SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Pf1N1B4_1583 FitnessBrowser__pseudo1_N1B4:Pf1N1B4_1583 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
56% identity, 96% coverage: 8:273/276 of query aligns to 2:267/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
K
 
K
I
 
I
E
 
K
V
 
I
K
 
E
N
 
H
V
 
L
F
 
T
K
 
K
I
 
I
F
|
F
G
 
G
N
 
K
R
 
R
S
 
I
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
T
M
 
M
I
 
V
R
 
E
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
T
 
P
K
 
K
D
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
K
T
 
T
G
 
G
C
 
A
V
x
T
V
|
V
G
|
G
V
 
V
N
 
Y
D
 
D
L
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
I
 
I
G
 
N
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
L
F
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
I
 
V
L
 
A
Q
 
T
Y
 
L
D
 
N
M
 
K
E
 
E
A
 
D
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
K
K
 
T
I
 
M
S
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
E
V
 
V
R
 
Q
G
 
N
E
 
V
S
 
P
K
 
K
Q
 
E
M
 
E
C
 
R
A
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
E
H
 
K
W
 
A
I
 
L
N
 
D
T
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
D
Y
 
F
E
 
K
N
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
N
D
 
D
T
 
P
D
 
E
I
 
I
I
 
L
L
 
L
M
 
M
D
|
D
E
|
E
A
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
R
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
K
 
A
T
 
K
L
 
F
H
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
M
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
H
 
T
S
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
D
 
K
R
 
T
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
D
R
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
56% identity, 96% coverage: 8:273/276 of query aligns to 2:267/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
K
 
K
I
 
I
E
 
K
V
 
I
K
 
E
N
 
H
V
 
L
F
 
T
K
 
K
I
 
I
F
 
F
G
 
G
N
 
K
R
 
R
S
 
I
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
T
M
 
M
I
 
V
R
 
E
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
T
 
P
K
 
K
D
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
K
T
 
T
G
 
G
C
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
Y
D
 
D
L
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
I
 
I
G
 
N
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
L
F
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
I
 
V
L
 
A
Q
 
T
Y
 
L
D
 
N
M
 
K
E
 
E
A
 
D
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
K
K
 
T
I
 
M
S
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
E
V
 
V
R
 
Q
G
 
N
E
 
V
S
 
P
K
 
K
Q
 
E
M
 
E
C
 
R
A
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
E
H
 
K
W
 
A
I
 
L
N
 
D
T
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
D
Y
 
F
E
 
K
N
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
N
D
 
D
T
 
P
D
 
E
I
 
I
I
 
L
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
R
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
K
 
A
T
 
K
L
 
F
H
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
M
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
H
 
T
S
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V
D
 
K
R
 
T
F
 
F
V
 
V
Q
 
E
R
 
D
R
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
56% identity, 93% coverage: 8:265/276 of query aligns to 2:259/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
K
 
K
I
 
I
E
 
K
V
 
I
K
 
E
N
 
H
V
 
L
F
 
T
K
 
K
I
 
I
F
|
F
G
 
G
N
 
K
R
 
R
S
 
I
K
 
K
D
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
T
M
 
M
I
 
V
R
 
E
Q
 
K
K
 
G
K
 
E
T
 
P
K
 
K
D
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
K
E
 
K
T
 
T
G
 
G
C
 
A
V
x
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
Y
D
 
D
L
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
I
 
I
G
 
N
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
G
 
G
L
 
L
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
L
F
 
L
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
Q
D
 
D
I
 
V
L
 
A
Q
 
T
Y
 
L
D
 
N
M
 
K
E
 
E
A
 
D
L
 
L
R
 
L
E
 
Q
F
 
V
R
 
R
R
 
R
H
 
K
K
 
T
I
 
M
S
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
S
 
N
F
 
F
G
 
G
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
K
 
E
V
 
V
R
 
Q
G
 
N
E
 
V
S
 
P
K
 
K
Q
 
E
M
 
E
C
 
R
A
 
R
E
 
K
R
 
R
A
 
A
L
 
E
H
 
K
W
 
A
I
 
L
N
 
D
T
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
K
 
L
G
 
D
Y
 
F
E
 
K
N
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
x
K
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
|
M
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
N
D
 
D
T
 
P
D
 
E
I
 
I
I
 
L
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
x
Q
A
 
A
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
L
I
 
I
R
 
R
A
 
R
E
 
E
M
 
M
Q
 
Q
D
 
D
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
K
 
A
T
 
K
L
 
F
H
 
Q
K
 
K
T
 
T
I
 
I
V
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
N
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
M
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
L
H
 
T
S
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
N
E
 
D
Y
 
Y
V
 
V

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
40% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 17:243/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
G
 
G
C
 
D
V
 
V
V
 
T
G
 
A
V
 
V
N
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
S
L
 
L
S
 
E
I
 
I
G
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
L
V
 
V
I
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
L
 
Y
V
 
I
D
 
E
G
 
D
V
 
N
D
 
L
I
 
V
L
 
A
Q
 
D
Y
 
P
D
 
E
M
 
K
E
 
G
A
 
V
L
 
F
R
 
V
E
 
P
F
 
P
R
 
K
R
 
E
H
 
R
K
 
D
I
 
V
S
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
G
 
P
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
R
G
 
K
E
 
V
S
 
P
K
 
K
Q
 
Q
M
 
E
C
 
I
A
 
D
E
 
K
R
 
R
A
 
V
L
 
R
H
 
E
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
M
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
G
 
E
Y
 
L
E
 
L
N
 
N
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
I
A
 
R
D
 
R
T
 
P
D
 
K
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
K
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
K
L
 
L
Q
 
Q
K
 
R
T
 
Q
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
T
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
M
G
 
G
N
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
L
 
M
K
 
N
D
 
K
G
 
G
R
 
E
L
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
Y
H
 
Y
S
 
K
P
 
P
A
 
V
D
 
N
E
 
T
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
39% identity, 80% coverage: 48:269/276 of query aligns to 33:248/378 of P69874

query
sites
P69874
V
 
I
N
 
P
D
 
Q
L
 
L
S
 
D
L
 
L
S
 
T
I
 
I
G
 
N
T
 
N
G
 
G
E
 
E
I
x
F
F
 
L
V
 
T
I
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
V
x
L
R
 
R
H
 
L
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
V
T
 
D
S
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
M
V
x
L
D
 
D
G
 
N
V
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
T
Q
 
H
Y
 
V
D
 
P
M
 
A
E
 
E
A
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
N
H
 
R
K
 
Y
I
 
V
S
 
N
M
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
R
V
 
M
R
 
Q
G
 
K
E
 
T
S
 
P
K
 
A
Q
 
A
M
 
E
C
 
I
A
 
T
E
 
P
R
 
R
A
 
V
L
 
M
H
 
E
W
 
A
I
 
L
N
 
R
T
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
K
 
E
G
 
T
Y
 
F
E
 
A
N
 
Q
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
H
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
N
D
 
K
T
 
P
D
 
R
I
 
L
I
 
L
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
 
E
A
 
S
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
L
 
K
I
 
L
R
 
R
A
 
K
E
 
Q
M
 
M
Q
 
Q
D
 
N
Q
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
A
L
 
L
Q
 
Q
K
 
R
T
 
K
L
 
L
H
 
G
K
 
I
T
 
T
I
 
F
V
 
V
F
 
F
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
R
 
T
I
 
M
G
 
S
N
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
M
K
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
E
Q
 
Q
V
 
D
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
R
E
 
E
I
 
I
L
 
Y
H
 
E
S
 
E
P
 
P
A
 
K
D
 
N
E
 
L
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
42% identity, 80% coverage: 51:271/276 of query aligns to 21:238/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
L
 
I
S
 
H
L
 
L
S
 
E
I
 
V
G
 
A
T
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
K
F
 
L
V
 
V
I
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
H
 
T
F
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
L
I
 
E
D
 
D
P
 
F
T
 
Q
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
V
L
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
L
D
 
S
I
 
V
L
 
-
Q
 
-
Y
 
K
D
 
D
M
 
D
E
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
F
 
I
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
E
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
T
Y
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
R
E
 
W
S
 
P
K
 
R
Q
 
E
M
 
K
C
 
A
A
 
E
E
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
L
H
 
E
W
 
L
I
 
L
N
 
E
T
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
L
G
 
D
Y
 
Q
E
 
A
N
 
R
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
H
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
D
 
E
T
 
P
D
 
K
I
 
I
I
 
M
L
 
L
M
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
D
 
G
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
L
 
V
Q
 
M
K
 
R
T
 
D
L
 
L
H
 
A
K
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
D
 
G
E
 
F
A
 
A
V
 
R
R
 
E
I
 
V
G
 
A
N
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
V
I
 
F
L
 
M
K
 
D
D
 
G
G
 
G
R
 
Q
L
 
I
I
 
V
Q
 
E
V
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
F
H
 
T
S
 
R
P
 
P
A
 
K
D
 
E
E
 
E
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
R
 
S
F
 
F
V
 
L
Q
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1g291 Malk (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 14:240/372 of 1g291

query
sites
1g291
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
T
G
 
A
V
 
V
N
 
R
D
 
E
L
 
M
S
 
S
L
 
L
S
 
E
I
 
V
G
 
K
T
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
M
V
 
I
I
 
L
M
 
L
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
R
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
L
 
Y
V
 
I
D
 
G
G
 
D
V
 
K
D
 
L
I
 
V
L
 
A
Q
x
D
Y
 
P
D
x
E
M
x
K
E
 
G
A
 
I
L
 
F
R
 
V
E
 
P
F
 
P
R
x
K
R
x
D
H
 
R
K
 
D
I
 
I
S
 
A
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
Y
 
F
G
 
P
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
R
G
 
K
E
 
V
S
 
P
K
 
R
Q
 
Q
M
 
E
C
 
I
A
 
D
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
R
H
 
E
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
G
 
E
Y
 
L
E
 
L
N
 
N
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
A
 
R
D
 
K
T
 
P
D
 
Q
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
K
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
R
M
 
M
Q
 
R
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
L
 
K
E
 
K
L
 
L
Q
 
Q
K
 
R
T
 
Q
L
 
L
H
 
G
K
 
V
T
 
T
I
 
T
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
M
G
 
G
N
 
D
R
 
R
I
 
I
A
 
A
I
 
V
L
 
M
K
 
N
D
 
R
G
 
G
R
 
V
L
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
S
P
 
P
R
 
D
E
 
E
I
 
V
L
 
Y
H
 
D
S
 
K
P
 
P
A
 
A
D
 
N
E
 
T
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
38% identity, 83% coverage: 42:270/276 of query aligns to 15:242/343 of P30750

query
sites
P30750
T
 
T
G
 
R
C
 
T
V
 
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
I
 
V
G
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
V
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
H
 
C
F
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
T
Q
 
T
Y
 
L
D
 
S
M
 
E
E
 
S
A
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
F
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
I
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
E
 
T
S
 
P
K
 
K
Q
 
D
M
 
E
C
 
V
A
 
K
E
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
H
 
E
W
 
L
I
 
L
N
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
Y
 
K
E
 
H
N
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
P
D
 
K
I
 
V
I
 
L
L
 
L
M
 
C
D
 
D
E
|
E
A
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
Q
 
L
L
 
L
L
 
K
E
 
D
L
 
I
Q
 
N
K
 
R
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
C
N
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
V
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
F
H
 
S
S
 
H
P
 
P
A
 
K
D
 
T
E
 
P
Y
 
L
V
 
A
D
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
38% identity, 83% coverage: 42:270/276 of query aligns to 16:243/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
T
 
T
G
 
R
C
 
T
V
x
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
I
 
V
G
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
V
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
H
 
C
F
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
T
Q
 
T
Y
 
L
D
 
S
M
 
E
E
 
S
A
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
F
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
I
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
E
 
T
S
 
P
K
 
K
Q
 
D
M
 
E
C
 
V
A
 
K
E
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
H
 
E
W
 
L
I
 
L
N
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
Y
 
K
E
 
H
N
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
x
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
P
D
 
K
I
 
V
I
 
L
L
 
L
M
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
Q
 
L
L
 
L
L
 
K
E
 
D
L
 
I
Q
 
N
K
 
R
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
C
N
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
V
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
F
H
 
S
S
 
H
P
 
P
A
 
K
D
 
T
E
 
P
Y
 
L
V
 
A
D
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
38% identity, 83% coverage: 42:270/276 of query aligns to 16:243/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
T
 
T
G
 
R
C
 
T
V
 
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
I
 
V
G
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
V
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
H
 
C
F
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
T
Q
 
T
Y
 
L
D
 
S
M
 
E
E
 
S
A
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
F
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
I
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
E
 
T
S
 
P
K
 
K
Q
 
D
M
 
E
C
 
V
A
 
K
E
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
H
 
E
W
 
L
I
 
L
N
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
Y
 
K
E
 
H
N
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
P
D
 
K
I
 
V
I
 
L
L
 
L
M
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
Q
 
L
L
 
L
L
 
K
E
 
D
L
 
I
Q
 
N
K
 
R
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
C
N
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
V
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
F
H
 
S
S
 
H
P
 
P
A
 
K
D
 
T
E
 
P
Y
 
L
V
 
A
D
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
38% identity, 83% coverage: 42:270/276 of query aligns to 16:243/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
T
 
T
G
 
R
C
 
T
V
 
I
V
 
Q
G
 
A
V
 
L
N
 
N
D
 
N
L
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
H
I
 
V
G
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
F
 
Y
V
 
G
I
 
V
M
 
I
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
I
R
 
R
H
 
C
F
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
D
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
A
 
S
I
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
I
 
L
L
 
T
Q
 
T
Y
 
L
D
 
S
M
 
E
E
 
S
A
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
F
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
I
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
S
H
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Y
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
E
 
T
S
 
P
K
 
K
Q
 
D
M
 
E
C
 
V
A
 
K
E
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
H
 
E
W
 
L
I
 
L
N
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
G
 
D
Y
 
K
E
 
H
N
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
H
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
P
D
 
K
I
 
V
I
 
L
L
 
L
M
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
I
 
T
R
 
T
A
 
R
E
 
S
M
 
I
Q
 
L
D
 
E
Q
 
L
L
 
L
L
 
K
E
 
D
L
 
I
Q
 
N
K
 
R
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
L
T
 
T
I
 
I
V
 
L
F
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
V
 
K
R
 
R
I
 
I
G
 
C
N
 
D
R
 
C
I
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
K
 
S
D
 
N
G
 
G
R
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
V
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
R
 
S
E
 
E
I
 
V
L
 
F
H
 
S
S
 
H
P
 
P
A
 
K
D
 
T
E
 
P
Y
 
L
V
 
A
D
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
38% identity, 80% coverage: 51:271/276 of query aligns to 20:238/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
V
S
 
T
L
 
L
S
 
K
I
 
V
G
 
N
T
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
F
 
V
V
 
V
I
 
I
M
 
I
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
C
F
 
I
N
 
N
R
 
L
L
 
L
I
 
E
D
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
K
G
 
G
A
 
E
I
 
V
L
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
K
I
 
I
L
 
N
Q
 
N
Y
 
G
D
 
K
M
 
V
E
 
N
A
 
I
L
 
N
R
 
K
E
 
-
F
 
-
R
 
V
R
 
R
H
 
Q
K
 
K
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
H
F
 
F
G
 
N
L
 
L
L
 
F
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
T
V
 
A
L
 
I
D
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
Y
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
K
G
 
K
E
 
M
S
 
N
K
 
K
Q
 
K
M
 
E
C
 
A
A
 
E
E
 
E
R
 
L
A
 
A
L
 
V
H
 
D
W
 
L
I
 
L
N
 
A
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
L
G
 
D
Y
 
K
E
 
K
N
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
H
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
D
 
Q
T
 
P
D
 
E
I
 
V
I
 
M
L
 
L
M
 
F
D
 
D
E
|
E
A
 
P
F
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
M
 
M
Q
 
V
D
 
K
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
N
L
 
V
Q
 
M
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
H
 
A
K
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
M
T
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
V
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
D
 
G
E
 
F
A
 
A
V
 
R
R
 
E
I
 
V
G
 
G
N
 
D
R
 
R
I
 
V
A
 
I
I
 
F
L
 
M
K
 
D
D
 
D
G
 
G
R
 
V
L
 
I
I
 
V
Q
 
E
V
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
R
 
E
E
 
E
I
 
I
L
 
F
H
 
Y
S
 
R
P
 
A
A
 
K
D
 
N
E
 
E
Y
 
R
V
 
T
D
 
R
R
 
E
F
 
F
V
 
L
Q
 
S
R
 
K

Sites not aligning to the query:

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 13:233/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
N
H
 
Q
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
I
Q
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
K
 
K
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
L
G
 
A
N
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
R
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1q12A Crystal structure of the atp-bound e. Coli malk (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 11:231/367 of 1q12A

query
sites
1q12A
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
N
H
 
Q
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
x
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
I
Q
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
K
 
K
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
L
G
 
A
N
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
R
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 13:233/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
N
H
 
Q
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
x
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
I
Q
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
K
 
K
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
L
G
 
A
N
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
R
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 13:233/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
N
H
 
Q
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
x
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
I
Q
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
K
 
K
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
L
G
 
A
N
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
R
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 13:233/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
N
H
 
Q
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
x
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
|
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
I
Q
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
K
 
K
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
L
G
 
A
N
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
R
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 13:233/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
x
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
S
 
S
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
 
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
 
V
L
 
N
H
 
Q
W
 
V
I
 
A
N
 
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
x
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
x
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
L
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
V
E
 
Q
M
 
M
Q
 
R
D
 
I
Q
 
E
L
 
I
L
 
S
E
 
R
L
 
L
Q
 
H
K
 
K
T
 
R
L
 
L
H
 
G
K
 
R
T
 
T
I
 
M
V
 
I
F
 
Y
I
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
R
 
T
I
 
L
G
 
A
N
 
D
R
 
K
I
 
I
A
 
V
I
 
V
L
 
L
K
 
D
D
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
A
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
R
 
L
E
 
E
I
 
L
L
 
Y
H
 
H
S
 
Y
P
 
P
A
 
A
D
 
D
E
 
R
Y
 
F
V
 
V
D
 
A
R
 
G
F
 
F
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
38% identity, 82% coverage: 43:269/276 of query aligns to 14:234/371 of P68187

query
sites
P68187
G
 
G
C
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
V
V
 
S
N
 
K
D
 
D
L
 
I
S
 
N
L
 
L
S
 
D
I
 
I
G
 
H
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
F
F
 
V
V
 
V
I
 
F
M
 
V
G
 
G
L
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
V
 
L
R
 
R
H
 
M
F
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
I
 
E
D
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
D
I
 
L
L
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
G
V
 
E
D
 
K
I
 
R
L
 
M
Q
 
N
Y
 
D
D
 
T
M
 
P
E
 
P
A
 
A
L
 
E
R
 
R
E
 
-
F
 
-
R
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
G
I
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
S
F
 
Y
G
x
A
L
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
H
K
 
L
T
 
S
V
 
V
L
 
A
D
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
G
E
 
A
S
x
K
K
 
K
Q
 
E
M
 
V
C
 
I
A
 
N
E
 
Q
R
 
R
A
x
V
L
 
N
H
 
Q
W
x
V
I
 
A
N
x
E
T
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
x
A
G
 
H
Y
 
L
E
 
L
N
 
D
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
H
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
|
G
M
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
E
T
 
P
D
 
S
I
 
V
I
 
F
L
 
L
M
 
L
D
|
D
E
 
E
A
 
P
F
 
L
S
 
S