SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_1031 Oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P97852 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2; MFE-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 4; 17-beta-HSD 4; D-bifunctional protein; DBP; Multifunctional protein 2; MFP-2; EC 1.1.1.n12; EC 4.2.1.107; EC 4.2.1.119 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
60% identity, 99% coverage: 1:300/303 of query aligns to 1:301/735 of P97852

query
sites
P97852
M
 
M
N
 
A
E
 
S
S
 
P
V
 
L
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
A
|
A
H
x
Y
A
|
A
L
|
L
L
x
A
F
|
F
A
|
A
K
x
E
Q
x
R
G
|
G
A
|
A
K
x
L
V
|
V
L
x
V
V
|
V
N
|
N
D
|
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
A
 
F
Q
 
K
G
 
G
E
 
V
G
 
G
A
 
K
N
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
F
 
F
H
 
S
K
 
R
M
 
I
D
 
S
D
 
D
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
D
H
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
M
T
 
T
A
 
A
S
 
S
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
T
L
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
E
H
 
D
V
 
L
F
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
C
S
 
H
E
 
E
H
 
S
C
 
C
Q
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
W
 
W
M
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
R
 
R
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
I
F
 
V
D
 
R
P
 
K
R
 
R
-
 
N
V
 
Q
G
 
P
F
 
M
S
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
D
H
 
N
W
 
W
Q
 
V
Q
 
K
I
 
I
C
 
C
D
 
D
F
 
F
E
 
S
G
 
N
A
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
P
K
 
K
D
 
S
N
 
I
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
T
K
 
G
E
 
G
M
 
I
M
 
I
E
 
E
N
 
V
L
 
L
Q
 
H
K
 
K

1gz6A (3r)-hydroxyacyl-coa dehydrogenase fragment of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (see paper)
60% identity, 98% coverage: 5:300/303 of query aligns to 3:299/301 of 1gz6A

query
sites
1gz6A
V
 
L
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
A
 
F
Q
 
K
G
 
G
E
 
V
G
 
G
A
 
K
N
 
G
A
 
S
S
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
S
|
S
V
|
V
T
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
F
 
F
H
 
S
K
 
R
M
 
I
D
 
S
D
 
D
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
|
H
V
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
D
H
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
M
T
|
T
A
 
A
S
|
S
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
A
P
|
P
T
 
N
G
x
A
G
 
G
T
x
S
R
|
R
M
|
M
T
 
T
E
 
E
G
 
T
L
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
E
H
 
D
V
 
L
F
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
C
S
 
H
E
 
E
H
 
S
C
 
C
Q
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
W
 
W
M
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
R
 
R
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
I
F
 
V
D
 
R
P
 
K
R
 
R
-
 
N
V
 
Q
G
 
P
F
 
M
S
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
D
H
 
N
W
 
W
Q
 
V
Q
 
K
I
 
I
C
 
C
D
 
D
F
 
F
E
 
S
G
 
N
A
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
P
K
 
K
D
 
S
N
 
I
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
T
K
 
G
E
 
G
M
 
I
M
 
I
E
 
E
N
 
V
L
 
L
Q
 
H
K
 
K

P51659 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2; MFE-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 4; 17-beta-HSD 4; D-bifunctional protein; DBP; Multifunctional protein 2; MFP-2; Short chain dehydrogenase/reductase family 8C member 1; EC 1.1.1.n12; EC 4.2.1.107; EC 4.2.1.119 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
57% identity, 99% coverage: 1:300/303 of query aligns to 1:301/736 of P51659

query
sites
P51659
M
 
M
N
 
G
E
 
S
S
 
P
V
 
L
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
A
 
F
Q
 
K
G
 
G
E
 
V
G
 
G
A
 
K
N
 
G
A
 
S
S
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
E
K
 
K
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
x
R
T
 
S
F
 
F
H
 
A
K
 
R
M
 
I
D
 
S
D
 
D
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
H
R
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
M
T
 
T
A
 
S
S
 
S
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
N
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
R
K
 
K
N
 
S
N
 
N
I
 
I
L
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
N
G
 
A
G
 
G
T
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
T
L
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
E
H
 
D
V
 
L
F
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
C
S
 
H
E
 
E
H
 
S
C
 
C
Q
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
W
 
W
M
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
R
 
R
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
I
F
 
V
D
 
R
P
 
Q
R
 
K
V
 
N
-
 
H
G
 
P
F
 
M
S
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
H
 
N
W
 
W
Q
 
K
Q
 
K
I
 
I
C
 
C
D
 
D
F
 
F
E
 
E
G
 
N
A
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
P
K
 
Q
D
 
S
N
 
I
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
T
K
 
G
E
 
S
M
 
I
M
 
I
E
 
E
N
 
V
L
 
L
Q
 
S
K
 
K

Sites not aligning to the query:

1zbqA Crystal structure of human 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 4 in complex with NAD
58% identity, 98% coverage: 5:300/303 of query aligns to 3:299/302 of 1zbqA

query
sites
1zbqA
V
 
L
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
A
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
A
 
F
Q
 
K
G
 
G
E
 
V
G
 
G
A
 
K
N
 
G
A
 
S
S
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
S
|
S
V
|
V
T
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
E
K
 
K
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
F
 
F
H
 
A
K
 
R
M
 
I
D
 
S
D
 
D
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
H
R
 
R
V
 
V
H
 
H
V
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
M
T
|
T
A
 
S
S
|
S
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
N
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
R
K
 
K
N
 
S
N
 
N
I
 
I
L
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
A
P
|
P
T
x
N
G
x
A
G
 
G
T
x
S
R
|
R
M
|
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
T
L
 
V
I
 
M
P
 
P
P
 
E
H
 
D
V
 
L
F
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
C
S
 
H
E
 
E
H
 
S
C
 
C
Q
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
W
 
W
M
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
R
 
R
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
I
F
 
V
D
 
R
P
 
Q
R
 
K
V
 
N
-
 
H
G
 
P
F
 
M
S
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
H
 
N
W
 
W
Q
 
K
Q
 
K
I
 
I
C
 
C
D
 
D
F
 
F
E
 
E
G
 
N
A
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
P
K
 
Q
D
 
S
N
 
I
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
T
K
 
G
E
 
S
M
 
I
M
 
I
E
 
E
N
 
V
L
 
L
Q
 
S
K
 
K

1gz6B (3r)-hydroxyacyl-coa dehydrogenase fragment of rat peroxisomal multifunctional enzyme type 2 (see paper)
58% identity, 98% coverage: 5:300/303 of query aligns to 3:276/278 of 1gz6B

query
sites
1gz6B
V
 
L
R
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
R
A
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
S
|
S
V
|
V
T
 
E
D
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
S
F
 
F
H
 
S
K
 
R
M
 
I
D
 
S
D
 
D
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
I
V
 
I
Y
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
|
H
V
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
S
Y
 
F
K
 
Q
V
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
D
H
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
M
T
|
T
A
 
A
S
|
S
T
 
A
S
 
S
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
L
T
 
A
R
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
V
I
 
I
E
 
E
G
 
G
R
 
R
K
 
K
N
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
H
V
 
C
N
 
N
A
 
T
I
 
I
A
 
A
P
|
P
T
 
N
G
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
-
F
 
-
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
Y
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
C
S
 
H
E
 
E
H
 
S
C
 
C
Q
 
E
E
 
E
T
 
N
S
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
W
 
W
M
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
L
R
 
R
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
I
F
 
V
D
 
R
P
 
K
R
 
R
-
 
N
V
 
Q
G
 
P
F
 
M
S
 
T
P
 
P
E
 
E
D
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
D
H
 
N
W
 
W
Q
 
V
Q
 
K
I
 
I
C
 
C
D
 
D
F
 
F
E
 
S
G
 
N
A
 
A
A
 
S
H
 
K
P
 
P
K
 
K
D
 
S
N
 
I
I
 
Q
E
 
E
A
 
S
L
 
T
K
 
G
E
 
G
M
 
I
M
 
I
E
 
E
N
 
V
L
 
L
Q
 
H
K
 
K

P96825 Putative short-chain type dehydrogenase/reductase Rv0148; EC 1.1.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
56% identity, 90% coverage: 8:281/303 of query aligns to 5:279/286 of P96825

query
sites
P96825
E
 
Q
D
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
I
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
E
H
 
Y
A
 
A
L
 
L
L
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
G
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
R
Q
 
D
G
 
G
E
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
S
 
A
A
 
M
A
 
A
D
 
D
R
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
D
A
 
K
G
 
G
G
 
G
T
 
R
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
N
H
 
Y
D
 
D
S
 
S
V
 
V
T
 
A
D
 
T
G
 
E
D
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
A
K
 
N
I
 
I
V
 
I
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
A
V
 
V
D
 
H
V
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
G
T
 
T
F
 
F
H
 
H
K
 
K
M
 
M
D
 
S
D
 
F
S
 
E
D
 
N
W
 
W
D
 
D
L
 
A
V
 
V
Y
 
L
R
 
K
V
 
V
H
 
H
V
 
L
E
 
Y
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
K
 
H
V
 
V
T
 
L
R
 
R
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
H
 
H
M
 
F
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
V
T
 
A
A
 
T
S
 
S
T
 
T
S
 
S
G
 
G
I
 
L
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
 
Y
G
 
G
M
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
I
R
 
N
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
A
K
 
K
N
 
Y
N
 
N
I
 
I
L
 
H
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
I
G
 
A
G
 
A
T
 
T
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
Q
G
 
D
L
 
I
I
 
L
P
 
P
P
 
P
H
 
E
V
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
K
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
F
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
V
V
 
V
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
T
E
 
E
H
 
E
C
 
C
Q
 
A
E
 
D
T
 
N
S
 
A
G
 
S
L
 
V
F
 
Y
E
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
W
 
K
M
 
V
G
 
Q
K
 
R
V
 
V
R
 
A
W
 
L
E
 
F
R
 
G
S
 
N
L
 
D
G
 
G
A
 
A
G
 
N
F
 
F
D
 
D
P
 
K
R
 
P
V
 
P
G
 
-
F
 
-
S
 
S
P
 
V
E
 
Q
D
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
A
H
 
R
W
 
W
Q
 
A
Q
 
E
I
 
I
C
 
T
D
 
D
F
 
L
E
 
S
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P22414 Peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase; HDE; Multifunctional beta-oxidation protein; MFP; EC 4.2.1.119; EC 1.1.1.n12 from Candida tropicalis (Yeast) (see paper)
52% identity, 93% coverage: 5:285/303 of query aligns to 4:284/906 of P22414

query
sites
P22414
V
 
V
R
 
D
F
 
F
E
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
K
A
 
Y
H
 
Y
A
 
S
L
 
L
L
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
K
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
A
 
G
N
 
N
A
 
S
S
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
E
I
 
I
R
 
V
E
 
K
A
 
N
G
 
G
G
 
G
T
 
V
A
 
A
E
 
V
A
 
A
N
 
D
H
 
Y
D
 
N
S
 
N
V
 
V
T
 
L
D
 
D
G
 
G
D
 
D
K
 
K
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
H
 
T
A
 
A
L
 
V
D
 
K
T
 
N
F
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
V
D
 
H
V
 
V
V
 
I
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
A
T
 
S
F
 
M
H
 
K
K
 
K
M
 
M
D
 
T
D
 
E
S
 
K
D
 
D
W
 
Y
D
 
K
L
 
L
V
 
V
Y
 
I
R
 
D
V
 
V
H
 
H
V
 
L
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
A
W
 
W
P
 
P
H
 
Y
M
 
F
R
 
Q
E
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
V
F
 
N
T
 
T
A
 
S
S
 
S
T
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
A
M
 
S
A
 
A
K
 
K
L
 
S
G
 
A
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
F
T
 
A
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
K
E
 
E
G
 
G
R
 
A
K
 
K
N
 
Y
N
 
N
I
 
I
L
 
K
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
L
G
 
A
G
 
R
T
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
S
L
 
I
I
 
L
P
 
P
P
 
P
H
 
P
V
 
M
F
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
K
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
K
V
 
V
S
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
S
S
 
S
E
 
A
H
 
E
C
 
N
Q
 
E
E
 
L
T
 
T
S
 
G
G
 
Q
L
 
F
F
 
F
E
 
E
V
 
V
G
 
A
G
 
A
G
 
G
W
 
F
M
 
Y
G
 
A
K
 
Q
V
 
I
R
 
R
W
 
W
E
 
E
R
 
R
S
 
S
L
 
G
G
 
G
A
 
V
G
 
L
F
 
F
D
 
K
P
 
P
R
 
D
V
 
Q
G
 
S
F
 
F
S
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
K
H
 
R
W
 
F
Q
 
S
Q
 
E
I
 
I
C
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
 
D
G
 
D
A
 
S
A
 
R
H
 
K
P
 
P
K
 
E

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
36% identity, 79% coverage: 6:244/303 of query aligns to 4:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
F
 
L
E
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
H
 
A
A
 
A
L
 
R
L
 
V
F
 
F
A
 
M
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
I
N
 
A
D
|
D
L
x
F
G
 
N
G
 
E
S
 
A
A
 
A
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
G
A
 
K
N
 
E
A
 
A
S
 
V
A
 
E
A
 
A
D
 
N
R
 
P
V
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
F
I
 
I
R
 
R
E
x
V
A
x
D
G
x
V
G
 
S
T
 
D
A
 
R
E
 
E
A
 
S
N
 
V
H
 
H
D
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
R
I
 
L
V
 
V
Q
 
E
H
 
N
A
 
V
L
 
A
D
 
E
T
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
K
 
S
T
 
M
F
 
L
H
 
S
K
|
K
M
 
M
D
 
T
D
 
V
S
 
D
D
 
Q
W
 
F
D
 
Q
L
 
Q
V
 
V
Y
 
I
R
 
N
V
 
V
H
x
N
V
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
H
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
W
 
L
P
 
P
H
 
Y
M
 
M
R
 
A
E
 
E
Q
 
Q
N
 
G
Y
 
K
G
 
G
R
 
K
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
|
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
|
N
F
x
V
G
 
G
Q
|
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
G
 
L
R
 
A
K
 
R
N
 
K
N
 
G
I
 
I
L
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
T
 
G
G
x
F
G
x
T
T
 
E
R
x
T
M
 
A
T
x
M
E
 
V
G
 
A
L
 
E
I
 
V
P
 
P
P
 
E
H
 
K
V
 
V
F
 
I
E
 
E
Q
x
K
L
 
M
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
I
S
 
A
P
 
N
L
 
A
V
 
Y
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
H
H
 
E
C
 
S
Q
 
D
E
 
Y
T
 
V
S
 
N
G
 
G
-
 
H
L
 
V
F
 
L
E
 
H
V
 
V
G
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
I
M
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
34% identity, 78% coverage: 6:242/303 of query aligns to 2:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
R
 
K
F
 
L
E
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
G
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
Y
A
 
A
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
A
N
 
G
D
|
D
L
|
L
G
 
G
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
D
I
 
L
R
 
T
E
 
Y
A
 
S
G
 
H
G
 
P
T
 
N
A
 
V
E
 
E
A
 
G
N
 
M
H
 
Y
D
x
L
S
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
G
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
V
D
 
E
K
 
K
I
 
F
V
 
Y
Q
 
Q
H
 
S
A
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
K
 
A
T
 
M
F
 
T
H
 
R
K
 
K
M
 
M
D
 
T
D
 
E
S
 
A
D
 
Q
W
 
W
D
 
D
L
 
A
V
 
V
Y
 
I
R
 
D
V
 
V
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
V
W
 
G
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
R
 
Q
E
 
T
Q
 
N
N
 
G
Y
 
Y
G
 
G
R
 
S
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
x
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
M
 
A
A
 
T
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
T
 
T
L
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
G
 
F
-
 
A
-
 
L
R
 
K
K
 
G
N
 
A
N
 
N
I
 
V
L
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
T
 
-
G
 
-
G
|
G
T
 
Y
R
x
I
M
 
M
T
|
T
E
 
D
G
 
I
L
 
L
-
 
K
-
 
T
I
 
V
P
 
P
P
 
Q
H
 
D
V
 
L
F
 
L
E
 
D
Q
 
K
L
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
M
-
 
L
-
 
N
-
 
R
-
 
L
-
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
E
V
 
I
S
 
A
P
 
K
L
 
V
V
 
A
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
H
 
D
C
 
A
Q
 
S
E
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
-
 
Q
L
 
T
F
 
I
E
 
N
V
 
V
G
 
N
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
38% identity, 78% coverage: 10:244/303 of query aligns to 7:245/247 of P73574

query
sites
P73574
K
 
Q
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
G
 
S
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
H
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
F
 
L
A
 
A
K
 
A
Q
 
T
G
 
G
A
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
S
A
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
I
E
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
T
 
E
A
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
V
E
 
Q
A
 
A
N
 
N
H
 
V
D
 
A
S
 
N
V
 
A
T
 
D
D
 
E
G
 
V
D
 
D
K
 
Q
I
 
L
V
 
I
Q
 
K
H
 
T
A
 
T
L
 
L
D
 
D
T
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
T
T
 
L
F
 
L
H
 
L
K
 
R
M
 
M
D
 
K
D
 
L
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
Q
L
 
A
V
 
V
Y
 
I
R
 
D
V
 
L
H
 
N
V
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
W
 
S
P
 
K
H
 
L
M
 
M
R
 
L
E
 
K
Q
 
Q
N
 
K
Y
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
 
I
A
 
T
S
 
S
T
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
M
Y
 
M
G
 
G
N
 
N
F
x
P
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
 
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
K
E
 
E
G
 
L
R
 
A
K
 
S
N
 
R
N
 
G
I
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
G
T
x
F
G
 
I
G
 
A
T
 
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
N
L
 
L
I
x
N
P
 
A
P
 
E
H
 
P
V
 
I
F
 
L
E
 
Q
Q
 
F
L
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
G
L
 
T
V
 
I
V
 
R
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
E
 
D
H
 
P
C
 
A
Q
 
A
E
 
A
-
 
Y
-
 
I
T
 
T
S
 
G
G
 
Q
L
 
T
F
 
F
E
 
N
V
 
V
G
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
M
 
V

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 80% coverage: 2:242/303 of query aligns to 1:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
N
 
S
E
 
N
S
 
A
V
 
M
R
 
K
F
 
L
E
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
V
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
H
 
I
A
 
A
L
 
Q
L
 
V
F
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
L
 
I
V
 
I
N
 
A
D
|
D
L
x
R
G
 
-
G
 
-
S
 
D
A
 
A
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
A
A
 
A
S
 
S
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
L
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
T
 
Q
A
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
I
E
 
S
A
x
C
N
 
N
H
x
I
D
 
A
S
 
E
V
 
K
T
 
T
D
 
Q
G
 
V
D
 
E
K
 
A
I
 
L
V
 
F
Q
 
S
H
 
Q
A
 
A
L
 
E
D
 
E
T
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
K
 
A
T
 
M
F
 
L
H
 
H
K
 
K
M
 
L
D
 
T
D
 
E
S
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
T
V
 
V
Y
 
I
R
 
D
V
|
V
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
M
R
 
Q
A
 
Q
A
 
A
W
 
A
P
 
I
H
 
R
M
 
M
R
 
R
E
 
E
Q
 
R
N
 
G
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
A
S
 
S
G
 
W
I
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
N
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
S
M
 
A
A
 
S
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
C
I
 
R
E
 
E
G
 
L
R
 
A
K
 
K
N
 
K
N
 
G
I
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
T
 
G
G
 
F
-
x
I
G
 
D
T
|
T
R
 
D
M
 
M
T
|
T
E
 
R
G
 
G
L
 
-
I
 
V
P
 
P
P
 
E
H
 
N
V
 
V
F
 
W
E
 
Q
Q
 
I
L
 
M
K
 
V
P
 
S
E
 
K
L
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
D
V
 
V
S
 
G
P
 
E
L
 
C
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
H
 
G
C
 
A
Q
 
R
E
 
Y
T
 
I
S
 
N
G
 
G
-
 
E
L
 
V
F
 
I
E
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
41% identity, 61% coverage: 11:194/303 of query aligns to 3:181/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
H
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
S
F
 
L
A
 
G
K
 
K
Q
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
K
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
|
N
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
x
Y
G
x
A
A
x
R
N
x
S
A
 
A
S
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
E
V
 
V
V
 
S
A
 
K
E
 
Q
I
 
I
R
 
E
E
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
E
 
I
A
 
T
N
 
F
H
 
G
D
 
G
S
x
D
V
|
V
T
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
A
D
 
D
G
 
V
D
 
E
K
 
A
I
 
M
V
 
M
Q
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
I
D
 
D
T
 
A
F
 
W
G
 
G
R
 
T
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
T
T
 
L
F
 
L
H
 
I
K
 
R
M
 
M
D
 
K
D
 
K
S
 
S
D
 
Q
W
 
W
D
 
D
L
 
E
V
 
V
Y
 
I
R
 
D
V
 
L
H
 
N
V
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
W
 
T
P
 
K
H
 
I
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
K
N
 
R
Y
 
K
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
A
K
 
S
N
 
R
N
 
N
I
 
I
L
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
A
 
C
P
|
P

Sites not aligning to the query:

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
35% identity, 69% coverage: 7:216/303 of query aligns to 3:196/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
A
G
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
H
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
R
F
 
F
A
 
A
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
I
N
 
N
D
|
D
L
 
I
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
D
G
 
A
E
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
R
A
 
A
S
 
T
A
 
V
A
 
D
D
 
E
R
 
F
V
 
S
V
 
A
A
 
R
E
 
G
I
 
H
R
 
R
E
 
V
A
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
V
A
 
A
E
x
D
A
x
I
N
 
G
H
 
N
D
 
K
S
 
A
V
 
A
T
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
-
K
 
-
I
 
M
V
 
V
Q
 
K
H
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
D
T
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
E
R
 
R
D
 
A
K
 
G
T
 
A
F
 
L
H
 
R
K
 
K
M
 
L
D
 
S
D
 
E
S
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
V
V
 
T
Y
 
I
R
 
N
V
 
V
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
W
 
H
P
 
G
H
 
H
M
 
M
R
 
V
E
 
E
Q
 
N
N
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
V
F
 
N
T
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
R
S
 
A
G
 
W
I
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
P
Y
|
Y
G
 
S
M
 
S
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
L
R
 
G
K
 
R
N
 
A
N
 
G
I
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
H
P
 
T
H
 
P
V
 
M
F
 
W
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
K
 
-
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
35% identity, 69% coverage: 7:216/303 of query aligns to 2:195/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
I
E
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
G
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
R
 
K
A
 
Q
H
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
R
F
 
F
A
 
A
K
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
I
N
 
N
D
|
D
L
x
I
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
D
G
 
A
E
 
E
G
 
K
A
 
V
N
 
R
A
 
A
S
 
T
A
 
V
A
 
D
D
 
E
R
 
F
V
 
S
V
 
A
A
 
R
E
 
G
I
 
H
R
 
R
E
 
V
A
 
L
G
 
G
G
 
A
T
 
V
A
 
A
E
 
D
A
x
I
N
 
G
H
 
N
D
 
K
S
 
A
V
 
A
T
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
-
K
 
-
I
 
M
V
 
V
Q
 
K
H
 
Q
A
 
T
L
 
I
D
 
D
T
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
L
 
E
R
 
R
D
 
A
K
 
G
T
 
A
F
 
L
H
 
R
K
 
K
M
 
L
D
 
S
D
 
E
S
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
V
V
 
T
Y
 
I
R
 
N
V
 
V
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
W
 
H
P
 
G
H
 
H
M
 
M
R
 
V
E
 
E
Q
 
N
N
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
V
F
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
T
 
R
S
 
A
G
 
W
I
 
L
Y
 
-
G
 
G
N
 
G
F
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
P
Y
|
Y
G
 
S
M
 
S
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
V
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
R
T
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
E
 
E
G
 
L
R
 
G
K
 
R
N
 
A
N
 
G
I
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
L
I
|
I
P
 
H
P
 
T
H
 
P
V
 
M
F
 
W
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
K
 
-
P
 
P
E
 
E

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
32% identity, 75% coverage: 10:235/303 of query aligns to 2:233/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
K
 
R
V
 
I
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
M
G
 
G
G
|
G
L
 
L
G
 
G
R
 
E
A
 
A
H
 
V
A
 
S
L
 
I
L
 
R
F
 
L
A
 
N
K
 
D
Q
 
A
G
 
G
A
 
H
K
 
R
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
T
D
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
x
Y
G
x
S
A
 
P
N
 
N
A
x
N
S
 
T
A
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
W
V
 
L
A
 
T
E
 
E
I
 
M
R
 
H
E
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
R
T
 
E
A
 
F
E
 
H
A
 
A
N
 
Y
H
 
P
D
x
V
S
x
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
G
 
H
D
 
D
-
 
S
-
 
C
-
 
Q
K
 
Q
I
 
C
V
 
I
Q
 
E
H
 
K
A
 
I
L
 
V
D
 
R
T
 
D
F
 
V
G
 
G
R
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
M
T
 
T
F
 
L
H
 
R
K
 
K
M
 
L
D
 
D
D
 
K
S
 
V
D
x
N
W
 
W
D
 
D
L
 
A
V
 
V
Y
 
I
R
 
R
V
 
T
H
 
N
V
 
L
E
 
D
G
 
S
A
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
P
A
 
V
W
 
C
P
 
D
H
 
G
M
 
M
R
 
V
E
 
E
Q
 
R
N
 
G
Y
 
W
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
V
F
 
N
T
 
I
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
N
G
 
G
I
 
S
Y
 
K
G
 
G
N
 
S
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
M
Y
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
I
R
 
A
K
 
R
N
 
K
N
 
G
I
 
V
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
 
P
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
T
T
 
K
G
 
M
G
 
V
T
 
T
R
 
A
M
 
I
T
 
P
E
 
Q
G
 
D
L
 
I
I
 
L
P
 
D
P
 
T
H
 
K
V
 
I
F
 
L
E
 
P
Q
 
Q
L
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
E
V
 
V
S
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
S
E
 
E
H
 
E
C
 
A
Q
 
G
E
 
F
T
 
V
S
 
T
G
 
G

7x5jC Acp-dependent oxoacyl reductase
35% identity, 78% coverage: 7:242/303 of query aligns to 2:250/256 of 7x5jC

query
sites
7x5jC
F
 
L
E
 
Q
D
 
K
K
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
G
 
G
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
T
F
 
L
A
 
A
K
 
Q
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
T
D
 
G
L
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
x
N
A
x
R
N
|
N
A
 
I
S
 
D
A
 
K
A
 
A
D
 
E
R
 
S
V
 
V
V
 
A
A
 
N
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
T
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
N
 
I
H
 
K
D
 
V
S
x
D
V
|
V
T
 
S
D
 
N
G
 
E
D
 
D
K
 
E
I
 
V
-
 
N
-
 
E
-
 
G
V
 
V
Q
 
E
H
 
K
A
 
I
L
 
K
D
 
K
T
 
E
F
 
L
G
 
G
R
 
S
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
-
x
A
-
 
S
G
 
G
I
 
I
L
 
V
R
 
R
D
 
A
K
 
T
T
 
L
F
 
I
H
 
E
K
 
K
M
 
T
D
 
A
D
 
K
S
 
E
D
 
D
W
 
W
D
 
D
L
 
Q
V
 
D
Y
 
L
R
 
R
V
|
V
H
 
N
V
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
K
 
N
V
 
C
T
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
V
W
 
I
P
 
P
H
 
D
M
 
M
R
 
K
E
 
K
Q
 
N
N
 
N
Y
 
W
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
x
I
A
 
S
S
 
S
T
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
T
Y
 
M
G
 
G
N
 
G
F
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
C
N
 
S
Y
|
Y
G
 
A
M
 
T
A
 
T
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
A
K
 
R
N
 
Y
N
 
N
I
 
I
L
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
V
P
x
L
-
x
G
T
x
V
G
 
F
G
 
G
T
 
G
R
 
R
M
 
G
T
x
R
E
 
E
G
 
D
L
x
S
I
x
S
P
 
F
P
 
Y
H
 
D
V
 
V
F
 
A
E
 
E
Q
 
P
L
 
F
K
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
T
-
 
A
-
 
M
-
 
R
-
 
R
-
 
P
-
 
G
-
 
D
P
 
P
E
 
K
L
 
E
V
 
L
S
 
S
P
 
N
L
 
V
V
 
L
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
H
 
E
C
 
A
Q
 
S
E
 
Y
T
 
V
S
 
T
G
 
G
-
 
D
L
 
A
F
 
I
E
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
37% identity, 75% coverage: 10:235/303 of query aligns to 2:240/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
E
F
 
F
A
 
A
K
 
Q
Q
 
A
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
V
 
V
L
 
V
V
 
A
N
 
W
D
|
D
L
|
L
G
 
A
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
E
G
 
E
A
 
A
N
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
A
E
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
A
 
A
E
 
D
-
 
F
-
 
A
-
 
R
A
x
V
N
x
D
H
x
V
D
 
S
S
 
A
V
 
A
T
 
E
D
 
S
G
 
V
D
 
E
K
 
A
I
 
A
V
 
V
Q
 
A
H
 
E
A
 
I
L
 
I
D
 
A
T
 
E
F
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
G
K
 
E
T
 
V
F
 
V
H
 
K
K
 
K
M
 
M
D
 
A
D
 
E
S
 
A
D
 
Q
W
 
F
D
 
D
L
 
A
V
 
V
Y
 
I
R
 
S
V
 
V
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
W
 
A
P
 
P
H
 
H
M
 
M
R
 
I
E
 
A
Q
 
A
N
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
I
I
 
L
F
 
N
T
 
A
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
S
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
T
 
V
L
 
W
A
 
A
I
 
R
E
 
E
G
 
L
R
 
G
K
 
R
N
 
Y
N
 
G
I
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
G
G
 
F
-
x
I
G
 
A
T
|
T
R
 
E
M
 
M
T
 
V
E
 
Q
G
 
Q
L
 
M
I
 
-
P
 
P
P
 
E
H
 
R
V
 
V
F
 
L
E
 
E
Q
 
A
L
 
M
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
V
L
 
D
V
 
I
S
 
A
P
 
R
L
 
A
V
 
Y
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
H
 
E
C
 
S
Q
 
G
E
 
F
T
 
I
S
 
S
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
33% identity, 77% coverage: 10:243/303 of query aligns to 2:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
V
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
H
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
Q
F
 
L
A
 
A
K
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
|
N
D
x
Y
L
x
A
G
|
G
G
x
S
S
 
K
A
 
E
Q
 
K
G
 
A
E
 
E
G
 
A
A
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
K
E
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
T
 
D
A
 
S
E
 
F
A
 
A
N
 
I
H
 
Q
D
x
A
S
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
G
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
M
V
 
I
Q
 
K
H
 
E
A
 
V
L
 
V
D
 
S
T
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
F
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
D
 
E
S
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
D
V
 
V
Y
 
I
R
 
D
V
x
T
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
V
Y
 
F
K
 
N
V
 
C
T
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
W
 
T
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
R
 
L
E
 
R
Q
 
Q
N
 
R
Y
 
S
G
 
G
R
 
A
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
 
L
A
 
S
S
|
S
T
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
A
Y
 
V
G
 
G
N
 
N
F
 
P
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
M
 
A
A
 
T
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
G
 
L
R
 
A
K
 
S
N
 
R
N
 
G
I
 
I
L
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
T
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
R
 
-
M
 
-
T
 
-
E
 
-
G
|
G
L
 
F
I
 
I
P
 
V
P
 
S
H
 
D
V
 
M
F
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
Q
L
 
M
V
 
L
S
 
T
-
 
Q
-
 
I
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
D
-
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
N
-
 
T
V
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
H
 
K
C
 
A
Q
 
K
E
 
Y
T
 
I
S
 
T
G
 
G
-
 
Q
L
 
T
F
 
I
E
 
H
V
 
V
G
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 79% coverage: 7:244/303 of query aligns to 3:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
E
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
H
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
N
F
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
L
 
F
V
 
F
N
|
N
D
 
-
L
x
Y
G
x
N
G
|
G
S
|
S
A
 
P
Q
 
E
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
E
V
 
T
V
 
A
A
 
K
E
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
H
G
 
G
G
 
V
T
 
E
A
 
V
E
 
E
A
 
A
N
 
M
H
 
K
D
 
A
S
x
N
V
|
V
T
 
A
-
 
I
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
V
D
 
D
K
 
A
I
 
F
V
 
F
Q
 
K
H
 
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
E
T
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
N
T
 
L
F
 
L
H
 
M
K
 
R
M
 
M
D
 
K
D
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
D
V
 
V
Y
 
I
R
 
N
V
x
I
H
 
N
V
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
T
Y
 
F
K
 
L
V
 
C
T
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
W
 
S
P
 
R
H
 
T
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
Q
N
 
R
Y
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
I
 
I
F
 
N
T
 
M
A
 
A
S
|
S
T
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
Y
 
I
G
 
G
N
 
N
F
 
A
G
 
G
Q
|
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
V
M
 
A
A
 
S
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
G
 
L
R
 
A
K
 
P
N
 
R
N
 
G
I
 
I
L
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
T
 
G
G
 
F
-
x
I
G
 
T
T
|
T
R
 
D
M
 
M
T
 
T
E
 
D
G
 
K
L
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
K
I
 
T
P
 
K
P
 
E
H
 
A
V
 
M
F
 
L
E
 
A
Q
 
Q
L
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
G
K
 
T
P
 
T
E
 
E
L
 
D
V
 
I
S
 
A
P
 
N
L
 
A
V
 
V
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
H
 
A
C
 
S
Q
 
K
E
 
Y
T
 
I
S
 
T
G
 
G
-
 
Q
L
 
T
F
 
L
E
 
S
V
 
V
G
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
M
 
V

7lgbA Chsb1 in complex with NAD+ (see paper)
37% identity, 75% coverage: 10:235/303 of query aligns to 6:236/282 of 7lgbA

query
sites
7lgbA
K
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
 
A
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
G
F
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
D
|
D
L
x
V
G
 
-
G
 
-
S
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
N
 
S
A
 
A
S
 
L
A
 
D
A
 
A
D
 
S
R
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
D
E
 
E
I
 
I
R
 
G
E
 
A
A
 
A
G
 
D
G
 
A
T
 
G
A
 
A
E
 
K
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
x
G
N
x
D
H
x
I
D
 
S
S
 
Q
V
 
R
T
 
A
D
 
T
G
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
L
V
 
L
Q
 
A
H
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
G
T
 
-
F
 
L
G
 
G
R
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
R
T
 
M
F
 
L
H
 
F
K
 
N
M
 
M
D
 
S
D
 
D
S
 
E
D
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
A
V
 
V
Y
 
I
R
 
A
V
|
V
H
 
H
V
 
L
E
 
R
G
 
G
A
 
H
Y
 
F
K
 
L
V
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
N
A
 
A
W
 
A
P
 
A
H
 
Y
M
 
W
R
 
R
E
 
D
Q
 
K
N
 
A
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
L
I
 
V
F
 
N
T
|
T
A
 
S
S
|
S
T
 
E
S
 
A
G
 
G
I
 
L
Y
 
V
G
 
G
N
 
P
F
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
N
 
N
Y
|
Y
G
 
A
M
 
A
A
 
A
K
|
K
L
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
T
G
 
A
L
 
L
T
 
T
R
 
L
T
 
S
L
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
A
G
 
L
R
 
G
K
 
R
N
 
Y
N
 
G
I
 
V
L
 
C
V
 
A
N
 
N
A
 
V
I
 
I
A
 
C
P
|
P
T
 
R
G
 
A
G
 
R
T
|
T
R
 
A
M
|
M
T
|
T
E
 
A
G
 
D
L
 
V
I
 
F
-
 
G
-
 
A
P
 
A
P
 
P
H
 
Q
V
 
I
F
 
-
E
 
D
Q
 
P
L
 
L
K
 
S
P
 
P
E
 
Q
L
 
H
V
 
V
S
 
V
P
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
P
H
 
A
C
 
A
Q
 
A
E
 
E
T
 
V
S
 
N
G
 
G

Query Sequence

>Pf1N1B4_1031 Oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family
MNESVRFEDKVVIVTGAGGGLGRAHALLFAKQGAKVLVNDLGGSAQGEGANASAADRVVA
EIREAGGTAEANHDSVTDGDKIVQHALDTFGRVDVVVNNAGILRDKTFHKMDDSDWDLVY
RVHVEGAYKVTRAAWPHMREQNYGRVIFTASTSGIYGNFGQSNYGMAKLGLYGLTRTLAI
EGRKNNILVNAIAPTGGTRMTEGLIPPHVFEQLKPELVSPLVVYLASEHCQETSGLFEVG
GGWMGKVRWERSLGAGFDPRVGFSPEDVAAHWQQICDFEGAAHPKDNIEALKEMMENLQK
YSI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory