SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_1040 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_1040 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bt9C Crystal structure of folm alternative dihydrofolate reductase 1 from brucella canis complexed with NADP (see paper)
27% identity, 97% coverage: 7:235/236 of query aligns to 9:242/250 of 5bt9C

query
sites
5bt9C
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
Q
 
R
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
K
H
 
A
C
 
I
A
 
V
Q
 
E
R
 
D
L
 
L
L
 
A
E
 
S
D
 
H
G
 
G
H
 
F
P
 
P
V
 
V
-
 
A
I
 
I
F
 
H
S
x
C
Y
x
N
R
|
R
S
|
S
E
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
I
V
 
A
Q
 
N
T
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
D
L
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
N
A
 
A
V
 
C
F
 
V
A
 
V
D
 
Q
F
 
A
S
 
D
S
x
L
E
|
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
L
 
R
A
 
G
F
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
L
 
A
K
 
S
N
 
D
H
 
R
T
 
I
D
 
G
S
 
P
L
 
I
R
 
R
A
 
L
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
E
 
L
W
 
F
L
 
Q
A
 
E
E
 
D
T
 
K
P
 
V
G
 
G
T
 
A
-
 
L
E
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
L
F
 
W
T
 
D
R
 
R
M
 
H
F
 
F
S
 
A
V
 
V
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
T
P
 
P
Y
 
V
L
 
I
I
 
L
N
 
-
L
 
-
H
 
-
C
 
-
A
 
A
D
 
E
L
 
D
L
 
M
R
 
R
R
 
K
S
 
A
S
 
L
P
 
P
A
 
E
D
 
D
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
L
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
|
I
S
 
I
D
 
D
D
 
Q
V
 
R
T
 
V
R
 
W
R
 
K
G
 
L
S
 
N
S
 
P
K
 
Q
H
 
F
I
 
F
G
 
S
Y
|
Y
C
 
T
A
 
L
S
 
S
K
|
K
A
 
T
G
 
A
L
 
L
D
 
W
S
 
N
L
 
A
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
P
L
x
T
L
|
L
F
 
P
N
 
S
P
 
E
D
 
R
D
 
Q
D
 
R
A
 
P
A
 
E
Y
 
D
R
 
F
A
 
E
R
 
R
V
 
Q
L
 
V
A
 
S
K
 
K
S
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
Q
I
 
R
E
 
A
P
 
P
G
 
E
S
 
L
E
 
P
V
 
E
I
 
F
Y
 
G
Q
 
R
S
 
T
L
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
F
L
 
W
D
 
E
N
 
N
P
 
R
Y
 
S
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
M
L
 
I
T
 
A
V
 
L
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
H
 
H
V
 
L

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
27% identity, 96% coverage: 8:233/236 of query aligns to 7:250/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
I
 
M
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
L
L
 
A
L
 
A
E
 
E
D
 
R
G
 
G
H
 
Y
P
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
L
S
 
N
Y
 
Y
R
x
L
S
x
R
E
x
N
R
 
R
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
Q
L
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
G
 
E
A
 
A
S
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
A
A
|
A
D
|
D
F
x
V
S
 
A
S
 
E
E
 
E
A
 
G
G
 
D
I
 
V
L
 
E
A
 
R
F
 
L
I
 
F
G
 
A
E
 
S
L
 
I
K
 
D
N
 
E
H
 
R
T
 
F
D
 
G
S
 
R
L
 
L
R
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
G
E
 
M
W
 
L
L
 
E
A
 
A
E
 
Q
T
 
T
-
 
R
-
 
L
P
 
E
G
 
N
T
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
R
F
 
L
T
 
H
R
 
R
M
 
V
F
 
F
S
 
A
V
x
T
H
 
N
M
 
V
L
 
T
A
 
G
P
 
S
Y
 
F
L
 
L
I
 
-
N
 
-
L
 
-
H
 
-
C
 
C
A
 
A
-
 
R
D
 
E
L
 
A
L
 
V
R
 
K
R
 
R
S
 
L
S
 
S
P
 
T
-
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
G
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
V
S
 
S
D
x
S
D
 
M
V
 
A
T
 
S
R
 
R
R
 
L
G
 
G
S
 
S
-
 
P
S
 
N
K
 
E
H
 
Y
I
 
I
G
 
D
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
S
 
S
L
 
M
T
 
T
L
 
I
S
 
G
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
-
 
A
A
 
A
P
 
E
S
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
R
P
|
P
A
x
G
L
 
L
L
x
I
-
 
D
-
x
T
-
 
E
L
x
I
F
x
H
N
 
A
P
 
S
D
 
G
D
 
G
D
 
E
A
 
P
A
 
G
Y
 
R
R
 
I
A
 
E
R
 
R
V
 
L
L
 
K
A
 
G
K
 
G
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
G
P
 
G
G
 
T
S
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
V
Y
 
A
Q
 
R
S
 
A
L
 
I
R
 
L
Y
 
W
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
P
 
E
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
F
L
 
I
T
 
D
V
 
V
N
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
27% identity, 96% coverage: 9:234/236 of query aligns to 10:239/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
T
Q
 
S
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
H
 
E
C
 
S
A
 
A
Q
 
R
R
 
L
L
 
M
L
 
A
E
 
A
D
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
D
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
T
Y
 
G
R
|
R
S
x
D
E
 
A
R
 
Q
P
x
R
G
 
G
V
 
E
Q
 
Q
T
 
A
L
 
A
R
 
A
D
 
D
L
 
I
G
 
G
A
 
H
S
 
G
A
 
A
V
 
R
F
 
F
A
 
-
D
 
-
F
 
V
S
 
Q
S
 
A
E
x
D
A
x
L
G
 
G
I
 
D
L
 
L
A
 
D
F
 
S
I
 
V
G
 
A
E
 
D
L
 
L
K
 
A
N
 
A
H
 
Q
T
 
A
D
 
P
S
 
D
L
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
 
G
E
 
I
W
x
Y
-
 
P
L
 
Q
A
 
A
E
 
S
T
 
T
P
 
F
G
 
D
T
 
Q
E
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
G
F
 
F
T
 
Q
R
 
Q
M
 
L
F
 
F
S
 
D
V
 
T
H
 
N
M
 
V
L
 
R
A
 
G
P
 
T
Y
 
Y
L
 
F
I
 
L
N
 
V
L
 
A
H
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
K
L
 
G
L
 
M
R
 
V
R
 
A
S
 
R
S
 
G
P
 
H
A
 
G
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
|
I
S
 
T
D
x
T
D
 
L
V
 
A
T
 
A
R
 
H
R
 
K
G
 
G
S
 
F
S
 
P
K
 
G
H
x
T
I
 
S
G
 
V
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
T
F
 
W
A
 
A
A
 
A
K
 
E
Y
 
F
-
 
G
A
 
A
P
 
N
S
 
G
I
 
V
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
S
P
|
P
A
 
G
-
x
P
-
x
T
-
 
R
-
x
T
-
 
P
L
x
T
L
x
T
L
 
L
F
 
E
N
 
Q
P
 
L
D
 
G
D
 
D
D
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
F
R
 
I
A
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
A
K
 
G
S
 
L
A
 
P
L
 
L
G
 
R
I
 
R
E
 
T
P
 
A
G
 
A
S
 
P
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
Q
S
 
A
L
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
-
 
P
-
 
R
N
 
A
P
 
S
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
S
T
 
T
L
 
L
T
 
Y
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
G
H
 
Y

5iz4A Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
26% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 8:243/247 of 5iz4A

query
sites
5iz4A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
Q
x
S
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
L
 
F
L
 
A
E
 
Q
D
 
A
G
 
G
H
 
W
P
 
S
V
 
V
I
 
A
F
 
I
-
 
G
-
 
N
-
x
F
-
 
D
-
 
D
S
 
S
Y
 
T
R
 
R
S
 
D
E
 
A
R
 
A
P
 
S
G
 
T
V
 
V
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
-
 
C
R
 
R
D
 
D
L
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
A
 
T
V
 
L
F
 
I
-
 
F
-
 
D
A
|
A
D
|
D
F
x
V
S
 
G
S
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
D
I
 
C
-
 
R
-
 
H
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
M
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
R
L
 
W
A
 
Q
F
 
R
I
 
I
G
 
D
E
 
A
L
 
L
K
 
I
N
 
N
H
 
C
T
x
A
D
x
G
S
 
T
L
 
T
R
 
R
A
 
V
V
 
I
V
 
P
H
 
H
N
 
N
A
 
A
S
 
F
E
 
D
W
 
Q
L
 
I
A
 
D
E
 
D
T
 
F
P
 
E
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
F
T
 
E
R
 
R
M
 
V
F
 
Y
S
 
R
V
|
V
H
 
N
M
 
L
L
 
I
A
 
G
P
 
L
Y
 
Y
L
 
Q
I
 
M
N
 
T
L
 
R
H
 
A
C
 
A
A
 
V
D
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
E
S
 
S
S
 
A
P
 
S
A
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
T
D
 
S
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
 
V
S
 
S
D
x
S
D
 
L
V
 
A
T
 
G
R
 
L
R
 
N
G
 
G
S
 
T
S
 
G
K
x
S
H
 
S
I
 
I
G
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
D
 
N
S
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
N
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
H
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
L
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
M
L
 
V
L
 
-
F
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
D
D
 
D
A
 
G
A
 
G
Y
 
V
R
 
L
A
 
S
R
 
R
V
 
M
L
 
T
A
 
E
K
 
S
S
 
A
A
 
P
L
 
L
G
 
K
-
 
R
I
 
V
E
 
S
P
 
R
G
 
P
S
 
A
E
 
E
V
 
I
I
 
A
Y
 
E
Q
 
L
S
 
A
L
 
W
R
 
F
Y
 
L
L
 
T
L
 
A
D
 
H
N
 
A
P
 
P
Y
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
I
T
 
A
V
 
A
N
 
E
G
 
N
G
 
G

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
26% identity, 100% coverage: 1:235/236 of query aligns to 1:243/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
M
 
M
T
 
T
S
 
Q
T
 
E
A
 
R
A
 
K
P
 
V
I
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
A
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
D
 
D
G
 
G
H
 
Y
P
 
F
V
 
V
I
 
V
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
x
T
S
 
S
E
 
E
R
 
-
P
 
S
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
T
 
K
L
 
L
R
 
T
D
 
D
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
S
F
 
F
S
 
G
S
 
E
E
 
Q
A
 
G
G
 
A
I
 
G
L
 
L
A
 
A
F
x
L
I
 
-
G
 
-
E
x
D
L
x
V
K
 
R
N
 
N
H
 
-
T
 
L
D
 
D
S
 
E
L
 
I
R
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
H
 
S
N
 
H
A
 
I
S
 
E
E
 
Q
-
 
N
-
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
L
W
 
V
L
 
L
A
 
V
E
 
N
T
x
N
P
x
A
G
|
G
-
x
I
T
 
T
E
 
K
A
 
D
A
 
N
A
 
L
F
 
L
T
 
L
R
 
R
M
 
M
-
 
S
-
 
E
-
 
D
-
 
D
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
I
F
 
L
S
 
N
V
 
I
H
 
H
M
 
L
L
 
K
A
 
A
P
 
V
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
R
C
 
V
A
 
L
D
 
K
L
 
G
L
 
M
R
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
F
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
|
I
S
 
S
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
A
R
 
H
R
 
F
G
 
A
S
 
N
S
 
P
K
 
G
H
 
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
D
 
E
S
 
A
L
 
F
T
 
S
L
 
R
S
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
Y
 
M
A
 
G
P
 
S
-
 
R
S
 
Q
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
A
F
 
T
N
 
E
P
 
M
D
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
S
A
 
E
A
 
D
Y
 
I
R
 
R
A
 
K
R
 
K
V
 
M
L
 
S
A
 
D
K
 
Q
S
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
N
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
E
S
 
P
E
 
Q
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
A
L
 
V
R
 
S
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
P
 
K
-
 
A
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
L
H
 
Y
V
 
M

3iccA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase from bacillus anthracis at 1.87 a resolution (see paper)
30% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 11:252/255 of 3iccA

query
sites
3iccA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
N
D
 
D
G
 
G
H
 
A
P
 
L
V
 
V
I
 
A
F
 
I
S
x
H
Y
|
Y
-
x
G
-
 
N
R
 
R
S
 
K
E
 
E
-
 
E
-
 
A
R
 
E
P
 
E
G
 
T
V
 
V
Q
 
Y
T
 
E
L
 
I
R
 
Q
D
 
S
L
 
N
G
 
G
A
 
G
S
 
S
A
 
A
-
 
F
-
 
S
V
 
I
F
 
G
A
 
A
D
 
N
F
x
L
S
x
E
S
 
S
E
 
L
A
 
H
G
 
G
I
 
V
L
 
E
A
 
A
F
 
L
I
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
D
G
 
N
E
 
E
L
 
L
K
 
Q
N
 
N
H
 
R
T
 
T
D
 
G
S
 
S
L
 
T
R
 
K
-
 
F
-
 
D
A
 
I
V
 
L
V
 
I
H
 
N
N
|
N
A
 
A
-
x
G
-
 
I
-
 
G
-
 
P
S
 
G
E
 
A
W
 
F
L
 
I
A
 
E
E
 
E
T
 
T
P
 
-
G
 
-
T
 
T
E
 
E
A
 
-
A
 
Q
A
 
F
F
 
F
T
 
D
R
 
R
M
 
M
F
 
V
S
 
S
V
 
V
H
 
N
M
 
A
L
 
K
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
F
I
 
I
N
 
I
L
 
Q
H
 
Q
C
 
A
A
 
L
D
 
S
L
 
R
L
 
L
R
 
R
R
 
D
S
 
N
S
 
S
P
 
R
A
 
-
D
 
-
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
|
I
S
 
S
D
x
S
D
 
A
V
 
A
T
 
T
R
 
R
R
 
I
G
 
S
S
 
L
S
 
P
K
 
D
H
x
F
I
 
I
G
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
M
S
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
N
S
 
T
L
 
M
T
 
T
L
 
F
S
 
T
F
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
Q
Y
 
L
-
 
G
A
 
A
P
 
R
S
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
L
P
|
P
A
x
G
L
 
F
L
 
V
L
 
K
F
 
T
N
 
D
P
x
M
D
x
N
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
P
A
 
M
Y
 
M
R
 
K
A
 
Q
R
 
Y
V
 
A
L
 
T
A
 
T
K
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
F
G
 
N
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
E
S
 
V
E
 
E
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
T
L
 
A
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
P
D
 
D
N
 
S
P
 
R
Y
 
W
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
L
L
 
I
T
 
D
V
 
V
N
 
S
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
23% identity, 98% coverage: 1:232/236 of query aligns to 1:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
T
 
T
S
 
L
T
 
Q
A
 
G
A
 
K
P
 
V
I
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
D
C
 
I
A
 
A
Q
 
I
R
 
N
L
 
L
L
 
A
E
 
K
D
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
N
V
 
I
I
 
F
F
 
F
S
x
N
Y
|
Y
R
x
N
S
x
G
E
x
S
R
 
P
P
 
E
G
 
A
V
 
A
Q
 
E
T
 
E
L
 
T
R
 
A
D
 
K
L
 
L
G
 
V
A
 
A
S
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
E
A
 
A
V
 
M
F
 
K
A
 
A
D
x
N
F
x
V
S
 
A
S
 
I
E
 
A
A
 
E
G
 
D
I
 
V
L
 
D
A
 
A
F
 
F
I
 
F
G
 
K
E
 
Q
L
 
A
K
 
I
N
 
E
H
 
R
T
 
F
D
 
G
S
 
R
L
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
-
 
G
-
x
I
-
 
T
-
 
R
S
 
D
E
 
N
W
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
R
T
 
M
P
 
K
G
 
E
T
 
D
E
 
E
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
D
R
 
D
M
 
V
F
 
I
S
 
N
V
x
I
H
 
N
M
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
T
Y
 
F
L
 
L
I
 
C
N
 
T
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
S
D
 
R
L
 
T
L
 
M
R
 
M
R
 
K
S
 
Q
S
 
R
P
 
A
A
 
G
D
 
K
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
M
S
 
A
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
x
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
T
F
 
T
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
-
 
R
S
 
G
I
 
I
K
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
 
G
L
 
F
L
x
I
L
 
T
F
x
T
N
 
D
P
 
M
D
 
T
D
 
D
-
 
K
-
 
L
D
 
D
A
 
E
A
 
K
Y
 
T
R
 
K
A
 
E
R
 
A
V
 
M
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
A
E
 
Y
P
 
G
G
 
T
S
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
A
L
 
V
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
T
 
S
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
25% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 5:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
S
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
L
 
L
L
 
A
E
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
Y
P
 
N
V
 
V
I
 
A
F
 
V
S
x
N
Y
|
Y
R
x
A
S
x
G
E
x
S
R
 
K
P
 
E
G
 
K
V
 
A
Q
 
E
T
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
R
 
K
D
 
G
L
 
V
G
 
D
A
 
S
S
 
F
A
 
A
V
 
I
F
 
Q
A
|
A
D
x
N
F
x
V
S
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
D
G
 
E
I
 
V
L
 
K
A
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
K
E
 
E
L
 
V
K
 
V
N
 
S
H
 
Q
T
 
F
D
 
G
S
 
S
L
 
L
R
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
R
S
 
D
E
 
N
W
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
R
T
 
M
P
 
K
G
 
E
T
 
Q
E
 
E
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
D
R
 
D
M
 
V
F
 
I
S
 
D
V
x
T
H
 
N
M
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
-
 
N
L
 
C
I
 
I
N
 
Q
L
 
K
H
 
A
C
 
T
A
 
P
D
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
S
 
R
S
 
S
P
 
G
A
 
A
D
 
-
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
L
S
 
S
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
K
 
G
H
x
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
S
-
 
R
S
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
F
L
 
I
L
 
V
F
 
S
N
 
D
P
 
M
D
 
T
D
 
D
D
 
E
A
 
-
A
 
-
Y
 
L
R
 
K
A
 
E
R
 
Q
V
 
M
L
 
L
A
 
T
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
A
I
 
R
E
 
F
P
 
G
G
 
Q
S
 
D
E
 
T
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
T
L
 
V
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
T
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

3o03A Quaternary complex structure of gluconate 5-dehydrogenase from streptococcus suis type 2 (see paper)
24% identity, 73% coverage: 9:180/236 of query aligns to 15:193/254 of 3o03A

query
sites
3o03A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
Q
x
Y
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
F
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
S
R
 
A
L
 
Y
L
 
A
E
 
K
D
 
A
G
 
G
H
 
A
P
 
T
V
 
I
I
 
V
F
 
F
S
 
N
Y
x
D
R
x
I
S
 
N
E
 
Q
R
 
E
-
x
L
-
 
V
-
 
D
P
 
R
G
 
G
V
 
M
Q
 
A
T
 
A
L
 
Y
R
 
K
D
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
I
S
 
N
A
 
A
-
 
H
-
 
G
V
 
Y
F
 
V
A
 
C
D
|
D
F
x
V
S
 
T
S
 
D
E
 
E
A
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
Q
A
 
A
F
 
M
I
 
V
G
 
A
E
 
Q
L
 
I
K
 
E
N
 
S
H
 
E
T
 
V
D
 
G
S
 
I
L
 
I
R
 
D
A
 
I
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
x
G
E
 
-
W
 
I
L
x
I
A
 
R
E
x
R
T
 
V
P
 
P
G
 
M
T
 
I
E
 
E
-
 
M
-
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
F
 
F
T
 
R
R
 
Q
M
 
V
F
 
I
S
 
D
V
 
I
H
 
D
M
 
L
L
 
N
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
L
 
I
I
 
V
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
I
D
 
P
L
 
S
L
 
M
R
 
I
R
 
K
S
 
K
S
 
G
P
 
H
A
 
G
D
 
K
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
|
I
S
 
C
D
x
S
D
x
M
V
x
M
T
 
S
R
 
E
R
 
L
G
 
G
S
x
R
S
 
E
K
 
T
H
x
V
I
 
S
G
 
A
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
K
S
 
M
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
N
F
 
I
A
 
A
A
 
S
K
 
E
Y
 
Y
A
 
G
P
 
E
-
 
A
S
 
N
I
 
I
K
 
Q
V
 
C
N
 
N
G
 
G
I
 
I
A
 
G
P
|
P
A
 
G
L
 
Y
L
 
I

4bo9A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 5-(2-(furan-2-ylmethoxy) phenyl)-2-phenyltetrazole at 2.9a resolution (see paper)
26% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 11:234/235 of 4bo9A

query
sites
4bo9A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
Q
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
A
P
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
 
T
S
 
S
E
 
A
R
 
S
P
 
G
G
 
A
V
 
E
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
R
 
E
D
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
A
S
 
N
A
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
F
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
F
 
T
I
 
L
G
 
E
E
 
H
L
 
I
K
 
Q
N
 
Q
H
 
H
T
 
L
D
 
G
S
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
S
 
-
E
 
E
W
 
W
L
 
F
A
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
D
M
 
V
F
x
V
S
x
N
V
 
T
H
 
N
M
x
L
L
 
N
A
 
S
P
 
L
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
G
L
 
M
R
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
W
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
I
S
 
G
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
 
Q
I
 
T
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
E
S
x
G
L
x
F
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
A
 
G
P
 
S
-
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
-
F
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
T
D
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
P
A
 
E
A
 
A
Y
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
Q
S
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
K
S
 
V
L
 
V
R
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

4bo7A Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with n-(2,3-dihydro-1h-inden- 5-yl)tetrazolo(1,5-b)pyridazin-6-amine at 2.6a resolution (see paper)
26% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 11:237/238 of 4bo7A

query
sites
4bo7A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
Q
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
A
P
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
 
T
S
 
S
E
 
A
R
 
S
P
 
G
G
 
A
V
 
E
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
R
 
E
D
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
A
S
 
N
A
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
F
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
F
 
T
I
 
L
G
 
E
E
 
H
L
 
I
K
 
Q
N
 
Q
H
 
H
T
 
L
D
 
G
S
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
S
 
K
-
 
D
-
 
D
E
 
E
W
 
W
L
x
F
A
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
D
M
 
V
F
x
V
S
 
N
V
 
T
H
 
N
M
x
L
L
 
N
A
 
S
P
 
L
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
G
L
 
M
R
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
W
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
I
S
 
G
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
 
Q
I
 
T
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
S
 
G
L
x
F
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
A
 
G
P
 
S
-
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
-
F
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
T
D
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
P
A
 
E
A
 
A
Y
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
Q
S
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
K
S
 
V
L
 
V
R
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
25% identity, 100% coverage: 1:235/236 of query aligns to 3:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
T
 
T
S
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
-
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
R
H
 
S
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
Q
L
 
L
L
 
A
E
 
E
D
 
E
G
 
G
H
 
Y
P
 
N
V
 
V
I
 
A
F
 
V
S
 
N
Y
 
Y
R
 
A
S
 
G
E
 
S
R
 
K
P
 
E
G
 
K
V
 
A
Q
 
E
T
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
R
 
K
D
 
G
L
 
V
G
 
D
A
 
S
S
 
F
A
 
A
V
 
I
F
 
Q
A
 
A
D
 
N
F
 
V
S
 
A
S
 
D
E
 
A
A
 
D
G
 
E
I
 
V
L
 
K
A
 
A
F
 
M
I
 
I
G
 
K
E
 
E
L
 
V
K
 
V
N
 
S
H
 
Q
T
 
F
D
 
G
S
 
S
L
 
L
R
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
R
S
 
D
E
 
N
W
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
R
T
 
M
P
 
K
G
 
E
T
 
Q
E
 
E
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
D
R
 
D
M
 
V
F
 
I
S
 
D
V
 
T
H
 
N
M
 
L
L
 
K
A
 
G
P
 
V
Y
 
F
-
 
N
L
 
C
I
 
I
N
 
Q
L
 
K
H
 
A
C
 
T
A
 
P
D
 
Q
L
 
M
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
S
 
R
S
 
S
P
 
G
A
 
A
D
 
-
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
L
S
 
S
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
V
G
 
G
S
 
N
S
 
P
K
 
G
H
x
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
S
F
 
A
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
S
-
 
R
S
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
V
F
 
S
N
 
D
P
 
M
D
 
T
D
 
D
-
 
A
-
 
L
D
 
S
A
 
D
A
 
E
Y
 
L
R
 
K
A
 
E
R
 
Q
V
 
M
L
 
L
A
 
T
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
A
I
 
R
E
 
F
P
 
G
G
 
Q
S
 
D
E
 
T
V
 
D
I
 
I
Y
 
A
Q
 
N
S
 
T
L
 
V
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
P
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
T
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
27% identity, 72% coverage: 8:178/236 of query aligns to 12:189/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
I
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
Q
x
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
Y
H
 
A
C
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
A
L
 
L
E
 
R
D
 
S
G
 
G
H
 
A
P
 
A
V
 
V
-
 
A
I
 
L
F
 
W
S
x
D
Y
x
L
R
 
D
S
 
A
E
 
E
R
 
R
-
 
L
-
 
A
P
 
R
G
 
S
V
 
E
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
R
 
A
D
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
K
A
 
V
S
 
C
A
 
A
V
 
V
F
 
T
A
x
V
D
|
D
F
x
Q
S
 
T
S
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
Q
I
 
I
L
 
E
A
 
A
F
 
A
I
 
V
G
 
G
E
 
K
L
 
T
K
 
L
N
 
A
H
 
A
T
 
F
D
 
G
S
 
A
L
 
I
R
 
D
A
 
V
V
 
L
V
 
I
H
 
N
-
 
C
-
x
A
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
G
-
 
G
N
 
N
A
 
G
S
 
T
E
 
T
W
 
W
L
 
E
A
 
L
E
 
E
T
 
P
P
 
D
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
V
F
 
W
T
 
R
R
 
Q
M
 
V
F
 
I
S
 
D
V
 
V
H
 
N
M
 
L
L
 
I
A
 
G
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
C
L
 
R
H
 
A
C
 
V
A
 
V
D
 
P
L
 
Q
L
 
M
R
 
L
R
 
K
S
 
Q
S
 
G
P
 
Y
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
 
I
S
 
A
D
x
S
D
 
V
V
 
A
T
 
G
R
 
K
R
 
E
G
 
G
S
 
N
S
 
P
K
 
N
H
 
A
I
 
S
G
 
H
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
G
A
 
K
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
-
 
T
P
 
K
S
 
N
I
 
I
K
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
T
P
|
P
A
|
A

Sites not aligning to the query:

4bnyA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 4-(2-phenylthieno(3,2-d) pyrimidin-4-yl)morpholine at 1.8a resolution (see paper)
25% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 10:238/239 of 4bnyA

query
sites
4bnyA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
Q
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
A
P
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
 
T
S
 
S
E
 
A
R
 
S
P
 
G
G
 
A
V
 
E
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
R
 
E
D
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
A
S
 
N
A
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
F
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
F
 
T
I
 
L
G
 
E
E
 
H
L
 
I
K
 
Q
N
 
Q
H
 
H
T
 
L
D
 
G
S
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
K
-
 
D
S
 
D
E
 
E
W
|
W
L
 
F
A
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
D
M
 
V
F
 
V
S
 
N
V
 
T
H
 
N
M
x
L
L
 
N
A
 
S
P
 
L
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
G
L
 
M
R
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
W
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
I
S
 
G
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
 
Q
I
 
T
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
E
S
x
G
L
x
F
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
A
 
G
P
 
S
-
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
-
F
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
T
D
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
P
A
 
E
A
 
A
Y
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
Q
S
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
K
S
 
V
L
 
V
R
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

4bnxA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 6-(4-(2-chloroanilino)- 1h-quinazolin-2-ylidene)cyclohexa-2, 4-dien-1-one at 2.3a resolution (see paper)
25% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 11:239/239 of 4bnxA

query
sites
4bnxA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
Q
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
A
P
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
 
T
S
 
S
E
 
A
R
 
S
P
 
G
G
 
A
V
 
E
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
R
 
E
D
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
A
S
 
N
A
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
F
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
F
 
T
I
 
L
G
 
E
E
 
H
L
 
I
K
 
Q
N
 
Q
H
 
H
T
 
L
D
 
G
S
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
K
-
 
D
S
 
D
E
 
E
W
 
W
L
 
F
A
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
D
M
 
V
F
x
V
S
x
N
V
 
T
H
 
N
M
x
L
L
 
N
A
 
S
P
 
L
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
G
L
 
M
R
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
W
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
I
S
 
G
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
 
Q
I
 
T
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
E
S
x
G
L
x
F
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
A
 
G
P
 
S
-
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
-
F
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
T
D
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
P
A
 
E
A
 
A
Y
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
Q
S
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
K
S
 
V
L
 
V
R
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

4bnzA Crystal structure of 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with 1-methyl-n-phenylindole- 3-carboxamide at 2.5a resolution (see paper)
25% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 11:240/241 of 4bnzA

query
sites
4bnzA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
x
G
V
 
I
G
 
G
L
 
Q
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
L
 
L
L
 
G
E
 
R
D
 
L
G
 
G
H
 
A
P
 
V
V
 
V
I
 
I
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
 
T
S
 
S
E
 
A
R
 
S
P
 
G
G
 
A
V
 
E
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
R
 
E
D
 
T
L
 
L
G
 
K
A
 
A
S
 
N
A
 
G
V
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
L
F
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
V
S
 
S
S
 
S
E
 
D
A
 
E
G
 
S
I
 
V
L
 
A
A
 
A
F
 
T
I
 
L
G
 
E
E
 
H
L
 
I
K
 
Q
N
 
Q
H
 
H
T
 
L
D
 
G
S
 
Q
L
 
P
R
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
S
 
G
-
 
R
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
E
 
E
W
 
W
L
x
F
A
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
D
M
 
V
F
x
V
S
 
N
V
 
T
H
 
N
M
x
L
L
 
N
A
 
S
P
 
L
Y
 
Y
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
L
D
 
R
L
 
G
L
 
M
R
 
T
R
 
K
S
 
A
S
 
R
P
 
W
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
N
I
 
I
S
 
G
D
x
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
A
R
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
 
Q
I
 
T
G
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
|
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
|
G
L
 
L
D
 
E
S
 
G
L
x
F
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
A
 
G
P
 
S
-
 
R
S
 
A
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
-
F
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
T
D
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
P
A
 
E
A
 
A
Y
 
Q
R
 
R
A
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
I
A
 
P
L
 
L
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
Q
S
 
A
E
 
E
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
K
S
 
V
L
 
V
R
 
G
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
P
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
T
L
 
V
T
 
P
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
25% identity, 96% coverage: 9:235/236 of query aligns to 9:243/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
R
R
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
A
D
 
R
G
 
G
H
 
A
P
 
K
V
 
V
I
 
I
F
 
G
S
 
T
Y
 
A
R
 
T
S
 
S
E
 
E
R
 
N
P
 
-
G
 
G
V
 
A
Q
 
K
T
 
N
L
 
I
R
 
S
D
 
D
-
 
Y
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
N
A
 
G
-
 
K
-
 
G
V
 
L
F
 
M
A
 
L
D
 
N
F
 
V
S
 
T
S
 
D
E
 
P
A
 
A
G
 
S
I
 
I
L
 
E
A
 
S
F
 
V
I
 
L
G
 
E
E
 
N
L
 
I
K
 
R
N
 
A
H
 
E
T
 
F
D
 
G
S
 
E
L
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
 
N
A
 
A
S
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
R
-
 
D
E
 
N
W
 
L
L
 
L
A
 
M
E
 
R
T
 
M
P
 
K
G
 
D
T
 
D
E
 
E
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
W
T
 
N
R
 
D
M
 
I
F
 
I
S
 
E
V
 
T
H
 
N
M
 
L
L
 
S
A
 
S
P
 
V
Y
 
F
L
 
R
I
 
L
N
 
S
L
 
K
H
 
A
C
 
V
A
 
M
D
 
R
L
 
A
L
x
M
R
 
M
R
 
K
S
 
K
S
 
R
P
 
C
A
 
G
D
 
R
I
 
I
V
 
I
H
 
T
I
 
I
S
 
G
D
 
S
D
 
V
V
 
V
T
 
G
R
 
T
R
 
M
G
 
G
S
 
N
S
 
A
K
 
G
H
 
Q
I
 
A
G
 
N
Y
 
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
S
L
 
K
S
 
S
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
Y
 
V
A
 
A
P
 
S
-
 
R
S
 
G
I
 
I
K
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
G
L
 
F
L
 
I
L
 
E
F
 
T
N
 
D
-
 
M
-
 
T
-
 
R
-
 
A
-
 
L
P
 
S
D
 
D
D
 
D
D
 
Q
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
A
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
V
A
 
P
L
 
A
G
 
G
I
 
R
E
 
L
P
 
G
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
E
I
 
I
Y
 
A
Q
 
S
S
 
A
L
 
V
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
x
A
D
x
S
N
 
D
P
 
E
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
H
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
H
 
Y
V
 
M

1mxhA Crystal structure of substrate complex of putative pteridine reductase 2 (ptr2) from trypanosoma cruzi (see paper)
30% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 5:242/248 of 1mxhA

query
sites
1mxhA
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
Q
 
R
R
|
R
V
x
I
G
 
G
L
 
H
H
 
S
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
Q
G
 
G
H
 
F
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
V
S
 
H
Y
|
Y
R
|
R
-
x
H
S
|
S
E
 
E
R
 
G
P
 
A
G
 
A
V
 
Q
Q
 
R
T
 
L
L
 
V
R
 
A
D
 
E
L
 
L
G
 
N
A
 
A
S
 
A
A
 
R
V
 
A
F
 
G
A
 
S
D
 
A
F
 
V
S
 
L
S
 
C
E
 
K
A
 
G
G
 
D
I
x
L
L
 
S
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
S
E
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
C
H
 
C
T
 
E
D
 
D
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
C
S
 
S
L
 
F
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
-
 
D
-
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
|
A
S
|
S
E
 
A
W
x
Y
L
 
Y
A
 
-
E
 
P
T
 
T
P
 
P
G
 
L
T
 
L
E
 
P
A
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
A
 
Q
F
 
V
T
 
A
R
x
E
M
 
L
F
 
F
S
 
G
V
 
S
H
 
N
M
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
L
Y
 
F
L
 
L
I
 
I
N
 
R
L
 
-
H
 
-
C
 
-
A
 
A
D
 
F
L
 
A
L
 
R
R
 
R
R
 
Q
S
 
S
S
 
R
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
x
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
T
R
 
D
R
 
L
G
 
P
S
 
L
S
 
P
K
 
G
H
x
F
I
 
C
G
 
V
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
R
-
 
H
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
L
L
x
S
L
|
L
F
 
L
N
x
P
P
 
P
-
 
A
-
 
M
-
 
P
-
 
Q
D
 
E
D
 
T
D
 
Q
A
 
E
A
 
E
Y
|
Y
R
 
R
A
 
R
R
 
K
V
 
V
-
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
S
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
A
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
I
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
-
 
S
-
 
K
D
 
D
N
 
A
P
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

1mxfA Crystal structure of inhibitor complex of putative pteridine reductase 2 (ptr2) from trypanosoma cruzi (see paper)
28% identity, 95% coverage: 9:232/236 of query aligns to 5:241/247 of 1mxfA

query
sites
1mxfA
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
G
 
A
Q
 
R
R
|
R
V
 
I
G
 
G
L
 
H
H
 
S
C
 
I
A
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
H
E
 
Q
D
 
Q
G
 
G
H
 
F
P
 
R
V
 
V
I
 
V
F
 
V
S
 
H
Y
 
Y
R
|
R
-
x
H
S
|
S
E
 
E
R
 
G
P
 
A
G
 
A
V
 
Q
Q
 
R
T
 
L
L
 
V
R
 
A
D
 
E
L
 
L
G
 
N
A
 
A
S
 
A
A
 
R
V
 
A
F
 
G
A
 
S
D
 
A
F
 
V
S
 
L
S
 
C
E
 
K
A
 
G
G
 
D
I
x
L
L
 
S
A
 
L
F
 
S
I
 
S
G
 
S
E
 
L
L
 
L
K
 
D
N
 
C
H
 
C
T
 
E
D
 
D
-
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
C
S
 
S
L
 
F
R
 
R
A
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
C
-
 
D
-
 
V
V
 
L
V
 
V
H
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
E
 
A
W
x
Y
L
 
Y
A
 
P
E
 
T
T
 
P
-
 
L
-
 
L
P
 
P
G
 
K
T
 
P
E
 
I
A
 
D
A
 
A
A
 
Q
F
 
V
T
 
A
R
x
E
M
 
L
F
 
F
S
 
G
V
 
S
H
 
N
M
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
-
 
L
Y
 
F
L
 
L
I
 
I
N
 
R
L
 
-
H
 
-
C
 
-
A
 
-
D
 
-
L
 
A
L
 
F
R
 
A
R
 
R
S
 
R
S
 
Q
P
 
N
A
 
L
D
 
S
I
 
V
V
 
V
H
 
N
I
x
L
S
 
C
D
|
D
D
 
A
V
 
M
T
 
T
R
 
D
R
 
L
G
 
P
S
 
L
S
 
P
K
 
G
H
 
F
I
 
C
G
 
V
Y
|
Y
C
 
T
A
 
M
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
L
D
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
R
S
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
L
K
 
E
Y
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
R
-
 
H
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
A
x
G
L
 
L
L
x
S
L
 
L
F
 
L
N
x
P
P
 
P
-
 
A
-
x
M
-
 
P
-
 
Q
D
 
E
D
 
T
D
 
Q
A
 
E
A
 
E
Y
|
Y
R
 
R
A
 
R
R
 
K
V
 
V
-
 
P
L
 
L
A
 
G
K
 
Q
S
 
S
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
E
P
 
A
G
 
S
S
 
A
E
 
A
V
 
Q
I
 
I
Y
 
A
Q
 
D
S
 
A
L
 
I
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
L
 
V
-
 
S
-
 
K
D
 
D
N
 
A
P
 
G
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
D
G
 
G
G
 
G

5b1yB Crystal structure of NADPH bound carbonyl reductase from aeropyrum pernix (see paper)
26% identity, 96% coverage: 9:234/236 of query aligns to 7:242/243 of 5b1yB

query
sites
5b1yB
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
Q
x
R
R
x
G
V
x
I
G
 
G
L
 
R
H
 
A
C
 
T
A
x
V
Q
 
L
R
 
R
L
 
F
L
 
A
E
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
W
P
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
I
S
 
A
Y
|
Y
R
x
K
S
|
S
E
x
R
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
R
 
E
P
 
K
G
 
T
V
 
A
Q
 
E
T
 
E
L
 
A
R
 
R
D
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
S
S
 
P
A
 
E
V
 
A
F
 
Y
-
 
T
-
 
V
-
 
R
-
x
V
-
x
D
-
x
V
A
 
G
D
 
D
F
 
P
S
 
D
S
 
S
E
 
V
A
 
T
G
 
E
I
 
M
L
 
S
A
 
S
F
 
R
I
 
V
G
 
G
E
 
E
L
 
L
K
 
I
N
 
P
H
 
H
T
 
L
D
 
N
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
V
 
L
H
 
V
N
 
N
A
 
A
S
x
A
E
x
G
-
 
V
-
 
L
W
 
Q
L
 
L
A
 
G
E
 
G
T
 
I
P
 
E
G
 
E
T
 
T
E
 
S
A
 
I
A
 
S
A
 
E
F
 
W
T
 
E
R
 
E
M
 
T
F
 
L
S
 
R
V
 
V
H
 
N
M
 
L
L
 
T
A
 
G
P
 
V
Y
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
T
L
 
K
H
 
L
C
 
L
A
 
L
D
 
P
L
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
A
S
 
K
P
 
W
A
 
A
D
 
S
I
 
I
V
 
V
H
 
N
I
x
V
S
 
A
D
x
S
D
 
I
V
 
A
T
 
G
R
 
E
R
 
T
G
 
G
S
 
N
-
 
V
S
 
V
K
 
A
H
 
G
I
 
V
G
 
A
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
D
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
K
S
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
Y
 
L
A
 
A
P
 
G
-
 
Y
S
 
G
I
 
I
K
 
R
V
 
V
N
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
-
L
 
-
L
 
-
F
|
F
N
x
V
P
 
E
D
x
T
D
 
D
D
 
M
A
 
T
A
 
R
Y
 
S
R
 
F
A
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
A
A
 
S
K
 
L
S
 
H
A
 
P
L
 
L
G
 
K
I
 
I
E
 
I
P
 
L
G
 
K
S
 
P
E
 
E
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
Q
 
E
S
 
A
L
 
I
R
 
L
Y
 
F
L
 
L
L
 
A
D
 
D
-
 
P
-
 
R
-
 
R
N
 
S
P
 
R
Y
 
G
V
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
H
T
 
V
L
 
L
T
 
S
V
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
R
 
R
H
 
R

Query Sequence

>Pf1N1B4_1040 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_1040
MTSTAAPILITGAGQRVGLHCAQRLLEDGHPVIFSYRSERPGVQTLRDLGASAVFADFSS
EAGILAFIGELKNHTDSLRAVVHNASEWLAETPGTEAAAFTRMFSVHMLAPYLINLHCAD
LLRRSSPADIVHISDDVTRRGSSKHIGYCASKAGLDSLTLSFAAKYAPSIKVNGIAPALL
LFNPDDDAAYRARVLAKSALGIEPGSEVIYQSLRYLLDNPYVTGTTLTVNGGRHVK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory