SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_4934 FitnessBrowser__Putida:PP_4934 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P76658 Bifunctional protein HldE; EC 2.7.1.167; EC 2.7.7.70 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
57% identity, 100% coverage: 1:473/473 of query aligns to 1:474/477 of P76658

query
sites
P76658
M
 
M
K
 
K
L
 
V
S
 
T
M
 
L
P
 
P
R
 
E
F
 
F
D
 
E
Q
 
R
A
 
A
P
 
G
V
 
V
L
 
M
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
H
 
Y
G
 
G
G
 
P
T
 
T
S
 
S
R
 
R
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
K
V
 
V
D
 
N
Q
 
T
I
 
I
E
 
E
D
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
M
N
 
N
I
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
N
A
 
A
S
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
A
D
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
K
S
 
S
L
 
L
Q
 
A
A
 
D
A
 
V
G
 
N
V
 
V
R
 
K
S
 
C
V
 
D
F
 
F
Q
 
V
R
 
S
I
 
V
A
 
P
H
 
T
Q
 
H
P
 
P
T
 
T
I
 
I
V
 
T
K
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
M
 
L
S
 
S
R
 
R
H
 
N
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
R
I
 
L
D
 
D
F
 
F
E
 
E
E
 
E
P
 
G
F
 
F
-
 
E
A
 
G
T
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
Q
S
 
P
L
 
L
G
 
H
A
 
E
E
 
R
V
 
I
D
 
N
S
 
Q
L
 
A
L
 
L
E
 
S
G
 
S
V
 
I
K
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
A
N
 
S
H
 
V
Q
 
Q
N
 
Q
L
 
M
I
 
I
Q
 
Q
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
K
K
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
D
 
D
P
 
P
K
|
K
G
 
G
K
 
T
D
 
D
F
 
F
S
 
E
I
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
N
|
N
L
 
L
S
 
S
E
|
E
F
 
F
E
 
E
T
 
A
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
K
C
 
C
V
 
K
D
 
T
E
 
E
A
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
E
K
 
R
G
 
G
L
 
M
Q
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
A
D
 
D
L
 
Y
D
 
E
L
 
L
G
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
S
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
M
 
M
T
 
S
L
 
L
L
 
L
R
 
Q
V
 
P
G
 
G
Q
 
K
P
 
A
A
 
P
L
 
L
H
 
H
L
 
M
P
 
P
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
V
 
V
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
T
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
N
D
 
S
L
 
L
P
 
E
H
 
E
A
 
A
V
 
C
A
 
F
L
 
F
A
 
A
N
 
N
L
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
S
A
 
T
I
 
V
S
 
S
A
 
P
P
 
I
E
 
E
L
 
L
R
 
E
R
 
N
A
 
A
I
 
V
Q
 
R
R
 
G
E
 
R
E
 
A
G
 
D
S
 
T
E
 
G
R
 
F
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
 
T
L
 
E
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
A
D
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
K
H
 
R
N
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
V
V
 
V
F
 
M
T
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
F
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
A
G
 
G
H
 
H
V
 
V
T
 
S
Y
 
Y
L
 
L
E
 
A
Q
 
N
A
 
A
R
 
R
A
 
K
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
S
V
 
T
S
 
K
R
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
D
G
 
S
R
 
R
P
 
P
I
 
V
N
 
N
S
 
P
V
 
L
D
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
M
A
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
D
W
 
W
V
 
V
I
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
E
E
 
E
G
 
D
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
R
L
 
L
L
 
I
S
 
A
Q
 
G
V
 
I
K
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
G
 
K
I
 
P
D
 
E
Q
 
E
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
S
D
 
K
I
 
E
V
 
V
K
 
W
G
 
A
Y
 
N
G
 
G
G
 
G
T
 
E
V
 
V
K
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
N
L
 
F
V
 
E
E
 
D
N
 
G
S
 
C
S
 
S
T
 
T
T
 
T
A
 
N
I
 
I
V
 
I
E
 
K
K
 
K
I
 
I
R
 
Q
K
 
Q
N
 
D

4e84A Crystal structure of burkholderia cenocepacia hlda (see paper)
54% identity, 62% coverage: 13:307/473 of query aligns to 17:311/313 of 4e84A

query
sites
4e84A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
M
|
M
L
 
L
D
|
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
H
 
F
G
 
G
G
 
N
T
 
V
S
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
H
V
 
V
D
 
Q
Q
 
R
I
 
Q
E
 
E
D
 
E
R
 
R
P
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
N
I
 
A
A
 
V
A
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
C
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Q
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
G
D
 
E
S
 
R
L
 
I
A
 
V
N
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
T
S
 
P
V
 
H
F
 
L
Q
 
E
R
 
R
I
 
D
A
 
P
H
 
A
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
T
V
 
I
K
|
K
L
 
L
R
|
R
V
 
V
M
 
L
S
 
A
R
 
R
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
|
R
I
 
V
D
 
D
F
 
F
E
 
E
E
 
A
P
 
M
F
 
P
A
 
T
T
 
H
D
 
E
P
 
V
L
 
L
S
 
L
L
 
A
G
 
G
-
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
F
D
 
D
S
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
Q
V
 
H
K
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
S
D
 
D
Y
|
Y
G
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
L
K
 
T
N
 
H
H
 
V
Q
 
T
N
 
T
L
 
M
I
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
K
 
D
D
 
D
F
 
W
S
 
A
I
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
|
N
L
x
R
S
 
A
E
 
E
F
 
L
E
 
R
T
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
C
x
W
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
V
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
L
 
R
Q
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
L
T
|
T
R
|
R
G
x
S
E
 
E
H
 
E
G
|
G
M
 
M
T
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
G
P
 
-
A
 
E
L
 
L
H
 
H
L
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
|
V
F
 
F
D
 
D
V
|
V
T
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
T
A
 
M
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
V
D
 
P
L
 
L
P
 
V
H
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
R
A
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
T
I
 
V
S
 
D
A
 
Y
P
 
D
E
 
E
L
 
L

4e8zA Crystal structure of burkholderia cenocepacia hlda in complex with an atp-competitive inhibitor (see paper)
54% identity, 62% coverage: 13:307/473 of query aligns to 14:308/308 of 4e8zA

query
sites
4e8zA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
H
 
F
G
 
G
G
 
N
T
 
V
S
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
H
V
 
V
D
 
Q
Q
 
R
I
 
Q
E
 
E
D
 
E
R
 
R
P
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
N
I
 
A
A
 
V
A
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
C
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Q
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
G
D
 
E
S
 
R
L
 
I
A
 
V
N
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
T
S
 
P
V
 
H
F
 
L
Q
 
E
R
 
R
I
 
D
A
 
P
H
 
A
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
T
V
 
I
K
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
M
 
L
S
 
A
R
 
R
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
V
D
 
D
F
 
F
E
 
E
E
 
A
P
 
M
F
 
P
A
 
T
T
 
H
D
 
E
P
 
V
L
 
L
S
 
L
L
 
A
G
 
G
-
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
F
D
 
D
S
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
Q
V
 
H
K
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
G
L
 
L
K
 
T
N
 
H
H
 
V
Q
 
T
N
 
T
L
 
M
I
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
K
 
D
D
 
D
F
 
W
S
 
A
I
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
|
N
L
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
L
E
 
R
T
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
C
 
W
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
V
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
L
 
R
Q
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
L
T
|
T
R
 
R
G
x
S
E
|
E
H
 
E
G
|
G
M
 
M
T
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
G
P
 
-
A
 
E
L
 
L
H
 
H
L
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
F
 
F
D
 
D
V
 
V
T
 
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
T
A
 
M
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
V
D
 
P
L
 
L
P
 
V
H
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
N
|
N
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
|
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
 
T
I
 
V
S
 
D
A
 
Y
P
 
D
E
 
E
L
 
L

4e84B Crystal structure of burkholderia cenocepacia hlda (see paper)
54% identity, 62% coverage: 13:307/473 of query aligns to 14:308/310 of 4e84B

query
sites
4e84B
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
M
|
M
L
 
L
D
|
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
H
 
F
G
 
G
G
 
N
T
 
V
S
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
H
V
 
V
D
 
Q
Q
 
R
I
 
Q
E
 
E
D
 
E
R
 
R
P
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
N
I
 
A
A
 
V
A
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
C
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Q
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
G
D
 
E
S
 
R
L
 
I
A
 
V
N
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
T
S
 
P
V
 
H
F
 
L
Q
 
E
R
 
R
I
 
D
A
 
P
H
 
A
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
T
V
 
I
K
|
K
L
 
L
R
|
R
V
 
V
M
 
L
S
 
A
R
 
R
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
|
R
I
 
V
D
 
D
F
 
F
E
 
E
E
 
A
P
 
M
F
 
P
A
 
T
T
 
H
D
 
E
P
 
V
L
 
L
S
 
L
L
 
A
G
 
G
-
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
F
D
 
D
S
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
Q
V
 
H
K
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
S
D
 
D
Y
|
Y
G
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
L
K
 
T
N
 
H
H
 
V
Q
 
T
N
 
T
L
 
M
I
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
K
 
D
D
 
D
F
 
W
S
 
A
I
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
|
N
L
x
R
S
 
A
E
 
E
F
 
L
E
 
R
T
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
C
 
W
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
V
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
L
 
R
Q
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
L
T
|
T
R
|
R
G
x
S
E
 
E
H
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
G
P
 
-
A
 
E
L
 
L
H
 
H
L
 
A
P
 
P
A
 
A
R
 
L
A
|
A
R
 
R
E
 
E
V
|
V
F
 
F
D
 
D
V
|
V
T
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
T
A
 
M
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
V
D
 
P
L
 
L
P
 
V
H
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
R
A
 
A
A
|
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
T
I
 
V
S
 
D
A
 
Y
P
 
D
E
 
E
L
 
L

4e8wA Crystal structure of burkholderia cenocepacia hlda in complex with an atp-competitive inhibitor (see paper)
52% identity, 62% coverage: 13:307/473 of query aligns to 11:298/299 of 4e8wA

query
sites
4e8wA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
M
 
M
L
 
L
D
 
D
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
H
 
F
G
 
G
G
 
N
T
 
V
S
 
D
R
 
R
I
 
I
S
 
S
P
 
P
E
 
E
A
 
A
P
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
K
 
H
V
 
V
D
 
Q
Q
 
R
I
 
Q
E
 
E
D
 
E
R
 
R
P
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
R
N
 
N
I
 
A
A
 
V
A
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
Q
A
 
A
S
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
C
V
 
V
T
 
V
G
 
G
Q
 
C
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
G
D
 
E
S
 
R
L
 
I
A
 
V
N
 
E
S
 
L
L
 
L
Q
 
G
A
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
T
S
 
P
V
 
H
F
 
L
Q
 
E
R
 
R
I
 
D
A
 
P
H
 
A
Q
 
L
P
 
P
T
 
T
I
 
T
V
 
I
K
 
K
L
 
L
R
 
R
V
 
V
M
 
L
S
 
A
R
 
R
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
R
I
 
V
D
 
D
F
 
F
E
 
E
E
 
A
P
 
M
F
 
P
A
 
T
T
 
H
D
 
E
P
 
V
L
 
L
S
 
L
L
 
A
G
 
G
-
 
L
A
 
A
E
 
R
V
 
F
D
 
D
S
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
Q
V
 
H
K
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
L
L
 
M
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
G
 
A
K
 
K
G
 
G
A
 
G
L
 
L
K
 
T
N
 
H
H
 
V
Q
 
T
N
 
T
L
 
M
I
 
I
Q
 
E
A
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
A
G
 
G
I
 
K
P
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
V
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
K
 
D
D
 
D
F
 
W
S
 
A
I
 
R
Y
 
Y
R
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
N
|
N
L
 
R
S
 
A
E
 
E
F
 
L
E
 
R
T
 
E
I
 
V
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
C
 
W
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
R
A
 
A
K
 
R
G
 
V
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
L
 
R
Q
 
A
D
 
E
L
 
L
D
 
D
L
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
L
T
|
T
R
 
R
G
x
S
E
 
E
H
 
E
G
|
G
M
 
M
T
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
S
V
 
A
G
 
G
Q
 
G
P
 
-
A
 
E
L
 
L
H
 
H
L
 
A
P
 
P
A
|
A
R
 
L
A
 
A
R
 
-
E
 
-
V
 
-
F
 
-
D
 
-
V
|
V
T
 
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
I
 
I
S
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
T
A
 
M
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
V
D
 
P
L
 
L
P
 
V
H
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
N
|
N
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
|
V
G
 
G
K
 
K
L
 
-
G
 
-
T
 
T
A
 
A
A
 
T
I
 
V
S
 
D
A
 
Y
P
 
D
E
 
E
L
 
L

Q9ZVI9 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase; CTP:phosphoethanolamine cytidylyltransferase; Phosphorylethanolamine cytidylyltransferase 1; EC 2.7.7.14 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
33% identity, 27% coverage: 342:470/473 of query aligns to 57:189/421 of Q9ZVI9

query
sites
Q9ZVI9
V
 
V
F
 
Y
T
 
M
N
 
D
G
 
G
C
 
C
F
 
F
D
 
D
I
 
M
L
 
M
H
 
H
A
 
Y
G
 
G
H
 
H
V
 
C
T
 
N
Y
 
A
L
 
L
E
 
R
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
V
D
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
E
V
 
I
S
 
I
R
 
A
L
 
N
K
 
K
G
 
G
P
 
P
G
 
-
R
 
-
P
 
P
I
 
V
N
 
T
S
 
P
V
 
L
D
 
H
R
 
E
R
 
R
M
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
A
 
K
G
 
A
L
 
V
G
 
K
A
 
W
V
 
V
D
 
D
W
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
S
-
 
D
F
 
A
P
|
P
E
 
Y
G
 
A
T
 
I
P
 
T
E
 
E
N
 
D
L
 
F
L
 
M
S
 
K
Q
 
K
V
 
L
K
 
F
P
 
D
D
 
E
V
 
Y
L
 
Q
V
 
I
K
 
D
G
 
Y
G
 
I
D
 
I
Y
 
H
G
 
G
I
 
D
D
 
D
Q
 
P
V
 
C
V
 
V
G
 
L
A
 
P
D
 
D
I
 
G
V
 
T
K
 
D
G
 
A
Y
 
Y
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
K
G
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
Y
K
 
K
V
 
Q
L
 
I
G
 
K
L
 
R
V
 
T
E
 
E
N
 
G
S
 
V
S
 
S
T
 
S
T
 
T
A
 
D
I
 
I
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
M

4xsvA Human ctp: phosphoethanolamine cytidylyltransferase in complex with ctp
37% identity, 19% coverage: 342:433/473 of query aligns to 7:97/306 of 4xsvA

query
sites
4xsvA
V
 
V
F
 
W
T
 
C
N
 
D
G
|
G
C
|
C
F
x
Y
D
 
D
I
 
M
L
 
V
H
|
H
A
 
Y
G
 
G
H
|
H
V
 
S
T
 
N
Y
 
Q
L
 
L
E
 
R
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
H
D
 
T
D
 
D
A
 
E
S
 
E
V
 
I
S
 
A
R
 
K
L
x
H
K
 
K
G
|
G
P
 
P
G
 
-
R
 
-
P
 
P
I
 
V
N
 
F
S
 
T
V
 
Q
D
 
E
R
 
E
R
 
R
M
 
Y
A
 
K
V
 
M
L
 
V
A
 
Q
G
 
A
L
 
I
G
 
K
A
 
W
V
 
V
D
 
D
W
 
E
V
 
V
I
 
V
-
 
P
S
 
A
F
 
A
P
 
P
E
 
Y
G
 
V
T
 
T
P
 
T
E
 
L
N
 
E
L
 
T
L
 
L
S
 
D
Q
 
K
V
 
Y
K
 
N
P
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
C
V
 
V
K
 
H
G
 
G
G
 
N
D
 
D

Sites not aligning to the query:

3glvB Crystal structure of the lipopolysaccharide core biosynthesis protein from thermoplasma volcanium gss1
36% identity, 24% coverage: 342:455/473 of query aligns to 5:116/122 of 3glvB

query
sites
3glvB
V
 
V
F
 
M
T
 
A
N
 
T
G
|
G
C
x
V
F
|
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
|
H
A
 
L
G
|
G
H
|
H
V
 
I
T
 
H
Y
|
Y
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
A
 
S
R
 
K
A
 
K
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
V
N
 
A
D
 
R
D
 
D
A
 
-
S
 
S
V
 
T
S
 
A
R
 
R
L
 
N
K
x
N
G
 
G
P
x
K
G
 
-
R
 
I
P
 
P
I
 
I
N
 
F
S
 
D
V
 
E
D
 
N
R
 
S
R
 
R
M
 
L
A
 
A
V
 
L
L
 
I
A
 
S
G
 
E
L
 
L
G
 
K
A
 
V
V
 
V
D
 
D
W
 
R
V
 
A
I
 
I
S
 
L
F
 
G
P
 
H
E
 
E
G
 
G
T
 
D
P
 
M
E
 
M
N
 
K
L
 
T
L
 
V
S
 
I
Q
 
E
V
 
V
K
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
I
V
 
T
K
 
L
G
|
G
G
x
Y
D
|
D
Y
x
Q
G
 
K
I
 
F
D
 
D
Q
 
E
V
 
A
V
 
E
G
 
L
A
 
Q
D
 
S
I
 
K
V
 
I
K
 
N
G
 
K
Y
 
L
G
 
G
G
 
I
T
 
T
V
 
V
K
 
K
V
 
I
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Q58579 FAD synthase; FMN adenylyltransferase; Flavin adenine dinucleotide synthase; EC 2.7.7.2 from Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) (see paper)
41% identity, 20% coverage: 339:433/473 of query aligns to 2:95/149 of Q58579

query
sites
Q58579
E
 
K
K
 
K
I
 
R
V
 
V
F
 
V
T
 
T
N
 
A
G
 
G
C
 
T
F
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
H
A
 
P
G
 
G
H
 
H
V
 
Y
T
 
E
Y
 
I
L
 
L
E
 
K
Q
 
F
A
 
A
R
 
K
A
 
S
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
E
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
V
 
V
N
 
A
D
 
R
D
 
D
A
 
E
S
 
T
V
 
V
S
 
K
R
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
R
G
 
-
R
 
K
P
 
P
I
 
I
N
 
I
S
 
P
V
 
E
D
 
E
R
 
Q
R
 
R
M
 
R
A
 
E
V
 
M
L
 
V
A
 
E
G
 
A
L
 
L
G
 
K
A
 
P
V
 
V
D
 
D
W
 
K
V
 
A
I
 
I
S
 
L
F
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
G
T
 
S
P
 
L
E
 
K
N
 
N
L
 
K
L
 
L
S
 
E
-
 
P
-
 
I
-
 
L
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
I
V
 
V
K
 
L
G
 
G
G
 
P
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6a8cA Ribokinase from leishmania donovani with adp (see paper)
25% identity, 62% coverage: 9:299/473 of query aligns to 11:312/327 of 6a8cA

query
sites
6a8cA
D
 
E
Q
 
Y
A
 
A
P
 
P
-
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
S
V
 
C
M
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
-
Y
 
-
W
 
-
H
 
Y
G
 
V
G
 
G
T
 
Y
S
 
V
R
 
D
I
 
H
S
 
M
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
P
 
G
V
 
E
P
 
T
V
 
M
V
 
H
K
x
S
V
 
V
D
x
S
Q
 
F
I
 
H
E
 
K
D
 
G
R
 
F
P
x
G
G
|
G
G
 
K
A
 
G
A
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
L
 
V
N
 
A
I
 
A
A
 
G
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
K
A
 
V
S
 
A
L
 
M
I
 
V
G
 
S
V
 
M
T
 
V
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
E
 
G
A
 
D
A
 
G
D
 
S
S
 
D
L
 
Y
A
 
I
N
 
K
S
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
D
S
 
T
V
 
A
F
 
Y
Q
 
M
-
 
F
R
 
R
I
 
T
A
 
G
H
 
K
Q
 
S
P
 
S
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
A
I
 
M
V
 
I
K
 
L
L
 
V
R
 
D
V
 
T
M
 
K
S
 
S
R
 
S
H
 
N
Q
 
N
Q
 
E
L
 
I
L
 
V
R
 
I
I
 
C
D
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
P
 
P
F
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
N
-
 
H
-
 
F
-
 
T
P
 
P
L
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
D
 
N
S
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
I
L
 
L
L
 
H
E
 
T
G
 
G
V
 
L
K
 
K
V
 
Y
L
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
Q
D
 
N
Y
 
-
G
 
-
K
 
E
G
 
I
A
 
P
L
 
L
K
 
P
N
 
T
H
 
T
Q
 
L
N
 
D
L
 
T
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
Y
V
 
T
L
 
V
A
 
F
D
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
K
 
K
D
 
P
F
 
F
S
 
L
I
 
P
Y
 
Y
R
 
-
G
 
-
A
 
V
S
 
S
L
 
L
I
 
F
T
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
E
S
 
V
E
 
E
F
 
A
E
 
T
T
 
L
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
 
V
C
 
K
V
 
V
D
 
T
E
 
D
A
 
T
E
 
E
L
 
S
V
 
A
A
 
F
K
 
S
G
 
A
L
 
I
Q
 
K
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
V
G
 
R
A
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
L
G
|
G
E
x
A
H
 
A
G
 
G
M
 
F
T
 
V
L
 
L
L
 
S
R
 
E
V
 
N
G
 
G
Q
 
A
P
 
E
A
 
P
L
 
V
H
 
H
L
 
V
P
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
H
R
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
V
D
 
D
V
x
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
T
 
C
V
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
I
 
M
A
 
S
A
 
R
G
 
G
E
 
R
D
 
N
L
 
L
P
 
L
H
 
E
A
 
A
V
 
C
A
 
K
L
 
R
A
 
A
N
|
N
L
 
E
A
 
C
A
|
A
G
 
A
I
 
I
V
 
S
V
 
V
G
 
T
K
 
R
L
 
K
G
 
G
T
 
T

6a8bA Ribokinase from leishmania donovani with amppcp (see paper)
25% identity, 62% coverage: 9:299/473 of query aligns to 11:312/327 of 6a8bA

query
sites
6a8bA
D
 
E
Q
 
Y
A
 
A
P
 
P
-
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
S
V
 
C
M
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
-
Y
 
-
W
 
-
H
 
Y
G
 
V
G
 
G
T
 
Y
S
 
V
R
 
D
I
 
H
S
 
M
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
P
 
G
V
 
E
P
 
T
V
 
M
V
 
H
K
 
S
V
 
V
D
 
S
Q
 
F
I
 
H
E
 
K
D
 
G
R
 
F
P
x
G
G
|
G
G
 
K
A
 
G
A
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
L
 
V
N
 
A
I
 
A
A
 
G
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
K
A
 
V
S
 
A
L
 
M
I
 
V
G
 
S
V
 
M
T
 
V
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
E
 
G
A
 
D
A
 
G
D
 
S
S
 
D
L
 
Y
A
 
I
N
 
K
S
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
D
S
 
T
V
 
A
F
 
Y
Q
 
M
-
 
F
R
 
R
I
 
T
A
 
G
H
 
K
Q
 
S
P
 
S
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
A
I
 
M
V
 
I
K
 
L
L
 
V
R
 
D
V
 
T
M
 
K
S
 
S
R
 
S
H
 
N
Q
 
N
Q
 
E
L
 
I
L
 
V
R
 
I
I
 
C
D
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
P
 
P
F
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
N
-
 
H
-
 
F
-
 
T
P
 
P
L
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
D
 
N
S
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
I
L
 
L
L
 
H
E
 
T
G
 
G
V
 
L
K
 
K
V
 
Y
L
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
Q
D
x
N
Y
 
-
G
 
-
K
 
E
G
x
I
A
 
P
L
 
L
K
 
P
N
 
T
H
 
T
Q
 
L
N
 
D
L
 
T
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
Y
V
 
T
L
 
V
A
 
F
D
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
P
-
 
A
-
x
E
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
K
 
K
D
 
P
F
 
F
S
 
L
I
 
P
Y
 
Y
R
 
-
G
 
-
A
 
V
S
 
S
L
 
L
I
 
F
T
 
C
P
 
P
N
 
N
L
 
E
S
 
V
E
 
E
F
 
A
E
 
T
T
 
L
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
 
V
C
 
K
V
 
V
D
 
T
E
 
D
A
 
T
E
 
E
L
 
S
V
 
A
A
 
F
K
 
S
G
 
A
L
 
I
Q
 
K
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
V
G
 
R
A
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
L
G
|
G
E
x
A
H
 
A
G
 
G
M
 
F
T
 
V
L
 
L
L
 
S
R
 
E
V
 
N
G
 
G
Q
 
A
P
 
E
A
 
P
L
 
V
H
 
H
L
 
V
P
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
H
R
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
V
D
 
D
V
x
T
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
T
 
C
V
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
I
 
M
A
 
S
A
 
R
G
 
G
E
 
R
D
 
N
L
 
L
P
 
L
H
 
E
A
 
A
V
 
C
A
 
K
L
 
R
A
 
A
N
|
N
L
 
E
A
 
C
A
|
A
G
 
A
I
 
I
V
 
S
V
|
V
G
 
T
K
 
R
L
 
K
G
 
G
T
 
T

6a8aA Ribokinase from leishmania donovani with atp (see paper)
25% identity, 62% coverage: 9:299/473 of query aligns to 11:312/327 of 6a8aA

query
sites
6a8aA
D
 
E
Q
 
Y
A
 
A
P
 
P
-
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
S
V
 
C
M
 
F
L
 
L
D
|
D
R
 
-
Y
 
-
W
 
-
H
 
Y
G
 
V
G
 
G
T
 
Y
S
 
V
R
 
D
I
 
H
S
 
M
P
 
P
E
 
Q
A
 
V
P
 
G
V
 
E
P
 
T
V
 
M
V
 
H
K
 
S
V
 
V
D
 
S
Q
 
F
I
 
H
E
 
K
D
 
G
R
 
F
P
x
G
G
|
G
G
 
K
A
 
G
A
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
L
 
V
N
 
A
I
 
A
A
 
G
A
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
K
A
 
V
S
 
A
L
 
M
I
 
V
G
 
S
V
 
M
T
 
V
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
E
 
G
A
 
D
A
 
G
D
 
S
S
 
D
L
 
Y
A
 
I
N
 
K
S
 
E
L
 
L
Q
 
E
A
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
D
S
 
T
V
 
A
F
 
Y
Q
 
M
-
 
F
R
 
R
I
 
T
A
 
G
H
 
K
Q
 
S
P
 
S
T
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
A
I
 
M
V
 
I
K
 
L
L
 
V
R
 
D
V
 
T
M
 
K
S
 
S
R
 
S
H
 
N
Q
 
N
Q
 
E
L
 
I
L
 
V
R
 
I
I
 
C
D
 
-
F
 
-
E
 
-
E
 
-
P
 
P
F
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
N
-
 
H
-
 
F
-
 
T
P
 
P
L
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
A
E
 
Q
V
 
T
D
 
N
S
 
N
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
I
L
 
L
L
 
H
E
 
T
G
 
G
V
 
L
K
 
K
V
 
Y
L
 
L
V
 
I
L
 
C
S
 
Q
D
 
N
Y
 
-
G
 
-
K
 
E
G
 
I
A
 
P
L
 
L
K
 
P
N
 
T
H
 
T
Q
 
L
N
 
D
L
 
T
I
 
I
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
R
 
H
A
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
V
P
 
Y
V
 
T
L
 
V
A
 
F
D
 
N
-
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
K
 
K
D
 
P
F
 
F
S
 
L
I
 
P
Y
 
Y
R
 
-
G
 
-
A
 
V
S
 
S
L
 
L
I
 
F
T
 
C
P
 
P
N
|
N
L
 
E
S
 
V
E
 
E
F
 
A
E
 
T
T
 
L
I
 
I
V
 
T
G
 
G
R
 
V
C
 
K
V
 
V
D
 
T
E
 
D
A
 
T
E
 
E
L
 
S
V
 
A
A
 
F
K
 
S
G
 
A
L
 
I
Q
 
K
L
 
A
L
 
L
Q
 
Q
D
 
Q
L
 
L
D
 
G
L
 
V
G
 
R
A
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
T
|
T
R
 
L
G
|
G
E
x
A
H
 
A
G
|
G
M
 
F
T
 
V
L
 
L
L
 
S
R
 
E
V
 
N
G
 
G
Q
 
A
P
 
E
A
 
P
L
 
V
H
 
H
L
 
V
P
 
T
A
 
G
R
 
K
A
 
H
R
 
V
E
 
K
V
 
A
F
 
V
D
 
D
V
x
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
 
D
T
 
C
V
 
F
I
 
V
S
 
G
T
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
Y
A
 
F
I
 
M
A
 
S
A
 
R
G
 
G
E
 
R
D
 
N
L
 
L
P
 
L
H
 
E
A
 
A
V
 
C
A
 
K
L
 
R
A
 
A
N
|
N
L
 
E
A
 
C
A
|
A
G
 
A
I
 
I
V
 
S
V
|
V
G
 
T
K
 
R
L
 
K
G
 
G
T
 
T

1n1dA Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase complexed with cdp-glycerol (see paper)
34% identity, 28% coverage: 340:470/473 of query aligns to 2:126/126 of 1n1dA

query
sites
1n1dA
K
 
K
I
 
K
V
 
V
F
 
I
T
 
T
N
 
Y
G
|
G
C
x
T
F
|
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
H
|
H
A
 
W
G
 
G
H
|
H
V
 
I
T
 
K
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
I
N
 
S
D
 
T
D
 
D
A
 
E
S
 
-
V
 
-
S
 
F
R
 
N
L
 
L
K
 
Q
G
x
K
P
 
Q
G
x
K
R
 
K
P
 
A
I
 
Y
N
 
H
S
 
S
V
 
Y
D
 
E
R
 
H
R
 
R
M
 
K
A
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
E
G
 
T
L
 
I
G
 
R
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
W
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
P
E
|
E
N
 
K
L
 
N
L
 
W
S
 
E
Q
 
Q
V
 
K
K
 
K
P
 
Q
D
 
D
V
 
I
L
 
I
V
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
Y
 
H
G
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
M
A
x
G
D
 
D
I
 
D
V
x
W
K
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
F
G
 
D
T
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
C
-
 
E
-
 
V
-
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
P
L
x
R
V
x
T
E
 
E
N
 
G
S
x
I
S
|
S
T
|
T
T
 
T
A
 
K
I
 
I
V
 
K
E
 
E
K
 
E
I
 
I

1cozA Ctp:glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase from bacillus subtilis (see paper)
34% identity, 28% coverage: 340:470/473 of query aligns to 2:126/126 of 1cozA

query
sites
1cozA
K
 
K
I
 
K
V
 
V
F
 
I
T
 
T
N
 
Y
G
 
G
C
x
T
F
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
H
|
H
A
 
W
G
 
G
H
|
H
V
 
I
T
 
K
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
I
N
 
S
D
 
T
D
 
D
A
 
E
S
 
-
V
 
-
S
 
F
R
 
N
L
 
L
K
 
Q
G
x
K
P
 
Q
G
x
K
R
 
K
P
 
A
I
 
Y
N
 
H
S
 
S
V
 
Y
D
 
E
R
 
H
R
 
R
M
 
K
A
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
E
G
 
T
L
 
I
G
 
R
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
W
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
N
 
K
L
 
N
L
 
W
S
 
E
Q
 
Q
V
 
K
K
 
K
P
 
Q
D
 
D
V
 
I
L
 
I
V
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
Y
 
H
G
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
M
A
x
G
D
 
D
I
 
D
V
 
W
K
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
F
G
 
D
T
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
C
-
 
E
-
 
V
-
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
P
L
x
R
V
x
T
E
 
E
N
 
G
S
x
I
S
|
S
T
|
T
T
|
T
A
 
K
I
 
I
V
 
K
E
 
E
K
 
E
I
 
I

P27623 Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase; GCT; GCTase; Gro-PCT; CDP-glycerol pyrophosphorylase; Teichoic acid biosynthesis protein D; EC 2.7.7.39 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 3 papers)
34% identity, 28% coverage: 340:470/473 of query aligns to 2:126/129 of P27623

query
sites
P27623
K
 
K
I
 
K
V
 
V
F
 
I
T
 
T
N
 
Y
G
 
G
C
x
T
F
|
F
D
|
D
I
 
L
L
 
L
H
|
H
A
x
W
G
|
G
H
|
H
V
 
I
T
 
K
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
Q
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
I
N
 
S
D
 
T
D
|
D
A
 
E
S
 
-
V
 
-
S
 
F
R
 
N
L
 
L
K
 
Q
G
x
K
P
 
Q
G
x
K
R
 
K
P
 
A
I
 
Y
N
 
H
S
 
S
V
 
Y
D
 
E
R
 
H
R
|
R
M
 
K
A
 
L
V
 
I
L
 
L
A
 
E
G
 
T
L
 
I
G
x
R
A
 
Y
V
 
V
D
|
D
W
 
E
V
 
V
I
 
I
S
 
-
F
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
E
N
 
K
L
 
N
L
x
W
S
 
E
Q
 
Q
V
x
K
K
 
K
P
 
Q
D
 
D
V
 
I
L
 
I
V
 
-
K
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
D
Y
x
H
G
 
N
I
 
I
D
 
D
Q
 
V
V
 
F
V
 
V
G
 
M
A
 
G
D
 
D
I
x
D
V
 
W
K
 
E
G
 
G
Y
 
K
G
 
F
G
 
D
T
 
F
V
 
L
K
 
K
-
 
D
-
 
Q
-
 
C
-
 
E
-
 
V
-
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
P
L
x
R
V
x
T
E
|
E
N
x
G
S
x
I
S
|
S
T
|
T
T
|
T
A
 
K
I
 
I
V
 
K
E
 
E
K
 
E
I
 
I

3ikhA Crystal structure of ribokinase in complex with atp and glycerol in the active site from klebsiella pneumoniae
25% identity, 55% coverage: 13:272/473 of query aligns to 4:242/286 of 3ikhA

query
sites
3ikhA
V
 
V
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
D
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
V
D
 
D
R
 
E
Y
 
T
W
 
W
H
 
S
G
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
I
P
 
P
E
 
D
A
 
I
P
 
P
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
A
-
 
S
V
 
I
P
 
H
V
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
V
D
 
S
Q
 
Q
I
 
-
E
 
-
D
 
D
R
 
I
P
 
G
G
 
G
G
 
K
A
 
G
A
 
A
N
 
N
V
 
Q
A
 
A
L
 
I
N
 
I
I
 
L
A
 
S
A
 
R
L
 
C
G
 
G
A
 
I
P
 
E
A
 
T
S
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
A
V
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
D
 
D
E
 
S
A
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
N
A
 
G
A
 
A
G
 
W
V
 
I
R
 
R
S
 
-
V
 
-
F
 
-
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
K
H
 
N
Q
 
E
P
 
P
-
 
L
T
 
M
I
 
L
V
 
L
K
 
P
L
 
D
R
 
G
V
 
H
M
 
F
S
 
N
R
 
Q
H
 
H
Q
 
S
Q
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
I
-
 
I
L
 
L
L
 
N
R
 
S
I
 
A
D
 
D
F
 
G
E
 
D
E
 
N
P
 
A
F
 
I
A
 
I
T
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
A
D
 
D
P
 
T
L
 
F
S
 
S
L
 
L
G
 
D
A
 
E
E
 
M
V
 
I
D
 
P
S
 
H
L
 
M
L
 
A
E
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
A
V
 
G
L
 
D
V
 
I
L
 
L
S
 
L
D
 
Q
Y
 
Q
G
 
G
K
 
N
G
 
F
A
 
S
L
 
L
K
 
D
N
 
K
H
 
T
Q
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
F
Q
 
Q
A
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
T
L
 
V
A
 
F
D
 
N
P
 
P
K
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
L
 
P
I
 
V
T
 
N
P
 
P
N
 
D
L
 
F
S
 
C
E
 
H
F
 
L
E
 
W
T
 
P
I
 
L
V
 
I
G
 
D
-
 
I
R
 
A
C
 
V
V
 
V
D
x
N
E
 
E
A
 
S
E
 
E
L
 
A
V
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
P
L
 
Y
D
 
G
L
 
V
G
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
V
V
 
I
T
|
T
R
 
Q
G
|
G
E
 
A
H
 
A
G
 
G
M
 
A
T
 
W
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
V
 
E
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
A
 
Q
L
 
F
H
 
-
L
 
C
P
 
P
A
 
A
R
 
V
A
 
P
R
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
V
x
F
I
 
L
S
 
A
T
 
V
L
 
M
A
 
L
A
 
A
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3i3yD Crystal structure of ribokinase in complex with d-ribose from klebsiella pneumoniae
25% identity, 55% coverage: 13:272/473 of query aligns to 3:241/285 of 3i3yD

query
sites
3i3yD
V
 
V
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
D
 
N
V
 
I
M
 
T
L
 
V
D
|
D
R
 
E
Y
 
T
W
 
W
H
 
S
G
 
-
G
 
-
T
 
-
S
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
I
P
 
P
E
 
D
A
 
I
P
 
P
-
 
K
-
 
K
-
 
G
-
 
A
-
 
S
V
 
I
P
 
H
V
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
V
D
 
S
Q
 
Q
I
 
-
E
 
-
D
 
D
R
 
I
P
x
G
G
|
G
G
x
K
A
 
G
A
 
A
N
|
N
V
 
Q
A
 
A
L
 
I
N
 
I
I
 
L
A
 
S
A
 
R
L
 
C
G
 
G
A
 
I
P
 
E
A
 
T
S
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
A
V
 
A
T
 
T
G
 
G
Q
 
N
D
 
D
E
 
S
A
 
-
A
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
Q
 
N
A
 
G
A
 
A
G
 
W
V
 
I
R
 
R
S
 
-
V
 
-
F
 
-
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
K
H
 
N
Q
 
E
P
 
P
-
 
L
T
 
M
I
 
L
V
 
L
K
 
P
L
 
D
R
 
G
V
 
H
M
 
F
S
 
N
R
 
Q
H
 
H
Q
 
S
Q
 
D
-
 
T
-
x
S
-
 
I
-
 
I
L
 
L
L
 
N
R
 
S
I
 
A
D
 
D
F
 
G
E
 
D
E
 
N
P
 
A
F
 
I
A
 
I
T
 
T
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
A
D
 
D
P
 
T
L
 
F
S
 
S
L
 
L
G
 
D
A
 
E
E
 
M
V
 
I
D
 
P
S
 
H
L
 
M
L
 
A
E
 
D
G
 
A
V
 
V
K
 
A
V
 
G
L
 
D
V
 
I
L
 
L
S
 
L
D
 
Q
Y
 
Q
G
 
G
K
 
N
G
 
F
A
 
S
L
 
L
K
 
D
N
 
K
H
 
T
Q
 
R
N
 
A
L
 
L
I
 
F
Q
 
Q
A
 
Y
A
 
A
R
 
R
A
 
S
K
 
R
G
 
G
I
 
M
P
 
T
V
 
T
L
 
V
A
 
F
D
 
N
P
 
P
K
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
S
L
 
P
I
 
V
T
 
N
P
 
P
N
 
D
L
 
F
S
 
C
E
 
H
F
 
L
E
 
W
T
 
P
I
 
L
V
 
I
G
 
D
-
 
I
R
 
A
C
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
E
A
 
S
E
 
E
L
 
A
V
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
D
 
P
L
 
Y
D
 
G
L
 
V
G
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
Q
G
 
G
E
 
A
H
 
A
G
 
G
M
 
A
T
 
W
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
V
 
E
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
A
 
Q
L
 
F
H
 
-
L
 
C
P
 
P
A
 
A
R
 
V
A
 
P
R
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
L
D
 
D
V
 
T
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
T
 
T
V
 
F
I
 
L
S
 
A
T
 
V
L
 
M
A
 
L
A
 
A
A
 
S

7qa7A Crystal structure of thE C-terminal catalytic domain of plasmodium falciparum ctp:phosphocholine cytidylyltransferase with cyclopropanemethylamine
31% identity, 28% coverage: 341:473/473 of query aligns to 5:132/136 of 7qa7A

query
sites
7qa7A
I
 
V
V
 
I
F
 
Y
T
 
A
N
x
D
G
 
G
C
 
V
F
 
Y
D
 
D
I
 
M
L
 
L
H
 
H
A
 
L
G
 
G
H
 
H
V
 
M
T
 
K
Y
 
Q
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
K
-
 
L
-
 
F
Q
 
E
G
 
N
D
 
T
R
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
G
V
 
V
N
 
T
D
 
S
D
 
D
A
 
N
S
 
E
V
 
T
S
 
K
R
 
L
L
 
F
K
 
K
G
 
-
P
 
-
G
 
G
R
 
Q
P
 
V
I
 
V
N
 
Q
S
 
T
V
 
L
D
 
E
R
 
E
R
 
R
M
 
T
A
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
K
G
 
H
L
 
I
G
 
R
A
 
W
V
 
V
D
 
D
W
 
E
V
 
I
I
 
I
S
 
S
F
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
P
 
P
E
 
C
N
 
P
L
x
W
L
 
V
S
 
-
Q
 
-
V
 
V
K
 
T
P
 
P
D
 
E
V
 
F
L
 
L
V
 
E
K
 
K
G
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
Y
G
 
K
I
 
I
D
 
D
Q
 
Y
V
 
V
V
 
A
G
 
H
A
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
E
K
 
D
G
 
I
Y
 
Y
-
 
A
-
 
W
-
 
L
-
 
K
-
 
R
G
 
A
G
 
G
T
 
K
V
 
F
K
 
K
V
 
A
L
 
T
G
 
Q
L
 
R
V
 
T
E
 
E
N
 
G
S
 
V
S
 
S
T
 
T
T
 
T
A
 
D
I
 
L
V
 
I
E
 
V
K
 
R
I
 
I
R
 
L
K
 
K
N
 
N

3b1rA Structure of burkholderia thailandensis nucleoside kinase (bthnk) in complex with amp-mg-amp (see paper)
27% identity, 52% coverage: 51:298/473 of query aligns to 47:287/310 of 3b1rA

query
sites
3b1rA
G
|
G
G
x
C
A
 
A
A
 
G
N
 
N
V
 
I
A
 
A
L
 
Y
N
 
A
I
 
L
A
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
D
A
 
A
S
 
R
L
 
M
I
 
M
G
 
G
V
 
T
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
D
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
P
S
 
Y
L
 
L
A
 
-
N
 
D
S
 
R
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
S
S
 
R
V
 
E
F
 
Y
Q
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
P
V
 
D
M
 
T
S
 
Y
R
 
S
H
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
M
L
 
I
R
 
T
I
 
T
D
 
D
F
 
L
E
 
D
E
x
N
P
 
N
F
 
Q
A
 
I
T
 
T
D
 
-
P
 
A
L
x
F
S
 
H
L
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
M
V
 
M
D
 
Q
S
 
S
L
 
H
L
 
V
-
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
A
E
 
K
G
 
D
V
 
I
K
 
K
V
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
V
S
 
G
D
x
P
Y
 
D
G
 
G
-
 
F
K
 
Q
G
 
G
A
 
M
L
 
V
K
 
Q
N
 
H
H
 
T
Q
 
E
N
 
E
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
F
L
 
I
A
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
-
G
 
G
K
x
Q
D
 
G
F
 
L
S
 
P
I
 
L
Y
 
F
R
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
-
T
 
-
P
 
R
N
 
R
L
 
S
S
 
I
E
 
E
F
 
L
E
 
A
T
 
T
I
 
Y
V
 
I
G
 
A
R
 
V
C
 
N
V
 
D
D
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
C
K
 
D
G
 
K
L
 
T
Q
 
G
L
 
W
L
 
S
Q
 
E
D
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
A
L
 
S
D
 
R
L
 
V
G
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
I
V
 
I
T
|
T
R
 
R
G
|
G
E
|
E
H
 
H
G
|
G
M
 
A
T
 
T
L
 
I
L
 
-
R
 
R
V
 
H
G
 
R
Q
 
D
P
 
G
A
 
T
L
 
E
H
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
A
-
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
E
E
 
R
V
 
V
F
 
I
D
|
D
V
x
P
T
 
T
G
|
G
A
x
C
G
 
G
D
|
D
T
 
A
V
x
F
I
 
R
S
 
G
T
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
Y
A
 
G
I
 
I
A
 
E
A
 
H
G
 
G
E
 
F
D
 
D
L
 
W
P
 
A
H
 
T
A
 
A
V
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
A
N
x
S
L
 
L
A
 
M
A
x
G
G
 
A
I
 
L
V
 
K
V
x
I
G
 
A
K
 
H
L
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3b1nB Structure of burkholderia thailandensis nucleoside kinase (bthnk) in complex with adp-mizoribine (see paper)
27% identity, 52% coverage: 51:298/473 of query aligns to 47:287/320 of 3b1nB

query
sites
3b1nB
G
|
G
G
x
C
A
 
A
A
 
G
N
|
N
V
 
I
A
 
A
L
 
Y
N
 
A
I
 
L
A
 
N
A
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
G
P
 
D
A
 
A
S
 
R
L
 
M
I
 
M
G
 
G
V
 
T
T
 
L
G
 
G
Q
 
A
D
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
Q
D
 
P
S
 
Y
L
 
L
A
 
-
N
 
D
S
 
R
L
 
M
Q
 
D
A
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
S
S
 
R
V
 
E
F
 
Y
Q
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
P
V
 
D
M
 
T
S
 
Y
R
 
S
H
 
A
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
M
L
 
I
R
 
T
I
 
T
D
 
D
F
 
L
E
 
D
E
x
N
P
 
N
F
 
Q
A
 
I
T
 
T
D
 
-
P
 
A
L
x
F
S
 
H
L
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
M
V
 
M
D
 
Q
S
 
S
L
 
H
L
 
V
-
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
A
E
 
K
G
 
D
V
 
I
K
 
K
V
 
L
L
 
A
V
 
I
L
 
V
S
 
G
D
 
P
Y
 
D
G
 
G
-
 
F
K
 
Q
G
 
G
A
 
M
L
 
V
K
 
Q
N
 
H
H
 
T
Q
 
E
N
 
E
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
-
R
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
G
I
 
V
P
 
P
V
 
F
L
 
I
A
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
-
G
 
G
K
x
Q
D
 
G
F
 
L
S
 
P
I
 
L
Y
 
F
R
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
T
L
 
L
I
 
-
T
 
-
P
 
R
N
 
R
L
 
S
S
 
I
E
 
E
F
 
L
E
 
A
T
 
T
I
 
Y
V
 
I
G
 
A
R
 
V
C
 
N
V
 
D
D
 
Y
E
 
E
A
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
C
K
 
D
G
 
K
L
 
T
Q
 
G
L
 
W
L
 
S
Q
 
E
D
 
D
-
 
E
-
 
I
-
 
A
L
 
S
D
 
R
L
 
V
G
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
I
V
 
I
T
|
T
R
 
R
G
|
G
E
|
E
H
 
H
G
|
G
M
 
A
T
 
T
L
 
I
L
 
-
R
 
R
V
 
H
G
 
R
Q
 
D
P
 
G
A
 
T
L
 
E
H
 
Q
L
 
I
P
 
P
A
 
A
-
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
E
E
 
R
V
 
V
F
 
I
D
 
D
V
 
P
T
 
T
G
|
G
A
x
C
G
|
G
D
|
D
T
 
A
V
 
F
I
 
R
S
 
G
T
 
G
L
 
L
A
 
L
A
 
Y
A
 
G
I
 
I
A
 
E
A
 
H
G
 
G
E
 
F
D
 
D
L
 
W
P
 
A
H
 
T
A
 
A
V
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
A
N
x
S
L
 
L
A
 
M
A
x
G
G
 
A
I
 
L
V
 
K
V
x
I
G
 
A
K
 
H
L
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>PP_4934 FitnessBrowser__Putida:PP_4934
MKLSMPRFDQAPVLVVGDVMLDRYWHGGTSRISPEAPVPVVKVDQIEDRPGGAANVALNI
AALGAPASLIGVTGQDEAADSLANSLQAAGVRSVFQRIAHQPTIVKLRVMSRHQQLLRID
FEEPFATDPLSLGAEVDSLLEGVKVLVLSDYGKGALKNHQNLIQAARAKGIPVLADPKGK
DFSIYRGASLITPNLSEFETIVGRCVDEAELVAKGLQLLQDLDLGALLVTRGEHGMTLLR
VGQPALHLPARAREVFDVTGAGDTVISTLAAAIAAGEDLPHAVALANLAAGIVVGKLGTA
AISAPELRRAIQREEGSERGVLGLEQLLLAIDDARAHNEKIVFTNGCFDILHAGHVTYLE
QARAQGDRLIVAVNDDASVSRLKGPGRPINSVDRRMAVLAGLGAVDWVISFPEGTPENLL
SQVKPDVLVKGGDYGIDQVVGADIVKGYGGTVKVLGLVENSSTTAIVEKIRKN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory