
L
S
 
N
N
 
T
L
 
A
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
T
F
 
Y
I
 
L
N
 
D
Q
 
Y
V
 
S
I
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
K
K
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
A
A
 
Y
V
 
L
Q
 
K
P
 
A
E
 
-
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
P
 
V
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
C
 
A
K
 
K
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
I
 
Y
I
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
V
 
F
L
 
I
N
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
K
A
 
F
A
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
E
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
S
 
A
I
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
E
F
 
-
G
 
-
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
T
D
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
K
Q
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
K
D
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
S
K
 
E
V
 
L
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
V
E
 
T
L
 
F
F
 
K
G
 
D
M
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ypiA Electrophilic catalysis in triosephosphase isomerase: the role of histidine-95 (see paper)
45% identity, 94% coverage: 2:237/251 of query aligns to 2:235/247 of 3ypiA

query
sites
3ypiA
R
 
R
R
 
T
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
I
T
 
V
K
 
E
G
 
R
L
 
L
S
 
N
N
 
T
L
 
A
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
T
F
 
Y
I
 
L
N
 
D
Q
 
Y
V
 
S
I
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
K
K
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
A
A
 
Y
V
 
L
Q
 
K
P
 
A
E
 
-
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
P
 
V
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
C
 
A
K
 
K
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
x
Q
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
I
 
Y
I
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
V
 
F
L
 
I
N
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
K
A
 
F
A
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
E
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
S
 
A
I
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
E
F
 
-
G
 
-
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
T
D
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
K
Q
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
K
D
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
S
K
 
E
V
 
L
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
V
E
 
T
L
 
F
F
 
K
G
 
D
M
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

4ff7B Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 94% coverage: 2:237/251 of query aligns to 2:235/247 of 4ff7B

query
sites
4ff7B
R
 
R
R
 
T
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
I
T
 
V
K
 
E
G
 
R
L
 
L
S
 
N
N
 
T
L
 
A
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
T
F
 
Y
I
 
L
N
 
D
Q
 
Y
V
 
S
I
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
K
K
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
A
A
 
Y
V
 
L
Q
 
K
P
x
A
E
 
-
Q
x
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
P
 
V
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
C
 
A
K
 
K
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
I
 
Y
I
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
V
 
F
L
 
I
N
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
K
A
x
F
A
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
E
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
S
 
A
I
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
E
F
 
-
G
 
-
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
T
D
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
K
Q
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
K
D
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
S
K
 
E
V
 
L
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
V
E
 
T
L
 
F
F
 
K
G
 
D
M
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

4ff7A Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 94% coverage: 2:237/251 of query aligns to 2:235/247 of 4ff7A

query
sites
4ff7A
R
 
R
R
 
T
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
M
 
L
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
I
T
 
V
K
 
E
G
 
R
L
 
L
S
 
N
N
 
T
L
 
A
A
 
S
L
 
I
P
 
P
S
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
I
F
 
C
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
T
F
 
Y
I
 
L
N
 
D
Q
 
Y
V
 
S
I
 
V
D
 
S
G
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
K
K
 
P
E
 
Q
I
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
A
A
 
Y
V
 
L
Q
 
K
P
 
A
E
 
-
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
P
 
V
E
 
D
Q
 
Q
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
C
 
A
K
 
K
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
S
I
 
Y
I
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
D
D
 
D
E
 
K
V
 
F
L
 
I
N
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
A
 
K
A
 
F
A
 
A
Q
 
L
A
 
G
K
 
Q
G
 
G
L
 
V
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
S
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
K
E
 
K
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
E
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
S
 
N
S
 
A
I
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
E
F
 
-
G
 
-
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
T
D
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
S
I
 
I
R
 
R
G
 
K
Q
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
S
E
 
K
D
 
L
A
 
G
E
 
D
V
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
S
K
 
E
V
 
L
Q
 
R
L
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
A
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
V
E
 
T
L
 
F
F
 
K
G
 
D
M
 
K
P
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 1:246/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
S
R
 
K
A
 
K
S
 
E
V
 
N
A
 
D
E
 
K
L
 
L
T
 
I
K
x
E
G
 
M
L
 
L
S
 
T
N
x
H
L
 
A
A
 
K
L
 
I
P
 
D
S
 
P
G
 
N
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
L
V
 
V
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
I
 
L
N
 
P
Q
 
S
V
 
V
I
 
R
D
 
E
G
 
K
L
 
L
A
 
-
G
 
D
K
 
K
E
 
R
I
 
F
T
 
H
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
C
A
 
Y
V
 
K
Q
 
V
P
 
P
E
 
-
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
P
 
P
E
 
A
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
C
 
C
K
 
D
L
 
W
V
 
V
L
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
I
I
 
L
G
 
L
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
L
 
V
N
 
G
R
 
E
K
 
K
F
 
T
A
 
N
A
 
H
A
 
A
Q
 
I
A
 
S
K
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
N
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
C
G
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
M
S
 
E
S
 
A
I
 
I
I
 
R
E
 
K
A
 
N
F
 
L
-
 
S
G
 
S
V
 
A
K
 
D
A
 
M
F
 
W
A
 
N
D
 
H
A
 
I
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
L
x
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
A
 
A
I
 
V
R
 
R
G
 
R
Q
 
W
L
 
M
A
 
E
A
 
E
E
 
K
-
 
V
D
 
S
A
 
P
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
K
K
 
S
V
 
I
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
R
E
 
T
L
 
L
F
 
A
G
 
K
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
D
E
 
-
F
 
F
G
 
I
A
 
E
I
 
I
C
 
C
R
 
N
A
 
A

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
44% identity, 96% coverage: 1:242/251 of query aligns to 1:243/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
R
 
K
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
 
N
G
 
K
T
 
T
R
 
L
A
 
G
S
 
E
V
 
A
A
 
V
E
 
S
L
 
F
T
 
V
K
 
E
G
 
E
L
 
V
-
 
K
S
 
S
N
 
S
L
 
I
A
 
P
L
 
A
P
 
A
S
 
D
G
 
K
V
 
A
E
 
E
V
 
A
A
 
V
V
 
V
F
 
C
P
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
I
 
L
N
 
E
Q
 
K
V
 
L
I
 
A
D
 
S
G
 
A
L
 
V
A
 
K
G
 
G
K
 
T
E
 
D
I
 
L
T
 
K
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
M
A
 
H
V
 
F
Q
 
E
P
 
-
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
V
Q
 
A
L
 
L
V
 
K
E
 
D
A
 
L
G
 
G
C
 
V
K
 
D
L
 
Y
V
 
C
L
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
E
I
 
M
I
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
D
 
D
E
 
E
V
 
T
L
 
V
N
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
A
Q
 
F
A
 
K
K
 
H
G
 
G
L
 
I
K
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
N
E
 
D
V
 
L
V
 
V
G
 
A
R
 
D
Q
 
Q
L
 
V
S
 
K
S
 
K
I
 
G
I
 
L
E
 
A
A
 
G
F
 
L
G
 
S
V
 
E
K
 
E
A
 
Q
F
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
S
V
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
A
Q
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
V
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
H
I
 
I
R
 
R
G
 
K
Q
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
S
-
 
F
D
 
S
A
 
Q
E
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
K
V
 
L
Q
 
R
L
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
I
A
 
K
E
 
E
L
 
Y
F
 
M
G
 
A
M
 
E
P
 
S
D
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
E
A
 
P
D
 
Q
E
 
S
F
 
F

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
47% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 5:247/249 of P60174

query
sites
P60174
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
R
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
I
K
 
G
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
P
K
 
K
E
 
-
I
 
I
T
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Q
 
M
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
C
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
W
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
I
 
F
G
 
G
E
|
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
x
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
S
 
K
S
 
V
I
 
I
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
E
 
N
D
 
V
A
 
S
E
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
|
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

1htiB Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. Triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 4:246/248 of 1htiB

query
sites
1htiB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
R
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
I
K
 
G
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
P
K
 
K
E
 
-
I
 
I
T
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Q
 
M
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
C
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
W
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
S
 
K
S
 
V
I
 
I
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
E
 
N
D
 
V
A
 
S
E
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

4pocB Structure of triosephosphate isomerase wild type human enzyme. (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 3:245/247 of 4pocB

query
sites
4pocB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
R
R
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
I
K
 
G
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
P
K
 
K
E
 
-
I
 
I
T
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Q
 
M
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
C
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
W
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
A
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
S
 
K
S
 
V
I
 
I
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
E
 
N
D
 
V
A
 
S
E
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
46% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 2:244/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
R
R
 
K
A
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
I
K
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
P
K
 
K
E
 
-
I
 
I
T
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Q
 
M
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
C
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
W
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
S
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
S
 
K
S
 
V
I
 
I
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
E
 
N
D
 
V
A
 
S
E
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 3:245/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
H
 
N
G
 
G
T
 
R
R
 
K
A
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
I
K
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
P
K
 
K
E
 
-
I
 
I
T
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
T
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Q
 
M
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
C
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
W
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
|
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
S
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
|
Q
L
 
T
S
 
K
S
 
V
I
 
I
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
E
 
N
D
 
V
A
 
S
E
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
46% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 5:247/249 of P00939

query
sites
P00939
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
H
x
N
G
 
G
T
 
R
R
 
K
A
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
I
K
 
T
G
 
T
L
 
L
S
 
N
N
 
A
L
 
A
A
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
A
G
 
D
V
 
T
E
 
E
V
 
V
A
 
V
V
 
C
F
 
A
P
 
P
P
 
P
A
 
T
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
D
Q
 
F
V
 
A
I
 
R
D
 
Q
G
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
P
K
 
K
E
 
-
I
 
I
T
 
A
V
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
S
 
-
A
 
C
V
 
Y
Q
 
K
P
 
V
E
 
T
Q
x
N
G
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
P
 
P
E
 
G
Q
 
M
L
 
I
V
 
K
E
 
D
A
 
C
G
 
G
C
 
A
K
 
T
L
 
W
V
 
V
L
 
V
I
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
H
I
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
G
R
 
Q
K
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
A
 
S
K
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
L
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
I
T
 
T
L
 
E
E
 
K
V
 
V
V
 
V
G
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
S
 
K
S
 
V
I
 
I
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
A
 
D
F
 
W
A
 
S
D
 
K
A
 
V
V
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
S
E
 
N
D
 
V
A
 
S
E
 
D
-
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
K
 
S
V
 
T
Q
 
R
L
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
A
 
G
A
 
A
N
 
T
A
 
C
A
 
K
E
 
E
L
 
L
F
 
A
G
 
S
M
 
Q
P
 
P
D
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
A
 
P
D
 
-
E
 
E
F
 
F
G
 
V
A
 
D
I
 
I
C
 
I
R
 
N
A
 
A

Query Sequence

>PP_4715 FitnessBrowser__Putida:PP_4715
MRRPMVAGNWKMHGTRASVAELTKGLSNLALPSGVEVAVFPPALFINQVIDGLAGKEITV
GAQNSAVQPEQGALTGEVAPEQLVEAGCKLVLIGHSERRQIIGETDEVLNRKFAAAQAKG
LKPVLCIGETLEEREAGKTLEVVGRQLSSIIEAFGVKAFADAVIAYEPVWAIGTGLTATP
QQAQDVHAAIRGQLAAEDAEVAAKVQLLYGGSVKAANAAELFGMPDIDGGLIGGASLNAD
EFGAICRAAGN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory