SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_1020 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_1020 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3dufA Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:324/332 of query aligns to 43:365/365 of 3dufA

query
sites
3dufA
L
 
L
T
 
K
R
 
E
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
K
 
R
A
 
S
V
 
I
A
x
S
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
F
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
S
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
V
 
S
G
 
H
S
 
F
L
 
A
M
 
L
H
 
E
A
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
L
 
I
I
 
L
P
 
P
Y
 
G
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
V
A
 
P
V
 
Q
Q
 
I
L
 
I
M
 
W
R
 
H
G
 
G
V
 
L
R
 
P
M
 
L
E
 
Y
E
 
Q
I
 
A
L
 
F
L
 
L
Y
 
F
W
 
S
G
 
R
G
 
G
D
 
H
E
 
F
R
 
H
G
 
G
S
 
N
D
 
Q
F
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
V
 
G
A
 
V
Q
 
N
D
 
V
F
 
L
P
 
P
I
 
P
C
 
Q
V
x
I
P
 
I
I
|
I
A
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
I
H
 
Q
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
L
A
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
M
R
 
R
G
 
G
E
 
K
H
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
Y
C
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Q
 
K
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
V
V
 
V
N
 
Q
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
W
x
F
A
|
A
I
 
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
E
I
 
K
Q
 
Q
C
 
T
G
 
V
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
I
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
I
H
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
T
L
 
L
S
 
C
Y
 
F
R
|
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
|
T
-
 
M
T
 
S
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
P
T
 
T
R
 
R
Y
|
Y
R
 
R
S
 
S
A
 
-
D
 
K
E
 
E
V
 
L
K
 
E
Q
 
N
A
 
E
W
 
W
L
 
A
-
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
L
K
 
V
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
G
 
E
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
A
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
E
E
 
Q
C
 
A
Q
 
K
G
 
E
L
 
E
V
 
I
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
K
N
 
K
F
 
A
E
 
D
A
 
E
A
 
T
G
 
P
L
 
K
Q
 
Q
A
 
K
P
 
V
E
 
T
S
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
S
H
 
I
V
 
M
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
W
 
L
P
 
P
Q
 
F
A
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
E
 
E
D
 
I
F
 
Y
L
 
K
E
 
E
R
 
K
V
 
E
A
 
S
R
 
K

1w85A The crystal structure of pyruvate dehydrogenase e1 bound to the peripheral subunit binding domain of e2 (see paper)
39% identity, 97% coverage: 1:321/332 of query aligns to 43:356/358 of 1w85A

query
sites
1w85A
L
 
L
T
 
K
R
 
E
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
K
 
R
A
 
S
V
 
I
A
x
S
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
F
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
S
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
V
 
S
G
 
H
S
 
F
L
 
A
M
 
L
H
 
E
A
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
L
 
I
I
 
L
P
 
P
Y
 
G
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
V
A
 
P
V
 
Q
Q
 
I
L
 
I
M
 
W
R
 
H
G
 
G
V
 
L
R
 
P
M
 
L
E
 
Y
E
 
Q
I
 
A
L
 
F
L
 
L
Y
 
F
W
 
S
G
 
R
G
 
G
D
 
H
E
 
F
R
 
H
G
 
G
S
 
N
D
 
Q
F
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
V
 
G
A
 
V
Q
 
N
D
 
V
F
 
L
P
 
P
I
 
P
C
 
Q
V
x
I
P
 
I
I
|
I
A
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
I
H
 
Q
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
L
A
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
M
R
 
R
G
 
G
E
 
K
H
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
Y
C
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
|
G
T
 
T
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Q
 
K
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
V
V
 
V
N
 
Q
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
W
x
F
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
E
I
 
K
Q
 
Q
C
 
T
G
 
V
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
I
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
I
H
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
T
L
 
L
S
 
C
Y
 
F
R
|
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
|
T
T
 
M
A
 
S
D
 
G
D
 
D
A
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
S
D
 
K
E
 
E
V
 
L
K
 
E
Q
 
N
A
 
E
W
 
W
L
 
A
-
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
L
K
 
V
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
G
 
E
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
A
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
E
E
 
Q
C
 
A
Q
 
K
G
 
E
L
 
E
V
 
I
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
K
N
 
K
F
 
A
E
 
D
A
 
E
A
 
T
G
 
P
L
 
K
Q
 
Q
A
 
K
P
 
V
E
 
T
S
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
S
H
 
I
V
 
M
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
W
 
L
P
 
P
Q
 
F
A
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
E
 
E
D
 
I
F
 
Y
L
 
K
E
 
E
R
 
K

3dv0A Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
38% identity, 97% coverage: 1:321/332 of query aligns to 43:347/349 of 3dv0A

query
sites
3dv0A
L
 
L
T
 
K
R
 
E
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
K
 
R
A
 
S
V
 
I
A
x
S
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
F
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
S
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
V
 
S
G
 
H
S
 
F
L
 
A
M
 
L
H
 
E
A
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
L
 
I
I
 
L
P
 
P
Y
 
G
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
V
A
 
P
V
 
Q
Q
 
I
L
 
I
M
 
W
R
 
H
G
 
G
V
 
L
R
 
P
M
 
L
E
 
Y
E
 
Q
I
 
A
L
 
F
L
 
L
Y
 
F
W
 
S
G
 
R
G
 
G
D
 
H
E
 
F
R
 
H
G
 
G
S
 
N
D
 
Q
F
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
V
 
G
A
 
V
Q
 
N
D
 
V
F
 
L
P
 
P
I
 
P
C
 
Q
V
x
I
P
 
I
I
|
I
A
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
I
H
 
Q
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
L
A
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
M
R
 
R
G
 
G
E
 
K
H
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
Y
C
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Q
 
K
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
V
V
 
V
N
 
Q
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
W
x
F
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
E
I
 
K
Q
 
Q
C
 
T
G
 
V
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
I
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
I
H
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
T
L
 
L
S
 
C
Y
 
F
R
|
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
E
Q
 
N
A
 
E
W
 
W
L
 
A
-
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
L
K
 
V
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
G
 
E
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
A
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
E
E
 
Q
C
 
A
Q
 
K
G
 
E
L
 
E
V
 
I
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
K
N
 
K
F
 
A
E
 
D
A
 
E
A
 
T
G
 
P
L
 
K
Q
 
Q
A
 
K
P
 
V
E
 
T
S
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
S
H
 
I
V
 
M
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
W
 
L
P
 
P
Q
 
F
A
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
E
 
E
D
 
I
F
 
Y
L
 
K
E
 
E
R
 
K

3dv0E Snapshots of catalysis in the e1 subunit of the pyruvate dehydrogenase multi-enzyme complex (see paper)
37% identity, 97% coverage: 1:321/332 of query aligns to 43:342/344 of 3dv0E

query
sites
3dv0E
L
 
L
T
 
K
R
 
E
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
K
 
R
A
 
S
V
 
I
A
x
S
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
F
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
S
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
V
 
S
G
 
H
S
 
F
L
 
A
M
 
L
H
 
E
A
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
L
 
I
I
 
L
P
 
P
Y
 
G
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
V
A
 
P
V
 
Q
Q
 
I
L
 
I
M
 
W
R
 
H
G
 
G
V
 
L
R
 
P
M
 
L
E
 
Y
E
 
Q
I
 
A
L
 
F
L
 
L
Y
 
F
W
 
S
G
 
R
G
 
G
D
 
H
E
 
F
R
 
H
G
 
G
S
 
N
D
 
Q
F
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
V
 
G
A
 
V
Q
 
N
D
 
V
F
 
L
P
 
P
I
 
P
C
 
Q
V
x
I
P
 
I
I
|
I
A
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
I
H
 
Q
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
L
A
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
M
R
 
R
G
 
G
E
 
K
H
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
Y
C
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
Y
E
 
E
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Q
 
K
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
V
V
 
V
N
x
Q
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
W
x
F
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
E
I
 
K
Q
 
Q
C
 
T
G
 
V
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
I
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
I
H
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
T
L
 
L
S
 
C
Y
 
F
R
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
H
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
R
|
R
Y
 
Y
R
 
E
S
 
W
A
 
A
D
 
K
E
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
L
K
 
V
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
G
 
E
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
A
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
E
E
 
Q
C
 
A
Q
 
K
G
 
E
L
 
E
V
 
I
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
K
N
 
K
F
 
A
E
 
D
A
 
E
A
 
T
G
 
P
L
 
K
Q
 
Q
A
 
K
P
 
V
E
 
T
S
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
S
H
 
I
V
 
M
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
W
 
L
P
 
P
Q
 
F
A
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
E
 
E
D
 
I
F
 
Y
L
 
K
E
 
E
R
 
K

1w88A The crystal structure of pyruvate dehydrogenase e1(d180n,e183q) bound to the peripheral subunit binding domain of e2 (see paper)
36% identity, 97% coverage: 1:321/332 of query aligns to 42:338/340 of 1w88A

query
sites
1w88A
L
 
L
T
 
K
R
 
E
L
 
L
Y
 
M
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
V
 
V
L
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
D
Q
 
Q
K
 
R
A
 
S
V
 
I
A
x
S
L
 
L
Q
 
N
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
T
 
F
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
T
 
T
L
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
S
G
 
Q
V
 
I
A
 
A
V
 
S
G
 
H
S
 
F
L
 
A
M
 
L
H
 
E
A
 
K
E
 
E
D
 
D
V
 
F
L
 
I
I
 
L
P
 
P
Y
 
G
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
V
A
 
P
V
 
Q
Q
 
I
L
 
I
M
 
W
R
 
H
G
 
G
V
 
L
R
 
P
M
 
L
E
 
Y
E
 
Q
I
 
A
L
 
F
L
 
L
Y
 
F
W
 
S
G
 
R
G
 
G
D
 
H
E
 
F
R
 
H
G
 
G
S
 
N
D
 
Q
F
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
P
A
 
E
V
 
G
A
 
V
Q
 
N
D
 
V
F
 
L
P
 
P
I
 
P
C
 
Q
V
x
I
P
 
I
I
|
I
A
 
G
T
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
L
 
I
H
 
Q
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
A
S
 
L
A
 
G
F
 
L
K
 
K
I
 
M
R
 
R
G
 
G
E
 
K
H
 
K
R
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
T
 
Y
C
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
T
 
T
S
 
S
K
 
Q
G
 
G
D
 
N
F
 
F
L
 
Y
E
 
Q
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
G
A
 
A
W
 
F
Q
 
K
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
I
F
 
F
M
 
V
V
 
V
N
 
Q
N
 
N
N
|
N
Q
 
R
W
x
F
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
V
R
 
E
I
 
K
Q
 
Q
C
 
T
G
 
V
A
 
A
P
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
I
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
I
H
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
T
L
 
L
S
 
C
Y
 
F
R
|
R
L
 
-
G
 
-
D
 
-
H
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
Y
L
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
L
K
 
V
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
K
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
K
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
S
E
 
E
G
 
E
R
 
E
E
 
E
Q
 
N
A
 
N
L
 
V
I
 
I
S
 
E
E
 
Q
C
 
A
Q
 
K
G
 
E
L
 
E
V
 
I
Q
 
K
R
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
K
N
 
K
F
 
A
E
 
D
A
 
E
A
 
T
G
 
P
L
 
K
Q
 
Q
A
 
K
P
 
V
E
 
T
S
 
D
V
 
L
M
 
I
D
 
S
H
 
I
V
 
M
Y
 
F
A
 
E
Q
 
E
W
 
L
P
 
P
Q
 
F
A
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Y
E
 
E
D
 
I
F
 
Y
L
 
K
E
 
E
R
 
K

Q5SLR4 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha; Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component alpha chain; BCKDH E1-alpha; EC 1.2.4.4 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
37% identity, 95% coverage: 1:314/332 of query aligns to 38:359/367 of Q5SLR4

query
sites
Q5SLR4
L
 
L
T
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
D
M
 
M
V
 
L
L
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
M
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
Y
V
 
T
A
 
I
L
 
L
Q
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
G
 
S
T
x
F
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
A
G
 
G
Q
 
H
E
 
E
A
 
A
I
 
A
G
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
A
-
 
H
S
 
A
L
 
I
M
 
R
H
 
P
A
 
G
E
 
F
D
 
D
V
 
W
L
 
V
I
 
F
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
H
A
 
G
V
 
L
Q
 
A
L
 
L
M
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
P
M
 
L
E
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
L
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
G
E
 
Q
R
 
M
G
 
L
S
 
A
D
 
T
F
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
N
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
x
M
P
|
P
-
x
E
-
x
H
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
F
-
 
F
-
 
T
I
 
V
C
 
A
V
x
S
P
|
P
I
|
I
A
 
A
T
 
S
Q
 
H
A
 
V
L
 
P
H
 
P
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
I
A
 
S
F
 
M
K
 
K
I
 
L
R
 
L
G
 
R
E
 
T
H
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
C
T
 
T
C
 
F
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
x
A
T
|
T
S
|
S
K
x
E
G
 
G
D
 
D
F
 
W
L
 
Y
E
 
A
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
V
W
 
Q
Q
 
G
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
V
F
 
F
M
 
I
V
 
A
N
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
x
F
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
V
P
 
D
R
 
Y
R
 
R
I
 
H
Q
 
Q
C
 
T
G
 
H
A
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
I
 
H
G
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
Y
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Y
 
Y
D
 
Y
R
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
R
H
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
 
S
T
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
D
T
 
S
R
 
R
Y
 
Y
R
 
R
S
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
F
A
 
W
W
 
R
L
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
P
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
N
E
 
E
G
 
E
R
 
W
E
 
E
Q
 
E
A
 
D
L
 
V
I
 
R
S
 
E
E
 
E
C
 
I
Q
 
R
G
 
A
L
 
E
V
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
V
 
L
D
 
K
N
 
E
F
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
P
Q
 
V
A
 
P
P
 
P
E
 
E
S
 
W
V
 
M
M
 
F
D
 
E
H
 
D
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
P
 
P
Q
 
W
A
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q

1umdA Branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (e1) from thermus thermophilus hb8 with 4-methyl-2-oxopentanoate as an intermediate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 1:314/332 of query aligns to 33:354/362 of 1umdA

query
sites
1umdA
L
 
L
T
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
D
M
 
M
V
 
L
L
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
M
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
Y
V
 
T
A
x
I
L
 
L
Q
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
G
 
S
T
x
F
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
A
G
 
G
Q
 
H
E
 
E
A
 
A
I
 
A
G
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
A
-
 
H
S
 
A
L
 
I
M
 
R
H
 
P
A
 
G
E
 
F
D
 
D
V
 
W
L
 
V
I
 
F
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
H
A
 
G
V
 
L
Q
 
A
L
 
L
M
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
P
M
 
L
E
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
L
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
G
E
 
Q
R
 
M
G
 
L
S
 
A
D
 
T
F
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
N
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
F
-
 
F
-
 
T
I
 
V
C
 
A
V
x
S
P
|
P
I
|
I
A
 
A
T
 
S
Q
 
H
A
 
V
L
 
P
H
 
P
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
I
A
 
S
F
 
M
K
 
K
I
 
L
R
 
L
G
 
R
E
 
T
H
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
C
T
 
T
C
 
F
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
A
T
 
T
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
W
L
 
Y
E
 
A
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
V
W
 
Q
Q
 
G
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
V
F
 
F
M
 
I
V
 
A
N
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
F
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
V
P
 
D
R
 
Y
R
 
R
I
 
H
Q
 
Q
C
 
T
G
 
H
A
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
I
 
H
G
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
Y
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Y
 
Y
D
 
Y
R
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
R
H
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
|
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
x
S
T
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
D
T
 
S
R
 
R
Y
|
Y
R
 
R
S
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
F
A
 
W
W
 
R
L
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
P
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
N
E
 
E
G
 
E
R
 
W
E
 
E
Q
 
E
A
 
D
L
 
V
I
 
R
S
 
E
E
 
E
C
 
I
Q
 
R
G
 
A
L
 
E
V
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
V
 
L
D
 
K
N
 
E
F
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
P
Q
 
V
A
 
P
P
 
P
E
 
E
S
 
W
V
 
M
M
 
F
D
 
E
H
 
D
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
P
 
P
Q
 
W
A
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q

1umcA Branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (e1) from thermus thermophilus hb8 with 4-methylpentanoate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 1:314/332 of query aligns to 33:354/362 of 1umcA

query
sites
1umcA
L
 
L
T
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
D
M
 
M
V
 
L
L
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
M
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
Y
V
 
T
A
x
I
L
 
L
Q
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
G
 
S
T
 
F
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
A
G
 
G
Q
 
H
E
 
E
A
 
A
I
 
A
G
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
A
-
 
H
S
 
A
L
 
I
M
 
R
H
 
P
A
 
G
E
 
F
D
 
D
V
 
W
L
 
V
I
 
F
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
H
A
 
G
V
 
L
Q
 
A
L
 
L
M
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
P
M
 
L
E
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
L
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
G
E
 
Q
R
 
M
G
 
L
S
 
A
D
 
T
F
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
N
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
E
-
x
H
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
F
-
 
F
-
 
T
I
 
V
C
 
A
V
x
S
P
 
P
I
|
I
A
 
A
T
 
S
Q
 
H
A
 
V
L
 
P
H
 
P
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
I
A
 
S
F
 
M
K
 
K
I
 
L
R
 
L
G
 
R
E
 
T
H
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
C
T
 
T
C
 
F
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
A
T
 
T
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
W
L
 
Y
E
 
A
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
V
W
 
Q
Q
 
G
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
V
F
 
F
M
 
I
V
 
A
N
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
F
W
x
Y
A
 
A
I
|
I
S
 
S
V
 
V
P
 
D
R
 
Y
R
 
R
I
 
H
Q
 
Q
C
 
T
G
 
H
A
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
I
 
H
G
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
Y
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Y
 
Y
D
 
Y
R
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
R
H
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
|
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
x
S
T
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
D
T
 
S
R
 
R
Y
|
Y
R
 
R
S
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
F
A
 
W
W
 
R
L
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
P
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
N
E
 
E
G
 
E
R
 
W
E
 
E
Q
 
E
A
 
D
L
 
V
I
 
R
S
 
E
E
 
E
C
 
I
Q
 
R
G
 
A
L
 
E
V
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
V
 
L
D
 
K
N
 
E
F
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
P
Q
 
V
A
 
P
P
 
P
E
 
E
S
 
W
V
 
M
M
 
F
D
 
E
H
 
D
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
P
 
P
Q
 
W
A
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q

1umbA Branched-chain 2-oxo acid dehydrogenase (e1) from thermus thermophilus hb8 in holo-form (see paper)
37% identity, 95% coverage: 1:314/332 of query aligns to 33:354/362 of 1umbA

query
sites
1umbA
L
 
L
T
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
D
M
 
M
V
 
L
L
 
A
T
 
A
R
 
R
L
 
M
F
 
L
D
 
D
Q
 
E
K
 
R
A
 
Y
V
 
T
A
x
I
L
 
L
Q
 
I
R
 
R
T
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
T
G
 
S
T
 
F
Y
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
A
L
 
A
G
 
G
Q
 
H
E
 
E
A
 
A
I
 
A
G
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
I
G
 
A
-
 
H
S
 
A
L
 
I
M
 
R
H
 
P
A
 
G
E
 
F
D
 
D
V
 
W
L
 
V
I
 
F
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
R
|
R
D
 
D
T
 
H
A
 
G
V
 
L
Q
 
A
L
 
L
M
 
A
R
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
P
M
 
L
E
 
K
E
 
E
I
 
L
L
 
L
L
 
-
Y
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
G
E
 
Q
R
 
M
G
 
L
S
 
A
D
 
T
F
 
K
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
N
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
N
-
 
F
-
 
F
-
 
T
I
 
V
C
 
A
V
x
S
P
|
P
I
|
I
A
 
A
T
 
S
Q
 
H
A
 
V
L
 
P
H
 
P
A
 
A
C
 
A
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
I
A
 
S
F
 
M
K
 
K
I
 
L
R
 
L
G
 
R
E
 
T
H
 
G
R
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
C
T
 
T
C
 
F
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
A
T
 
T
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
W
L
 
Y
E
 
A
A
 
G
L
 
I
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
V
W
 
Q
Q
 
G
L
 
A
P
 
P
V
 
A
V
 
V
F
 
F
M
 
I
V
 
A
N
 
E
N
 
N
N
|
N
Q
 
F
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
V
P
 
D
R
 
Y
R
 
R
I
 
H
Q
 
Q
C
 
T
G
 
H
A
 
S
P
 
P
T
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
K
 
K
A
 
A
I
 
H
G
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
I
H
 
P
G
 
G
E
 
Y
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
M
D
 
D
M
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
S
Y
 
Y
D
 
Y
R
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
R
H
 
R
G
 
G
K
 
E
G
 
G
P
 
P
V
 
S
L
 
L
L
 
V
E
 
E
C
 
L
L
 
R
S
 
V
Y
 
Y
R
|
R
L
 
Y
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
x
S
T
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
D
T
 
S
R
 
R
Y
|
Y
R
 
R
S
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
F
A
 
W
W
 
R
L
 
K
E
 
K
E
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
P
R
 
R
L
 
F
Q
 
R
R
 
R
F
 
F
M
 
L
A
 
E
G
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
L
W
 
W
D
 
N
E
 
E
G
 
E
R
 
W
E
 
E
Q
 
E
A
 
D
L
 
V
I
 
R
S
 
E
E
 
E
C
 
I
Q
 
R
G
 
A
L
 
E
V
 
L
Q
 
E
R
 
R
A
 
G
V
 
L
D
 
K
N
 
E
F
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
P
Q
 
V
A
 
P
P
 
P
E
 
E
S
 
W
V
 
M
M
 
F
D
 
E
H
 
D
V
 
V
Y
 
F
A
 
A
Q
 
E
W
 
K
P
 
P
Q
 
W
A
 
H
L
 
L
A
 
L
E
 
R
Q
 
Q

1qs0A Crystal structure of pseudomonas putida 2-oxoisovalerate dehydrogenase (branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase, e1b) (see paper)
34% identity, 94% coverage: 6:318/332 of query aligns to 81:407/407 of 1qs0A

query
sites
1qs0A
R
 
R
Q
 
A
M
 
M
V
 
L
L
 
K
T
 
T
R
 
R
L
 
I
F
 
F
D
 
D
Q
 
S
K
 
R
A
 
M
V
 
V
A
x
V
L
 
A
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
K
R
 
K
I
 
M
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
Q
T
 
S
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
S
A
 
G
V
 
Q
G
 
A
S
 
L
L
 
A
M
 
L
H
 
N
A
 
R
E
 
T
D
 
D
V
 
M
L
 
C
I
 
F
P
 
P
Y
 
T
Y
|
Y
R
|
R
D
 
Q
T
 
Q
A
 
S
V
 
I
Q
 
L
L
 
M
M
 
A
R
 
R
G
 
D
V
 
V
R
 
S
M
 
L
E
 
V
E
 
E
I
 
M
L
 
I
L
 
C
Y
 
Q
W
 
L
G
 
L
G
 
S
D
 
N
E
 
E
R
 
R
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
D
P
 
P
A
 
L
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
L
P
 
P
I
 
I
C
 
M
V
 
Y
P
 
S
I
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
F
-
 
F
-
 
T
-
 
I
-
 
S
-
x
G
-
 
N
-
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
F
L
 
V
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
W
A
 
A
S
 
M
A
 
A
F
 
S
K
 
A
I
 
I
R
 
K
G
 
G
E
 
D
H
 
T
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
S
T
 
A
T
 
W
C
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
x
A
T
 
T
S
 
A
K
 
E
G
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
H
E
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
T
V
 
F
A
 
A
G
 
H
A
 
V
W
 
Y
Q
 
R
L
 
A
P
 
P
V
 
V
V
 
I
F
 
L
M
 
N
V
 
V
N
 
V
N
 
N
N
|
N
Q
 
Q
W
|
W
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
F
R
 
Q
R
 
A
I
 
I
Q
 
A
C
 
G
G
 
G
-
 
E
A
 
S
P
 
T
T
 
T
L
 
F
A
 
A
Q
 
G
K
 
R
A
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
C
G
 
G
F
 
I
H
 
A
G
 
S
E
 
L
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
F
L
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
A
R
 
A
V
 
S
Q
 
R
A
 
W
A
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
R
T
 
A
R
 
R
H
 
R
G
 
G
K
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
S
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
W
L
 
V
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
A
G
 
G
D
 
P
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
P
T
 
S
R
 
K
Y
|
Y
R
 
R
S
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
D
V
 
W
K
 
S
Q
 
H
A
 
F
W
 
P
L
 
L
E
 
G
E
 
D
P
 
P
I
 
I
K
 
A
R
 
R
L
 
L
Q
 
K
R
 
Q
F
 
H
M
 
L
A
 
I
G
 
K
Q
 
I
G
 
G
V
 
H
W
 
W
D
 
S
E
 
E
G
 
E
R
 
E
E
 
H
Q
 
Q
A
 
A
L
 
T
I
 
T
S
 
A
E
 
E
C
 
F
Q
 
E
G
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
I
R
 
A
A
 
A
V
 
Q
D
 
K
N
 
E
F
 
A
E
 
E
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
G
-
 
H
L
 
I
Q
 
P
A
 
S
P
 
A
E
 
A
S
 
S
V
 
M
M
 
F
D
 
E
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
K
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
D
A
 
H
L
 
L
A
 
R
E
 
R
Q
 
Q
R
 
R
E
 
Q
D
 
E
F
 
L

P11960 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial; Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component alpha chain; BCKDE1A; BCKDH E1-alpha; EC 1.2.4.4 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
31% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 98:423/441 of P11960

query
sites
P11960
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
 
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
E
A
 
R
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
V
A
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
 
S
P
 
P
I
 
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
Q
V
 
I
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
 
G
D
 
E
G
 
G
G
 
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
 
R
N
 
N
N
 
N
Q
 
G
W
 
Y
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
 
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
 
S
A
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
N
Q
 
-
A
 
Y
W
 
W
-
 
D
-
 
K
L
 
Q
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
Q
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
N
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
K
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
L
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
S
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
R
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

P12694 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial; Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component alpha chain; BCKDE1A; BCKDH E1-alpha; EC 1.2.4.4 from Homo sapiens (Human) (see 14 papers)
31% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 102:427/445 of P12694

query
sites
P12694
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
 
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
 
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
x
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
x
S
V
x
S
P
|
P
I
 
L
A
 
A
T
|
T
Q
|
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
 
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
x
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
|
A
G
x
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
 
A
I
 
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
|
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
|
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
x
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
x
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
x
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
S
|
S
A
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
N
Q
 
-
A
 
Y
W
 
W
-
 
D
-
 
K
L
 
Q
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
x
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
|
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

Sites not aligning to the query:

2bewA Reactivity modulation of human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase by an internal molecular switch (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 52:372/390 of 2bewA

query
sites
2bewA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
x
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
|
Y
R
 
R
S
 
N
A
 
Y
D
 
W
E
 
D
V
 
K
K
 
Q
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

2bevA Reactivity modulation of human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase by an internal molecular switch (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 52:372/390 of 2bevA

query
sites
2bevA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
x
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
|
Y
R
 
R
S
 
N
A
 
Y
D
 
W
E
 
D
V
 
K
K
 
Q
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

2beuA Reactivity modulation of human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase by an internal molecular switch (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 52:372/390 of 2beuA

query
sites
2beuA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
|
Y
R
 
R
S
 
N
A
 
Y
D
 
W
E
 
D
V
 
K
K
 
Q
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

1wciA Reactivity modulation of human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase by an internal molecular switch (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 52:370/388 of 1wciA

query
sites
1wciA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
|
Y
R
 
R
S
 
W
A
 
D
D
 
K
E
 
Q
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

2bffA Reactivity modulation of human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase by an internal molecular switch (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 52:374/392 of 2bffA

query
sites
2bffA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
|
Y
R
 
R
S
 
E
A
 
V
D
 
G
E
 
Y
V
 
W
K
 
D
Q
 
K
A
 
Q
W
 
-
L
 
-
E
 
D
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

1dtwA Human branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase (see paper)
29% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 51:364/382 of 1dtwA

query
sites
1dtwA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
x
Q
Y
|
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
x
S
V
x
S
P
|
P
I
x
L
A
 
A
T
|
T
Q
|
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
H
H
|
H
T
x
S
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
T
 
S
R
 
A
Y
|
Y
R
 
R
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
H
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

1v1mA Crosstalk between cofactor binding and the phosphorylation loop conformation in the bckd machine (see paper)
28% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 52:354/372 of 1v1mA

query
sites
1v1mA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
x
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

1oluA Roles of his291-alpha and his146-beta' in the reductive acylation reaction catalyzed by human branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase (see paper)
28% identity, 96% coverage: 1:318/332 of query aligns to 48:348/366 of 1oluA

query
sites
1oluA
L
 
V
T
 
L
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
S
M
 
M
V
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
N
L
 
T
F
 
M
D
 
D
Q
 
R
K
 
I
A
 
L
V
 
Y
A
x
E
L
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
S
T
 
F
Y
 
Y
A
 
M
P
 
T
T
 
N
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
A
 
G
I
 
T
G
 
H
V
 
V
A
 
G
V
 
S
G
 
A
S
 
A
L
 
A
M
 
L
H
 
D
A
 
N
E
 
T
D
 
D
V
 
L
L
 
V
I
 
F
P
 
G
Y
 
Q
Y
 
Y
R
|
R
D
 
E
T
 
A
A
 
G
V
 
V
Q
 
L
L
 
M
M
 
Y
R
 
R
G
 
D
V
 
Y
R
 
P
M
 
L
E
 
E
E
 
L
I
 
F
L
 
M
L
 
A
Y
 
Q
W
 
C
G
 
Y
G
 
G
D
 
N
E
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
S
D
 
D
P
 
L
A
 
G
V
 
K
A
 
G
Q
 
R
D
 
Q
F
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
G
-
 
C
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
V
-
 
T
I
 
I
C
 
S
V
x
S
P
 
P
I
x
L
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
A
 
I
L
 
P
H
 
Q
A
 
A
C
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
S
 
Y
A
 
A
F
 
A
K
 
K
I
 
R
R
 
A
G
 
N
E
 
A
H
 
N
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
I
T
 
C
T
 
Y
C
 
F
G
|
G
D
x
E
G
|
G
G
x
A
T
 
A
S
 
S
K
 
E
G
 
G
D
 
D
F
 
A
L
 
H
E
 
A
A
 
G
L
 
F
N
 
N
V
 
F
A
 
A
G
 
A
A
 
T
W
 
L
Q
 
E
L
 
C
P
 
P
V
 
I
V
 
I
F
 
F
M
 
F
V
 
C
N
 
R
N
 
N
N
|
N
Q
 
G
W
x
Y
A
|
A
I
|
I
S
 
S
V
 
T
P
 
P
R
 
T
R
 
S
I
 
E
Q
 
Q
C
 
Y
G
 
R
A
 
G
P
 
D
T
 
G
L
 
I
A
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
G
I
 
P
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
F
 
I
H
 
M
G
 
S
E
 
I
Q
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
N
 
N
D
 
D
M
 
V
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
D
 
N
R
 
A
V
 
T
Q
 
K
A
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
R
R
 
R
T
 
A
R
 
V
H
 
A
G
 
E
K
 
N
G
 
Q
P
 
P
V
 
F
L
 
L
L
 
I
E
 
E
C
 
A
L
 
M
S
 
T
Y
 
Y
R
|
R
L
 
-
G
 
-
D
 
D
H
 
H
T
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
P
 
P
I
 
I
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
R
R
 
H
F
 
Y
M
 
L
A
 
L
G
 
S
Q
 
Q
G
 
G
V
 
W
W
 
W
D
 
D
E
 
E
G
 
E
R
 
Q
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
W
I
 
R
S
 
K
E
 
Q
C
 
S
Q
 
R
G
 
R
L
 
K
V
 
V
Q
 
M
R
 
E
A
 
A
V
 
F
D
 
E
N
 
Q
F
 
A
E
 
E
A
 
R
A
 
K
G
 
P
L
 
K
Q
 
P
A
 
N
P
 
P
E
 
N
S
 
L
V
 
L
M
 
F
D
 
S
H
 
D
V
 
V
Y
 
Y
A
 
Q
Q
 
E
W
 
M
P
 
P
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
R
E
 
K
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
E
D
 
S
F
 
L

Query Sequence

>Pf1N1B4_1020 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_1020
LTRLYRQMVLTRLFDQKAVALQRTGRIGTYAPTLGQEAIGVAVGSLMHAEDVLIPYYRDT
AVQLMRGVRMEEILLYWGGDERGSDFADPAVAQDFPICVPIATQALHACGVASAFKIRGE
HRVAVTTCGDGGTSKGDFLEALNVAGAWQLPVVFMVNNNQWAISVPRRIQCGAPTLAQKA
IGAGFHGEQVDGNDMLAVYDRVQAALERTRHGKGPVLLECLSYRLGDHTTADDATRYRSA
DEVKQAWLEEPIKRLQRFMAGQGVWDEGREQALISECQGLVQRAVDNFEAAGLQAPESVM
DHVYAQWPQALAEQREDFLERVARRTGGSSDE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory