SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing PP_5163 FitnessBrowser__Putida:PP_5163 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
54% identity, 95% coverage: 4:181/188 of query aligns to 4:182/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
S
 
T
E
 
E
K
 
K
H
 
D
K
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
A
G
 
G
Q
 
E
L
 
M
Y
 
Y
H
 
I
A
 
A
G
 
D
C
 
D
P
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
V
A
 
A
E
 
D
Q
 
R
I
 
V
A
 
E
N
 
A
K
 
K
H
 
R
W
 
L
M
 
T
H
 
R
R
 
L
Y
 
Y
N
 
N
N
 
E
S
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
T
L
 
G
N
 
D
D
 
E
A
 
R
R
 
R
H
 
F
G
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
N
E
 
Q
H
 
L
F
 
L
G
 
G
Q
 
S
V
 
S
G
 
A
E
 
D
G
 
G
-
 
K
A
 
A
V
 
Q
I
 
I
R
 
N
P
 
P
P
 
D
F
 
F
Y
 
R
C
 
C
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
S
 
H
V
 
V
G
 
G
R
 
K
N
 
S
T
 
F
F
|
F
M
 
A
N
 
N
F
 
F
N
 
N
C
 
C
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
C
P
 
E
V
 
V
R
 
R
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
C
 
C
Q
 
M
I
 
F
G
x
A
P
 
P
N
 
G
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
Y
|
Y
T
 
T
A
|
A
D
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
H
P
 
P
E
 
V
V
 
E
R
 
R
R
 
N
S
 
S
G
 
G
L
 
K
E
 
E
S
 
Y
G
 
G
R
 
K
P
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
L
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
I
G
x
A
A
x
S
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
V
 
V

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
49% identity, 96% coverage: 2:181/188 of query aligns to 1:180/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
S
 
A
L
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
K
H
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
S
G
 
G
Q
 
K
L
 
G
Y
 
Y
H
 
Y
A
 
A
G
 
N
C
 
D
P
 
E
E
 
L
L
 
L
Q
 
V
A
 
K
E
 
E
Q
 
R
I
 
E
A
 
Y
N
 
C
K
 
K
H
 
K
W
 
L
M
 
T
H
 
R
R
 
L
Y
 
F
N
 
N
N
 
N
S
 
T
V
 
L
E
 
E
L
 
D
L
 
E
N
 
Y
D
 
E
A
 
K
R
 
R
H
 
E
G
 
D
L
 
I
L
 
L
V
 
R
E
 
Q
H
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
K
G
 
Q
A
 
I
V
 
N
I
 
V
R
 
E
P
 
Q
P
 
N
F
 
I
Y
 
R
C
 
C
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
S
 
H
V
 
V
G
 
G
R
 
E
N
 
N
T
 
F
F
 
F
M
 
A
N
|
N
F
 
Y
N
 
D
C
 
C
V
 
I
I
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
C
P
 
K
V
 
I
R
 
E
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
N
C
 
V
Q
 
M
I
 
L
G
x
A
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
Y
H
 
H
P
 
P
L
 
I
D
 
D
P
 
A
E
 
Q
V
 
L
R
 
R
R
 
N
S
 
S
G
 
G
L
 
I
E
 
E
S
 
Y
G
 
G
R
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
G
|
G
A
 
G
A
 
V
I
 
I
I
 
I
L
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
T
T
 
V
V
 
A
V
|
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
41% identity, 96% coverage: 1:181/188 of query aligns to 1:181/203 of P07464

query
sites
P07464
M
|
M
S
 
N
L
 
M
S
 
P
E
 
M
K
 
T
H
 
E
K
 
R
M
 
I
L
 
R
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Y
 
F
H
 
T
A
x
D
G
 
M
C
 
C
P
 
E
E
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
E
E
 
K
Q
 
R
I
 
L
A
 
R
N
 
G
K
 
K
H
 
T
W
 
L
M
 
M
H
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
N
 
H
S
 
S
V
 
H
E
 
P
L
 
S
L
 
E
N
 
V
D
 
E
A
 
K
R
 
R
H
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
K
E
 
E
H
 
M
F
 
F
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
Y
 
Y
C
 
F
D
x
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
T
 
F
F
 
Y
M
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
x
D
V
 
Y
P
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
N
C
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
Y
 
S
T
 
V
A
 
T
D
 
G
H
|
H
P
 
P
L
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
L
 
E
E
 
M
S
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
G
x
S
A
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
S
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
V
P
 
P
A
 
C
R
|
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
41% identity, 96% coverage: 1:181/188 of query aligns to 2:180/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
M
 
M
S
 
P
L
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
R
H
 
-
K
 
-
M
 
I
L
 
R
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Y
 
F
H
 
T
A
x
D
G
 
M
C
 
C
P
 
E
E
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
E
E
 
K
Q
x
R
I
 
L
A
 
R
N
 
G
K
 
K
H
 
T
W
 
L
M
 
M
H
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
N
 
H
S
 
S
V
 
H
E
 
P
L
 
S
L
 
E
N
 
V
D
 
E
A
 
K
R
 
R
H
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
K
E
 
E
H
 
M
F
 
F
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
Y
 
Y
C
 
F
D
x
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
T
 
F
F
x
Y
M
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
x
V
D
 
D
V
x
D
V
 
Y
P
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
N
C
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
x
A
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
Y
x
S
T
 
V
A
x
T
D
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
L
 
E
E
x
M
S
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
G
x
S
A
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
S
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
|
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
41% identity, 96% coverage: 1:181/188 of query aligns to 2:180/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
M
 
M
S
 
P
L
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
R
H
 
-
K
 
-
M
 
I
L
 
R
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Y
 
F
H
 
T
A
x
D
G
 
M
C
 
C
P
 
E
E
 
G
L
 
L
Q
x
P
A
 
E
E
 
K
Q
x
R
I
 
L
A
 
R
N
 
G
K
 
K
H
 
T
W
 
L
M
 
M
H
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
N
 
H
S
 
S
V
 
H
E
 
P
L
 
S
L
 
E
N
 
V
D
 
E
A
 
K
R
 
R
H
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
K
E
 
E
H
 
M
F
 
F
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
N
A
 
A
V
x
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
Y
 
Y
C
 
F
D
x
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
T
 
F
F
x
Y
M
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
x
V
D
 
D
V
x
D
V
 
Y
P
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
N
C
 
V
Q
x
L
I
 
I
G
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
Y
 
S
T
 
V
A
 
T
D
 
G
H
|
H
P
 
P
L
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
L
 
E
E
x
M
S
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
G
x
S
A
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
S
I
 
V
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
41% identity, 96% coverage: 1:181/188 of query aligns to 2:180/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
M
 
M
S
 
P
L
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
R
H
 
-
K
 
-
M
 
I
L
 
R
T
 
A
G
 
G
Q
 
K
L
 
L
Y
 
F
H
 
T
A
 
D
G
 
M
C
 
C
P
 
E
E
 
G
L
 
L
Q
 
P
A
 
E
E
 
K
Q
 
R
I
 
L
A
 
R
N
 
G
K
 
K
H
 
T
W
 
L
M
 
M
H
 
Y
R
 
E
Y
 
F
N
 
N
N
 
H
S
 
S
V
 
H
E
 
P
L
 
S
L
 
E
N
 
V
D
 
E
A
 
K
R
 
R
H
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
I
V
 
K
E
 
E
H
 
M
F
 
F
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
N
A
 
A
V
 
W
I
 
V
R
 
E
P
 
P
P
 
P
F
 
V
Y
 
Y
C
 
F
D
 
S
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
S
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
N
T
 
F
F
 
Y
M
 
A
N
|
N
F
 
F
N
 
N
C
 
L
V
 
T
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
 
D
V
 
Y
P
 
T
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
N
C
 
V
Q
 
L
I
|
I
G
x
A
P
|
P
N
 
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
L
Y
 
S
T
 
V
A
x
T
D
 
G
H
|
H
P
 
P
L
 
V
D
 
H
P
 
H
E
 
E
V
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
N
G
 
G
L
 
E
E
 
M
S
 
Y
G
 
S
R
 
F
P
 
P
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
G
x
S
A
 
H
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
N
A
 
S
I
 
V
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
N
A
 
V
T
 
V
V
 
A
V
x
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
 
R
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
40% identity, 96% coverage: 1:181/188 of query aligns to 2:180/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
M
 
M
S
 
K
L
 
M
S
 
S
E
 
E
K
 
L
H
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
H
Y
 
F
H
 
D
A
 
G
G
 
A
C
 
S
P
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
A
E
 
L
Q
 
R
I
 
S
A
 
Q
N
 
A
K
 
G
H
 
R
W
 
L
M
 
K
H
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
N
N
 
Q
S
 
S
V
 
L
E
 
D
L
 
-
L
 
-
N
 
E
D
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
R
E
 
E
H
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
G
 
G
E
 
H
G
 
K
A
 
S
V
 
C
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
H
C
 
C
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
Y
 
K
N
 
T
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
H
T
 
T
F
 
F
M
 
I
N
 
N
F
 
M
N
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
A
P
 
P
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
C
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
|
G
P
 
P
N
 
S
V
 
T
Q
 
Q
I
 
F
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
S
H
|
H
P
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
R
V
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
A
G
 
W
L
 
E
E
 
T
S
 
I
G
 
C
R
 
K
P
 
P
V
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
G
 
G
A
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
R
A
 
S
I
 
V
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
40% identity, 95% coverage: 3:181/188 of query aligns to 1:177/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
L
 
M
S
 
S
E
 
E
K
 
L
H
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
E
L
 
H
Y
 
F
H
 
D
A
 
G
G
 
A
C
 
S
P
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
A
E
 
L
Q
 
R
I
 
S
A
 
Q
N
 
A
K
 
G
H
 
R
W
 
L
M
 
K
H
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
N
N
 
Q
S
 
S
V
 
L
E
 
D
L
 
-
L
 
-
N
 
E
D
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
R
E
 
E
H
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
G
 
G
E
 
H
G
 
K
A
 
S
V
 
C
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
H
C
 
C
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
Y
 
K
N
 
T
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
H
T
 
T
F
 
F
M
 
I
N
 
N
F
 
M
N
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
A
P
 
P
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
C
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
V
 
T
Q
 
Q
I
 
F
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
S
H
|
H
P
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
R
V
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
A
G
 
W
L
 
E
E
 
T
S
 
I
G
 
C
R
 
K
P
 
P
V
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
G
 
G
A
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
R
A
 
S
I
 
V
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
x
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
39% identity, 95% coverage: 3:181/188 of query aligns to 1:180/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
L
 
M
S
 
T
E
 
E
K
 
K
H
 
E
K
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
A
G
 
E
Q
 
K
L
 
W
Y
 
Y
H
 
D
A
 
A
G
 
N
C
 
F
P
 
D
E
 
Q
-
 
Y
L
 
L
Q
 
I
A
 
N
E
 
E
Q
 
R
I
 
A
A
 
R
N
 
A
K
 
K
H
 
D
W
 
I
M
 
C
H
 
F
R
 
E
Y
 
L
N
 
N
N
 
H
S
 
T
V
 
R
E
 
P
L
 
S
L
 
A
N
 
T
D
 
N
A
 
K
R
 
R
H
 
K
G
 
E
L
 
L
L
 
I
V
 
D
E
 
Q
H
 
L
F
 
F
G
 
Q
Q
 
T
V
 
T
G
 
T
E
 
D
G
 
N
A
 
V
V
 
S
I
 
I
R
 
S
P
 
I
P
 
P
F
 
F
Y
 
D
C
 
T
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
Y
 
W
N
 
N
I
 
V
S
 
K
V
 
L
G
 
G
R
 
K
N
 
N
T
 
V
F
 
Y
M
 
V
N
 
N
F
 
T
N
 
N
C
 
C
V
 
Y
I
 
F
L
x
M
D
 
D
V
 
G
V
 
G
P
 
Q
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
N
C
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
V
 
C
Q
 
G
I
 
F
Y
|
Y
T
 
T
A
|
A
D
 
T
H
|
H
P
 
P
L
 
L
D
 
N
P
 
F
E
 
H
V
 
H
R
 
R
R
 
N
S
 
E
G
 
G
L
 
F
E
 
E
S
 
K
G
 
A
R
 
G
P
 
P
V
 
I
T
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
S
N
 
N
V
 
T
W
 
W
I
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
H
A
 
V
I
 
A
I
 
V
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
P
G
 
H
A
 
S
T
 
L
V
 
A
V
 
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
K
V
 
V

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
41% identity, 93% coverage: 8:181/188 of query aligns to 3:170/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
K
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
-
L
 
-
Y
 
-
H
 
H
A
 
A
G
 
S
C
 
A
P
 
-
E
 
E
L
 
I
Q
 
E
A
 
A
E
 
L
Q
 
R
I
 
S
A
 
Q
N
 
A
K
 
G
H
 
R
W
 
L
M
 
K
H
 
L
R
 
E
Y
 
I
N
 
N
N
 
Q
S
 
S
V
 
L
E
 
D
L
 
-
L
 
-
N
 
E
D
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Q
V
 
R
E
 
E
H
 
L
F
 
F
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
G
 
G
E
 
H
G
 
K
A
 
S
V
 
C
I
 
V
R
 
Q
P
 
P
P
 
P
F
 
F
Y
 
H
C
 
C
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
Y
 
K
N
 
T
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
D
N
 
H
T
 
T
F
 
F
M
 
I
N
 
N
F
 
M
N
 
N
C
 
V
V
 
V
I
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
A
P
 
P
V
 
I
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
D
D
 
H
C
 
V
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
V
 
T
Q
 
Q
I
 
F
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
D
 
S
H
 
H
P
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
R
V
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
A
G
 
W
L
 
E
E
 
T
S
 
I
G
 
C
R
 
K
P
 
P
V
 
I
T
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
N
P
 
Q
G
|
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
N
 
R
A
 
S
I
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
N
R
 
Q
D
|
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
D
A
 
T
T
 
L
V
 
V
V
 
G
G
 
G
N
 
T
P
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
I

A1ADJ6 Polysialic acid O-acetyltransferase; Capsule O-acetyl transferase; EC 2.3.1.136 from Escherichia coli O1:K1 / APEC (see paper)
29% identity, 68% coverage: 54:181/188 of query aligns to 147:276/307 of A1ADJ6

query
sites
A1ADJ6
H
 
N
F
 
Y
G
 
V
Q
 
R
V
 
I
G
 
H
E
 
K
G
 
N
A
 
S
V
 
K
I
 
I
R
 
K
P
 
G
P
 
D
F
 
I
Y
 
V
C
 
A
D
 
T
Y
 
K
G
 
G
Y
 
S
N
 
K
I
 
V
S
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
R
T
 
T
F
 
T
M
 
I
N
 
G
-
 
A
-
 
G
F
 
F
N
 
E
C
 
-
V
 
V
I
 
V
L
 
T
D
 
D
V
 
K
V
 
C
P
 
N
V
 
V
R
 
T
I
 
I
G
 
G
E
 
H
D
 
D
C
 
C
Q
 
M
I
 
I
G
 
A
P
 
R
N
 
D
V
 
V
Q
 
I
I
 
L
Y
 
R
T
 
A
A
 
S
D
 
D
-
 
G
H
|
H
P
 
P
L
 
I
D
 
F
P
 
D
E
 
I
V
 
H
R
 
S
R
 
K
S
 
K
G
 
R
L
 
I
E
 
N
S
 
W
G
 
A
R
 
K
P
 
D
V
 
I
T
 
I
I
 
I
G
 
S
D
 
S
N
 
Y
V
 
V
W
|
W
I
 
V
G
 
G
G
 
R
A
 
N
A
 
V
I
 
S
I
 
I
L
 
M
P
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
G
D
 
S
N
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
S
G
 
M
A
 
C
T
 
A
V
 
A
V
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
V
 
I

4mzuF Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
34% identity, 69% coverage: 52:181/188 of query aligns to 19:140/294 of 4mzuF

query
sites
4mzuF
V
 
V
E
x
W
H
x
Q
F
 
F
G
 
C
Q
 
V
V
 
I
G
 
L
E
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
Y
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
G
Y
 
R
N
 
N
I
 
C
S
 
N
V
 
I
G
x
C
R
 
A
N
 
N
T
 
S
F
 
L
M
 
I
N
 
E
F
 
N
N
 
D
C
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
G
D
 
D
V
 
N
V
 
V
P
 
T
V
 
I
R
 
K
I
 
S
G
 
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
Q
E
 
D
D
 
D
C
 
V
Q
 
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
F
Y
 
T
T
x
N
A
x
D
D
x
K
H
 
Q
P
 
P
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
R
S
 
S
G
 
K
L
 
I
E
 
K
S
 
T
G
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
I
I
 
V
G
 
K
D
 
K
N
 
G
V
 
A
W
 
S
I
 
I
G
|
G
G
x
A
A
 
N
A
 
S
I
 
T
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
M
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
N
A
 
A
T
 
I
V
 
V
V
x
I
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
34% identity, 69% coverage: 52:181/188 of query aligns to 19:139/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
V
 
V
E
x
W
H
x
Q
F
 
F
G
 
C
Q
 
V
V
 
I
G
 
L
E
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
I
R
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
Y
 
-
C
 
-
D
 
-
Y
 
-
G
 
G
Y
 
R
N
 
N
I
 
C
S
 
N
V
 
I
G
x
C
R
x
A
N
 
N
T
 
S
F
 
L
M
 
I
N
 
E
F
 
N
N
 
D
C
 
V
V
 
V
I
 
I
L
 
G
D
 
D
V
 
N
V
 
V
P
 
T
V
 
I
R
 
K
I
 
S
G
|
G
-
 
V
-
 
Q
-
 
I
-
 
W
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
I
-
 
Q
E
 
D
D
 
D
C
 
V
Q
x
F
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
V
 
V
Q
 
T
I
 
-
Y
 
F
T
|
T
A
x
N
D
|
D
H
x
K
P
 
-
L
 
-
D
 
Q
P
|
P
E
 
R
V
 
S
R
 
L
R
 
K
S
 
T
G
 
I
L
 
V
E
 
K
S
 
K
G
 
G
R
 
A
P
 
S
V
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
N
 
-
V
 
-
W
 
-
I
 
I
G
|
G
G
x
A
A
 
N
A
 
S
I
 
T
I
 
I
L
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
M
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
|
T
R
x
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
D
G
 
N
A
 
A
T
 
I
V
 
V
V
x
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P50870 Streptogramin A acetyltransferase; Virginiamycin acetyltransferase D; Vat(D); EC 2.3.1.- from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see paper)
35% identity, 56% coverage: 75:179/188 of query aligns to 29:161/209 of P50870

query
sites
P50870
N
 
N
I
 
V
S
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
E
N
 
Y
T
 
S
F
 
Y
M
 
Y
N
 
D
-
 
S
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
T
F
 
F
N
 
D
C
 
K
V
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
Y
V
 
H
V
 
Y
P
 
P
V
 
I
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
K
D
 
F
C
 
C
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
I
Y
 
I
T
 
M
-
 
N
-
 
G
A
 
A
D
 
N
H
|
H
P
 
R
L
 
M
D
 
D
P
 
G
E
 
S
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
F
-
 
N
V
 
L
R
 
F
R
 
G
S
 
N
G
 
G
L
 
W
E
 
E
S
 
K
G
 
H
R
 
M
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
G
 
K
A
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
M
T
 
L
V
 
A
V
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A

3dhoA Structure of streptogramin acetyltransferase in complex with an inhibitor
39% identity, 45% coverage: 96:179/188 of query aligns to 61:161/203 of 3dhoA

query
sites
3dhoA
V
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
K
D
 
F
C
 
C
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
I
Y
 
I
T
 
M
-
 
N
-
 
G
A
 
A
D
 
N
H
 
H
P
 
R
L
x
M
D
 
D
P
 
G
E
 
S
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
F
-
 
N
V
 
L
R
 
F
R
 
G
S
 
N
G
 
G
L
 
W
E
 
E
S
 
K
G
 
H
R
 
M
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
G
 
K
A
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
G
A
 
A
I
|
I
V
 
V
G
x
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
M
T
x
L
V
 
A
V
x
G
G
 
G
N
 
N
P
|
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1mrlA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase with dalfopristin (see paper)
35% identity, 56% coverage: 75:179/188 of query aligns to 29:161/204 of 1mrlA

query
sites
1mrlA
N
 
N
I
 
V
S
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
E
N
 
Y
T
 
S
F
x
Y
M
 
Y
N
x
D
-
 
S
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
T
F
 
F
N
 
D
C
 
K
V
 
Q
I
 
I
L
 
L
D
 
Y
V
 
H
V
x
Y
P
 
P
V
x
I
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
K
D
 
F
C
 
C
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
I
Y
 
I
T
 
M
-
 
N
-
 
G
A
 
A
D
x
N
H
|
H
P
 
R
L
 
M
D
 
D
P
 
G
E
 
S
V
 
T
R
 
Y
R
 
P
-
 
F
-
 
N
-
x
L
-
 
F
-
 
G
S
 
N
G
 
G
L
 
W
E
 
E
S
 
K
G
 
H
R
x
M
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
x
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
G
 
K
A
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
M
T
 
L
V
 
A
V
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A

1khrA Crystal structure of vat(d) in complex with virginiamycin and coenzyme a (see paper)
39% identity, 45% coverage: 96:179/188 of query aligns to 61:161/206 of 1khrA

query
sites
1khrA
V
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
K
D
 
F
C
 
C
Q
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
I
Y
 
I
T
 
M
-
 
N
-
 
G
A
|
A
D
x
N
H
|
H
P
 
R
L
x
M
D
 
D
P
 
G
E
 
S
V
 
T
R
 
Y
R
 
P
-
 
F
-
 
N
-
x
L
-
 
F
-
 
G
S
 
N
G
 
G
L
 
W
E
 
E
S
 
K
G
 
H
R
 
M
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
 
G
G
 
K
A
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
M
T
x
L
V
 
A
V
x
G
G
 
G
N
 
N
P
|
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1kk4A Crystal structure of vat(d) in complex with acetyl-coa (see paper)
39% identity, 45% coverage: 96:179/188 of query aligns to 61:161/205 of 1kk4A

query
sites
1kk4A
V
 
L
R
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
K
D
 
F
C
 
C
Q
 
S
I
|
I
G
|
G
P
 
P
N
 
G
V
 
V
Q
 
T
I
 
I
Y
 
I
T
 
M
-
 
N
-
 
G
A
 
A
D
 
N
H
 
H
P
 
R
L
 
M
D
 
D
P
 
G
E
 
S
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
-
 
F
-
 
N
V
 
L
R
 
F
R
 
G
S
 
N
G
 
G
L
 
W
E
 
E
S
 
K
G
 
H
R
 
M
P
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
x
K
-
 
G
-
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
N
N
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
G
x
K
A
 
D
A
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
M
T
x
L
V
 
A
V
x
G
G
|
G
N
 
N
P
|
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
47% identity, 46% coverage: 96:181/188 of query aligns to 154:232/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
V
 
V
R
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
T
C
 
A
Q
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
N
N
 
N
V
 
V
Q
 
S
I
 
I
Y
x
L
T
 
-
A
 
-
D
 
-
H
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
H
E
 
H
V
 
V
R
 
T
R
 
L
S
 
G
G
|
G
L
 
T
E
 
G
S
 
G
G
 
D
R
 
R
P
 
H
V
 
P
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
G
V
 
V
W
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
G
A
 
A
I
 
T
I
 
I
L
 
L
P
 
G
G
 
N
V
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
E
N
 
G
A
 
A
I
x
K
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
L
R
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
R
A
 
T
T
 
T
V
 
A
V
|
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
V
 
L

Sites not aligning to the query:

8vr6A Crystal structure of the pcryo_0619 n-acetryltransferase from psychrobacter cryohalolentis k5 in the presence of coa-disulfide
37% identity, 55% coverage: 76:179/188 of query aligns to 61:165/177 of 8vr6A

query
sites
8vr6A
I
 
V
S
 
K
V
 
V
G
 
G
R
 
K
N
 
D
T
 
T
F
 
W
M
 
I
N
 
G
F
 
P
N
 
N
C
 
-
V
 
T
I
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
G
V
 
S
P
 
G
V
 
G
R
 
G
I
 
L
G
 
I
E
 
I
-
 
G
-
 
S
D
 
N
C
 
C
Q
 
S
I
 
I
G
 
S
P
 
A
N
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
Y
|
Y
T
 
T
A
x
H
D
|
D
H
 
-
P
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
-
E
x
T
V
 
V
R
 
R
R
 
K
S
 
S
G
 
-
L
 
L
E
 
S
S
 
G
G
 
G
R
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
A
P
 
S
V
 
T
T
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
S
N
 
D
V
 
C
W
 
Y
I
 
L
G
 
G
G
 
P
A
 
N
A
 
T
I
 
I
I
 
I
L
x
V
P
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
N
 
R
A
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
S
 
S
V
x
L
V
 
V
T
x
L
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
S
G
 
D
A
 
C
T
 
K
V
 
V
V
 
F
G
 
G
N
x
S
P
|
P
A
 
A

Query Sequence

>PP_5163 FitnessBrowser__Putida:PP_5163
MSLSEKHKMLTGQLYHAGCPELQAEQIANKHWMHRYNNSVELLNDARHGLLVEHFGQVGE
GAVIRPPFYCDYGYNISVGRNTFMNFNCVILDVVPVRIGEDCQIGPNVQIYTADHPLDPE
VRRSGLESGRPVTIGDNVWIGGAAIILPGVTIGDNAIVGAGSVVTRDVPAGATVVGNPAR
VRQPDQGQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory